data_SMR-e3d4048fe81610e3b3cdcd0e82675c05_1 _entry.id SMR-e3d4048fe81610e3b3cdcd0e82675c05_1 _struct.entry_id SMR-e3d4048fe81610e3b3cdcd0e82675c05_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9QYX7/ PCLO_MOUSE, Protein piccolo Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9QYX7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CA non-polymer 'CALCIUM ION' Ca 40.078 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 642808.063 1 . 2 non-polymer man 'CALCIUM ION' 40.078 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PCLO_MOUSE Q9QYX7 1 ;MGNEASLEGEGLPEGLAAAAGGAGGSGSALHPGIPAGMEADLSQLSEEERRQIAAVMSRAQGLPKGSVPA AAAESPSMHRKQELDSSQAPQQPGKPPDPGRPPQHGLSKSRTTDTFRSEQKLPGRSPSTISLKESKSRTD FKEEYKSSMMPGFFSDVNPLSAVSSVVNKFNPFDLISDSEAVQEETTKKQKVAQKDQGKSEGITKPSLQQ PSPKLIPKQQGPGKEVIPQDIPSKSVSSQQAEKTKPQAPGTAKPSQQSPAQTPAQQAKPVAQQPGPAKAT VQQPGPAKSPAQPAGTGKSPAQPPVTAKPPAQQAGLEKTSLQQPGPKSLAQTPGQGKVPPGPAKSPAQQP GTAKLPAQQPGPQTAAKVPGPTKTPAQLSGPGKTPAQQPGPTKPSPQQPIPAKPQPQQPVATKPQPQQPA PAKPQPQHPTPAKPQPQHPTPAKPQPQQPTPAKPQPQQPTPAKPQPQQPTPAKPQPQHPTPAKPQPQQPG LGKPSAQQPSKSISQTVTGRPLQAPPTSAAQAPAQGLSKTICPLCNTTELLLHTPEKANFNTCTECQSTV CSLCGFNPNPHLTEIKEWLCLNCQMQRALGGELAAIPSSPQPTPKAASVQPATASKSPVPSQQASPKKEL PSKQDSPKAPESKKPPPLVKQPTLHGPTPATAPQPPVAEALPKPAPPKKPSAALPEQAKAPVADVEPKQP KTTETLTDSPSSAAATSKPAILSSQVQAQAQVTTAPPLKTDSAKTSQSFPPTGDTITPLDSKAMPRPASD SKIVSHPGPTSESKDPVQKKEEPKKAQTKVTPKPDTKPVPKGSPTPSGTRPTTGQATPQSQQPPKPPEQS RRFSLNLGGIADAPKSQPTTPQETVTGKLFGFGASIFSQASNLISTAGQQAPHPQTGPAAPSKQAPPPSQ TLAAQGPPKSTGPHPSAPAKTTAVKKETKGPAAENLEAKPVQAPTVKKAEKDKKPPPGKVSKPPPTEPEK AVLAQKPDKTTKPKPACPLCRTELNVGSQDPPNFNTCTECKNQVCNLCGFNPTPHLTEIQEWLCLNCQTQ RAISGQLGDMDKMPPASSGPKASPVPAPAEPPPQKTPTAAHAKGKKKETEVKAETEKQIPEKETPSIEKT 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RRGTESLDHLAGLSHYYHADTSYRHFPKSEKYSISRLTLEKQAAKQLPAAILYQKQSKHKKALIDPKMSK FSPIQESRDLEPDYPTYLSSSTSSIGGISSRARLLQDDITFGLRKNITDQQKFMGSSLGSGLGTLGNTIR SALQDEADKPYSSGSRSRPSSRPSSVYGLDLSIKRDSSSSSLRLKAQEAEALDVSFGHSSSSARTKPTSL PISQSRGRIPIVAQNSEEESPLSPVGQPMGMARAAAGPLPPISADTRDQFGSSHSLPEVQQHMREESRTR GYDRDIAFIMDDFQHAMSDSEAYHLRREETDWFDKPRESRLENGHGLDRKLPERLVHSRPLSQHQEQILQ MNGKTMHYIFPHARIKITRDSKDHTVSGNGLGIRIVGGKEIPGHSGEIGAYIAKILPGGSAEHSGKLIEG MQVLEWNGIPLTSKTYEEVQSIINQQSGEAEICVRLDLNMLSDSENPQHLELHEPPKVVDKAKSPGVDPK QLAAELQKVSLQQSPLVMSSVVEKGAHAHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKHGGSKPTDVSKTASH PITGEIQLQINYDLGNLIIHILQARNLVPRDNNGYSDPFVKVYLLPGRGQVMVVQNASVEYKRRTKYVQK SLNPEWNQTVIYKSISMEQLMKKTLEVTVWDYDRFSSNDFLGEVLIDLSSTSHLDNTPRWYPLKEQTESI EHGKSHSSQNSQQSPKPSVIKSRSHGIFPDPSKDMQVPTIEKSHSSPGSSKSSSEGHLRSHGPSRSQSKT SVAQTHLEDAGAAIAAAEAAVQQLRIQPTKPTNHRPAETSVSTGSSGSSVGSGYSVDSEGSSCVAGEPNL LPIPRIGKMGQNGQDPVKQPGMGAADTEAKTQVMGEIKLALKKEMKTDGEQLIVEILQCRNITYKFKSPD HLPDLYVKIYVINIATQKKVIKKKTRVCRHDREPSFNETFRFSLSPAGHSLQILLFSNGGKFMKKTLIGE ACIWLDKVDLRKRIVNWHKLLMSPTQTH ; 'Protein piccolo' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 5068 1 5068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA 1 6 6 CA '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rabphilin-3A {PDB ID=5low, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5low.1.B}' 'template structure' . 2 'CALCIUM ION {PDB ID=5low, label_asym_id=T, auth_asym_id=B, SMTL ID=5low.1._.6}' 'template structure' . 3 . target . 4 'CALCIUM ION' target . 5 'Target-template alignment by BLAST to 5low, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B T 5 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;HMASMTGGQQMGRGSDFGDIEERGKILVSLMYSTQQGGLIVGIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPDM GKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIKHSDLAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHW YECLKNKDKKIERWHQLQNENH ; ;HMASMTGGQQMGRGSDFGDIEERGKILVSLMYSTQQGGLIVGIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPDM GKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIKHSDLAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHW YECLKNKDKKIERWHQLQNENH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 24 152 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 CA 'CALCIUM ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5low 2024-01-10 2 PDB . 5low 2024-01-10 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 5068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 5071 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.12e-17 40.476 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 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2 1 2 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----------------------------------------------------------------------- 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_atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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VAL 4662 4662 ? A -5.373 20.142 3.477 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 310 C C . VAL 4662 4662 ? A -4.825 19.372 2.274 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 311 O O . VAL 4662 4662 ? A -5.576 18.924 1.405 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 312 C CB . VAL 4662 4662 ? A -5.741 19.158 4.593 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 313 C CG1 . VAL 4662 4662 ? A -6.077 19.911 5.893 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 314 C CG2 . VAL 4662 4662 ? A -6.949 18.298 4.201 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 315 N N . TYR 4663 4663 ? A -3.480 19.253 2.173 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 316 C CA . TYR 4663 4663 ? A -2.803 18.642 1.043 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 317 C C . TYR 4663 4663 ? A -1.524 17.898 1.493 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 318 O O . TYR 4663 4663 ? A -0.558 18.496 1.948 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 319 C CB . TYR 4663 4663 ? A -2.482 19.804 0.057 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 320 C CG . TYR 4663 4663 ? A -2.231 19.416 -1.367 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 321 C CD1 . TYR 4663 4663 ? A -3.030 18.479 -2.036 1 1 B TYR 0.680 1 ATOM 322 C CD2 . TYR 4663 4663 ? 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LEU 4665 4665 ? A 2.341 16.435 -0.695 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 337 C C . LEU 4665 4665 ? A 3.563 15.512 -0.697 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 338 O O . LEU 4665 4665 ? A 4.130 15.208 0.351 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 339 C CB . LEU 4665 4665 ? A 2.619 17.873 -1.264 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 340 C CG . LEU 4665 4665 ? A 3.628 18.797 -0.582 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 341 C CD1 . LEU 4665 4665 ? A 5.080 18.520 -1.002 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 342 C CD2 . LEU 4665 4665 ? A 3.305 20.265 -0.864 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 343 N N . PRO 4666 4666 ? A 4.025 14.974 -1.856 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 344 C CA . PRO 4666 4666 ? A 3.563 15.267 -3.229 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 345 C C . PRO 4666 4666 ? A 2.916 14.082 -3.947 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 346 O O . PRO 4666 4666 ? A 1.887 14.249 -4.601 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 347 C CB . PRO 4666 4666 ? A 4.877 15.657 -3.930 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 348 C CG . PRO 4666 4666 ? A 5.944 14.762 -3.279 1 1 B PRO 0.590 1 ATOM 349 C CD . PRO 4666 4666 ? 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MET 4672 4672 ? A -5.144 9.195 -5.493 1 1 B MET 0.210 1 ATOM 391 S SD . MET 4672 4672 ? A -5.592 7.622 -4.709 1 1 B MET 0.210 1 ATOM 392 C CE . MET 4672 4672 ? A -3.958 6.820 -4.748 1 1 B MET 0.210 1 ATOM 393 N N . VAL 4673 4673 ? A -4.764 9.489 -10.119 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 394 C CA . VAL 4673 4673 ? A -5.104 9.574 -11.540 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 395 C C . VAL 4673 4673 ? A -4.466 8.456 -12.368 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 396 O O . VAL 4673 4673 ? A -5.126 7.804 -13.173 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 397 C CB . VAL 4673 4673 ? A -4.725 10.944 -12.108 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 398 C CG1 . VAL 4673 4673 ? A -4.962 11.019 -13.631 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 399 C CG2 . VAL 4673 4673 ? A -5.570 12.032 -11.414 1 1 B VAL 0.190 1 ATOM 400 N N . VAL 4674 4674 ? A -3.170 8.158 -12.146 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 401 C CA . VAL 4674 4674 ? A -2.441 7.081 -12.809 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 402 C C . VAL 4674 4674 ? A -3.019 5.693 -12.526 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 403 O O . VAL 4674 4674 ? A -3.054 4.824 -13.394 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 404 C CB . VAL 4674 4674 ? A -0.960 7.149 -12.430 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 405 C CG1 . VAL 4674 4674 ? A -0.159 5.938 -12.944 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 406 C CG2 . VAL 4674 4674 ? A -0.341 8.428 -13.031 1 1 B VAL 0.150 1 ATOM 407 N N . GLN 4675 4675 ? A -3.506 5.442 -11.296 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 408 C CA . GLN 4675 4675 ? A -4.035 4.146 -10.907 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 409 C C . GLN 4675 4675 ? A -5.547 4.028 -11.095 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 410 O O . GLN 4675 4675 ? A -6.144 3.027 -10.704 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 411 C CB . GLN 4675 4675 ? A -3.699 3.863 -9.420 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 412 C CG . GLN 4675 4675 ? A -2.184 3.808 -9.096 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 413 C CD . GLN 4675 4675 ? A -1.461 2.681 -9.832 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 414 O OE1 . GLN 4675 4675 ? A -1.818 1.508 -9.743 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 415 N NE2 . GLN 4675 4675 ? A -0.376 3.031 -10.561 1 1 B GLN 0.220 1 ATOM 416 N N . ASN 4676 4676 ? 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SER 4678 4678 ? A -10.375 9.089 -6.806 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 431 C C . SER 4678 4678 ? A -9.217 9.937 -6.317 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 432 O O . SER 4678 4678 ? A -8.323 9.440 -5.639 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 433 C CB . SER 4678 4678 ? A -11.438 9.034 -5.678 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 434 O OG . SER 4678 4678 ? A -11.971 10.325 -5.372 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 435 N N . VAL 4679 4679 ? A -9.183 11.254 -6.611 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 436 C CA . VAL 4679 4679 ? A -8.145 12.112 -6.064 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 437 C C . VAL 4679 4679 ? A -8.384 12.335 -4.574 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 438 O O . VAL 4679 4679 ? A -9.023 13.279 -4.107 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 439 C CB . VAL 4679 4679 ? A -7.955 13.422 -6.820 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 440 C CG1 . VAL 4679 4679 ? A -6.800 14.256 -6.221 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 441 C CG2 . VAL 4679 4679 ? A -7.623 13.103 -8.291 1 1 B VAL 0.240 1 ATOM 442 N N . GLU 4680 4680 ? A -7.810 11.438 -3.750 1 1 B GLU 0.450 1 ATOM 443 C CA . GLU 4680 4680 ? 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TYR 4681 4681 ? A -2.340 14.578 -1.948 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 458 C CD2 . TYR 4681 4681 ? A -2.416 15.335 -4.248 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 459 C CE1 . TYR 4681 4681 ? A -1.164 15.299 -1.797 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 460 C CE2 . TYR 4681 4681 ? A -1.162 15.912 -4.121 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 461 C CZ . TYR 4681 4681 ? A -0.580 15.944 -2.879 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 462 O OH . TYR 4681 4681 ? A 0.200 17.070 -2.751 1 1 B TYR 0.500 1 ATOM 463 N N . LYS 4682 4682 ? A -6.600 16.022 -1.949 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 464 C CA . LYS 4682 4682 ? A -7.075 17.235 -1.316 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 465 C C . LYS 4682 4682 ? A -8.304 16.915 -0.487 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 466 O O . LYS 4682 4682 ? A -9.170 16.129 -0.884 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 467 C CB . LYS 4682 4682 ? A -7.398 18.366 -2.340 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 468 C CG . LYS 4682 4682 ? A -6.131 18.934 -2.978 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 469 C CD . LYS 4682 4682 ? A -6.324 20.029 -4.042 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 470 C CE . LYS 4682 4682 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.547 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 4624 GLY 1 0.660 2 1 A 4625 GLU 1 0.630 3 1 A 4626 ILE 1 0.750 4 1 A 4627 GLN 1 0.720 5 1 A 4628 LEU 1 0.690 6 1 A 4629 GLN 1 0.740 7 1 A 4630 ILE 1 0.740 8 1 A 4631 ASN 1 0.680 9 1 A 4632 TYR 1 0.560 10 1 A 4633 ASP 1 0.600 11 1 A 4634 LEU 1 0.420 12 1 A 4635 GLY 1 0.550 13 1 A 4636 ASN 1 0.690 14 1 A 4637 LEU 1 0.720 15 1 A 4638 ILE 1 0.760 16 1 A 4639 ILE 1 0.790 17 1 A 4640 HIS 1 0.770 18 1 A 4641 ILE 1 0.780 19 1 A 4642 LEU 1 0.730 20 1 A 4643 GLN 1 0.650 21 1 A 4644 ALA 1 0.750 22 1 A 4645 ARG 1 0.650 23 1 A 4646 ASN 1 0.670 24 1 A 4647 LEU 1 0.680 25 1 A 4648 VAL 1 0.640 26 1 A 4649 PRO 1 0.460 27 1 A 4650 ARG 1 0.310 28 1 A 4651 ASP 1 0.370 29 1 A 4652 ASN 1 0.480 30 1 A 4653 ASN 1 0.500 31 1 A 4654 GLY 1 0.410 32 1 A 4655 TYR 1 0.450 33 1 A 4656 SER 1 0.490 34 1 A 4657 ASP 1 0.520 35 1 A 4658 PRO 1 0.640 36 1 A 4659 PHE 1 0.720 37 1 A 4660 VAL 1 0.810 38 1 A 4661 LYS 1 0.800 39 1 A 4662 VAL 1 0.810 40 1 A 4663 TYR 1 0.680 41 1 A 4664 LEU 1 0.700 42 1 A 4665 LEU 1 0.630 43 1 A 4666 PRO 1 0.590 44 1 A 4667 GLY 1 0.470 45 1 A 4668 ARG 1 0.410 46 1 A 4669 GLY 1 0.490 47 1 A 4670 GLN 1 0.310 48 1 A 4671 VAL 1 0.240 49 1 A 4672 MET 1 0.210 50 1 A 4673 VAL 1 0.190 51 1 A 4674 VAL 1 0.150 52 1 A 4675 GLN 1 0.220 53 1 A 4676 ASN 1 0.210 54 1 A 4677 ALA 1 0.210 55 1 A 4678 SER 1 0.230 56 1 A 4679 VAL 1 0.240 57 1 A 4680 GLU 1 0.450 58 1 A 4681 TYR 1 0.500 59 1 A 4682 LYS 1 0.620 60 1 A 4683 ARG 1 0.650 61 1 A 4684 ARG 1 0.650 62 1 A 4685 THR 1 0.670 63 1 A 4686 LYS 1 0.540 64 1 A 4687 TYR 1 0.510 65 1 A 4688 VAL 1 0.550 66 1 A 4689 GLN 1 0.420 67 1 A 4690 LYS 1 0.460 68 1 A 4691 SER 1 0.580 69 1 A 4692 LEU 1 0.570 70 1 A 4693 ASN 1 0.620 71 1 A 4694 PRO 1 0.640 72 1 A 4695 GLU 1 0.470 73 1 A 4696 TRP 1 0.550 74 1 A 4697 ASN 1 0.700 75 1 A 4698 GLN 1 0.750 76 1 A 4699 THR 1 0.800 77 1 A 4700 VAL 1 0.780 78 1 A 4701 ILE 1 0.660 79 1 A 4702 TYR 1 0.650 80 1 A 4703 LYS 1 0.640 81 1 A 4704 SER 1 0.640 82 1 A 4705 ILE 1 0.690 83 1 A 4706 SER 1 0.700 84 1 A 4707 MET 1 0.570 85 1 A 4708 GLU 1 0.610 86 1 A 4709 GLN 1 0.630 87 1 A 4710 LEU 1 0.620 88 1 A 4711 MET 1 0.590 89 1 A 4712 LYS 1 0.590 90 1 A 4713 LYS 1 0.650 91 1 A 4714 THR 1 0.660 92 1 A 4715 LEU 1 0.650 93 1 A 4716 GLU 1 0.700 94 1 A 4717 VAL 1 0.790 95 1 A 4718 THR 1 0.820 96 1 A 4719 VAL 1 0.790 97 1 A 4720 TRP 1 0.700 98 1 A 4721 ASP 1 0.670 99 1 A 4722 TYR 1 0.550 100 1 A 4723 ASP 1 0.560 101 1 A 4724 ARG 1 0.470 102 1 A 4725 PHE 1 0.340 103 1 A 4726 SER 1 0.390 104 1 A 4727 SER 1 0.470 105 1 A 4728 ASN 1 0.620 106 1 A 4729 ASP 1 0.650 107 1 A 4730 PHE 1 0.700 108 1 A 4731 LEU 1 0.710 109 1 A 4732 GLY 1 0.750 110 1 A 4733 GLU 1 0.770 111 1 A 4734 VAL 1 0.750 112 1 A 4735 LEU 1 0.660 113 1 A 4736 ILE 1 0.630 114 1 A 4737 ASP 1 0.600 115 1 A 4738 LEU 1 0.290 116 1 A 4739 SER 1 0.500 117 1 A 4740 SER 1 0.440 118 1 A 4741 THR 1 0.370 119 1 A 4742 SER 1 0.490 120 1 A 4743 HIS 1 0.370 121 1 A 4744 LEU 1 0.350 122 1 A 4745 ASP 1 0.410 123 1 A 4746 ASN 1 0.460 124 1 A 4747 THR 1 0.410 125 1 A 4748 PRO 1 0.350 126 1 A 4749 ARG 1 0.370 127 1 A 4750 TRP 1 0.360 128 1 A 4751 TYR 1 0.280 129 1 A 4752 PRO 1 0.420 130 1 A 4753 LEU 1 0.350 131 1 A 4754 LYS 1 0.220 132 1 A 4755 GLU 1 0.280 133 1 A 4756 GLN 1 0.260 134 1 A 4757 THR 1 0.220 135 1 A 4758 GLU 1 0.240 136 1 A 4759 SER 1 0.360 137 1 A 4760 ILE 1 0.260 138 1 A 4761 GLU 1 0.300 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #