data_SMR-54459abaa7c04ce431daf917cae12459_2 _entry.id SMR-54459abaa7c04ce431daf917cae12459_2 _struct.entry_id SMR-54459abaa7c04ce431daf917cae12459_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q80WC3 (isoform 2)/ TNC18_MOUSE, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q80WC3 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 219613.716 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TNC18_MOUSE Q80WC3 1 ;MDGRDFGPQRSVHGPPPPLLSGLAMDSHRVGAATAGRLPSSGLPGPPPPGKYMAGLNLHPHPGFSHLPSG LYPSYLHLNHLDPPSSGSPLLSQLGQPSIFDTQKDGFYLPAPGTLHAHTPSSRTPSGHSSGGPAKGSSRE GTGKDRAGRGGDPPPLFGKKDPRAREEVSGPRGVVDLTQEARAEGRQDRGSSRLAERLSPFLAEVKAKGA LQPSALSLCNGVVDAGLVAELGRGGAKEVARQEENARLLRRAEALLPAARPCGSPLPPPPPLPPKGPPAP PSSTPAGVYTVFREPGREHRVVAPTFVPSVEAFDERVGPIQIASQARDVRAREREPGRPGVLQGPPGSPR LERPEVLREKSSVIRSLKRPPPSDGPPAARSSRSSPDARAYLPPKELLKPEADPRPCERAPRGPSASAAQ QAAKLFGLEPSRPPGPEHKWKPFELGNFATTQMAVLAAQHHHASRAEEEAAVATASKKAYLDPGGAMPRA SATCGRPGADLHSAAHGPGEASAMQSLIKYSGSFAREAVAVRPGGCGKKSPFGGLGTMKPEPTPTSAGPP RAQARLTHPGVPTAGGGRQLKRDPERPESAKAFGREGSGAQGEAEVRHPPVGIAVAVARQKDSGSSSRLG PGLGDQERTLSLNNVKGHGRTDDECDRARHREDRLLGTRLDRDQEKLLRESKELADLARLHPTSCAPNGL NPNLMVTGGPTLAGSGRWSADPAAHLATNPWLPRSGSTSMWLAGHPYGLGPPSLHQGMAPAFPPGLGGSL PSAYQFVRDPQSGQLVVIPSDHLPHFAELMERAAVPPLWPALYPPGRSPLHHAQQLQLFSQQHFLRQQEL LYLQQQAAQALELQRSAQLVERLKAQEHRTEMEEKISKRSLETTGKAGLSAAGPGLLPRKSAGLANGPAG SHGKAVSPPPSPRASPVTSLKAKVIQKVEDVSKPPAYTYPATPSSHPSSPPPASPPPTPGLTRKEEAPEN VVEKKDLELEKETPSPFQALFTDIPPRYPFQALPPHYGRPYPFLLQPAAASDADGLAPDVPLPADGPERL ALSPEDKPICLSPSKIPEPPRDSPEEEQLADREVKAEVEDIEEGPTELPPLESPLALPVPETMVAVSPAG GCGGSPLEAQALSTAGPGCREPSEVSDFAQVAEPQIELPSKTEHRMTALELGTQLTPEPLVETKEEPVEV PLDVPMEEPTTEAGPEDSLPQPSLTEPQPSLELSDCDLPVPEGQCLNLEAQEAVPAPASTCYLEETHSES LLPGLDDPLAGMNALAAAAELPQARPLPSLGPGVPAGEKLDTAPSLVLEHSFLQGITLLSEIAELELDRR GQEAADPEPNLVVRPSLESLLAASSHMLKEVLESPFSDPLKNLRLPRELNSNKKYSWMQKKEERMFAMKS SLEDMDALELDFRMRLAEVQRRYKEKQRELVKLQRRRDSGDRHEDAHRSLARRGPGRPRKRTHTLSALSP PCKRKSHSSSGKGLSSKSLLTSDDYDLGAGIRKRHKGPEEEQEALMGMGKARSRNQSWDDHDSSSDFMSQ LKIKKKKMASDQEQLASKLDRALSLTKQDKLKSPFKFSDGPGGKPKTGGGCGRFLTQYDSLLGKDRKALA KGLGLSLKPSREGKHKRASKARKMEGGFQARGQPKSVHSPFASEVSSQSYNTDSDEDEDFLKNEWSAQGP SSSKLTSSLLCGMVPKNSKPATGPKLTKRGLAGPRTLKPKVVTSRKQSFCLLLREAEARSSFSDSSEEDS FDQGY ; 'Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1755 1 1755 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TNC18_MOUSE Q80WC3 Q80WC3-2 1 1755 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2008-04-29 A26D7F93B4004B17 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MDGRDFGPQRSVHGPPPPLLSGLAMDSHRVGAATAGRLPSSGLPGPPPPGKYMAGLNLHPHPGFSHLPSG LYPSYLHLNHLDPPSSGSPLLSQLGQPSIFDTQKDGFYLPAPGTLHAHTPSSRTPSGHSSGGPAKGSSRE GTGKDRAGRGGDPPPLFGKKDPRAREEVSGPRGVVDLTQEARAEGRQDRGSSRLAERLSPFLAEVKAKGA LQPSALSLCNGVVDAGLVAELGRGGAKEVARQEENARLLRRAEALLPAARPCGSPLPPPPPLPPKGPPAP PSSTPAGVYTVFREPGREHRVVAPTFVPSVEAFDERVGPIQIASQARDVRAREREPGRPGVLQGPPGSPR LERPEVLREKSSVIRSLKRPPPSDGPPAARSSRSSPDARAYLPPKELLKPEADPRPCERAPRGPSASAAQ QAAKLFGLEPSRPPGPEHKWKPFELGNFATTQMAVLAAQHHHASRAEEEAAVATASKKAYLDPGGAMPRA SATCGRPGADLHSAAHGPGEASAMQSLIKYSGSFAREAVAVRPGGCGKKSPFGGLGTMKPEPTPTSAGPP RAQARLTHPGVPTAGGGRQLKRDPERPESAKAFGREGSGAQGEAEVRHPPVGIAVAVARQKDSGSSSRLG 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; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 GLY . 1 4 ARG . 1 5 ASP . 1 6 PHE . 1 7 GLY . 1 8 PRO . 1 9 GLN . 1 10 ARG . 1 11 SER . 1 12 VAL . 1 13 HIS . 1 14 GLY . 1 15 PRO . 1 16 PRO . 1 17 PRO . 1 18 PRO . 1 19 LEU . 1 20 LEU . 1 21 SER . 1 22 GLY . 1 23 LEU . 1 24 ALA . 1 25 MET . 1 26 ASP . 1 27 SER . 1 28 HIS . 1 29 ARG . 1 30 VAL . 1 31 GLY . 1 32 ALA . 1 33 ALA . 1 34 THR . 1 35 ALA . 1 36 GLY . 1 37 ARG . 1 38 LEU . 1 39 PRO . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 GLY . 1 43 LEU . 1 44 PRO . 1 45 GLY . 1 46 PRO . 1 47 PRO . 1 48 PRO . 1 49 PRO . 1 50 GLY . 1 51 LYS . 1 52 TYR . 1 53 MET . 1 54 ALA . 1 55 GLY . 1 56 LEU . 1 57 ASN . 1 58 LEU . 1 59 HIS . 1 60 PRO . 1 61 HIS . 1 62 PRO . 1 63 GLY . 1 64 PHE . 1 65 SER . 1 66 HIS . 1 67 LEU . 1 68 PRO . 1 69 SER . 1 70 GLY . 1 71 LEU . 1 72 TYR . 1 73 PRO . 1 74 SER . 1 75 TYR . 1 76 LEU . 1 77 HIS . 1 78 LEU . 1 79 ASN . 1 80 HIS . 1 81 LEU . 1 82 ASP . 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E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'SWI/SNF complex subunit SMARCC2 {PDB ID=6lth, label_asym_id=E, auth_asym_id=O, SMTL ID=6lth.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6lth, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 4 1 O # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSN APLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRP NIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPD SYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDE VNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVP NVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQ THHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNL AGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLN FPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR TQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEF SKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKK EPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVE SEGERKTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELE TIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQQQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGP PAVHGLAVAPASVVPAPAGSGAPPGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSP FPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHH HHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPD PGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ ; ;MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSN APLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRP NIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPD SYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKISAKTLTDE VNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYTKSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVP NVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMETTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQ THHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNL AGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLN FPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR TQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEF SKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKK EPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVE SEGERKTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELE TIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQQQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGP PAVHGLAVAPASVVPAPAGSGAPPGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSP FPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHH HHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPD PGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 907 932 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6lth 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1755 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1755 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 230.000 34.615 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDGRDFGPQRSVHGPPPPLLSGLAMDSHRVGAATAGRLPSSGLPGPPPPGKYMAGLNLHPHPGFSHLPSGLYPSYLHLNHLDPPSSGSPLLSQLGQPSIFDTQKDGFYLPAPGTLHAHTPSSRTPSGHSSGGPAKGSSREGTGKDRAGRGGDPPPLFGKKDPRAREEVSGPRGVVDLTQEARAEGRQDRGSSRLAERLSPFLAEVKAKGALQPSALSLCNGVVDAGLVAELGRGGAKEVARQEENARLLRRAEALLPAARPCGSPLPPPPPLPPKGPPAPPSSTPAGVYTVFREPGREHRVVAPTFVPSVEAFDERVGPIQIASQARDVRAREREPGRPGVLQGPPGSPRLERPEVLREKSSVIRSLKRPPPSDGPPAARSSRSSPDARAYLPPKELLKPEADPRPCERAPRGPSASAAQQAAKLFGLEPSRPPGPEHKWKPFELGNFATTQMAVLAAQHHHASRAEEEAAVATASKKAYLDPGGAMPRASATCGRPGADLHSAAHGPGEASAMQSLIKYSGSFAREAVAVRPGGCGKKSPFGGLGTMKPEPTPTSAGPPRAQARLTHPGVPTAGGGRQLKRDPERPESAKAFGREGSGAQGEAEVRHPPVGIAVAVARQKDSGSSSRLGPGLGDQERTLSLNNVKGHGRTDDECDRARHREDRLLGTRLDRDQEKLLRESKELADLARLHPTSCAPNGLNPNLMVTGGPTLAGSGRWSADPAAHLATNPWLPRSGSTSMWLAGHPYGLGPPSLHQGMAPAFPPGLGGSLPSAYQFVRDPQSGQLVVIPSDHLPHFAELMERAAVPPLWPALYPPGRSPLHHAQQLQLFSQQHFLRQQELLYLQQQAAQALELQRSAQLVERLKAQEHRTEMEEKISKRSLETTGKAGLSAAGPGLLPRKSAGLANGPAGSHGKAVSPPPSPRASPVTSLKAKVIQKVEDVSKPPAYTYPATPSSHPSSPPPASPPPTPGLTRKEEAPENVVEKKDLELEKETPSPFQALFTDIPPRYPFQALPPHYGRPYPFLLQPAAASDADGLAPDVPLPADGPERLALSPEDKPICLSPSKIPEPPRDSPEEEQLADREVKAEVEDIEEGPTELPPLESPLALPVPETMVAVSPAGGCGGSPLEAQALSTAGPGCREPSEVSDFAQVAEPQIELPSKTEHRMTALELGTQLTPEPLVETKEEPVEVPLDVPMEEPTTEAGPEDSLPQPSLTEPQPSLELSDCDLPVPEGQCLNLEAQEAVPAPASTCYLEETHSESLLPGLDDPLAGMNALAAAAELPQARPLPSLGPGVPAGEKLDTAPSLVLEHSFLQGITLLSEIAELELDRRGQEAADPEPNLVVRPSLESLLAASSHMLKEVLESPFSDPLKNLRLPRELNSNKKYSWMQKKEERMFAMKSSLEDMDALELDFRMRLAEVQRRYKEKQRELVKLQRRRDSGDRHEDAHRSLARRGPGRPRKRTHTLSALSPPCKRKSHSSSGKGLSSKSLLTSDDYDLGAGIRKRHKGPEEEQEALMGMGKARSRNQSWDDHDSSSDFMSQLKIKKKKMASDQEQLASKLDRALSLTKQDKLKSPFKFSDGPGGKPKTGGGCGRFLTQYDSLLGKDRKALAKGLGLSLKPSREGKHKRASKARKMEGGFQARGQPKSVHSPFASEVSSQSYNTDSDEDEDFLKNEWSAQGPSSSKLTSSLLCGMVPKNSKPATGPKLTKRGLAGPRTLKPKVVTSRKQSFCLLLREAEARSSFSDSSEEDSFDQGY 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EELETIMDREREALEYQRQQLLADRQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.168}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6lth.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 838 838 ? A 197.554 224.324 250.986 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 2 C CA . GLN 838 838 ? A 198.805 224.638 251.769 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 3 C C . GLN 838 838 ? A 198.685 224.552 253.283 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 4 O O . GLN 838 838 ? A 199.433 223.810 253.896 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 5 C CB . GLN 838 838 ? A 199.370 225.997 251.316 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 6 C CG . GLN 838 838 ? A 199.925 225.976 249.869 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 7 C CD . GLN 838 838 ? A 200.399 227.374 249.467 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 838 838 ? A 199.889 228.366 249.998 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 838 838 ? A 201.348 227.472 248.518 1 1 E GLN 0.480 1 ATOM 10 N N . GLU 839 839 ? A 197.700 225.242 253.916 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 11 C CA . GLU 839 839 ? A 197.453 225.162 255.349 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 12 C C . GLU 839 839 ? A 197.171 223.751 255.852 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 13 O O . GLU 839 839 ? A 197.653 223.329 256.895 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 14 C CB . GLU 839 839 ? A 196.276 226.089 255.749 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 15 C CG . GLU 839 839 ? A 194.839 225.662 255.325 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 16 C CD . GLU 839 839 ? A 193.734 226.401 256.088 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 17 O OE1 . GLU 839 839 ? A 194.058 227.197 257.000 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 18 O OE2 . GLU 839 839 ? A 192.557 226.127 255.748 1 1 E GLU 0.470 1 ATOM 19 N N . LEU 840 840 ? A 196.409 222.961 255.059 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 20 C CA . LEU 840 840 ? A 196.081 221.595 255.402 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 21 C C . LEU 840 840 ? A 197.313 220.700 255.481 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 22 O O . LEU 840 840 ? A 197.524 220.006 256.465 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 23 C CB . LEU 840 840 ? A 195.012 221.055 254.423 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 24 C CG . LEU 840 840 ? A 194.272 219.797 254.918 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 25 C CD1 . LEU 840 840 ? A 193.528 220.048 256.243 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 26 C CD2 . LEU 840 840 ? A 193.287 219.310 253.844 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 27 N N . LEU 841 841 ? A 198.216 220.808 254.477 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 28 C CA . LEU 841 841 ? A 199.512 220.152 254.439 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 29 C C . LEU 841 841 ? A 200.384 220.545 255.623 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 30 O O . LEU 841 841 ? A 201.012 219.696 256.249 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 31 C CB . LEU 841 841 ? A 200.266 220.516 253.133 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 32 C CG . LEU 841 841 ? A 201.674 219.893 253.001 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 33 C CD1 . LEU 841 841 ? A 201.618 218.357 252.996 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 34 C CD2 . LEU 841 841 ? A 202.406 220.431 251.761 1 1 E LEU 0.600 1 ATOM 35 N N . TYR 842 842 ? A 200.388 221.859 255.976 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 36 C CA . TYR 842 842 ? A 201.058 222.379 257.156 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 37 C C . TYR 842 842 ? A 200.591 221.657 258.426 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 38 O O . TYR 842 842 ? A 201.386 221.023 259.106 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 39 C CB . TYR 842 842 ? A 200.853 223.927 257.258 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 40 C CG . TYR 842 842 ? A 201.501 224.523 258.477 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 41 C CD1 . TYR 842 842 ? A 200.749 224.794 259.632 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 42 C CD2 . TYR 842 842 ? A 202.878 224.771 258.494 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 43 C CE1 . TYR 842 842 ? A 201.369 225.303 260.780 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 44 C CE2 . TYR 842 842 ? A 203.497 225.288 259.641 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 45 C CZ . TYR 842 842 ? A 202.738 225.562 260.783 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 46 O OH . TYR 842 842 ? A 203.332 226.105 261.938 1 1 E TYR 0.570 1 ATOM 47 N N . LEU 843 843 ? A 199.271 221.655 258.724 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 48 C CA . LEU 843 843 ? A 198.734 220.978 259.899 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 49 C C . LEU 843 843 ? A 198.942 219.464 259.920 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 50 O O . LEU 843 843 ? A 199.227 218.875 260.959 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 51 C CB . LEU 843 843 ? A 197.234 221.293 260.111 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 52 C CG . LEU 843 843 ? A 196.917 222.758 260.485 1 1 E LEU 0.590 1 ATOM 53 C CD1 . LEU 843 843 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #