data_SMR-6d8d705b90c6a4dcf7f33125d0ddae7c_5 _entry.id SMR-6d8d705b90c6a4dcf7f33125d0ddae7c_5 _struct.entry_id SMR-6d8d705b90c6a4dcf7f33125d0ddae7c_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6IMT1/ SAB_ARATH, Protein SABRE Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6IMT1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 340210.343 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SAB_ARATH Q6IMT1 1 ;MAASPAKFFFGFLIVSIVLWMIFMLFAWMLSRVLGASVVFRVGGWKCLKDVVVKFKKGAIESVSASEIKL SLRQSLVKLGVGFLSRDPKVQVLISDLEVVMRSSTSTTNLQKAKSHKPRTSGRGKWMVVANVARFLSVSV ADMVVKTTKVIVEVKELKLDINKDGGTKPNLYVKLNVLPILVHLCESRIISDQSSNVSFECCPASQASSA SPDRSAATLFCDELSLSSEFGHDRAVGIVVRNVEVTSGDVILNFDEDSFPKSKQSSASLRSDEVRTSATA ASSAKKPHKEHQLVAALAKYSSSFPEKVSFSLPKLDVRCVNREHDLLAENNITGIQLRSVKSKSFEDTGE STRLDVQMELSEIHVFREADSSILEIMKVDVVSFIYIPVQPVLPIRAEVDIKLGGTRCNLFISRLQPWLR LHFLKKKKLVLQEKTHNLEKTKAADMKAIMWTGTVSAPEMTVMLYGTEDIPLYHFCSQSSHVFANNVSSL GTAVHVELGELNLHLADEYQECFREHLFGIEPNSGSLMHIAKVSLDWGRRDRTSSDEVGFRSKLVLSVDV TGMGIYFSFKRVQSLIINALSFKALFKTLSVTGKKMNKTVSVQPSKGSGKGTRLVNINLERCCVNFCDDT GLDNTVIDDPKSVNYGSQGGRVSFSSLADGTPRTASILSTAPEACKRLKYSVSLEISQFSFCLNKDKLST QMELGRAKSIYQEYLEEHTPCSNVILFDMHNAKLVRRSGGLNEIDVCSLFSATHISLGWEPDVHLSFYEL FLRLRSLVYAQRHKEPESGCNKGISSVKDGGPSEKINQSNSVNKQKKKESMFAIDVETLTISAEVGDGVE VKLEAQSIFSENACIGVLLEGLMLAFNGSRVFKTTRMQVSRIPTATNLSDAVPVMTDGPWDWVVQGLDVH ICMPYKLQLRAIDDSIEEMLRGLKLISVAKGKHILSGKRESSKPKKSSPKFGRIKFCIRRLTADIEEEPI QGWLDEHYQLVKKEACELAVRLKFLEDLIHKAGQSPKGAETSAVLDERKMFFDGVEIDVEDPVAINKVKE EIHKRSFQSYYQACQGLAPSEGSGACREGFQAGFKPSAARTSLLSVCATDFDLSLTAVHGGDAGLIEVLK KLDPICEENDIPFSRLYGSNVYLNTGSLVVQLRNYTLPLLSGTSGKCEGRIVLAQQATCFQPQISQDVFV GRWRKVKMFRSASGTTPPLKTYSDLRIHFEQGEVSFGVGYEPAFADISYAFTVALRRANLSHRNPDMVQV IKKERSLPWWDDMRNYVHGNITLSFSESKWSVLATTDPYESLDQLQIVSGPIELKQSDGRVFVSAKDFKI KLSSLESLISRHSLKVPVRASGAAFIEAPDFNLEVTMDWDCESGNSLNHYLYAFPAEGKPREKVFDPFRS TSLSLRWNFSLRPEKFHQSPSSTEHPTDVGTVYSSQDKPDSIPLASPTMNLGAHDLAWILKFWGLNYYPP HKLRSFSRWPRFGVPRAARSGNLSLDKVMTEFMLRVDATPSLIKYMPWDSDDPAKGLTFNMAKLKYELCY SRGKQKYTFECKRDALDLVYQGLDLHVPKAFINKDEHPCIPGSVQVLRKSTQDALIDRVPSGKDHKRYEK HRDEGFLLSSDYFTIRRQAPKADPERLLAWQEAGRRNLEMTYVRSEFENGSESDEHIRSDPSDDDGYNVV IADNCQRVFVYGLKLLWTIENRDAVWSFVGGISKAFEPPKPSPSRQYTQRKIHEENQKESCPETHQGEMS RSSASPGRNLPSSPSHSIKIEKSDDIGTVETIESEEEGTRHFMVNVIEPQFNLHSEEANGRFLLAAVSGR VLARSFHSIMRVGVEVIEQALGTGSVKIPECSPEMTWTRMEVSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPKI RRNSPKVKRTGALLERVFMPCDMYFRYTRHKGGTPDLKVKPLKELTFNSHNIIATMTSRQFQVMLDVLTN LLFARLPKPRKSSLQCPTEDEDVEEEADEVVPYGVEEVELAKINLEEKERERKLLLDDIRKLSPCSDNMD DTHIEREGELWMISTRRSILVQGLKKELTYAQKSRKAASASLRMALQKAAQLRIMEKEKNKSPSYAMCIS LQINKVVWSMLVDGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDIGVARFTTKYFVVRNCLPNAKSDMLLSAWNPPPEW GKKVMLRVDAKQGAPKDAHYPLELFHVEIYPLRIHLTETMYRMMWEYFFPEEEQDSQSRQEVWKISTTAG SKRVKKGLVGHESSGHAIKDVEASRMSSSALSASAAVQSQSNDDSVQKSNVICLRSSTGASAQELRRTSS FDREENVAEPIANELVLQAHSCNVSSSIEQQEDFSKQKVKEIKPVKSGRSSHEEKKAGKSHEEKKSRPRK MMEFHNIKISQVELLVTYEGSRFVVNDLKLLMDTFHRVEFTGTWRRLFSRVKKHIIWGVLKSVTGMQGKK FKDKSHNNRESTDNDLNLSDNDQTGKPDQQQVTWFKRQSDGAGDGFVTSIRGLFNTQRRKAKAFVLRTMR GEAENDFHGDWSDSDVEFSPFARQLTITKAKRLIRRHTKKFRPRSQRGSTSQQRESLPSSPIETTPFESG YSSGSSPYEDFRE ; 'Protein SABRE' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2603 1 2603 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SAB_ARATH Q6IMT1 . 1 2603 3702 'Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)' 2004-07-05 509E210A22858ACF # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MAASPAKFFFGFLIVSIVLWMIFMLFAWMLSRVLGASVVFRVGGWKCLKDVVVKFKKGAIESVSASEIKL SLRQSLVKLGVGFLSRDPKVQVLISDLEVVMRSSTSTTNLQKAKSHKPRTSGRGKWMVVANVARFLSVSV ADMVVKTTKVIVEVKELKLDINKDGGTKPNLYVKLNVLPILVHLCESRIISDQSSNVSFECCPASQASSA SPDRSAATLFCDELSLSSEFGHDRAVGIVVRNVEVTSGDVILNFDEDSFPKSKQSSASLRSDEVRTSATA ASSAKKPHKEHQLVAALAKYSSSFPEKVSFSLPKLDVRCVNREHDLLAENNITGIQLRSVKSKSFEDTGE STRLDVQMELSEIHVFREADSSILEIMKVDVVSFIYIPVQPVLPIRAEVDIKLGGTRCNLFISRLQPWLR LHFLKKKKLVLQEKTHNLEKTKAADMKAIMWTGTVSAPEMTVMLYGTEDIPLYHFCSQSSHVFANNVSSL GTAVHVELGELNLHLADEYQECFREHLFGIEPNSGSLMHIAKVSLDWGRRDRTSSDEVGFRSKLVLSVDV TGMGIYFSFKRVQSLIINALSFKALFKTLSVTGKKMNKTVSVQPSKGSGKGTRLVNINLERCCVNFCDDT 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Pre-mRNA-splicing regulator WTAP {PDB ID=7vf5, label_asym_id=B, auth_asym_id=C, SMTL ID=7vf5.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7vf5, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MTNEEPLPKKVRLSETDFKVMARDELILRWKQYEAYVQALEGKYTDLNSNDVTGLRESEEKLKQQQQESA RRENILVMRLATKEQEMQECTTQIQYLKQVQQPSVAQLRSTMVDPAINLFFLKMKGELEQTKDKLEQAQN ELSAWKFTPDSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQ LDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTASEPVEQSEATSKDCSRLTNGPSNG SSSRQRTSGSGFHREGNTTEDDFPSSPGNGNKSSNSSEERTGRGGSGYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLT HQSNDTDSSHDPQEEKAVSGKGNRTVGSRHVQNGLDSSVNVQGSVL ; ;MTNEEPLPKKVRLSETDFKVMARDELILRWKQYEAYVQALEGKYTDLNSNDVTGLRESEEKLKQQQQESA RRENILVMRLATKEQEMQECTTQIQYLKQVQQPSVAQLRSTMVDPAINLFFLKMKGELEQTKDKLEQAQN ELSAWKFTPDSQTGKKLMAKCRMLIQENQELGRQLSQGRIAQLEAELALQKKYSEELKSSQDELNDFIIQ LDEEVEGMQSTILVLQQQLKETRQQLAQYQQQQSQASAPSTSRTTASEPVEQSEATSKDCSRLTNGPSNG SSSRQRTSGSGFHREGNTTEDDFPSSPGNGNKSSNSSEERTGRGGSGYVNQLSAGYESVDSPTGSENSLT HQSNDTDSSHDPQEEKAVSGKGNRTVGSRHVQNGLDSSVNVQGSVL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 78 143 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7vf5 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2603 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2603 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 600.000 18.182 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAASPAKFFFGFLIVSIVLWMIFMLFAWMLSRVLGASVVFRVGGWKCLKDVVVKFKKGAIESVSASEIKLSLRQSLVKLGVGFLSRDPKVQVLISDLEVVMRSSTSTTNLQKAKSHKPRTSGRGKWMVVANVARFLSVSVADMVVKTTKVIVEVKELKLDINKDGGTKPNLYVKLNVLPILVHLCESRIISDQSSNVSFECCPASQASSASPDRSAATLFCDELSLSSEFGHDRAVGIVVRNVEVTSGDVILNFDEDSFPKSKQSSASLRSDEVRTSATAASSAKKPHKEHQLVAALAKYSSSFPEKVSFSLPKLDVRCVNREHDLLAENNITGIQLRSVKSKSFEDTGESTRLDVQMELSEIHVFREADSSILEIMKVDVVSFIYIPVQPVLPIRAEVDIKLGGTRCNLFISRLQPWLRLHFLKKKKLVLQEKTHNLEKTKAADMKAIMWTGTVSAPEMTVMLYGTEDIPLYHFCSQSSHVFANNVSSLGTAVHVELGELNLHLADEYQECFREHLFGIEPNSGSLMHIAKVSLDWGRRDRTSSDEVGFRSKLVLSVDVTGMGIYFSFKRVQSLIINALSFKALFKTLSVTGKKMNKTVSVQPSKGSGKGTRLVNINLERCCVNFCDDTGLDNTVIDDPKSVNYGSQGGRVSFSSLADGTPRTASILSTAPEACKRLKYSVSLEISQFSFCLNKDKLSTQMELGRAKSIYQEYLEEHTPCSNVILFDMHNAKLVRRSGGLNEIDVCSLFSATHISLGWEPDVHLSFYELFLRLRSLVYAQRHKEPESGCNKGISSVKDGGPSEKINQSNSVNKQKKKESMFAIDVETLTISAEVGDGVEVKLEAQSIFSENACIGVLLEGLMLAFNGSRVFKTTRMQVSRIPTATNLSDAVPVMTDGPWDWVVQGLDVHICMPYKLQLRAIDDSIEEMLRGLKLISVAKGKHILSGKRESSKPKKSSPKFGRIKFCIRRLTADIEEEPIQGWLDEHYQLVKKEACELAVRLKFLEDLIHKAGQSPKGAETSAVLDERKMFFDGVEIDVEDPVAINKVKEEIHKRSFQSYYQACQGLAPSEGSGACREGFQAGFKPSAARTSLLSVCATDFDLSLTAVHGGDAGLIEVLKKLDPICEENDIPFSRLYGSNVYLNTGSLVVQLRNYTLPLLSGTSGKCEGRIVLAQQATCFQPQISQDVFVGRWRKVKMFRSASGTTPPLKTYSDLRIHFEQGEVSFGVGYEPAFADISYAFTVALRRANLSHRNPDMVQVIKKERSLPWWDDMRNYVHGNITLSFSESKWSVLATTDPYESLDQLQIVSGPIELKQSDGRVFVSAKDFKIKLSSLESLISRHSLKVPVRASGAAFIEAPDFNLEVTMDWDCESGNSLNHYLYAFPAEGKPREKVFDPFRSTSLSLRWNFSLRPEKFHQSPSSTEHPTDVGTVYSSQDKPDSIPLASPTMNLGAHDLAWILKFWGLNYYPPHKLRSFSRWPRFGVPRAARSGNLSLDKVMTEFMLRVDATPSLIKYMPWDSDDPAKGLTFNMAKLKYELCYSRGKQKYTFECKRDALDLVYQGLDLHVPKAFINKDEHPCIPGSVQVLRKSTQDALIDRVPSGKDHKRYEKHRDEGFLLSSDYFTIRRQAPKADPERLLAWQEAGRRNLEMTYVRSEFENGSESDEHIRSDPSDDDGYNVVIADNCQRVFVYGLKLLWTIENRDAVWSFVGGISKAFEPPKPSPSRQYTQRKIHEENQKESCPETHQGEMSRSSASPGRNLPSSPSHSIKIEKSDDIGTVETIESEEEGTRHFMVNVIEPQFNLHSEEANGRFLLAAVSGRVLARSFHSIMRVGVEVIEQALGTGSVKIPECSPEMTWTRMEVSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPKIRRNSPKVKRTGALLERVFMPCDMYFRYTRHKGGTPDLKVKPLKELTFNSHNIIATMTSRQFQVMLDVLTNLLFARLPKPRKSSLQCPTEDEDVEEEADEVVPYGVEEVELAKINLEEKERERKLLLDDIRKLSPCSDNMDDTHIEREGELWMISTRRSILVQGLKKELTYAQKSRKAASASLRMALQKAAQLRIMEKEKNKSPSYAMCISLQINKVVWSMLVDGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDIGVARFTTKYFVVRNCLPNAKSDMLLSAWNPPPEWGKKVMLRVDAKQGAPKDAHYPLELFHVEIYPLRIHLTETMYRMMWEYFFPEEEQDSQSRQEVWKISTTAGSKRVKKGLVGHESSGHAIKDVEASRMSSSALSASAAVQSQSNDDSVQKSNVICLRSSTGASAQELRRTSSFDREENVAEPIANELVLQAHSCNVSSSIEQQEDFSKQKVKEIKPVKSGRSSHEEKKAGKSHEEKKSRPRKMMEFHNIKISQVELLVTYEGSRFVVNDLKLLMDTFHRVEFTGTWRRLFSRVKKHIIWGVLKSVTGMQGKKFKDKSHNNRESTDNDLNLSDNDQTGKPDQQQVTWFKRQSDGAGDGFVTSIRGLFNTQRRKAKAFVLRTMRGEAENDFHGDWSDSDVEFSPFARQLTITKAKRLIRRHTKKFRPRSQRGSTSQQRESLPSSPIETTPFESGYSSGSSPYEDFRE 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MRLATKEQEMQECTTQIQYLKQVQQPSVAQ-L----RSTMVDPAINLFFLKMKGELEQTKDKLEQAQNELS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.051}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7vf5.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ILE 2003 2003 ? A 157.988 165.923 153.837 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 2 C CA . ILE 2003 2003 ? A 156.557 166.017 153.354 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 3 C C . ILE 2003 2003 ? A 156.445 166.538 151.931 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 4 O O . ILE 2003 2003 ? A 156.061 165.804 151.050 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 5 C CB . ILE 2003 2003 ? A 155.684 166.815 154.322 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 6 C CG1 . ILE 2003 2003 ? A 155.701 166.132 155.710 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 7 C CG2 . ILE 2003 2003 ? A 154.228 166.932 153.792 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 8 C CD1 . ILE 2003 2003 ? A 155.101 166.993 156.823 1 1 B ILE 0.340 1 ATOM 9 N N . ASN 2004 2004 ? A 156.844 167.804 151.629 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 10 C CA . ASN 2004 2004 ? A 156.737 168.349 150.277 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 11 C C . ASN 2004 2004 ? A 157.397 167.486 149.196 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 12 O O . ASN 2004 2004 ? A 156.816 167.208 148.170 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 13 C CB . ASN 2004 2004 ? A 157.358 169.774 150.183 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 14 C CG . ASN 2004 2004 ? A 156.489 170.750 150.979 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 15 O OD1 . ASN 2004 2004 ? A 155.360 170.438 151.307 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 16 N ND2 . ASN 2004 2004 ? A 157.025 171.953 151.309 1 1 B ASN 0.350 1 ATOM 17 N N . LEU 2005 2005 ? A 158.623 166.997 149.465 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 18 C CA . LEU 2005 2005 ? A 159.343 166.065 148.622 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 19 C C . LEU 2005 2005 ? A 158.624 164.725 148.383 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 20 O O . LEU 2005 2005 ? A 158.610 164.224 147.273 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 21 C CB . LEU 2005 2005 ? A 160.790 165.909 149.155 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 22 C CG . LEU 2005 2005 ? A 161.828 165.403 148.130 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 23 C CD1 . LEU 2005 2005 ? A 163.219 165.962 148.466 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 24 C CD2 . LEU 2005 2005 ? A 161.907 163.874 148.010 1 1 B LEU 0.450 1 ATOM 25 N N . GLU 2006 2006 ? A 157.945 164.153 149.407 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 26 C CA . GLU 2006 2006 ? A 157.134 162.946 149.298 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 27 C C . GLU 2006 2006 ? A 155.949 163.114 148.347 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 28 O O . GLU 2006 2006 ? A 155.702 162.283 147.478 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 29 C CB . GLU 2006 2006 ? A 156.656 162.516 150.703 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 30 C CG . GLU 2006 2006 ? A 157.812 162.062 151.629 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 31 C CD . GLU 2006 2006 ? A 157.407 161.910 153.095 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 32 O OE1 . GLU 2006 2006 ? A 156.341 162.459 153.494 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 33 O OE2 . GLU 2006 2006 ? A 158.244 161.376 153.859 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 34 N N . GLU 2007 2007 ? A 155.238 164.260 148.432 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 35 C CA . GLU 2007 2007 ? A 154.242 164.656 147.447 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 36 C C . GLU 2007 2007 ? A 154.809 164.848 146.034 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 37 O O . GLU 2007 2007 ? A 154.217 164.442 145.044 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 38 C CB . GLU 2007 2007 ? A 153.415 165.883 147.920 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 39 C CG . GLU 2007 2007 ? A 152.538 165.621 149.183 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 40 C CD . GLU 2007 2007 ? A 151.724 164.337 149.099 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 41 O OE1 . GLU 2007 2007 ? A 151.142 164.093 148.013 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 42 O OE2 . GLU 2007 2007 ? A 151.646 163.547 150.076 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 43 N N . LYS 2008 2008 ? A 156.028 165.419 145.899 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 44 C CA . LYS 2008 2008 ? A 156.738 165.469 144.621 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 45 C C . LYS 2008 2008 ? A 157.096 164.102 144.024 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 46 O O . LYS 2008 2008 ? A 156.961 163.887 142.825 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 47 C CB . LYS 2008 2008 ? A 158.015 166.343 144.693 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 48 C CG . LYS 2008 2008 ? A 157.779 167.814 145.087 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 49 C CD . LYS 2008 2008 ? A 156.773 168.575 144.198 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 50 C CE . LYS 2008 2008 ? A 156.265 169.899 144.772 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 51 N NZ . LYS 2008 2008 ? A 157.429 170.731 145.124 1 1 B LYS 0.570 1 ATOM 52 N N . GLU 2009 2009 ? A 157.541 163.131 144.851 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 53 C CA . GLU 2009 2009 ? A 157.711 161.730 144.473 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 54 C C . GLU 2009 2009 ? A 156.383 161.084 144.063 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 55 O O . GLU 2009 2009 ? A 156.307 160.351 143.085 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 56 C CB . GLU 2009 2009 ? A 158.455 160.923 145.569 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 57 C CG . GLU 2009 2009 ? A 158.670 159.395 145.305 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 58 C CD . GLU 2009 2009 ? A 159.448 158.974 144.054 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 59 O OE1 . GLU 2009 2009 ? A 160.554 159.514 143.774 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 60 O OE2 . GLU 2009 2009 ? A 158.965 158.059 143.338 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 61 N N . ARG 2010 2010 ? A 155.257 161.399 144.744 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 62 C CA . ARG 2010 2010 ? A 153.934 160.970 144.305 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 63 C C . ARG 2010 2010 ? A 153.540 161.471 142.906 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 64 O O . ARG 2010 2010 ? A 153.027 160.718 142.081 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 65 C CB . ARG 2010 2010 ? A 152.849 161.437 145.304 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 66 C CG . ARG 2010 2010 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.507 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2003 ILE 1 0.340 2 1 A 2004 ASN 1 0.350 3 1 A 2005 LEU 1 0.450 4 1 A 2006 GLU 1 0.480 5 1 A 2007 GLU 1 0.520 6 1 A 2008 LYS 1 0.570 7 1 A 2009 GLU 1 0.580 8 1 A 2010 ARG 1 0.520 9 1 A 2011 GLU 1 0.600 10 1 A 2012 ARG 1 0.550 11 1 A 2013 LYS 1 0.610 12 1 A 2014 LEU 1 0.610 13 1 A 2015 LEU 1 0.610 14 1 A 2016 LEU 1 0.610 15 1 A 2017 ASP 1 0.610 16 1 A 2018 ASP 1 0.600 17 1 A 2019 ILE 1 0.550 18 1 A 2020 ARG 1 0.480 19 1 A 2021 LYS 1 0.550 20 1 A 2022 LEU 1 0.450 21 1 A 2023 SER 1 0.440 22 1 A 2024 PRO 1 0.430 23 1 A 2025 CYS 1 0.370 24 1 A 2026 SER 1 0.380 25 1 A 2027 ASP 1 0.350 26 1 A 2028 ASN 1 0.420 27 1 A 2029 MET 1 0.420 28 1 A 2030 ASP 1 0.490 29 1 A 2031 ASP 1 0.470 30 1 A 2032 THR 1 0.520 31 1 A 2033 HIS 1 0.440 32 1 A 2034 ILE 1 0.330 33 1 A 2035 GLU 1 0.430 34 1 A 2036 ARG 1 0.420 35 1 A 2037 GLU 1 0.450 36 1 A 2038 GLY 1 0.500 37 1 A 2039 GLU 1 0.510 38 1 A 2040 LEU 1 0.480 39 1 A 2041 TRP 1 0.320 40 1 A 2042 MET 1 0.390 41 1 A 2043 ILE 1 0.480 42 1 A 2044 SER 1 0.490 43 1 A 2045 THR 1 0.580 44 1 A 2046 ARG 1 0.470 45 1 A 2047 ARG 1 0.410 46 1 A 2048 SER 1 0.490 47 1 A 2049 ILE 1 0.530 48 1 A 2050 LEU 1 0.520 49 1 A 2051 VAL 1 0.650 50 1 A 2052 GLN 1 0.580 51 1 A 2053 GLY 1 0.620 52 1 A 2054 LEU 1 0.580 53 1 A 2055 LYS 1 0.620 54 1 A 2056 LYS 1 0.610 55 1 A 2057 GLU 1 0.590 56 1 A 2058 LEU 1 0.620 57 1 A 2059 THR 1 0.650 58 1 A 2060 TYR 1 0.630 59 1 A 2061 ALA 1 0.680 60 1 A 2062 GLN 1 0.610 61 1 A 2063 LYS 1 0.600 62 1 A 2064 SER 1 0.570 63 1 A 2065 ARG 1 0.550 64 1 A 2066 LYS 1 0.590 65 1 A 2067 ALA 1 0.590 66 1 A 2068 ALA 1 0.570 67 1 A 2069 SER 1 0.490 68 1 A 2070 ALA 1 0.490 69 1 A 2071 SER 1 0.410 70 1 A 2072 LEU 1 0.310 71 1 A 2073 ARG 1 0.220 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #