data_SMR-a3b71f45ba15f5fbec0ac8c446685cc9_3 _entry.id SMR-a3b71f45ba15f5fbec0ac8c446685cc9_3 _struct.entry_id SMR-a3b71f45ba15f5fbec0ac8c446685cc9_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A2AQ25/ SKT_MOUSE, Sickle tail protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A2AQ25' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 248382.887 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SKT_MOUSE A2AQ25 1 ;MEESEGQKCEPNLPPSGDSRQMPQQGRSNLHVTSQEDAACRRPRERLSNGNARAQVSKPARNIPRRHTLG GPRSSKEILGMQPSEMDRKREAFLEHLKQKYPHHATAIMGHQERLRDQTKSPKLSHSPQPPNLGDPVEHL SETSGDSLEAMSEGEVPSPFARGSRTRASLPVVRSANQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEVTSTDTI RALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDDSRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPSHAFNHMTKAVNGD MRMQREIVYARGDGLVAPRPGSVAHPPHVIPNSPPSTPVPHSLPPSPSRIPYGGSRPMAIPGNATIPRDR LSSLPVSRSISPSPSAILERRDVKPDEDMSSKNLVMFRNEGFYADPYLYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDH VIAYHRTAIRSASAYCSPSLQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVGDLRMIDLHPHL NTHGPPHTLQPDRASPSRQSFKKEPGTLVYIEKPRNTSGLSSLVDLGPPLVEKQGFAYSTTTIPKDRETR ERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKGPITSSSKEASSEKMVKATANRNQADGAGTAHVSAGKVLGSVEFSLP PSQPLPAGTSPIHTSLLDMRRNVAELRLQLQQMRQLQLQNQEILRAMMKKAELEISNKVKETMKRLEDPV QRQRTLVEQERQKYLHEEERIVKKLCELEDFVEDLKKDSSSTGRVVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKG EFPTLQNKMRAVLRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDASQAAQYVAM EKATAAEVLKHQEETAHAPGQPLHCSTGSPGDVKSEVVPLSTMTVHHVQSSPVVMQPSQHSSALMNPAQN LPGGTRPHTASPPAITQEVTSAQSAPGPQSPQTPVNGSSMQSLFIEEIHSVSAKNRAVSIEKAEKKWEEK RQNLEHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLEMPPASSPVSKGDAAGDKLELSEDSPNSEQELDKIGGKSP PPPPPPPRRSYLPGSGLTTTRSGDVVYTGRSMSKVSSEDPGPTPQTRATKCPPEEPASAWAPSPPPVPAP SSKEEEEEEEEGDKIMAELQAFQKCSFMDVNPNSHAEQSRANSHLKDTRAGATAPPKEKKNLEFYHEDVR KSDVECENGPQVESQKVTAGALRPSGPPKWERVMVDSISDTSRTSECRADTFTEENATPNKSLFRDSRNY SQKNVPKVSFSSSGLNSLEGEINKGPNVSGLQCAIPDLENQKLNFGKTKEIGQQGQENADKSHIPLPTRS AEFSIHDVKTQDQDVPVTGYGQVVLRSKVGRHANMNMNEDGESTPSSPSEEHTATDNIAFMITKTAVQVL SSGEVHDIVSQKGQDVQTVNIDGRKETASQHEGTEGEEPVVCLDKKPVIIIFDEPMDIRSAYKRLSTIFE ECDEELERMLTEEKIEEEEEDENEDSGVRTSSQMSCEQVDSRSDRMGQKAETQSQPHVLSAELLTPGVQG VRKAEQRKLSSADSPDSGNKCGMVDDQFESPKKKFKFKFPKKQLAALTQAIRTGTKTGKKTLQVVVYEEE EEDGTLKQHKEAKRFEITRSQPEDALKTMARRQEQLSPEGTLPASRTDEIRKSTYRTLDSLEQTIKQLEN TISEMSPRALVDTSCSSNRDCGASLPHMAQEVSPRSLLVLDEVPPAPEPPTSISPASRKGSSTTPQTSRM PVPMTSKNRPGSLDKASKQSKLQDPRQYRQANGSAKKAGGDCKPTSPSLPASKIPALSPSSGKSSSLPSA SGDSSNLPNAPATKPSIASTPLSPQAGRSAHSASLIPSVSNGSLKFQSPPHAGKGHHHLSFALQTQNGRA APTTSSSSSPPSPASPTSLNQGARGIRTIHTPSLASYKAQNGSSSKATPSTAKETS ; 'Sickle tail protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1946 1 1946 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SKT_MOUSE A2AQ25 . 1 1946 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-02-20 E5D411BD044DC1CB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no J ;MEESEGQKCEPNLPPSGDSRQMPQQGRSNLHVTSQEDAACRRPRERLSNGNARAQVSKPARNIPRRHTLG GPRSSKEILGMQPSEMDRKREAFLEHLKQKYPHHATAIMGHQERLRDQTKSPKLSHSPQPPNLGDPVEHL SETSGDSLEAMSEGEVPSPFARGSRTRASLPVVRSANQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEVTSTDTI RALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDDSRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPSHAFNHMTKAVNGD MRMQREIVYARGDGLVAPRPGSVAHPPHVIPNSPPSTPVPHSLPPSPSRIPYGGSRPMAIPGNATIPRDR LSSLPVSRSISPSPSAILERRDVKPDEDMSSKNLVMFRNEGFYADPYLYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDH VIAYHRTAIRSASAYCSPSLQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVGDLRMIDLHPHL NTHGPPHTLQPDRASPSRQSFKKEPGTLVYIEKPRNTSGLSSLVDLGPPLVEKQGFAYSTTTIPKDRETR ERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKGPITSSSKEASSEKMVKATANRNQADGAGTAHVSAGKVLGSVEFSLP 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J . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynein regulatory complex protein 9 {PDB ID=8th8, label_asym_id=J, auth_asym_id=J, SMTL ID=8th8.1.J}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8th8, label_asym_id=J' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A J 10 1 J # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MNQIDAHKLTIILRDATERLTFLDTINRQDDLSSELAGYEISKLLKKQKNLENQYADLVQLRTSLTGIQN KKNLIETQTKIVDVAQNLKESTKKLCRLFKENPDLESDALKVKKDRIQFMAVIEQLIQMVQNNSLTKFQS MTTLELEDQDRLRKLIFREKELYQEIKKLQFDRNQENKEYDNEQKDTNLKIQNLKERLLYKKARAQLKNQ YKEKEARAEEGTQQRMYEFEQKQLKEKINNLKQKTDTENMVHEQLRNFLIEKEDQIKQKSDEWAKKVETC REQLQEEIDRLTVEKEKKQEELRELRERDQKEQEEKDRRERQELEEADRKQQEELDQIRLDNAIKLIQIE YQEWKDAGGGKKKRKKGKKKKK ; ;MNQIDAHKLTIILRDATERLTFLDTINRQDDLSSELAGYEISKLLKKQKNLENQYADLVQLRTSLTGIQN KKNLIETQTKIVDVAQNLKESTKKLCRLFKENPDLESDALKVKKDRIQFMAVIEQLIQMVQNNSLTKFQS MTTLELEDQDRLRKLIFREKELYQEIKKLQFDRNQENKEYDNEQKDTNLKIQNLKERLLYKKARAQLKNQ YKEKEARAEEGTQQRMYEFEQKQLKEKINNLKQKTDTENMVHEQLRNFLIEKEDQIKQKSDEWAKKVETC REQLQEEIDRLTVEKEKKQEELRELRERDQKEQEEKDRRERQELEEADRKQQEELDQIRLDNAIKLIQIE YQEWKDAGGGKKKRKKGKKKKK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 160 310 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8th8 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1946 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1963 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 24.000 8.955 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEESEGQKCEPNLPPSGDSRQMPQQGRSNLHVTSQEDAACRRPRERLSNGNARAQVSKPARNIPRRHTLGGPRSSKEILGMQPSEMDRKREAFLEHLKQKYPHHATAIMGHQERLRDQTKSPKLSHSPQPPNLGDPVEHLSETSGDSLEAMSEGEVPSPFARGSRTRASLPVVRSANQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEVTSTDTIRALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDDSRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPSHAFNHMTKAVNGDMRMQREIVYARGDGLVAPRPGSVAHPPHVIPNSPPSTPVPHSLPPSPSRIPYGGSRPMAIPGNATIPRDRLSSLPVSRSISPSPSAILERRDVKPDEDMSSKNLVMFRNEGFYADPYLYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDHVIAYHRTAIRSASAYCSPSLQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVGDLRMIDLHPHLNTHGPPHTLQPDRASPSRQSFKKEPGTLVYIEKPRNTSGLSSLVDLGPPLVEKQGFAYSTTTIPKDRETRERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKGPITSSSKEASSEKMVKATANRNQADGAGTAHVSAGKVLGSVEFSLPPSQPLPAGTSPIHTSLLDMRRNVAELRLQLQQMRQLQLQNQEILRAMMKKAELEISNKVKETMKRLEDPVQRQRTLVEQERQKYLHEEERIVKKLCELEDFVEDLKKDSSSTGR-----------VVT------LKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNKMRAVLRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDASQAAQYVAMEKATAAEVLKHQEETAHAPGQPLHCSTGSPGDVKSEVVPLSTMTVHHVQSSPVVMQPSQHSSALMNPAQNLPGGTRPHTASPPAITQEVTSAQSAPGPQSPQTPVNGSSMQSLFIEEIHSVSAKNRAVSIEKAEKKWEEKRQNLEHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLEMPPASSPVSKGDAAGDKLELSEDSPNSEQELDKIGGKSPPPPPPPPRRSYLPGSGLTTTRSGDVVYTGRSMSKVSSEDPGPTPQTRATKCPPEEPASAWAPSPPPVPAPSSKEEEEEEEEGDKIMAELQAFQKCSFMDVNPNSHAEQSRANSHLKDTRAGATAPPKEKKNLEFYHEDVRKSDVECENGPQVESQKVTAGALRPSGPPKWERVMVDSISDTSRTSECRADTFTEENATPNKSLFRDSRNYSQKNVPKVSFSSSGLNSLEGEINKGPNVSGLQCAIPDLENQKLNFGKTKEIGQQGQENADKSHIPLPTRSAEFSIHDVKTQDQDVPVTGYGQVVLRSKVGRHANMNMNEDGESTPSSPSEEHTATDNIAFMITKTAVQVLSSGEVHDIVSQKGQDVQTVNIDGRKETASQHEGTEGEEPVVCLDKKPVIIIFDEPMDIRSAYKRLSTIFEECDEELERMLTEEKIEEEEEDENEDSGVRTSSQMSCEQVDSRSDRMGQKAETQSQPHVLSAELLTPGVQGVRKAEQRKLSSADSPDSGNKCGMVDDQFESPKKKFKFKFPKKQLAALTQAIRTGTKTGKKTLQVVVYEEEEEDGTLKQHKEAKRFEITRSQPEDALKTMARRQEQLSPEGTLPASRTDEIRKSTYRTLDSLEQTIKQLENTISEMSPRALVDTSCSSNRDCGASLPHMAQEVSPRSLLVLDEVPPAPEPPTSISPASRKGSSTTPQTSRMPVPMTSKNRPGSLDKASKQSKLQDPRQYRQANGSAKKAGGDCKPTSPSLPASKIPALSPSSGKSSSLPSASGDSSNLPNAPATKPSIASTPLSPQAGRSAHSASLIPSVSNGSLKFQSPPHAGKGHHHLSFALQTQNGRAAPTTSSSSSPPSPASPTSLNQGARGIRTIHTPSLASYKAQNGSSSKATPSTAKETS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KELYQEIKKLQFDRNQENKEYDNEQKDTNLKIQNLKERLLYKKARAQLKNQYKEKEARAEEGTQQRMYEFEQKQLKEKINNLKQKTDTENMVHEQLRNFLIEKEDQIKQKSDEWAKKVETCREQLQEEIDRLTVEKEKKQEELRELRERDQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8th8.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 647 647 ? A 408.482 150.780 250.189 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 2 C CA . LEU 647 647 ? A 407.388 150.915 249.168 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 3 C C . LEU 647 647 ? A 406.093 150.271 249.622 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 4 O O . LEU 647 647 ? A 405.116 150.979 249.812 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 5 C CB . LEU 647 647 ? A 407.887 150.408 247.799 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 6 C CG . LEU 647 647 ? A 406.880 150.564 246.638 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 647 647 ? A 406.472 152.022 246.351 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 647 647 ? A 407.461 149.913 245.375 1 1 J LEU 0.500 1 ATOM 9 N N . ASP 648 648 ? A 406.094 148.952 249.910 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 10 C CA . ASP 648 648 ? A 404.945 148.194 250.387 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 11 C C . ASP 648 648 ? A 404.324 148.749 251.646 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 12 O O . ASP 648 648 ? A 403.113 148.889 251.758 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 13 C CB . ASP 648 648 ? A 405.410 146.743 250.636 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 14 C CG . ASP 648 648 ? A 405.849 146.124 249.315 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 15 O OD1 . ASP 648 648 ? A 405.637 146.765 248.256 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 16 O OD2 . ASP 648 648 ? A 406.488 145.051 249.386 1 1 J ASP 0.560 1 ATOM 17 N N . MET 649 649 ? A 405.160 149.174 252.614 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 18 C CA . MET 649 649 ? A 404.676 149.846 253.803 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 19 C C . MET 649 649 ? A 403.897 151.122 253.503 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 20 O O . MET 649 649 ? A 402.803 151.303 254.011 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 21 C CB . MET 649 649 ? A 405.830 150.155 254.780 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 22 C CG . MET 649 649 ? A 406.485 148.883 255.349 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 23 S SD . MET 649 649 ? A 407.934 149.212 256.398 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 24 C CE . MET 649 649 ? A 407.040 149.953 257.796 1 1 J MET 0.570 1 ATOM 25 N N . ARG 650 650 ? A 404.390 152.001 252.604 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 26 C CA . ARG 650 650 ? A 403.667 153.191 252.179 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 27 C C . ARG 650 650 ? A 402.350 152.879 251.483 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 28 O O . ARG 650 650 ? A 401.341 153.534 251.727 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 29 C CB . ARG 650 650 ? A 404.510 154.073 251.230 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 30 C CG . ARG 650 650 ? A 405.686 154.775 251.934 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 31 C CD . ARG 650 650 ? A 406.331 155.872 251.084 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 32 N NE . ARG 650 650 ? A 406.933 155.210 249.876 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 33 C CZ . ARG 650 650 ? A 408.179 154.726 249.801 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 34 N NH1 . ARG 650 650 ? A 408.994 154.731 250.851 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 35 N NH2 . ARG 650 650 ? A 408.635 154.248 248.642 1 1 J ARG 0.590 1 ATOM 36 N N . ARG 651 651 ? A 402.341 151.846 250.610 1 1 J ARG 0.610 1 ATOM 37 C CA . ARG 651 651 ? A 401.139 151.367 249.953 1 1 J ARG 0.610 1 ATOM 38 C C . ARG 651 651 ? A 400.087 150.848 250.914 1 1 J ARG 0.610 1 ATOM 39 O O . ARG 651 651 ? A 398.907 151.182 250.784 1 1 J ARG 0.610 1 ATOM 40 C CB . ARG 651 651 ? 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A 399.937 146.947 252.043 1 1 J ASN 0.710 1 ATOM 54 N ND2 . ASN 652 652 ? A 401.553 146.334 253.487 1 1 J ASN 0.710 1 ATOM 55 N N . VAL 653 653 ? A 400.041 151.565 254.314 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 56 C CA . VAL 653 653 ? A 399.639 152.674 255.168 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 57 C C . VAL 653 653 ? A 398.620 153.585 254.501 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 58 O O . VAL 653 653 ? A 397.623 153.956 255.116 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 59 C CB . VAL 653 653 ? A 400.836 153.492 255.654 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 60 C CG1 . VAL 653 653 ? A 400.392 154.751 256.422 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 61 C CG2 . VAL 653 653 ? A 401.676 152.639 256.624 1 1 J VAL 0.720 1 ATOM 62 N N . ALA 654 654 ? A 398.810 153.935 253.210 1 1 J ALA 0.760 1 ATOM 63 C CA . ALA 654 654 ? A 397.850 154.723 252.463 1 1 J ALA 0.760 1 ATOM 64 C C . ALA 654 654 ? A 396.490 154.051 252.329 1 1 J ALA 0.760 1 ATOM 65 O O . ALA 654 654 ? A 395.464 154.662 252.617 1 1 J ALA 0.760 1 ATOM 66 C CB . ALA 654 654 ? 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A 359.003 163.843 268.742 1 1 J LEU 0.640 1 ATOM 314 N N . GLU 684 684 ? A 356.542 159.280 267.003 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 315 C CA . GLU 684 684 ? A 355.365 158.547 266.586 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 316 C C . GLU 684 684 ? A 354.650 157.870 267.740 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 317 O O . GLU 684 684 ? A 353.428 157.943 267.842 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 318 C CB . GLU 684 684 ? A 355.715 157.517 265.505 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 319 C CG . GLU 684 684 ? A 356.108 158.192 264.172 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 320 C CD . GLU 684 684 ? A 356.509 157.179 263.105 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 321 O OE1 . GLU 684 684 ? A 356.511 155.957 263.401 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 322 O OE2 . GLU 684 684 ? A 356.800 157.639 261.970 1 1 J GLU 0.650 1 ATOM 323 N N . ILE 685 685 ? A 355.395 157.244 268.680 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 324 C CA . ILE 685 685 ? A 354.839 156.649 269.892 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 325 C C . ILE 685 685 ? A 354.114 157.692 270.738 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 326 O O . ILE 685 685 ? A 352.964 157.490 271.121 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 327 C CB . ILE 685 685 ? A 355.909 155.926 270.723 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 328 C CG1 . ILE 685 685 ? A 356.436 154.688 269.958 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 329 C CG2 . ILE 685 685 ? A 355.379 155.493 272.115 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 330 C CD1 . ILE 685 685 ? A 357.758 154.144 270.518 1 1 J ILE 0.640 1 ATOM 331 N N . SER 686 686 ? A 354.728 158.873 270.989 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 332 C CA . SER 686 686 ? A 354.103 159.950 271.755 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 333 C C . SER 686 686 ? A 352.835 160.492 271.120 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 334 O O . SER 686 686 ? A 351.836 160.697 271.806 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 335 C CB . SER 686 686 ? A 355.053 161.138 272.108 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 336 O OG . SER 686 686 ? A 355.444 161.922 270.982 1 1 J SER 0.690 1 ATOM 337 N N . ASN 687 687 ? A 352.832 160.686 269.784 1 1 J ASN 0.630 1 ATOM 338 C CA . ASN 687 687 ? A 351.654 161.050 269.012 1 1 J ASN 0.630 1 ATOM 339 C C . ASN 687 687 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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