data_SMR-ad5736df2869443379c9653bbfe6d2d8_4 _entry.id SMR-ad5736df2869443379c9653bbfe6d2d8_4 _struct.entry_id SMR-ad5736df2869443379c9653bbfe6d2d8_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q04637 (isoform 3)/ IF4G1_HUMAN, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q04637 (isoform 3)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 184557.517 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP IF4G1_HUMAN Q04637 1 ;MNQPPQIAPKRERKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGARTASTPTPPQTGGGLEPQANGETPQVAVIVRPDD RSQGAIIADRPGLPGPEHSPSESQPSSPSPTPSPSPVLEPGSEPNLAVLSIPGDTMTTIQMSVEESTPIS RETGEPYRLSPEPTPLAEPILEVEVTLSKPVPESEFSSSPLQAPTPLASHTVEIHEPNGMVPSEDLEPEV ESSPELAPPPACPSESPVPIAPTAQPEELLNGAPSPPAVDLSPVSEPEEQAKEVTASMAPPTIPSATPAT APSATSPAQEEEMEEEEEEEEGEAGEAGEAESEKGGEELLPPESTPIPANLSQNLEAAAATQVAVSVPKR RRKIKELNKKEAVGDLLDAFKEANPAVPEVENQPPAGSNPGPESEGSGVPPRPEEADETWDSKEDKIHNA ENIQPGEQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLDP TRLQGINCGPDFTPSFANLGRTTLSTRGPPRGGPGGELPRGPAGLGPRRSQQGPRKEPRKIIATVLMTED IKLNKAEKAWKPSSKRTAADKDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERL KGVIDLIFEKAISEPNFSVAYANMCRCLMALKVPTTEKPTVTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKDDDEVFEKK QKEMDEAATAEERGRLKEELEEARDIARRRSLGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLEC LCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIIKEKKTSSRIRFMLQDVLDLRGSNWVPRRGDQGPKTIDQ IHKEAEMEEHREHIKVQQLMAKGSDKRRGGPPGPPISRGLPLVDDGGWNTVPISKGSRPIDTSRLTKITK PGSIDSNNQLFAPGGRLSWGKGSSGGSGAKPSDAASEAARPATSTLNRFSALQQAVPTESTDNRRVVQRS SLSRERGEKAGDRGDRLERSERGGDRGDRLDRARTPATKRSFSKEVEERSRERPSQPEGLRKAASLTEDR DRGRDAVKREAALPPVSPLKAALSEEELEKKSKAIIEEYLHLNDMKEAVQCVQELASPSLLFIFVRHGVE STLERSAIAREHMGQLLHQLLCAGHLSTAQYYQGLYEILELAEDMEIDIPHVWLYLAELVTPILQEGGVP MGELFREITKPLRPLGKAASLLLEILGLLCKSMGPKKVGTLWREAGLSWKEFLPEGQDIGAFVAEQKVEY TLGEESEAPGQRALPSEELNRQLEKLLKEGSSNQRVFDWIEANLSEQQIVSNTLVRALMTAVCYSAIIFE TPLRVDVAVLKARAKLLQKYLCDEQKELQALYALQALVVTLEQPPNLLRMFFDALYDEDVVKEDAFYSWE SSKDPAEQQGKGVALKSVTAFFKWLREAEEESDHN ; 'Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1435 1 1435 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . IF4G1_HUMAN Q04637 Q04637-3 1 1435 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-04-20 6F7E9DE4106E73B9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MNQPPQIAPKRERKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGARTASTPTPPQTGGGLEPQANGETPQVAVIVRPDD RSQGAIIADRPGLPGPEHSPSESQPSSPSPTPSPSPVLEPGSEPNLAVLSIPGDTMTTIQMSVEESTPIS RETGEPYRLSPEPTPLAEPILEVEVTLSKPVPESEFSSSPLQAPTPLASHTVEIHEPNGMVPSEDLEPEV ESSPELAPPPACPSESPVPIAPTAQPEELLNGAPSPPAVDLSPVSEPEEQAKEVTASMAPPTIPSATPAT APSATSPAQEEEMEEEEEEEEGEAGEAGEAESEKGGEELLPPESTPIPANLSQNLEAAAATQVAVSVPKR RRKIKELNKKEAVGDLLDAFKEANPAVPEVENQPPAGSNPGPESEGSGVPPRPEEADETWDSKEDKIHNA ENIQPGEQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLDP TRLQGINCGPDFTPSFANLGRTTLSTRGPPRGGPGGELPRGPAGLGPRRSQQGPRKEPRKIIATVLMTED IKLNKAEKAWKPSSKRTAADKDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERL 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RETGEPYRLSPEPTPLAEPILEVEVTLSKPVPESEFSSSPLQAPTPLASHTVEIHEPNGMVPSEDLEPEV ESSPELAPPPACPSESPVPIAPTAQPEELLNGAPSPPAVDLSPVSEPEEQAKEVTASMAPPTIPSATPAT APSATSPAQEEEMEEEEEEEEGEAGEAGEAESEKGGEELLPPESTPIPANLSQNLEAAAATQVAVSVPKR RRKIKELNKKEAVGDLLDAFKEANPAVPEVENQPPAGSNPGPESEGSGVPPRPEEADETWDSKEDKIHNA ENIQPGEQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLDP TRLQGINCGPDFTPSFANLGRTTLSTRGPPRGGPGGELPRGPAGLGPRRSQQGPRKEPRKIIATVLMTED IKLNKAEKAWKPSSKRTAADKDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERL KGVIDLIFEKAISEPNFSVAYANMCRCLMALKVPTTEKPTVTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKDDDEVFEKK QKEMDEAATAEERGRLKEELEEARDIARRRSLGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLEC LCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIIKEKKTSSRIRFMLQDVLDLRGSNWVPRRGDQGPKTIDQ IHKEAEMEEHREHIKVQQLMAKGSDKRRGGPPGPPISRGLPLVDDGGWNTVPISKGSRPIDTSRLTKITK PGSIDSNNQLFAPGGRLSWGKGSSGGSGAKPSDAASEAARPATSTLNRFSALQQAVPTESTDNRRVVQRS SLSRERGEKAGDRGDRLERSERGGDRGDRLDRARTPATKRSFSKEVEERSRERPSQPEGLRKAASLTEDR DRGRDAVKREAALPPVSPLKAALSEEELEKKSKAIIEEYLHLNDMKEAVQCVQELASPSLLFIFVRHGVE 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. 1 54 GLN . 1 55 ALA . 1 56 ASN . 1 57 GLY . 1 58 GLU . 1 59 THR . 1 60 PRO . 1 61 GLN . 1 62 VAL . 1 63 ALA . 1 64 VAL . 1 65 ILE . 1 66 VAL . 1 67 ARG . 1 68 PRO . 1 69 ASP . 1 70 ASP . 1 71 ARG . 1 72 SER . 1 73 GLN . 1 74 GLY . 1 75 ALA . 1 76 ILE . 1 77 ILE . 1 78 ALA . 1 79 ASP . 1 80 ARG . 1 81 PRO . 1 82 GLY . 1 83 LEU . 1 84 PRO . 1 85 GLY . 1 86 PRO . 1 87 GLU . 1 88 HIS . 1 89 SER . 1 90 PRO . 1 91 SER . 1 92 GLU . 1 93 SER . 1 94 GLN . 1 95 PRO . 1 96 SER . 1 97 SER . 1 98 PRO . 1 99 SER . 1 100 PRO . 1 101 THR . 1 102 PRO . 1 103 SER . 1 104 PRO . 1 105 SER . 1 106 PRO . 1 107 VAL . 1 108 LEU . 1 109 GLU . 1 110 PRO . 1 111 GLY . 1 112 SER . 1 113 GLU . 1 114 PRO . 1 115 ASN . 1 116 LEU . 1 117 ALA . 1 118 VAL . 1 119 LEU . 1 120 SER . 1 121 ILE . 1 122 PRO . 1 123 GLY . 1 124 ASP . 1 125 THR . 1 126 MET . 1 127 THR . 1 128 THR . 1 129 ILE . 1 130 GLN . 1 131 MET . 1 132 SER . 1 133 VAL . 1 134 GLU . 1 135 GLU . 1 136 SER . 1 137 THR . 1 138 PRO . 1 139 ILE . 1 140 SER . 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A 1 1271 GLN 1271 ? ? ? B . A 1 1272 ARG 1272 ? ? ? B . A 1 1273 ALA 1273 ? ? ? B . A 1 1274 LEU 1274 ? ? ? B . A 1 1275 PRO 1275 ? ? ? B . A 1 1276 SER 1276 ? ? ? B . A 1 1277 GLU 1277 ? ? ? B . A 1 1278 GLU 1278 ? ? ? B . A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? B . A 1 1280 ASN 1280 ? ? ? B . A 1 1281 ARG 1281 ? ? ? B . A 1 1282 GLN 1282 ? ? ? B . A 1 1283 LEU 1283 ? ? ? B . A 1 1284 GLU 1284 ? ? ? B . A 1 1285 LYS 1285 ? ? ? B . A 1 1286 LEU 1286 ? ? ? B . A 1 1287 LEU 1287 ? ? ? B . A 1 1288 LYS 1288 ? ? ? B . A 1 1289 GLU 1289 ? ? ? B . A 1 1290 GLY 1290 ? ? ? B . A 1 1291 SER 1291 ? ? ? B . A 1 1292 SER 1292 ? ? ? B . A 1 1293 ASN 1293 ? ? ? B . A 1 1294 GLN 1294 ? ? ? B . A 1 1295 ARG 1295 ? ? ? B . A 1 1296 VAL 1296 ? ? ? B . A 1 1297 PHE 1297 ? ? ? B . A 1 1298 ASP 1298 ? ? ? B . A 1 1299 TRP 1299 ? ? ? B . A 1 1300 ILE 1300 ? ? ? B . A 1 1301 GLU 1301 ? ? ? B . A 1 1302 ALA 1302 ? ? ? B . A 1 1303 ASN 1303 ? ? ? B . A 1 1304 LEU 1304 ? ? ? B . A 1 1305 SER 1305 ? ? ? B . A 1 1306 GLU 1306 ? ? ? B . A 1 1307 GLN 1307 ? ? ? B . A 1 1308 GLN 1308 ? ? ? B . A 1 1309 ILE 1309 ? ? ? B . A 1 1310 VAL 1310 ? ? ? B . A 1 1311 SER 1311 ? ? ? B . A 1 1312 ASN 1312 ? ? ? B . A 1 1313 THR 1313 ? ? ? B . A 1 1314 LEU 1314 ? ? ? B . A 1 1315 VAL 1315 ? ? ? B . A 1 1316 ARG 1316 ? ? ? B . A 1 1317 ALA 1317 ? ? ? B . A 1 1318 LEU 1318 ? ? ? B . A 1 1319 MET 1319 ? ? ? B . A 1 1320 THR 1320 ? ? ? B . A 1 1321 ALA 1321 ? ? ? B . A 1 1322 VAL 1322 ? ? ? B . A 1 1323 CYS 1323 ? ? ? B . A 1 1324 TYR 1324 ? ? ? B . A 1 1325 SER 1325 ? ? ? B . A 1 1326 ALA 1326 ? ? ? B . A 1 1327 ILE 1327 ? ? ? B . A 1 1328 ILE 1328 ? ? ? B . A 1 1329 PHE 1329 ? ? ? B . A 1 1330 GLU 1330 ? ? ? B . A 1 1331 THR 1331 ? ? ? B . A 1 1332 PRO 1332 ? ? ? B . A 1 1333 LEU 1333 ? ? ? B . A 1 1334 ARG 1334 ? ? ? B . A 1 1335 VAL 1335 ? ? ? B . A 1 1336 ASP 1336 ? ? ? B . A 1 1337 VAL 1337 ? ? ? B . A 1 1338 ALA 1338 ? ? ? B . A 1 1339 VAL 1339 ? ? ? B . A 1 1340 LEU 1340 ? ? ? B . A 1 1341 LYS 1341 ? ? ? B . A 1 1342 ALA 1342 ? ? ? B . A 1 1343 ARG 1343 ? ? ? B . A 1 1344 ALA 1344 ? ? ? B . A 1 1345 LYS 1345 ? ? ? B . A 1 1346 LEU 1346 ? ? ? B . A 1 1347 LEU 1347 ? ? ? B . A 1 1348 GLN 1348 ? ? ? B . A 1 1349 LYS 1349 ? ? ? B . A 1 1350 TYR 1350 ? ? ? B . A 1 1351 LEU 1351 ? ? ? B . A 1 1352 CYS 1352 ? ? ? B . A 1 1353 ASP 1353 ? ? ? B . A 1 1354 GLU 1354 ? ? ? B . A 1 1355 GLN 1355 ? ? ? B . A 1 1356 LYS 1356 ? ? ? B . A 1 1357 GLU 1357 ? ? ? B . A 1 1358 LEU 1358 ? ? ? B . A 1 1359 GLN 1359 ? ? ? B . A 1 1360 ALA 1360 ? ? ? B . A 1 1361 LEU 1361 ? ? ? B . A 1 1362 TYR 1362 ? ? ? B . A 1 1363 ALA 1363 ? ? ? B . A 1 1364 LEU 1364 ? ? ? B . A 1 1365 GLN 1365 ? ? ? B . A 1 1366 ALA 1366 ? ? ? B . A 1 1367 LEU 1367 ? ? ? B . A 1 1368 VAL 1368 ? ? ? B . A 1 1369 VAL 1369 ? ? ? B . A 1 1370 THR 1370 ? ? ? B . A 1 1371 LEU 1371 ? ? ? B . A 1 1372 GLU 1372 ? ? ? B . A 1 1373 GLN 1373 ? ? ? B . A 1 1374 PRO 1374 ? ? ? B . A 1 1375 PRO 1375 ? ? ? B . A 1 1376 ASN 1376 ? ? ? B . A 1 1377 LEU 1377 ? ? ? B . A 1 1378 LEU 1378 ? ? ? B . A 1 1379 ARG 1379 ? ? ? B . A 1 1380 MET 1380 ? ? ? B . A 1 1381 PHE 1381 ? ? ? B . A 1 1382 PHE 1382 ? ? ? B . A 1 1383 ASP 1383 ? ? ? B . A 1 1384 ALA 1384 ? ? ? B . A 1 1385 LEU 1385 ? ? ? B . A 1 1386 TYR 1386 ? ? ? B . A 1 1387 ASP 1387 ? ? ? B . A 1 1388 GLU 1388 ? ? ? B . A 1 1389 ASP 1389 ? ? ? B . A 1 1390 VAL 1390 ? ? ? B . A 1 1391 VAL 1391 ? ? ? B . A 1 1392 LYS 1392 ? ? ? B . A 1 1393 GLU 1393 ? ? ? B . A 1 1394 ASP 1394 ? ? ? B . A 1 1395 ALA 1395 ? ? ? B . A 1 1396 PHE 1396 ? ? ? B . A 1 1397 TYR 1397 ? ? ? B . A 1 1398 SER 1398 ? ? ? B . A 1 1399 TRP 1399 ? ? ? B . A 1 1400 GLU 1400 ? ? ? B . A 1 1401 SER 1401 ? ? ? B . A 1 1402 SER 1402 ? ? ? B . A 1 1403 LYS 1403 ? ? ? B . A 1 1404 ASP 1404 ? ? ? B . A 1 1405 PRO 1405 ? ? ? B . A 1 1406 ALA 1406 ? ? ? B . A 1 1407 GLU 1407 ? ? ? B . A 1 1408 GLN 1408 ? ? ? B . A 1 1409 GLN 1409 ? ? ? B . A 1 1410 GLY 1410 ? ? ? B . A 1 1411 LYS 1411 ? ? ? B . A 1 1412 GLY 1412 ? ? ? B . A 1 1413 VAL 1413 ? ? ? B . A 1 1414 ALA 1414 ? ? ? B . A 1 1415 LEU 1415 ? ? ? B . A 1 1416 LYS 1416 ? ? ? B . A 1 1417 SER 1417 ? ? ? B . A 1 1418 VAL 1418 ? ? ? B . A 1 1419 THR 1419 ? ? ? B . A 1 1420 ALA 1420 ? ? ? B . A 1 1421 PHE 1421 ? ? ? B . A 1 1422 PHE 1422 ? ? ? B . A 1 1423 LYS 1423 ? ? ? B . A 1 1424 TRP 1424 ? ? ? B . A 1 1425 LEU 1425 ? ? ? B . A 1 1426 ARG 1426 ? ? ? B . A 1 1427 GLU 1427 ? ? ? B . A 1 1428 ALA 1428 ? ? ? B . A 1 1429 GLU 1429 ? ? ? B . A 1 1430 GLU 1430 ? ? ? B . A 1 1431 GLU 1431 ? ? ? B . A 1 1432 SER 1432 ? ? ? B . A 1 1433 ASP 1433 ? ? ? B . A 1 1434 HIS 1434 ? ? ? B . A 1 1435 ASN 1435 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 {PDB ID=5t46, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5t46.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5t46, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GPHMQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLD GPHMQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLD # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 66 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5t46 2024-01-17 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1435 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1435 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.79e-35 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNQPPQIAPKRERKTIRIRDPNQGGKDITEEIMSGARTASTPTPPQTGGGLEPQANGETPQVAVIVRPDDRSQGAIIADRPGLPGPEHSPSESQPSSPSPTPSPSPVLEPGSEPNLAVLSIPGDTMTTIQMSVEESTPISRETGEPYRLSPEPTPLAEPILEVEVTLSKPVPESEFSSSPLQAPTPLASHTVEIHEPNGMVPSEDLEPEVESSPELAPPPACPSESPVPIAPTAQPEELLNGAPSPPAVDLSPVSEPEEQAKEVTASMAPPTIPSATPATAPSATSPAQEEEMEEEEEEEEGEAGEAGEAESEKGGEELLPPESTPIPANLSQNLEAAAATQVAVSVPKRRRKIKELNKKEAVGDLLDAFKEANPAVPEVENQPPAGSNPGPESEGSGVPPRPEEADETWDSKEDKIHNAENIQPGEQKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLDPTRLQGINCGPDFTPSFANLGRTTLSTRGPPRGGPGGELPRGPAGLGPRRSQQGPRKEPRKIIATVLMTEDIKLNKAEKAWKPSSKRTAADKDRGEEDADGSKTQDLFRRVRSILNKLTPQMFQQLMKQVTQLAIDTEERLKGVIDLIFEKAISEPNFSVAYANMCRCLMALKVPTTEKPTVTVNFRKLLLNRCQKEFEKDKDDDEVFEKKQKEMDEAATAEERGRLKEELEEARDIARRRSLGNIKFIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKIIKEKKTSSRIRFMLQDVLDLRGSNWVPRRGDQGPKTIDQIHKEAEMEEHREHIKVQQLMAKGSDKRRGGPPGPPISRGLPLVDDGGWNTVPISKGSRPIDTSRLTKITKPGSIDSNNQLFAPGGRLSWGKGSSGGSGAKPSDAASEAARPATSTLNRFSALQQAVPTESTDNRRVVQRSSLSRERGEKAGDRGDRLERSERGGDRGDRLDRARTPATKRSFSKEVEERSRERPSQPEGLRKAASLTEDRDRGRDAVKREAALPPVSPLKAALSEEELEKKSKAIIEEYLHLNDMKEAVQCVQELASPSLLFIFVRHGVESTLERSAIAREHMGQLLHQLLCAGHLSTAQYYQGLYEILELAEDMEIDIPHVWLYLAELVTPILQEGGVPMGELFREITKPLRPLGKAASLLLEILGLLCKSMGPKKVGTLWREAGLSWKEFLPEGQDIGAFVAEQKVEYTLGEESEAPGQRALPSEELNRQLEKLLKEGSSNQRVFDWIEANLSEQQIVSNTLVRALMTAVCYSAIIFETPLRVDVAVLKARAKLLQKYLCDEQKELQALYALQALVVTLEQPPNLLRMFFDALYDEDVVKEDAFYSWESSKDPAEQQGKGVALKSVTAFFKWLREAEEESDHN 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QKYEYKSDQWKPLNLEEKKRYDREFLLGFQFIFASMQKPEGLPHISDVVLDKANKTPLRPLD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5t46.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 444 444 ? A -31.190 40.842 65.304 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 2 C CA . GLU 444 444 ? A -30.761 40.491 66.695 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 3 C C . GLU 444 444 ? A -29.362 39.913 66.707 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 4 O O . GLU 444 444 ? A -29.034 39.074 65.864 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 5 C CB . GLU 444 444 ? A -31.776 39.505 67.290 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 6 C CG . GLU 444 444 ? A -31.656 39.368 68.825 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 7 C CD . GLU 444 444 ? A -32.800 38.515 69.364 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 444 444 ? A -33.646 38.091 68.536 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 444 444 ? A -32.828 38.316 70.600 1 1 B GLU 0.320 1 ATOM 10 N N . LYS 445 445 ? A -28.468 40.395 67.595 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 11 C CA . LYS 445 445 ? A -27.131 39.853 67.738 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 12 C C . LYS 445 445 ? A -27.150 38.602 68.581 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 13 O O . LYS 445 445 ? A -27.937 38.472 69.510 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 14 C CB . LYS 445 445 ? A -26.172 40.875 68.394 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 15 C CG . LYS 445 445 ? A -26.058 42.191 67.603 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 16 C CD . LYS 445 445 ? A -25.297 42.054 66.270 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 17 C CE . LYS 445 445 ? A -25.009 43.419 65.623 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 18 N NZ . LYS 445 445 ? A -24.200 43.266 64.391 1 1 B LYS 0.350 1 ATOM 19 N N . LYS 446 446 ? A -26.257 37.651 68.278 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 20 C CA . LYS 446 446 ? A -26.191 36.403 68.993 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 21 C C . LYS 446 446 ? A -25.235 36.585 70.149 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 22 O O . LYS 446 446 ? A -24.022 36.661 69.964 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 23 C CB . LYS 446 446 ? A -25.707 35.302 68.019 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 24 C CG . LYS 446 446 ? A -26.738 35.043 66.904 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 25 C CD . LYS 446 446 ? A -26.138 34.299 65.698 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 26 C CE . LYS 446 446 ? A -27.166 33.852 64.647 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 27 N NZ . LYS 446 446 ? A -27.785 35.028 63.997 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 28 N N . ARG 447 447 ? A -25.776 36.730 71.368 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 29 C CA . ARG 447 447 ? A -25.003 36.967 72.563 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 30 C C . ARG 447 447 ? A -25.323 35.885 73.554 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 31 O O . ARG 447 447 ? A -26.474 35.472 73.675 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 32 C CB . ARG 447 447 ? A -25.356 38.320 73.223 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 33 C CG . ARG 447 447 ? A -25.128 39.526 72.297 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 34 C CD . ARG 447 447 ? A -25.333 40.860 73.021 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 35 N NE . ARG 447 447 ? A -25.378 41.962 71.997 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 36 C CZ . ARG 447 447 ? A -24.318 42.443 71.330 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 37 N NH1 . ARG 447 447 ? A -24.486 43.463 70.490 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 38 N NH2 . ARG 447 447 ? A -23.099 41.948 71.489 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 39 N N . TYR 448 448 ? A -24.313 35.404 74.289 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 40 C CA . TYR 448 448 ? A -24.474 34.299 75.197 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 41 C C . TYR 448 448 ? A -23.734 34.641 76.458 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 42 O O . TYR 448 448 ? A -22.604 35.139 76.394 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 43 C CB . TYR 448 448 ? A -23.838 33.012 74.619 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 44 C CG . TYR 448 448 ? A -24.509 32.613 73.336 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 45 C CD1 . TYR 448 448 ? A -25.823 32.127 73.355 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 46 C CD2 . TYR 448 448 ? A -23.842 32.717 72.103 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 47 C CE1 . TYR 448 448 ? A -26.449 31.708 72.173 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 48 C CE2 . TYR 448 448 ? A -24.472 32.314 70.916 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 49 C CZ . TYR 448 448 ? A -25.775 31.804 70.954 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 50 O OH . TYR 448 448 ? A -26.404 31.386 69.765 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 51 N N . ASP 449 449 ? A -24.338 34.398 77.635 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 52 C CA . ASP 449 449 ? A -23.649 34.501 78.896 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 53 C C . ASP 449 449 ? A -22.758 33.278 79.124 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 54 O O . ASP 449 449 ? A -22.771 32.287 78.384 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 55 C CB . ASP 449 449 ? A -24.616 34.839 80.075 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 56 C CG . ASP 449 449 ? A -25.689 33.786 80.295 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 57 O OD1 . ASP 449 449 ? A -25.318 32.587 80.385 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 58 O OD2 . ASP 449 449 ? A -26.876 34.176 80.379 1 1 B ASP 0.600 1 ATOM 59 N N . ARG 450 450 ? A -21.891 33.344 80.144 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 60 C CA . ARG 450 450 ? A -20.963 32.283 80.464 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 61 C C . ARG 450 450 ? A -21.613 30.969 80.899 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 62 O O . ARG 450 450 ? A -21.137 29.905 80.537 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 63 C CB . ARG 450 450 ? A -19.915 32.744 81.516 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 64 C CG . ARG 450 450 ? A -20.458 32.933 82.960 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 65 C CD . ARG 450 450 ? A -19.473 33.525 83.979 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 66 N NE . ARG 450 450 ? A -18.218 32.690 83.937 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 67 C CZ . ARG 450 450 ? A -18.029 31.525 84.576 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 68 N NH1 . ARG 450 450 ? A -18.969 30.976 85.335 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 69 N NH2 . ARG 450 450 ? A -16.862 30.890 84.437 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 70 N N . GLU 451 451 ? A -22.712 31.028 81.696 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 71 C CA . GLU 451 451 ? A -23.436 29.878 82.203 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 72 C C . GLU 451 451 ? A -24.110 29.114 81.095 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 73 O O . GLU 451 451 ? A -24.011 27.888 81.034 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 74 C CB . GLU 451 451 ? A -24.490 30.298 83.251 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 75 C CG . GLU 451 451 ? A -23.845 30.813 84.559 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 76 C CD . GLU 451 451 ? A -24.835 30.951 85.713 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 77 O OE1 . GLU 451 451 ? A -26.045 30.678 85.535 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 78 O OE2 . GLU 451 451 ? A -24.330 31.313 86.809 1 1 B GLU 0.630 1 ATOM 79 N N . PHE 452 452 ? A -24.743 29.836 80.138 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 80 C CA . PHE 452 452 ? A -25.300 29.247 78.943 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 81 C C . PHE 452 452 ? A -24.236 28.501 78.138 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 82 O O . PHE 452 452 ? A -24.407 27.335 77.824 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 83 C CB . PHE 452 452 ? A -25.954 30.363 78.073 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 84 C CG . PHE 452 452 ? A -26.671 29.801 76.865 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 85 C CD1 . PHE 452 452 ? A -27.987 29.329 76.981 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 86 C CD2 . PHE 452 452 ? A -26.021 29.683 75.624 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 87 C CE1 . PHE 452 452 ? A -28.659 28.792 75.873 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 88 C CE2 . PHE 452 452 ? A -26.690 29.155 74.510 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 89 C CZ . PHE 452 452 ? A -28.016 28.723 74.631 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 90 N N . LEU 453 453 ? A -23.074 29.144 77.860 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 91 C CA . LEU 453 453 ? A -21.982 28.542 77.101 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 92 C C . LEU 453 453 ? A -21.360 27.315 77.750 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 93 O O . LEU 453 453 ? A -21.122 26.302 77.096 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 94 C CB . LEU 453 453 ? A -20.854 29.574 76.850 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 95 C CG . LEU 453 453 ? A -21.276 30.732 75.927 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 96 C CD1 . LEU 453 453 ? A -20.209 31.837 75.937 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 97 C CD2 . LEU 453 453 ? A -21.559 30.246 74.494 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 98 N N . LEU 454 454 ? A -21.113 27.373 79.075 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 99 C CA . LEU 454 454 ? A -20.564 26.284 79.866 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 100 C C . LEU 454 454 ? A -21.454 25.057 79.925 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 101 O O . LEU 454 454 ? A -20.972 23.932 79.969 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 102 C CB . LEU 454 454 ? A -20.233 26.753 81.301 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 103 C CG . LEU 454 454 ? A -18.983 27.653 81.359 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 104 C CD1 . LEU 454 454 ? A -18.916 28.376 82.713 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 105 C CD2 . LEU 454 454 ? A -17.698 26.844 81.098 1 1 B LEU 0.580 1 ATOM 106 N N . GLY 455 455 ? A -22.791 25.253 79.868 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 107 C CA . GLY 455 455 ? A -23.774 24.175 79.837 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 108 C C . GLY 455 455 ? A -23.672 23.252 78.638 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 109 O O . GLY 455 455 ? A -24.114 22.112 78.681 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 110 N N . PHE 456 456 ? A -23.050 23.725 77.535 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 111 C CA . PHE 456 456 ? A -22.879 22.959 76.315 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 112 C C . PHE 456 456 ? A -21.526 22.292 76.228 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 113 O O . PHE 456 456 ? A -21.252 21.634 75.231 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 114 C CB . PHE 456 456 ? A -22.933 23.855 75.050 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 115 C CG . PHE 456 456 ? A -24.334 24.292 74.821 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 116 C CD1 . PHE 456 456 ? A -25.238 23.488 74.117 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 117 C CD2 . PHE 456 456 ? A -24.766 25.504 75.349 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 118 C CE1 . PHE 456 456 ? A -26.558 23.911 73.913 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 119 C CE2 . PHE 456 456 ? A -26.097 25.901 75.219 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 120 C CZ . PHE 456 456 ? A -26.989 25.125 74.466 1 1 B PHE 0.540 1 ATOM 121 N N . GLN 457 457 ? A -20.621 22.405 77.225 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 122 C CA . GLN 457 457 ? A -19.264 21.891 77.066 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 123 C C . GLN 457 457 ? A -19.152 20.382 76.805 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 124 O O . GLN 457 457 ? A -18.348 19.931 76.007 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 125 C CB . GLN 457 457 ? A -18.348 22.276 78.259 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 126 C CG . GLN 457 457 ? A -16.889 21.784 78.058 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 127 C CD . GLN 457 457 ? A -15.901 22.298 79.107 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 128 O OE1 . GLN 457 457 ? A -16.204 22.988 80.064 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 129 N NE2 . GLN 457 457 ? A -14.613 21.920 78.882 1 1 B GLN 0.540 1 ATOM 130 N N . PHE 458 458 ? A -19.995 19.577 77.487 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 131 C CA . PHE 458 458 ? A -19.895 18.126 77.469 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 132 C C . PHE 458 458 ? A -21.117 17.465 76.881 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 133 O O . PHE 458 458 ? A -21.312 16.262 77.018 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 134 C CB . PHE 458 458 ? A -19.712 17.564 78.898 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 135 C CG . PHE 458 458 ? A -18.480 18.143 79.530 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 136 C CD1 . PHE 458 458 ? A -17.216 18.003 78.928 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 137 C CD2 . PHE 458 458 ? A -18.582 18.836 80.743 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 138 C CE1 . PHE 458 458 ? A -16.073 18.526 79.546 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 139 C CE2 . PHE 458 458 ? A -17.443 19.363 81.362 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 140 C CZ . PHE 458 458 ? A -16.186 19.200 80.768 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 141 N N . ILE 459 459 ? A -21.978 18.221 76.167 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 142 C CA . ILE 459 459 ? A -23.011 17.602 75.354 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 143 C C . ILE 459 459 ? A -22.367 16.861 74.191 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 144 O O . ILE 459 459 ? A -21.218 17.140 73.834 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 145 C CB . ILE 459 459 ? A -24.088 18.561 74.846 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 146 C CG1 . ILE 459 459 ? A -23.594 19.577 73.777 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 147 C CG2 . ILE 459 459 ? A -24.728 19.264 76.070 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 148 C CD1 . ILE 459 459 ? A -24.721 20.031 72.836 1 1 B ILE 0.500 1 ATOM 149 N N . PHE 460 460 ? A -23.054 15.890 73.556 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 150 C CA . PHE 460 460 ? A -22.448 15.004 72.574 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 151 C C . PHE 460 460 ? A -21.783 15.711 71.373 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 152 O O . PHE 460 460 ? A -20.712 15.335 70.945 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 153 C CB . PHE 460 460 ? A -23.458 13.897 72.108 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 154 C CG . PHE 460 460 ? A -24.466 14.404 71.088 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 155 C CD1 . PHE 460 460 ? A -25.623 15.108 71.467 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 156 C CD2 . PHE 460 460 ? A -24.175 14.286 69.715 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 157 C CE1 . PHE 460 460 ? A -26.468 15.674 70.500 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 158 C CE2 . PHE 460 460 ? A -25.007 14.862 68.748 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 159 C CZ . PHE 460 460 ? A -26.163 15.546 69.140 1 1 B PHE 0.480 1 ATOM 160 N N . ALA 461 461 ? A -22.427 16.797 70.859 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 161 C CA . ALA 461 461 ? A -21.994 17.593 69.725 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 162 C C . ALA 461 461 ? A -20.678 18.324 69.990 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 163 O O . ALA 461 461 ? A -19.898 18.592 69.094 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 164 C CB . ALA 461 461 ? A -23.110 18.606 69.357 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 165 N N . SER 462 462 ? A -20.388 18.605 71.281 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 166 C CA . SER 462 462 ? A -19.192 19.315 71.700 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 167 C C . SER 462 462 ? A -18.063 18.349 72.023 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 168 O O . SER 462 462 ? A -16.964 18.765 72.363 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 169 C CB . SER 462 462 ? A -19.456 20.136 72.987 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 170 O OG . SER 462 462 ? A -20.409 21.172 72.749 1 1 B SER 0.540 1 ATOM 171 N N . MET 463 463 ? A -18.302 17.019 71.895 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 172 C CA . MET 463 463 ? A -17.296 15.994 72.113 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 173 C C . MET 463 463 ? A -16.999 15.218 70.843 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 174 O O . MET 463 463 ? A -16.203 14.284 70.836 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 175 C CB . MET 463 463 ? A -17.770 15.000 73.206 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 176 C CG . MET 463 463 ? A -17.763 15.617 74.623 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 177 S SD . MET 463 463 ? A -16.123 16.181 75.200 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 178 C CE . MET 463 463 ? A -15.283 14.567 75.270 1 1 B MET 0.510 1 ATOM 179 N N . GLN 464 464 ? A -17.592 15.610 69.697 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 180 C CA . GLN 464 464 ? A -17.218 15.049 68.417 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 181 C C . GLN 464 464 ? A -15.944 15.727 67.974 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 182 O O . GLN 464 464 ? A -15.879 16.953 67.907 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 183 C CB . GLN 464 464 ? A -18.345 15.242 67.373 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 184 C CG . GLN 464 464 ? A -19.611 14.461 67.794 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 185 C CD . GLN 464 464 ? A -20.818 14.781 66.912 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 186 O OE1 . GLN 464 464 ? A -21.083 15.901 66.522 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 187 N NE2 . GLN 464 464 ? A -21.627 13.728 66.617 1 1 B GLN 0.570 1 ATOM 188 N N . LYS 465 465 ? A -14.866 14.951 67.722 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 189 C CA . LYS 465 465 ? A -13.585 15.518 67.341 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 190 C C . LYS 465 465 ? A -13.695 16.339 66.050 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 191 O O . LYS 465 465 ? A -14.289 15.833 65.100 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 192 C CB . LYS 465 465 ? A -12.482 14.431 67.177 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 193 C CG . LYS 465 465 ? A -11.082 15.023 66.910 1 1 B LYS 0.590 1 ATOM 194 C CD . 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A -2.279 12.459 69.193 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 293 O OD2 . ASP 478 478 ? A -2.092 12.602 66.987 1 1 B ASP 0.430 1 ATOM 294 O OXT . ASP 478 478 ? A -6.135 10.501 69.182 1 1 B ASP 0.430 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.522 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 444 GLU 1 0.320 2 1 A 445 LYS 1 0.350 3 1 A 446 LYS 1 0.510 4 1 A 447 ARG 1 0.520 5 1 A 448 TYR 1 0.540 6 1 A 449 ASP 1 0.600 7 1 A 450 ARG 1 0.570 8 1 A 451 GLU 1 0.630 9 1 A 452 PHE 1 0.590 10 1 A 453 LEU 1 0.590 11 1 A 454 LEU 1 0.580 12 1 A 455 GLY 1 0.610 13 1 A 456 PHE 1 0.540 14 1 A 457 GLN 1 0.540 15 1 A 458 PHE 1 0.480 16 1 A 459 ILE 1 0.500 17 1 A 460 PHE 1 0.480 18 1 A 461 ALA 1 0.550 19 1 A 462 SER 1 0.540 20 1 A 463 MET 1 0.510 21 1 A 464 GLN 1 0.570 22 1 A 465 LYS 1 0.590 23 1 A 466 PRO 1 0.560 24 1 A 467 GLU 1 0.480 25 1 A 468 GLY 1 0.520 26 1 A 469 LEU 1 0.560 27 1 A 470 PRO 1 0.550 28 1 A 471 HIS 1 0.530 29 1 A 472 ILE 1 0.460 30 1 A 473 SER 1 0.520 31 1 A 474 ASP 1 0.500 32 1 A 475 VAL 1 0.500 33 1 A 476 VAL 1 0.500 34 1 A 477 LEU 1 0.450 35 1 A 478 ASP 1 0.430 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #