data_SMR-218aae60ddc1c05b23a482db3e252349_1 _entry.id SMR-218aae60ddc1c05b23a482db3e252349_1 _struct.entry_id SMR-218aae60ddc1c05b23a482db3e252349_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P59598/ ASXL1_MOUSE, Polycomb group protein ASXL1 - Q24JP2/ Q24JP2_MOUSE, Additional sex combs-like 1 protein Estimated model accuracy of this model is 0.061, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P59598, Q24JP2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 190130.994 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ASXL1_MOUSE P59598 1 ;MKDKQKRKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDAVQWSRNAATVDGDEPEDSADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSHRASSQANKQKKRTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVEPASGFSGRHADGESGSPSSSSSGSL ALGNSAIRGQAEVTRDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEVDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPLHF QQQLLLLLPEVDRQVGTDGLLRLSGSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRLRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQKEVQEEAKVKSGLCVSGESVRPQRGPNTRQRDGHFKKRSRPDLRTRS RRNIYKKQEPEQAGVAKDASAAPDVSLSKDTKTDLAGVNSTPGPDVSSATSGQEGPKCPSEPVASQIQAE RDNLACASASPDRIPTLPQDTVDQETKDQKRKSFEQEASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKPQPT KEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVAKGRPTYQICPRIVPITESSCRGWTGARTLADIKARALQARGARGYHCN RETATTAIGGGGGPGGGGSGAIDEGGGRDSSSGDGSEACGHPEPRGAPSTSGESASDLQRTQLLPPCPLN GEHTPAEAAMPRARREDSASLRKEESCLLKRVPGVLTSGLEDASQPPIAPTGDQPCQALPPLSSQTPVAE MLTEQPKLLLDDRTECESSREDQGPTIPSESSSGRFPLGDLLGGGSDQAFDNMKEPVSMTPTFISELSLA NYLQDRPDDDGLGLGATGLLIRESSRQEALTEAFASGSPTSWVPILSNYEVIKTSDPESRENIPCPEPQD EKEWERAVPLIAATESVPQPESCISHWTPPPAAVGSTGSDSEQVDLERLEMNGISEAPSPHSESTDTASD SEGHLSEDSSEVDASEVTVVKGSLGGDEKQDWDPSASLSKVNNDLSVLTRTGGVAASQSWVSRVCSVPHK IPDSLLLSSTECQPRSVCPLRPGSSVEVTNPLVMHLLHGNLPLEKVLPPGHRSSRLESSQLPLREQSQDR GTLQGTGENNRLAARINPGSAQTLKESILAQSYGASAGLVRAMASKAPAMSQKIAKMVTSLDSQHPETEL TPSSGNLEEIDSKEHLSSFLCEEQKEGHSLSQGSDPGAAPGQCLGDHTTSKVPCFSSTNVSLSFGSEQTD GTLSDQNNAGGHEKKLFGPGNTVTTLQCPRSEEQTPLPAEVPPVFPSRKIEPSKNSVSGGVQTTRENRMP KPPPVSADSIKTEQTFLRDPIKADAENRKAAGYSSLELVGHLQGMPFVVDLPFWKLPREPGKGFSQPLEP SSIPSQLNIKQALYGKLSKLQLSPTSFNYSSSSATFPKGLAGGVVQLSHKASFGTGHTASLSLQMFADSS AVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR ; 'Polycomb group protein ASXL1' 2 1 UNP Q24JP2_MOUSE Q24JP2 1 ;MKDKQKRKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDAVQWSRNAATVDGDEPEDSADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSHRASSQANKQKKRTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVEPASGFSGRHADGESGSPSSSSSGSL ALGNSAIRGQAEVTRDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEVDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPLHF QQQLLLLLPEVDRQVGTDGLLRLSGSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRLRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQKEVQEEAKVKSGLCVSGESVRPQRGPNTRQRDGHFKKRSRPDLRTRS RRNIYKKQEPEQAGVAKDASAAPDVSLSKDTKTDLAGVNSTPGPDVSSATSGQEGPKCPSEPVASQIQAE RDNLACASASPDRIPTLPQDTVDQETKDQKRKSFEQEASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKPQPT KEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVAKGRPTYQICPRIVPITESSCRGWTGARTLADIKARALQARGARGYHCN RETATTAIGGGGGPGGGGSGAIDEGGGRDSSSGDGSEACGHPEPRGAPSTSGESASDLQRTQLLPPCPLN GEHTPAEAAMPRARREDSASLRKEESCLLKRVPGVLTSGLEDASQPPIAPTGDQPCQALPPLSSQTPVAE MLTEQPKLLLDDRTECESSREDQGPTIPSESSSGRFPLGDLLGGGSDQAFDNMKEPVSMTPTFISELSLA NYLQDRPDDDGLGLGATGLLIRESSRQEALTEAFASGSPTSWVPILSNYEVIKTSDPESRENIPCPEPQD EKEWERAVPLIAATESVPQPESCISHWTPPPAAVGSTGSDSEQVDLERLEMNGISEAPSPHSESTDTASD SEGHLSEDSSEVDASEVTVVKGSLGGDEKQDWDPSASLSKVNNDLSVLTRTGGVAASQSWVSRVCSVPHK IPDSLLLSSTECQPRSVCPLRPGSSVEVTNPLVMHLLHGNLPLEKVLPPGHRSSRLESSQLPLREQSQDR GTLQGTGENNRLAARINPGSAQTLKESILAQSYGASAGLVRAMASKAPAMSQKIAKMVTSLDSQHPETEL TPSSGNLEEIDSKEHLSSFLCEEQKEGHSLSQGSDPGAAPGQCLGDHTTSKVPCFSSTNVSLSFGSEQTD GTLSDQNNAGGHEKKLFGPGNTVTTLQCPRSEEQTPLPAEVPPVFPSRKIEPSKNSVSGGVQTTRENRMP KPPPVSADSIKTEQTFLRDPIKADAENRKAAGYSSLELVGHLQGMPFVVDLPFWKLPREPGKGFSQPLEP SSIPSQLNIKQALYGKLSKLQLSPTSFNYSSSSATFPKGLAGGVVQLSHKASFGTGHTASLSLQMFADSS AVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR ; 'Additional sex combs-like 1 protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1514 1 1514 2 2 1 1514 1 1514 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ASXL1_MOUSE P59598 . 1 1514 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-04-23 20D9FBE9D4CF9E74 1 UNP . Q24JP2_MOUSE Q24JP2 . 1 1514 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2006-04-18 20D9FBE9D4CF9E74 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no N ;MKDKQKRKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDAVQWSRNAATVDGDEPEDSADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSHRASSQANKQKKRTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVEPASGFSGRHADGESGSPSSSSSGSL ALGNSAIRGQAEVTRDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEVDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPLHF QQQLLLLLPEVDRQVGTDGLLRLSGSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRLRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQKEVQEEAKVKSGLCVSGESVRPQRGPNTRQRDGHFKKRSRPDLRTRS RRNIYKKQEPEQAGVAKDASAAPDVSLSKDTKTDLAGVNSTPGPDVSSATSGQEGPKCPSEPVASQIQAE RDNLACASASPDRIPTLPQDTVDQETKDQKRKSFEQEASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKPQPT KEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVAKGRPTYQICPRIVPITESSCRGWTGARTLADIKARALQARGARGYHCN 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A 1 1500 CYS 1500 ? ? ? N . A 1 1501 ILE 1501 ? ? ? N . A 1 1502 GLY 1502 ? ? ? N . A 1 1503 PRO 1503 ? ? ? N . A 1 1504 SER 1504 ? ? ? N . A 1 1505 LYS 1505 ? ? ? N . A 1 1506 LEU 1506 ? ? ? N . A 1 1507 CYS 1507 ? ? ? N . A 1 1508 VAL 1508 ? ? ? N . A 1 1509 LEU 1509 ? ? ? N . A 1 1510 CYS 1510 ? ? ? N . A 1 1511 LEU 1511 ? ? ? N . A 1 1512 VAL 1512 ? ? ? N . A 1 1513 VAL 1513 ? ? ? N . A 1 1514 ARG 1514 ? ? ? N . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Polycomb group protein ASXL1 {PDB ID=8h1t, label_asym_id=N, auth_asym_id=N, SMTL ID=8h1t.1.N}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8h1t, label_asym_id=N' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A N 10 1 N # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQE ; ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 378 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8h1t 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1514 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1514 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.7e-87 94.180 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKDKQKRKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGLFYKLPGRISLFTLKKDAVQWSRNAATVDGDEPEDSADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSNPRDSHRASSQANKQKKRTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVEPASGFSGRHADGESGSPSSSSSGSLALGNSAIRGQAEVTRDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEVDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPLHFQQQLLLLLPEVDRQVGTDGLLRLSGSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRLRQEMEKEKKVEQWKEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQKEVQEEAKVKSGLCVSGESVRPQRGPNTRQRDGHFKKRSRPDLRTRSRRNIYKKQEPEQAGVAKDASAAPDVSLSKDTKTDLAGVNSTPGPDVSSATSGQEGPKCPSEPVASQIQAERDNLACASASPDRIPTLPQDTVDQETKDQKRKSFEQEASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKPQPTKEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVAKGRPTYQICPRIVPITESSCRGWTGARTLADIKARALQARGARGYHCNRETATTAIGGGGGPGGGGSGAIDEGGGRDSSSGDGSEACGHPEPRGAPSTSGESASDLQRTQLLPPCPLNGEHTPAEAAMPRARREDSASLRKEESCLLKRVPGVLTSGLEDASQPPIAPTGDQPCQALPPLSSQTPVAEMLTEQPKLLLDDRTECESSREDQGPTIPSESSSGRFPLGDLLGGGSDQAFDNMKEPVSMTPTFISELSLANYLQDRPDDDGLGLGATGLLIRESSRQEALTEAFASGSPTSWVPILSNYEVIKTSDPESRENIPCPEPQDEKEWERAVPLIAATESVPQPESCISHWTPPPAAVGSTGSDSEQVDLERLEMNGISEAPSPHSESTDTASDSEGHLSEDSSEVDASEVTVVKGSLGGDEKQDWDPSASLSKVNNDLSVLTRTGGVAASQSWVSRVCSVPHKIPDSLLLSSTECQPRSVCPLRPGSSVEVTNPLVMHLLHGNLPLEKVLPPGHRSSRLESSQLPLREQSQDRGTLQGTGENNRLAARINPGSAQTLKESILAQSYGASAGLVRAMASKAPAMSQKIAKMVTSLDSQHPETELTPSSGNLEEIDSKEHLSSFLCEEQKEGHSLSQGSDPGAAPGQCLGDHTTSKVPCFSSTNVSLSFGSEQTDGTLSDQNNAGGHEKKLFGPGNTVTTLQCPRSEEQTPLPAEVPPVFPSRKIEPSKNSVSGGVQTTRENRMPKPPPVSADSIKTEQTFLRDPIKADAENRKAAGYSSLELVGHLQGMPFVVDLPFWKLPREPGKGFSQPLEPSSIPSQLNIKQALYGKLSKLQLSPTSFNYSSSSATFPKGLAGGVVQLSHKASFGTGHTASLSLQMFADSSAVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR 2 1 2 MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGLFYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSLALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHFQQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQWKEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8h1t.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 247 247 ? A 175.852 188.270 217.505 1 1 N GLY 0.350 1 ATOM 2 C CA . GLY 247 247 ? A 176.442 186.906 217.808 1 1 N GLY 0.350 1 ATOM 3 C C . GLY 247 247 ? A 177.542 187.049 218.829 1 1 N GLY 0.350 1 ATOM 4 O O . GLY 247 247 ? A 177.738 188.155 219.317 1 1 N GLY 0.350 1 ATOM 5 N N . GLU 248 248 ? A 178.268 185.968 219.171 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 6 C CA . GLU 248 248 ? A 179.302 185.995 220.199 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 7 C C . GLU 248 248 ? A 180.656 185.625 219.625 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 8 O O . GLU 248 248 ? A 181.680 186.220 219.958 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 9 C CB . GLU 248 248 ? A 178.966 184.950 221.287 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 10 C CG . GLU 248 248 ? A 177.617 185.219 221.993 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 11 C CD . GLU 248 248 ? A 177.318 184.209 223.102 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 12 O OE1 . GLU 248 248 ? A 178.245 183.472 223.519 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 13 O OE2 . GLU 248 248 ? A 176.134 184.176 223.521 1 1 N GLU 0.460 1 ATOM 14 N N . GLU 249 249 ? A 180.692 184.653 218.699 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 15 C CA . GLU 249 249 ? A 181.891 184.212 218.041 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 16 C C . GLU 249 249 ? A 181.993 184.912 216.695 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 17 O O . GLU 249 249 ? A 181.034 185.489 216.198 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 18 C CB . GLU 249 249 ? A 181.945 182.655 218.028 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 19 C CG . GLU 249 249 ? A 180.696 181.887 217.513 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 20 C CD . GLU 249 249 ? A 180.653 181.645 216.004 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 21 O OE1 . GLU 249 249 ? A 181.726 181.693 215.355 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 22 O OE2 . GLU 249 249 ? A 179.522 181.358 215.540 1 1 N GLU 0.520 1 ATOM 23 N N . VAL 250 250 ? A 183.210 184.982 216.135 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 24 C CA . VAL 250 250 ? A 183.503 185.521 214.819 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 25 C C . VAL 250 250 ? A 183.566 184.376 213.835 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 26 O O . VAL 250 250 ? A 184.380 183.478 213.998 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 27 C CB . VAL 250 250 ? A 184.842 186.268 214.788 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 28 C CG1 . VAL 250 250 ? A 185.194 186.732 213.354 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 29 C CG2 . VAL 250 250 ? A 184.744 187.484 215.728 1 1 N VAL 0.550 1 ATOM 30 N N . ASP 251 251 ? A 182.735 184.394 212.776 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 31 C CA . ASP 251 251 ? A 182.648 183.349 211.775 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 32 C C . ASP 251 251 ? A 183.909 183.134 210.925 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 33 O O . ASP 251 251 ? A 184.258 183.945 210.065 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 34 C CB . ASP 251 251 ? A 181.521 183.630 210.752 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 35 C CG . ASP 251 251 ? A 180.118 183.672 211.341 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 36 O OD1 . ASP 251 251 ? A 179.628 182.610 211.765 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 37 O OD2 . ASP 251 251 ? A 179.491 184.760 211.269 1 1 N ASP 0.550 1 ATOM 38 N N . PHE 252 252 ? A 184.600 181.985 211.099 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 39 C CA . PHE 252 252 ? A 185.749 181.611 210.276 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 40 C C . PHE 252 252 ? A 185.480 180.398 209.390 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 41 O O . PHE 252 252 ? A 186.245 180.111 208.473 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 42 C CB . PHE 252 252 ? A 186.961 181.251 211.182 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 43 C CG . PHE 252 252 ? A 187.751 182.486 211.532 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 44 C CD1 . PHE 252 252 ? A 187.322 183.351 212.547 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 45 C CD2 . PHE 252 252 ? A 188.948 182.781 210.861 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 46 C CE1 . PHE 252 252 ? A 188.062 184.487 212.897 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 47 C CE2 . PHE 252 252 ? A 189.704 183.910 211.212 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 48 C CZ . PHE 252 252 ? A 189.259 184.766 212.228 1 1 N PHE 0.560 1 ATOM 49 N N . GLU 253 253 ? A 184.403 179.640 209.634 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 50 C CA . GLU 253 253 ? A 184.219 178.346 209.007 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 51 C C . GLU 253 253 ? A 183.506 178.350 207.665 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 52 O O . GLU 253 253 ? A 183.964 177.783 206.677 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 53 C CB . GLU 253 253 ? A 183.324 177.531 209.942 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 54 C CG . GLU 253 253 ? A 183.976 177.230 211.301 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 55 C CD . GLU 253 253 ? A 183.088 176.310 212.129 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 56 O OE1 . GLU 253 253 ? A 182.165 175.688 211.547 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 57 O OE2 . GLU 253 253 ? A 183.381 176.181 213.338 1 1 N GLU 0.660 1 ATOM 58 N N . THR 254 254 ? A 182.308 178.963 207.635 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 59 C CA . THR 254 254 ? A 181.466 179.146 206.459 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 60 C C . THR 254 254 ? A 182.069 180.133 205.449 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 61 O O . THR 254 254 ? A 182.599 181.162 205.870 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 62 C CB . THR 254 254 ? A 180.016 179.527 206.826 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 63 O OG1 . THR 254 254 ? A 179.181 179.744 205.694 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 64 C CG2 . THR 254 254 ? A 179.919 180.793 207.687 1 1 N THR 0.620 1 ATOM 65 N N . PRO 255 255 ? A 181.986 179.915 204.123 1 1 N PRO 0.700 1 ATOM 66 C CA . PRO 255 255 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.646 2 1 3 0.061 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 247 GLY 1 0.350 2 1 A 248 GLU 1 0.460 3 1 A 249 GLU 1 0.520 4 1 A 250 VAL 1 0.550 5 1 A 251 ASP 1 0.550 6 1 A 252 PHE 1 0.560 7 1 A 253 GLU 1 0.660 8 1 A 254 THR 1 0.620 9 1 A 255 PRO 1 0.700 10 1 A 256 GLY 1 0.710 11 1 A 257 SER 1 0.620 12 1 A 258 ILE 1 0.590 13 1 A 259 LEU 1 0.680 14 1 A 260 VAL 1 0.700 15 1 A 261 ASN 1 0.740 16 1 A 262 THR 1 0.730 17 1 A 263 ASN 1 0.720 18 1 A 264 LEU 1 0.770 19 1 A 265 ARG 1 0.740 20 1 A 266 ALA 1 0.730 21 1 A 267 LEU 1 0.740 22 1 A 268 ILE 1 0.690 23 1 A 269 ASN 1 0.700 24 1 A 270 SER 1 0.710 25 1 A 271 ARG 1 0.670 26 1 A 272 THR 1 0.620 27 1 A 273 PHE 1 0.650 28 1 A 274 HIS 1 0.680 29 1 A 275 ALA 1 0.610 30 1 A 276 LEU 1 0.620 31 1 A 277 PRO 1 0.600 32 1 A 278 LEU 1 0.530 33 1 A 279 HIS 1 0.690 34 1 A 280 PHE 1 0.600 35 1 A 281 GLN 1 0.520 36 1 A 282 GLN 1 0.580 37 1 A 283 GLN 1 0.610 38 1 A 284 LEU 1 0.610 39 1 A 285 LEU 1 0.530 40 1 A 286 LEU 1 0.540 41 1 A 287 LEU 1 0.550 42 1 A 288 LEU 1 0.500 43 1 A 289 PRO 1 0.630 44 1 A 290 GLU 1 0.580 45 1 A 291 VAL 1 0.550 46 1 A 292 ASP 1 0.620 47 1 A 293 ARG 1 0.530 48 1 A 294 GLN 1 0.590 49 1 A 295 VAL 1 0.540 50 1 A 296 GLY 1 0.510 51 1 A 297 THR 1 0.370 52 1 A 298 ASP 1 0.620 53 1 A 299 GLY 1 0.530 54 1 A 300 LEU 1 0.540 55 1 A 301 LEU 1 0.570 56 1 A 302 ARG 1 0.560 57 1 A 303 LEU 1 0.660 58 1 A 304 SER 1 0.710 59 1 A 305 GLY 1 0.800 60 1 A 306 SER 1 0.740 61 1 A 307 ALA 1 0.750 62 1 A 308 LEU 1 0.740 63 1 A 309 ASN 1 0.750 64 1 A 310 ASN 1 0.770 65 1 A 311 GLU 1 0.770 66 1 A 312 PHE 1 0.730 67 1 A 313 PHE 1 0.720 68 1 A 314 THR 1 0.770 69 1 A 315 HIS 1 0.780 70 1 A 316 ALA 1 0.720 71 1 A 317 ALA 1 0.810 72 1 A 318 GLN 1 0.790 73 1 A 319 SER 1 0.770 74 1 A 320 TRP 1 0.760 75 1 A 321 ARG 1 0.810 76 1 A 322 GLU 1 0.810 77 1 A 323 ARG 1 0.810 78 1 A 324 LEU 1 0.790 79 1 A 325 ALA 1 0.810 80 1 A 326 ASP 1 0.790 81 1 A 327 GLY 1 0.710 82 1 A 328 GLU 1 0.730 83 1 A 329 PHE 1 0.690 84 1 A 330 THR 1 0.670 85 1 A 331 HIS 1 0.690 86 1 A 332 GLU 1 0.600 87 1 A 333 MET 1 0.630 88 1 A 334 GLN 1 0.670 89 1 A 335 VAL 1 0.590 90 1 A 336 ARG 1 0.580 91 1 A 337 LEU 1 0.650 92 1 A 338 ARG 1 0.610 93 1 A 339 GLN 1 0.640 94 1 A 340 GLU 1 0.630 95 1 A 341 MET 1 0.650 96 1 A 342 GLU 1 0.700 97 1 A 343 LYS 1 0.700 98 1 A 344 GLU 1 0.730 99 1 A 345 LYS 1 0.730 100 1 A 346 LYS 1 0.700 101 1 A 347 VAL 1 0.650 102 1 A 348 GLU 1 0.660 103 1 A 349 GLN 1 0.610 104 1 A 350 TRP 1 0.510 105 1 A 351 LYS 1 0.550 106 1 A 352 GLU 1 0.560 107 1 A 353 LYS 1 0.520 108 1 A 354 PHE 1 0.350 109 1 A 355 PHE 1 0.370 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #