data_SMR-b364633e5cfdb9753584c1c2654f7d95_7 _entry.id SMR-b364633e5cfdb9753584c1c2654f7d95_7 _struct.entry_id SMR-b364633e5cfdb9753584c1c2654f7d95_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q7TP36/ SHRM2_RAT, Protein Shroom2 Estimated model accuracy of this model is 0.026, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q7TP36' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183834.580 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SHRM2_RAT Q7TP36 1 ;MRPSTVTSRIWWSESSSSSSHDLSGSWEHTSLQRTSDHFSSMGSIDSLDHSSQLYPSGHLSSAKSNSSID HLGGHSKRDSAYGSFSTCSSTPDHTLPKADASSTENILYKVGLWEASRPGSSRQSQSTGDPQGLQDRPSS FLPRVPGNSSKSPRPEDNIEPKIATSGRSNFGPVWYVPDKKKAPSPPPLGLPLRSDSFAVAARGHEKARG PPFSDLASMQHFTTLPHVQPRGDRRMETTDRQWKLAHPSSGKEIGNVGYQPEGHLDCRWLCSDDRAGRPS GAPGRHQFSLSSTDVHFLKSYHGSQHPQPCSDESPRFPSSPRELLRITPSGCLQEPPELSQDDNPAQVRW PGSVNQKLDDRGRSHYFSVPHRQPVHGSAHVLIPRSDYWHSDTTPVDLECPLLRPDQRGYPQQYEETPAS HERGGYQQLNAGIEGCCSGIHEPPRASHTVRAGLQCPGNDFKLVDAESGRISRQRTPMLHSLTQDGAWRP GNSKDCGNEKPPLLDAQVGKPTRRSDRFATTLRNEIQMRRAKLQKSKSTVTLAGDSEAEDCAGDWRVDVG AVPEGSFPSTYKEHLKEAQTRVLKATSFQRRDLDPTPADQYPGPPEHRTCDHSASSSLSSFPGEPDSAPR LCEAGLAKPPSSAGGVPHILRIGGRKRFTAEQKLKSYSEPEKINEVGLSGDHSPHPTIRTSEDSVGTFAD RWKFFEETSKSLLQKPGHRQAFCGIPREKAERPQTQGHECESTEPWFQKRSRATSCGEILSEDRKVEKAS EKLNPPRRLGTFAEYQASWKEQKKSLEARSSGRYHSADDILDAGLDQQQRPQYIHERSRSSPSTDHYSQE VPVEPNRQAEDSGGQKEALLCTLQAEEGCSAPSSSVLSSAQPQDSQHVNEDPTSPQPEAQLSSKCQHLQT STMETSRSPSPQFAPQKLTDKPPLLIHEDNSARYCPVTACYVFIPCRLQVFVAGALPQLQTLGIERVMDN NTTVKMVPIKIVHSESQPEKESRQSLACPAELPALPSGLEKDQIKTLSTSEQCYSRFCVYTRQEVETPHR ARPPEPQPPSTPAPPVRDSCSSPPSLNYGKAKEKTVDDLKSEELAREIVGKDKSLADILDPSVKIKTTMD LMEGIFPKDEYLLEEAQQRRKLLPKVPSPRVTEDNSCPSLSAICYNLGTRSKSVPVSQLIKIKILASSPR KQDPGMPGVVSLATNSTYYSTSAPKAELLIKMKDLQEPEEYSAGDLDHDLSIKKQELIDSISRKLQVLRE ARESLLEDIQANNALGDEVEAIVKDVCKPNEFDKFRMFIGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNNLDDSP SPGDRQSLLEKQRVLTQQHEDAKELKENLDRRERIVFDILATYLSEENLADYEHFVKMKSALIIEQRELE DKIHLGEEQLKCLFDSLQPERSK ; 'Protein Shroom2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1423 1 1423 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SHRM2_RAT Q7TP36 . 1 1423 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2003-10-01 13E5176B51C333C9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no S ;MRPSTVTSRIWWSESSSSSSHDLSGSWEHTSLQRTSDHFSSMGSIDSLDHSSQLYPSGHLSSAKSNSSID HLGGHSKRDSAYGSFSTCSSTPDHTLPKADASSTENILYKVGLWEASRPGSSRQSQSTGDPQGLQDRPSS FLPRVPGNSSKSPRPEDNIEPKIATSGRSNFGPVWYVPDKKKAPSPPPLGLPLRSDSFAVAARGHEKARG PPFSDLASMQHFTTLPHVQPRGDRRMETTDRQWKLAHPSSGKEIGNVGYQPEGHLDCRWLCSDDRAGRPS GAPGRHQFSLSSTDVHFLKSYHGSQHPQPCSDESPRFPSSPRELLRITPSGCLQEPPELSQDDNPAQVRW PGSVNQKLDDRGRSHYFSVPHRQPVHGSAHVLIPRSDYWHSDTTPVDLECPLLRPDQRGYPQQYEETPAS HERGGYQQLNAGIEGCCSGIHEPPRASHTVRAGLQCPGNDFKLVDAESGRISRQRTPMLHSLTQDGAWRP GNSKDCGNEKPPLLDAQVGKPTRRSDRFATTLRNEIQMRRAKLQKSKSTVTLAGDSEAEDCAGDWRVDVG AVPEGSFPSTYKEHLKEAQTRVLKATSFQRRDLDPTPADQYPGPPEHRTCDHSASSSLSSFPGEPDSAPR 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FLPRVPGNSSKSPRPEDNIEPKIATSGRSNFGPVWYVPDKKKAPSPPPLGLPLRSDSFAVAARGHEKARG PPFSDLASMQHFTTLPHVQPRGDRRMETTDRQWKLAHPSSGKEIGNVGYQPEGHLDCRWLCSDDRAGRPS GAPGRHQFSLSSTDVHFLKSYHGSQHPQPCSDESPRFPSSPRELLRITPSGCLQEPPELSQDDNPAQVRW PGSVNQKLDDRGRSHYFSVPHRQPVHGSAHVLIPRSDYWHSDTTPVDLECPLLRPDQRGYPQQYEETPAS HERGGYQQLNAGIEGCCSGIHEPPRASHTVRAGLQCPGNDFKLVDAESGRISRQRTPMLHSLTQDGAWRP GNSKDCGNEKPPLLDAQVGKPTRRSDRFATTLRNEIQMRRAKLQKSKSTVTLAGDSEAEDCAGDWRVDVG AVPEGSFPSTYKEHLKEAQTRVLKATSFQRRDLDPTPADQYPGPPEHRTCDHSASSSLSSFPGEPDSAPR LCEAGLAKPPSSAGGVPHILRIGGRKRFTAEQKLKSYSEPEKINEVGLSGDHSPHPTIRTSEDSVGTFAD RWKFFEETSKSLLQKPGHRQAFCGIPREKAERPQTQGHECESTEPWFQKRSRATSCGEILSEDRKVEKAS EKLNPPRRLGTFAEYQASWKEQKKSLEARSSGRYHSADDILDAGLDQQQRPQYIHERSRSSPSTDHYSQE VPVEPNRQAEDSGGQKEALLCTLQAEEGCSAPSSSVLSSAQPQDSQHVNEDPTSPQPEAQLSSKCQHLQT STMETSRSPSPQFAPQKLTDKPPLLIHEDNSARYCPVTACYVFIPCRLQVFVAGALPQLQTLGIERVMDN NTTVKMVPIKIVHSESQPEKESRQSLACPAELPALPSGLEKDQIKTLSTSEQCYSRFCVYTRQEVETPHR ARPPEPQPPSTPAPPVRDSCSSPPSLNYGKAKEKTVDDLKSEELAREIVGKDKSLADILDPSVKIKTTMD LMEGIFPKDEYLLEEAQQRRKLLPKVPSPRVTEDNSCPSLSAICYNLGTRSKSVPVSQLIKIKILASSPR KQDPGMPGVVSLATNSTYYSTSAPKAELLIKMKDLQEPEEYSAGDLDHDLSIKKQELIDSISRKLQVLRE ARESLLEDIQANNALGDEVEAIVKDVCKPNEFDKFRMFIGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNNLDDSP SPGDRQSLLEKQRVLTQQHEDAKELKENLDRRERIVFDILATYLSEENLADYEHFVKMKSALIIEQRELE DKIHLGEEQLKCLFDSLQPERSK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ARG . 1 3 PRO . 1 4 SER . 1 5 THR . 1 6 VAL . 1 7 THR . 1 8 SER . 1 9 ARG . 1 10 ILE . 1 11 TRP . 1 12 TRP . 1 13 SER . 1 14 GLU . 1 15 SER . 1 16 SER . 1 17 SER . 1 18 SER . 1 19 SER . 1 20 SER . 1 21 HIS . 1 22 ASP . 1 23 LEU . 1 24 SER . 1 25 GLY . 1 26 SER . 1 27 TRP . 1 28 GLU . 1 29 HIS . 1 30 THR . 1 31 SER . 1 32 LEU . 1 33 GLN . 1 34 ARG . 1 35 THR . 1 36 SER . 1 37 ASP . 1 38 HIS . 1 39 PHE . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 MET . 1 43 GLY . 1 44 SER . 1 45 ILE . 1 46 ASP . 1 47 SER . 1 48 LEU . 1 49 ASP . 1 50 HIS . 1 51 SER . 1 52 SER . 1 53 GLN . 1 54 LEU . 1 55 TYR . 1 56 PRO . 1 57 SER . 1 58 GLY . 1 59 HIS . 1 60 LEU . 1 61 SER . 1 62 SER . 1 63 ALA . 1 64 LYS . 1 65 SER . 1 66 ASN . 1 67 SER . 1 68 SER . 1 69 ILE . 1 70 ASP . 1 71 HIS . 1 72 LEU . 1 73 GLY . 1 74 GLY . 1 75 HIS . 1 76 SER . 1 77 LYS . 1 78 ARG . 1 79 ASP . 1 80 SER . 1 81 ALA . 1 82 TYR . 1 83 GLY . 1 84 SER . 1 85 PHE . 1 86 SER . 1 87 THR . 1 88 CYS . 1 89 SER . 1 90 SER . 1 91 THR . 1 92 PRO . 1 93 ASP . 1 94 HIS . 1 95 THR . 1 96 LEU . 1 97 PRO . 1 98 LYS . 1 99 ALA . 1 100 ASP . 1 101 ALA . 1 102 SER . 1 103 SER . 1 104 THR . 1 105 GLU . 1 106 ASN . 1 107 ILE . 1 108 LEU . 1 109 TYR . 1 110 LYS . 1 111 VAL . 1 112 GLY . 1 113 LEU . 1 114 TRP . 1 115 GLU . 1 116 ALA . 1 117 SER . 1 118 ARG . 1 119 PRO . 1 120 GLY . 1 121 SER . 1 122 SER . 1 123 ARG . 1 124 GLN . 1 125 SER . 1 126 GLN . 1 127 SER . 1 128 THR . 1 129 GLY . 1 130 ASP . 1 131 PRO . 1 132 GLN . 1 133 GLY . 1 134 LEU . 1 135 GLN . 1 136 ASP . 1 137 ARG . 1 138 PRO . 1 139 SER . 1 140 SER . 1 141 PHE . 1 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A 1 1278 GLU 1278 1278 GLU GLU S . A 1 1279 VAL 1279 1279 VAL VAL S . A 1 1280 GLU 1280 1280 GLU GLU S . A 1 1281 ALA 1281 1281 ALA ALA S . A 1 1282 ILE 1282 1282 ILE ILE S . A 1 1283 VAL 1283 1283 VAL VAL S . A 1 1284 LYS 1284 1284 LYS LYS S . A 1 1285 ASP 1285 1285 ASP ASP S . A 1 1286 VAL 1286 1286 VAL VAL S . A 1 1287 CYS 1287 1287 CYS CYS S . A 1 1288 LYS 1288 1288 LYS LYS S . A 1 1289 PRO 1289 1289 PRO PRO S . A 1 1290 ASN 1290 1290 ASN ASN S . A 1 1291 GLU 1291 1291 GLU GLU S . A 1 1292 PHE 1292 1292 PHE PHE S . A 1 1293 ASP 1293 1293 ASP ASP S . A 1 1294 LYS 1294 1294 LYS LYS S . A 1 1295 PHE 1295 1295 PHE PHE S . A 1 1296 ARG 1296 1296 ARG ARG S . A 1 1297 MET 1297 1297 MET MET S . A 1 1298 PHE 1298 1298 PHE PHE S . A 1 1299 ILE 1299 1299 ILE ILE S . A 1 1300 GLY 1300 1300 GLY GLY S . A 1 1301 ASP 1301 1301 ASP ASP S . A 1 1302 LEU 1302 1302 LEU LEU S . A 1 1303 ASP 1303 1303 ASP ASP S . A 1 1304 LYS 1304 1304 LYS LYS S . A 1 1305 VAL 1305 1305 VAL VAL S . A 1 1306 VAL 1306 1306 VAL VAL S . A 1 1307 ASN 1307 1307 ASN ASN S . A 1 1308 LEU 1308 1308 LEU LEU S . A 1 1309 LEU 1309 1309 LEU LEU S . A 1 1310 LEU 1310 1310 LEU LEU S . A 1 1311 SER 1311 1311 SER SER S . A 1 1312 LEU 1312 1312 LEU LEU S . A 1 1313 SER 1313 1313 SER SER S . A 1 1314 GLY 1314 1314 GLY GLY S . A 1 1315 ARG 1315 1315 ARG ARG S . A 1 1316 LEU 1316 1316 LEU LEU S . A 1 1317 ALA 1317 1317 ALA ALA S . A 1 1318 ARG 1318 1318 ARG ARG S . A 1 1319 VAL 1319 1319 VAL VAL S . A 1 1320 GLU 1320 1320 GLU GLU S . A 1 1321 ASN 1321 1321 ASN ASN S . A 1 1322 ALA 1322 1322 ALA ALA S . A 1 1323 LEU 1323 1323 LEU LEU S . A 1 1324 ASN 1324 1324 ASN ASN S . A 1 1325 ASN 1325 1325 ASN ASN S . A 1 1326 LEU 1326 1326 LEU LEU S . A 1 1327 ASP 1327 1327 ASP ASP S . A 1 1328 ASP 1328 1328 ASP ASP S . A 1 1329 SER 1329 1329 SER SER S . A 1 1330 PRO 1330 1330 PRO PRO S . A 1 1331 SER 1331 1331 SER SER S . A 1 1332 PRO 1332 1332 PRO PRO S . A 1 1333 GLY 1333 1333 GLY GLY S . A 1 1334 ASP 1334 1334 ASP ASP S . A 1 1335 ARG 1335 1335 ARG ARG S . A 1 1336 GLN 1336 1336 GLN GLN S . A 1 1337 SER 1337 1337 SER SER S . A 1 1338 LEU 1338 1338 LEU LEU S . A 1 1339 LEU 1339 1339 LEU LEU S . A 1 1340 GLU 1340 1340 GLU GLU S . A 1 1341 LYS 1341 1341 LYS LYS S . A 1 1342 GLN 1342 1342 GLN GLN S . A 1 1343 ARG 1343 1343 ARG ARG S . A 1 1344 VAL 1344 1344 VAL VAL S . A 1 1345 LEU 1345 1345 LEU LEU S . A 1 1346 THR 1346 1346 THR THR S . A 1 1347 GLN 1347 1347 GLN GLN S . A 1 1348 GLN 1348 1348 GLN GLN S . A 1 1349 HIS 1349 1349 HIS HIS S . A 1 1350 GLU 1350 1350 GLU GLU S . A 1 1351 ASP 1351 1351 ASP ASP S . A 1 1352 ALA 1352 1352 ALA ALA S . A 1 1353 LYS 1353 ? ? ? S . A 1 1354 GLU 1354 ? ? ? S . A 1 1355 LEU 1355 ? ? ? S . A 1 1356 LYS 1356 ? ? ? S . A 1 1357 GLU 1357 ? ? ? S . A 1 1358 ASN 1358 ? ? ? S . A 1 1359 LEU 1359 ? ? ? S . A 1 1360 ASP 1360 ? ? ? S . A 1 1361 ARG 1361 ? ? ? S . A 1 1362 ARG 1362 ? ? ? S . A 1 1363 GLU 1363 ? ? ? S . A 1 1364 ARG 1364 ? ? ? S . A 1 1365 ILE 1365 ? ? ? S . A 1 1366 VAL 1366 ? ? ? S . A 1 1367 PHE 1367 ? ? ? S . A 1 1368 ASP 1368 ? ? ? S . A 1 1369 ILE 1369 ? ? ? S . A 1 1370 LEU 1370 ? ? ? S . A 1 1371 ALA 1371 ? ? ? S . A 1 1372 THR 1372 ? ? ? S . A 1 1373 TYR 1373 ? ? ? S . A 1 1374 LEU 1374 ? ? ? S . A 1 1375 SER 1375 ? ? ? S . A 1 1376 GLU 1376 ? ? ? S . A 1 1377 GLU 1377 ? ? ? S . A 1 1378 ASN 1378 ? ? ? S . A 1 1379 LEU 1379 ? ? ? S . A 1 1380 ALA 1380 ? ? ? S . A 1 1381 ASP 1381 ? ? ? S . A 1 1382 TYR 1382 ? ? ? S . A 1 1383 GLU 1383 ? ? ? S . A 1 1384 HIS 1384 ? ? ? S . A 1 1385 PHE 1385 ? ? ? S . A 1 1386 VAL 1386 ? ? ? S . A 1 1387 LYS 1387 ? ? ? S . A 1 1388 MET 1388 ? ? ? S . A 1 1389 LYS 1389 ? ? ? S . A 1 1390 SER 1390 ? ? ? S . A 1 1391 ALA 1391 ? ? ? S . A 1 1392 LEU 1392 ? ? ? S . A 1 1393 ILE 1393 ? ? ? S . A 1 1394 ILE 1394 ? ? ? S . A 1 1395 GLU 1395 ? ? ? S . A 1 1396 GLN 1396 ? ? ? S . A 1 1397 ARG 1397 ? ? ? S . A 1 1398 GLU 1398 ? ? ? S . A 1 1399 LEU 1399 ? ? ? S . A 1 1400 GLU 1400 ? ? ? S . A 1 1401 ASP 1401 ? ? ? S . A 1 1402 LYS 1402 ? ? ? S . A 1 1403 ILE 1403 ? ? ? S . A 1 1404 HIS 1404 ? ? ? S . A 1 1405 LEU 1405 ? ? ? S . A 1 1406 GLY 1406 ? ? ? S . A 1 1407 GLU 1407 ? ? ? S . A 1 1408 GLU 1408 ? ? ? S . A 1 1409 GLN 1409 ? ? ? S . A 1 1410 LEU 1410 ? ? ? S . A 1 1411 LYS 1411 ? ? ? S . A 1 1412 CYS 1412 ? ? ? S . A 1 1413 LEU 1413 ? ? ? S . A 1 1414 PHE 1414 ? ? ? S . A 1 1415 ASP 1415 ? ? ? S . A 1 1416 SER 1416 ? ? ? S . A 1 1417 LEU 1417 ? ? ? S . A 1 1418 GLN 1418 ? ? ? S . A 1 1419 PRO 1419 ? ? ? S . A 1 1420 GLU 1420 ? ? ? S . A 1 1421 ARG 1421 ? ? ? S . A 1 1422 SER 1422 ? ? ? S . A 1 1423 LYS 1423 ? ? ? S . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7utl, label_asym_id=S, auth_asym_id=a, SMTL ID=7utl.1.S}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7utl, label_asym_id=S' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A S 2 1 a # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 102 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7utl 2022-09-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1423 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1425 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.800 21.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRPSTVTSRIWWSESSSSSSHDLSGSWEHTSLQRTSDHFSSMGSIDSLDHSSQLYPSGHLSSAKSNSSIDHLGGHSKRDSAYGSFSTCSSTPDHTLPKADASSTENILYKVGLWEASRPGSSRQSQSTGDPQGLQDRPSSFLPRVPGNSSKSPRPEDNIEPKIATSGRSNFGPVWYVPDKKKAPSPPPLGLPLRSDSFAVAARGHEKARGPPFSDLASMQHFTTLPHVQPRGDRRMETTDRQWKLAHPSSGKEIGNVGYQPEGHLDCRWLCSDDRAGRPSGAPGRHQFSLSSTDVHFLKSYHGSQHPQPCSDESPRFPSSPRELLRITPSGCLQEPPELSQDDNPAQVRWPGSVNQKLDDRGRSHYFSVPHRQPVHGSAHVLIPRSDYWHSDTTPVDLECPLLRPDQRGYPQQYEETPASHERGGYQQLNAGIEGCCSGIHEPPRASHTVRAGLQCPGNDFKLVDAESGRISRQRTPMLHSLTQDGAWRPGNSKDCGNEKPPLLDAQVGKPTRRSDRFATTLRNEIQMRRAKLQKSKSTVTLAGDSEAEDCAGDWRVDVGAVPEGSFPSTYKEHLKEAQTRVLKATSFQRRDLDPTPADQYPGPPEHRTCDHSASSSLSSFPGEPDSAPRLCEAGLAKPPSSAGGVPHILRIGGRKRFTAEQKLKSYSEPEKINEVGLSGDHSPHPTIRTSEDSVGTFADRWKFFEETSKSLLQKPGHRQAFCGIPREKAERPQTQGHECESTEPWFQKRSRATSCGEILSEDRKVEKASEKLNPPRRLGTFAEYQASWKEQKKSLEARSSGRYHSADDILDAGLDQQQRPQYIHERSRSSPSTDHYSQEVPVEPNRQAEDSGGQKEALLCTLQAEEGCSAPSSSVLSSAQPQDSQHVNEDPTSPQPEAQLSSKCQHLQTSTMETSRSPSPQFAPQKLTDKPPLLIHEDNSARYCPVTACYVFIPCRLQVFVAGALPQLQTLGIERVMDNNTTVKMVPIKIVHSESQPEKESRQSLACPAELPALPSGLEKDQIKTLSTSEQCYSRFCVYTRQEVETPHRARPPEPQPPSTPAPPVRDSCSSPPSLNYGKAKEKTVDDLKSEELAREIVGKDKSLADILDPSVKIKTTMDLMEGIFPKDEYLLEEAQQRRKLLPKVPSPRVTEDNSCPSLSAICYNLGTRSKSVPVSQLIKIKILASSPRKQDPGMPGVVSLATNSTYYSTSAPKAELLIKMKDLQEPEEYSAGDLDHDLSIKKQELIDSISRKLQVLREARESLLEDIQANNALGDEVEAIVKDVCK--PNEFDKFRMFIGDLDKVVNLLLSLSGRLARVENALNNLDDSPSPGDRQSLLEKQRVLTQQHEDAKELKENLDRRERIVFDILATYLSEENLADYEHFVKMKSALIIEQRELEDKIHLGEEQLKCLFDSLQPERSK 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDA-----EADVASLNRRIQLVEEELDRA----------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.093}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7utl.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 1275 1275 ? A 242.112 259.757 2.771 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 2 C CA . LEU 1275 1275 ? A 242.313 260.621 3.986 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 3 C C . LEU 1275 1275 ? A 241.203 261.612 4.250 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 4 O O . LEU 1275 1275 ? A 240.665 261.619 5.342 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 5 C CB . LEU 1275 1275 ? A 243.667 261.376 3.926 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 6 C CG . LEU 1275 1275 ? A 244.920 260.480 3.964 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 1275 1275 ? A 246.179 261.328 3.710 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 1275 1275 ? A 245.047 259.733 5.304 1 1 S LEU 0.480 1 ATOM 9 N N . GLY 1276 1276 ? A 240.805 262.468 3.267 1 1 S GLY 0.440 1 ATOM 10 C CA . GLY 1276 1276 ? A 239.777 263.480 3.512 1 1 S GLY 0.440 1 ATOM 11 C C . GLY 1276 1276 ? A 238.431 262.961 3.956 1 1 S GLY 0.440 1 ATOM 12 O O . GLY 1276 1276 ? A 237.891 263.459 4.930 1 1 S GLY 0.440 1 ATOM 13 N N . ASP 1277 1277 ? A 237.915 261.896 3.302 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 14 C CA . ASP 1277 1277 ? A 236.660 261.259 3.666 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 15 C C . ASP 1277 1277 ? A 236.658 260.660 5.070 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 16 O O . ASP 1277 1277 ? A 235.719 260.818 5.846 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 17 C CB . ASP 1277 1277 ? A 236.332 260.134 2.649 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 18 C CG . ASP 1277 1277 ? A 236.086 260.681 1.251 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 19 O OD1 . ASP 1277 1277 ? A 236.001 261.917 1.090 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 20 O OD2 . ASP 1277 1277 ? A 236.071 259.837 0.320 1 1 S ASP 0.510 1 ATOM 21 N N . GLU 1278 1278 ? A 237.765 259.973 5.445 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 22 C CA . GLU 1278 1278 ? A 237.979 259.470 6.788 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 23 C C . GLU 1278 1278 ? A 238.040 260.587 7.808 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 24 O O . GLU 1278 1278 ? A 237.348 260.530 8.813 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 25 C CB . GLU 1278 1278 ? A 239.254 258.610 6.881 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 26 C CG . GLU 1278 1278 ? A 239.137 257.281 6.104 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 27 C CD . GLU 1278 1278 ? A 240.455 256.514 6.075 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 28 O OE1 . GLU 1278 1278 ? A 241.505 257.121 6.412 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 29 O OE2 . GLU 1278 1278 ? A 240.420 255.347 5.617 1 1 S GLU 0.520 1 ATOM 30 N N . VAL 1279 1279 ? A 238.792 261.680 7.518 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 31 C CA . VAL 1279 1279 ? A 238.837 262.880 8.346 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 32 C C . VAL 1279 1279 ? A 237.449 263.470 8.546 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 33 O O . VAL 1279 1279 ? A 237.061 263.732 9.674 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 34 C CB . VAL 1279 1279 ? A 239.801 263.933 7.778 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 35 C CG1 . VAL 1279 1279 ? A 239.602 265.345 8.382 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 36 C CG2 . VAL 1279 1279 ? A 241.252 263.469 8.026 1 1 S VAL 0.540 1 ATOM 37 N N . GLU 1280 1280 ? A 236.634 263.619 7.476 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 38 C CA . GLU 1280 1280 ? A 235.274 264.117 7.584 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 39 C C . GLU 1280 1280 ? A 234.332 263.263 8.417 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 40 O O . GLU 1280 1280 ? A 233.579 263.772 9.247 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 41 C CB . GLU 1280 1280 ? A 234.646 264.331 6.196 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 42 C CG . GLU 1280 1280 ? A 235.168 265.609 5.511 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 43 C CD . GLU 1280 1280 ? A 234.177 266.079 4.455 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 44 O OE1 . GLU 1280 1280 ? A 234.140 265.478 3.357 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 45 O OE2 . GLU 1280 1280 ? A 233.426 267.040 4.770 1 1 S GLU 0.530 1 ATOM 46 N N . ALA 1281 1281 ? A 234.375 261.924 8.242 1 1 S ALA 0.490 1 ATOM 47 C CA . ALA 1281 1281 ? A 233.630 260.992 9.064 1 1 S ALA 0.490 1 ATOM 48 C C . ALA 1281 1281 ? A 234.033 261.058 10.534 1 1 S ALA 0.490 1 ATOM 49 O O . ALA 1281 1281 ? A 233.178 261.191 11.404 1 1 S ALA 0.490 1 ATOM 50 C CB . ALA 1281 1281 ? A 233.811 259.553 8.533 1 1 S ALA 0.490 1 ATOM 51 N N . ILE 1282 1282 ? A 235.361 261.074 10.813 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 52 C CA . ILE 1282 1282 ? A 235.927 261.238 12.147 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 53 C C . ILE 1282 1282 ? A 235.499 262.553 12.773 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 54 O O . ILE 1282 1282 ? A 235.014 262.572 13.896 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 55 C CB . ILE 1282 1282 ? A 237.463 261.158 12.125 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 56 C CG1 . ILE 1282 1282 ? A 237.931 259.726 11.766 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 57 C CG2 . ILE 1282 1282 ? A 238.103 261.607 13.467 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 58 C CD1 . ILE 1282 1282 ? A 239.413 259.645 11.364 1 1 S ILE 0.460 1 ATOM 59 N N . VAL 1283 1283 ? A 235.602 263.690 12.041 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 60 C CA . VAL 1283 1283 ? A 235.190 265.002 12.530 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 61 C C . VAL 1283 1283 ? A 233.719 265.043 12.883 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 62 O O . VAL 1283 1283 ? A 233.343 265.516 13.949 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 63 C CB . VAL 1283 1283 ? A 235.555 266.126 11.553 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 64 C CG1 . VAL 1283 1283 ? A 234.837 267.464 11.863 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 65 C CG2 . VAL 1283 1283 ? A 237.081 266.336 11.629 1 1 S VAL 0.430 1 ATOM 66 N N . LYS 1284 1284 ? A 232.838 264.484 12.032 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 67 C CA . LYS 1284 1284 ? A 231.422 264.433 12.330 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 68 C C . LYS 1284 1284 ? A 231.068 263.639 13.585 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 69 O O . LYS 1284 1284 ? A 230.249 264.070 14.388 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 70 C CB . LYS 1284 1284 ? A 230.672 263.772 11.163 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 71 C CG . LYS 1284 1284 ? A 229.140 263.775 11.310 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 72 C CD . LYS 1284 1284 ? A 228.466 262.711 10.435 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 73 C CE . LYS 1284 1284 ? A 228.865 262.813 8.964 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 74 N NZ . LYS 1284 1284 ? A 228.092 261.849 8.158 1 1 S LYS 0.410 1 ATOM 75 N N . ASP 1285 1285 ? A 231.689 262.449 13.758 1 1 S ASP 0.430 1 ATOM 76 C CA . ASP 1285 1285 ? A 231.551 261.628 14.942 1 1 S ASP 0.430 1 ATOM 77 C C . ASP 1285 1285 ? A 232.073 262.282 16.211 1 1 S ASP 0.430 1 ATOM 78 O O . ASP 1285 1285 ? A 231.411 262.233 17.248 1 1 S ASP 0.430 1 ATOM 79 C CB . ASP 1285 1285 ? 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A 230.315 266.696 17.592 1 1 S CYS 0.370 1 ATOM 93 O O . CYS 1287 1287 ? A 229.641 267.667 17.932 1 1 S CYS 0.370 1 ATOM 94 C CB . CYS 1287 1287 ? A 231.649 267.811 15.818 1 1 S CYS 0.370 1 ATOM 95 S SG . CYS 1287 1287 ? A 233.261 268.488 15.323 1 1 S CYS 0.370 1 ATOM 96 N N . LYS 1288 1288 ? A 229.828 265.443 17.696 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 97 C CA . LYS 1288 1288 ? A 228.552 265.117 18.296 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 98 C C . LYS 1288 1288 ? A 228.415 265.590 19.752 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 99 O O . LYS 1288 1288 ? A 229.284 265.308 20.576 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 100 C CB . LYS 1288 1288 ? A 228.314 263.591 18.300 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 101 C CG . LYS 1288 1288 ? A 228.040 263.001 16.916 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 102 C CD . LYS 1288 1288 ? A 227.806 261.484 16.966 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 103 C CE . LYS 1288 1288 ? A 227.564 260.890 15.575 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 104 N NZ . LYS 1288 1288 ? A 227.419 259.422 15.648 1 1 S LYS 0.300 1 ATOM 105 N N . PRO 1289 1289 ? 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A 230.834 264.313 38.214 1 1 S PHE 0.610 1 ATOM 197 C CZ . PHE 1298 1298 ? A 231.564 265.408 38.679 1 1 S PHE 0.610 1 ATOM 198 N N . ILE 1299 1299 ? A 226.770 268.386 36.515 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 199 C CA . ILE 1299 1299 ? A 226.487 269.654 37.184 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 200 C C . ILE 1299 1299 ? A 225.125 269.680 37.855 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 201 O O . ILE 1299 1299 ? A 225.003 270.060 39.010 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 202 C CB . ILE 1299 1299 ? A 226.670 270.842 36.239 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 203 C CG1 . ILE 1299 1299 ? A 228.153 270.927 35.798 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 204 C CG2 . ILE 1299 1299 ? A 226.215 272.171 36.903 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 205 C CD1 . ILE 1299 1299 ? A 228.379 271.889 34.626 1 1 S ILE 0.610 1 ATOM 206 N N . GLY 1300 1300 ? A 224.060 269.201 37.177 1 1 S GLY 0.620 1 ATOM 207 C CA . GLY 1300 1300 ? A 222.725 269.215 37.760 1 1 S GLY 0.620 1 ATOM 208 C C . GLY 1300 1300 ? A 222.553 268.371 38.997 1 1 S GLY 0.620 1 ATOM 209 O O . GLY 1300 1300 ? A 221.865 268.764 39.938 1 1 S GLY 0.620 1 ATOM 210 N N . ASP 1301 1301 ? A 223.211 267.195 39.020 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 211 C CA . ASP 1301 1301 ? A 223.358 266.364 40.189 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 212 C C . ASP 1301 1301 ? A 224.234 267.015 41.239 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 213 O O . ASP 1301 1301 ? A 223.842 267.027 42.400 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 214 C CB . ASP 1301 1301 ? A 223.880 264.951 39.827 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 215 C CG . ASP 1301 1301 ? A 222.821 264.158 39.074 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 216 O OD1 . ASP 1301 1301 ? A 221.620 264.544 39.136 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 217 O OD2 . ASP 1301 1301 ? A 223.194 263.114 38.482 1 1 S ASP 0.600 1 ATOM 218 N N . LEU 1302 1302 ? A 225.393 267.635 40.877 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 219 C CA . LEU 1302 1302 ? A 226.225 268.386 41.820 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 220 C C . LEU 1302 1302 ? A 225.416 269.420 42.589 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 221 O O . LEU 1302 1302 ? A 225.354 269.366 43.810 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 222 C CB . LEU 1302 1302 ? A 227.410 269.176 41.182 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 223 C CG . LEU 1302 1302 ? A 228.576 268.382 40.557 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 224 C CD1 . LEU 1302 1302 ? A 229.466 269.365 39.769 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 225 C CD2 . LEU 1302 1302 ? A 229.407 267.559 41.559 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 226 N N . ASP 1303 1303 ? A 224.713 270.327 41.881 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 227 C CA . ASP 1303 1303 ? A 223.966 271.418 42.470 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 228 C C . ASP 1303 1303 ? A 222.827 270.953 43.363 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 229 O O . ASP 1303 1303 ? A 222.628 271.427 44.483 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 230 C CB . ASP 1303 1303 ? A 223.351 272.299 41.356 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 231 C CG . ASP 1303 1303 ? A 224.396 272.984 40.490 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 232 O OD1 . ASP 1303 1303 ? A 225.594 272.986 40.867 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 233 O OD2 . ASP 1303 1303 ? A 223.973 273.542 39.445 1 1 S ASP 0.580 1 ATOM 234 N N . LYS 1304 1304 ? A 222.054 269.956 42.884 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 235 C CA . LYS 1304 1304 ? A 221.011 269.347 43.677 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 236 C C . LYS 1304 1304 ? A 221.532 268.632 44.912 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 237 O O . LYS 1304 1304 ? A 221.030 268.867 46.005 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 238 C CB . LYS 1304 1304 ? A 220.194 268.341 42.845 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 239 C CG . LYS 1304 1304 ? A 219.100 268.986 41.983 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 240 C CD . LYS 1304 1304 ? A 218.315 267.952 41.150 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 241 C CE . LYS 1304 1304 ? A 217.697 266.802 41.962 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 242 N NZ . LYS 1304 1304 ? A 217.192 265.734 41.071 1 1 S LYS 0.580 1 ATOM 243 N N . VAL 1305 1305 ? A 222.581 267.786 44.778 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 244 C CA . VAL 1305 1305 ? A 223.212 267.082 45.885 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 245 C C . VAL 1305 1305 ? A 223.793 268.060 46.894 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 246 O O . VAL 1305 1305 ? A 223.620 267.873 48.091 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 247 C CB . VAL 1305 1305 ? A 224.259 266.066 45.424 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 248 C CG1 . VAL 1305 1305 ? A 225.040 265.444 46.606 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 249 C CG2 . VAL 1305 1305 ? A 223.551 264.932 44.646 1 1 S VAL 0.630 1 ATOM 250 N N . VAL 1306 1306 ? A 224.438 269.164 46.448 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 251 C CA . VAL 1306 1306 ? A 224.956 270.213 47.327 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 252 C C . VAL 1306 1306 ? A 223.879 270.875 48.178 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 253 O O . VAL 1306 1306 ? A 224.012 270.981 49.397 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 254 C CB . VAL 1306 1306 ? A 225.700 271.285 46.524 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 255 C CG1 . VAL 1306 1306 ? A 225.927 272.605 47.303 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 256 C CG2 . VAL 1306 1306 ? A 227.066 270.718 46.090 1 1 S VAL 0.590 1 ATOM 257 N N . ASN 1307 1307 ? A 222.746 271.287 47.567 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 258 C CA . ASN 1307 1307 ? A 221.628 271.868 48.300 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 259 C C . ASN 1307 1307 ? A 220.954 270.887 49.259 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 260 O O . ASN 1307 1307 ? A 220.571 271.235 50.375 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 261 C CB . ASN 1307 1307 ? A 220.559 272.457 47.347 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 262 C CG . ASN 1307 1307 ? A 221.077 273.737 46.705 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 263 O OD1 . ASN 1307 1307 ? A 221.999 274.384 47.192 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 264 N ND2 . ASN 1307 1307 ? A 220.419 274.161 45.600 1 1 S ASN 0.630 1 ATOM 265 N N . LEU 1308 1308 ? A 220.809 269.614 48.832 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 266 C CA . LEU 1308 1308 ? A 220.365 268.513 49.670 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 267 C C . LEU 1308 1308 ? A 221.294 268.213 50.823 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 268 O O . LEU 1308 1308 ? A 220.835 267.913 51.920 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 269 C CB . LEU 1308 1308 ? A 220.171 267.207 48.872 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 270 C CG . LEU 1308 1308 ? A 219.008 267.230 47.866 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 271 C CD1 . LEU 1308 1308 ? A 219.062 265.965 46.992 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 272 C CD2 . LEU 1308 1308 ? A 217.636 267.395 48.544 1 1 S LEU 0.640 1 ATOM 273 N N . LEU 1309 1309 ? A 222.624 268.295 50.613 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 274 C CA . LEU 1309 1309 ? A 223.592 268.183 51.681 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 275 C C . LEU 1309 1309 ? A 223.463 269.288 52.716 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 276 O O . LEU 1309 1309 ? A 223.444 269.005 53.909 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 277 C CB . LEU 1309 1309 ? A 225.046 268.167 51.151 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 278 C CG . LEU 1309 1309 ? A 226.111 267.892 52.238 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 279 C CD1 . LEU 1309 1309 ? A 226.098 266.412 52.658 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 280 C CD2 . LEU 1309 1309 ? A 227.505 268.376 51.802 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 281 N N . LEU 1310 1310 ? A 223.313 270.569 52.295 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 282 C CA . LEU 1310 1310 ? A 223.110 271.674 53.219 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 283 C C . LEU 1310 1310 ? A 221.833 271.538 54.035 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 284 O O . LEU 1310 1310 ? A 221.793 271.781 55.239 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 285 C CB . LEU 1310 1310 ? A 223.060 273.040 52.493 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 286 C CG . LEU 1310 1310 ? A 222.881 274.249 53.447 1 1 S LEU 0.660 1 ATOM 287 C CD1 . LEU 1310 1310 ? 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A 221.249 264.963 55.470 1 1 S LEU 0.650 1 ATOM 301 C CD1 . LEU 1312 1312 ? A 219.930 264.421 56.054 1 1 S LEU 0.650 1 ATOM 302 C CD2 . LEU 1312 1312 ? A 221.922 263.915 54.569 1 1 S LEU 0.650 1 ATOM 303 N N . SER 1313 1313 ? A 222.492 268.515 56.491 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 304 C CA . SER 1313 1313 ? A 223.431 268.928 57.532 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 305 C C . SER 1313 1313 ? A 222.841 269.881 58.565 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 306 O O . SER 1313 1313 ? A 223.062 269.743 59.764 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 307 C CB . SER 1313 1313 ? A 224.747 269.527 56.954 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 308 O OG . SER 1313 1313 ? A 224.562 270.803 56.338 1 1 S SER 0.670 1 ATOM 309 N N . GLY 1314 1314 ? A 222.028 270.871 58.131 1 1 S GLY 0.680 1 ATOM 310 C CA . GLY 1314 1314 ? A 221.324 271.763 59.049 1 1 S GLY 0.680 1 ATOM 311 C C . GLY 1314 1314 ? A 220.221 271.108 59.842 1 1 S GLY 0.680 1 ATOM 312 O O . GLY 1314 1314 ? A 219.934 271.477 60.975 1 1 S GLY 0.680 1 ATOM 313 N N . ARG 1315 1315 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.514 2 1 3 0.026 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1275 LEU 1 0.480 2 1 A 1276 GLY 1 0.440 3 1 A 1277 ASP 1 0.510 4 1 A 1278 GLU 1 0.520 5 1 A 1279 VAL 1 0.540 6 1 A 1280 GLU 1 0.530 7 1 A 1281 ALA 1 0.490 8 1 A 1282 ILE 1 0.460 9 1 A 1283 VAL 1 0.430 10 1 A 1284 LYS 1 0.410 11 1 A 1285 ASP 1 0.430 12 1 A 1286 VAL 1 0.420 13 1 A 1287 CYS 1 0.370 14 1 A 1288 LYS 1 0.300 15 1 A 1289 PRO 1 0.390 16 1 A 1290 ASN 1 0.430 17 1 A 1291 GLU 1 0.410 18 1 A 1292 PHE 1 0.490 19 1 A 1293 ASP 1 0.560 20 1 A 1294 LYS 1 0.560 21 1 A 1295 PHE 1 0.560 22 1 A 1296 ARG 1 0.610 23 1 A 1297 MET 1 0.570 24 1 A 1298 PHE 1 0.610 25 1 A 1299 ILE 1 0.610 26 1 A 1300 GLY 1 0.620 27 1 A 1301 ASP 1 0.600 28 1 A 1302 LEU 1 0.640 29 1 A 1303 ASP 1 0.580 30 1 A 1304 LYS 1 0.580 31 1 A 1305 VAL 1 0.630 32 1 A 1306 VAL 1 0.590 33 1 A 1307 ASN 1 0.630 34 1 A 1308 LEU 1 0.640 35 1 A 1309 LEU 1 0.660 36 1 A 1310 LEU 1 0.660 37 1 A 1311 SER 1 0.690 38 1 A 1312 LEU 1 0.650 39 1 A 1313 SER 1 0.670 40 1 A 1314 GLY 1 0.680 41 1 A 1315 ARG 1 0.590 42 1 A 1316 LEU 1 0.650 43 1 A 1317 ALA 1 0.660 44 1 A 1318 ARG 1 0.580 45 1 A 1319 VAL 1 0.620 46 1 A 1320 GLU 1 0.570 47 1 A 1321 ASN 1 0.580 48 1 A 1322 ALA 1 0.490 49 1 A 1323 LEU 1 0.410 50 1 A 1324 ASN 1 0.400 51 1 A 1325 ASN 1 0.420 52 1 A 1326 LEU 1 0.370 53 1 A 1327 ASP 1 0.320 54 1 A 1328 ASP 1 0.310 55 1 A 1329 SER 1 0.310 56 1 A 1330 PRO 1 0.380 57 1 A 1331 SER 1 0.340 58 1 A 1332 PRO 1 0.380 59 1 A 1333 GLY 1 0.500 60 1 A 1334 ASP 1 0.420 61 1 A 1335 ARG 1 0.390 62 1 A 1336 GLN 1 0.420 63 1 A 1337 SER 1 0.530 64 1 A 1338 LEU 1 0.570 65 1 A 1339 LEU 1 0.530 66 1 A 1340 GLU 1 0.560 67 1 A 1341 LYS 1 0.640 68 1 A 1342 GLN 1 0.610 69 1 A 1343 ARG 1 0.580 70 1 A 1344 VAL 1 0.560 71 1 A 1345 LEU 1 0.570 72 1 A 1346 THR 1 0.540 73 1 A 1347 GLN 1 0.520 74 1 A 1348 GLN 1 0.490 75 1 A 1349 HIS 1 0.470 76 1 A 1350 GLU 1 0.520 77 1 A 1351 ASP 1 0.330 78 1 A 1352 ALA 1 0.300 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #