data_SMR-cc42d9b4552b8e8b40192ab9ae93ce6e_3 _entry.id SMR-cc42d9b4552b8e8b40192ab9ae93ce6e_3 _struct.entry_id SMR-cc42d9b4552b8e8b40192ab9ae93ce6e_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8BRB7 (isoform 2)/ KAT6B_MOUSE, Histone acetyltransferase KAT6B Estimated model accuracy of this model is 0.031, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8BRB7 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 228859.824 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KAT6B_MOUSE Q8BRB7 1 ;MVKLANPLYTEWILEAVQKIKKQKQRPSEERICHAVSTSHGLDKKTVSEQLELSVQDGSVLKVTNKGLAS YKDPDNPGRFSSVKPGTFPKPTKGSKGPPCNDLRNVDWNKLLKRAIEGLEEPNGSSLKNIEKYLRSQSDL TGTTNHPAFQQRLRLGAKRAVNNGRLLKEGPQYRVNSGSSDGKGAPQYPSAFPSSLPPVSLLPHEKDQPR ADPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCGSSGHPSCLKFCPELTANVKALRWQCIECKTCSACRVQG KNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLSRMPKGMWICQVCRPKKKGRKLLHEKAAQIKRRYAKPIGRPKNKL KQRLLSVTSDEGSMSAFTGRGSPDTDIKISIKQESADVSLVGNKELVTEEDLDVFKQAQELSWEKIECES GVEDCGRYPSVIEFGKYEIQTWYSSPYPQEYARLPKLYLCEFCLKYMKSKNILLRHSKKCGWFHPPANEI YRRKDLSVFEVDGNMSKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTKNDEKGCHLVGYFSKEKLCQQ KYNVSCIMIMPQHQRQGFGRFLIDFSYLLSRREGQAGSPEKPLSDLGRLSYLAYWKSVILEYLYRHHERH ISIKAISRATGMCPHDIATTLQHLHMIDRRDGRFVIIRREKLILGHMEKLKNCSRPNELDPESLRWTPML ISNAVVSEEEREAEKEAERLMEQASCWEKEEQEILSSRVSSRQSSAKVQSKNKYLHSPERRPVAGERGQL LELSKESSEEEEEEEEEDDEEEEEEEEEESIQTSPPRLTKPQSVSIKRKRPFVVKKKRGRKRRRINSSVT TETISETTEVLNEPFDNSDEERPMPQLEPTCEIPVEEGGRKPVLRKAFPHQPGKKRQTEEEEGEDNHFFK TAALCRKDVDDDAEHLKEGSKDNPEPLKCRQVWPKGAKRGLSKWKQSKERKTGFKLNLYTPPETPMEPED QVTIEEQKELSEDKGSPVGMEREVTETVDALLPQEGSRREETGIPVSPHKSPGGKVDEEDLIRGEEEGEE EGEEEGEREEQEEEEEVTTEKDLDGAKSKENPEPEISMEKEDPVHLGDHEEDEDEEEEPSHNEDHDADDE DDGHMEAANMERGDLPRETFKDALEGQEAFLDLSIQPSHSNPEVLMNCGVDLTMSCNSEPKELAGDTGTA PESDAEPPEEQTQKQDQKNSDGVDAELEEGGPAAVEIDSETAQAVQSLTQENREHDDTFPDCAETQEACR SLQNYTHTDQSPQIATTLDECQQSDHSSPVSSVHSHPGQSVRSVNSPSVPALENSYAQISPDQTAITVPP LQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNGSSQNSCSYSSLT SSNLTQNSCAVTQQMSNISGSCSMLQQTSISSPPTCSVKSPQGCVVERPPSSSQQLAQCSMAANFTPPMQ LADIPETSNANIGLYERMGQSDFGAGHYPQPSATFSLAKLQQLTNTLIDHSLPYSHSAAVTSYANSASLS TPLSNTGLVQLSQSPHSVPGGPQAQATMTPPPNLTPPPMNLPPPLLQRNMAASNIGISHSQRLQTQIASK GHVSMRTKAASLSPAAATHQSQIYGRSQTVAMQGPARTLTMQRGMNMSVNLMPAPAYNVNSVNMNMNTLN AMNGYSMSQPMMNSGYHSNHGYMNQTPQYPMQMQMGMMGSQPYAQQPMQTPPHANMMYTAPGHHGYMNTG MSKQSLNGSYMRR ; 'Histone acetyltransferase KAT6B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1763 1 1763 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KAT6B_MOUSE Q8BRB7 Q8BRB7-2 1 1763 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 667EEDB2F43FF958 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MVKLANPLYTEWILEAVQKIKKQKQRPSEERICHAVSTSHGLDKKTVSEQLELSVQDGSVLKVTNKGLAS YKDPDNPGRFSSVKPGTFPKPTKGSKGPPCNDLRNVDWNKLLKRAIEGLEEPNGSSLKNIEKYLRSQSDL TGTTNHPAFQQRLRLGAKRAVNNGRLLKEGPQYRVNSGSSDGKGAPQYPSAFPSSLPPVSLLPHEKDQPR ADPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCGSSGHPSCLKFCPELTANVKALRWQCIECKTCSACRVQG KNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLSRMPKGMWICQVCRPKKKGRKLLHEKAAQIKRRYAKPIGRPKNKL KQRLLSVTSDEGSMSAFTGRGSPDTDIKISIKQESADVSLVGNKELVTEEDLDVFKQAQELSWEKIECES GVEDCGRYPSVIEFGKYEIQTWYSSPYPQEYARLPKLYLCEFCLKYMKSKNILLRHSKKCGWFHPPANEI YRRKDLSVFEVDGNMSKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTKNDEKGCHLVGYFSKEKLCQQ KYNVSCIMIMPQHQRQGFGRFLIDFSYLLSRREGQAGSPEKPLSDLGRLSYLAYWKSVILEYLYRHHERH ISIKAISRATGMCPHDIATTLQHLHMIDRRDGRFVIIRREKLILGHMEKLKNCSRPNELDPESLRWTPML ISNAVVSEEEREAEKEAERLMEQASCWEKEEQEILSSRVSSRQSSAKVQSKNKYLHSPERRPVAGERGQL LELSKESSEEEEEEEEEDDEEEEEEEEEESIQTSPPRLTKPQSVSIKRKRPFVVKKKRGRKRRRINSSVT TETISETTEVLNEPFDNSDEERPMPQLEPTCEIPVEEGGRKPVLRKAFPHQPGKKRQTEEEEGEDNHFFK TAALCRKDVDDDAEHLKEGSKDNPEPLKCRQVWPKGAKRGLSKWKQSKERKTGFKLNLYTPPETPMEPED QVTIEEQKELSEDKGSPVGMEREVTETVDALLPQEGSRREETGIPVSPHKSPGGKVDEEDLIRGEEEGEE EGEEEGEREEQEEEEEVTTEKDLDGAKSKENPEPEISMEKEDPVHLGDHEEDEDEEEEPSHNEDHDADDE DDGHMEAANMERGDLPRETFKDALEGQEAFLDLSIQPSHSNPEVLMNCGVDLTMSCNSEPKELAGDTGTA PESDAEPPEEQTQKQDQKNSDGVDAELEEGGPAAVEIDSETAQAVQSLTQENREHDDTFPDCAETQEACR SLQNYTHTDQSPQIATTLDECQQSDHSSPVSSVHSHPGQSVRSVNSPSVPALENSYAQISPDQTAITVPP LQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNGSSQNSCSYSSLT SSNLTQNSCAVTQQMSNISGSCSMLQQTSISSPPTCSVKSPQGCVVERPPSSSQQLAQCSMAANFTPPMQ LADIPETSNANIGLYERMGQSDFGAGHYPQPSATFSLAKLQQLTNTLIDHSLPYSHSAAVTSYANSASLS TPLSNTGLVQLSQSPHSVPGGPQAQATMTPPPNLTPPPMNLPPPLLQRNMAASNIGISHSQRLQTQIASK 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MSKQSLNGSYMRR ; # # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id _pdbx_entity_nonpoly.ma_model_mode 2 'ZINC ION' ZN implicit # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 VAL . 1 3 LYS . 1 4 LEU . 1 5 ALA . 1 6 ASN . 1 7 PRO . 1 8 LEU . 1 9 TYR . 1 10 THR . 1 11 GLU . 1 12 TRP . 1 13 ILE . 1 14 LEU . 1 15 GLU . 1 16 ALA . 1 17 VAL . 1 18 GLN . 1 19 LYS . 1 20 ILE . 1 21 LYS . 1 22 LYS . 1 23 GLN . 1 24 LYS . 1 25 GLN . 1 26 ARG . 1 27 PRO . 1 28 SER . 1 29 GLU . 1 30 GLU . 1 31 ARG . 1 32 ILE . 1 33 CYS . 1 34 HIS . 1 35 ALA . 1 36 VAL . 1 37 SER . 1 38 THR . 1 39 SER . 1 40 HIS . 1 41 GLY . 1 42 LEU . 1 43 ASP . 1 44 LYS . 1 45 LYS . 1 46 THR . 1 47 VAL . 1 48 SER . 1 49 GLU . 1 50 GLN . 1 51 LEU . 1 52 GLU . 1 53 LEU . 1 54 SER . 1 55 VAL . 1 56 GLN . 1 57 ASP . 1 58 GLY . 1 59 SER . 1 60 VAL . 1 61 LEU . 1 62 LYS . 1 63 VAL . 1 64 THR . 1 65 ASN . 1 66 LYS . 1 67 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A 1 1733 HIS 1733 ? ? ? G . A 1 1734 ALA 1734 ? ? ? G . A 1 1735 ASN 1735 ? ? ? G . A 1 1736 MET 1736 ? ? ? G . A 1 1737 MET 1737 ? ? ? G . A 1 1738 TYR 1738 ? ? ? G . A 1 1739 THR 1739 ? ? ? G . A 1 1740 ALA 1740 ? ? ? G . A 1 1741 PRO 1741 ? ? ? G . A 1 1742 GLY 1742 ? ? ? G . A 1 1743 HIS 1743 ? ? ? G . A 1 1744 HIS 1744 ? ? ? G . A 1 1745 GLY 1745 ? ? ? G . A 1 1746 TYR 1746 ? ? ? G . A 1 1747 MET 1747 ? ? ? G . A 1 1748 ASN 1748 ? ? ? G . A 1 1749 THR 1749 ? ? ? G . A 1 1750 GLY 1750 ? ? ? G . A 1 1751 MET 1751 ? ? ? G . A 1 1752 SER 1752 ? ? ? G . A 1 1753 LYS 1753 ? ? ? G . A 1 1754 GLN 1754 ? ? ? G . A 1 1755 SER 1755 ? ? ? G . A 1 1756 LEU 1756 ? ? ? G . A 1 1757 ASN 1757 ? ? ? G . A 1 1758 GLY 1758 ? ? ? G . A 1 1759 SER 1759 ? ? ? G . A 1 1760 TYR 1760 ? ? ? G . A 1 1761 MET 1761 ? ? ? G . A 1 1762 ARG 1762 ? ? ? G . A 1 1763 ARG 1763 ? ? ? G . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 7 7 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Uncharacterized protein C2F7.07c {PDB ID=8i02, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=8i02.1.G}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=8i02, label_asym_id=N, auth_asym_id=G, SMTL ID=8i02.1._.7}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 8i02, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 6 'model 3' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 6 1 G 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B N 7 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAKPWNHTSEAFQASILEDLKIIQKAGAERNAKSSHGSINSRSASPNKATSRRNRAQNGNSNGRASVDN SDDGSKDDLDYSPSVKRKHVNGEGAEKGDHDTSNNGPSITKLRRKVRRTYDTKDGFVAWNTLDDDFRPIV PDQERSRKINPQKGNNNNLLKENKSLKTTAKDLSDISSSSMKKANNSSKPLFSGKLTFKANIPVPTSEVV TENNVTRNVTVYSNQKHLGNESENFNDMEGRAEDISSNELLPTPEEYPYRYNNDYCSACHGPGNFLCCET CPNSFHFTCIDPPIEEKNLPDDAWYCNECKHHSLYNELDEQEELESNVKEEGTMVDVWMQLCTYIDSHNP IQFHLPHSISSFFRGVGSGVMGEYIETDVLKHLKSSRRSNGEERDPLLLKSKSGTPILCFRCHKSALVSQ SILACDYCNSYWHPDCLNPPLATLPSNLRKWKCPNHSDHVTPRYRLPEKAKVIRVGLPRGFKNKGNIVID ENEDEPSVQTIQLQGKIRVVPSKPFKLNFLEQIRDNVINLRKMVEQDEQLCIETFSKFDFYATRDCELPL RILCDVANDNLENDDYVLALRDLLRISKWDPNQPVPAPFDLANLLSY ; ;MDAKPWNHTSEAFQASILEDLKIIQKAGAERNAKSSHGSINSRSASPNKATSRRNRAQNGNSNGRASVDN SDDGSKDDLDYSPSVKRKHVNGEGAEKGDHDTSNNGPSITKLRRKVRRTYDTKDGFVAWNTLDDDFRPIV PDQERSRKINPQKGNNNNLLKENKSLKTTAKDLSDISSSSMKKANNSSKPLFSGKLTFKANIPVPTSEVV TENNVTRNVTVYSNQKHLGNESENFNDMEGRAEDISSNELLPTPEEYPYRYNNDYCSACHGPGNFLCCET CPNSFHFTCIDPPIEEKNLPDDAWYCNECKHHSLYNELDEQEELESNVKEEGTMVDVWMQLCTYIDSHNP IQFHLPHSISSFFRGVGSGVMGEYIETDVLKHLKSSRRSNGEERDPLLLKSKSGTPILCFRCHKSALVSQ SILACDYCNSYWHPDCLNPPLATLPSNLRKWKCPNHSDHVTPRYRLPEKAKVIRVGLPRGFKNKGNIVID ENEDEPSVQTIQLQGKIRVVPSKPFKLNFLEQIRDNVINLRKMVEQDEQLCIETFSKFDFYATRDCELPL RILCDVANDNLENDDYVLALRDLLRISKWDPNQPVPAPFDLANLLSY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 136 460 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8i02 2024-07-03 2 PDB . 8i02 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1763 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 1878 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.1e-17 24.762 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MVKLANPLYTEWILEAVQKIKKQKQRPSEERICHAVSTSHGLDKKTVSEQLELSVQDGSVLKVTNKGLASYKDPDNPGRFSSVKPGTFPKPTKGSKGPPCNDLRNVDWNKLLKRAIEGLEEPNGSSLKNIEKYLRSQSDLTGTT----------NHPAFQQRLRLGAKRAVNNGRLLKEGPQYRVNSGSSDGKGAPQ---Y---PSAFPSSLPPVSLLPHEKDQPRADPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCGSSGHPSCLKFCPELTANVKALRWQCIECKT-------------------------------------------------------------------------------------------------CSACRVQGKNADNMLFCDSCDRGFHMECCDPPLSRMPK--GMWICQVCRPKKKGRKLLHEKAAQIKRRYAKPIGRPKNKLKQRLLSVTSDEGSMSAFTGRGSPDTDIKISIKQESADVSLVGNKELVTEEDLDVFKQAQELSWEKIECESGVEDCGRYPSVIEFGKYEIQTWYSSPYPQEYARLPKLYLCEFCLKYMKSKNILLRHSKKCGWFHPPANEIYRRKDLSVFEVDGNMSKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYYDVEPFLFYVLTKNDEKGCHLVGYFSKEKLCQQKYNVSCIMIMPQHQRQGFGRFLIDFSYLLSRREGQAGSPEKPLSDLGRLSYLAYWKSVILEYLYRHHERHISIKAISRATGMCPHDIATTLQHLHMIDRRDGRFVIIRREKLILGHMEKLKNCSRPNELDPESLRWTPMLISNAVVSEEEREAEKEAERLMEQASCWEKEEQEILSSRVSSRQSSAKVQSKNKYLHSPERRPVAGERGQLLELSKESSEEEEEEEEEDDEEEEEEEEEESIQTSPPRLTKPQSVSIKRKRPFVVKKKRGRKRRRINSSVTTETISETTEVLNEPFDNSDEERPMPQLEPTCEIPVEEGGRKPVLRKAFPHQPGKKRQTEEEEGEDNHFFKTAALCRKDVDDDAEHLKEGSKDNPEPLKCRQVWPKGAKRGLSKWKQSKERKTGFKLNLYTPPETPMEPEDQVTIEEQKELSEDKGSPVGMEREVTETVDALLPQEGSRREETGIPVSPHKSPGGKVDEEDLIRGEEEGEEEGEEEGEREEQEEEEEVTTEKDLDGAKSKENPEPEISMEKEDPVHLGDHEEDEDEEEEPSHNEDHDADDEDDGHMEAANMERGDLPRETFKDALEGQEAFLDLSIQPSHSNPEVLMNCGVDLTMSCNSEPKELAGDTGTAPESDAEPPEEQTQKQDQKNSDGVDAELEEGGPAAVEIDSETAQAVQSLTQENREHDDTFPDCAETQEACRSLQNYTHTDQSPQIATTLDECQQSDHSSPVSSVHSHPGQSVRSVNSPSVPALENSYAQISPDQTAITVPPLQNMETSPMMDVPSVSDHSQQVVDSGFSDLGSIESTTENYENPSSYDSTMGGSICGNGSSQNSCSYSSLTSSNLTQNSCAVTQQMSNISGSCSMLQQTSISSPPTCSVKSPQGCVVERPPSSSQQLAQCSMAANFTPPMQLADIPETSNANIGLYERMGQSDFGAGHYPQPSATFSLAKLQQLTNTLIDHSLPYSHSAAVTSYANSASLSTPLSNTGLVQLSQSPHSVPGGPQAQATMTPPPNLTPPPMNLPPPLLQRNMAASNIGISHSQRLQTQIASKGHVSMRTKAASLSPAAATHQSQIYGRSQTVAMQGPARTLTMQRGMNMSVNLMPAPAYNVNSVNMNMNTLNAMNGYSMSQPMMNSGYHSNHGYMNQTPQYPMQMQMGMMGSQPYAQQPMQTPPHANMMYTAPGHHGYMNTGMSKQSLNGSYMRR 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------FRPIVPDQERSRKINPQKGNNNNLLKENKSLKTTAKDLSDISSSSMKKANNSSKPLFSGKLTFKANIPVPTSEVVTENNVTRNVTVYSNQKHLGNESENFNDMEGRAEDISSNELLPTPEEYPYRYNNDYCSACHGP---------GNFLCCETCPNSFHFTCIDPPIE-EKNLPDDAWYCNECKHHSLYNELDEQEELESNVKEEGTMVDVWMQLCTYIDSHNPIQFHLPHSISSFFRGVGSGVMGEYIETDVLKHLKSSRRSNGEERDPLLLKSKSGTPILCFRCHKSALVSQSILACDYCNSYWHPDCLNPPLATLPSNLRKWKCPNHSDHV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8i02.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 213 213 ? A 222.446 181.478 198.392 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 2 C CA . PRO 213 213 ? A 222.245 181.911 196.964 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 3 C C . PRO 213 213 ? A 222.229 180.697 196.067 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 4 O O . PRO 213 213 ? A 222.346 179.589 196.586 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 5 C CB . PRO 213 213 ? A 223.461 182.811 196.711 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 6 C CG . PRO 213 213 ? A 224.594 182.251 197.580 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 7 C CD . PRO 213 213 ? A 223.920 181.465 198.704 1 1 G PRO 0.310 1 ATOM 8 N N . ILE 214 214 ? A 222.086 180.907 194.742 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 9 C CA . ILE 214 214 ? A 222.132 179.905 193.704 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 10 C C . ILE 214 214 ? A 223.310 180.334 192.838 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 11 O O . ILE 214 214 ? A 223.460 181.544 192.632 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 12 C CB . ILE 214 214 ? A 220.842 179.901 192.882 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 13 C CG1 . ILE 214 214 ? A 219.683 179.424 193.788 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 14 C CG2 . ILE 214 214 ? A 220.955 179.019 191.611 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 15 C CD1 . ILE 214 214 ? A 218.290 179.552 193.162 1 1 G ILE 0.410 1 ATOM 16 N N . PRO 215 215 ? A 224.171 179.476 192.296 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 17 C CA . PRO 215 215 ? A 225.343 179.926 191.579 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 18 C C . PRO 215 215 ? A 225.007 179.952 190.115 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 19 O O . PRO 215 215 ? A 225.678 179.311 189.334 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 20 C CB . PRO 215 215 ? A 226.406 178.852 191.884 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 21 C CG . PRO 215 215 ? A 225.616 177.567 192.146 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 22 C CD . PRO 215 215 ? A 224.219 178.041 192.563 1 1 G PRO 0.610 1 ATOM 23 N N . ILE 216 216 ? A 223.989 180.697 189.686 1 1 G ILE 0.610 1 ATOM 24 C CA . ILE 216 216 ? A 223.708 180.851 188.283 1 1 G ILE 0.610 1 ATOM 25 C C . ILE 216 216 ? A 223.136 182.271 188.219 1 1 G ILE 0.610 1 ATOM 26 O O . ILE 216 216 ? A 222.464 182.704 189.151 1 1 G ILE 0.610 1 ATOM 27 C CB . ILE 216 216 ? 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B 192.558 205.638 193.286 1 2 '_' ZN . 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S ZN # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.500 2 1 3 0.031 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 213 PRO 1 0.310 2 1 A 214 ILE 1 0.410 3 1 A 215 PRO 1 0.610 4 1 A 216 ILE 1 0.610 5 1 A 217 CYS 1 0.670 6 1 A 218 SER 1 0.650 7 1 A 219 PHE 1 0.640 8 1 A 220 CYS 1 0.600 9 1 A 221 LEU 1 0.610 10 1 A 222 GLY 1 0.630 11 1 A 223 THR 1 0.440 12 1 A 224 LYS 1 0.330 13 1 A 225 GLU 1 0.470 14 1 A 226 SER 1 0.500 15 1 A 227 ASN 1 0.330 16 1 A 228 ARG 1 0.250 17 1 A 229 GLU 1 0.370 18 1 A 230 LYS 1 0.510 19 1 A 231 LYS 1 0.500 20 1 A 232 PRO 1 0.460 21 1 A 233 GLU 1 0.450 22 1 A 234 GLU 1 0.620 23 1 A 235 LEU 1 0.630 24 1 A 236 LEU 1 0.620 25 1 A 237 SER 1 0.600 26 1 A 238 CYS 1 0.550 27 1 A 239 ALA 1 0.480 28 1 A 240 ASP 1 0.320 29 1 A 241 CYS 1 0.350 30 1 A 242 GLY 1 0.520 31 1 A 243 SER 1 0.610 32 1 A 244 SER 1 0.630 33 1 A 245 GLY 1 0.620 34 1 A 246 HIS 1 0.630 35 1 A 247 PRO 1 0.600 36 1 A 248 SER 1 0.550 37 1 A 249 CYS 1 0.640 38 1 A 250 LEU 1 0.530 39 1 A 251 LYS 1 0.350 40 1 A 252 PHE 1 0.250 41 1 A 253 CYS 1 0.260 42 1 A 254 PRO 1 0.330 43 1 A 255 GLU 1 0.290 44 1 A 256 LEU 1 0.260 45 1 A 257 THR 1 0.470 46 1 A 258 ALA 1 0.370 47 1 A 259 ASN 1 0.280 48 1 A 260 VAL 1 0.240 49 1 A 261 LYS 1 0.180 50 1 A 262 ALA 1 0.250 51 1 A 263 LEU 1 0.300 52 1 A 264 ARG 1 0.330 53 1 A 265 TRP 1 0.250 54 1 A 266 GLN 1 0.190 55 1 A 267 CYS 1 0.260 56 1 A 268 ILE 1 0.230 57 1 A 269 GLU 1 0.300 58 1 A 270 CYS 1 0.410 59 1 A 271 LYS 1 0.550 60 1 A 272 THR 1 0.660 61 1 A 273 CYS 1 0.710 62 1 A 274 SER 1 0.740 63 1 A 275 ALA 1 0.700 64 1 A 276 CYS 1 0.580 65 1 A 277 ARG 1 0.610 66 1 A 278 VAL 1 0.640 67 1 A 279 GLN 1 0.590 68 1 A 280 GLY 1 0.510 69 1 A 281 LYS 1 0.520 70 1 A 282 ASN 1 0.500 71 1 A 283 ALA 1 0.500 72 1 A 284 ASP 1 0.510 73 1 A 285 ASN 1 0.570 74 1 A 286 MET 1 0.630 75 1 A 287 LEU 1 0.650 76 1 A 288 PHE 1 0.640 77 1 A 289 CYS 1 0.670 78 1 A 290 ASP 1 0.660 79 1 A 291 SER 1 0.660 80 1 A 292 CYS 1 0.680 81 1 A 293 ASP 1 0.580 82 1 A 294 ARG 1 0.680 83 1 A 295 GLY 1 0.680 84 1 A 296 PHE 1 0.680 85 1 A 297 HIS 1 0.720 86 1 A 298 MET 1 0.650 87 1 A 299 GLU 1 0.660 88 1 A 300 CYS 1 0.650 89 1 A 301 CYS 1 0.590 90 1 A 302 ASP 1 0.490 91 1 A 303 PRO 1 0.530 92 1 A 304 PRO 1 0.590 93 1 A 305 LEU 1 0.600 94 1 A 306 SER 1 0.520 95 1 A 307 ARG 1 0.470 96 1 A 308 MET 1 0.540 97 1 A 309 PRO 1 0.430 98 1 A 310 LYS 1 0.340 99 1 A 311 GLY 1 0.290 100 1 A 312 MET 1 0.500 101 1 A 313 TRP 1 0.560 102 1 A 314 ILE 1 0.660 103 1 A 315 CYS 1 0.670 104 1 A 316 GLN 1 0.670 105 1 A 317 VAL 1 0.640 106 1 A 318 CYS 1 0.310 107 1 A 319 ARG 1 0.190 108 1 A 320 PRO 1 0.340 109 1 A 321 LYS 1 0.360 110 1 A 322 LYS 1 0.320 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #