data_SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _entry.id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _struct.entry_id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - C8YR32/ LOXH1_MOUSE, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.018, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries C8YR32' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 273295.196 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LOXH1_MOUSE C8YR32 1 ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC GSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFD LLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILD IAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWT SYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVW HDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETG NGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKR ELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYE PGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVE KVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV ; 'Lipoxygenase homology domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2068 1 2068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LOXH1_MOUSE C8YR32 . 1 2068 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2009-11-03 65B9CEE21632016B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG 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AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC 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A 1 1874 SER 1874 ? ? ? B . A 1 1875 LEU 1875 ? ? ? B . A 1 1876 CYS 1876 ? ? ? B . A 1 1877 VAL 1877 ? ? ? B . A 1 1878 GLY 1878 ? ? ? B . A 1 1879 HIS 1879 ? ? ? B . A 1 1880 LEU 1880 ? ? ? B . A 1 1881 ALA 1881 ? ? ? B . A 1 1882 ARG 1882 ? ? ? B . A 1 1883 GLU 1883 ? ? ? B . A 1 1884 ASP 1884 ? ? ? B . A 1 1885 ARG 1885 ? ? ? B . A 1 1886 PHE 1886 ? ? ? B . A 1 1887 ILE 1887 ? ? ? B . A 1 1888 PRO 1888 ? ? ? B . A 1 1889 LYS 1889 ? ? ? B . A 1 1890 ARG 1890 ? ? ? B . A 1 1891 GLU 1891 ? ? ? B . A 1 1892 LEU 1892 ? ? ? B . A 1 1893 VAL 1893 ? ? ? B . A 1 1894 TRP 1894 ? ? ? B . A 1 1895 HIS 1895 ? ? ? B . A 1 1896 VAL 1896 ? ? ? B . A 1 1897 LYS 1897 ? ? ? B . A 1 1898 THR 1898 ? ? ? B . A 1 1899 ILE 1899 ? ? ? B . A 1 1900 THR 1900 ? ? ? B . A 1 1901 ILE 1901 ? ? ? B . A 1 1902 THR 1902 ? ? ? B . A 1 1903 GLU 1903 ? ? ? B . A 1 1904 MET 1904 ? ? ? B . A 1 1905 GLU 1905 ? ? ? B . A 1 1906 TYR 1906 ? ? ? B . A 1 1907 GLY 1907 ? ? ? B . A 1 1908 ASN 1908 ? ? ? B . A 1 1909 VAL 1909 ? ? ? B . A 1 1910 TYR 1910 ? ? ? B . A 1 1911 PHE 1911 ? ? ? B . A 1 1912 PHE 1912 ? ? ? B . A 1 1913 ASN 1913 ? ? ? B . A 1 1914 CYS 1914 ? ? ? B . A 1 1915 ASP 1915 ? ? ? B . A 1 1916 CYS 1916 ? ? ? B . A 1 1917 LEU 1917 ? ? ? B . A 1 1918 ILE 1918 ? ? ? B . A 1 1919 PRO 1919 ? ? ? B . A 1 1920 LEU 1920 ? ? ? B . A 1 1921 LYS 1921 ? ? ? B . A 1 1922 ARG 1922 ? ? ? B . A 1 1923 LYS 1923 ? ? ? B . A 1 1924 ARG 1924 ? ? ? B . A 1 1925 LYS 1925 ? ? ? B . A 1 1926 TYR 1926 ? ? ? B . A 1 1927 PHE 1927 ? ? ? B . A 1 1928 LYS 1928 ? ? ? B . A 1 1929 VAL 1929 ? ? ? B . A 1 1930 PHE 1930 ? ? ? B . A 1 1931 GLU 1931 ? ? ? B . A 1 1932 VAL 1932 ? ? ? B . A 1 1933 THR 1933 ? ? ? B . A 1 1934 LYS 1934 ? ? ? B . A 1 1935 THR 1935 ? ? ? B . A 1 1936 THR 1936 ? ? ? B . A 1 1937 GLU 1937 ? ? ? B . A 1 1938 SER 1938 ? ? ? B . A 1 1939 PHE 1939 ? ? ? B . A 1 1940 ALA 1940 ? ? ? B . A 1 1941 SER 1941 ? ? ? B . A 1 1942 LYS 1942 ? ? ? B . A 1 1943 ILE 1943 ? ? ? B . A 1 1944 GLN 1944 ? ? ? B . A 1 1945 SER 1945 ? ? ? B . A 1 1946 LEU 1946 ? ? ? B . A 1 1947 VAL 1947 1947 VAL VAL B . A 1 1948 PRO 1948 1948 PRO PRO B . A 1 1949 VAL 1949 1949 VAL VAL B . A 1 1950 LYS 1950 1950 LYS LYS B . A 1 1951 TYR 1951 1951 TYR TYR B . A 1 1952 GLU 1952 1952 GLU GLU B . A 1 1953 VAL 1953 1953 VAL VAL B . A 1 1954 ILE 1954 1954 ILE ILE B . A 1 1955 VAL 1955 1955 VAL VAL B . A 1 1956 THR 1956 1956 THR THR B . A 1 1957 THR 1957 1957 THR THR B . A 1 1958 GLY 1958 1958 GLY GLY B . A 1 1959 TYR 1959 1959 TYR TYR B . A 1 1960 GLU 1960 1960 GLU GLU B . A 1 1961 PRO 1961 1961 PRO PRO B . A 1 1962 GLY 1962 1962 GLY GLY B . A 1 1963 ALA 1963 1963 ALA ALA B . A 1 1964 GLY 1964 1964 GLY GLY B . A 1 1965 THR 1965 1965 THR THR B . A 1 1966 ASP 1966 1966 ASP ASP B . A 1 1967 ALA 1967 1967 ALA ALA B . A 1 1968 ASN 1968 1968 ASN ASN B . A 1 1969 VAL 1969 1969 VAL VAL B . A 1 1970 PHE 1970 1970 PHE PHE B . A 1 1971 VAL 1971 1971 VAL VAL B . A 1 1972 THR 1972 1972 THR THR B . A 1 1973 ILE 1973 1973 ILE ILE B . A 1 1974 PHE 1974 1974 PHE PHE B . A 1 1975 GLY 1975 1975 GLY GLY B . A 1 1976 ALA 1976 1976 ALA ALA B . A 1 1977 ASN 1977 1977 ASN ASN B . A 1 1978 GLY 1978 1978 GLY GLY B . A 1 1979 ASP 1979 1979 ASP ASP B . A 1 1980 THR 1980 1980 THR THR B . A 1 1981 GLY 1981 1981 GLY GLY B . A 1 1982 LYS 1982 1982 LYS LYS B . A 1 1983 ARG 1983 1983 ARG ARG B . A 1 1984 GLU 1984 1984 GLU GLU B . A 1 1985 LEU 1985 1985 LEU LEU B . A 1 1986 LYS 1986 1986 LYS LYS B . A 1 1987 GLN 1987 1987 GLN GLN B . A 1 1988 LYS 1988 1988 LYS LYS B . A 1 1989 MET 1989 1989 MET MET B . A 1 1990 ARG 1990 1990 ARG ARG B . A 1 1991 ASN 1991 1991 ASN ASN B . A 1 1992 LEU 1992 1992 LEU LEU B . A 1 1993 PHE 1993 1993 PHE PHE B . A 1 1994 GLU 1994 1994 GLU GLU B . A 1 1995 ARG 1995 1995 ARG ARG B . A 1 1996 GLY 1996 1996 GLY GLY B . A 1 1997 SER 1997 1997 SER SER B . A 1 1998 THR 1998 1998 THR THR B . A 1 1999 ASP 1999 1999 ASP ASP B . A 1 2000 ARG 2000 2000 ARG ARG B . A 1 2001 PHE 2001 2001 PHE PHE B . A 1 2002 PHE 2002 2002 PHE PHE B . A 1 2003 LEU 2003 2003 LEU LEU B . A 1 2004 GLU 2004 2004 GLU GLU B . A 1 2005 THR 2005 2005 THR THR B . A 1 2006 LEU 2006 2006 LEU LEU B . A 1 2007 GLU 2007 2007 GLU GLU B . A 1 2008 LEU 2008 2008 LEU LEU B . A 1 2009 GLY 2009 2009 GLY GLY B . A 1 2010 GLU 2010 2010 GLU GLU B . A 1 2011 LEU 2011 2011 LEU LEU B . A 1 2012 ARG 2012 2012 ARG ARG B . A 1 2013 LYS 2013 2013 LYS LYS B . A 1 2014 VAL 2014 2014 VAL VAL B . A 1 2015 ARG 2015 2015 ARG ARG B . A 1 2016 LEU 2016 2016 LEU LEU B . A 1 2017 GLU 2017 2017 GLU GLU B . A 1 2018 HIS 2018 2018 HIS HIS B . A 1 2019 ASP 2019 2019 ASP ASP B . A 1 2020 SER 2020 2020 SER SER B . A 1 2021 SER 2021 2021 SER SER B . A 1 2022 GLY 2022 2022 GLY GLY B . A 1 2023 TYR 2023 2023 TYR TYR B . A 1 2024 TYR 2024 2024 TYR TYR B . A 1 2025 SER 2025 2025 SER SER B . A 1 2026 GLY 2026 2026 GLY GLY B . A 1 2027 TRP 2027 2027 TRP TRP B . A 1 2028 LEU 2028 2028 LEU LEU B . A 1 2029 VAL 2029 2029 VAL VAL B . A 1 2030 GLU 2030 2030 GLU GLU B . A 1 2031 LYS 2031 2031 LYS LYS B . A 1 2032 VAL 2032 2032 VAL VAL B . A 1 2033 GLU 2033 2033 GLU GLU B . A 1 2034 VAL 2034 2034 VAL VAL B . A 1 2035 THR 2035 2035 THR THR B . A 1 2036 ASN 2036 2036 ASN ASN B . A 1 2037 THR 2037 2037 THR THR B . A 1 2038 SER 2038 2038 SER SER B . A 1 2039 THR 2039 2039 THR THR B . A 1 2040 GLY 2040 2040 GLY GLY B . A 1 2041 VAL 2041 2041 VAL VAL B . A 1 2042 ALA 2042 2042 ALA ALA B . A 1 2043 THR 2043 2043 THR THR B . A 1 2044 ILE 2044 2044 ILE ILE B . A 1 2045 PHE 2045 2045 PHE PHE B . A 1 2046 SER 2046 2046 SER SER B . A 1 2047 CYS 2047 2047 CYS CYS B . A 1 2048 GLY 2048 2048 GLY GLY B . A 1 2049 ARG 2049 2049 ARG ARG B . A 1 2050 TRP 2050 2050 TRP TRP B . A 1 2051 LEU 2051 2051 LEU LEU B . A 1 2052 ASP 2052 2052 ASP ASP B . A 1 2053 LYS 2053 2053 LYS LYS B . A 1 2054 SER 2054 2054 SER SER B . A 1 2055 ARG 2055 2055 ARG ARG B . A 1 2056 GLY 2056 2056 GLY GLY B . A 1 2057 ASP 2057 2057 ASP ASP B . A 1 2058 GLY 2058 2058 GLY GLY B . A 1 2059 LEU 2059 2059 LEU LEU B . A 1 2060 THR 2060 2060 THR THR B . A 1 2061 TRP 2061 2061 TRP TRP B . A 1 2062 ARG 2062 2062 ARG ARG B . A 1 2063 GLU 2063 2063 GLU GLU B . A 1 2064 LEU 2064 2064 LEU LEU B . A 1 2065 PHE 2065 2065 PHE PHE B . A 1 2066 PRO 2066 2066 PRO PRO B . A 1 2067 SER 2067 2067 SER SER B . A 1 2068 VAL 2068 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rab6-interacting protein 1 {PDB ID=3cwz, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3cwz.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3cwz, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 246 358 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3cwz 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2069 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.1e-17 33.929 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGENGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYFNCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLENEKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDGKIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIDLAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKKRLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIRAWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVCTGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSGSGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGASTDSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSVQIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYGEEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNETTYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGDKKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGWFVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANIFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVDIRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQIFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTKWCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSCGSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFDLLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILDIAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWTSYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVWHDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETGNGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKRELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYEPG-AGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVEKVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGETQILQIPR---------NVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERVLVGE- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3cwz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 1947 1947 ? A -9.769 31.981 162.121 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 2 C CA . VAL 1947 1947 ? A -9.500 32.212 163.583 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 3 C C . VAL 1947 1947 ? A -10.661 32.952 164.228 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 4 O O . VAL 1947 1947 ? A -11.500 33.428 163.458 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 5 C CB . VAL 1947 1947 ? A -8.180 32.971 163.705 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 1947 1947 ? A -7.013 32.063 163.264 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 1947 1947 ? A -8.202 34.285 162.900 1 1 B VAL 0.360 1 ATOM 8 N N . PRO 1948 1948 ? A -10.831 33.068 165.550 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 9 C CA . PRO 1948 1948 ? A -11.729 34.060 166.118 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 10 C C . PRO 1948 1948 ? A -11.088 35.439 166.054 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 11 O O . PRO 1948 1948 ? A -9.870 35.569 166.183 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 12 C CB . PRO 1948 1948 ? A -11.949 33.570 167.553 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 13 C CG . PRO 1948 1948 ? A -10.645 32.866 167.936 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 14 C CD . PRO 1948 1948 ? A -10.042 32.404 166.600 1 1 B PRO 0.420 1 ATOM 15 N N . VAL 1949 1949 ? A -11.892 36.473 165.781 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 16 C CA . VAL 1949 1949 ? A -11.458 37.849 165.700 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 17 C C . VAL 1949 1949 ? A -12.505 38.663 166.429 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 18 O O . VAL 1949 1949 ? A -13.711 38.468 166.265 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 19 C CB . VAL 1949 1949 ? A -11.293 38.358 164.267 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 20 C CG1 . VAL 1949 1949 ? A -10.841 39.829 164.259 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 21 C CG2 . VAL 1949 1949 ? A -10.254 37.502 163.520 1 1 B VAL 0.600 1 ATOM 22 N N . LYS 1950 1950 ? A -12.068 39.590 167.297 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 23 C CA . LYS 1950 1950 ? A -12.954 40.423 168.074 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 24 C C . LYS 1950 1950 ? A -13.150 41.765 167.395 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 25 O O . LYS 1950 1950 ? A -12.203 42.496 167.091 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 26 C CB . LYS 1950 1950 ? A -12.419 40.563 169.512 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 27 C CG . LYS 1950 1950 ? A -13.271 41.451 170.428 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 28 C CD . LYS 1950 1950 ? A -12.680 41.529 171.843 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 29 C CE . LYS 1950 1950 ? A -11.368 42.317 171.895 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 30 N NZ . LYS 1950 1950 ? A -10.851 42.353 173.278 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 31 N N . TYR 1951 1951 ? A -14.417 42.098 167.108 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 32 C CA . TYR 1951 1951 ? A -14.851 43.262 166.373 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 33 C C . TYR 1951 1951 ? A -15.484 44.239 167.343 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 34 O O . TYR 1951 1951 ? A -16.495 43.956 167.987 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 35 C CB . TYR 1951 1951 ? A -15.910 42.884 165.303 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 36 C CG . TYR 1951 1951 ? A -15.271 42.080 164.209 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 37 C CD1 . TYR 1951 1951 ? A -15.221 40.677 164.277 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 38 C CD2 . TYR 1951 1951 ? A -14.686 42.730 163.110 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 39 C CE1 . TYR 1951 1951 ? A -14.588 39.937 163.268 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 40 C CE2 . TYR 1951 1951 ? A -14.050 41.992 162.101 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 41 C CZ . TYR 1951 1951 ? A -14.000 40.596 162.183 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 42 O OH . TYR 1951 1951 ? A -13.346 39.862 161.174 1 1 B TYR 0.620 1 ATOM 43 N N . GLU 1952 1952 ? A -14.889 45.429 167.478 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 44 C CA . GLU 1952 1952 ? A -15.385 46.503 168.304 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 45 C C . GLU 1952 1952 ? A -16.464 47.264 167.573 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 46 O O . GLU 1952 1952 ? A -16.213 47.789 166.493 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 47 C CB . GLU 1952 1952 ? A -14.229 47.463 168.638 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 48 C CG . GLU 1952 1952 ? A -14.652 48.640 169.537 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 49 C CD . GLU 1952 1952 ? A -13.498 49.526 169.973 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 50 O OE1 . GLU 1952 1952 ? A -12.331 49.293 169.578 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 51 O OE2 . GLU 1952 1952 ? A -13.802 50.457 170.767 1 1 B GLU 0.650 1 ATOM 52 N N . VAL 1953 1953 ? A -17.688 47.338 168.114 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 53 C CA . VAL 1953 1953 ? A -18.803 48.024 167.492 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 54 C C . VAL 1953 1953 ? A -19.069 49.280 168.277 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 55 O O . VAL 1953 1953 ? A -19.198 49.237 169.503 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 56 C CB . VAL 1953 1953 ? A -20.077 47.183 167.495 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 57 C CG1 . VAL 1953 1953 ? A -21.263 47.955 166.880 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 58 C CG2 . VAL 1953 1953 ? A -19.822 45.888 166.709 1 1 B VAL 0.710 1 ATOM 59 N N . ILE 1954 1954 ? A -19.154 50.430 167.590 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 60 C CA . ILE 1954 1954 ? A -19.494 51.712 168.176 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 61 C C . ILE 1954 1954 ? A -20.651 52.278 167.365 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 62 O O . ILE 1954 1954 ? A -20.552 52.468 166.151 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 63 C CB . ILE 1954 1954 ? A -18.304 52.676 168.170 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 64 C CG1 . ILE 1954 1954 ? A -17.085 52.061 168.903 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 65 C CG2 . ILE 1954 1954 ? A -18.713 54.025 168.799 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 66 C CD1 . ILE 1954 1954 ? A -15.781 52.849 168.741 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 67 N N . VAL 1955 1955 ? A -21.806 52.543 168.000 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 68 C CA . VAL 1955 1955 ? A -22.968 53.142 167.363 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 69 C C . VAL 1955 1955 ? A -22.996 54.621 167.683 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 70 O O . VAL 1955 1955 ? A -23.220 55.032 168.820 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 71 C CB . VAL 1955 1955 ? A -24.279 52.512 167.830 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 72 C CG1 . VAL 1955 1955 ? A -25.486 53.226 167.189 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 73 C CG2 . VAL 1955 1955 ? A -24.293 51.021 167.449 1 1 B VAL 0.660 1 ATOM 74 N N . THR 1956 1956 ? A -22.794 55.483 166.674 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 75 C CA . THR 1956 1956 ? A -22.758 56.924 166.879 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 76 C C . THR 1956 1956 ? A -24.120 57.496 166.595 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 77 O O . THR 1956 1956 ? A -24.555 57.633 165.448 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 78 C CB . THR 1956 1956 ? A -21.736 57.626 166.004 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 79 O OG1 . THR 1956 1956 ? A -20.448 57.094 166.275 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 80 C CG2 . THR 1956 1956 ? A -21.666 59.130 166.299 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 81 N N . THR 1957 1957 ? A -24.855 57.834 167.661 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 82 C CA . THR 1957 1957 ? A -26.172 58.442 167.591 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 83 C C . THR 1957 1957 ? A -26.073 59.928 167.316 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 84 O O . THR 1957 1957 ? A -25.113 60.584 167.710 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 85 C CB . THR 1957 1957 ? A -27.002 58.189 168.846 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 86 O OG1 . THR 1957 1957 ? A -26.340 58.635 170.020 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 87 C CG2 . THR 1957 1957 ? A -27.185 56.677 169.017 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 88 N N . GLY 1958 1958 ? A -27.069 60.510 166.609 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 89 C CA . GLY 1958 1958 ? A -27.096 61.957 166.392 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 90 C C . GLY 1958 1958 ? A -27.532 62.679 167.638 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 91 O O . GLY 1958 1958 ? A -28.712 62.690 167.983 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 92 N N . TYR 1959 1959 ? 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A -38.742 53.705 174.195 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 145 C CG . ASP 1966 1966 ? A -39.154 54.912 175.011 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 146 O OD1 . ASP 1966 1966 ? A -38.437 55.288 175.968 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 147 O OD2 . ASP 1966 1966 ? A -40.280 55.402 174.721 1 1 B ASP 0.480 1 ATOM 148 N N . ALA 1967 1967 ? A -36.931 52.109 172.053 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 149 C CA . ALA 1967 1967 ? A -36.943 50.847 171.343 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 150 C C . ALA 1967 1967 ? A -35.662 50.048 171.431 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 151 O O . ALA 1967 1967 ? A -34.571 50.549 171.718 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 152 C CB . ALA 1967 1967 ? A -37.308 51.015 169.860 1 1 B ALA 0.550 1 ATOM 153 N N . ASN 1968 1968 ? A -35.770 48.740 171.178 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 154 C CA . ASN 1968 1968 ? A -34.699 47.818 171.409 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 155 C C . ASN 1968 1968 ? A -33.925 47.488 170.153 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 156 O O . ASN 1968 1968 ? A -34.482 46.986 169.178 1 1 B ASN 0.500 1 ATOM 157 C CB . ASN 1968 1968 ? 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A -29.213 45.335 165.792 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 171 O O . PHE 1970 1970 ? A -29.412 46.337 165.105 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 172 C CB . PHE 1970 1970 ? A -31.220 43.969 166.219 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 173 C CG . PHE 1970 1970 ? A -32.431 43.676 167.069 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 174 C CD1 . PHE 1970 1970 ? A -32.266 42.945 168.245 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 175 C CD2 . PHE 1970 1970 ? A -33.740 44.037 166.694 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 176 C CE1 . PHE 1970 1970 ? A -33.353 42.597 169.051 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 177 C CE2 . PHE 1970 1970 ? A -34.838 43.671 167.476 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 178 C CZ . PHE 1970 1970 ? A -34.646 42.956 168.660 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 179 N N . VAL 1971 1971 ? A -28.131 44.546 165.594 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 180 C CA . VAL 1971 1971 ? A -27.115 44.811 164.572 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 181 C C . VAL 1971 1971 ? A -26.588 43.522 163.966 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 182 O O . VAL 1971 1971 ? A -26.524 42.477 164.611 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 183 C CB . VAL 1971 1971 ? A -25.894 45.614 165.045 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 184 C CG1 . VAL 1971 1971 ? A -26.304 47.062 165.365 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 185 C CG2 . VAL 1971 1971 ? A -25.209 44.935 166.246 1 1 B VAL 0.680 1 ATOM 186 N N . THR 1972 1972 ? A -26.183 43.580 162.686 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 187 C CA . THR 1972 1972 ? A -25.635 42.453 161.938 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 188 C C . THR 1972 1972 ? A -24.466 42.973 161.130 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 189 O O . THR 1972 1972 ? A -24.604 43.979 160.436 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 190 C CB . THR 1972 1972 ? A -26.636 41.836 160.962 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 191 O OG1 . THR 1972 1972 ? A -27.804 41.399 161.640 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 192 C CG2 . THR 1972 1972 ? A -26.056 40.592 160.286 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 193 N N . ILE 1973 1973 ? A -23.284 42.320 161.191 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 194 C CA . ILE 1973 1973 ? A -22.058 42.763 160.534 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 195 C C . ILE 1973 1973 ? A -21.676 41.705 159.506 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 196 O O . ILE 1973 1973 ? A -21.523 40.536 159.842 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 197 C CB . ILE 1973 1973 ? A -20.869 42.913 161.499 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 198 C CG1 . ILE 1973 1973 ? A -21.216 43.692 162.790 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 199 C CG2 . ILE 1973 1973 ? A -19.691 43.587 160.760 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 200 C CD1 . ILE 1973 1973 ? A -20.143 43.536 163.875 1 1 B ILE 0.680 1 ATOM 201 N N . PHE 1974 1974 ? A -21.508 42.084 158.224 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 202 C CA . PHE 1974 1974 ? A -21.176 41.177 157.137 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 203 C C . PHE 1974 1974 ? A -19.846 41.607 156.528 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 204 O O . PHE 1974 1974 ? A -19.584 42.795 156.316 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 205 C CB . PHE 1974 1974 ? A -22.366 41.140 156.110 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 206 C CG . PHE 1974 1974 ? A -22.089 40.414 154.806 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 207 C CD1 . PHE 1974 1974 ? A -21.399 41.096 153.793 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 208 C CD2 . PHE 1974 1974 ? A -22.479 39.085 154.559 1 1 B PHE 0.650 1 ATOM 209 C CE1 . PHE 1974 1974 ? 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A -15.540 35.711 154.392 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 223 C C . ASN 1977 1977 ? A -16.752 35.205 155.172 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 224 O O . ASN 1977 1977 ? A -16.791 34.041 155.571 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 225 C CB . ASN 1977 1977 ? A -14.280 35.447 155.267 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 226 C CG . ASN 1977 1977 ? A -12.985 35.771 154.530 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 227 O OD1 . ASN 1977 1977 ? A -12.916 35.876 153.308 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 228 N ND2 . ASN 1977 1977 ? A -11.884 35.924 155.304 1 1 B ASN 0.650 1 ATOM 229 N N . GLY 1978 1978 ? A -17.782 36.045 155.404 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 230 C CA . GLY 1978 1978 ? A -18.941 35.657 156.203 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 231 C C . GLY 1978 1978 ? A -19.435 36.758 157.086 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 232 O O . GLY 1978 1978 ? A -18.983 37.903 157.008 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 233 N N . ASP 1979 1979 ? A -20.407 36.440 157.944 1 1 B ASP 0.620 1 ATOM 234 C CA . ASP 1979 1979 ? A -21.145 37.400 158.721 1 1 B ASP 0.620 1 ATOM 235 C C . ASP 1979 1979 ? 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A -13.316 52.494 154.600 1 1 B SER 0.450 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.543 2 1 3 0.018 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1947 VAL 1 0.360 2 1 A 1948 PRO 1 0.420 3 1 A 1949 VAL 1 0.600 4 1 A 1950 LYS 1 0.610 5 1 A 1951 TYR 1 0.620 6 1 A 1952 GLU 1 0.650 7 1 A 1953 VAL 1 0.710 8 1 A 1954 ILE 1 0.670 9 1 A 1955 VAL 1 0.660 10 1 A 1956 THR 1 0.600 11 1 A 1957 THR 1 0.560 12 1 A 1958 GLY 1 0.490 13 1 A 1959 TYR 1 0.330 14 1 A 1960 GLU 1 0.280 15 1 A 1961 PRO 1 0.220 16 1 A 1962 GLY 1 0.290 17 1 A 1963 ALA 1 0.350 18 1 A 1964 GLY 1 0.370 19 1 A 1965 THR 1 0.480 20 1 A 1966 ASP 1 0.480 21 1 A 1967 ALA 1 0.550 22 1 A 1968 ASN 1 0.500 23 1 A 1969 VAL 1 0.550 24 1 A 1970 PHE 1 0.590 25 1 A 1971 VAL 1 0.680 26 1 A 1972 THR 1 0.690 27 1 A 1973 ILE 1 0.680 28 1 A 1974 PHE 1 0.650 29 1 A 1975 GLY 1 0.680 30 1 A 1976 ALA 1 0.680 31 1 A 1977 ASN 1 0.650 32 1 A 1978 GLY 1 0.660 33 1 A 1979 ASP 1 0.620 34 1 A 1980 THR 1 0.630 35 1 A 1981 GLY 1 0.610 36 1 A 1982 LYS 1 0.570 37 1 A 1983 ARG 1 0.560 38 1 A 1984 GLU 1 0.530 39 1 A 1985 LEU 1 0.550 40 1 A 1986 LYS 1 0.400 41 1 A 1987 GLN 1 0.360 42 1 A 1988 LYS 1 0.370 43 1 A 1989 MET 1 0.290 44 1 A 1990 ARG 1 0.280 45 1 A 1991 ASN 1 0.320 46 1 A 1992 LEU 1 0.240 47 1 A 1993 PHE 1 0.250 48 1 A 1994 GLU 1 0.310 49 1 A 1995 ARG 1 0.320 50 1 A 1996 GLY 1 0.340 51 1 A 1997 SER 1 0.430 52 1 A 1998 THR 1 0.460 53 1 A 1999 ASP 1 0.550 54 1 A 2000 ARG 1 0.570 55 1 A 2001 PHE 1 0.580 56 1 A 2002 PHE 1 0.630 57 1 A 2003 LEU 1 0.640 58 1 A 2004 GLU 1 0.600 59 1 A 2005 THR 1 0.570 60 1 A 2006 LEU 1 0.520 61 1 A 2007 GLU 1 0.590 62 1 A 2008 LEU 1 0.660 63 1 A 2009 GLY 1 0.680 64 1 A 2010 GLU 1 0.640 65 1 A 2011 LEU 1 0.650 66 1 A 2012 ARG 1 0.590 67 1 A 2013 LYS 1 0.630 68 1 A 2014 VAL 1 0.700 69 1 A 2015 ARG 1 0.630 70 1 A 2016 LEU 1 0.630 71 1 A 2017 GLU 1 0.560 72 1 A 2018 HIS 1 0.540 73 1 A 2019 ASP 1 0.560 74 1 A 2020 SER 1 0.560 75 1 A 2021 SER 1 0.560 76 1 A 2022 GLY 1 0.510 77 1 A 2023 TYR 1 0.440 78 1 A 2024 TYR 1 0.470 79 1 A 2025 SER 1 0.540 80 1 A 2026 GLY 1 0.530 81 1 A 2027 TRP 1 0.530 82 1 A 2028 LEU 1 0.560 83 1 A 2029 VAL 1 0.590 84 1 A 2030 GLU 1 0.570 85 1 A 2031 LYS 1 0.600 86 1 A 2032 VAL 1 0.680 87 1 A 2033 GLU 1 0.660 88 1 A 2034 VAL 1 0.700 89 1 A 2035 THR 1 0.680 90 1 A 2036 ASN 1 0.650 91 1 A 2037 THR 1 0.590 92 1 A 2038 SER 1 0.550 93 1 A 2039 THR 1 0.570 94 1 A 2040 GLY 1 0.600 95 1 A 2041 VAL 1 0.600 96 1 A 2042 ALA 1 0.640 97 1 A 2043 THR 1 0.640 98 1 A 2044 ILE 1 0.610 99 1 A 2045 PHE 1 0.600 100 1 A 2046 SER 1 0.610 101 1 A 2047 CYS 1 0.630 102 1 A 2048 GLY 1 0.600 103 1 A 2049 ARG 1 0.530 104 1 A 2050 TRP 1 0.510 105 1 A 2051 LEU 1 0.530 106 1 A 2052 ASP 1 0.500 107 1 A 2053 LYS 1 0.440 108 1 A 2054 SER 1 0.400 109 1 A 2055 ARG 1 0.390 110 1 A 2056 GLY 1 0.490 111 1 A 2057 ASP 1 0.520 112 1 A 2058 GLY 1 0.530 113 1 A 2059 LEU 1 0.530 114 1 A 2060 THR 1 0.620 115 1 A 2061 TRP 1 0.640 116 1 A 2062 ARG 1 0.650 117 1 A 2063 GLU 1 0.660 118 1 A 2064 LEU 1 0.660 119 1 A 2065 PHE 1 0.600 120 1 A 2066 PRO 1 0.560 121 1 A 2067 SER 1 0.450 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #