data_SMR-183e3d55b6e7d05fb9c29a10285351f8_4 _entry.id SMR-183e3d55b6e7d05fb9c29a10285351f8_4 _struct.entry_id SMR-183e3d55b6e7d05fb9c29a10285351f8_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9WU42/ NCOR2_MOUSE, Nuclear receptor corepressor 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9WU42' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 314720.098 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NCOR2_MOUSE Q9WU42 1 ;MSGSTQPVAQTWRAAEPRYPPHGISYPVQIARSHTDVGLLEYQHHPRDYTSHLSPGSIIQPQRRRPSLLS EFQPGSERSQELHLRPESRTFLPELGKPDIEFTESKRPRLELLPDTLLRPSPLLATGQPSGSEDLTKDRS LAGKLEPVSPPSPPHADPELELAPSRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEP EKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKL ILYFKRRNHARKQWEQRFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERM QSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMDDPM KVYKDRQVTNMWSEQERDTFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRR GKSQQQQQQQQQQQQQQMARSSQEEKEEKEKEKEADKEEEKQDAENEKEELSKEKTDDTSGEDNDEKEAV ASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANHEETATPQQSSELASMEMNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNW SAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKTPAAASEETAFPPAAEDEE MEASGASANEEELAEEAEASQASGNEVPRVGECSGPAAVNNSSDTESVPSPRSEATKDTGPKPTGTEALP AATQPPVPPPEEPAVAPAEPSPVPDASGPPSPEPSPSPAAPPATVDKDEQEAPAAPAPQTEDAKEQKSEA EEIDVGKPEEPEASEEPPESVKSDHKEETEEEPEDKAKGTEAIETVSEAPLKVEEAGSKAAVTKGSSSGA TQDSDSSATCSADEVDEPEGGDKGRLLSPRPSLLTPAGDPRASTSPQKPLDLKQLKQRAAAIPPIVTKVH EPPREDTVPPKPVPPVPPPTQHLQPEGDVSQQSGGSPRGKSRSPVPPAEKEAEKPAFFPAFPTEGPKLPT EPPRWSSGLPFPIPPREVIKTSPHAADPSAFSYTPPGHPLPLGLHDSARPVLPRPPISNPPPLISSAKHP GVLERQLGAISQQGMSVQLRVPHSEHAKAPMGPLTMGLPLAVDPKKLGTALGSATSGSITKGLPSTRAAD GPSYRGSITHGTPADVLYKGTISRIVGEDSPSRLDRAREDTLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGGMSVSQCSK EDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRTVTSASIEGLMGRAIPEQHSPHLKEQHHIRGSITQGIPRSY VEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPPRDLTETYKPRPLDPLGPLKLKPTHEGVVATVKEAGRSIHEIPR EELRRTPELPLAPRPLKEGSITQGTPLKYDSGAPSTGTKKHDVRSIIGSPGRPFPALHPLDIMADARALE RACYEESLKSRSGTSSGAGGSITRGAPVVVPELGKPRQSPLTYEDHGAPFTSHLPRGSPVTTREPTPRLQ EGSLLSSKASQDRKLTSTPREIAKSPHSTVPEHHPHPISPYEHLLRGVTGVDLYRGHIPLAFDPTSIPRG IPLEAAAAAYYLPRHLAPSPTYPHLYPPYLIRGYPDTAALENRQTIINDYITSQQMHHNAASAMAQRADM LRGLSPRESSLALNYAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAIDRLAYLPTAPPPFSSRHSSSPLSP GGPTHLAKPTATSSSERERERERERDKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGAGGSSRPASHTHQHSPISP RTQDALQQRPSVLHNTSMKGVVTSVEPGTPTVLRWARSTSTSSPVRPAATFPPATHCPLGGTLEGVYPTL MEPVLLPKETSRVARPERPRVDAGHAFLTKPPAREPASSPSKSSEPRSLAPPSSSHTAIARTPAKNLAPH HASPDPPAPTSASDLHREKTQSKPFSIQELELRSLGYHSGAGYSPDGVEPISPVSSPSLTHDKGLSKPLE ELEKSHLEGELRHKQPGPMKLSAEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGIKGHQRVVTLAQHISEVITQ DYTRHHPQQLSGPLPAPLYSFPGASCPVLDLRRPPSDLYLPPPDHGTPARGSPHSEGGKRSPEPSKTSVL GSSEDAIEPVSPPEGMTEPGHARSTAYPLLYRDGEQGEPRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSK KQEINKKLNTHNRNEPEYNIGQPGTEIFNMPAITGAGLMTCRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQ WEEPPPLGANAFNPLNASASLPAAAMPITTADGRSDHALTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGD RPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLAAGSGPLAGPH HAWDEEPKPLLCSQYETLSDSE ; 'Nuclear receptor corepressor 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2472 1 2472 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NCOR2_MOUSE Q9WU42 . 1 2472 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 8068020DF0AAB9B7 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSGSTQPVAQTWRAAEPRYPPHGISYPVQIARSHTDVGLLEYQHHPRDYTSHLSPGSIIQPQRRRPSLLS EFQPGSERSQELHLRPESRTFLPELGKPDIEFTESKRPRLELLPDTLLRPSPLLATGQPSGSEDLTKDRS LAGKLEPVSPPSPPHADPELELAPSRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEP EKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKL ILYFKRRNHARKQWEQRFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERM QSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMDDPM KVYKDRQVTNMWSEQERDTFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRR GKSQQQQQQQQQQQQQQMARSSQEEKEEKEKEKEADKEEEKQDAENEKEELSKEKTDDTSGEDNDEKEAV ASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANHEETATPQQSSELASMEMNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNW 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A 1 2384 SER 2384 ? ? ? B . A 1 2385 VAL 2385 ? ? ? B . A 1 2386 SER 2386 ? ? ? B . A 1 2387 SER 2387 ? ? ? B . A 1 2388 VAL 2388 ? ? ? B . A 1 2389 HIS 2389 ? ? ? B . A 1 2390 SER 2390 ? ? ? B . A 1 2391 GLU 2391 ? ? ? B . A 1 2392 GLY 2392 ? ? ? B . A 1 2393 ASP 2393 ? ? ? B . A 1 2394 CYS 2394 ? ? ? B . A 1 2395 ASN 2395 ? ? ? B . A 1 2396 ARG 2396 ? ? ? B . A 1 2397 ARG 2397 ? ? ? B . A 1 2398 THR 2398 ? ? ? B . A 1 2399 PRO 2399 ? ? ? B . A 1 2400 LEU 2400 ? ? ? B . A 1 2401 THR 2401 ? ? ? B . A 1 2402 ASN 2402 ? ? ? B . A 1 2403 ARG 2403 ? ? ? B . A 1 2404 VAL 2404 ? ? ? B . A 1 2405 TRP 2405 ? ? ? B . A 1 2406 GLU 2406 ? ? ? B . A 1 2407 ASP 2407 ? ? ? B . A 1 2408 ARG 2408 ? ? ? B . A 1 2409 PRO 2409 ? ? ? B . A 1 2410 SER 2410 ? ? ? B . A 1 2411 SER 2411 ? ? ? B . A 1 2412 ALA 2412 ? ? ? B . A 1 2413 GLY 2413 ? ? ? B . A 1 2414 SER 2414 ? ? ? B . A 1 2415 THR 2415 ? ? ? B . A 1 2416 PRO 2416 ? ? ? B . A 1 2417 PHE 2417 ? ? ? B . A 1 2418 PRO 2418 ? ? ? B . A 1 2419 TYR 2419 ? ? ? B . A 1 2420 ASN 2420 ? ? ? B . A 1 2421 PRO 2421 ? ? ? B . A 1 2422 LEU 2422 ? ? ? B . A 1 2423 ILE 2423 ? ? ? B . A 1 2424 MET 2424 ? ? ? B . A 1 2425 ARG 2425 ? ? ? B . A 1 2426 LEU 2426 ? ? ? B . A 1 2427 GLN 2427 ? ? ? B . A 1 2428 ALA 2428 ? ? ? B . A 1 2429 GLY 2429 ? ? ? B . A 1 2430 VAL 2430 ? ? ? B . A 1 2431 MET 2431 ? ? ? B . A 1 2432 ALA 2432 ? ? ? B . A 1 2433 SER 2433 ? ? ? B . A 1 2434 PRO 2434 ? ? ? B . A 1 2435 PRO 2435 ? ? ? B . A 1 2436 PRO 2436 ? ? ? B . A 1 2437 PRO 2437 ? ? ? B . A 1 2438 GLY 2438 ? ? ? B . A 1 2439 LEU 2439 ? ? ? B . A 1 2440 ALA 2440 ? ? ? B . A 1 2441 ALA 2441 ? ? ? B . A 1 2442 GLY 2442 ? ? ? B . A 1 2443 SER 2443 ? ? ? B . A 1 2444 GLY 2444 ? ? ? B . A 1 2445 PRO 2445 ? ? ? B . A 1 2446 LEU 2446 ? ? ? B . A 1 2447 ALA 2447 ? ? ? B . A 1 2448 GLY 2448 ? ? ? B . A 1 2449 PRO 2449 ? ? ? B . A 1 2450 HIS 2450 ? ? ? B . A 1 2451 HIS 2451 ? ? ? B . A 1 2452 ALA 2452 ? ? ? B . A 1 2453 TRP 2453 ? ? ? B . A 1 2454 ASP 2454 ? ? ? B . A 1 2455 GLU 2455 ? ? ? B . A 1 2456 GLU 2456 ? ? ? B . A 1 2457 PRO 2457 ? ? ? B . A 1 2458 LYS 2458 ? ? ? B . A 1 2459 PRO 2459 ? ? ? B . A 1 2460 LEU 2460 ? ? ? B . A 1 2461 LEU 2461 ? ? ? B . A 1 2462 CYS 2462 ? ? ? B . A 1 2463 SER 2463 ? ? ? B . A 1 2464 GLN 2464 ? ? ? B . A 1 2465 TYR 2465 ? ? ? B . A 1 2466 GLU 2466 ? ? ? B . A 1 2467 THR 2467 ? ? ? B . A 1 2468 LEU 2468 ? ? ? B . A 1 2469 SER 2469 ? ? ? B . A 1 2470 ASP 2470 ? ? ? B . A 1 2471 SER 2471 ? ? ? B . A 1 2472 GLU 2472 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'NUCLEAR RECEPTOR COREPRESSOR 2 {PDB ID=4a69, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=4a69.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 4a69, label_asym_id=C' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIAS FLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK ; ;GAMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIAS FLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 94 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4a69 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2472 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2472 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.17e-55 95.652 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSGSTQPVAQTWRAAEPRYPPHGISYPVQIARSHTDVGLLEYQHHPRDYTSHLSPGSIIQPQRRRPSLLSEFQPGSERSQELHLRPESRTFLPELGKPDIEFTESKRPRLELLPDTLLRPSPLLATGQPSGSEDLTKDRSLAGKLEPVSPPSPPHADPELELAPSRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGPQVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFKRRNHARKQWEQRFCQRYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERMQSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMDDPMKVYKDRQVTNMWSEQERDTFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRRGKSQQQQQQQQQQQQQQMARSSQEEKEEKEKEKEADKEEEKQDAENEKEELSKEKTDDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANHEETATPQQSSELASMEMNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCKNFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKTPAAASEETAFPPAAEDEEMEASGASANEEELAEEAEASQASGNEVPRVGECSGPAAVNNSSDTESVPSPRSEATKDTGPKPTGTEALPAATQPPVPPPEEPAVAPAEPSPVPDASGPPSPEPSPSPAAPPATVDKDEQEAPAAPAPQTEDAKEQKSEAEEIDVGKPEEPEASEEPPESVKSDHKEETEEEPEDKAKGTEAIETVSEAPLKVEEAGSKAAVTKGSSSGATQDSDSSATCSADEVDEPEGGDKGRLLSPRPSLLTPAGDPRASTSPQKPLDLKQLKQRAAAIPPIVTKVHEPPREDTVPPKPVPPVPPPTQHLQPEGDVSQQSGGSPRGKSRSPVPPAEKEAEKPAFFPAFPTEGPKLPTEPPRWSSGLPFPIPPREVIKTSPHAADPSAFSYTPPGHPLPLGLHDSARPVLPRPPISNPPPLISSAKHPGVLERQLGAISQQGMSVQLRVPHSEHAKAPMGPLTMGLPLAVDPKKLGTALGSATSGSITKGLPSTRAADGPSYRGSITHGTPADVLYKGTISRIVGEDSPSRLDRAREDTLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGGMSVSQCSKEDGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRTVTSASIEGLMGRAIPEQHSPHLKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPPRDLTETYKPRPLDPLGPLKLKPTHEGVVATVKEAGRSIHEIPREELRRTPELPLAPRPLKEGSITQGTPLKYDSGAPSTGTKKHDVRSIIGSPGRPFPALHPLDIMADARALERACYEESLKSRSGTSSGAGGSITRGAPVVVPELGKPRQSPLTYEDHGAPFTSHLPRGSPVTTREPTPRLQEGSLLSSKASQDRKLTSTPREIAKSPHSTVPEHHPHPISPYEHLLRGVTGVDLYRGHIPLAFDPTSIPRGIPLEAAAAAYYLPRHLAPSPTYPHLYPPYLIRGYPDTAALENRQTIINDYITSQQMHHNAASAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIIDLSQVPHLPVLVPPTPGTPATAIDRLAYLPTAPPPFSSRHSSSPLSPGGPTHLAKPTATSSSERERERERERDKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGAGGSSRPASHTHQHSPISPRTQDALQQRPSVLHNTSMKGVVTSVEPGTPTVLRWARSTSTSSPVRPAATFPPATHCPLGGTLEGVYPTLMEPVLLPKETSRVARPERPRVDAGHAFLTKPPAREPASSPSKSSEPRSLAPPSSSHTAIARTPAKNLAPHHASPDPPAPTSASDLHREKTQSKPFSIQELELRSLGYHSGAGYSPDGVEPISPVSSPSLTHDKGLSKPLEELEKSHLEGELRHKQPGPMKLSAEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGIKGHQRVVTLAQHISEVITQDYTRHHPQQLSGPLPAPLYSFPGASCPVLDLRRPPSDLYLPPPDHGTPARGSPHSEGGKRSPEPSKTSVLGSSEDAIEPVSPPEGMTEPGHARSTAYPLLYRDGEQGEPRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINKKLNTHNRNEPEYNIGQPGTEIFNMPAITGAGLMTCRSQAVQEHASTNMGLEAIIRKALMGKYDQWEEPPPLGANAFNPLNASASLPAAAMPITTADGRSDHALTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEGDCNRRTPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLAAGSGPLAGPHHAWDEEPKPLLCSQYETLSDSE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MRQLAVIPPMLYDADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKNFGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4a69.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 408 408 ? A 40.624 19.761 12.694 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 2 C CA . LYS 408 408 ? A 40.111 19.868 11.272 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 3 C C . LYS 408 408 ? A 39.532 21.202 10.828 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 4 O O . LYS 408 408 ? A 39.840 21.656 9.738 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 5 C CB . LYS 408 408 ? A 39.097 18.744 10.894 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 6 C CG . LYS 408 408 ? A 39.160 18.377 9.388 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 7 C CD . LYS 408 408 ? A 38.084 17.367 8.931 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 8 C CE . LYS 408 408 ? A 38.561 16.247 7.989 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 9 N NZ . LYS 408 408 ? A 39.254 16.805 6.808 1 1 B LYS 0.420 1 ATOM 10 N N . PHE 409 409 ? A 38.658 21.849 11.631 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 11 C CA . PHE 409 409 ? A 38.270 23.227 11.367 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 12 C C . PHE 409 409 ? A 39.025 24.215 12.248 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 13 O O . PHE 409 409 ? A 39.146 25.395 11.918 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 14 C CB . PHE 409 409 ? A 36.752 23.405 11.611 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 15 C CG . PHE 409 409 ? A 35.920 22.471 10.772 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 16 C CD1 . PHE 409 409 ? A 36.110 22.390 9.385 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 17 C CD2 . PHE 409 409 ? A 34.894 21.703 11.351 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 18 C CE1 . PHE 409 409 ? A 35.305 21.564 8.596 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 19 C CE2 . PHE 409 409 ? A 34.090 20.868 10.564 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 20 C CZ . PHE 409 409 ? A 34.295 20.799 9.183 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 21 N N . ILE 410 410 ? A 39.596 23.747 13.375 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 22 C CA . ILE 410 410 ? A 40.549 24.484 14.168 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 23 C C . ILE 410 410 ? A 41.710 23.512 14.368 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 24 O O . ILE 410 410 ? A 41.487 22.302 14.572 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 25 C CB . ILE 410 410 ? A 39.982 25.025 15.492 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 26 C CG1 . ILE 410 410 ? A 38.638 25.771 15.274 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 27 C CG2 . ILE 410 410 ? A 41.033 25.948 16.144 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 28 C CD1 . ILE 410 410 ? A 37.972 26.298 16.552 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 29 N N . ASN 411 411 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.589 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 408 LYS 1 0.420 2 1 A 409 PHE 1 0.460 3 1 A 410 ILE 1 0.590 4 1 A 411 ASN 1 0.610 5 1 A 412 MET 1 0.550 6 1 A 413 ASN 1 0.630 7 1 A 414 GLY 1 0.580 8 1 A 415 LEU 1 0.610 9 1 A 416 MET 1 0.600 10 1 A 417 ASP 1 0.560 11 1 A 418 ASP 1 0.560 12 1 A 419 PRO 1 0.580 13 1 A 420 MET 1 0.630 14 1 A 421 LYS 1 0.620 15 1 A 422 VAL 1 0.650 16 1 A 423 TYR 1 0.670 17 1 A 424 LYS 1 0.620 18 1 A 425 ASP 1 0.600 19 1 A 426 ARG 1 0.590 20 1 A 427 GLN 1 0.580 21 1 A 428 VAL 1 0.390 22 1 A 429 THR 1 0.460 23 1 A 430 ASN 1 0.540 24 1 A 431 MET 1 0.500 25 1 A 432 TRP 1 0.480 26 1 A 433 SER 1 0.670 27 1 A 434 GLU 1 0.660 28 1 A 435 GLN 1 0.670 29 1 A 436 GLU 1 0.690 30 1 A 437 ARG 1 0.720 31 1 A 438 ASP 1 0.690 32 1 A 439 THR 1 0.710 33 1 A 440 PHE 1 0.700 34 1 A 441 ARG 1 0.710 35 1 A 442 GLU 1 0.670 36 1 A 443 LYS 1 0.640 37 1 A 444 PHE 1 0.610 38 1 A 445 MET 1 0.580 39 1 A 446 GLN 1 0.570 40 1 A 447 HIS 1 0.630 41 1 A 448 PRO 1 0.590 42 1 A 449 LYS 1 0.610 43 1 A 450 ASN 1 0.620 44 1 A 451 PHE 1 0.570 45 1 A 452 GLY 1 0.580 46 1 A 453 LEU 1 0.580 47 1 A 454 ILE 1 0.660 48 1 A 455 ALA 1 0.650 49 1 A 456 SER 1 0.590 50 1 A 457 PHE 1 0.530 51 1 A 458 LEU 1 0.590 52 1 A 459 GLU 1 0.480 53 1 A 460 ARG 1 0.460 54 1 A 461 LYS 1 0.590 55 1 A 462 THR 1 0.590 56 1 A 463 VAL 1 0.600 57 1 A 464 ALA 1 0.590 58 1 A 465 GLU 1 0.640 59 1 A 466 CYS 1 0.670 60 1 A 467 VAL 1 0.630 61 1 A 468 LEU 1 0.570 62 1 A 469 TYR 1 0.620 63 1 A 470 TYR 1 0.600 64 1 A 471 TYR 1 0.530 65 1 A 472 LEU 1 0.530 66 1 A 473 THR 1 0.590 67 1 A 474 LYS 1 0.550 68 1 A 475 LYS 1 0.400 69 1 A 476 ASN 1 0.440 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #