data_SMR-aca7cdba5b031ecc1b587fb5435be072_1
_entry.id SMR-aca7cdba5b031ecc1b587fb5435be072_1
_struct.entry_id SMR-aca7cdba5b031ecc1b587fb5435be072_1
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q92954 (isoform 2)/ PRG4_HUMAN, Proteoglycan 4

Estimated model accuracy of this model is 0.048, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q92954 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 159584.754 1 .
#
#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP PRG4_HUMAN Q92954 1
;MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYESFCAEVKDNK
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TTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPTPTTPKEPAPTTKEPAPTTPKEPAP
TAPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKEPSPTTPKEPAPTTTKSAPTTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPSP
TTTKEPAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKKPAPTTPKEPAPTTPKETAPTTPKKL
TPTTPEKLAPTTPEKPAPTTPEELAPTTPEEPTPTTPEEPAPTTPKAAAPNTPKEPAPTTPKEPAPTTPK
EPAPTTPKETAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKEPTSTTSDKPAPTTPKGTAPTTPKE
PAPTTPKEPAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKGPTSTTSDKPAPTTPKETAPTTPKEP
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TLSKVWYNCP
;
'Proteoglycan 4'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1270 1 1270
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . PRG4_HUMAN Q92954 Q92954-2 1 1270 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28
35D5DCF77028AA12
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYESFCAEVKDNK
KNRTKKKPTPKPPVVDEAGSGLDNGDFKVTTPDTSTTQHNKVSTSPKITTAKPINPRPSLPPNSDTSKET
SLTVNKETTVETKETTTTNKQTSTDGKEKTTSAKETQSIEKTSAKDLAPTSKVLAKPTPKAETTTKGPAL
TTPKEPTPTTPKEPASTTPKEPTPTTIKSAPTTPKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTTKEPAPTTPKEPAP
TTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPTPTTPKEPAPTTKEPAPTTPKEPAP
TAPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKEPSPTTPKEPAPTTTKSAPTTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPSP
TTTKEPAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKKPAPTTPKEPAPTTPKETAPTTPKKL
TPTTPEKLAPTTPEKPAPTTPEELAPTTPEEPTPTTPEEPAPTTPKAAAPNTPKEPAPTTPKEPAPTTPK
EPAPTTPKETAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKEPTSTTSDKPAPTTPKGTAPTTPKE
PAPTTPKEPAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKGPTSTTSDKPAPTTPKETAPTTPKEP
APTTPKKPAPTTPETPPPTTSEVSTPTTTKEPTTIHKSPDESTPELSAEPTPKALENSPKEPGVPTTKTP
AATKPEMTTTAKDKTTERDLRTTPETTTAAPKMTKETATTTEKTTESKITATTTQVTSTTTQDTTPFKIT
TLKTTTLAPKVTTTKKTITTTEIMNKPEETAKPKDRATNSKATTPKPQKPTKAPKKPTSTKKPKTMPRVR
KPKTTPTPRKMTSTMPELNPTSRIAEAMLQTTTRPNQTPNSKLVEVNPKSEDAGGAEGETPHMLLRPHVF
MPEVTPDMDYLPRVPNQGIIINPMLSDETNICNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLSPFSPPSPARR
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LAYQDKGVLHNEVKVSILWRGLPNVVTSAISLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPSRTARAITTRSGQ
TLSKVWYNCP
;

;MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYESFCAEVKDNK
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TTPKEPTPTTPKEPASTTPKEPTPTTIKSAPTTPKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTTKEPAPTTPKEPAP
TTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPTPTTPKEPAPTTKEPAPTTPKEPAP
TAPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKEPSPTTPKEPAPTTTKSAPTTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPSP
TTTKEPAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKKPAPTTPKEPAPTTPKETAPTTPKKL
TPTTPEKLAPTTPEKPAPTTPEELAPTTPEEPTPTTPEEPAPTTPKAAAPNTPKEPAPTTPKEPAPTTPK
EPAPTTPKETAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKEPTSTTSDKPAPTTPKGTAPTTPKE
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AATKPEMTTTAKDKTTERDLRTTPETTTAAPKMTKETATTTEKTTESKITATTTQVTSTTTQDTTPFKIT
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TLSKVWYNCP
;

#
#
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_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ALA .
1 3 TRP .
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1 5 THR .
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1 7 PRO .
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1 11 LEU .
1 12 LEU .
1 13 LEU .
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1 18 VAL .
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1 21 GLN .
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1 24 SER .
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1 32 ARG .
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1 44 ASP .
1 45 CYS .
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1 51 LYS .
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1 71 LYS .
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1 101 THR .
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1 107 THR .
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1 132 PRO .
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1 143 THR .
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1 157 THR .
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1 1252 ARG .
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1 1255 THR .
1 1256 THR .
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A 1 .
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A 1 272 PRO 272 ? ? ? A .
A 1 273 THR 273 ? ? ? A .
A 1 274 THR 274 ? ? ? A .
A 1 275 PRO 275 ? ? ? A .
A 1 276 LYS 276 ? ? ? A .
A 1 277 GLU 277 ? ? ? A .
A 1 278 PRO 278 ? ? ? A .
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A 1 280 PRO 280 ? ? ? A .
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A 1 695 THR 695 ? ? ? A .
A 1 696 THR 696 ? ? ? A .
A 1 697 PRO 697 ? ? ? A .
A 1 698 LYS 698 ? ? ? A .
A 1 699 GLU 699 ? ? ? A .
A 1 700 PRO 700 ? ? ? A .
A 1 701 ALA 701 ? ? ? A .
A 1 702 PRO 702 ? ? ? A .
A 1 703 THR 703 ? ? ? A .
A 1 704 THR 704 ? ? ? A .
A 1 705 PRO 705 ? ? ? A .
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A 1 707 LYS 707 ? ? ? A .
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A 1 1103 GLY 1103 ? ? ? A .
A 1 1104 GLY 1104 ? ? ? A .
A 1 1105 LEU 1105 ? ? ? A .
A 1 1106 THR 1106 ? ? ? A .
A 1 1107 GLY 1107 ? ? ? A .
A 1 1108 GLN 1108 ? ? ? A .
A 1 1109 ILE 1109 ? ? ? A .
A 1 1110 VAL 1110 ? ? ? A .
A 1 1111 ALA 1111 ? ? ? A .
A 1 1112 ALA 1112 ? ? ? A .
A 1 1113 LEU 1113 ? ? ? A .
A 1 1114 SER 1114 ? ? ? A .
A 1 1115 THR 1115 ? ? ? A .
A 1 1116 ALA 1116 ? ? ? A .
A 1 1117 LYS 1117 ? ? ? A .
A 1 1118 TYR 1118 ? ? ? A .
A 1 1119 LYS 1119 ? ? ? A .
A 1 1120 ASN 1120 ? ? ? A .
A 1 1121 TRP 1121 ? ? ? A .
A 1 1122 PRO 1122 ? ? ? A .
A 1 1123 GLU 1123 ? ? ? A .
A 1 1124 SER 1124 ? ? ? A .
A 1 1125 VAL 1125 ? ? ? A .
A 1 1126 TYR 1126 ? ? ? A .
A 1 1127 PHE 1127 ? ? ? A .
A 1 1128 PHE 1128 ? ? ? A .
A 1 1129 LYS 1129 ? ? ? A .
A 1 1130 ARG 1130 ? ? ? A .
A 1 1131 GLY 1131 ? ? ? A .
A 1 1132 GLY 1132 ? ? ? A .
A 1 1133 SER 1133 ? ? ? A .
A 1 1134 ILE 1134 ? ? ? A .
A 1 1135 GLN 1135 ? ? ? A .
A 1 1136 GLN 1136 ? ? ? A .
A 1 1137 TYR 1137 ? ? ? A .
A 1 1138 ILE 1138 ? ? ? A .
A 1 1139 TYR 1139 ? ? ? A .
A 1 1140 LYS 1140 ? ? ? A .
A 1 1141 GLN 1141 ? ? ? A .
A 1 1142 GLU 1142 ? ? ? A .
A 1 1143 PRO 1143 ? ? ? A .
A 1 1144 VAL 1144 ? ? ? A .
A 1 1145 GLN 1145 ? ? ? A .
A 1 1146 LYS 1146 ? ? ? A .
A 1 1147 CYS 1147 ? ? ? A .
A 1 1148 PRO 1148 ? ? ? A .
A 1 1149 GLY 1149 ? ? ? A .
A 1 1150 ARG 1150 ? ? ? A .
A 1 1151 ARG 1151 ? ? ? A .
A 1 1152 PRO 1152 ? ? ? A .
A 1 1153 ALA 1153 ? ? ? A .
A 1 1154 LEU 1154 ? ? ? A .
A 1 1155 ASN 1155 ? ? ? A .
A 1 1156 TYR 1156 ? ? ? A .
A 1 1157 PRO 1157 ? ? ? A .
A 1 1158 VAL 1158 ? ? ? A .
A 1 1159 TYR 1159 ? ? ? A .
A 1 1160 GLY 1160 ? ? ? A .
A 1 1161 GLU 1161 ? ? ? A .
A 1 1162 THR 1162 ? ? ? A .
A 1 1163 THR 1163 ? ? ? A .
A 1 1164 GLN 1164 ? ? ? A .
A 1 1165 VAL 1165 ? ? ? A .
A 1 1166 ARG 1166 ? ? ? A .
A 1 1167 ARG 1167 ? ? ? A .
A 1 1168 ARG 1168 ? ? ? A .
A 1 1169 ARG 1169 ? ? ? A .
A 1 1170 PHE 1170 ? ? ? A .
A 1 1171 GLU 1171 ? ? ? A .
A 1 1172 ARG 1172 ? ? ? A .
A 1 1173 ALA 1173 ? ? ? A .
A 1 1174 ILE 1174 ? ? ? A .
A 1 1175 GLY 1175 ? ? ? A .
A 1 1176 PRO 1176 ? ? ? A .
A 1 1177 SER 1177 ? ? ? A .
A 1 1178 GLN 1178 ? ? ? A .
A 1 1179 THR 1179 ? ? ? A .
A 1 1180 HIS 1180 ? ? ? A .
A 1 1181 THR 1181 ? ? ? A .
A 1 1182 ILE 1182 ? ? ? A .
A 1 1183 ARG 1183 ? ? ? A .
A 1 1184 ILE 1184 ? ? ? A .
A 1 1185 GLN 1185 ? ? ? A .
A 1 1186 TYR 1186 ? ? ? A .
A 1 1187 SER 1187 ? ? ? A .
A 1 1188 PRO 1188 ? ? ? A .
A 1 1189 ALA 1189 ? ? ? A .
A 1 1190 ARG 1190 ? ? ? A .
A 1 1191 LEU 1191 ? ? ? A .
A 1 1192 ALA 1192 ? ? ? A .
A 1 1193 TYR 1193 ? ? ? A .
A 1 1194 GLN 1194 ? ? ? A .
A 1 1195 ASP 1195 ? ? ? A .
A 1 1196 LYS 1196 ? ? ? A .
A 1 1197 GLY 1197 ? ? ? A .
A 1 1198 VAL 1198 ? ? ? A .
A 1 1199 LEU 1199 ? ? ? A .
A 1 1200 HIS 1200 ? ? ? A .
A 1 1201 ASN 1201 ? ? ? A .
A 1 1202 GLU 1202 ? ? ? A .
A 1 1203 VAL 1203 ? ? ? A .
A 1 1204 LYS 1204 ? ? ? A .
A 1 1205 VAL 1205 ? ? ? A .
A 1 1206 SER 1206 ? ? ? A .
A 1 1207 ILE 1207 ? ? ? A .
A 1 1208 LEU 1208 ? ? ? A .
A 1 1209 TRP 1209 ? ? ? A .
A 1 1210 ARG 1210 ? ? ? A .
A 1 1211 GLY 1211 ? ? ? A .
A 1 1212 LEU 1212 ? ? ? A .
A 1 1213 PRO 1213 ? ? ? A .
A 1 1214 ASN 1214 ? ? ? A .
A 1 1215 VAL 1215 ? ? ? A .
A 1 1216 VAL 1216 ? ? ? A .
A 1 1217 THR 1217 ? ? ? A .
A 1 1218 SER 1218 ? ? ? A .
A 1 1219 ALA 1219 ? ? ? A .
A 1 1220 ILE 1220 ? ? ? A .
A 1 1221 SER 1221 ? ? ? A .
A 1 1222 LEU 1222 ? ? ? A .
A 1 1223 PRO 1223 ? ? ? A .
A 1 1224 ASN 1224 ? ? ? A .
A 1 1225 ILE 1225 ? ? ? A .
A 1 1226 ARG 1226 ? ? ? A .
A 1 1227 LYS 1227 ? ? ? A .
A 1 1228 PRO 1228 ? ? ? A .
A 1 1229 ASP 1229 ? ? ? A .
A 1 1230 GLY 1230 ? ? ? A .
A 1 1231 TYR 1231 ? ? ? A .
A 1 1232 ASP 1232 ? ? ? A .
A 1 1233 TYR 1233 ? ? ? A .
A 1 1234 TYR 1234 ? ? ? A .
A 1 1235 ALA 1235 ? ? ? A .
A 1 1236 PHE 1236 ? ? ? A .
A 1 1237 SER 1237 ? ? ? A .
A 1 1238 LYS 1238 ? ? ? A .
A 1 1239 ASP 1239 ? ? ? A .
A 1 1240 GLN 1240 ? ? ? A .
A 1 1241 TYR 1241 ? ? ? A .
A 1 1242 TYR 1242 ? ? ? A .
A 1 1243 ASN 1243 ? ? ? A .
A 1 1244 ILE 1244 ? ? ? A .
A 1 1245 ASP 1245 ? ? ? A .
A 1 1246 VAL 1246 ? ? ? A .
A 1 1247 PRO 1247 ? ? ? A .
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A 1 1251 ALA 1251 ? ? ? A .
A 1 1252 ARG 1252 ? ? ? A .
A 1 1253 ALA 1253 ? ? ? A .
A 1 1254 ILE 1254 ? ? ? A .
A 1 1255 THR 1255 ? ? ? A .
A 1 1256 THR 1256 ? ? ? A .
A 1 1257 ARG 1257 ? ? ? A .
A 1 1258 SER 1258 ? ? ? A .
A 1 1259 GLY 1259 ? ? ? A .
A 1 1260 GLN 1260 ? ? ? A .
A 1 1261 THR 1261 ? ? ? A .
A 1 1262 LEU 1262 ? ? ? A .
A 1 1263 SER 1263 ? ? ? A .
A 1 1264 LYS 1264 ? ? ? A .
A 1 1265 VAL 1265 ? ? ? A .
A 1 1266 TRP 1266 ? ? ? A .
A 1 1267 TYR 1267 ? ? ? A .
A 1 1268 ASN 1268 ? ? ? A .
A 1 1269 CYS 1269 ? ? ? A .
A 1 1270 PRO 1270 ? ? ? A .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1 'Vitronectin {PDB ID=1ssu, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1ssu.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 1ssu, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 1' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1 DQESCKGRCTEGFNVDKKCQCDELCSYYQSCCTDYTAECKPQVTRGDVFTM
DQESCKGRCTEGFNVDKKCQCDELCSYYQSCCTDYTAECKPQVTRGDVFTM
#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 2 42
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 1ssu 2024-11-20
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1270
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1270 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.3e-09 43.902
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MAWKTLPIYLLLLLSVFVIQQVSSQELSCKGRCFESFERGRECDCDAQCKKYDKCCPDYESFCAEVKDNKKNRTKKKPTPKPPVVDEAGSGLDNGDFKVTTPDTSTTQHNKVSTSPKITTAKPINPRPSLPPNSDTSKETSLTVNKETTVETKETTTTNKQTSTDGKEKTTSAKETQSIEKTSAKDLAPTSKVLAKPTPKAETTTKGPALTTPKEPTPTTPKEPASTTPKEPTPTTIKSAPTTPKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTTKEPAPTTPKEPAPTTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPTPTTPKEPAPTTKEPAPTTPKEPAPTAPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKEPSPTTPKEPAPTTTKSAPTTTKEPAPTTTKSAPTTPKEPSPTTTKEPAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTTKKPAPTTPKEPAPTTPKETAPTTPKKLTPTTPEKLAPTTPEKPAPTTPEELAPTTPEEPTPTTPEEPAPTTPKAAAPNTPKEPAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTPKETAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKEPTSTTSDKPAPTTPKGTAPTTPKEPAPTTPKEPAPTTPKGTAPTTLKEPAPTTPKKPAPKELAPTTTKGPTSTTSDKPAPTTPKETAPTTPKEPAPTTPKKPAPTTPETPPPTTSEVSTPTTTKEPTTIHKSPDESTPELSAEPTPKALENSPKEPGVPTTKTPAATKPEMTTTAKDKTTERDLRTTPETTTAAPKMTKETATTTEKTTESKITATTTQVTSTTTQDTTPFKITTLKTTTLAPKVTTTKKTITTTEIMNKPEETAKPKDRATNSKATTPKPQKPTKAPKKPTSTKKPKTMPRVRKPKTTPTPRKMTSTMPELNPTSRIAEAMLQTTTRPNQTPNSKLVEVNPKSEDAGGAEGETPHMLLRPHVFMPEVTPDMDYLPRVPNQGIIINPMLSDETNICNGKPVDGLTTLRNGTLVAFRGHYFWMLSPFSPPSPARRITEVWGIPSPIDTVFTRCNCEGKTFFFKDSQYWRFTNDIKDAGYPKPIFKGFGGLTGQIVAALSTAKYKNWPESVYFFKRGGSIQQYIYKQEPVQKCPGRRPALNYPVYGETTQVRRRRFERAIGPSQTHTIRIQYSPARLAYQDKGVLHNEVKVSILWRGLPNVVTSAISLPNIRKPDGYDYYAFSKDQYYNIDVPSRTARAITTRSGQTLSKVWYNCP
2 1 2
-------------------------QESCKGRCTEGFNVDKKCQCDELCSYYQSCCTDYTAECKPQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1ssu.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . GLU 26 26 ? A -0.006 -0.441 -17.233 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 2 C CA . GLU 26 26 ? A -0.491 -1.139 -15.996 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 3 C C . GLU 26 26 ? A 0.638 -1.660 -15.130 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 4 O O . GLU 26 26 ? A 1.749 -1.791 -15.625 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 5 C CB . GLU 26 26 ? A -1.373 -2.294 -16.468 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 6 C CG . GLU 26 26 ? A -2.668 -1.820 -17.157 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 7 C CD . GLU 26 26 ? A -3.514 -3.016 -17.592 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 8 O OE1 . GLU 26 26 ? A -2.982 -4.153 -17.556 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 9 O OE2 . GLU 26 26 ? A -4.681 -2.770 -17.971 1 1 A GLU 0.300 1
ATOM 10 N N . LEU 27 27 ? A 0.396 -1.937 -13.826 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 11 C CA . LEU 27 27 ? A 1.438 -2.341 -12.894 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 12 C C . LEU 27 27 ? A 0.842 -3.292 -11.874 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 13 O O . LEU 27 27 ? A -0.362 -3.520 -11.847 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 14 C CB . LEU 27 27 ? A 2.067 -1.153 -12.116 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 15 C CG . LEU 27 27 ? A 2.931 -0.196 -12.957 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 16 C CD1 . LEU 27 27 ? A 3.324 1.044 -12.138 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 17 C CD2 . LEU 27 27 ? A 4.185 -0.893 -13.509 1 1 A LEU 0.310 1
ATOM 18 N N . SER 28 28 ? A 1.693 -3.883 -11.006 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 19 C CA . SER 28 28 ? A 1.281 -4.851 -10.005 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 20 C C . SER 28 28 ? A 2.088 -4.619 -8.753 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 21 O O . SER 28 28 ? A 2.872 -3.684 -8.669 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 22 C CB . SER 28 28 ? A 1.315 -6.355 -10.455 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 23 O OG . SER 28 28 ? A 2.592 -6.953 -10.729 1 1 A SER 0.530 1
ATOM 24 N N . CYS 29 29 ? A 1.873 -5.459 -7.717 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 25 C CA . CYS 29 29 ? A 2.566 -5.356 -6.441 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 26 C C . CYS 29 29 ? A 4.049 -5.705 -6.466 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 27 O O . CYS 29 29 ? A 4.762 -5.500 -5.496 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 28 C CB . CYS 29 29 ? A 1.905 -6.269 -5.384 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 29 S SG . CYS 29 29 ? A 2.332 -5.790 -3.682 1 1 A CYS 0.580 1
ATOM 30 N N . LYS 30 30 ? A 4.567 -6.283 -7.564 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 31 C CA . LYS 30 30 ? A 5.940 -6.752 -7.600 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 32 C C . LYS 30 30 ? A 6.967 -5.630 -7.426 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 33 O O . LYS 30 30 ? A 7.169 -4.808 -8.313 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 34 C CB . LYS 30 30 ? A 6.181 -7.584 -8.881 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 35 C CG . LYS 30 30 ? A 5.347 -8.879 -8.898 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 36 C CD . LYS 30 30 ? A 5.732 -9.872 -10.014 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 37 C CE . LYS 30 30 ? A 5.487 -9.409 -11.445 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 38 N NZ . LYS 30 30 ? A 4.037 -9.266 -11.607 1 1 A LYS 0.500 1
ATOM 39 N N . GLY 31 31 ? A 7.608 -5.575 -6.231 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 40 C CA . GLY 31 31 ? A 8.472 -4.472 -5.821 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 41 C C . GLY 31 31 ? A 7.826 -3.451 -4.913 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 42 O O . GLY 31 31 ? A 8.450 -2.450 -4.589 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 43 N N . ARG 32 32 ? A 6.563 -3.664 -4.480 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 44 C CA . ARG 32 32 ? A 5.828 -2.677 -3.708 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 45 C C . ARG 32 32 ? A 5.097 -3.189 -2.465 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 46 O O . ARG 32 32 ? A 4.569 -2.414 -1.684 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 47 C CB . ARG 32 32 ? A 4.703 -2.090 -4.586 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 48 C CG . ARG 32 32 ? A 5.183 -1.440 -5.896 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 49 C CD . ARG 32 32 ? A 4.125 -0.591 -6.595 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 50 N NE . ARG 32 32 ? A 3.903 0.586 -5.711 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 51 C CZ . ARG 32 32 ? A 3.565 1.811 -6.085 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 52 N NH1 . ARG 32 32 ? A 3.202 2.029 -7.339 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 53 N NH2 . ARG 32 32 ? A 3.629 2.792 -5.188 1 1 A ARG 0.500 1
ATOM 54 N N . CYS 33 33 ? A 4.981 -4.514 -2.258 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 55 C CA . CYS 33 33 ? A 4.132 -5.063 -1.205 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 56 C C . CYS 33 33 ? A 4.514 -4.701 0.222 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 57 O O . CYS 33 33 ? A 5.596 -5.031 0.695 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 58 C CB . CYS 33 33 ? A 4.022 -6.602 -1.310 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 59 S SG . CYS 33 33 ? A 3.662 -7.170 -3.007 1 1 A CYS 0.620 1
ATOM 60 N N . PHE 34 34 ? A 3.603 -3.993 0.930 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 61 C CA . PHE 34 34 ? A 3.837 -3.390 2.229 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 62 C C . PHE 34 34 ? A 4.995 -2.380 2.205 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 63 O O . PHE 34 34 ? A 5.855 -2.352 3.081 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 64 C CB . PHE 34 34 ? A 3.846 -4.428 3.399 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 65 C CG . PHE 34 34 ? A 3.818 -3.789 4.773 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 66 C CD1 . PHE 34 34 ? A 4.871 -4.015 5.674 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 67 C CD2 . PHE 34 34 ? A 2.770 -2.946 5.178 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 68 C CE1 . PHE 34 34 ? A 4.873 -3.429 6.945 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 69 C CE2 . PHE 34 34 ? A 2.796 -2.319 6.430 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 70 C CZ . PHE 34 34 ? A 3.834 -2.580 7.326 1 1 A PHE 0.480 1
ATOM 71 N N . GLU 35 35 ? A 5.028 -1.477 1.192 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 72 C CA . GLU 35 35 ? A 6.081 -0.478 1.059 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 73 C C . GLU 35 35 ? A 6.088 0.639 2.114 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 74 O O . GLU 35 35 ? A 7.129 1.211 2.387 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 75 C CB . GLU 35 35 ? A 6.122 0.173 -0.359 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 76 C CG . GLU 35 35 ? A 4.823 0.870 -0.843 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 77 C CD . GLU 35 35 ? A 4.948 1.513 -2.228 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 78 O OE1 . GLU 35 35 ? A 5.739 2.466 -2.433 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 79 O OE2 . GLU 35 35 ? A 4.210 1.066 -3.147 1 1 A GLU 0.540 1
ATOM 80 N N . SER 36 36 ? A 4.907 0.912 2.731 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 81 C CA . SER 36 36 ? A 4.625 1.978 3.700 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 82 C C . SER 36 36 ? A 3.772 3.069 3.066 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 83 O O . SER 36 36 ? A 3.797 3.279 1.861 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 84 C CB . SER 36 36 ? A 5.824 2.583 4.498 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 85 O OG . SER 36 36 ? A 5.423 3.368 5.627 1 1 A SER 0.580 1
ATOM 86 N N . PHE 37 37 ? A 2.925 3.726 3.885 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 87 C CA . PHE 37 37 ? A 1.967 4.742 3.481 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 88 C C . PHE 37 37 ? A 2.586 6.028 2.938 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 89 O O . PHE 37 37 ? A 3.410 6.663 3.596 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 90 C CB . PHE 37 37 ? A 1.047 5.036 4.702 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 91 C CG . PHE 37 37 ? A 0.086 6.174 4.503 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 92 C CD1 . PHE 37 37 ? A -0.942 6.077 3.559 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 93 C CD2 . PHE 37 37 ? A 0.229 7.362 5.240 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 94 C CE1 . PHE 37 37 ? A -1.835 7.134 3.376 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 95 C CE2 . PHE 37 37 ? A -0.667 8.421 5.065 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 96 C CZ . PHE 37 37 ? A -1.704 8.301 4.138 1 1 A PHE 0.530 1
ATOM 97 N N . GLU 38 38 ? A 2.104 6.488 1.764 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 98 C CA . GLU 38 38 ? A 2.478 7.774 1.214 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 99 C C . GLU 38 38 ? A 1.441 8.178 0.182 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 100 O O . GLU 38 38 ? A 1.575 7.919 -1.009 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 101 C CB . GLU 38 38 ? A 3.891 7.786 0.571 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 102 C CG . GLU 38 38 ? A 4.344 9.172 0.036 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 103 C CD . GLU 38 38 ? A 5.733 9.189 -0.613 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 104 O OE1 . GLU 38 38 ? A 6.340 10.292 -0.596 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 105 O OE2 . GLU 38 38 ? A 6.163 8.155 -1.187 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 106 N N . ARG 39 39 ? A 0.359 8.861 0.631 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 107 C CA . ARG 39 39 ? A -0.862 9.081 -0.136 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 108 C C . ARG 39 39 ? A -0.793 9.895 -1.423 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 109 O O . ARG 39 39 ? A -1.787 10.079 -2.111 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 110 C CB . ARG 39 39 ? A -1.966 9.722 0.749 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 111 C CG . ARG 39 39 ? A -1.681 11.155 1.259 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 112 C CD . ARG 39 39 ? A -2.715 11.662 2.274 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 113 N NE . ARG 39 39 ? A -2.340 13.060 2.695 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 114 C CZ . ARG 39 39 ? A -1.468 13.370 3.667 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 115 N NH1 . ARG 39 39 ? A -0.802 12.437 4.340 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 116 N NH2 . ARG 39 39 ? A -1.248 14.650 3.969 1 1 A ARG 0.420 1
ATOM 117 N N . GLY 40 40 ? A 0.396 10.450 -1.743 1 1 A GLY 0.510 1
ATOM 118 C CA . GLY 40 40 ? A 0.678 11.022 -3.049 1 1 A GLY 0.510 1
ATOM 119 C C . GLY 40 40 ? A 0.942 9.982 -4.106 1 1 A GLY 0.510 1
ATOM 120 O O . GLY 40 40 ? A 0.882 10.275 -5.293 1 1 A GLY 0.510 1
ATOM 121 N N . ARG 41 41 ? A 1.262 8.737 -3.703 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 122 C CA . ARG 41 41 ? A 1.463 7.647 -4.626 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 123 C C . ARG 41 41 ? A 0.196 7.110 -5.262 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 124 O O . ARG 41 41 ? A -0.913 7.141 -4.727 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 125 C CB . ARG 41 41 ? A 2.337 6.519 -4.016 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 126 C CG . ARG 41 41 ? A 3.753 6.974 -3.594 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 127 C CD . ARG 41 41 ? A 4.594 7.678 -4.664 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 128 N NE . ARG 41 41 ? A 4.748 6.741 -5.829 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 129 C CZ . ARG 41 41 ? A 5.754 5.872 -5.968 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 130 N NH1 . ARG 41 41 ? A 6.681 5.743 -5.024 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 131 N NH2 . ARG 41 41 ? A 5.776 5.070 -7.029 1 1 A ARG 0.480 1
ATOM 132 N N . GLU 42 42 ? A 0.357 6.547 -6.457 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 133 C CA . GLU 42 42 ? A -0.652 5.957 -7.278 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 134 C C . GLU 42 42 ? A -1.197 4.629 -6.770 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 135 O O . GLU 42 42 ? A -2.296 4.217 -7.115 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 136 C CB . GLU 42 42 ? A -0.056 5.809 -8.702 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 137 C CG . GLU 42 42 ? A 1.189 4.868 -8.880 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 138 C CD . GLU 42 42 ? A 2.570 5.269 -8.285 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 139 O OE1 . GLU 42 42 ? A 3.501 4.414 -8.373 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 140 O OE2 . GLU 42 42 ? A 2.791 6.360 -7.714 1 1 A GLU 0.520 1
ATOM 141 N N . CYS 43 43 ? A -0.414 3.934 -5.924 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 142 C CA . CYS 43 43 ? A -0.869 2.784 -5.175 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 143 C C . CYS 43 43 ? A -0.446 2.993 -3.745 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 144 O O . CYS 43 43 ? A 0.752 3.035 -3.466 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 145 C CB . CYS 43 43 ? A -0.230 1.436 -5.648 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 146 S SG . CYS 43 43 ? A -0.663 -0.013 -4.606 1 1 A CYS 0.600 1
ATOM 147 N N . ASP 44 44 ? A -1.419 3.039 -2.816 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 148 C CA . ASP 44 44 ? A -1.188 2.790 -1.409 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 149 C C . ASP 44 44 ? A -1.049 1.274 -1.222 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 150 O O . ASP 44 44 ? A -1.983 0.553 -0.871 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 151 C CB . ASP 44 44 ? A -2.333 3.368 -0.527 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 152 C CG . ASP 44 44 ? A -2.395 4.893 -0.471 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 153 O OD1 . ASP 44 44 ? A -1.361 5.568 -0.698 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 154 O OD2 . ASP 44 44 ? A -3.502 5.405 -0.139 1 1 A ASP 0.570 1
ATOM 155 N N . CYS 45 45 ? A 0.139 0.712 -1.522 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 156 C CA . CYS 45 45 ? A 0.406 -0.717 -1.497 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 157 C C . CYS 45 45 ? A 0.792 -1.173 -0.078 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 158 O O . CYS 45 45 ? A 1.776 -1.882 0.135 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 159 C CB . CYS 45 45 ? A 1.505 -1.066 -2.548 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 160 S SG . CYS 45 45 ? A 0.985 -1.188 -4.314 1 1 A CYS 0.630 1
ATOM 161 N N . ASP 46 46 ? A -0.010 -0.784 0.936 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 162 C CA . ASP 46 46 ? A 0.355 -0.815 2.338 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 163 C C . ASP 46 46 ? A -0.845 -1.020 3.280 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 164 O O . ASP 46 46 ? A -1.988 -1.186 2.865 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 165 C CB . ASP 46 46 ? A 1.156 0.468 2.689 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 166 C CG . ASP 46 46 ? A 0.256 1.694 2.711 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 167 O OD1 . ASP 46 46 ? A -0.366 1.924 3.785 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 168 O OD2 . ASP 46 46 ? A 0.165 2.387 1.676 1 1 A ASP 0.580 1
ATOM 169 N N . ALA 47 47 ? A -0.576 -1.008 4.603 1 1 A ALA 0.600 1
ATOM 170 C CA . ALA 47 47 ? A -1.524 -1.232 5.676 1 1 A ALA 0.600 1
ATOM 171 C C . ALA 47 47 ? A -2.639 -0.194 5.853 1 1 A ALA 0.600 1
ATOM 172 O O . ALA 47 47 ? A -3.660 -0.486 6.474 1 1 A ALA 0.600 1
ATOM 173 C CB . ALA 47 47 ? A -0.741 -1.304 7.001 1 1 A ALA 0.600 1
ATOM 174 N N . GLN 48 48 ? A -2.504 1.054 5.348 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 175 C CA . GLN 48 48 ? A -3.472 2.093 5.670 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 176 C C . GLN 48 48 ? A -4.417 2.416 4.529 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 177 O O . GLN 48 48 ? A -5.307 3.256 4.659 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 178 C CB . GLN 48 48 ? A -2.749 3.371 6.135 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 179 C CG . GLN 48 48 ? A -1.969 3.182 7.461 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 180 C CD . GLN 48 48 ? A -2.844 2.757 8.653 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 181 O OE1 . GLN 48 48 ? A -3.878 3.315 9.011 1 1 A GLN 0.560 1
ATOM 182 N NE2 . GLN 48 48 ? A -2.387 1.674 9.341 1 1 A GLN 0.560 1
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C
N
O
S
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_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
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_ma_qa_metric_local.metric_id
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1 1 A 26 GLU 1 0.300
2 1 A 27 LEU 1 0.310
3 1 A 28 SER 1 0.530
4 1 A 29 CYS 1 0.580
5 1 A 30 LYS 1 0.500
6 1 A 31 GLY 1 0.530
7 1 A 32 ARG 1 0.500
8 1 A 33 CYS 1 0.620
9 1 A 34 PHE 1 0.480
10 1 A 35 GLU 1 0.540
11 1 A 36 SER 1 0.580
12 1 A 37 PHE 1 0.530
13 1 A 38 GLU 1 0.500
14 1 A 39 ARG 1 0.420
15 1 A 40 GLY 1 0.510
16 1 A 41 ARG 1 0.480
17 1 A 42 GLU 1 0.520
18 1 A 43 CYS 1 0.600
19 1 A 44 ASP 1 0.570
20 1 A 45 CYS 1 0.630
21 1 A 46 ASP 1 0.580
22 1 A 47 ALA 1 0.600
23 1 A 48 GLN 1 0.560
24 1 A 49 CYS 1 0.620
25 1 A 50 LYS 1 0.570
26 1 A 51 LYS 1 0.560
27 1 A 52 TYR 1 0.540
28 1 A 53 ASP 1 0.580
29 1 A 54 LYS 1 0.580
30 1 A 55 CYS 1 0.630
31 1 A 56 CYS 1 0.650
32 1 A 57 PRO 1 0.620
33 1 A 58 ASP 1 0.600
34 1 A 59 TYR 1 0.580
35 1 A 60 GLU 1 0.580
36 1 A 61 SER 1 0.600
37 1 A 62 PHE 1 0.580
38 1 A 63 CYS 1 0.550
39 1 A 64 ALA 1 0.520
40 1 A 65 GLU 1 0.420
41 1 A 66 VAL 1 0.270
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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