data_SMR-3fddf00b6e440678da30b55d4417587b_1 _entry.id SMR-3fddf00b6e440678da30b55d4417587b_1 _struct.entry_id SMR-3fddf00b6e440678da30b55d4417587b_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q06179/ FMP27_YEAST, Protein FMP27, mitochondrial Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q06179' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 351207.652 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP FMP27_YEAST Q06179 1 ;MMFPINVLLYKWLIFAVTFLWSCKILLRKLLGINITWINLFKLEICGLSLEDGTVRLKSVRFAVFERKLF IKGLRIDSKKSSTNDLHKELPREEERTFIETPEDNGGGFISKILSLSQYWLNGVTIILEDTQLVNNDITI EKFGFFLSIDNSKHIKSLRFDSFLRKLLWNGQTIIADAIFIVNTNLLIGEIMNPLKDGLQVGLDLKLGDL NIPMNLLNLFINKENVDLMSNEKLLQRLADTTKANEELKDEDIAKMKDDLVYAMEKFVDRIKPLKEMNVT VDKLQIKDFPLTNHPELLGMNKYISYNVLVSNINFNTNRFRNEMPGYTLIFEERDSPFKFSIIMARFNIY LNLNRKHQSHAKQLKIIEIPNVSIFGETNLFSQKFRLSNNLHAKELENAIFNIKGNISSLTIDMDPVNIS FIKCFLSNIKVFTSSCPKNKILKENSHVKFLTRRRVLFDYFKCFLPLINMKFTLDDPKFVINDKDDLIIG KFSVFMISHHSKRYTLGNNLMEEKEETQHIFYESHWNVELLDMKLQHIIKHQKYEHTILRVDSIAIEEKV QLLPDILCSANADIDTLMLDLSELPTMVMLSELVHNLDSQLANVEENYFKEFYEKFASNLQNMKAECSNM AKCLRQKEILPSDFMFQQLPDFFDYIKINIRDISSTLGARSVFMPRDVFSSVDSQSSKDLIDGKLRKYCN TVEKLQIALFGDKTQWHNKIGSNHATMVRSGQLTNFSKDNKQNPNHKSSIADLDDISTSDATEVNHLWNI NLLVNDITTSIIGETPEVSEELSTKTVSKVSNLSIKLFPDTESFSSNESDSKIILQINHSRGTSVVSLMS IFLAVSGIHTLNQIFGHCIHQKMRQSKTKQYFLALSESKKKSCIKSIKWGQLKELLEINFSSEYISQIIA LPNGLRTKFEPTSTFITVKNCNTISVSGQYFRMMVESPTQPNFWERMICINGFKVMIHIDLLKQQMKKLN SLQNWEKLPSAITLENDSWHFSIPHHFEMFKIIDSIPTIFKSIKQMLYSLKTSKDDLIIFPHKIETPLSL PKIKLKSKRWLFSISDDPLEAELNTIFQIGLQEQRERLAKLQEFNKRISEDLIKSQKNAKEMKDDFEAID NAILKHRTGLWAKDGKKRLRKSATDSEIPLTPAALNINGKRDDRPDRTQFISPEIENAYNTLLANFSDSW IKRVKEYKVKERREFDKNFSFLWGFIDYTKLPKDINKKVLPFSTNPFLMNLIIENIDIDIIRPSCGIENI PNFIHDVGKGVPKNTEYSIMIPMHLDAKFSEVRWHLRDYPLPFVSIPPLSSTQSKETIPMRIYGDFMITE DMLQSDRELRTLFVPLIPSVTVENTDRYYSLFVPRTMTSAKIFTDLNFEINSNHTTRVTWGGSYQPAIQQ TMQCLDNFSKPPLDPSVKLGFWDKTRYLFHGKINIVWKKRGKFEISLKGAKSPYMLGGESAGFIVGFDGN VNLKCNEDNDPKKFLSCSADKVHFSIPNYFAKPLLVWSRPSTNTMFIPNQDDTNMQRYASFYYLLNTTSS KNEKADKEIMGKSFIEKTGIKLSGGMTLDMGILFERLGPSLNERTFESKKHYLTRLCNPIYVQDLSKHDS YAGFRSDFIHMSFGLSSNSNSAYNAMQLSPNGFKAFFVWWKSFSGNFPVRRGPLFGLQSISPKFGEHLYT ISYHADVSPLFINYMYHNADADQILRKNYLEVAEFAGLKAKSSHFIMDLHQRKEVLTEYQAGLNVRRRVM KLKFLAGDVVCQDVDIRTVSGEFSKLNYIEEKEDAEYDIFDNDMSWLDITDFQDAFFINPDNYLPKIKIM PFAFSPQFAYQKRASYGDKYQVDPKTCKPITPFDNRVSHGCTLGHNVSLRTDLVEKRVTVLKKFREKLQE GIRKNKSAGVSEENLNDLLSKANSSVENAELLLKDFQKIFKQHEAGQTEQPFHFDSLNLLKNTKKTLKQF EHRFFIFNVLLKWNEDARSAIFKFFYYANLSNEFASLASGKGLREFEDVIKQREMTDDTTSMEAIPEGTD KANTTKQCHSCDDTEFTTENLLNIFEKNITQLSCDIKNKIHHKFFVQFITPQIQLTSLENPEACVLVSSP FFMLKTLEFDANTTSNTYMQDIFLKRHGILFGNANAFLFNKKDYQEFFELYFGSSSYGQDKKEQWPPWLG LELGFEPSALKKKAVVRNISALLHHQKLAPFSAKYDSLKDKIEDNICGYVPQVNVQVNSDEYLMLTKMAL KLFLYVEPEDEELKKYIEKLIIGYDIYDTAQTRKFVNDLHDSEQILAVVEKELLFKRSLLDDIGKLDLSN IHNERMHQLLRLYILRKVFTSNGNNYINRTLVWNIKVNETILHLLDKIDKPFLDIAVAKLNFQRIQHTMG LRKNTVTVKMMQIFDLGENVNYHCILGPLITSSGNDTVGLASDVPLVQITWDVDKPVGGIKVVKNVETTL SSLTIKLEEDRLNKLFEWLSLKELIYDGNGDDDDGASSIFDMVSSESEEGKIEFSEDISSDFNEMLKRSS DYMIVEDLKLNSFKLCISYKGKGKMRLANVTNFVFNFPTLRLSNQTLRVTDLLLALKKVLIKVLIKHTGR FIGNKLKRNSKENKIADDTSPLKQLTTYNSYTEPEELR ; 'Protein FMP27, mitochondrial' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2628 1 2628 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . FMP27_YEAST Q06179 . 1 2628 559292 "Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)" 1996-11-01 82B0F6296B59E34E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no F ;MMFPINVLLYKWLIFAVTFLWSCKILLRKLLGINITWINLFKLEICGLSLEDGTVRLKSVRFAVFERKLF IKGLRIDSKKSSTNDLHKELPREEERTFIETPEDNGGGFISKILSLSQYWLNGVTIILEDTQLVNNDITI EKFGFFLSIDNSKHIKSLRFDSFLRKLLWNGQTIIADAIFIVNTNLLIGEIMNPLKDGLQVGLDLKLGDL NIPMNLLNLFINKENVDLMSNEKLLQRLADTTKANEELKDEDIAKMKDDLVYAMEKFVDRIKPLKEMNVT VDKLQIKDFPLTNHPELLGMNKYISYNVLVSNINFNTNRFRNEMPGYTLIFEERDSPFKFSIIMARFNIY LNLNRKHQSHAKQLKIIEIPNVSIFGETNLFSQKFRLSNNLHAKELENAIFNIKGNISSLTIDMDPVNIS FIKCFLSNIKVFTSSCPKNKILKENSHVKFLTRRRVLFDYFKCFLPLINMKFTLDDPKFVINDKDDLIIG KFSVFMISHHSKRYTLGNNLMEEKEETQHIFYESHWNVELLDMKLQHIIKHQKYEHTILRVDSIAIEEKV 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A 1 2561 ARG 2561 ? ? ? F . A 1 2562 LEU 2562 ? ? ? F . A 1 2563 SER 2563 ? ? ? F . A 1 2564 ASN 2564 ? ? ? F . A 1 2565 GLN 2565 ? ? ? F . A 1 2566 THR 2566 ? ? ? F . A 1 2567 LEU 2567 ? ? ? F . A 1 2568 ARG 2568 ? ? ? F . A 1 2569 VAL 2569 ? ? ? F . A 1 2570 THR 2570 ? ? ? F . A 1 2571 ASP 2571 ? ? ? F . A 1 2572 LEU 2572 ? ? ? F . A 1 2573 LEU 2573 ? ? ? F . A 1 2574 LEU 2574 ? ? ? F . A 1 2575 ALA 2575 ? ? ? F . A 1 2576 LEU 2576 ? ? ? F . A 1 2577 LYS 2577 ? ? ? F . A 1 2578 LYS 2578 ? ? ? F . A 1 2579 VAL 2579 ? ? ? F . A 1 2580 LEU 2580 ? ? ? F . A 1 2581 ILE 2581 ? ? ? F . A 1 2582 LYS 2582 ? ? ? F . A 1 2583 VAL 2583 ? ? ? F . A 1 2584 LEU 2584 ? ? ? F . A 1 2585 ILE 2585 ? ? ? F . A 1 2586 LYS 2586 ? ? ? F . A 1 2587 HIS 2587 ? ? ? F . A 1 2588 THR 2588 ? ? ? F . A 1 2589 GLY 2589 ? ? ? F . A 1 2590 ARG 2590 ? ? ? F . A 1 2591 PHE 2591 ? ? ? F . A 1 2592 ILE 2592 ? ? ? F . A 1 2593 GLY 2593 ? ? ? F . A 1 2594 ASN 2594 ? ? ? F . A 1 2595 LYS 2595 ? ? ? F . A 1 2596 LEU 2596 ? ? ? F . A 1 2597 LYS 2597 ? ? ? F . A 1 2598 ARG 2598 ? ? ? F . A 1 2599 ASN 2599 ? ? ? F . A 1 2600 SER 2600 ? ? ? F . A 1 2601 LYS 2601 ? ? ? F . A 1 2602 GLU 2602 ? ? ? F . A 1 2603 ASN 2603 ? ? ? F . A 1 2604 LYS 2604 ? ? ? F . A 1 2605 ILE 2605 ? ? ? F . A 1 2606 ALA 2606 ? ? ? F . A 1 2607 ASP 2607 ? ? ? F . A 1 2608 ASP 2608 ? ? ? F . A 1 2609 THR 2609 ? ? ? F . A 1 2610 SER 2610 ? ? ? F . A 1 2611 PRO 2611 ? ? ? F . A 1 2612 LEU 2612 ? ? ? F . A 1 2613 LYS 2613 ? ? ? F . A 1 2614 GLN 2614 ? ? ? F . A 1 2615 LEU 2615 ? ? ? F . A 1 2616 THR 2616 ? ? ? F . A 1 2617 THR 2617 ? ? ? F . A 1 2618 TYR 2618 ? ? ? F . A 1 2619 ASN 2619 ? ? ? F . A 1 2620 SER 2620 ? ? ? F . A 1 2621 TYR 2621 ? ? ? F . A 1 2622 THR 2622 ? ? ? F . A 1 2623 GLU 2623 ? ? ? F . A 1 2624 PRO 2624 ? ? ? F . A 1 2625 GLU 2625 ? ? ? F . A 1 2626 GLU 2626 ? ? ? F . A 1 2627 LEU 2627 ? ? ? F . A 1 2628 ARG 2628 ? ? ? F . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9 {PDB ID=8t1i, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=8t1i.1.F}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8t1i, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 6 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MASSGVAGGRQAEDTLQPPPELLPESKPPPPPQPLPVAALPPPAAPRPQSPAGAKEENYSFLPLVHNVIK CMDKDSPDLHQDLNALKTKFQELRKLIGTMPGIHVSPEQQQQQLHSLREQVRTKNELLQKYKSLCMFEIP KD ; ;MASSGVAGGRQAEDTLQPPPELLPESKPPPPPQPLPVAALPPPAAPRPQSPAGAKEENYSFLPLVHNVIK CMDKDSPDLHQDLNALKTKFQELRKLIGTMPGIHVSPEQQQQQLHSLREQVRTKNELLQKYKSLCMFEIP KD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 80 133 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8t1i 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2628 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2628 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 120.000 20.370 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMFPINVLLYKWLIFAVTFLWSCKILLRKLLGINITWINLFKLEICGLSLEDGTVRLKSVRFAVFERKLFIKGLRIDSKKSSTNDLHKELPREEERTFIETPEDNGGGFISKILSLSQYWLNGVTIILEDTQLVNNDITIEKFGFFLSIDNSKHIKSLRFDSFLRKLLWNGQTIIADAIFIVNTNLLIGEIMNPLKDGLQVGLDLKLGDLNIPMNLLNLFINKENVDLMSNEKLLQRLADTTKANEELKDEDIAKMKDDLVYAMEKFVDRIKPLKEMNVTVDKLQIKDFPLTNHPELLGMNKYISYNVLVSNINFNTNRFRNEMPGYTLIFEERDSPFKFSIIMARFNIYLNLNRKHQSHAKQLKIIEIPNVSIFGETNLFSQKFRLSNNLHAKELENAIFNIKGNISSLTIDMDPVNISFIKCFLSNIKVFTSSCPKNKILKENSHVKFLTRRRVLFDYFKCFLPLINMKFTLDDPKFVINDKDDLIIGKFSVFMISHHSKRYTLGNNLMEEKEETQHIFYESHWNVELLDMKLQHIIKHQKYEHTILRVDSIAIEEKVQLLPDILCSANADIDTLMLDLSELPTMVMLSELVHNLDSQLANVEENYFKEFYEKFASNLQNMKAECSNMAKCLRQKEILPSDFMFQQLPDFFDYIKINIRDISSTLGARSVFMPRDVFSSVDSQSSKDLIDGKLRKYCNTVEKLQIALFGDKTQWHNKIGSNHATMVRSGQLTNFSKDNKQNPNHKSSIADLDDISTSDATEVNHLWNINLLVNDITTSIIGETPEVSEELSTKTVSKVSNLSIKLFPDTESFSSNESDSKIILQINHSRGTSVVSLMSIFLAVSGIHTLNQIFGHCIHQKMRQSKTKQYFLALSESKKKSCIKSIKWGQLKELLEINFSSEYISQIIALPNGLRTKFEPTSTFITVKNCNTISVSGQYFRMMVESPTQPNFWERMICINGFKVMIHIDLLKQQMKKLNSLQNWEKLPSAITLENDSWHFSIPHHFEMFKIIDSIPTIFKSIKQMLYSLKTSKDDLIIFPHKIETPLSLPKIKLKSKRWLFSISDDPLEAELNTIFQIGLQEQRERLAKLQEFNKRISEDLIKSQKNAKEMKDDFEAIDNAILKHRTGLWAKDGKKRLRKSATDSEIPLTPAALNINGKRDDRPDRTQFISPEIENAYNTLLANFSDSWIKRVKEYKVKERREFDKNFSFLWGFIDYTKLPKDINKKVLPFSTNPFLMNLIIENIDIDIIRPSCGIENIPNFIHDVGKGVPKNTEYSIMIPMHLDAKFSEVRWHLRDYPLPFVSIPPLSSTQSKETIPMRIYGDFMITEDMLQSDRELRTLFVPLIPSVTVENTDRYYSLFVPRTMTSAKIFTDLNFEINSNHTTRVTWGGSYQPAIQQTMQCLDNFSKPPLDPSVKLGFWDKTRYLFHGKINIVWKKRGKFEISLKGAKSPYMLGGESAGFIVGFDGNVNLKCNEDNDPKKFLSCSADKVHFSIPNYFAKPLLVWSRPSTNTMFIPNQDDTNMQRYASFYYLLNTTSSKNEKADKEIMGKSFIEKTGIKLSGGMTLDMGILFERLGPSLNERTFESKKHYLTRLCNPIYVQDLSKHDSYAGFRSDFIHMSFGLSSNSNSAYNAMQLSPNGFKAFFVWWKSFSGNFPVRRGPLFGLQSISPKFGEHLYTISYHADVSPLFINYMYHNADADQILRKNYLEVAEFAGLKAKSSHFIMDLHQRKEVLTEYQAGLNVRRRVMKLKFLAGDVVCQDVDIRTVSGEFSKLNYIEEKEDAEYDIFDNDMSWLDITDFQDAFFINPDNYLPKIKIMPFAFSPQFAYQKRASYGDKYQVDPKTCKPITPFDNRVSHGCTLGHNVSLRTDLVEKRVTVLKKFREKLQEGIRKNKSAGVSEENLNDLLSKANSSVENAELLLKDFQKIFKQHEAGQTEQPFHFDSLNLLKNTKKTLKQFEHRFFIFNVLLKWNEDARSAIFKFFYYANLSNEFASLASGKGLREFEDVIKQREMTDDTTSMEAIPEGTDKANTTKQCHSCDDTEFTTENLLNIFEKNITQLSCDIKNKIHHKFFVQFITPQIQLTSLENPEACVLVSSPFFMLKTLEFDANTTSNTYMQDIFLKRHGILFGNANAFLFNKKDYQEFFELYFGSSSYGQDKKEQWPPWLGLELGFEPSALKKKAVVRNISALLHHQKLAPFSAKYDSLKDKIEDNICGYVPQVNVQVNSDEYLMLTKMALKLFLYVEPEDEELKKYIEKLIIGYDIYDTAQTRKFVNDLHDSEQILAVVEKELLFKRSLLDDIGKLDLSNIHNERMHQLLRLYILRKVFTSNGNNYINRTLVWNIKVNETILHLLDKIDKPFLDIAVAKLNFQRIQHTMGLRKNTVTVKMMQIFDLGENVNYHCILGPLITSSGNDTVGLASDVPLVQITWDVDKPVGGIKVVKNVETTLSSLTIKLEEDRLNKLFEWLSLKELIYDGNGDDDDGASSIFDMVSSESEEGKIEFSEDISSDFNEMLKRSSDYMIVEDLKLNSFKLCISYKGKGKMRLANVTNFVFNFPTLRLSNQTLRVTDLLLALKKVLIKVLIKHTGRFIGNKLKRNSKENKIADDTSPLKQLTTYNSYTEPEELR 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HQDLNALKTKFQELRKLIGTMPGIHVSPEQQQQQLHSLREQVRTKNELLQKYKS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8t1i.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 328.715 386.571 377.697 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 15 C CG . ARG 1877 1877 ? A 330.025 387.284 378.090 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 16 C CD . ARG 1877 1877 ? A 329.915 388.186 379.326 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 17 N NE . ARG 1877 1877 ? A 329.605 387.296 380.492 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 18 C CZ . ARG 1877 1877 ? A 329.267 387.749 381.708 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 19 N NH1 . ARG 1877 1877 ? A 329.174 389.052 381.956 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 20 N NH2 . ARG 1877 1877 ? A 329.023 386.894 382.698 1 1 F ARG 0.490 1 ATOM 21 N N . VAL 1878 1878 ? A 327.269 384.418 375.035 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 22 C CA . VAL 1878 1878 ? A 326.020 383.729 374.692 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 23 C C . VAL 1878 1878 ? A 325.837 382.466 375.512 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 24 O O . VAL 1878 1878 ? A 324.766 382.227 376.066 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 25 C CB . VAL 1878 1878 ? A 325.934 383.397 373.198 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 26 C CG1 . VAL 1878 1878 ? A 324.702 382.524 372.862 1 1 F VAL 0.540 1 ATOM 27 C CG2 . VAL 1878 1878 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.599 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1876 LYS 1 0.310 2 1 A 1877 ARG 1 0.490 3 1 A 1878 VAL 1 0.540 4 1 A 1879 THR 1 0.580 5 1 A 1880 VAL 1 0.590 6 1 A 1881 LEU 1 0.640 7 1 A 1882 LYS 1 0.630 8 1 A 1883 LYS 1 0.670 9 1 A 1884 PHE 1 0.640 10 1 A 1885 ARG 1 0.640 11 1 A 1886 GLU 1 0.660 12 1 A 1887 LYS 1 0.660 13 1 A 1888 LEU 1 0.720 14 1 A 1889 GLN 1 0.680 15 1 A 1890 GLU 1 0.660 16 1 A 1891 GLY 1 0.690 17 1 A 1892 ILE 1 0.720 18 1 A 1893 ARG 1 0.600 19 1 A 1894 LYS 1 0.620 20 1 A 1895 ASN 1 0.580 21 1 A 1896 LYS 1 0.600 22 1 A 1897 SER 1 0.540 23 1 A 1898 ALA 1 0.580 24 1 A 1899 GLY 1 0.570 25 1 A 1900 VAL 1 0.660 26 1 A 1901 SER 1 0.620 27 1 A 1902 GLU 1 0.580 28 1 A 1903 GLU 1 0.610 29 1 A 1904 ASN 1 0.630 30 1 A 1905 LEU 1 0.660 31 1 A 1906 ASN 1 0.600 32 1 A 1907 ASP 1 0.610 33 1 A 1908 LEU 1 0.650 34 1 A 1909 LEU 1 0.640 35 1 A 1910 SER 1 0.620 36 1 A 1911 LYS 1 0.590 37 1 A 1912 ALA 1 0.640 38 1 A 1913 ASN 1 0.580 39 1 A 1914 SER 1 0.610 40 1 A 1915 SER 1 0.620 41 1 A 1916 VAL 1 0.630 42 1 A 1917 GLU 1 0.610 43 1 A 1918 ASN 1 0.620 44 1 A 1919 ALA 1 0.700 45 1 A 1920 GLU 1 0.630 46 1 A 1921 LEU 1 0.650 47 1 A 1922 LEU 1 0.600 48 1 A 1923 LEU 1 0.550 49 1 A 1924 LYS 1 0.560 50 1 A 1925 ASP 1 0.480 51 1 A 1926 PHE 1 0.450 52 1 A 1927 GLN 1 0.430 53 1 A 1928 LYS 1 0.310 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #