data_SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_4 _entry.id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_4 _struct.entry_id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - C8YR32/ LOXH1_MOUSE, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.023, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries C8YR32' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 273295.196 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LOXH1_MOUSE C8YR32 1 ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC GSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFD LLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILD IAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWT SYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVW HDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETG NGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKR ELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYE PGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVE KVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV ; 'Lipoxygenase homology domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2068 1 2068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LOXH1_MOUSE C8YR32 . 1 2068 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2009-11-03 65B9CEE21632016B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG 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AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC 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A 1 1843 PHE 1843 ? ? ? B . A 1 1844 LEU 1844 ? ? ? B . A 1 1845 VAL 1845 ? ? ? B . A 1 1846 GLU 1846 ? ? ? B . A 1 1847 ASN 1847 ? ? ? B . A 1 1848 SER 1848 ? ? ? B . A 1 1849 SER 1849 ? ? ? B . A 1 1850 ARG 1850 ? ? ? B . A 1 1851 GLN 1851 ? ? ? B . A 1 1852 ARG 1852 ? ? ? B . A 1 1853 ALA 1853 ? ? ? B . A 1 1854 PHE 1854 ? ? ? B . A 1 1855 ARG 1855 ? ? ? B . A 1 1856 LYS 1856 ? ? ? B . A 1 1857 GLY 1857 ? ? ? B . A 1 1858 THR 1858 ? ? ? B . A 1 1859 THR 1859 ? ? ? B . A 1 1860 ASP 1860 ? ? ? B . A 1 1861 THR 1861 ? ? ? B . A 1 1862 PHE 1862 ? ? ? B . A 1 1863 GLU 1863 ? ? ? B . A 1 1864 PHE 1864 ? ? ? B . A 1 1865 ASP 1865 ? ? ? B . A 1 1866 SER 1866 ? ? ? B . A 1 1867 ILE 1867 ? ? ? B . A 1 1868 PHE 1868 ? ? ? B . A 1 1869 LEU 1869 ? ? ? B . A 1 1870 GLY 1870 ? ? ? B . A 1 1871 ASP 1871 ? ? ? B . A 1 1872 ILE 1872 ? ? ? B . A 1 1873 ALA 1873 ? ? ? B . A 1 1874 SER 1874 ? ? ? B . A 1 1875 LEU 1875 ? ? ? B . A 1 1876 CYS 1876 ? ? ? B . A 1 1877 VAL 1877 ? ? ? B . A 1 1878 GLY 1878 ? ? ? B . A 1 1879 HIS 1879 ? ? ? B . A 1 1880 LEU 1880 ? ? ? B . A 1 1881 ALA 1881 ? ? ? B . A 1 1882 ARG 1882 ? ? ? B . A 1 1883 GLU 1883 ? ? ? B . A 1 1884 ASP 1884 ? ? ? B . A 1 1885 ARG 1885 ? ? ? B . A 1 1886 PHE 1886 ? ? ? B . A 1 1887 ILE 1887 ? ? ? B . A 1 1888 PRO 1888 ? ? ? B . A 1 1889 LYS 1889 ? ? ? B . A 1 1890 ARG 1890 ? ? ? B . A 1 1891 GLU 1891 ? ? ? B . A 1 1892 LEU 1892 ? ? ? B . A 1 1893 VAL 1893 ? ? ? B . A 1 1894 TRP 1894 ? ? ? B . A 1 1895 HIS 1895 ? ? ? B . A 1 1896 VAL 1896 ? ? ? B . A 1 1897 LYS 1897 ? ? ? B . A 1 1898 THR 1898 ? ? ? B . A 1 1899 ILE 1899 ? ? ? B . A 1 1900 THR 1900 ? ? ? B . A 1 1901 ILE 1901 ? ? ? B . A 1 1902 THR 1902 ? ? ? B . A 1 1903 GLU 1903 ? ? ? B . A 1 1904 MET 1904 ? ? ? B . A 1 1905 GLU 1905 ? ? ? B . A 1 1906 TYR 1906 ? ? ? B . A 1 1907 GLY 1907 ? ? ? B . A 1 1908 ASN 1908 ? ? ? B . A 1 1909 VAL 1909 ? ? ? B . A 1 1910 TYR 1910 ? ? ? B . A 1 1911 PHE 1911 ? ? ? B . A 1 1912 PHE 1912 ? ? ? B . A 1 1913 ASN 1913 ? ? ? B . A 1 1914 CYS 1914 ? ? ? B . A 1 1915 ASP 1915 ? ? ? B . A 1 1916 CYS 1916 ? ? ? B . A 1 1917 LEU 1917 ? ? ? B . A 1 1918 ILE 1918 ? ? ? B . A 1 1919 PRO 1919 ? ? ? B . A 1 1920 LEU 1920 ? ? ? B . A 1 1921 LYS 1921 ? ? ? B . A 1 1922 ARG 1922 ? ? ? B . A 1 1923 LYS 1923 ? ? ? B . A 1 1924 ARG 1924 ? ? ? B . A 1 1925 LYS 1925 ? ? ? B . A 1 1926 TYR 1926 ? ? ? B . A 1 1927 PHE 1927 ? ? ? B . A 1 1928 LYS 1928 ? ? ? B . A 1 1929 VAL 1929 ? ? ? B . A 1 1930 PHE 1930 ? ? ? B . A 1 1931 GLU 1931 ? ? ? B . A 1 1932 VAL 1932 ? ? ? B . A 1 1933 THR 1933 ? ? ? B . A 1 1934 LYS 1934 ? ? ? B . A 1 1935 THR 1935 ? ? ? B . A 1 1936 THR 1936 ? ? ? B . A 1 1937 GLU 1937 ? ? ? B . A 1 1938 SER 1938 ? ? ? B . A 1 1939 PHE 1939 ? ? ? B . A 1 1940 ALA 1940 ? ? ? B . A 1 1941 SER 1941 ? ? ? B . A 1 1942 LYS 1942 ? ? ? B . A 1 1943 ILE 1943 ? ? ? B . A 1 1944 GLN 1944 ? ? ? B . A 1 1945 SER 1945 ? ? ? B . A 1 1946 LEU 1946 ? ? ? B . A 1 1947 VAL 1947 ? ? ? B . A 1 1948 PRO 1948 ? ? ? B . A 1 1949 VAL 1949 ? ? ? B . A 1 1950 LYS 1950 ? ? ? B . A 1 1951 TYR 1951 ? ? ? B . A 1 1952 GLU 1952 ? ? ? B . A 1 1953 VAL 1953 ? ? ? B . A 1 1954 ILE 1954 ? ? ? B . A 1 1955 VAL 1955 ? ? ? B . A 1 1956 THR 1956 ? ? ? B . A 1 1957 THR 1957 ? ? ? B . A 1 1958 GLY 1958 ? ? ? B . A 1 1959 TYR 1959 ? ? ? B . A 1 1960 GLU 1960 ? ? ? B . A 1 1961 PRO 1961 ? ? ? B . A 1 1962 GLY 1962 ? ? ? B . A 1 1963 ALA 1963 ? ? ? B . A 1 1964 GLY 1964 ? ? ? B . A 1 1965 THR 1965 ? ? ? B . A 1 1966 ASP 1966 ? ? ? B . A 1 1967 ALA 1967 ? ? ? B . A 1 1968 ASN 1968 ? ? ? B . A 1 1969 VAL 1969 ? ? ? B . A 1 1970 PHE 1970 ? ? ? B . A 1 1971 VAL 1971 ? ? ? B . A 1 1972 THR 1972 ? ? ? B . A 1 1973 ILE 1973 ? ? ? B . A 1 1974 PHE 1974 ? ? ? B . A 1 1975 GLY 1975 ? ? ? B . A 1 1976 ALA 1976 ? ? ? B . A 1 1977 ASN 1977 ? ? ? B . A 1 1978 GLY 1978 ? ? ? B . A 1 1979 ASP 1979 ? ? ? B . A 1 1980 THR 1980 ? ? ? B . A 1 1981 GLY 1981 ? ? ? B . A 1 1982 LYS 1982 ? ? ? B . A 1 1983 ARG 1983 ? ? ? B . A 1 1984 GLU 1984 ? ? ? B . A 1 1985 LEU 1985 ? ? ? B . A 1 1986 LYS 1986 ? ? ? B . A 1 1987 GLN 1987 ? ? ? B . A 1 1988 LYS 1988 ? ? ? B . A 1 1989 MET 1989 ? ? ? B . A 1 1990 ARG 1990 ? ? ? B . A 1 1991 ASN 1991 ? ? ? B . A 1 1992 LEU 1992 ? ? ? B . A 1 1993 PHE 1993 ? ? ? B . A 1 1994 GLU 1994 ? ? ? B . A 1 1995 ARG 1995 ? ? ? B . A 1 1996 GLY 1996 ? ? ? B . A 1 1997 SER 1997 ? ? ? B . A 1 1998 THR 1998 ? ? ? B . A 1 1999 ASP 1999 ? ? ? B . A 1 2000 ARG 2000 ? ? ? B . A 1 2001 PHE 2001 ? ? ? B . A 1 2002 PHE 2002 ? ? ? B . A 1 2003 LEU 2003 ? ? ? B . A 1 2004 GLU 2004 ? ? ? B . A 1 2005 THR 2005 ? ? ? B . A 1 2006 LEU 2006 ? ? ? B . A 1 2007 GLU 2007 ? ? ? B . A 1 2008 LEU 2008 ? ? ? B . A 1 2009 GLY 2009 ? ? ? B . A 1 2010 GLU 2010 ? ? ? B . A 1 2011 LEU 2011 ? ? ? B . A 1 2012 ARG 2012 ? ? ? B . A 1 2013 LYS 2013 ? ? ? B . A 1 2014 VAL 2014 ? ? ? B . A 1 2015 ARG 2015 ? ? ? B . A 1 2016 LEU 2016 ? ? ? B . A 1 2017 GLU 2017 ? ? ? B . A 1 2018 HIS 2018 ? ? ? B . A 1 2019 ASP 2019 ? ? ? B . A 1 2020 SER 2020 ? ? ? B . A 1 2021 SER 2021 ? ? ? B . A 1 2022 GLY 2022 ? ? ? B . A 1 2023 TYR 2023 ? ? ? B . A 1 2024 TYR 2024 ? ? ? B . A 1 2025 SER 2025 ? ? ? B . A 1 2026 GLY 2026 ? ? ? B . A 1 2027 TRP 2027 ? ? ? B . A 1 2028 LEU 2028 ? ? ? B . A 1 2029 VAL 2029 ? ? ? B . A 1 2030 GLU 2030 ? ? ? B . A 1 2031 LYS 2031 ? ? ? B . A 1 2032 VAL 2032 ? ? ? B . A 1 2033 GLU 2033 ? ? ? B . A 1 2034 VAL 2034 ? ? ? B . A 1 2035 THR 2035 ? ? ? B . A 1 2036 ASN 2036 ? ? ? B . A 1 2037 THR 2037 ? ? ? B . A 1 2038 SER 2038 ? ? ? B . A 1 2039 THR 2039 ? ? ? B . A 1 2040 GLY 2040 ? ? ? B . A 1 2041 VAL 2041 ? ? ? B . A 1 2042 ALA 2042 ? ? ? B . A 1 2043 THR 2043 ? ? ? B . A 1 2044 ILE 2044 ? ? ? B . A 1 2045 PHE 2045 ? ? ? B . A 1 2046 SER 2046 ? ? ? B . A 1 2047 CYS 2047 ? ? ? B . A 1 2048 GLY 2048 ? ? ? B . A 1 2049 ARG 2049 ? ? ? B . A 1 2050 TRP 2050 ? ? ? B . A 1 2051 LEU 2051 ? ? ? B . A 1 2052 ASP 2052 ? ? ? B . A 1 2053 LYS 2053 ? ? ? B . A 1 2054 SER 2054 ? ? ? B . A 1 2055 ARG 2055 ? ? ? B . A 1 2056 GLY 2056 ? ? ? B . A 1 2057 ASP 2057 ? ? ? B . A 1 2058 GLY 2058 ? ? ? B . A 1 2059 LEU 2059 ? ? ? B . A 1 2060 THR 2060 ? ? ? B . A 1 2061 TRP 2061 ? ? ? B . A 1 2062 ARG 2062 ? ? ? B . A 1 2063 GLU 2063 ? ? ? B . A 1 2064 LEU 2064 ? ? ? B . A 1 2065 PHE 2065 ? ? ? B . A 1 2066 PRO 2066 ? ? ? B . A 1 2067 SER 2067 ? ? ? B . A 1 2068 VAL 2068 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rab6-interacting protein 1 {PDB ID=3cwz, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3cwz.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3cwz, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 244 358 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3cwz 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2069 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.2e-17 28.947 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGENGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYFNCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLENEKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDGKIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIDLAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKKRLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIRAWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVCTGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSGSGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGASTDSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSVQIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYGEEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNETTYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGDKKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGWFVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANIFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVDIRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQIFTGNVPG-AGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTKWCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSCGSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFDLLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILDIAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWTSYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVWHDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETGNGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKRELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYEPGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVEKVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQILQIPR-----------NVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3cwz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 1251 1251 ? A -8.702 32.535 157.857 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 2 C CA . PRO 1251 1251 ? A -10.180 32.612 157.706 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 3 C C . PRO 1251 1251 ? A -10.904 31.833 158.776 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 4 O O . PRO 1251 1251 ? A -12.124 31.896 158.761 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 5 C CB . PRO 1251 1251 ? A -10.411 32.018 156.309 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 6 C CG . PRO 1251 1251 ? A -9.289 30.993 156.094 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 7 C CD . PRO 1251 1251 ? A -8.121 31.481 156.953 1 1 B PRO 0.280 1 ATOM 8 N N . LEU 1252 1252 ? A -10.251 31.077 159.692 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 9 C CA . LEU 1252 1252 ? A -11.017 30.328 160.684 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 10 C C . LEU 1252 1252 ? A -10.716 30.726 162.110 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 11 O O . LEU 1252 1252 ? A -11.295 30.179 163.044 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 12 C CB . LEU 1252 1252 ? A -10.809 28.799 160.536 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 13 C CG . LEU 1252 1252 ? A -11.375 28.188 159.236 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 14 C CD1 . LEU 1252 1252 ? A -11.046 26.691 159.154 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 15 C CD2 . LEU 1252 1252 ? A -12.893 28.381 159.111 1 1 B LEU 0.220 1 ATOM 16 N N . ASP 1253 1253 ? A -9.844 31.721 162.320 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 17 C CA . ASP 1253 1253 ? A -9.540 32.220 163.639 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 18 C C . ASP 1253 1253 ? A -10.635 33.117 164.194 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 19 O O . ASP 1253 1253 ? A -11.406 33.750 163.471 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 20 C CB . ASP 1253 1253 ? A -8.195 32.975 163.652 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 21 C CG . ASP 1253 1253 ? A -7.109 32.065 163.118 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 22 O OD1 . ASP 1253 1253 ? A -7.006 30.919 163.614 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 23 O OD2 . ASP 1253 1253 ? A -6.406 32.484 162.162 1 1 B ASP 0.340 1 ATOM 24 N N . ILE 1254 1254 ? A -10.728 33.183 165.530 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 25 C CA . ILE 1254 1254 ? A -11.599 34.104 166.226 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 26 C C . ILE 1254 1254 ? A -11.039 35.517 166.193 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 27 O O . ILE 1254 1254 ? A -9.867 35.767 166.468 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 28 C CB . ILE 1254 1254 ? A -11.877 33.653 167.645 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 29 C CG1 . ILE 1254 1254 ? A -10.572 33.320 168.401 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 30 C CG2 . ILE 1254 1254 ? A -12.796 32.419 167.551 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 31 C CD1 . ILE 1254 1254 ? A -10.790 33.107 169.897 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 32 N N . VAL 1255 1255 ? A -11.875 36.489 165.801 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 33 C CA . VAL 1255 1255 ? A -11.472 37.876 165.674 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 34 C C . VAL 1255 1255 ? A -12.494 38.714 166.399 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 35 O O . VAL 1255 1255 ? A -13.699 38.478 166.333 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 36 C CB . VAL 1255 1255 ? A -11.294 38.355 164.236 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 37 C CG1 . VAL 1255 1255 ? A -10.814 39.819 164.193 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 38 C CG2 . VAL 1255 1255 ? A -10.239 37.472 163.547 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 39 N N . LEU 1256 1256 ? A -12.023 39.707 167.168 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 40 C CA . LEU 1256 1256 ? A -12.870 40.529 167.986 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 41 C C . LEU 1256 1256 ? A -13.174 41.802 167.213 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 42 O O . LEU 1256 1256 ? A -12.296 42.439 166.631 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 43 C CB . LEU 1256 1256 ? A -12.207 40.806 169.360 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 44 C CG . LEU 1256 1256 ? A -12.066 39.579 170.300 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 45 C CD1 . LEU 1256 1256 ? A -11.027 38.543 169.840 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 46 C CD2 . LEU 1256 1256 ? A -11.706 40.024 171.724 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 47 N N . TYR 1257 1257 ? A -14.464 42.159 167.134 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 48 C CA . TYR 1257 1257 ? A -14.926 43.295 166.381 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 49 C C . TYR 1257 1257 ? A -15.537 44.276 167.352 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 50 O O . TYR 1257 1257 ? A -16.589 44.039 167.949 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 51 C CB . TYR 1257 1257 ? A -15.964 42.895 165.298 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 52 C CG . TYR 1257 1257 ? A -15.308 42.089 164.205 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 53 C CD1 . TYR 1257 1257 ? A -15.232 40.690 164.306 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 54 C CD2 . TYR 1257 1257 ? A -14.755 42.714 163.072 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 55 C CE1 . TYR 1257 1257 ? A -14.604 39.932 163.309 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 56 C CE2 . TYR 1257 1257 ? A -14.123 41.957 162.071 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 57 C CZ . TYR 1257 1257 ? A -14.044 40.568 162.197 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 58 O OH . TYR 1257 1257 ? A -13.394 39.801 161.212 1 1 B TYR 0.640 1 ATOM 59 N N . SER 1258 1258 ? A -14.866 45.422 167.530 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 60 C CA . SER 1258 1258 ? A -15.332 46.512 168.362 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 61 C C . SER 1258 1258 ? A -16.413 47.286 167.649 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 62 O O . SER 1258 1258 ? A -16.196 47.812 166.559 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 63 C CB . SER 1258 1258 ? A -14.163 47.445 168.756 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 64 O OG . SER 1258 1258 ? A -14.575 48.520 169.603 1 1 B SER 0.650 1 ATOM 65 N N . VAL 1259 1259 ? A -17.629 47.343 168.226 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 66 C CA . VAL 1259 1259 ? A -18.751 48.029 167.620 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 67 C C . VAL 1259 1259 ? A -18.956 49.332 168.334 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 68 O O . VAL 1259 1259 ? A -18.957 49.374 169.558 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 69 C CB . VAL 1259 1259 ? A -20.072 47.237 167.559 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 70 C CG1 . VAL 1259 1259 ? A -19.756 45.754 167.317 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 71 C CG2 . VAL 1259 1259 ? A -20.981 47.378 168.800 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 72 N N . GLN 1260 1260 ? A -19.139 50.431 167.589 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 73 C CA . GLN 1260 1260 ? A -19.518 51.707 168.158 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 74 C C . GLN 1260 1260 ? A -20.638 52.305 167.322 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 75 O O . GLN 1260 1260 ? A -20.526 52.470 166.111 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 76 C CB . GLN 1260 1260 ? A -18.309 52.671 168.231 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 77 C CG . GLN 1260 1260 ? A -18.579 54.023 168.933 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 78 C CD . GLN 1260 1260 ? A -17.286 54.835 169.037 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 79 O OE1 . GLN 1260 1260 ? A -16.239 54.353 169.471 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 80 N NE2 . GLN 1260 1260 ? A -17.345 56.124 168.634 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 81 N N . ILE 1261 1261 ? A -21.783 52.623 167.944 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 82 C CA . ILE 1261 1261 ? A -22.946 53.211 167.304 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 83 C C . ILE 1261 1261 ? A -22.967 54.674 167.640 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 84 O O . ILE 1261 1261 ? A -23.148 55.074 168.784 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 85 C CB . ILE 1261 1261 ? A -24.254 52.583 167.780 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 86 C CG1 . ILE 1261 1261 ? A -24.264 51.095 167.377 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 87 C CG2 . ILE 1261 1261 ? A -25.486 53.329 167.211 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 88 C CD1 . ILE 1261 1261 ? A -25.435 50.305 167.956 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 89 N N . PHE 1262 1262 ? A -22.800 55.540 166.633 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 90 C CA . PHE 1262 1262 ? A -22.773 56.962 166.867 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 91 C C . PHE 1262 1262 ? A -24.155 57.533 166.602 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 92 O O . PHE 1262 1262 ? A -24.620 57.651 165.468 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 93 C CB . PHE 1262 1262 ? A -21.673 57.609 165.992 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 94 C CG . PHE 1262 1262 ? A -21.447 59.059 166.309 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 95 C CD1 . PHE 1262 1262 ? A -21.171 59.484 167.620 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 96 C CD2 . PHE 1262 1262 ? A -21.488 60.011 165.281 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 97 C CE1 . PHE 1262 1262 ? A -20.952 60.840 167.896 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 98 C CE2 . PHE 1262 1262 ? A -21.278 61.365 165.554 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 99 C CZ . PHE 1262 1262 ? A -21.007 61.781 166.861 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 100 N N . THR 1263 1263 ? A -24.875 57.880 167.679 1 1 B THR 0.570 1 ATOM 101 C CA . THR 1263 1263 ? A -26.205 58.453 167.607 1 1 B THR 0.570 1 ATOM 102 C C . THR 1263 1263 ? A -26.094 59.940 167.384 1 1 B THR 0.570 1 ATOM 103 O O . THR 1263 1263 ? A -25.169 60.590 167.866 1 1 B THR 0.570 1 ATOM 104 C CB . THR 1263 1263 ? A -27.031 58.183 168.860 1 1 B THR 0.570 1 ATOM 105 O OG1 . THR 1263 1263 ? 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A -25.158 64.033 173.004 1 1 B ASN 0.400 1 ATOM 119 N N . VAL 1266 1266 ? A -28.731 65.453 169.451 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 120 C CA . VAL 1266 1266 ? A -29.517 66.653 169.288 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 121 C C . VAL 1266 1266 ? A -30.823 66.309 170.019 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 122 O O . VAL 1266 1266 ? A -31.144 65.117 170.056 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 123 C CB . VAL 1266 1266 ? A -29.698 66.986 167.803 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 124 C CG1 . VAL 1266 1266 ? A -30.576 65.941 167.093 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 125 C CG2 . VAL 1266 1266 ? A -30.227 68.411 167.569 1 1 B VAL 0.250 1 ATOM 126 N N . PRO 1267 1267 ? A -31.613 67.178 170.653 1 1 B PRO 0.210 1 ATOM 127 C CA . PRO 1267 1267 ? A -32.522 66.708 171.700 1 1 B PRO 0.210 1 ATOM 128 C C . PRO 1267 1267 ? A -33.983 66.575 171.280 1 1 B PRO 0.210 1 ATOM 129 O O . PRO 1267 1267 ? A -34.589 67.525 170.794 1 1 B PRO 0.210 1 ATOM 130 C CB . PRO 1267 1267 ? A -32.393 67.781 172.797 1 1 B PRO 0.210 1 ATOM 131 C CG . PRO 1267 1267 ? 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A -27.877 55.115 182.210 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 405 C C . LYS 1303 1303 ? A -26.862 55.291 181.099 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 406 O O . LYS 1303 1303 ? A -25.660 55.357 181.323 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 407 C CB . LYS 1303 1303 ? A -28.231 56.530 182.707 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 408 C CG . LYS 1303 1303 ? A -29.329 56.567 183.771 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 409 C CD . LYS 1303 1303 ? A -29.588 58.010 184.218 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 410 C CE . LYS 1303 1303 ? A -30.654 58.089 185.304 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 411 N NZ . LYS 1303 1303 ? A -30.846 59.497 185.707 1 1 B LYS 0.270 1 ATOM 412 N N . GLY 1304 1304 ? A -27.355 55.415 179.853 1 1 B GLY 0.340 1 ATOM 413 C CA . GLY 1304 1304 ? A -26.525 55.422 178.662 1 1 B GLY 0.340 1 ATOM 414 C C . GLY 1304 1304 ? A -26.712 54.151 177.932 1 1 B GLY 0.340 1 ATOM 415 O O . GLY 1304 1304 ? A -26.211 53.115 178.330 1 1 B GLY 0.340 1 ATOM 416 N N . THR 1305 1305 ? A -27.421 54.164 176.809 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 417 C CA . THR 1305 1305 ? A -27.741 52.955 176.093 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 418 C C . THR 1305 1305 ? A -26.499 52.222 175.595 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 419 O O . THR 1305 1305 ? A -25.425 52.798 175.476 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 420 C CB . THR 1305 1305 ? A -28.631 53.262 174.900 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 421 O OG1 . THR 1305 1305 ? A -28.004 54.270 174.113 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 422 C CG2 . THR 1305 1305 ? A -29.943 53.903 175.369 1 1 B THR 0.390 1 ATOM 423 N N . ALA 1306 1306 ? A -26.584 50.901 175.312 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 424 C CA . ALA 1306 1306 ? A -25.450 50.170 174.762 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 425 C C . ALA 1306 1306 ? A -25.118 50.576 173.340 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 426 O O . ALA 1306 1306 ? A -25.670 50.073 172.361 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 427 C CB . ALA 1306 1306 ? A -25.692 48.657 174.794 1 1 B ALA 0.460 1 ATOM 428 N N . ASP 1307 1307 ? A -24.189 51.526 173.198 1 1 B ASP 0.540 1 ATOM 429 C CA . ASP 1307 1307 ? A -23.766 52.028 171.925 1 1 B ASP 0.540 1 ATOM 430 C C . ASP 1307 1307 ? 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A -13.312 52.558 154.666 1 1 B LYS 0.380 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.530 2 1 3 0.023 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1251 PRO 1 0.280 2 1 A 1252 LEU 1 0.220 3 1 A 1253 ASP 1 0.340 4 1 A 1254 ILE 1 0.400 5 1 A 1255 VAL 1 0.550 6 1 A 1256 LEU 1 0.600 7 1 A 1257 TYR 1 0.640 8 1 A 1258 SER 1 0.650 9 1 A 1259 VAL 1 0.680 10 1 A 1260 GLN 1 0.660 11 1 A 1261 ILE 1 0.660 12 1 A 1262 PHE 1 0.600 13 1 A 1263 THR 1 0.570 14 1 A 1264 GLY 1 0.540 15 1 A 1265 ASN 1 0.400 16 1 A 1266 VAL 1 0.250 17 1 A 1267 PRO 1 0.210 18 1 A 1268 GLY 1 0.240 19 1 A 1269 ALA 1 0.300 20 1 A 1270 GLY 1 0.310 21 1 A 1271 THR 1 0.480 22 1 A 1272 ASP 1 0.420 23 1 A 1273 ALA 1 0.570 24 1 A 1274 LYS 1 0.570 25 1 A 1275 VAL 1 0.640 26 1 A 1276 TYR 1 0.640 27 1 A 1277 ILE 1 0.670 28 1 A 1278 THR 1 0.680 29 1 A 1279 ILE 1 0.650 30 1 A 1280 TYR 1 0.620 31 1 A 1281 GLY 1 0.620 32 1 A 1282 ASP 1 0.600 33 1 A 1283 LEU 1 0.560 34 1 A 1284 GLY 1 0.640 35 1 A 1285 ASP 1 0.610 36 1 A 1286 THR 1 0.620 37 1 A 1287 GLY 1 0.620 38 1 A 1288 GLU 1 0.600 39 1 A 1289 ARG 1 0.580 40 1 A 1290 TYR 1 0.550 41 1 A 1291 LEU 1 0.530 42 1 A 1292 GLY 1 0.470 43 1 A 1293 LYS 1 0.440 44 1 A 1294 SER 1 0.380 45 1 A 1295 GLU 1 0.460 46 1 A 1296 ASN 1 0.500 47 1 A 1297 ARG 1 0.320 48 1 A 1298 THR 1 0.350 49 1 A 1299 ASN 1 0.310 50 1 A 1300 LYS 1 0.260 51 1 A 1301 PHE 1 0.170 52 1 A 1302 GLU 1 0.250 53 1 A 1303 LYS 1 0.270 54 1 A 1304 GLY 1 0.340 55 1 A 1305 THR 1 0.390 56 1 A 1306 ALA 1 0.460 57 1 A 1307 ASP 1 0.540 58 1 A 1308 THR 1 0.620 59 1 A 1309 PHE 1 0.580 60 1 A 1310 ILE 1 0.610 61 1 A 1311 ILE 1 0.630 62 1 A 1312 GLU 1 0.580 63 1 A 1313 ALA 1 0.570 64 1 A 1314 ALA 1 0.510 65 1 A 1315 ASP 1 0.530 66 1 A 1316 LEU 1 0.590 67 1 A 1317 GLY 1 0.610 68 1 A 1318 VAL 1 0.590 69 1 A 1319 ILE 1 0.590 70 1 A 1320 TYR 1 0.560 71 1 A 1321 LYS 1 0.620 72 1 A 1322 ILE 1 0.670 73 1 A 1323 LYS 1 0.650 74 1 A 1324 LEU 1 0.670 75 1 A 1325 ARG 1 0.590 76 1 A 1326 HIS 1 0.610 77 1 A 1327 ASP 1 0.620 78 1 A 1328 ASN 1 0.540 79 1 A 1329 THR 1 0.510 80 1 A 1330 LYS 1 0.340 81 1 A 1331 TRP 1 0.330 82 1 A 1332 CYS 1 0.410 83 1 A 1333 ALA 1 0.500 84 1 A 1334 ASP 1 0.530 85 1 A 1335 TRP 1 0.580 86 1 A 1336 TYR 1 0.560 87 1 A 1337 VAL 1 0.630 88 1 A 1338 GLU 1 0.630 89 1 A 1339 LYS 1 0.630 90 1 A 1340 VAL 1 0.700 91 1 A 1341 GLU 1 0.670 92 1 A 1342 ILE 1 0.670 93 1 A 1343 TRP 1 0.640 94 1 A 1344 ASN 1 0.610 95 1 A 1345 ASP 1 0.550 96 1 A 1346 THR 1 0.540 97 1 A 1347 ASN 1 0.530 98 1 A 1348 GLU 1 0.520 99 1 A 1349 ASP 1 0.560 100 1 A 1350 GLU 1 0.590 101 1 A 1351 PHE 1 0.630 102 1 A 1352 LEU 1 0.660 103 1 A 1353 PHE 1 0.640 104 1 A 1354 LEU 1 0.620 105 1 A 1355 CYS 1 0.650 106 1 A 1356 GLY 1 0.640 107 1 A 1357 ARG 1 0.550 108 1 A 1358 TRP 1 0.540 109 1 A 1359 LEU 1 0.560 110 1 A 1360 SER 1 0.530 111 1 A 1361 LEU 1 0.440 112 1 A 1362 LYS 1 0.410 113 1 A 1363 LYS 1 0.450 114 1 A 1364 GLU 1 0.480 115 1 A 1365 ASP 1 0.540 116 1 A 1366 GLY 1 0.550 117 1 A 1367 ARG 1 0.570 118 1 A 1368 LEU 1 0.630 119 1 A 1369 GLU 1 0.670 120 1 A 1370 ARG 1 0.660 121 1 A 1371 LEU 1 0.670 122 1 A 1372 PHE 1 0.640 123 1 A 1373 TYR 1 0.510 124 1 A 1374 GLU 1 0.410 125 1 A 1375 LYS 1 0.380 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #