data_SMR-c0194241a488fd4300fb1f012d763429_3 _entry.id SMR-c0194241a488fd4300fb1f012d763429_3 _struct.entry_id SMR-c0194241a488fd4300fb1f012d763429_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9HCE0 (isoform 2)/ EPG5_HUMAN, Ectopic P granules protein 5 homolog Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9HCE0 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 326272.995 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP EPG5_HUMAN Q9HCE0 1 ;MAEAVKPQRRAKAKASRTKTKEKKKYETPQREESSEVSLPKTSREQEIPSLACEFKGDHLKVVTDSQLQD DASGQNESEMFDVPLTSLTISNEESLTCNTEPPKEGGEARPCVGDSAVTPKVHPGDNVGTKVETPKNFTE VEENMSVQGGLSESAPQSNFSYTQPAMENIQVRETQNSKEDKQGLVCSSEVPQNVGLQSSCPAKHGFQTP RVKKLYPQLPAEIAGEAPALVAVKPLLRSERLYPELPSQLELVPFTKEQLKILEPGSWLENVESYLEEFD SMAHQDRHEFYELLLNYSRCRKQLLLAEAELLTLTSDCQNAKSRLWQFKEEQMSVQGICADQVKVFSYHR YQRVEMNENALVELKKLFDAKSEHLHQTLALHSYTSVLSRLQVESYIYALLSSSAVLRSSAIHQQGRASK QTESIPSDLCQLKECISVLFMFTRRVNEDTQFHDDILLWLQKLVSVLQRVGCPGDHLFLLNHILRCPAGV SKWAVPFIQIKVLHNPSGVFHFMQSLALLMSPVKNRAEFMCHMKPSERKPSSSGPGSGTWTLVDEGGEED EDPETSWILLNEDDLVTILAQFPFHELFQHLLGFKAKGDYLPETTRPQEMMKIFAFANSLVELLAVGLET FNRARYRQFVKRIGYMIRMTLGYVSDHWAQYVSHNQGSGLAQQPYSMEKLQVEFDELFLRAVLHVLKAKR LGIWLFMSEMPFGTLSVQMLWKLFYLMHQVESENLQQLSSSLQPAQCKQQLQDPEHFTNFEKCLSSMNSS EEICLLTTFAQMAQARRTNVDEDFIKIIVLEIYEVSYVTLSTRETFSKVGRELLGTITAVHPEIISVLLD RVQETIDQVGMVSLYLFKELPLYLWQPSASEIAVIRDWLLNYNLTVVKNKLACVILEGLNWGFAKQATLH LDQAVHAEVALMVLEAYQKYLAQKPYAGILSESMKQVSYLASIVRYGETPETSFNQWAWNLILRLKLHKN DYGIQPNCPAVPFSVTVPDMTESPTFHPLLKAVKAGMPIGCYLALSMTAVGHSIEKFCAEGIPLLGILVQ SRHLRTVVHVLDKILPLFYPCQYYLLKNEQFLSHLLLFLHLDSGVPQGVTQQVTHKVAQHLTGASHGDNV KLLNSMIQAHISVSTQPNEVGPVAVLEFWVQALISQHLWYREQPILFLMDHLCKAAFQLMQEDCIQKLLY QQHKNALGYHCDRSLLSSLVSWIVAGNITPSFVEGLATPTQVWFAWTVLNMESIFEEDSQLRRVIEGELV INSAFTPDQALKKAQTQLKLPIVPSLQRLLIYRWAHQALVTPSDHPLLPLIWQKFFLLYLHRPGPQYGLP IDGCIGRRFFQSPAHINLLKEMKRRLTEVADFHHAASKALRVPAEGSEGLPESHSGTPGYLTSPELHKEL VRLFNVYILWLEDENFQKGDTYIPSLPKHYDIHRLAKVMQNQQDLWMEYLNMERIYHEFQETVGLWTQAK LESHSTPCSLSVQLDFTDPLLAKERVLSNLRKHEAPQPPLALHPTKPPVPVISSAVLLSQKDATQLVCTD LNLLQQQARTAALRESQQVALDGELLDTMPKQYVNREEQTTLHLECRGSSGKKCQGAAVVTVQFEGMHKN EAISQQLHVLRKEVKQLQAEAAKPPSLNIVEAAVHAENLITALVNAYKLQPTPGIQKVGISLFFTIVDYV SDETQRHPPTRQFFTSCIEILGQVFISGIKSECRKVLETILKNSRLCSLLSPFFTPNAAPAEFIQLYEQV VKFLSEDNSDMIFMLLTKFDLKQWLSATKPPLSDRTRLLESIHLALTAWGLEPDEDILMPFNLFCKHWTY LLLYQFPDQYSDILRLLMQSSAEQLLSPECWKATLRALGCCAPSCQQGAASTEGAVLPSSSDALLSDKQV METIQWLSDFFYKLRLSKMDFKSFGLFSKWSPYMADVKTFLGYLVKRLIDLEMTCLAQDPTASRKTVLKS LHSVIIQLFKPWILVLEDNESSQQRHYPWLESDTVVASSIVQLFTDCIDSLHESFKDKLLPGDAGALWLH LMHYCEACTAPKMPEFILYAFHSTYRKLPWKDLHPDQMLMEAFFKVERGSPKSCFLFLGSVLCEVNWVSV LSDAWNSSPHPETRSMIVCLLFMMILLAKEVQLVDQTDSPLLSLLGQTSSLSWHLVDIVSYQSVLSYFSS HYPPSIILAKESYAELIMKLLKVSAGLSIPTDSQKHLDAVPKCQAFTHQMVQFLSTLEQNGKITLAVLEQ EMSKLLDDIIVFNPPDMDSQTRHMALSSLFMEVLMMMNNATIPTAEFLRGSIRTWIGQKMHGLVVLPLLT AACQSLASVRHMAETTEACITAYFKESPLNQNSGWGPILVSLQVPELTMEEFLQECLTLGSYLTLYVYLL QCLNSEQTLRNEMKVLLILSKWLEQVYPSSVEEEAKLFLWWHQVLQLSLIQTEQNDSVLTESVIRILLLV QSRQNLVAEERLSSGILGAIGFGRKSPLSNR ; 'Ectopic P granules protein 5 homolog' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2481 1 2481 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . EPG5_HUMAN Q9HCE0 Q9HCE0-2 1 2481 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-10-02 6750A13A5CDBBBA3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 5 ;MAEAVKPQRRAKAKASRTKTKEKKKYETPQREESSEVSLPKTSREQEIPSLACEFKGDHLKVVTDSQLQD DASGQNESEMFDVPLTSLTISNEESLTCNTEPPKEGGEARPCVGDSAVTPKVHPGDNVGTKVETPKNFTE VEENMSVQGGLSESAPQSNFSYTQPAMENIQVRETQNSKEDKQGLVCSSEVPQNVGLQSSCPAKHGFQTP RVKKLYPQLPAEIAGEAPALVAVKPLLRSERLYPELPSQLELVPFTKEQLKILEPGSWLENVESYLEEFD SMAHQDRHEFYELLLNYSRCRKQLLLAEAELLTLTSDCQNAKSRLWQFKEEQMSVQGICADQVKVFSYHR YQRVEMNENALVELKKLFDAKSEHLHQTLALHSYTSVLSRLQVESYIYALLSSSAVLRSSAIHQQGRASK QTESIPSDLCQLKECISVLFMFTRRVNEDTQFHDDILLWLQKLVSVLQRVGCPGDHLFLLNHILRCPAGV SKWAVPFIQIKVLHNPSGVFHFMQSLALLMSPVKNRAEFMCHMKPSERKPSSSGPGSGTWTLVDEGGEED EDPETSWILLNEDDLVTILAQFPFHELFQHLLGFKAKGDYLPETTRPQEMMKIFAFANSLVELLAVGLET 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A 1 2481 ARG 2481 ? ? ? 5 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'IL4I1 protein {PDB ID=7vop, label_asym_id=FA, auth_asym_id=f, SMTL ID=7vop.1.5}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7vop, label_asym_id=FA' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A FA 15 1 f # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD ; ;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 356 396 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7vop 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2481 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2481 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 410.000 17.073 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAEAVKPQRRAKAKASRTKTKEKKKYETPQREESSEVSLPKTSREQEIPSLACEFKGDHLKVVTDSQLQDDASGQNESEMFDVPLTSLTISNEESLTCNTEPPKEGGEARPCVGDSAVTPKVHPGDNVGTKVETPKNFTEVEENMSVQGGLSESAPQSNFSYTQPAMENIQVRETQNSKEDKQGLVCSSEVPQNVGLQSSCPAKHGFQTPRVKKLYPQLPAEIAGEAPALVAVKPLLRSERLYPELPSQLELVPFTKEQLKILEPGSWLENVESYLEEFDSMAHQDRHEFYELLLNYSRCRKQLLLAEAELLTLTSDCQNAKSRLWQFKEEQMSVQGICADQVKVFSYHRYQRVEMNENALVELKKLFDAKSEHLHQTLALHSYTSVLSRLQVESYIYALLSSSAVLRSSAIHQQGRASKQTESIPSDLCQLKECISVLFMFTRRVNEDTQFHDDILLWLQKLVSVLQRVGCPGDHLFLLNHILRCPAGVSKWAVPFIQIKVLHNPSGVFHFMQSLALLMSPVKNRAEFMCHMKPSERKPSSSGPGSGTWTLVDEGGEEDEDPETSWILLNEDDLVTILAQFPFHELFQHLLGFKAKGDYLPETTRPQEMMKIFAFANSLVELLAVGLETFNRARYRQFVKRIGYMIRMTLGYVSDHWAQYVSHNQGSGLAQQPYSMEKLQVEFDELFLRAVLHVLKAKRLGIWLFMSEMPFGTLSVQMLWKLFYLMHQVESENLQQLSSSLQPAQCKQQLQDPEHFTNFEKCLSSMNSSEEICLLTTFAQMAQARRTNVDEDFIKIIVLEIYEVSYVTLSTRETFSKVGRELLGTITAVHPEIISVLLDRVQETIDQVGMVSLYLFKELPLYLWQPSASEIAVIRDWLLNYNLTVVKNKLACVILEGLNWGFAKQATLHLDQAVHAEVALMVLEAYQKYLAQKPYAGILSESMKQVSYLASIVRYGETPETSFNQWAWNLILRLKLHKNDYGIQPNCPAVPFSVTVPDMTESPTFHPLLKAVKAGMPIGCYLALSMTAVGHSIEKFCAEGIPLLGILVQSRHLRTVVHVLDKILPLFYPCQYYLLKNEQFLSHLLLFLHLDSGVPQGVTQQVTHKVAQHLTGASHGDNVKLLNSMIQAHISVSTQPNEVGPVAVLEFWVQALISQHLWYREQPILFLMDHLCKAAFQLMQEDCIQKLLYQQHKNALGYHCDRSLLSSLVSWIVAGNITPSFVEGLATPTQVWFAWTVLNMESIFEEDSQLRRVIEGELVINSAFTPDQALKKAQTQLKLPIVPSLQRLLIYRWAHQALVTPSDHPLLPLIWQKFFLLYLHRPGPQYGLPIDGCIGRRFFQSPAHINLLKEMKRRLTEVADFHHAASKALRVPAEGSEGLPESHSGTPGYLTSPELHKELVRLFNVYILWLEDENFQKGDTYIPSLPKHYDIHRLAKVMQNQQDLWMEYLNMERIYHEFQETVGLWTQAKLESHSTPCSLSVQLDFTDPLLAKERVLSNLRKHEAPQPPLALHPTKPPVPVISSAVLLSQKDATQLVCTDLNLLQQQARTAALRESQQVALDGELLDTMPKQYVNREEQTTLHLECRGSSGKKCQGAAVVTVQFEGMHKNEAISQQLHVLRKEVKQLQAEAAKPPSLNIVEAAVHAENLITALVNAYKLQPTPGIQKVGISLFFTIVDYVSDETQRHPPTRQFFTSCIEILGQVFISGIKSECRKVLETILKNSRLCSLLSPFFTPNAAPAEFIQLYEQVVKFLSEDNSDMIFMLLTKFDLKQWLSATKPPLSDRTRLLESIHLALTAWGLEPDEDILMPFNLFCKHWTYLLLYQFPDQYSDILRLLMQSSAEQLLSPECWKATLRALGCCAPSCQQGAASTEGAVLPSSSDALLSDKQVMETIQWLSDFFYKLRLSKMDFKSFGLFSKWSPYMADVKTFLGYLVKRLIDLEMTCLAQDPTASRKTVLKSLHSVIIQLFKPWILVLEDNESSQQRHYPWLESDTVVASSIVQLFTDCIDSLHESFKDKLLPGDAGALWLHLMHYCEACTAPKMPEFILYAFHSTYRKLPWKDLHPDQMLMEAFFKVERGSPKSCFLFLGSVLCEVNWVSVLSDAWNSSPHPETRSMIVCLLFMMILLAKEVQLVDQTDSPLLSLLGQTSSLSWHLVDIVSYQSVLSYFSSHYPPSIILAKESYAELIMKLLKVSAGLSIPTDSQKHLDAVPKCQAFTHQMVQFLSTLEQNGKITLAVLEQEMSKLLDDIIVFNPPDMDSQTRHMALSSLFMEVLMMMNNATIPTAEFLRGSIRTWIGQKMHGLVVLPLLTAACQSLASVRHMAETTEACITAYFKESPLNQNSGWGPILVSLQVPELTMEEFLQECLTLGSYLTLYVYLLQCLNSEQTLRNEMKVLLILSKWLEQVYPSSVEEEAKLFLWWHQVLQLSLIQTEQNDSVLTESVIRILLLVQSRQNLVAEERLSSGILGAIGFGRKSPLSNR 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGER---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7vop.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 1531 1531 ? A 214.299 514.873 410.990 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 2 C CA . LYS 1531 1531 ? A 213.668 513.942 411.985 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 3 C C . LYS 1531 1531 ? A 212.345 514.444 412.527 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 4 O O . LYS 1531 1531 ? A 211.349 513.734 412.409 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 5 C CB . LYS 1531 1531 ? A 214.677 513.578 413.102 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 6 C CG . LYS 1531 1531 ? A 215.858 512.722 412.604 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 7 C CD . LYS 1531 1531 ? A 216.856 512.390 413.729 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 8 C CE . LYS 1531 1531 ? A 218.046 511.545 413.254 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 9 N NZ . LYS 1531 1531 ? A 219.000 511.317 414.364 1 1 5 LYS 0.380 1 ATOM 10 N N . ASP 1532 1532 ? A 212.270 515.683 413.049 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 11 C CA . ASP 1532 1532 ? A 211.040 516.277 413.563 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 12 C C . ASP 1532 1532 ? A 209.913 516.334 412.547 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 13 O O . ASP 1532 1532 ? A 208.791 515.917 412.822 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 14 C CB . ASP 1532 1532 ? A 211.374 517.699 414.060 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 15 C CG . ASP 1532 1532 ? A 212.368 517.626 415.216 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 16 O OD1 . ASP 1532 1532 ? A 212.662 516.495 415.686 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 17 O OD2 . ASP 1532 1532 ? A 212.910 518.699 415.557 1 1 5 ASP 0.410 1 ATOM 18 N N . ALA 1533 1533 ? A 210.218 516.756 411.301 1 1 5 ALA 0.530 1 ATOM 19 C CA . ALA 1533 1533 ? A 209.263 516.731 410.208 1 1 5 ALA 0.530 1 ATOM 20 C C . ALA 1533 1533 ? A 208.727 515.329 409.922 1 1 5 ALA 0.530 1 ATOM 21 O O . ALA 1533 1533 ? A 207.522 515.125 409.833 1 1 5 ALA 0.530 1 ATOM 22 C CB . ALA 1533 1533 ? A 209.898 517.318 408.929 1 1 5 ALA 0.530 1 ATOM 23 N N . THR 1534 1534 ? A 209.613 514.310 409.865 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 24 C CA . THR 1534 1534 ? A 209.245 512.903 409.699 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 25 C C . THR 1534 1534 ? A 208.351 512.403 410.816 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 26 O O . THR 1534 1534 ? A 207.323 511.778 410.572 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 27 C CB . THR 1534 1534 ? A 210.465 511.977 409.656 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 28 O OG1 . THR 1534 1534 ? A 211.415 512.395 408.682 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 29 C CG2 . THR 1534 1534 ? A 210.068 510.530 409.315 1 1 5 THR 0.500 1 ATOM 30 N N . GLN 1535 1535 ? A 208.695 512.711 412.083 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 31 C CA . GLN 1535 1535 ? A 207.880 512.362 413.233 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 32 C C . GLN 1535 1535 ? A 206.502 513.011 413.225 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 33 O O . GLN 1535 1535 ? A 205.501 512.345 413.484 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 34 C CB . GLN 1535 1535 ? A 208.598 512.716 414.559 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 35 C CG . GLN 1535 1535 ? A 207.850 512.252 415.834 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 36 C CD . GLN 1535 1535 ? A 207.719 510.729 415.868 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 37 O OE1 . GLN 1535 1535 ? A 208.713 510.015 416.000 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 38 N NE2 . GLN 1535 1535 ? A 206.482 510.195 415.736 1 1 5 GLN 0.530 1 ATOM 39 N N . LEU 1536 1536 ? A 206.413 514.316 412.888 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 40 C CA . LEU 1536 1536 ? A 205.151 515.023 412.722 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 41 C C . LEU 1536 1536 ? A 204.283 514.419 411.634 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 42 O O . LEU 1536 1536 ? A 203.125 514.089 411.881 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 43 C CB . LEU 1536 1536 ? A 205.394 516.522 412.415 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 44 C CG . LEU 1536 1536 ? A 205.877 517.341 413.628 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 45 C CD1 . LEU 1536 1536 ? A 206.395 518.715 413.178 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 46 C CD2 . LEU 1536 1536 ? A 204.758 517.506 414.667 1 1 5 LEU 0.540 1 ATOM 47 N N . VAL 1537 1537 ? A 204.853 514.149 410.439 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 48 C CA . VAL 1537 1537 ? A 204.134 513.506 409.343 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 49 C C . VAL 1537 1537 ? A 203.613 512.128 409.739 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 50 O O . VAL 1537 1537 ? A 202.445 511.807 409.530 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 51 C CB . VAL 1537 1537 ? A 204.997 513.409 408.080 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 52 C CG1 . VAL 1537 1537 ? A 204.297 512.607 406.963 1 1 5 VAL 0.610 1 ATOM 53 C CG2 . VAL 1537 1537 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.586 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1531 LYS 1 0.380 2 1 A 1532 ASP 1 0.410 3 1 A 1533 ALA 1 0.530 4 1 A 1534 THR 1 0.500 5 1 A 1535 GLN 1 0.530 6 1 A 1536 LEU 1 0.540 7 1 A 1537 VAL 1 0.610 8 1 A 1538 CYS 1 0.580 9 1 A 1539 THR 1 0.610 10 1 A 1540 ASP 1 0.610 11 1 A 1541 LEU 1 0.610 12 1 A 1542 ASN 1 0.640 13 1 A 1543 LEU 1 0.630 14 1 A 1544 LEU 1 0.630 15 1 A 1545 GLN 1 0.660 16 1 A 1546 GLN 1 0.670 17 1 A 1547 GLN 1 0.670 18 1 A 1548 ALA 1 0.740 19 1 A 1549 ARG 1 0.620 20 1 A 1550 THR 1 0.680 21 1 A 1551 ALA 1 0.740 22 1 A 1552 ALA 1 0.730 23 1 A 1553 LEU 1 0.630 24 1 A 1554 ARG 1 0.590 25 1 A 1555 GLU 1 0.630 26 1 A 1556 SER 1 0.640 27 1 A 1557 GLN 1 0.620 28 1 A 1558 GLN 1 0.620 29 1 A 1559 VAL 1 0.620 30 1 A 1560 ALA 1 0.660 31 1 A 1561 LEU 1 0.580 32 1 A 1562 ASP 1 0.560 33 1 A 1563 GLY 1 0.610 34 1 A 1564 GLU 1 0.560 35 1 A 1565 LEU 1 0.540 36 1 A 1566 LEU 1 0.510 37 1 A 1567 ASP 1 0.520 38 1 A 1568 THR 1 0.510 39 1 A 1569 MET 1 0.460 40 1 A 1570 PRO 1 0.440 41 1 A 1571 LYS 1 0.410 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #