data_SMR-348ba8fed252132be59524ae055f2bea_6 _entry.id SMR-348ba8fed252132be59524ae055f2bea_6 _struct.entry_id SMR-348ba8fed252132be59524ae055f2bea_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P55937 (isoform 1)/ GOGA3_MOUSE, Golgin subfamily A member 3 Estimated model accuracy of this model is 0.025, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P55937 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 189095.299 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GOGA3_MOUSE P55937 1 ;MDGASAKQDGLWESKSSSDVSSCPEASLETVGSLARLPDQQDTAQDASVEVNRGFKEEGSPDRSSQVAIC QNGQIPDLQLSLDPTTSPVGPDASTGSTASSLPLEKEEQVRLQARKRLEEQLMQYRVKRHRERSSQPATK MKLFSTLDPELMLNPENLPRASTVAVTKEYSFLRTSVPRGPKVGSLGLLAHSKEKKNSKSSKIRSLADYR TEDPSDSGGLGSTADAVGSSLKQSRSSTSVVSEVSPSSETDNRVESASMTGDSVSEADGNESDSSSHSSL SARGACGVLGNVGMPGTAYMVDGQEISAEALGQFPSIKDVLQAAAAQHQDQNQEANGEVRSRRDSICSSV SMESSLAEPQDELLQILKDKRRLEGQVEALSLEASQALQEKAELQAQLAALSTRLQAQVEHSHSSQQKQD SLSSEVDTLKQSCWDLGRAMTDLQSMLEAKNASLASSNNDLQVAEEQYQRLMAKVEDMQRNILSKDNTVH DLRQQMTALQSQLQQVQLERTTLTSKLQASQAEITSLQHARQWYQQQLTLAQEARVRLQGEMAHIQVGQM TQAGLLEHLKLENVSLSHQLTETQHRSIKEKERIAVQLQSIEADMLDQEAAFVQIREAKTMVEEDLQRRL EEFEGEREQLQKVADAAASLEQQLEQVKLTLFQRDQQLAALQQEHLDVIKQLTSTQEALQAKGQSLDDLH TRYDELQARLEELQREADSREDAIHFLQNEKIVLEVALQSAKSDKEELDRGARRLEEDTEETSGLLEQLR QDLAVKSNQVEHLQQETATLRKQMQKVKEQFVQQKVMVEAYRRDATSKDQLINELKATKKRLDSEMKELR QELIKLQGEKKTVEVEHSRLQKDMSLVHQQMAELEGHLQSVQKERDEMEIHLQSLKFDKEQMIALTEANE TLKKQIEELQQEAKKAITEQKQKMKRLGSDLTSAQKEMKTKHKAYENAVSILSRRLQEALASKEATDAEL NQLRAQSTGGSSDPVLHEKIRALEVELQNVGQSKILLEKELQEVITMTSQELEESREKVLELEDELQESR GFRRKIKRLEESNKKLALELEHERGKLTGLGQSNAALREHNSILETALAKREADLVQLNLQVQAVLQRKE EEDRQMKQLVQALQVSLEKEKMEVNSLKEQMAAARIEAGHNRRHFKAATLELSEVKKELQAKEHLVQTLQ AEVDELQIQDGKHSQEIAQFQTELAEARTQLQLLQKKLDEQMSQQPTGSQEMEDLKWELDQKEREIQSLK QQLDLTEQQGKKELEGTQQTLQTIKSELEMVQEDLSETQKDKFMLQAKVSELKNNMKTLLQQNQQLKLDL RRGAAKKKEPKGESNSSSPATPIKIPDCPVPASLLEELLRPPPAVSKEPLKNLNNCLQQLKQEMDSLQRQ MEEHTITVHESLSSWAQVEAAPAEHAHPRGDTKLHNQNSVPRDGLGQ ; 'Golgin subfamily A member 3' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1447 1 1447 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GOGA3_MOUSE P55937 P55937-1 1 1447 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2005-11-08 8BB68F2D142F8A9B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no H ;MDGASAKQDGLWESKSSSDVSSCPEASLETVGSLARLPDQQDTAQDASVEVNRGFKEEGSPDRSSQVAIC QNGQIPDLQLSLDPTTSPVGPDASTGSTASSLPLEKEEQVRLQARKRLEEQLMQYRVKRHRERSSQPATK MKLFSTLDPELMLNPENLPRASTVAVTKEYSFLRTSVPRGPKVGSLGLLAHSKEKKNSKSSKIRSLADYR TEDPSDSGGLGSTADAVGSSLKQSRSSTSVVSEVSPSSETDNRVESASMTGDSVSEADGNESDSSSHSSL SARGACGVLGNVGMPGTAYMVDGQEISAEALGQFPSIKDVLQAAAAQHQDQNQEANGEVRSRRDSICSSV SMESSLAEPQDELLQILKDKRRLEGQVEALSLEASQALQEKAELQAQLAALSTRLQAQVEHSHSSQQKQD SLSSEVDTLKQSCWDLGRAMTDLQSMLEAKNASLASSNNDLQVAEEQYQRLMAKVEDMQRNILSKDNTVH DLRQQMTALQSQLQQVQLERTTLTSKLQASQAEITSLQHARQWYQQQLTLAQEARVRLQGEMAHIQVGQM TQAGLLEHLKLENVSLSHQLTETQHRSIKEKERIAVQLQSIEADMLDQEAAFVQIREAKTMVEEDLQRRL 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. 1 53 ARG . 1 54 GLY . 1 55 PHE . 1 56 LYS . 1 57 GLU . 1 58 GLU . 1 59 GLY . 1 60 SER . 1 61 PRO . 1 62 ASP . 1 63 ARG . 1 64 SER . 1 65 SER . 1 66 GLN . 1 67 VAL . 1 68 ALA . 1 69 ILE . 1 70 CYS . 1 71 GLN . 1 72 ASN . 1 73 GLY . 1 74 GLN . 1 75 ILE . 1 76 PRO . 1 77 ASP . 1 78 LEU . 1 79 GLN . 1 80 LEU . 1 81 SER . 1 82 LEU . 1 83 ASP . 1 84 PRO . 1 85 THR . 1 86 THR . 1 87 SER . 1 88 PRO . 1 89 VAL . 1 90 GLY . 1 91 PRO . 1 92 ASP . 1 93 ALA . 1 94 SER . 1 95 THR . 1 96 GLY . 1 97 SER . 1 98 THR . 1 99 ALA . 1 100 SER . 1 101 SER . 1 102 LEU . 1 103 PRO . 1 104 LEU . 1 105 GLU . 1 106 LYS . 1 107 GLU . 1 108 GLU . 1 109 GLN . 1 110 VAL . 1 111 ARG . 1 112 LEU . 1 113 GLN . 1 114 ALA . 1 115 ARG . 1 116 LYS . 1 117 ARG . 1 118 LEU . 1 119 GLU . 1 120 GLU . 1 121 GLN . 1 122 LEU . 1 123 MET . 1 124 GLN . 1 125 TYR . 1 126 ARG . 1 127 VAL . 1 128 LYS . 1 129 ARG . 1 130 HIS . 1 131 ARG . 1 132 GLU . 1 133 ARG . 1 134 SER . 1 135 SER . 1 136 GLN . 1 137 PRO . 1 138 ALA . 1 139 THR . 1 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A 1 1208 ALA 1208 1208 ALA ALA H . A 1 1209 GLN 1209 1209 GLN GLN H . A 1 1210 PHE 1210 1210 PHE PHE H . A 1 1211 GLN 1211 1211 GLN GLN H . A 1 1212 THR 1212 1212 THR THR H . A 1 1213 GLU 1213 1213 GLU GLU H . A 1 1214 LEU 1214 1214 LEU LEU H . A 1 1215 ALA 1215 1215 ALA ALA H . A 1 1216 GLU 1216 1216 GLU GLU H . A 1 1217 ALA 1217 1217 ALA ALA H . A 1 1218 ARG 1218 1218 ARG ARG H . A 1 1219 THR 1219 1219 THR THR H . A 1 1220 GLN 1220 1220 GLN GLN H . A 1 1221 LEU 1221 1221 LEU LEU H . A 1 1222 GLN 1222 1222 GLN GLN H . A 1 1223 LEU 1223 1223 LEU LEU H . A 1 1224 LEU 1224 1224 LEU LEU H . A 1 1225 GLN 1225 1225 GLN GLN H . A 1 1226 LYS 1226 1226 LYS LYS H . A 1 1227 LYS 1227 1227 LYS LYS H . A 1 1228 LEU 1228 1228 LEU LEU H . A 1 1229 ASP 1229 1229 ASP ASP H . A 1 1230 GLU 1230 1230 GLU GLU H . A 1 1231 GLN 1231 1231 GLN GLN H . A 1 1232 MET 1232 1232 MET MET H . A 1 1233 SER 1233 1233 SER SER H . A 1 1234 GLN 1234 1234 GLN GLN H . A 1 1235 GLN 1235 1235 GLN GLN H . A 1 1236 PRO 1236 1236 PRO PRO H . A 1 1237 THR 1237 1237 THR THR H . A 1 1238 GLY 1238 1238 GLY GLY H . A 1 1239 SER 1239 1239 SER SER H . A 1 1240 GLN 1240 1240 GLN GLN H . A 1 1241 GLU 1241 1241 GLU GLU H . A 1 1242 MET 1242 1242 MET MET H . A 1 1243 GLU 1243 1243 GLU GLU H . A 1 1244 ASP 1244 1244 ASP ASP H . A 1 1245 LEU 1245 1245 LEU LEU H . A 1 1246 LYS 1246 1246 LYS LYS H . A 1 1247 TRP 1247 1247 TRP TRP H . A 1 1248 GLU 1248 1248 GLU GLU H . A 1 1249 LEU 1249 1249 LEU LEU H . A 1 1250 ASP 1250 1250 ASP ASP H . A 1 1251 GLN 1251 1251 GLN GLN H . A 1 1252 LYS 1252 1252 LYS LYS H . A 1 1253 GLU 1253 1253 GLU GLU H . A 1 1254 ARG 1254 1254 ARG ARG H . A 1 1255 GLU 1255 1255 GLU GLU H . A 1 1256 ILE 1256 1256 ILE ILE H . A 1 1257 GLN 1257 1257 GLN GLN H . A 1 1258 SER 1258 1258 SER SER H . A 1 1259 LEU 1259 1259 LEU LEU H . A 1 1260 LYS 1260 1260 LYS LYS H . A 1 1261 GLN 1261 1261 GLN GLN H . A 1 1262 GLN 1262 1262 GLN GLN H . A 1 1263 LEU 1263 1263 LEU LEU H . A 1 1264 ASP 1264 1264 ASP ASP H . A 1 1265 LEU 1265 1265 LEU LEU H . A 1 1266 THR 1266 1266 THR THR H . A 1 1267 GLU 1267 1267 GLU GLU H . A 1 1268 GLN 1268 1268 GLN GLN H . A 1 1269 GLN 1269 1269 GLN GLN H . A 1 1270 GLY 1270 1270 GLY GLY H . A 1 1271 LYS 1271 1271 LYS LYS H . A 1 1272 LYS 1272 1272 LYS LYS H . A 1 1273 GLU 1273 1273 GLU GLU H . A 1 1274 LEU 1274 1274 LEU LEU H . A 1 1275 GLU 1275 1275 GLU GLU H . A 1 1276 GLY 1276 1276 GLY GLY H . A 1 1277 THR 1277 1277 THR THR H . A 1 1278 GLN 1278 1278 GLN GLN H . A 1 1279 GLN 1279 1279 GLN GLN H . A 1 1280 THR 1280 1280 THR THR H . A 1 1281 LEU 1281 1281 LEU LEU H . A 1 1282 GLN 1282 1282 GLN GLN H . A 1 1283 THR 1283 1283 THR THR H . A 1 1284 ILE 1284 1284 ILE ILE H . A 1 1285 LYS 1285 1285 LYS LYS H . A 1 1286 SER 1286 1286 SER SER H . A 1 1287 GLU 1287 1287 GLU GLU H . A 1 1288 LEU 1288 1288 LEU LEU H . A 1 1289 GLU 1289 1289 GLU GLU H . A 1 1290 MET 1290 1290 MET MET H . A 1 1291 VAL 1291 1291 VAL VAL H . A 1 1292 GLN 1292 ? ? ? H . A 1 1293 GLU 1293 ? ? ? H . A 1 1294 ASP 1294 ? ? ? H . A 1 1295 LEU 1295 ? ? ? H . A 1 1296 SER 1296 ? ? ? H . A 1 1297 GLU 1297 ? ? ? H . A 1 1298 THR 1298 ? ? ? H . A 1 1299 GLN 1299 ? ? ? H . A 1 1300 LYS 1300 ? ? ? H . A 1 1301 ASP 1301 ? ? ? H . A 1 1302 LYS 1302 ? ? ? H . A 1 1303 PHE 1303 ? ? ? H . A 1 1304 MET 1304 ? ? ? H . A 1 1305 LEU 1305 ? ? ? H . A 1 1306 GLN 1306 ? ? ? H . A 1 1307 ALA 1307 ? ? ? H . A 1 1308 LYS 1308 ? ? ? H . A 1 1309 VAL 1309 ? ? ? H . A 1 1310 SER 1310 ? ? ? H . A 1 1311 GLU 1311 ? ? ? H . A 1 1312 LEU 1312 ? ? ? H . A 1 1313 LYS 1313 ? ? ? H . A 1 1314 ASN 1314 ? ? ? H . A 1 1315 ASN 1315 ? ? ? H . A 1 1316 MET 1316 ? ? ? H . A 1 1317 LYS 1317 ? ? ? H . A 1 1318 THR 1318 ? ? ? H . A 1 1319 LEU 1319 ? ? ? H . A 1 1320 LEU 1320 ? ? ? H . A 1 1321 GLN 1321 ? ? ? H . A 1 1322 GLN 1322 ? ? ? H . A 1 1323 ASN 1323 ? ? ? H . A 1 1324 GLN 1324 ? ? ? H . A 1 1325 GLN 1325 ? ? ? H . A 1 1326 LEU 1326 ? ? ? H . A 1 1327 LYS 1327 ? ? ? H . A 1 1328 LEU 1328 ? ? ? H . A 1 1329 ASP 1329 ? ? ? H . A 1 1330 LEU 1330 ? ? ? H . A 1 1331 ARG 1331 ? ? ? H . A 1 1332 ARG 1332 ? ? ? H . A 1 1333 GLY 1333 ? ? ? H . A 1 1334 ALA 1334 ? ? ? H . A 1 1335 ALA 1335 ? ? ? H . A 1 1336 LYS 1336 ? ? ? H . A 1 1337 LYS 1337 ? ? ? H . A 1 1338 LYS 1338 ? ? ? H . A 1 1339 GLU 1339 ? ? ? H . A 1 1340 PRO 1340 ? ? ? H . A 1 1341 LYS 1341 ? ? ? H . A 1 1342 GLY 1342 ? ? ? H . A 1 1343 GLU 1343 ? ? ? H . A 1 1344 SER 1344 ? ? ? H . A 1 1345 ASN 1345 ? ? ? H . A 1 1346 SER 1346 ? ? ? H . A 1 1347 SER 1347 ? ? ? H . A 1 1348 SER 1348 ? ? ? H . A 1 1349 PRO 1349 ? ? ? H . A 1 1350 ALA 1350 ? ? ? H . A 1 1351 THR 1351 ? ? ? H . A 1 1352 PRO 1352 ? ? ? H . A 1 1353 ILE 1353 ? ? ? H . A 1 1354 LYS 1354 ? ? ? H . A 1 1355 ILE 1355 ? ? ? H . A 1 1356 PRO 1356 ? ? ? H . A 1 1357 ASP 1357 ? ? ? H . A 1 1358 CYS 1358 ? ? ? H . A 1 1359 PRO 1359 ? ? ? H . A 1 1360 VAL 1360 ? ? ? H . A 1 1361 PRO 1361 ? ? ? H . 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A 1 1397 LEU 1397 ? ? ? H . A 1 1398 GLN 1398 ? ? ? H . A 1 1399 ARG 1399 ? ? ? H . A 1 1400 GLN 1400 ? ? ? H . A 1 1401 MET 1401 ? ? ? H . A 1 1402 GLU 1402 ? ? ? H . A 1 1403 GLU 1403 ? ? ? H . A 1 1404 HIS 1404 ? ? ? H . A 1 1405 THR 1405 ? ? ? H . A 1 1406 ILE 1406 ? ? ? H . A 1 1407 THR 1407 ? ? ? H . A 1 1408 VAL 1408 ? ? ? H . A 1 1409 HIS 1409 ? ? ? H . A 1 1410 GLU 1410 ? ? ? H . A 1 1411 SER 1411 ? ? ? H . A 1 1412 LEU 1412 ? ? ? H . A 1 1413 SER 1413 ? ? ? H . A 1 1414 SER 1414 ? ? ? H . A 1 1415 TRP 1415 ? ? ? H . A 1 1416 ALA 1416 ? ? ? H . A 1 1417 GLN 1417 ? ? ? H . A 1 1418 VAL 1418 ? ? ? H . A 1 1419 GLU 1419 ? ? ? H . A 1 1420 ALA 1420 ? ? ? H . A 1 1421 ALA 1421 ? ? ? H . A 1 1422 PRO 1422 ? ? ? H . A 1 1423 ALA 1423 ? ? ? H . A 1 1424 GLU 1424 ? ? ? H . A 1 1425 HIS 1425 ? ? ? H . A 1 1426 ALA 1426 ? ? ? H . A 1 1427 HIS 1427 ? ? ? H . A 1 1428 PRO 1428 ? ? ? H . A 1 1429 ARG 1429 ? ? ? H . A 1 1430 GLY 1430 ? ? ? H . A 1 1431 ASP 1431 ? ? ? H . A 1 1432 THR 1432 ? ? ? H . A 1 1433 LYS 1433 ? ? ? H . A 1 1434 LEU 1434 ? ? ? H . A 1 1435 HIS 1435 ? ? ? H . A 1 1436 ASN 1436 ? ? ? H . A 1 1437 GLN 1437 ? ? ? H . A 1 1438 ASN 1438 ? ? ? H . A 1 1439 SER 1439 ? ? ? H . A 1 1440 VAL 1440 ? ? ? H . A 1 1441 PRO 1441 ? ? ? H . A 1 1442 ARG 1442 ? ? ? H . A 1 1443 ASP 1443 ? ? ? H . A 1 1444 GLY 1444 ? ? ? H . A 1 1445 LEU 1445 ? ? ? H . A 1 1446 GLY 1446 ? ? ? H . A 1 1447 GLN 1447 ? ? ? H . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=8zbk, label_asym_id=H, auth_asym_id=R, SMTL ID=8zbk.1.H}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8zbk, label_asym_id=H' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A H 3 1 R # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;QLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKY EEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKL KEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAI ; ;QLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKY EEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKL KEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 93 171 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8zbk 2025-01-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1447 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1450 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.270 18.421 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDGASAKQDGLWESKSSSDVSSCPEASLETVGSLARLPDQQDTAQDASVEVNRGFKEEGSPDRSSQVAICQNGQIPDLQLSLDPTTSPVGPDASTGSTASSLPLEKEEQVRLQARKRLEEQLMQYRVKRHRERSSQPATKMKLFSTLDPELMLNPENLPRASTVAVTKEYSFLRTSVPRGPKVGSLGLLAHSKEKKNSKSSKIRSLADYRTEDPSDSGGLGSTADAVGSSLKQSRSSTSVVSEVSPSSETDNRVESASMTGDSVSEADGNESDSSSHSSLSARGACGVLGNVGMPGTAYMVDGQEISAEALGQFPSIKDVLQAAAAQHQDQNQEANGEVRSRRDSICSSVSMESSLAEPQDELLQILKDKRRLEGQVEALSLEASQALQEKAELQAQLAALSTRLQAQVEHSHSSQQKQDSLSSEVDTLKQSCWDLGRAMTDLQSMLEAKNASLASSNNDLQVAEEQYQRLMAKVEDMQRNILSKDNTVHDLRQQMTALQSQLQQVQLERTTLTSKLQASQAEITSLQHARQWYQQQLTLAQEARVRLQGEMAHIQVGQMTQAGLLEHLKLENVSLSHQLTETQHRSIKEKERIAVQLQSIEADMLDQEAAFVQIREAKTMVEEDLQRRLEEFEGEREQLQKVADAAASLEQQLEQVKLTLFQRDQQLAALQQEHLDVIKQLTSTQEALQAKGQSLDDLHTRYDELQARLEELQREADSREDAIHFLQNEKIVLEVALQSAKSDKEELDRGARRLEEDTEETSGLLEQLRQDLAVKSNQVEHLQQETATLRKQMQKVKEQFVQQKVMVEAYRRDATSKDQLINELKATKKRLDSEMKELRQELIKLQGEKKTVEVEHSRLQKDMSLVHQQMAELEGHLQSVQKERDEMEIHLQSLKFDKEQMIALTEANETLKKQIEELQQEAKKAITEQKQKMKRLGSDLTSAQKEMKTKHKAYENAVSILSRRLQEALASKEATDAELNQLRAQSTGGSSDPVLHEKIRALEVELQNVGQSKILLEKELQEVITMTSQELEESREKVLELEDELQESRGFRRKIKRLEESNKKLALELEHERGKLTGLGQSNAALREHNSILETALAKREADLVQLNLQVQAVLQRKEEEDRQMKQLVQALQVSLEKEKMEVNSLKEQMAAARIEAGHNRRHFKAATLELSEVKKELQAKEHLVQTLQAEVDELQIQDGKHSQEIAQFQTELAEARTQLQLLQKKLDEQMSQQPTGSQEMEDLKWELDQKEREIQSLKQQLDLTEQQ---GKKELEGTQQTLQTIKSELEMVQEDLSETQKDKFMLQAKVSELKNNMKTLLQQNQQLKLDLRRGAAKKKEPKGESNSSSPATPIKIPDCPVPASLLEELLRPPPAVSKEPLKNLNNCLQQLKQEMDSLQRQMEEHTITVHESLSSWAQVEAAPAEHAHPRGDTKLHNQNSVPRDGLGQ 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKE--------------DKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.237}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8zbk.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 1202 1202 ? A 214.145 226.597 212.259 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 2 C CA . LYS 1202 1202 ? A 213.601 226.955 210.909 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 3 C C . LYS 1202 1202 ? A 214.718 227.361 209.976 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 4 O O . LYS 1202 1202 ? A 215.179 226.507 209.230 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 5 C CB . LYS 1202 1202 ? A 212.473 228.007 211.049 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 6 C CG . LYS 1202 1202 ? A 211.760 228.274 209.715 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 7 C CD . LYS 1202 1202 ? A 210.574 229.246 209.812 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 8 C CE . LYS 1202 1202 ? A 209.830 229.442 208.480 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 9 N NZ . LYS 1202 1202 ? A 210.731 229.922 207.413 1 1 H LYS 0.300 1 ATOM 10 N N . HIS 1203 1203 ? A 215.241 228.607 210.072 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 11 C CA . HIS 1203 1203 ? A 216.321 229.145 209.244 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 12 C C . HIS 1203 1203 ? A 217.448 228.186 208.886 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 13 O O . HIS 1203 1203 ? A 217.596 227.810 207.735 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 14 C CB . HIS 1203 1203 ? A 216.965 230.386 209.908 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 15 C CG . HIS 1203 1203 ? A 216.013 231.527 210.081 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 16 N ND1 . HIS 1203 1203 ? A 215.574 232.169 208.948 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 17 C CD2 . HIS 1203 1203 ? A 215.515 232.136 211.190 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 18 C CE1 . HIS 1203 1203 ? A 214.829 233.165 209.374 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 19 N NE2 . HIS 1203 1203 ? A 214.755 233.191 210.727 1 1 H HIS 0.380 1 ATOM 20 N N . SER 1204 1204 ? A 218.228 227.682 209.865 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 21 C CA . SER 1204 1204 ? A 219.359 226.784 209.628 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 22 C C . SER 1204 1204 ? A 219.022 225.513 208.864 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 23 O O . SER 1204 1204 ? A 219.799 225.041 208.040 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 24 C CB . SER 1204 1204 ? A 220.028 226.352 210.954 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 25 O OG . SER 1204 1204 ? A 220.270 227.491 211.777 1 1 H SER 0.490 1 ATOM 26 N N . GLN 1205 1205 ? A 217.831 224.932 209.108 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 27 C CA . GLN 1205 1205 ? A 217.332 223.800 208.345 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 28 C C . GLN 1205 1205 ? A 217.042 224.137 206.884 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 29 O O . GLN 1205 1205 ? A 217.501 223.453 205.975 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 30 C CB . GLN 1205 1205 ? A 216.043 223.276 209.024 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 31 C CG . GLN 1205 1205 ? A 215.425 222.010 208.391 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 32 C CD . GLN 1205 1205 ? A 216.356 220.798 208.403 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 33 O OE1 . GLN 1205 1205 ? A 216.651 220.228 207.354 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 34 N NE2 . GLN 1205 1205 ? A 216.813 220.380 209.605 1 1 H GLN 0.490 1 ATOM 35 N N . GLU 1206 1206 ? A 216.328 225.256 206.632 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 36 C CA . GLU 1206 1206 ? A 216.063 225.777 205.297 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 37 C C . GLU 1206 1206 ? A 217.363 226.132 204.572 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 38 O O . GLU 1206 1206 ? A 217.587 225.737 203.429 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 39 C CB . GLU 1206 1206 ? A 215.132 227.029 205.378 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 40 C CG . GLU 1206 1206 ? A 213.667 226.719 205.797 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 41 C CD . GLU 1206 1206 ? A 212.857 227.871 206.377 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 1206 1206 ? A 213.361 228.966 206.727 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 1206 1206 ? A 211.631 227.647 206.563 1 1 H GLU 0.500 1 ATOM 44 N N . ILE 1207 1207 ? A 218.305 226.812 205.254 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 45 C CA . ILE 1207 1207 ? A 219.631 227.168 204.754 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 46 C C . ILE 1207 1207 ? A 220.461 225.951 204.350 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 47 O O . ILE 1207 1207 ? A 221.038 225.933 203.269 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 48 C CB . ILE 1207 1207 ? A 220.393 228.021 205.778 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 49 C CG1 . ILE 1207 1207 ? A 219.684 229.377 206.015 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 50 C CG2 . ILE 1207 1207 ? A 221.851 228.282 205.338 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 51 C CD1 . ILE 1207 1207 ? A 220.147 230.104 207.285 1 1 H ILE 0.480 1 ATOM 52 N N . ALA 1208 1208 ? A 220.519 224.871 205.157 1 1 H ALA 0.590 1 ATOM 53 C CA . ALA 1208 1208 ? A 221.171 223.633 204.754 1 1 H ALA 0.590 1 ATOM 54 C C . ALA 1208 1208 ? A 220.509 222.921 203.568 1 1 H ALA 0.590 1 ATOM 55 O O . ALA 1208 1208 ? A 221.184 222.398 202.683 1 1 H ALA 0.590 1 ATOM 56 C CB . ALA 1208 1208 ? A 221.337 222.689 205.957 1 1 H ALA 0.590 1 ATOM 57 N N . GLN 1209 1209 ? A 219.165 222.913 203.480 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 58 C CA . GLN 1209 1209 ? A 218.459 222.418 202.305 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 59 C C . GLN 1209 1209 ? A 218.761 223.213 201.031 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 60 O O . GLN 1209 1209 ? A 219.077 222.644 199.988 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 61 C CB . GLN 1209 1209 ? A 216.937 222.389 202.571 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 62 C CG . GLN 1209 1209 ? A 216.528 221.348 203.641 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 63 C CD . GLN 1209 1209 ? A 215.036 221.437 203.961 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 64 O OE1 . GLN 1209 1209 ? A 214.211 221.873 203.160 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 65 N NE2 . GLN 1209 1209 ? A 214.657 220.986 205.178 1 1 H GLN 0.530 1 ATOM 66 N N . PHE 1210 1210 ? A 218.765 224.559 201.097 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 67 C CA . PHE 1210 1210 ? A 219.173 225.395 199.976 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 68 C C . PHE 1210 1210 ? A 220.683 225.343 199.705 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 69 O O . PHE 1210 1210 ? A 221.133 225.569 198.586 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 70 C CB . PHE 1210 1210 ? A 218.712 226.867 200.154 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 71 C CG . PHE 1210 1210 ? A 217.213 226.996 200.005 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 72 C CD1 . PHE 1210 1210 ? A 216.601 226.816 198.752 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 73 C CD2 . PHE 1210 1210 ? A 216.402 227.327 201.103 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 74 C CE1 . PHE 1210 1210 ? A 215.210 226.932 198.611 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 75 C CE2 . PHE 1210 1210 ? A 215.012 227.428 200.974 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 76 C CZ . PHE 1210 1210 ? A 214.415 227.229 199.725 1 1 H PHE 0.510 1 ATOM 77 N N . GLN 1211 1211 ? A 221.522 224.989 200.698 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 78 C CA . GLN 1211 1211 ? A 222.924 224.646 200.501 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 79 C C . GLN 1211 1211 ? A 223.116 223.385 199.662 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 80 O O . GLN 1211 1211 ? A 223.968 223.332 198.774 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 81 C CB . GLN 1211 1211 ? A 223.653 224.491 201.857 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 82 C CG . GLN 1211 1211 ? A 225.182 224.281 201.773 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 83 C CD . GLN 1211 1211 ? A 225.881 225.482 201.140 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 84 O OE1 . GLN 1211 1211 ? A 225.780 226.622 201.589 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 85 N NE2 . GLN 1211 1211 ? A 226.637 225.234 200.046 1 1 H GLN 0.540 1 ATOM 86 N N . THR 1212 1212 ? A 222.295 222.341 199.896 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 87 C CA . THR 1212 1212 ? A 222.194 221.158 199.036 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 88 C C . THR 1212 1212 ? A 221.705 221.507 197.640 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 89 O O . THR 1212 1212 ? A 222.263 221.049 196.646 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 90 C CB . THR 1212 1212 ? A 221.295 220.076 199.627 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 91 O OG1 . THR 1212 1212 ? A 221.830 219.639 200.868 1 1 H THR 0.560 1 ATOM 92 C CG2 . THR 1212 1212 ? 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A 223.833 221.066 190.611 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 119 C CB . GLU 1216 1216 ? A 221.672 220.182 193.089 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 120 C CG . GLU 1216 1216 ? A 220.923 219.612 191.862 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 121 C CD . GLU 1216 1216 ? A 221.498 218.313 191.306 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 122 O OE1 . GLU 1216 1216 ? A 221.340 218.119 190.069 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 123 O OE2 . GLU 1216 1216 ? A 222.096 217.523 192.078 1 1 H GLU 0.590 1 ATOM 124 N N . ALA 1217 1217 ? A 222.961 222.714 191.844 1 1 H ALA 0.660 1 ATOM 125 C CA . ALA 1217 1217 ? A 223.116 223.728 190.820 1 1 H ALA 0.660 1 ATOM 126 C C . ALA 1217 1217 ? A 224.570 223.970 190.410 1 1 H ALA 0.660 1 ATOM 127 O O . ALA 1217 1217 ? A 224.877 224.143 189.234 1 1 H ALA 0.660 1 ATOM 128 C CB . ALA 1217 1217 ? A 222.423 225.031 191.260 1 1 H ALA 0.660 1 ATOM 129 N N . ARG 1218 1218 ? A 225.526 223.942 191.362 1 1 H ARG 0.540 1 ATOM 130 C CA . ARG 1218 1218 ? A 226.951 223.940 191.058 1 1 H ARG 0.540 1 ATOM 131 C C . ARG 1218 1218 ? 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A 228.693 223.204 181.168 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 184 O O . LEU 1224 1224 ? A 228.826 223.369 179.960 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 185 C CB . LEU 1224 1224 ? A 226.433 223.716 182.231 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 186 C CG . LEU 1224 1224 ? A 226.077 224.856 181.257 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 187 C CD1 . LEU 1224 1224 ? A 224.658 225.366 181.535 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 188 C CD2 . LEU 1224 1224 ? A 227.057 226.030 181.364 1 1 H LEU 0.590 1 ATOM 189 N N . GLN 1225 1225 ? A 229.709 223.484 182.010 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 190 C CA . GLN 1225 1225 ? A 231.033 223.895 181.552 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 191 C C . GLN 1225 1225 ? A 231.697 222.860 180.644 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 192 O O . GLN 1225 1225 ? A 232.186 223.188 179.569 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 193 C CB . GLN 1225 1225 ? A 231.961 224.221 182.750 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 194 C CG . GLN 1225 1225 ? A 231.550 225.505 183.512 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 195 C CD . GLN 1225 1225 ? A 232.341 225.692 184.809 1 1 H GLN 0.570 1 ATOM 196 O OE1 . GLN 1225 1225 ? 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A 229.612 227.259 179.115 1 1 H LEU 0.600 1 ATOM 223 C CD2 . LEU 1228 1228 ? A 228.427 226.771 176.956 1 1 H LEU 0.600 1 ATOM 224 N N . ASP 1229 1229 ? A 232.709 223.395 176.646 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 225 C CA . ASP 1229 1229 ? A 233.983 222.991 176.074 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 226 C C . ASP 1229 1229 ? A 233.837 222.005 174.926 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 227 O O . ASP 1229 1229 ? A 234.385 222.210 173.841 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 228 C CB . ASP 1229 1229 ? A 234.863 222.353 177.173 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 229 C CG . ASP 1229 1229 ? A 235.405 223.402 178.129 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 230 O OD1 . ASP 1229 1229 ? A 235.399 224.611 177.774 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 231 O OD2 . ASP 1229 1229 ? A 235.875 222.982 179.217 1 1 H ASP 0.610 1 ATOM 232 N N . GLU 1230 1230 ? A 233.022 220.951 175.124 1 1 H GLU 0.620 1 ATOM 233 C CA . GLU 1230 1230 ? A 232.719 219.979 174.093 1 1 H GLU 0.620 1 ATOM 234 C C . GLU 1230 1230 ? A 231.957 220.572 172.919 1 1 H GLU 0.620 1 ATOM 235 O O . GLU 1230 1230 ? 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A 227.272 221.397 171.047 1 1 H GLN 0.660 1 ATOM 249 N NE2 . GLN 1231 1231 ? A 226.926 222.978 169.501 1 1 H GLN 0.660 1 ATOM 250 N N . MET 1232 1232 ? A 232.138 223.811 171.987 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 251 C CA . MET 1232 1232 ? A 233.119 224.599 171.250 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 252 C C . MET 1232 1232 ? A 234.046 223.779 170.358 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 253 O O . MET 1232 1232 ? A 234.252 224.143 169.206 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 254 C CB . MET 1232 1232 ? A 233.994 225.456 172.203 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 255 C CG . MET 1232 1232 ? A 233.252 226.644 172.847 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 256 S SD . MET 1232 1232 ? A 234.333 227.750 173.810 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 257 C CE . MET 1232 1232 ? A 234.645 226.605 175.183 1 1 H MET 0.560 1 ATOM 258 N N . SER 1233 1233 ? A 234.603 222.655 170.850 1 1 H SER 0.610 1 ATOM 259 C CA . SER 1233 1233 ? A 235.459 221.772 170.059 1 1 H SER 0.610 1 ATOM 260 C C . SER 1233 1233 ? A 234.743 221.033 168.930 1 1 H SER 0.610 1 ATOM 261 O O . SER 1233 1233 ? 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A 231.856 224.694 163.145 1 1 H PRO 0.470 1 ATOM 288 C CD . PRO 1236 1236 ? A 231.265 224.763 164.516 1 1 H PRO 0.470 1 ATOM 289 N N . THR 1237 1237 ? A 233.109 227.391 165.603 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 290 C CA . THR 1237 1237 ? A 233.515 228.759 165.760 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 291 C C . THR 1237 1237 ? A 233.285 229.035 167.247 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 292 O O . THR 1237 1237 ? A 232.445 229.814 167.706 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 293 C CB . THR 1237 1237 ? A 232.898 229.720 164.734 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 294 O OG1 . THR 1237 1237 ? A 233.453 231.014 164.911 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 295 C CG2 . THR 1237 1237 ? A 231.386 229.752 164.920 1 1 H THR 0.440 1 ATOM 296 N N . GLY 1238 1238 ? A 233.999 228.276 168.115 1 1 H GLY 0.460 1 ATOM 297 C CA . GLY 1238 1238 ? A 234.014 228.440 169.575 1 1 H GLY 0.460 1 ATOM 298 C C . GLY 1238 1238 ? A 234.509 229.776 169.996 1 1 H GLY 0.460 1 ATOM 299 O O . GLY 1238 1238 ? A 235.237 230.399 169.245 1 1 H GLY 0.460 1 ATOM 300 N N . SER 1239 1239 ? 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A 233.551 228.655 160.848 1 1 H GLU 0.560 1 ATOM 431 O OE2 . GLU 1253 1253 ? A 231.979 227.930 162.226 1 1 H GLU 0.560 1 ATOM 432 N N . ARG 1254 1254 ? A 236.124 223.197 160.085 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 433 C CA . ARG 1254 1254 ? A 237.256 222.633 159.411 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 434 C C . ARG 1254 1254 ? A 236.825 221.568 158.420 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 435 O O . ARG 1254 1254 ? A 237.275 221.611 157.279 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 436 C CB . ARG 1254 1254 ? A 238.320 222.139 160.407 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 437 C CG . ARG 1254 1254 ? A 239.662 221.920 159.686 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 438 C CD . ARG 1254 1254 ? A 240.852 221.444 160.525 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 439 N NE . ARG 1254 1254 ? A 241.252 222.519 161.480 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 440 C CZ . ARG 1254 1254 ? A 241.012 222.491 162.791 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 441 N NH1 . ARG 1254 1254 ? A 240.230 221.580 163.360 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 442 N NH2 . ARG 1254 1254 ? A 241.440 223.477 163.560 1 1 H ARG 0.580 1 ATOM 443 N N . GLU 1255 1255 ? 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A 234.789 204.873 100.707 1 1 H VAL 0.300 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.510 2 1 3 0.025 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1202 LYS 1 0.300 2 1 A 1203 HIS 1 0.380 3 1 A 1204 SER 1 0.490 4 1 A 1205 GLN 1 0.490 5 1 A 1206 GLU 1 0.500 6 1 A 1207 ILE 1 0.480 7 1 A 1208 ALA 1 0.590 8 1 A 1209 GLN 1 0.530 9 1 A 1210 PHE 1 0.510 10 1 A 1211 GLN 1 0.540 11 1 A 1212 THR 1 0.560 12 1 A 1213 GLU 1 0.570 13 1 A 1214 LEU 1 0.560 14 1 A 1215 ALA 1 0.630 15 1 A 1216 GLU 1 0.590 16 1 A 1217 ALA 1 0.660 17 1 A 1218 ARG 1 0.540 18 1 A 1219 THR 1 0.610 19 1 A 1220 GLN 1 0.610 20 1 A 1221 LEU 1 0.600 21 1 A 1222 GLN 1 0.600 22 1 A 1223 LEU 1 0.600 23 1 A 1224 LEU 1 0.590 24 1 A 1225 GLN 1 0.570 25 1 A 1226 LYS 1 0.570 26 1 A 1227 LYS 1 0.540 27 1 A 1228 LEU 1 0.600 28 1 A 1229 ASP 1 0.610 29 1 A 1230 GLU 1 0.620 30 1 A 1231 GLN 1 0.660 31 1 A 1232 MET 1 0.560 32 1 A 1233 SER 1 0.610 33 1 A 1234 GLN 1 0.630 34 1 A 1235 GLN 1 0.590 35 1 A 1236 PRO 1 0.470 36 1 A 1237 THR 1 0.440 37 1 A 1238 GLY 1 0.460 38 1 A 1239 SER 1 0.300 39 1 A 1240 GLN 1 0.260 40 1 A 1241 GLU 1 0.230 41 1 A 1242 MET 1 0.160 42 1 A 1243 GLU 1 0.210 43 1 A 1244 ASP 1 0.220 44 1 A 1245 LEU 1 0.230 45 1 A 1246 LYS 1 0.350 46 1 A 1247 TRP 1 0.250 47 1 A 1248 GLU 1 0.330 48 1 A 1249 LEU 1 0.430 49 1 A 1250 ASP 1 0.600 50 1 A 1251 GLN 1 0.620 51 1 A 1252 LYS 1 0.610 52 1 A 1253 GLU 1 0.560 53 1 A 1254 ARG 1 0.580 54 1 A 1255 GLU 1 0.640 55 1 A 1256 ILE 1 0.660 56 1 A 1257 GLN 1 0.620 57 1 A 1258 SER 1 0.570 58 1 A 1259 LEU 1 0.560 59 1 A 1260 LYS 1 0.580 60 1 A 1261 GLN 1 0.570 61 1 A 1262 GLN 1 0.550 62 1 A 1263 LEU 1 0.520 63 1 A 1264 ASP 1 0.510 64 1 A 1265 LEU 1 0.450 65 1 A 1266 THR 1 0.540 66 1 A 1267 GLU 1 0.490 67 1 A 1268 GLN 1 0.580 68 1 A 1269 GLN 1 0.530 69 1 A 1270 GLY 1 0.380 70 1 A 1271 LYS 1 0.390 71 1 A 1272 LYS 1 0.480 72 1 A 1273 GLU 1 0.450 73 1 A 1274 LEU 1 0.560 74 1 A 1275 GLU 1 0.510 75 1 A 1276 GLY 1 0.600 76 1 A 1277 THR 1 0.530 77 1 A 1278 GLN 1 0.550 78 1 A 1279 GLN 1 0.560 79 1 A 1280 THR 1 0.580 80 1 A 1281 LEU 1 0.580 81 1 A 1282 GLN 1 0.590 82 1 A 1283 THR 1 0.600 83 1 A 1284 ILE 1 0.580 84 1 A 1285 LYS 1 0.590 85 1 A 1286 SER 1 0.590 86 1 A 1287 GLU 1 0.520 87 1 A 1288 LEU 1 0.470 88 1 A 1289 GLU 1 0.480 89 1 A 1290 MET 1 0.280 90 1 A 1291 VAL 1 0.300 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #