data_SMR-b4f6b6dea876f3dcb324da8b6be89bf5_4 _entry.id SMR-b4f6b6dea876f3dcb324da8b6be89bf5_4 _struct.entry_id SMR-b4f6b6dea876f3dcb324da8b6be89bf5_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A2S3R7M0/ MARTX_VIBVL, Multifunctional-autoprocessing repeats-in-toxin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A2S3R7M0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 650700.711 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MARTX_VIBVL A0A2S3R7M0 1 ;MGKPFWRSVEYFFTGNYSADDGNNSIVAIGFGGEIHAYGGDDHVTVGSIGATVYTGSGNDTVVGGSAYLR VEDTTGHLSVKGAAGYADINKSGDGNVSFAGAAGGVSIDHLGNNGDVSYGGAAAYNGITRKGLSGNVTFK GAGGYNALWHETNQGNLSFAGAGAGNKLDRTWFNRYQGSRGDVTFDGAGAANSISSRVETGNITFRGAGA DNHLVRKGKVGDITLQGAGASNRIERTRQAEDVYAQTRGNIRFEGVGGYNSLYSDVAHGDIHFSGGGAYN TITRKGSGSSFDAQGMEYAKAEDIVLTAAQMHGLSIDNGNKFHAVTAVKSEREPNTYLFAIADGTYTKIN KVRLYNDPETGKLKYYSEAWFKRGNHLAELARSDVSSAGGFEVNPINGGYTLANIAVEHQQSVTVHAVEK NLTEYEWVTYANGTLIDAKDVALSEAKMGGHAISTDGTTVDVQAVKSNRKPNTYVYAKVLGPYTKIVVVE LANDPKTGALKYQARSWYKEGDHTANLANEDISSANGYHSMGKGGYSLSDLHYSVNAVRSTSETVADIDE YTDQTLFKPATDSGESSGDVRFNGAGGGNVIKSNVTRGNVYFNGGGIANVILHSSQFGNTEFNGGGAANV IVKSGEEGDLTFRGAGLANVLVHQSKQGKMDVYAGGAVNVLVRIGDGQYLAHLLAYGNISVHKGNGNSRV VMLGGYNTHTQIGSGNGLWLAAGGFNVMTQVGKGDVASVLAGGANVLTKVGDGDLTAGMLGGANVITHIS GDNETSNTTAVALGGANILTKKGKGNTLAVMGGGANVLTHVGDGTTTGVMVGGANILTKVGNGDTTGIML GVGNVLTHVGDGQTLGVMGAAGNIFTKVGDGTSIAVMIGAGNIFTHVGEGNAWALMGGLGNVFTKVGNGD ALALMVAEANVFTHIGDGMSVALMLAKGNVATKVGNGTTLAAMVGNANIFTHVGSGSTFAAMIGQANIMT KVGNDLTAALMVGKANIYTHVGDGTSLGIFAGEVNVMTKIGNGTTLAAMFGKANIMTHVGDGLTGVLALG EANIVTKVGDDFMGVVAAAKANVVTHVGDATTAAVLAGKGNILTKVGEGTTVGLLISDIGNVMTHVGDGT TIGIAKGKANIITKVGDGLGVNVAWGQANVFTQVGDGDRYNFAKGEANIITKVGDGKEVSVVQGKANIIT HVGNGDDYTGAWGKANVITKVGNGRNVVLAKGEANIVTQVGDGDSFNALWSKGNIVTKVGDGMQVTAAKG 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ERQAELLADNPDGYKADTLVELDVKLSAIDSMLRESLPFYSLRTERNLLVQEGEEGFEVRSWPGIDGKSK TILLDNPEDAAQQKSIERFILANFDNFEQMPDELFLVDNKVLSHHDGRTRIIAQKEDGAWTYNTNVELMS VTELLDAAHVNGKVRGDSYQQVIDALTEYHASTVEHADYELESVEKLLNLRKQIEGYVLGHPDSGRVEAM NSLLNQVNSRLEEVSVLAVSEQSIKAHDSFSRLYDQLDNANLKESKHLYLDGNGDFVTKGKGNLATIDQL GGSDAVLEKVKAAVTHEYGQVVADTIFARLSANDLAKDGKGIDIAGLNKVHQAIEQHMSPVSATMYIWKP SDHSTLGHAALQIGQGRTQLEGQAAADFNKQNYVSWWPLGSKSSNIRNIFNVATEDQPDLKLRWSDFSQP AHQNDTLEHDMASEENDGFGLKDGETKLKRFIEKLNAAKGIDASYKDASEGYASVLLGNPDMLASTGIPA HVFQPFVDQWNDTSYDMMDVANRFAEELQKQAQASGDPALVEKRIDNVVRLFAERALEEIEAFKASQADE GRVFRINLEGLDVAAMQAEWNRLSNDPDARYQLLTKNCSSTVAKVLKAGGADKLIGHTWRPKFGVWTPTE LFNFGQALQEAQLEIAAKKQSHQVTDVLDALSGNEKHKENVTIENDGTPPRDKESLSPLTRFLNNELYGE KDARRKIGEITQTLLDHAVENGESQKVTLKGEAGRLTGYYHQGAASSEGETSATSGKVVLFLHGSGSSAE EQASAIRNHYQKQGIDMLAVNLRGYGESDGGPSEKGLYQDARTMFNYLVNDKGIDPSNIIIHGYSMGGPI AADLARYAAQNGQAVSGLLLDRPMPSMTKAITAHEMANPAGIVGAIAKAVNGQFSVEKNLKGLPKETPIL LLTDNEGLGEEGEKLRAKLAIAGYNVTGEQTFYGHEASNRLMGQYADQIVSGLFNAEQAAVEAGEVLKGL 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DNLDSKSRVAITTAWADVVHKKGITV ; 'Multifunctional-autoprocessing repeats-in-toxin' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 5206 1 5206 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'RTX toxin RtxA {PDB ID=3fzy, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3fzy.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3fzy, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MHHHHHHSSGVDLGTENLYFQSNALADGKILHNQNVNSWGPITVTPTTDGGETRFDGQIIVQMENDPVVA KAAANLAGKHAESSVVVQLDSDGNYRVVYGDPSKLDGKLRWQLVGHGRDHSETNNTRLSGYSADELAVKL AKFQQSFNQAENINNKPDHISIVGSSLVSDDKQKGFGHQFINAMDANGLRVDVSVRSSELAVDEAGRKHT KDANGDWVQKAENNKVSLSWDAQG ; ;MHHHHHHSSGVDLGTENLYFQSNALADGKILHNQNVNSWGPITVTPTTDGGETRFDGQIIVQMENDPVVA KAAANLAGKHAESSVVVQLDSDGNYRVVYGDPSKLDGKLRWQLVGHGRDHSETNNTRLSGYSADELAVKL AKFQQSFNQAENINNKPDHISIVGSSLVSDDKQKGFGHQFINAMDANGLRVDVSVRSSELAVDEAGRKHT KDANGDWVQKAENNKVSLSWDAQG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 24 234 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3fzy 2023-09-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 5206 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 5206 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.4e-46 90.047 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MGKPFWRSVEYFFTGNYSADDGNNSIVAIGFGGEIHAYGGDDHVTVGSIGATVYTGSGNDTVVGGSAYLRVEDTTGHLSVKGAAGYADINKSGDGNVSFAGAAGGVSIDHLGNNGDVSYGGAAAYNGITRKGLSGNVTFKGAGGYNALWHETNQGNLSFAGAGAGNKLDRTWFNRYQGSRGDVTFDGAGAANSISSRVETGNITFRGAGADNHLVRKGKVGDITLQGAGASNRIERTRQAEDVYAQTRGNIRFEGVGGYNSLYSDVAHGDIHFSGGGAYNTITRKGSGSSFDAQGMEYAKAEDIVLTAAQMHGLSIDNGNKFHAVTAVKSEREPNTYLFAIADGTYTKINKVRLYNDPETGKLKYYSEAWFKRGNHLAELARSDVSSAGGFEVNPINGGYTLANIAVEHQQSVTVHAVEKNLTEYEWVTYANGTLIDAKDVALSEAKMGGHAISTDGTTVDVQAVKSNRKPNTYVYAKVLGPYTKIVVVELANDPKTGALKYQARSWYKEGDHTANLANEDISSANGYHSMGKGGYSLSDLHYSVNAVRSTSETVADIDEYTDQTLFKPATDSGESSGDVRFNGAGGGNVIKSNVTRGNVYFNGGGIANVILHSSQFGNTEFNGGGAANVIVKSGEEGDLTFRGAGLANVLVHQSKQGKMDVYAGGAVNVLVRIGDGQYLAHLLAYGNISVHKGNGNSRVVMLGGYNTHTQIGSGNGLWLAAGGFNVMTQVGKGDVASVLAGGANVLTKVGDGDLTAGMLGGANVITHISGDNETSNTTAVALGGANILTKKGKGNTLAVMGGGANVLTHVGDGTTTGVMVGGANILTKVGNGDTTGIMLGVGNVLTHVGDGQTLGVMGAAGNIFTKVGDGTSIAVMIGAGNIFTHVGEGNAWALMGGLGNVFTKVGNGDALALMVAEANVFTHIGDGMSVALMLAKGNVATKVGNGTTLAAMVGNANIFTHVGSGSTFAAMIGQANIMTKVGNDLTAALMVGKANIYTHVGDGTSLGIFAGEVNVMTKIGNGTTLAAMFGKANIMTHVGDGLTGVLALGEANIVTKVGDDFMGVVAAAKANVVTHVGDATTAAVLAGKGNILTKVGEGTTVGLLISDIGNVMTHVGDGTTIGIAKGKANIITKVGDGLGVNVAWGQANVFTQVGDGDRYNFAKGEANIITKVGDGKEVSVVQGKANIITHVGNGDDYTGAWGKANVITKVGNGRNVVLAKGEANIVTQVGDGDSFNALWSKGNIVTKVGDGMQVTAAKGKANITTTVGDGLSVTAAYGDANINTKVGDGVSVNVAWGKYNINTKVGDGLNVAVMKGKANANIHVGDGLNINASYAQNNVAIKVGNGDFYSLAVASSNTSSNKLSALFDNIKQTLLGVGGSQAINYLVQGDEASSSGTQKGRGAIATPEITKLDGFQMEAIEEVGSDLGDSLTGSVTKVDTPDLNKMQNALDVDGSSDQTQAPNLIVNGDFEQGDRGWKSTHGVEASYSGNVYGVNGEGHGARVTELDTYTNTSLYQDLTDLTEGEVIAVSFDFAKRAGLSNNEGIEVLWNGEVVFSSSGDASAWQQKTLKLTAHAGSNRIEFKGTGHNDGLGYILDNVVAKSESSQQANAVSEHATQNQASQNALSDKERAEADRQRLEQEKQKQLDAVAGSQSQLESTDQQALGNNGQAQRDAVKEESEAVTAELTKLAQGLDVLDGQATHTGESGDQWRNDFAGGLLDGVQSQLDDAKQLANDKIAAAKQTQSDNNSKVKESVAKSEAGVAQGEQNRAGAEQDIAEAKADAETRKADAVAKSNDAKQAESDAHSAANDAQSRGDRDAMNAENKANQAQNDAKGTKQNEGDRPDREGVAGSGLSGNAHSVEGAGETGSHITTDSQTNADGRFSEGLSEQEQEALEGATNAVNRLQINAGIRGKNSGSTITSMFTETNSDSIVVPTTASQDVVRKEIRISGVNLEGLGEASHDSAESLVAARAEKVANLYRWLDTDNDVATDKYVPVPGFERVDVDVSDEVKQRMIQSMSGYIEHTDNQVPKDQAEALATLFVESTLDYDWDKRVEFLTKLESYGYSFEAPHAEKSIVSFWSGKNFKQYRDILDNAQTDGKKVVYDIDVKGNAFAIDLNKHLMRWGGLFLDPDNAEQNQLKSSIDAATFSNTGFWSSVYATGAQNDVYVIAEGGVRLGNYFWNVELPALRQLQREGLVGEIRLLDKPVSEYKDLPADQIGRRLTDAGVAVKVRFDALSHERQAELLADNPDGYKADTLVELDVKLSAIDSMLRESLPFYSLRTERNLLVQEGEEGFEVRSWPGIDGKSKTILLDNPEDAAQQKSIERFILANFDNFEQMPDELFLVDNKVLSHHDGRTRIIAQKEDGAWTYNTNVELMSVTELLDAAHVNGKVRGDSYQQVIDALTEYHASTVEHADYELESVEKLLNLRKQIEGYVLGHPDSGRVEAMNSLLNQVNSRLEEVSVLAVSEQSIKAHDSFSRLYDQLDNANLKESKHLYLDGNGDFVTKGKGNLATIDQLGGSDAVLEKVKAAVTHEYGQVVADTIFARLSANDLAKDGKGIDIAGLNKVHQAIEQHMSPVSATMYIWKPSDHSTLGHAALQIGQGRTQLEGQAAADFNKQNYVSWWPLGSKSSNIRNIFNVATEDQPDLKLRWSDFSQPAHQNDTLEHDMASEENDGFGLKDGETKLKRFIEKLNAAKGIDASYKDASEGYASVLLGNPDMLASTGIPAHVFQPFVDQWNDTSYDMMDVANRFAEELQKQAQASGDPALVEKRIDNVVRLFAERALEEIEAFKASQADEGRVFRINLEGLDVAAMQAEWNRLSNDPDARYQLLTKNCSSTVAKVLKAGGADKLIGHTWRPKFGVWTPTELFNFGQALQEAQLEIAAKKQSHQVTDVLDALSGNEKHKENVTIENDGTPPRDKESLSPLTRFLNNELYGEKDARRKIGEITQTLLDHAVENGESQKVTLKGEAGRLTGYYHQGAASSEGETSATSGKVVLFLHGSGSSAEEQASAIRNHYQKQGIDMLAVNLRGYGESDGGPSEKGLYQDARTMFNYLVNDKGIDPSNIIIHGYSMGGPIAADLARYAAQNGQAVSGLLLDRPMPSMTKAITAHEMANPAGIVGAIAKAVNGQFSVEKNLKGLPKETPILLLTDNEGLGEEGEKLRAKLAIAGYNVTGEQTFYGHEASNRLMGQYADQIVSGLFNAEQAAVEAGEVLKGLEKDFKRYGDALKPDTSVPGKSKDIRTTKDFLNGYKNDHAKEIVDGFRSDMSIKQLVDLFVKGNWSAEQKGALAWEIESRALKVTFQNKSEKYNRLFREIASAGVVDAKATEQLAPQLMLLNLSNDGFGGRCDPLSKLVLVAKQLENDGQVGVARQLLEKMYSAAAVLSNPTLYSDSEKANASKLLSSLAAIHAKNPMHDTSMKVWQEKLEGKQALTVNGVVEKITDASANGKPVLLELDAPGHAMAAWAKDSGDDRVYGFYDPNAGIVEFSSAEKFGDYLTRFFGKSDLDMAQSYKLGKNDAGEAIFNRVVVMDGNTLASYKPTFGDKTTMQGILDLPVFDATPIKKPTGGVASDLEALGDKTKVVVDLAQIFTVQELKERAKVFAKPIGASYQGILDQLDLVHQAKGRDQIAASFELNKKINDYIAEHPTSGRNQALTQLKEQVTSALFIGKMQVAQAGIDAIAQTRPELAARIFMVAIEEANGKHVGLTDMMVRWANEDPYLAPKHGYKGETPSDLGFDAKYHVDLGEHYADFKQWLETSQSNGLLSKATLDESTKTVHLGYSYQELQDLTGAESVQMAFYFLKEAAKKADPISGDSAEMILLKKFADQSYLSQLDSDRMDQIEGIYRSSHETDIDAWDRRYSGTGYDELTNKLASATGVDEQLAVLLDDRKGLLIGEVHGSDVNGLRFVNEQMDALKKQGVTVIGLEHLRSDLAQPLIDRYLATGVMSSELSAMLKTKHLDVTLFENARANGIRIVALDANSSARPNVQGTEHGLMYRAGAANNIAVEVLQNLPDGEKFVAIYGKAHLQSHKGIEGFVPGITHRLDLPALKVSDSNQFTVEQDDVSLRVVYDDVANKPKITFKDSLSGANTALHNQNVNDWERVVVTPTADGGESRFDGQIIVQMENDDVVAKAAANLAGKHPESSVVVQIDSDGNYRVVYGDPSKLDGKLRWQLVGHGRDDSESNNTRLSGYSADELAVKLAKFQQSFNQAENINNKPDHISIVGCSLVSDDKQKGFGHQFINAMDANGLRVDVSVRSSELAVDEAGRKHTKDANGDWVQKAENNKVSLSWDEQGEVVAKDERIRNGIAEGDIDLSRIGVSDVDEPARGAIGDNNDVFDAPEKRKAETETSSSSANNKLSYSGNIQVNVGDGEFTAVNWGTSNVGIKVGTGGFKSLAFGDNNVMVHIGNGESKHSFDIGGYQALEGAQMFIGNRNVSFNLGRSNDLIVMMDKSIPTPPLVNPFDGAARISGVLQSIATSGEGQDWLAAQEQQWTLSGAKKFVKDMSGLDQSSSVDYTSLVELDSQNERSSRGLKHDAEAALNKQYNQWLSGNSDSDTSKLSRADKLRQANEKLAFNFAVGGQGADIQVTTGNWNFMFGDNIQSILDTNLGSLFGLMTQQFSATGQAKTTFTYTPEDLPRQLKNKLLGQLAGVGAETTLADIFGVDYTASGQIVSRNGEAVDGVAILKEMLEVIGEFSGDQLQAFVDPAKLLDSLKSGINMGADGIKSFAETHGLKEKAPEEEEDNSSVSVNGASVNSAQGATVADGSTETAETPDRAFGFNSLNLPNLFATIFSQDKQKEMKSLVENLKENLTADLLNMKEKTFDFLRNSGHLQGDGDINISLGNYNFNWGGDGKDLGAYLGDNNNFWGGRGDDVFYATGTSNIFTGGEGNDMGVLMGRENMMFGGDGNDTAVVAGRINHVFLGAGDDQSFVFGEGGEIDTGSGRDYVVTSGNFNRVDTGDDQDYSVTIGNNNQVELGAGNDFANVFGNYNRINASAGNDVVKLMGYHAVLNGGEGEDHLIAAAISKFSQFNGGEGRDLMVLGGYQNTFKGGTDVDSFVVSGDVIDNLVEDIRSEDNIVFNGIDWQKLWFERSGYDLKLSILRDPASDSDQAKFEHIGSVTFSDYFNGNRAQVIIAMGEKDATGEREYTTLSESAIDALVQAMSGFDPQAGDNGFMDNLDSKSRVAITTAWADVVHKKGITV 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ALADGKILHNQNVNSWGPITVTPTTDGGETRFDGQIIVQMENDPVVAKAAANLAGKHAESSVVVQLDSDGNYRVVYGDPSKLDGKLRWQLVGHGRDHSETNNTRLSGYSADELAVKLAKFQQSFNQAENINNKPDHISIVGSSLVSDDKQKGFGHQFINAMDANGLRVDVSVRSSELAVDEAGRKHTKDANGDWVQKAENNKVSLSWDAQG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3fzy.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 4089 4089 ? A 6.980 15.824 20.722 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 2 C CA . LEU 4089 4089 ? A 6.633 14.541 21.395 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 3 C C . LEU 4089 4089 ? A 7.900 13.764 21.531 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 4 O O . LEU 4089 4089 ? A 8.716 13.789 20.614 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 5 C CB . LEU 4089 4089 ? A 5.612 13.752 20.551 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 6 C CG . LEU 4089 4089 ? A 4.178 14.318 20.565 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 4089 4089 ? A 3.967 15.764 20.063 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 4089 4089 ? A 3.232 13.305 19.897 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 9 N N . SER 4090 4090 ? A 8.129 13.131 22.684 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 10 C CA . SER 4090 4090 ? A 9.390 12.475 22.957 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 11 C C . SER 4090 4090 ? A 9.329 10.996 22.667 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 12 O O . SER 4090 4090 ? A 9.709 10.168 23.501 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 13 C CB . SER 4090 4090 ? A 9.847 12.715 24.405 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 14 O OG . SER 4090 4090 ? A 10.004 14.117 24.631 1 1 A SER 0.770 1 ATOM 15 N N . GLY 4091 4091 ? A 8.848 10.651 21.455 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 16 C CA . GLY 4091 4091 ? A 8.887 9.318 20.892 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 17 C C . GLY 4091 4091 ? A 9.330 9.301 19.486 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 18 O O . GLY 4091 4091 ? A 9.047 10.221 18.725 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 19 N N . ALA 4092 4092 ? A 9.984 8.191 19.104 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 20 C CA . ALA 4092 4092 ? A 10.242 7.848 17.723 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 21 C C . ALA 4092 4092 ? A 10.965 8.889 16.886 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 22 O O . ALA 4092 4092 ? A 10.630 9.091 15.721 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 23 C CB . ALA 4092 4092 ? A 8.942 7.423 17.012 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 24 N N . ASN 4093 4093 ? A 12.033 9.539 17.405 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 25 C CA . ASN 4093 4093 ? A 12.928 10.246 16.510 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 26 C C . ASN 4093 4093 ? A 13.588 9.301 15.526 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 27 O O . ASN 4093 4093 ? A 14.112 8.246 15.905 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 28 C CB . ASN 4093 4093 ? A 13.973 11.114 17.243 1 1 A ASN 0.570 1 ATOM 29 C CG . ASN 4093 4093 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #