data_SMR-b0fb751461b3850f650061df636ee305_14 _entry.id SMR-b0fb751461b3850f650061df636ee305_14 _struct.entry_id SMR-b0fb751461b3850f650061df636ee305_14 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q14980/ NUMA1_HUMAN, Nuclear mitotic apparatus protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q14980' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 276692.570 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NUMA1_HUMAN Q14980 1 ;MTLHATRGAALLSWVNSLHVADPVEAVLQLQDCSIFIKIIDRIHGTEEGQQILKQPVSERLDFVCSFLQK NRKHPSSPECLVSAQKVLEGSELELAKMTMLLLYHSTMSSKSPRDWEQFEYKIQAELAVILKFVLDHEDG LNLNEDLENFLQKAPVPSTCSSTFPEELSPPSHQAKREIRFLELQKVASSSSGNNFLSGSPASPMGDILQ TPQFQMRRLKKQLADERSNRDELELELAENRKLLTEKDAQIAMMQQRIDRLALLNEKQAASPLEPKELEE LRDKNESLTMRLHETLKQCQDLKTEKSQMDRKINQLSEENGDLSFKLREFASHLQQLQDALNELTEEHSK ATQEWLEKQAQLEKELSAALQDKKCLEEKNEILQGKLSQLEEHLSQLQDNPPQEKGEVLGDVLQLETLKQ EAATLAANNTQLQARVEMLETERGQQEAKLLAERGHFEEEKQQLSSLITDLQSSISNLSQAKEELEQASQ AHGARLTAQVASLTSELTTLNATIQQQDQELAGLKQQAKEKQAQLAQTLQQQEQASQGLRHQVEQLSSSL KQKEQQLKEVAEKQEATRQDHAQQLATAAEEREASLRERDAALKQLEALEKEKAAKLEILQQQLQVANEA RDSAQTSVTQAQREKAELSRKVEELQACVETARQEQHEAQAQVAELELQLRSEQQKATEKERVAQEKDQL QEQLQALKESLKVTKGSLEEEKRRAADALEEQQRCISELKAETRSLVEQHKRERKELEEERAGRKGLEAR LQQLGEAHQAETEVLRRELAEAMAAQHTAESECEQLVKEVAAWRERYEDSQQEEAQYGAMFQEQLMTLKE ECEKARQELQEAKEKVAGIESHSELQISRQQNELAELHANLARALQQVQEKEVRAQKLADDLSTLQEKMA ATSKEVARLETLVRKAGEQQETASRELVKEPARAGDRQPEWLEEQQGRQFCSTQAALQAMEREAEQMGNE LERLRAALMESQGQQQEERGQQEREVARLTQERGRAQADLALEKAARAELEMRLQNALNEQRVEFATLQE ALAHALTEKEGKDQELAKLRGLEAAQIKELEELRQTVKQLKEQLAKKEKEHASGSGAQSEAAGRTEPTGP KLEALRAEVSKLEQQCQKQQEQADSLERSLEAERASRAERDSALETLQGQLEEKAQELGHSQSALASAQR ELAAFRTKVQDHSKAEDEWKAQVARGRQEAERKNSLISSLEEEVSILNRQVLEKEGESKELKRLVMAESE KSQKLEERLRLLQAETASNSARAAERSSALREEVQSLREEAEKQRVASENLRQELTSQAERAEELGQELK AWQEKFFQKEQALSTLQLEHTSTQALVSELLPAKHLCQQLQAEQAAAEKRHREELEQSKQAAGGLRAELL RAQRELGELIPLRQKVAEQERTAQQLRAEKASYAEQLSMLKKAHGLLAEENRGLGERANLGRQFLEVELD QAREKYVQELAAVRADAETRLAEVQREAQSTARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEQL EVFQREQTKQVEELSKKLADSDQASKVQQQKLKAVQAQGGESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHY KLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRSLEQLQKENKELRAEAERLGHELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQV RSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLSITSKLPRTQPDGTS VPGEPASPISQRLPPKVESLESLYFTPIPARSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMT KKLDVEEPDSANSSFYSTRSAPASQASLRATSSTQSLARLGSPDYGNSALLSLPGYRPTTRSSARRSQAG VSSGAPPGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQQRNRVCPPHLKTCYPLESRPSLSLGTITDEEMKTGD PQETLRRASMQPIQIAEGTGITTRQQRKRVSLEPHQGPGTPESKKATSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTEA QKKAAPASTKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGASKKALSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAATA AAIGATPRAKGKAKH ; 'Nuclear mitotic apparatus protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2115 1 2115 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NUMA1_HUMAN Q14980 . 1 2115 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-04-17 DE734EC85B812CC7 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no L ;MTLHATRGAALLSWVNSLHVADPVEAVLQLQDCSIFIKIIDRIHGTEEGQQILKQPVSERLDFVCSFLQK NRKHPSSPECLVSAQKVLEGSELELAKMTMLLLYHSTMSSKSPRDWEQFEYKIQAELAVILKFVLDHEDG LNLNEDLENFLQKAPVPSTCSSTFPEELSPPSHQAKREIRFLELQKVASSSSGNNFLSGSPASPMGDILQ TPQFQMRRLKKQLADERSNRDELELELAENRKLLTEKDAQIAMMQQRIDRLALLNEKQAASPLEPKELEE LRDKNESLTMRLHETLKQCQDLKTEKSQMDRKINQLSEENGDLSFKLREFASHLQQLQDALNELTEEHSK ATQEWLEKQAQLEKELSAALQDKKCLEEKNEILQGKLSQLEEHLSQLQDNPPQEKGEVLGDVLQLETLKQ EAATLAANNTQLQARVEMLETERGQQEAKLLAERGHFEEEKQQLSSLITDLQSSISNLSQAKEELEQASQ AHGARLTAQVASLTSELTTLNATIQQQDQELAGLKQQAKEKQAQLAQTLQQQEQASQGLRHQVEQLSSSL KQKEQQLKEVAEKQEATRQDHAQQLATAAEEREASLRERDAALKQLEALEKEKAAKLEILQQQLQVANEA 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L . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7nep, label_asym_id=L, auth_asym_id=P, SMTL ID=7nep.1.L}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7nep, label_asym_id=L' 'target-template alignment' . 4 'model 14' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A L 2 1 P # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 31 221 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7nep 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2115 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2125 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.0001 18.232 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTLHATRGAALLSWVNSLHVADPVEAVLQLQDCSIFIKIIDRIHGTEEGQQILKQPVSERLDFVCSFLQKNRKHPSSPECLVSAQKVLEGSELELAKMTMLLLYHSTMSSKSPRDWEQFEYKIQAELAVILKFVLDHEDGLNLNEDLENFLQKAPVPSTCSSTFPEELSPPSHQAKREIRFLELQKVASSSSGNNFLSGSPASPMGDILQTPQFQMRRLKKQLADERSNRDELELELAEN-------RKLLTEKDAQIAMMQQRIDRLALLNEKQAASPLEPKELEELRDKNESLTMRLHETLKQCQDLKTEKSQMDRKINQLSEENGDLSFKLREFASHLQQLQDALNELTEEHSKA---TQEWLEKQAQLEKELSAALQDKKCLEEKNEILQGKLSQLEEHLSQLQDNPPQEKGEVLGDVLQLETLKQEAATLAANNTQLQARVEMLETERGQQEAKLLAERGHFEEEKQQLSSLITDLQSSISNLSQAKEELEQASQAHGARLTAQVASLTSELTTLNATIQQQDQELAGLKQQAKEKQAQLAQTLQQQEQASQGLRHQVEQLSSSLKQKEQQLKEVAEKQEATRQDHAQQLATAAEEREASLRERDAALKQLEALEKEKAAKLEILQQQLQVANEARDSAQTSVTQAQREKAELSRKVEELQACVETARQEQHEAQAQVAELELQLRSEQQKATEKERVAQEKDQLQEQLQALKESLKVTKGSLEEEKRRAADALEEQQRCISELKAETRSLVEQHKRERKELEEERAGRKGLEARLQQLGEAHQAETEVLRRELAEAMAAQHTAESECEQLVKEVAAWRERYEDSQQEEAQYGAMFQEQLMTLKEECEKARQELQEAKEKVAGIESHSELQISRQQNELAELHANLARALQQVQEKEVRAQKLADDLSTLQEKMAATSKEVARLETLVRKAGEQQETASRELVKEPARAGDRQPEWLEEQQGRQFCSTQAALQAMEREAEQMGNELERLRAALMESQGQQQEERGQQEREVARLTQERGRAQADLALEKAARAELEMRLQNALNEQRVEFATLQEALAHALTEKEGKDQELAKLRGLEAAQIKELEELRQTVKQLKEQLAKKEKEHASGSGAQSEAAGRTEPTGPKLEALRAEVSKLEQQCQKQQEQADSLERSLEAERASRAERDSALETLQGQLEEKAQELGHSQSALASAQRELAAFRTKVQDHSKAEDEWKAQVARGRQEAERKNSLISSLEEEVSILNRQVLEKEGESKELKRLVMAESEKSQKLEERLRLLQAETASNSARAAERSSALREEVQSLREEAEKQRVASENLRQELTSQAERAEELGQELKAWQEKFFQKEQALSTLQLEHTSTQALVSELLPAKHLCQQLQAEQAAAEKRHREELEQSKQAAGGLRAELLRAQRELGELIPLRQKVAEQERTAQQLRAEKASYAEQLSMLKKAHGLLAEENRGLGERANLGRQFLEVELDQAREKYVQELAAVRADAETRLAEVQREAQSTARELEVMTAKYEGAKVKVLEERQRFQEERQKLTAQVEQLEVFQREQTKQVEELSKKLADSDQASKVQQQKLKAVQAQGGESQQEAQRLQAQLNELQAQLSQKEQAAEHYKLQMEKAKTHYDAKKQQNQELQEQLRSLEQLQKENKELRAEAERLGHELQQAGLKTKEAEQTCRHLTAQVRSLEAQVAHADQQLRDLGKFQVATDALKSREPQAKPQLDLSIDSLDLSCEEGTPLSITSKLPRTQPDGTSVPGEPASPISQRLPPKVESLESLYFTPIPARSQAPLESSLDSLGDVFLDSGRKTRSARRRTTQIINITMTKKLDVEEPDSANSSFYSTRSAPASQASLRATSSTQSLARLGSPDYGNSALLSLPGYRPTTRSSARRSQAGVSSGAPPGRNSFYMGTCQDEPEQLDDWNRIAELQQRNRVCPPHLKTCYPLESRPSLSLGTITDEEMKTGDPQETLRRASMQPIQIAEGTGITTRQQRKRVSLEPHQGPGTPESKKATSCFPRPMTPRDRHEGRKQSTTEAQKKAAPASTKQADRRQSMAFSILNTPKKLGNSLLRRGASKKALSKASPNTRSGTRRSPRIATTTASAATAAAIGATPRAKGKAKH 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRA------QERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.121}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7nep.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 14' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PHE 214 214 ? A 150.372 206.672 315.468 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 2 C CA . PHE 214 214 ? A 151.542 207.369 314.823 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 3 C C . PHE 214 214 ? A 152.004 206.666 313.578 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 4 O O . PHE 214 214 ? A 152.156 207.301 312.548 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 5 C CB . PHE 214 214 ? A 152.695 207.584 315.841 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 6 C CG . PHE 214 214 ? A 153.796 208.466 315.274 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 7 C CD1 . PHE 214 214 ? A 154.963 207.894 314.742 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 8 C CD2 . PHE 214 214 ? A 153.695 209.869 315.285 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 9 C CE1 . PHE 214 214 ? A 155.994 208.694 314.231 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 10 C CE2 . PHE 214 214 ? A 154.717 210.672 314.760 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 11 C CZ . PHE 214 214 ? A 155.870 210.084 314.237 1 1 L PHE 0.240 1 ATOM 12 N N . GLN 215 215 ? A 152.179 205.333 313.594 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 13 C CA . GLN 215 215 ? A 152.542 204.660 312.375 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 14 C C . GLN 215 215 ? A 151.411 204.412 311.398 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 15 O O . GLN 215 215 ? A 151.687 204.228 310.231 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 16 C CB . GLN 215 215 ? A 153.304 203.386 312.709 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 17 C CG . GLN 215 215 ? A 154.641 203.726 313.401 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 18 C CD . GLN 215 215 ? A 155.390 202.433 313.686 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 19 O OE1 . GLN 215 215 ? A 155.851 201.816 312.721 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 20 N NE2 . GLN 215 215 ? A 155.522 202.051 314.977 1 1 L GLN 0.340 1 ATOM 21 N N . MET 216 216 ? A 150.114 204.492 311.772 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 22 C CA . MET 216 216 ? A 149.076 204.642 310.758 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 23 C C . MET 216 216 ? A 149.193 205.953 310.023 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 24 O O . MET 216 216 ? A 149.075 206.004 308.811 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 25 C CB . MET 216 216 ? A 147.636 204.544 311.309 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 26 C CG . MET 216 216 ? A 147.242 203.154 311.836 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 27 S SD . MET 216 216 ? A 147.429 201.823 310.602 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 28 C CE . MET 216 216 ? A 146.126 202.328 309.434 1 1 L MET 0.370 1 ATOM 29 N N . ARG 217 217 ? A 149.490 207.050 310.745 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 30 C CA . ARG 217 217 ? A 149.870 208.299 310.124 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 31 C C . ARG 217 217 ? A 151.152 208.223 309.329 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 32 O O . ARG 217 217 ? A 151.182 208.732 308.226 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 33 C CB . ARG 217 217 ? A 150.001 209.455 311.136 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 34 C CG . ARG 217 217 ? A 148.661 209.911 311.743 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 35 C CD . ARG 217 217 ? A 148.778 211.229 312.518 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 36 N NE . ARG 217 217 ? A 149.684 210.988 313.700 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 37 C CZ . ARG 217 217 ? A 149.281 210.556 314.900 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 38 N NH1 . ARG 217 217 ? A 148.015 210.242 315.144 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 39 N NH2 . ARG 217 217 ? A 150.156 210.489 315.905 1 1 L ARG 0.400 1 ATOM 40 N N . ARG 218 218 ? A 152.236 207.581 309.810 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 41 C CA . ARG 218 218 ? A 153.401 207.338 308.979 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 42 C C . ARG 218 218 ? A 153.111 206.456 307.780 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 43 O O . ARG 218 218 ? A 153.488 206.816 306.680 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 44 C CB . ARG 218 218 ? A 154.588 206.725 309.770 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 45 C CG . ARG 218 218 ? A 155.891 206.555 308.945 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 46 C CD . ARG 218 218 ? A 157.084 205.891 309.669 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 47 N NE . ARG 218 218 ? A 156.727 204.477 310.073 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 48 C CZ . ARG 218 218 ? A 156.778 203.389 309.287 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 49 N NH1 . ARG 218 218 ? A 157.086 203.466 307.995 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 50 N NH2 . ARG 218 218 ? A 156.497 202.192 309.807 1 1 L ARG 0.430 1 ATOM 51 N N . LEU 219 219 ? A 152.408 205.321 307.919 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 52 C CA . LEU 219 219 ? A 152.030 204.487 306.798 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 53 C C . LEU 219 219 ? A 151.099 205.172 305.833 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 54 O O . LEU 219 219 ? A 151.345 205.119 304.646 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 55 C CB . LEU 219 219 ? A 151.424 203.124 307.222 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 56 C CG . LEU 219 219 ? A 152.440 201.969 307.395 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 57 C CD1 . LEU 219 219 ? A 153.049 201.551 306.047 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 58 C CD2 . LEU 219 219 ? A 153.542 202.254 308.421 1 1 L LEU 0.550 1 ATOM 59 N N . LYS 220 220 ? A 150.052 205.882 306.281 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 60 C CA . LYS 220 220 ? A 149.191 206.681 305.431 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 61 C C . LYS 220 220 ? A 149.898 207.851 304.776 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 62 O O . LYS 220 220 ? A 149.668 208.166 303.614 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 63 C CB . LYS 220 220 ? A 147.997 207.218 306.242 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 64 C CG . LYS 220 220 ? A 146.979 208.009 305.408 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 65 C CD . LYS 220 220 ? A 145.784 208.487 306.244 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 66 C CE . LYS 220 220 ? A 144.789 209.300 305.409 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 67 N NZ . LYS 220 220 ? A 143.648 209.735 306.244 1 1 L LYS 0.550 1 ATOM 68 N N . LYS 221 221 ? A 150.789 208.536 305.511 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 69 C CA . LYS 221 221 ? A 151.649 209.571 304.984 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 70 C C . LYS 221 221 ? A 152.642 209.041 303.971 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 71 O O . LYS 221 221 ? A 152.839 209.667 302.947 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 72 C CB . LYS 221 221 ? A 152.389 210.294 306.129 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 73 C CG . LYS 221 221 ? A 153.265 211.479 305.716 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 74 C CD . LYS 221 221 ? A 153.810 212.240 306.938 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 75 C CE . LYS 221 221 ? A 154.813 211.433 307.771 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 76 N NZ . LYS 221 221 ? A 155.394 212.285 308.835 1 1 L LYS 0.610 1 ATOM 77 N N . GLN 222 222 ? A 153.274 207.873 304.210 1 1 L GLN 0.650 1 ATOM 78 C CA . GLN 222 222 ? A 154.154 207.193 303.274 1 1 L GLN 0.650 1 ATOM 79 C C . GLN 222 222 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #