data_SMR-3d74a72188eab31e4f4acd8d7eaac7c0_3 _entry.id SMR-3d74a72188eab31e4f4acd8d7eaac7c0_3 _struct.entry_id SMR-3d74a72188eab31e4f4acd8d7eaac7c0_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P48634 (isoform 2)/ PRC2A_HUMAN, Protein PRRC2A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P48634 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 268193.423 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PRC2A_HUMAN P48634 1 ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP SQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPP KALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFD RHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPG FPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGG QGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPK PDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGAQ ANSAVTESFEEMMGVEVGQGDQTTLLLPEAAMPARHGARVQSMRKSPSGAGSGAQKQAARPMRVIWLLQT RRLPHPRREHSPRSSRSPTTRSPTLHRAPARFTCPGVGESSLPEGAISPGPRRREAPPQVCPGWSPPAKS LAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRLK QERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDFT SERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPGP GGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIHS NPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMVR GVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHIW NRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAE GPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPIR PSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGHC VPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGSHGLSITSKQWRLRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSAL LSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTPL QPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPAT RVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGVF RTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR ; 'Protein PRRC2A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2156 1 2156 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PRC2A_HUMAN P48634 P48634-2 1 2156 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 13C2A71F42213DDC # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no T ;MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENK GNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVK SWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDG GGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPS RFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDS DEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPA GNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVERARRRREEEERRMQEERRAACAEKL KRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPT PGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPP SQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPP KALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFD RHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPG FPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGG QGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPK PDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGAQ ANSAVTESFEEMMGVEVGQGDQTTLLLPEAAMPARHGARVQSMRKSPSGAGSGAQKQAARPMRVIWLLQT RRLPHPRREHSPRSSRSPTTRSPTLHRAPARFTCPGVGESSLPEGAISPGPRRREAPPQVCPGWSPPAKS LAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRLK QERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDFT SERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPGP GGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIHS NPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMVR GVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHIW 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A 1 2004 PRO 2004 ? ? ? T . A 1 2005 PRO 2005 ? ? ? T . A 1 2006 LEU 2006 ? ? ? T . A 1 2007 SER 2007 ? ? ? T . A 1 2008 LEU 2008 ? ? ? T . A 1 2009 LEU 2009 ? ? ? T . A 1 2010 PRO 2010 ? ? ? T . A 1 2011 VAL 2011 ? ? ? T . A 1 2012 GLY 2012 ? ? ? T . A 1 2013 PRO 2013 ? ? ? T . A 1 2014 ALA 2014 ? ? ? T . A 1 2015 LEU 2015 ? ? ? T . A 1 2016 GLN 2016 ? ? ? T . A 1 2017 PRO 2017 ? ? ? T . A 1 2018 PRO 2018 ? ? ? T . A 1 2019 SER 2019 ? ? ? T . A 1 2020 LEU 2020 ? ? ? T . A 1 2021 ALA 2021 ? ? ? T . A 1 2022 VAL 2022 ? ? ? T . A 1 2023 ARG 2023 ? ? ? T . A 1 2024 PRO 2024 ? ? ? T . A 1 2025 PRO 2025 ? ? ? T . A 1 2026 PRO 2026 ? ? ? T . A 1 2027 ALA 2027 ? ? ? T . A 1 2028 PRO 2028 ? ? ? T . A 1 2029 ALA 2029 ? ? ? T . A 1 2030 THR 2030 ? ? ? T . A 1 2031 ARG 2031 ? ? ? T . A 1 2032 VAL 2032 ? ? ? T . A 1 2033 LEU 2033 ? ? ? T . A 1 2034 PRO 2034 ? ? ? T . A 1 2035 SER 2035 ? ? ? T . A 1 2036 PRO 2036 ? ? ? T . A 1 2037 ALA 2037 ? ? ? T . A 1 2038 ARG 2038 ? ? ? T . 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A 1 2144 SER 2144 ? ? ? T . A 1 2145 ARG 2145 ? ? ? T . A 1 2146 GLY 2146 ? ? ? T . A 1 2147 ASP 2147 ? ? ? T . A 1 2148 LYS 2148 ? ? ? T . A 1 2149 GLU 2149 ? ? ? T . A 1 2150 PRO 2150 ? ? ? T . A 1 2151 GLY 2151 ? ? ? T . A 1 2152 LEU 2152 ? ? ? T . A 1 2153 PRO 2153 ? ? ? T . A 1 2154 PRO 2154 ? ? ? T . A 1 2155 PRO 2155 ? ? ? T . A 1 2156 ARG 2156 ? ? ? T . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Uncharacterized protein {PDB ID=6yws, label_asym_id=T, auth_asym_id=R, SMTL ID=6yws.1.T}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6yws, label_asym_id=T' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A T 20 1 R # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MHLAQLRQPLTRAAANSCHSVCRLPTTHSSVSATAILSEQFAHLRIGPSSSNVAVEGRRYASVKAQGAYR LKPKRTIPKKLGAKKTGDQYVIPGNIIYKQRGTLWHPGENTIMGRDHTIHAAVAGYVKYYRDPQLHPDRQ YIGVVFNRNDKLPYPKDAPRKRKLGLVAVPRKVEEVEKPTMSASGLPLFVTRHETIEIPPPAVTTPAAAG KAVKGQGARVSASGAAAVPASSSTISASASSNSNNGGSSVIAELIKEKLAARAEYNARQSALRKLQQQKM LARRGTRVLRLMNNYSYRETNWEIGRLIGDPGSVPGTEKVGSRKAKFRARRRRRNTFLLGIKERKLAKAD RREEYRRRVREKREQRLVQRKEFLAKQREAKKAREGGAAAEKSEKKEVKAEKPAAAAPKVEKPKAPEAAK KESKPKVEEKKAAAAEPKKDSKTEKKD ; ;MHLAQLRQPLTRAAANSCHSVCRLPTTHSSVSATAILSEQFAHLRIGPSSSNVAVEGRRYASVKAQGAYR LKPKRTIPKKLGAKKTGDQYVIPGNIIYKQRGTLWHPGENTIMGRDHTIHAAVAGYVKYYRDPQLHPDRQ YIGVVFNRNDKLPYPKDAPRKRKLGLVAVPRKVEEVEKPTMSASGLPLFVTRHETIEIPPPAVTTPAAAG KAVKGQGARVSASGAAAVPASSSTISASASSNSNNGGSSVIAELIKEKLAARAEYNARQSALRKLQQQKM LARRGTRVLRLMNNYSYRETNWEIGRLIGDPGSVPGTEKVGSRKAKFRARRRRRNTFLLGIKERKLAKAD RREEYRRRVREKREQRLVQRKEFLAKQREAKKAREGGAAAEKSEKKEVKAEKPAAAAPKVEKPKAPEAAK KESKPKVEEKKAAAAEPKKDSKTEKKD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 326 375 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6yws 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2156 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2159 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 75.000 29.787 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSDRSGPTAKGKDGKKYSSLNLFDTYKGKSLEIQKPAVAPRHGLQSLGKVAIARRMPPPANLPSLKAENKGNDPNVSLVPKDGTGWASKQEQSDPKSSDASTAQPPESQPLPASQTPASNQPKRPPAAPENTPLVPSGVKSWAQASVTHGAHGDGGRASSLLSRFSREEFPTLQAAGDQDKAAKERESAEQSSGPGPSLRPQNSTTWRDGGGRGPDELEGPDSKLHHGHDPRGGLQPSGPPQFPPYRGMMPPFMYPPYLPFPPPYGPQGPYRYPTPDGPSRFPRVAGPRGSGPPMRLVEPVGRPSILKEDNLKEFDQLDQENDDGWAGAHEEVDYTEKLKFSDEEDGRDSDEEGAEGHRDSQSASGEERPPEADGKKGNSPNSEPPTPKTAWAETSRPPETEPGPPAPKPPLPPPHRGPAGNWGPPGDYPDRGGPPCKPPAPEDEDEAWRQRRKQSSSEISLAVER---ARRRREEEERRMQEERRAACAEKLKRLDEKFGAPDKRLKAEPAAPPAAPSTPAPPPAVPKELPAPPAPPPASAPTPETEPEEPAQAPPAQSTPTPGVAAAPTLVSGGGSTSSTSSGSFEASPVEPQLPSKEGPEPPEEVPPPTTPPVPKVEPKGDGIGPTRQPPSQGLGYPKYQKSLPPRFQRQQQEQLLKQQQQHQWQQHQQGSAPPTPVPPSPPQPVTLGAVPAPQAPPPPPKALYPGALGRPPPMPPMNFDPRWMMIPPYVDPRLLQGRPPLDFYPPGVHPSGLVPRERSDSGGSSSEPFDRHAPAMLRERGTPPVDPKLAWVGDVFTATPAEPRPLTSPLRQAADEDDKGMRSETPPVPPPPPYLASYPGFPENGAPGPPISRFPLEEPGPRPLPWPPGSDEVAKIQTPPPKKEPPKEETAQLTGPEAGRKPARGVGSGGQGPPPPRRESRTETRWGPRPGSSRRGIPPEEPGAPPRRAGPIKKPPPPTKVEELPPKPLEQGDETPKPPKPDPLKITKGKLGGPKETPPNGNLSPAPRLRRDYSYERVGPTSCRGRGRGEYFARGRGFRGTYGGRGRGAQANSAVTESFEEMMGVEVGQGDQTTLLLPEAAMPARHGARVQSMRKSPSGAGSGAQKQAARPMRVIWLLQTRRLPHPRREHSPRSSRSPTTRSPTLHRAPARFTCPGVGESSLPEGAISPGPRRREAPPQVCPGWSPPAKSLAPKKPPTGPLPPSKEPLKEKLIPGPLSPVARGGSNGGSNVGMEDGERPRRRRHGRAQQQDKPPRFRRLKQERENAARGSEGKPSLTLPASAPGPEEALTTVTVAPAPRRAAAKSPDLSNQNSDQANEEWETASESSDFTSERRGDKEAPPPVLLTPKAVGTPGGGGGGAVPGISAMSRGDLSQRAKDLSKRSFSSQRPGMERQNRRPGPGGKAGSSGSSSGGGGGGPGGRTGPGRGDKRSWPSPKNRSRPPEERPPGLPLPPPPPSSSAVFRLDQVIHSNPAGIQQALAQLSSRQGSVTAPGGHPRHKPGLPQAPQGPSPRPPTRYEPQRVNSGLSSDPHFEEPGPMVRGVGGTPRDSAGVSPFPPKRRERPPRKPELLQEESLPPPHSSGFLGSKPEGPGPQAESRDTGTEALTPHIWNRLHTATSRKSYRPSSMEPWMEPLSPFEDVAGTEMSQSDSGVDLSGDSQVSSGPCSQRSSPDGGLKGAAEGPPKRPGGSSPLNAVPCEGPPGSEPPRRPPPAPHDGDRKELPREQPLPPGPIGTERSQRTDRGTEPGPIRPSHRPGPPVQFGTSDKDSDLRLVVGDSLKAEKELTASVTEAIPVSRDWELLPSAAASAEPQSKNLDSGHCVPEPSSSGQRLYPEVFYGSAGPSSSQISGGSHGLSITSKQWRLRPGTPSLHPYRSQPLYLPPGPAPPSALLSGLALKGQFLDFSTMQATELGKLPAGGVLYPPPSFLYSPAFCPSPLPDTSLLQVRQDLPSPSDFYSTPLQPGGQSGFLPSGAPAQQMLLPMVDSQLPVVNFGSLPPAPPPAPPPLSLLPVGPALQPPSLAVRPPPAPATRVLPSPARPFPASLGRAELHPVELKPFQDYQKLSSNLGGPGSSRTPPTGRSFSGLNSRLKATPSTYSGVFRTQRVDLYQQASPPDALRWIPKPWERTGPPPREGPSRRAEEPGSRGDKEPGLPPPR 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KFRARRRRRNTFLLGIKERKLAKADRREEYRRRVREKREQRLVQRKEFLA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6yws.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 448 448 ? A 117.297 166.207 209.647 1 1 T ALA 0.250 1 ATOM 2 C CA . ALA 448 448 ? A 118.481 165.353 209.316 1 1 T ALA 0.250 1 ATOM 3 C C . ALA 448 448 ? A 118.497 163.949 209.947 1 1 T ALA 0.250 1 ATOM 4 O O . ALA 448 448 ? A 118.723 162.980 209.250 1 1 T ALA 0.250 1 ATOM 5 C CB . ALA 448 448 ? A 119.749 166.175 209.613 1 1 T ALA 0.250 1 ATOM 6 N N . TRP 449 449 ? A 118.175 163.781 211.261 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 7 C CA . TRP 449 449 ? A 118.111 162.464 211.901 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 8 C C . TRP 449 449 ? A 117.094 161.498 211.266 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 9 O O . TRP 449 449 ? A 117.405 160.350 210.969 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 10 C CB . TRP 449 449 ? A 117.811 162.652 213.412 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 11 C CG . TRP 449 449 ? A 117.850 161.359 214.210 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 12 C CD1 . TRP 449 449 ? A 118.935 160.707 214.715 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 13 C CD2 . TRP 449 449 ? A 116.709 160.538 214.503 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 14 N NE1 . TRP 449 449 ? A 118.550 159.530 215.313 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 15 C CE2 . TRP 449 449 ? A 117.188 159.405 215.195 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 16 C CE3 . TRP 449 449 ? A 115.356 160.692 214.230 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 17 C CZ2 . TRP 449 449 ? A 116.315 158.422 215.638 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 18 C CZ3 . TRP 449 449 ? A 114.479 159.696 214.673 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 19 C CH2 . TRP 449 449 ? A 114.949 158.582 215.378 1 1 T TRP 0.310 1 ATOM 20 N N . ARG 450 450 ? A 115.864 161.981 210.972 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 21 C CA . ARG 450 450 ? A 114.819 161.201 210.315 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 22 C C . ARG 450 450 ? A 115.197 160.678 208.923 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 23 O O . ARG 450 450 ? A 114.937 159.533 208.570 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 24 C CB . ARG 450 450 ? A 113.505 162.024 210.198 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 25 C CG . ARG 450 450 ? A 112.864 162.416 211.548 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 26 C CD . ARG 450 450 ? A 111.407 162.898 211.428 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 27 N NE . ARG 450 450 ? A 111.399 164.301 210.878 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 28 C CZ . ARG 450 450 ? A 111.364 165.418 211.621 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 29 N NH1 . ARG 450 450 ? A 111.297 166.609 211.026 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 30 N NH2 . ARG 450 450 ? A 111.369 165.381 212.949 1 1 T ARG 0.370 1 ATOM 31 N N . GLN 451 451 ? A 115.846 161.536 208.109 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 32 C CA . GLN 451 451 ? A 116.413 161.196 206.813 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 33 C C . GLN 451 451 ? A 117.548 160.188 206.904 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 34 O O . GLN 451 451 ? A 117.604 159.232 206.135 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 35 C CB . GLN 451 451 ? A 116.892 162.476 206.095 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 36 C CG . GLN 451 451 ? A 115.718 163.396 205.683 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 37 C CD . GLN 451 451 ? A 116.230 164.699 205.061 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 38 O OE1 . GLN 451 451 ? A 117.232 165.251 205.506 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 39 N NE2 . GLN 451 451 ? A 115.483 165.236 204.066 1 1 T GLN 0.450 1 ATOM 40 N N . ARG 452 452 ? A 118.446 160.359 207.902 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 41 C CA . ARG 452 452 ? A 119.527 159.438 208.201 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 42 C C . ARG 452 452 ? A 119.012 158.048 208.543 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 43 O O . ARG 452 452 ? A 119.553 157.040 208.110 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 44 C CB . ARG 452 452 ? A 120.401 159.984 209.363 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 45 C CG . ARG 452 452 ? A 121.768 159.283 209.504 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 46 C CD . ARG 452 452 ? A 122.644 159.844 210.636 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 47 N NE . ARG 452 452 ? A 122.845 158.770 211.674 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 48 C CZ . ARG 452 452 ? A 123.859 157.890 211.682 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 49 N NH1 . ARG 452 452 ? A 124.795 157.892 210.741 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 50 N NH2 . ARG 452 452 ? A 123.927 156.970 212.646 1 1 T ARG 0.400 1 ATOM 51 N N . ARG 453 453 ? A 117.909 157.969 209.319 1 1 T ARG 0.440 1 ATOM 52 C CA . ARG 453 453 ? A 117.245 156.710 209.585 1 1 T ARG 0.440 1 ATOM 53 C C . ARG 453 453 ? 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A 114.373 157.433 205.658 1 1 T LYS 0.540 1 ATOM 67 C CG . LYS 454 454 ? A 113.648 156.955 204.385 1 1 T LYS 0.540 1 ATOM 68 C CD . LYS 454 454 ? A 112.798 158.050 203.729 1 1 T LYS 0.540 1 ATOM 69 C CE . LYS 454 454 ? A 112.131 157.581 202.433 1 1 T LYS 0.540 1 ATOM 70 N NZ . LYS 454 454 ? A 111.319 158.676 201.861 1 1 T LYS 0.540 1 ATOM 71 N N . GLN 455 455 ? A 117.323 156.440 205.090 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 72 C CA . GLN 455 455 ? A 118.417 155.961 204.266 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 73 C C . GLN 455 455 ? A 119.005 154.653 204.805 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 74 O O . GLN 455 455 ? A 119.147 153.671 204.098 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 75 C CB . GLN 455 455 ? A 119.514 157.056 204.160 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 76 C CG . GLN 455 455 ? A 120.667 156.725 203.188 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 77 C CD . GLN 455 455 ? A 120.147 156.543 201.766 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 78 O OE1 . GLN 455 455 ? A 119.440 157.392 201.220 1 1 T GLN 0.560 1 ATOM 79 N NE2 . GLN 455 455 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.528 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 448 ALA 1 0.250 2 1 A 449 TRP 1 0.310 3 1 A 450 ARG 1 0.370 4 1 A 451 GLN 1 0.450 5 1 A 452 ARG 1 0.400 6 1 A 453 ARG 1 0.440 7 1 A 454 LYS 1 0.540 8 1 A 455 GLN 1 0.560 9 1 A 456 SER 1 0.560 10 1 A 457 SER 1 0.580 11 1 A 458 SER 1 0.650 12 1 A 459 GLU 1 0.620 13 1 A 460 ILE 1 0.580 14 1 A 461 SER 1 0.630 15 1 A 462 LEU 1 0.600 16 1 A 463 ALA 1 0.650 17 1 A 464 VAL 1 0.630 18 1 A 465 GLU 1 0.590 19 1 A 466 ARG 1 0.450 20 1 A 467 ALA 1 0.450 21 1 A 468 ARG 1 0.300 22 1 A 469 ARG 1 0.320 23 1 A 470 ARG 1 0.430 24 1 A 471 ARG 1 0.470 25 1 A 472 GLU 1 0.550 26 1 A 473 GLU 1 0.580 27 1 A 474 GLU 1 0.610 28 1 A 475 GLU 1 0.650 29 1 A 476 ARG 1 0.620 30 1 A 477 ARG 1 0.660 31 1 A 478 MET 1 0.720 32 1 A 479 GLN 1 0.730 33 1 A 480 GLU 1 0.690 34 1 A 481 GLU 1 0.630 35 1 A 482 ARG 1 0.590 36 1 A 483 ARG 1 0.550 37 1 A 484 ALA 1 0.640 38 1 A 485 ALA 1 0.620 39 1 A 486 CYS 1 0.570 40 1 A 487 ALA 1 0.590 41 1 A 488 GLU 1 0.460 42 1 A 489 LYS 1 0.510 43 1 A 490 LEU 1 0.490 44 1 A 491 LYS 1 0.480 45 1 A 492 ARG 1 0.330 46 1 A 493 LEU 1 0.380 47 1 A 494 ASP 1 0.330 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #