data_SMR-a3f2c5761cf77895107cdd4e97c756de_14 _entry.id SMR-a3f2c5761cf77895107cdd4e97c756de_14 _struct.entry_id SMR-a3f2c5761cf77895107cdd4e97c756de_14 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P11137/ MTAP2_HUMAN, Microtubule-associated protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P11137' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 232687.165 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MTAP2_HUMAN P11137 1 ;MADERKDEAKAPHWTSAPLTEASAHSHPPEIKDQGGAGEGLVRSANGFPYREDEEGAFGEHGSQGTYSNT KENGINGELTSADRETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQEKEAQHKDQTAALPLAAEETANLPPSPPPS PASEQTVTVEEDLLTASKMEFHDQQELTPSTAEPSDQKEKESEKQSKPGEDLKHAALVSQPETTKTYPDK KDMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMKQKTEPSLVVPGIDLPKEPPTPKEQKDWFIEMPTEAKKDEWGL VAPISPGPLTPMREKDVFDDIPKWEGKQFDSPMPSPFQGGSFTLPLDVMKNEIVTETSPFAPAFLQPDDK KSLQQTSGPATAKDSFKIEEPHEAKPDKMAEAPPSEAMTLPKDAHIPVVEEHVMGKVLEEEKEAINQETV QQRDTFTPSGQEPILTEKETELKLEEKTTISDKEAVPKESKPPKPADEEIGIIQTSTEHTFSEQKDQEPT TDMLKQDSFPVSLEQAVTDSAMTSKTLEKAMTEPSALIEKSSIQELFEMRVDDKDKIEGVGAATSAELDM PFYEDKSGMSKYFETSALKEEATKSIEPGSDYYELSDTRESVHESIDTMSPMHKNGDKEFQTGKESQPSP PAQEAGYSTLAQSYPSDLPEEPSSPQERMFTIDPKVYGEKRDLHSKNKDDLTLSRSLGLGGRSAIEQRSM SINLPMSCLDSIALGFNFGRGHDLSPLASDILTNTSGSMDEGDDYLPATTPALEKAPCFPVESKEEEQIE KVKATGEESTQAEISCESPFLAKDFYKNGTVMAPDLPEMLDLAGTRSRLASVSADAEVARRKSVPSETVV EDSRTGLPPVTDENHVIVKTDSQLEDLGYCVFNKYTVPLPSPVQDSENLSGESGTFYEGTDDKVRRDLAT DLSLIEVKLAAAGRVKDEFSVDKEASAHISGDKSGLSKEFDQEKKANDRLDTVLEKSEEHADSKEHAKKT EEAGDEIETFGLGVTYEQALAKDLSIPTDASSEKAEKGLSSVPEIAEVEPSKKVEQGLDFAVQGQLDVKI SDFGQMASGLNIDDRRATELKLEATQDMTPSSKAPQEADAFMGVESGHMKEGTKVSETEVKEKVAKPDLV HQEAVDKEESYESSGEHESLTMESLKADEGKKETSPESSLIQDEIAVKLSVEIPCPPAVSEADLATDERA DVQMEFIQGPKEESKETPDISITPSDVAEPLHETIVSEPAEIQSEEEEIEAQGEYDKLLFRSDTLQITDL GVSGAREEFVETCPSEHKGVIESVVTIEDDFITVVQTTTDEGESGSHSVRFAALEQPEVERRPSPHDEEE FEVEEAAEAQAEPKDGSPEAPASPEREEVALSEYKTETYDDYKDETTIDDSIMDADSLWVDTQDDDRSIM TEQLETIPKEEKAEKEARRSSLEKHRKEKPFKTGRGRISTPERKVAKKEPSTVSRDEVRRKKAVYKKAEL AKKTEVQAHSPSRKFILKPAIKYTRPTHLSCVKRKTTAAGGESALAPSVFKQAKDKVSDGVTKSPEKRSS LPRPSSILPPRRGVSGDRDENSFSLNSSISSSARRTTRSEPIRRAGKSGTSTPTTPGSTAITPGTPPSYS SRTPGTPGTPSYPRTPHTPGTPKSAILVPSEKKVAIIRTPPKSPATPKQLRLINQPLPDLKNVKSKIGST DNIKYQPKGGQVQIVTKKIDLSHVTSKCGSLKNIRHRPGGGRVKIESVKLDFKEKAQAKVGSLDNAHHVP GGGNVKIDSQKLNFREHAKARVDHGAEIITQSPGRSSVASPRRLSNVSSSGSINLLESPQLATLAEDVTA ALAKQGL ; 'Microtubule-associated protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1827 1 1827 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MTAP2_HUMAN P11137 . 1 1827 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-11-25 2C4801C589086603 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no C ;MADERKDEAKAPHWTSAPLTEASAHSHPPEIKDQGGAGEGLVRSANGFPYREDEEGAFGEHGSQGTYSNT KENGINGELTSADRETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQEKEAQHKDQTAALPLAAEETANLPPSPPPS PASEQTVTVEEDLLTASKMEFHDQQELTPSTAEPSDQKEKESEKQSKPGEDLKHAALVSQPETTKTYPDK KDMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMKQKTEPSLVVPGIDLPKEPPTPKEQKDWFIEMPTEAKKDEWGL VAPISPGPLTPMREKDVFDDIPKWEGKQFDSPMPSPFQGGSFTLPLDVMKNEIVTETSPFAPAFLQPDDK KSLQQTSGPATAKDSFKIEEPHEAKPDKMAEAPPSEAMTLPKDAHIPVVEEHVMGKVLEEEKEAINQETV QQRDTFTPSGQEPILTEKETELKLEEKTTISDKEAVPKESKPPKPADEEIGIIQTSTEHTFSEQKDQEPT TDMLKQDSFPVSLEQAVTDSAMTSKTLEKAMTEPSALIEKSSIQELFEMRVDDKDKIEGVGAATSAELDM PFYEDKSGMSKYFETSALKEEATKSIEPGSDYYELSDTRESVHESIDTMSPMHKNGDKEFQTGKESQPSP 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SINLPMSCLDSIALGFNFGRGHDLSPLASDILTNTSGSMDEGDDYLPATTPALEKAPCFPVESKEEEQIE KVKATGEESTQAEISCESPFLAKDFYKNGTVMAPDLPEMLDLAGTRSRLASVSADAEVARRKSVPSETVV EDSRTGLPPVTDENHVIVKTDSQLEDLGYCVFNKYTVPLPSPVQDSENLSGESGTFYEGTDDKVRRDLAT DLSLIEVKLAAAGRVKDEFSVDKEASAHISGDKSGLSKEFDQEKKANDRLDTVLEKSEEHADSKEHAKKT EEAGDEIETFGLGVTYEQALAKDLSIPTDASSEKAEKGLSSVPEIAEVEPSKKVEQGLDFAVQGQLDVKI SDFGQMASGLNIDDRRATELKLEATQDMTPSSKAPQEADAFMGVESGHMKEGTKVSETEVKEKVAKPDLV HQEAVDKEESYESSGEHESLTMESLKADEGKKETSPESSLIQDEIAVKLSVEIPCPPAVSEADLATDERA DVQMEFIQGPKEESKETPDISITPSDVAEPLHETIVSEPAEIQSEEEEIEAQGEYDKLLFRSDTLQITDL GVSGAREEFVETCPSEHKGVIESVVTIEDDFITVVQTTTDEGESGSHSVRFAALEQPEVERRPSPHDEEE FEVEEAAEAQAEPKDGSPEAPASPEREEVALSEYKTETYDDYKDETTIDDSIMDADSLWVDTQDDDRSIM TEQLETIPKEEKAEKEARRSSLEKHRKEKPFKTGRGRISTPERKVAKKEPSTVSRDEVRRKKAVYKKAEL AKKTEVQAHSPSRKFILKPAIKYTRPTHLSCVKRKTTAAGGESALAPSVFKQAKDKVSDGVTKSPEKRSS LPRPSSILPPRRGVSGDRDENSFSLNSSISSSARRTTRSEPIRRAGKSGTSTPTTPGSTAITPGTPPSYS SRTPGTPGTPSYPRTPHTPGTPKSAILVPSEKKVAIIRTPPKSPATPKQLRLINQPLPDLKNVKSKIGST 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A 1 1729 LYS 1729 ? ? ? C . A 1 1730 LEU 1730 ? ? ? C . A 1 1731 ASP 1731 ? ? ? C . A 1 1732 PHE 1732 ? ? ? C . A 1 1733 LYS 1733 ? ? ? C . A 1 1734 GLU 1734 ? ? ? C . A 1 1735 LYS 1735 ? ? ? C . A 1 1736 ALA 1736 ? ? ? C . A 1 1737 GLN 1737 ? ? ? C . A 1 1738 ALA 1738 ? ? ? C . A 1 1739 LYS 1739 ? ? ? C . A 1 1740 VAL 1740 ? ? ? C . A 1 1741 GLY 1741 ? ? ? C . A 1 1742 SER 1742 ? ? ? C . A 1 1743 LEU 1743 ? ? ? C . A 1 1744 ASP 1744 ? ? ? C . A 1 1745 ASN 1745 ? ? ? C . A 1 1746 ALA 1746 ? ? ? C . A 1 1747 HIS 1747 ? ? ? C . A 1 1748 HIS 1748 ? ? ? C . A 1 1749 VAL 1749 ? ? ? C . A 1 1750 PRO 1750 ? ? ? C . A 1 1751 GLY 1751 ? ? ? C . A 1 1752 GLY 1752 ? ? ? C . A 1 1753 GLY 1753 ? ? ? C . A 1 1754 ASN 1754 ? ? ? C . A 1 1755 VAL 1755 ? ? ? C . A 1 1756 LYS 1756 ? ? ? C . A 1 1757 ILE 1757 ? ? ? C . A 1 1758 ASP 1758 ? ? ? C . A 1 1759 SER 1759 ? ? ? C . A 1 1760 GLN 1760 ? ? ? C . A 1 1761 LYS 1761 ? ? ? C . A 1 1762 LEU 1762 ? ? ? C . A 1 1763 ASN 1763 ? ? ? C . A 1 1764 PHE 1764 ? ? ? C . A 1 1765 ARG 1765 ? ? ? C . A 1 1766 GLU 1766 ? ? ? C . A 1 1767 HIS 1767 ? ? ? C . A 1 1768 ALA 1768 ? ? ? C . A 1 1769 LYS 1769 ? ? ? C . A 1 1770 ALA 1770 ? ? ? C . A 1 1771 ARG 1771 ? ? ? C . A 1 1772 VAL 1772 ? ? ? C . A 1 1773 ASP 1773 ? ? ? C . A 1 1774 HIS 1774 ? ? ? C . A 1 1775 GLY 1775 ? ? ? C . A 1 1776 ALA 1776 ? ? ? C . A 1 1777 GLU 1777 ? ? ? C . A 1 1778 ILE 1778 ? ? ? C . A 1 1779 ILE 1779 ? ? ? C . A 1 1780 THR 1780 ? ? ? C . A 1 1781 GLN 1781 ? ? ? C . A 1 1782 SER 1782 ? ? ? C . A 1 1783 PRO 1783 ? ? ? C . A 1 1784 GLY 1784 ? ? ? C . A 1 1785 ARG 1785 ? ? ? C . A 1 1786 SER 1786 ? ? ? C . A 1 1787 SER 1787 ? ? ? C . A 1 1788 VAL 1788 ? ? ? C . A 1 1789 ALA 1789 ? ? ? C . A 1 1790 SER 1790 ? ? ? C . A 1 1791 PRO 1791 ? ? ? C . A 1 1792 ARG 1792 ? ? ? C . A 1 1793 ARG 1793 ? ? ? C . A 1 1794 LEU 1794 ? ? ? C . A 1 1795 SER 1795 ? ? ? C . A 1 1796 ASN 1796 ? ? ? C . A 1 1797 VAL 1797 ? ? ? C . A 1 1798 SER 1798 ? ? ? C . A 1 1799 SER 1799 ? ? ? C . A 1 1800 SER 1800 ? ? ? C . A 1 1801 GLY 1801 ? ? ? C . A 1 1802 SER 1802 ? ? ? C . A 1 1803 ILE 1803 ? ? ? C . A 1 1804 ASN 1804 ? ? ? C . A 1 1805 LEU 1805 ? ? ? C . A 1 1806 LEU 1806 ? ? ? C . A 1 1807 GLU 1807 ? ? ? C . A 1 1808 SER 1808 ? ? ? C . A 1 1809 PRO 1809 ? ? ? C . A 1 1810 GLN 1810 ? ? ? C . A 1 1811 LEU 1811 ? ? ? C . A 1 1812 ALA 1812 ? ? ? C . A 1 1813 THR 1813 ? ? ? C . A 1 1814 LEU 1814 ? ? ? C . A 1 1815 ALA 1815 ? ? ? C . A 1 1816 GLU 1816 ? ? ? C . A 1 1817 ASP 1817 ? ? ? C . A 1 1818 VAL 1818 ? ? ? C . A 1 1819 THR 1819 ? ? ? C . A 1 1820 ALA 1820 ? ? ? C . A 1 1821 ALA 1821 ? ? ? C . A 1 1822 LEU 1822 ? ? ? C . A 1 1823 ALA 1823 ? ? ? C . A 1 1824 LYS 1824 ? ? ? C . A 1 1825 GLN 1825 ? ? ? C . A 1 1826 GLY 1826 ? ? ? C . A 1 1827 LEU 1827 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Isoform 3 of Microtubule-associated protein 2 {PDB ID=8s8o, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=8s8o.1.C}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8s8o, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 14' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 RETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQE RETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQE # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 28 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8s8o 2024-09-25 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1827 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1827 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9.3e-10 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MADERKDEAKAPHWTSAPLTEASAHSHPPEIKDQGGAGEGLVRSANGFPYREDEEGAFGEHGSQGTYSNTKENGINGELTSADRETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQEKEAQHKDQTAALPLAAEETANLPPSPPPSPASEQTVTVEEDLLTASKMEFHDQQELTPSTAEPSDQKEKESEKQSKPGEDLKHAALVSQPETTKTYPDKKDMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMKQKTEPSLVVPGIDLPKEPPTPKEQKDWFIEMPTEAKKDEWGLVAPISPGPLTPMREKDVFDDIPKWEGKQFDSPMPSPFQGGSFTLPLDVMKNEIVTETSPFAPAFLQPDDKKSLQQTSGPATAKDSFKIEEPHEAKPDKMAEAPPSEAMTLPKDAHIPVVEEHVMGKVLEEEKEAINQETVQQRDTFTPSGQEPILTEKETELKLEEKTTISDKEAVPKESKPPKPADEEIGIIQTSTEHTFSEQKDQEPTTDMLKQDSFPVSLEQAVTDSAMTSKTLEKAMTEPSALIEKSSIQELFEMRVDDKDKIEGVGAATSAELDMPFYEDKSGMSKYFETSALKEEATKSIEPGSDYYELSDTRESVHESIDTMSPMHKNGDKEFQTGKESQPSPPAQEAGYSTLAQSYPSDLPEEPSSPQERMFTIDPKVYGEKRDLHSKNKDDLTLSRSLGLGGRSAIEQRSMSINLPMSCLDSIALGFNFGRGHDLSPLASDILTNTSGSMDEGDDYLPATTPALEKAPCFPVESKEEEQIEKVKATGEESTQAEISCESPFLAKDFYKNGTVMAPDLPEMLDLAGTRSRLASVSADAEVARRKSVPSETVVEDSRTGLPPVTDENHVIVKTDSQLEDLGYCVFNKYTVPLPSPVQDSENLSGESGTFYEGTDDKVRRDLATDLSLIEVKLAAAGRVKDEFSVDKEASAHISGDKSGLSKEFDQEKKANDRLDTVLEKSEEHADSKEHAKKTEEAGDEIETFGLGVTYEQALAKDLSIPTDASSEKAEKGLSSVPEIAEVEPSKKVEQGLDFAVQGQLDVKISDFGQMASGLNIDDRRATELKLEATQDMTPSSKAPQEADAFMGVESGHMKEGTKVSETEVKEKVAKPDLVHQEAVDKEESYESSGEHESLTMESLKADEGKKETSPESSLIQDEIAVKLSVEIPCPPAVSEADLATDERADVQMEFIQGPKEESKETPDISITPSDVAEPLHETIVSEPAEIQSEEEEIEAQGEYDKLLFRSDTLQITDLGVSGAREEFVETCPSEHKGVIESVVTIEDDFITVVQTTTDEGESGSHSVRFAALEQPEVERRPSPHDEEEFEVEEAAEAQAEPKDGSPEAPASPEREEVALSEYKTETYDDYKDETTIDDSIMDADSLWVDTQDDDRSIMTEQLETIPKEEKAEKEARRSSLEKHRKEKPFKTGRGRISTPERKVAKKEPSTVSRDEVRRKKAVYKKAELAKKTEVQAHSPSRKFILKPAIKYTRPTHLSCVKRKTTAAGGESALAPSVFKQAKDKVSDGVTKSPEKRSSLPRPSSILPPRRGVSGDRDENSFSLNSSISSSARRTTRSEPIRRAGKSGTSTPTTPGSTAITPGTPPSYSSRTPGTPGTPSYPRTPHTPGTPKSAILVPSEKKVAIIRTPPKSPATPKQLRLINQPLPDLKNVKSKIGSTDNIKYQPKGGQVQIVTKKIDLSHVTSKCGSLKNIRHRPGGGRVKIESVKLDFKEKAQAKVGSLDNAHHVPGGGNVKIDSQKLNFREHAKARVDHGAEIITQSPGRSSVASPRRLSNVSSSGSINLLESPQLATLAEDVTAALAKQGL 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------RETAEEVSARIVQVVTAEAVAVLKGEQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8s8o.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 14' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 84 84 ? A -3.659 23.801 -1.774 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 2 C CA . ARG 84 84 ? A -4.694 23.031 -2.560 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 3 C C . ARG 84 84 ? A -4.041 21.770 -3.022 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 4 O O . ARG 84 84 ? A -2.961 21.861 -3.578 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 5 C CB . ARG 84 84 ? A -5.190 23.856 -3.795 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 6 C CG . ARG 84 84 ? A -5.813 25.229 -3.451 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 7 C CD . ARG 84 84 ? A -7.027 25.117 -2.521 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 8 N NE . ARG 84 84 ? A -7.414 26.501 -2.111 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 9 C CZ . ARG 84 84 ? A -8.284 26.754 -1.122 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 84 84 ? A -8.826 25.771 -0.408 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 84 84 ? A -8.642 28.006 -0.853 1 1 C ARG 0.340 1 ATOM 12 N N . GLU 85 85 ? A -4.623 20.594 -2.742 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 13 C CA . GLU 85 85 ? A -3.939 19.371 -3.016 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 14 C C . GLU 85 85 ? A -5.050 18.359 -3.121 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 15 O O . GLU 85 85 ? A -6.141 18.599 -2.606 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 16 C CB . GLU 85 85 ? A -2.941 19.051 -1.869 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 17 C CG . GLU 85 85 ? A -2.149 17.748 -2.044 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 18 C CD . GLU 85 85 ? A -1.355 17.715 -3.334 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 19 O OE1 . GLU 85 85 ? A -1.974 17.630 -4.422 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 20 O OE2 . GLU 85 85 ? A -0.110 17.718 -3.213 1 1 C GLU 0.470 1 ATOM 21 N N . THR 86 86 ? A -4.813 17.257 -3.840 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 22 C CA . THR 86 86 ? A -5.815 16.257 -4.173 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 23 C C . THR 86 86 ? A -5.405 14.923 -3.578 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 24 O O . THR 86 86 ? A -4.242 14.662 -3.303 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 25 C CB . THR 86 86 ? A -6.034 16.152 -5.690 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 26 O OG1 . THR 86 86 ? A -6.939 15.117 -6.059 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 27 C CG2 . THR 86 86 ? A -4.718 15.907 -6.444 1 1 C THR 0.730 1 ATOM 28 N N . ALA 87 87 ? A -6.399 14.018 -3.374 1 1 C ALA 0.790 1 ATOM 29 C CA . ALA 87 87 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #