data_SMR-fbec41870e2ad02b980653dffad5e737_1 _entry.id SMR-fbec41870e2ad02b980653dffad5e737_1 _struct.entry_id SMR-fbec41870e2ad02b980653dffad5e737_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q8BM65 (isoform 2)/ NYAP2_MOUSE, Neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adapter 2 Estimated model accuracy of this model is 0.013, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8BM65 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 91322.947 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP NYAP2_MOUSE Q8BM65 1 ;MIPSKMMSANPEEDPLDTFFQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETKLAYLKEKNEKRRRQEE TIKRIGGEVGRGQDASYAGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFTVRSQSLHSVGGTEDDSSCGSRRQPP PKPKRDPSTKLSTSSETVNSTAASKSGRSLERAEVSAKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDET YIKKHVPRRTSLPRDSSLSQVCSPAADPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEEDDQSEAVYEEMKYPIFDDLG HDSKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFVKSSGPCTPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNS DESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPPGACPSSLPSHGSSHAKDQTGALGPAPGASILSSSPPPPSTLYRT QSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSSSVPHTTPRPVSQDGAKMVNAAVN TYSAAQSGSRSRTPTSPLEELTSLFTSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDSKER GHYGSSSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRMGRCSVSPTLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTP LRQASDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEMIEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYS PPPYSKQQTVFWDTAI ; 'Neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adapter 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 716 1 716 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . NYAP2_MOUSE Q8BM65 Q8BM65-2 1 716 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-03-01 AE293039FC214184 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MIPSKMMSANPEEDPLDTFFQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETKLAYLKEKNEKRRRQEE TIKRIGGEVGRGQDASYAGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFTVRSQSLHSVGGTEDDSSCGSRRQPP PKPKRDPSTKLSTSSETVNSTAASKSGRSLERAEVSAKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDET YIKKHVPRRTSLPRDSSLSQVCSPAADPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEEDDQSEAVYEEMKYPIFDDLG HDSKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFVKSSGPCTPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNS DESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPPGACPSSLPSHGSSHAKDQTGALGPAPGASILSSSPPPPSTLYRT QSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSSSVPHTTPRPVSQDGAKMVNAAVN TYSAAQSGSRSRTPTSPLEELTSLFTSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDSKER GHYGSSSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRMGRCSVSPTLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTP LRQASDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEMIEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYS PPPYSKQQTVFWDTAI ; ;MIPSKMMSANPEEDPLDTFFQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETKLAYLKEKNEKRRRQEE TIKRIGGEVGRGQDASYAGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFTVRSQSLHSVGGTEDDSSCGSRRQPP PKPKRDPSTKLSTSSETVNSTAASKSGRSLERAEVSAKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDET YIKKHVPRRTSLPRDSSLSQVCSPAADPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEEDDQSEAVYEEMKYPIFDDLG HDSKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFVKSSGPCTPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNS DESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPPGACPSSLPSHGSSHAKDQTGALGPAPGASILSSSPPPPSTLYRT QSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSSSVPHTTPRPVSQDGAKMVNAAVN TYSAAQSGSRSRTPTSPLEELTSLFTSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDSKER GHYGSSSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRMGRCSVSPTLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTP LRQASDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEMIEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYS PPPYSKQQTVFWDTAI ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ILE . 1 3 PRO . 1 4 SER . 1 5 LYS . 1 6 MET . 1 7 MET . 1 8 SER . 1 9 ALA . 1 10 ASN . 1 11 PRO . 1 12 GLU . 1 13 GLU . 1 14 ASP . 1 15 PRO . 1 16 LEU . 1 17 ASP . 1 18 THR . 1 19 PHE . 1 20 PHE . 1 21 GLN . 1 22 TYR . 1 23 ILE . 1 24 GLU . 1 25 ASP . 1 26 MET . 1 27 GLY . 1 28 MET . 1 29 LYS . 1 30 ALA . 1 31 TYR . 1 32 ASP . 1 33 GLY . 1 34 LEU . 1 35 VAL . 1 36 ILE . 1 37 GLN . 1 38 ASN . 1 39 ALA . 1 40 SER . 1 41 ASP . 1 42 ILE . 1 43 ALA . 1 44 ARG . 1 45 GLU . 1 46 ASN . 1 47 ASP . 1 48 ARG . 1 49 LEU . 1 50 ARG . 1 51 ASN . 1 52 GLU . 1 53 THR . 1 54 LYS . 1 55 LEU . 1 56 ALA . 1 57 TYR . 1 58 LEU . 1 59 LYS . 1 60 GLU . 1 61 LYS . 1 62 ASN . 1 63 GLU . 1 64 LYS . 1 65 ARG . 1 66 ARG . 1 67 ARG . 1 68 GLN . 1 69 GLU . 1 70 GLU . 1 71 THR . 1 72 ILE . 1 73 LYS . 1 74 ARG . 1 75 ILE . 1 76 GLY . 1 77 GLY . 1 78 GLU . 1 79 VAL . 1 80 GLY . 1 81 ARG . 1 82 GLY . 1 83 GLN . 1 84 ASP . 1 85 ALA . 1 86 SER . 1 87 TYR . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 LYS . 1 91 HIS . 1 92 PHE . 1 93 ARG . 1 94 MET . 1 95 GLY . 1 96 PHE . 1 97 MET . 1 98 THR . 1 99 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. 1 183 SER . 1 184 ASP . 1 185 GLU . 1 186 TYR . 1 187 SER . 1 188 LYS . 1 189 LYS . 1 190 ILE . 1 191 PRO . 1 192 PRO . 1 193 PRO . 1 194 LYS . 1 195 PRO . 1 196 LYS . 1 197 ARG . 1 198 ASN . 1 199 PRO . 1 200 ASN . 1 201 THR . 1 202 GLN . 1 203 LEU . 1 204 SER . 1 205 THR . 1 206 SER . 1 207 PHE . 1 208 ASP . 1 209 GLU . 1 210 THR . 1 211 TYR . 1 212 ILE . 1 213 LYS . 1 214 LYS . 1 215 HIS . 1 216 VAL . 1 217 PRO . 1 218 ARG . 1 219 ARG . 1 220 THR . 1 221 SER . 1 222 LEU . 1 223 PRO . 1 224 ARG . 1 225 ASP . 1 226 SER . 1 227 SER . 1 228 LEU . 1 229 SER . 1 230 GLN . 1 231 VAL . 1 232 CYS . 1 233 SER . 1 234 PRO . 1 235 ALA . 1 236 ALA . 1 237 ASP . 1 238 PRO . 1 239 GLU . 1 240 GLU . 1 241 GLU . 1 242 GLU . 1 243 PRO . 1 244 VAL . 1 245 TYR . 1 246 ILE . 1 247 GLU . 1 248 MET . 1 249 VAL . 1 250 GLY . 1 251 ASN . 1 252 ILE . 1 253 LEU . 1 254 ARG . 1 255 ASP . 1 256 PHE . 1 257 ARG . 1 258 LYS . 1 259 GLU . 1 260 GLU . 1 261 ASP . 1 262 ASP . 1 263 GLN . 1 264 SER . 1 265 GLU . 1 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B 1 600 LEU 600 ? ? ? B . B 1 601 ALA 601 ? ? ? B . B 1 602 GLY 602 ? ? ? B . B 1 603 ASN 603 ? ? ? B . B 1 604 HIS 604 ? ? ? B . B 1 605 SER 605 ? ? ? B . B 1 606 SER 606 ? ? ? B . B 1 607 GLU 607 ? ? ? B . B 1 608 PRO 608 ? ? ? B . B 1 609 LYS 609 ? ? ? B . B 1 610 VAL 610 ? ? ? B . B 1 611 SER 611 ? ? ? B . B 1 612 CYS 612 ? ? ? B . B 1 613 LYS 613 ? ? ? B . B 1 614 LEU 614 ? ? ? B . B 1 615 GLY 615 ? ? ? B . B 1 616 ARG 616 ? ? ? B . B 1 617 SER 617 ? ? ? B . B 1 618 ALA 618 ? ? ? B . B 1 619 SER 619 ? ? ? B . B 1 620 THR 620 ? ? ? B . B 1 621 SER 621 ? ? ? B . B 1 622 GLY 622 ? ? ? B . B 1 623 VAL 623 ? ? ? B . B 1 624 PRO 624 ? ? ? B . B 1 625 PRO 625 ? ? ? B . B 1 626 PRO 626 ? ? ? B . B 1 627 SER 627 ? ? ? B . B 1 628 VAL 628 ? ? ? B . B 1 629 THR 629 ? ? ? B . B 1 630 PRO 630 ? ? ? B . B 1 631 LEU 631 ? ? ? B . B 1 632 ARG 632 ? ? ? B . B 1 633 GLN 633 ? ? ? B . B 1 634 ALA 634 ? ? ? B . B 1 635 SER 635 ? ? ? B . B 1 636 ASP 636 ? ? ? B . B 1 637 LEU 637 ? ? ? B . B 1 638 GLN 638 ? ? ? B . B 1 639 GLN 639 ? ? ? B . B 1 640 SER 640 ? ? ? B . B 1 641 GLN 641 ? ? ? B . B 1 642 VAL 642 ? ? ? B . B 1 643 ALA 643 ? ? ? B . B 1 644 CYS 644 ? ? ? B . B 1 645 MET 645 ? ? ? B . B 1 646 GLN 646 ? ? ? B . B 1 647 TRP 647 ? ? ? B . B 1 648 PHE 648 ? ? ? B . B 1 649 HIS 649 ? ? ? B . B 1 650 GLY 650 ? ? ? B . B 1 651 ASP 651 ? ? ? B . B 1 652 HIS 652 ? ? ? B . B 1 653 THR 653 ? ? ? B . B 1 654 MET 654 ? ? ? B . B 1 655 LEU 655 ? ? ? B . B 1 656 GLU 656 ? ? ? B . B 1 657 MET 657 ? ? ? B . B 1 658 ILE 658 ? ? ? B . B 1 659 GLU 659 ? ? ? B . B 1 660 LYS 660 ? ? ? B . B 1 661 LYS 661 ? ? ? B . B 1 662 ARG 662 ? ? ? B . B 1 663 CYS 663 ? ? ? B . B 1 664 LEU 664 ? ? ? B . B 1 665 CYS 665 ? ? ? B . B 1 666 LYS 666 ? ? ? B . B 1 667 GLU 667 ? ? ? B . B 1 668 ILE 668 ? ? ? B . B 1 669 LYS 669 ? ? ? B . B 1 670 ALA 670 ? ? ? B . B 1 671 ARG 671 ? ? ? B . B 1 672 GLN 672 ? ? ? B . B 1 673 LYS 673 ? ? ? B . B 1 674 THR 674 ? ? ? B . B 1 675 GLU 675 ? ? ? B . B 1 676 LYS 676 ? ? ? B . B 1 677 GLY 677 ? ? ? B . B 1 678 LEU 678 ? ? ? B . B 1 679 CYS 679 ? ? ? B . B 1 680 LYS 680 ? ? ? B . B 1 681 GLN 681 ? ? ? B . B 1 682 ASP 682 ? ? ? B . B 1 683 SER 683 ? ? ? B . B 1 684 MET 684 ? ? ? B . B 1 685 PRO 685 ? ? ? B . B 1 686 ILE 686 ? ? ? B . B 1 687 LEU 687 ? ? ? B . B 1 688 PRO 688 ? ? ? B . B 1 689 SER 689 ? ? ? B . B 1 690 TRP 690 ? ? ? B . B 1 691 LYS 691 ? ? ? B . B 1 692 LYS 692 ? ? ? B . B 1 693 ASN 693 ? ? ? B . B 1 694 ALA 694 ? ? ? B . B 1 695 GLY 695 ? ? ? B . B 1 696 ALA 696 ? ? ? B . B 1 697 LYS 697 ? ? ? B . B 1 698 LYS 698 ? ? ? B . B 1 699 TYR 699 ? ? ? B . B 1 700 SER 700 ? ? ? B . B 1 701 PRO 701 ? ? ? B . B 1 702 PRO 702 ? ? ? B . B 1 703 PRO 703 ? ? ? B . B 1 704 TYR 704 ? ? ? B . B 1 705 SER 705 ? ? ? B . B 1 706 LYS 706 ? ? ? B . B 1 707 GLN 707 ? ? ? B . B 1 708 GLN 708 ? ? ? B . B 1 709 THR 709 ? ? ? B . B 1 710 VAL 710 ? ? ? B . B 1 711 PHE 711 ? ? ? B . B 1 712 TRP 712 ? ? ? B . B 1 713 ASP 713 ? ? ? B . B 1 714 THR 714 ? ? ? B . B 1 715 ALA 715 ? ? ? B . B 1 716 ILE 716 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AVRM {PDB ID=4bjm, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4bjm.1.A}' 'template structure' . 2 'AVRM {PDB ID=4bjm, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4bjm.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 4bjm, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4bjm, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SNAQPEFDRGFLRPFGAKMKFLKPDQVQKLSTDDLITYMAEKDKNVRDLAIKLRDAKQDSTKNGTPEIKQ KYDKAYEKTKAAAEKLVSEESLTRDALLELTEEQYVEKAALFDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYRE VARTFIAREGEPALNAKIERLALTLENNADTRSKLDYLAIAADFLKNQANLHADDPELNLYKAETKAREI KANRAMKEALEGADKLFERNKILKSPDM ; ;SNAQPEFDRGFLRPFGAKMKFLKPDQVQKLSTDDLITYMAEKDKNVRDLAIKLRDAKQDSTKNGTPEIKQ KYDKAYEKTKAAAEKLVSEESLTRDALLELTEEQYVEKAALFDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYRE VARTFIAREGEPALNAKIERLALTLENNADTRSKLDYLAIAADFLKNQANLHADDPELNLYKAETKAREI KANRAMKEALEGADKLFERNKILKSPDM ; 2 ;SNAQPEFDRGFLRPFGAKMKFLKPDQVQKLSTDDLITYMAEKDKNVRDLAIKLRDAKQDSTKNGTPEIKQ KYDKAYEKTKAAAEKLVSEESLTRDALLELTEEQYVEKAALFDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYRE VARTFIAREGEPALNAKIERLALTLENNADTRSKLDYLAIAADFLKNQANLHADDPELNLYKAETKAREI KANRAMKEALEGADKLFERNKILKSPDM ; ;SNAQPEFDRGFLRPFGAKMKFLKPDQVQKLSTDDLITYMAEKDKNVRDLAIKLRDAKQDSTKNGTPEIKQ KYDKAYEKTKAAAEKLVSEESLTRDALLELTEEQYVEKAALFDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYRE VARTFIAREGEPALNAKIERLALTLENNADTRSKLDYLAIAADFLKNQANLHADDPELNLYKAETKAREI KANRAMKEALEGADKLFERNKILKSPDM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 104 148 2 2 104 148 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4bjm 2024-05-08 2 PDB . 4bjm 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 716 2 2 B 1 716 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 716 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 716 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 240.000 26.667 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 240.000 26.667 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MIPSKMMSANPEEDPLDTFFQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETKLAYLKEKNEKRRRQEETIKRIGGEVGRGQDASYAGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFTVRSQSLHSVGGTEDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVNSTAASKSGRSLERAEVSAKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHVPRRTSLPRDSSLSQVCSPAADPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEEDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGHDSKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFVKSSGPCTPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPPGACPSSLPSHGSSHAKDQTGALGPAPGASILSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSSSVPHTTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYSAAQSGSRSRTPTSPLEELTSLFTSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDSKERGHYGSSSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRMGRCSVSPTLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQASDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEMIEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYSPPPYSKQQTVFWDTAI 2 1 2 --------------------QYVEKAAL--FDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYREVARTFIAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MIPSKMMSANPEEDPLDTFFQYIEDMGMKAYDGLVIQNASDIARENDRLRNETKLAYLKEKNEKRRRQEETIKRIGGEVGRGQDASYAGKHFRMGFMTMPAPQDRLPHPCSSGFTVRSQSLHSVGGTEDDSSCGSRRQPPPKPKRDPSTKLSTSSETVNSTAASKSGRSLERAEVSAKPRPHSDEYSKKIPPPKPKRNPNTQLSTSFDETYIKKHVPRRTSLPRDSSLSQVCSPAADPEEEEPVYIEMVGNILRDFRKEEDDQSEAVYEEMKYPIFDDLGHDSKCDFDHHSCSSQCATPTVPDLDFVKSSGPCTPKGLLCDIPPPFPNLLSHRPPLLVFPPAPVHCSPNSDESPLTPLEVTKLPVLENVSYMKQPPGACPSSLPSHGSSHAKDQTGALGPAPGASILSSSPPPPSTLYRTQSPHGYPKSHSTSPSPVSMGRSLTPLSLKRPPPYDAVHSGSLSRSSSSVPHTTPRPVSQDGAKMVNAAVNTYSAAQSGSRSRTPTSPLEELTSLFTSGRSLLRKSSSGRRSKEPAEKSTEELKVRSHSTEPLPKLDSKERGHYGSSSSREPVKAQEWDGTPGPPVVTSRMGRCSVSPTLLAGNHSSEPKVSCKLGRSASTSGVPPPSVTPLRQASDLQQSQVACMQWFHGDHTMLEMIEKKRCLCKEIKARQKTEKGLCKQDSMPILPSWKKNAGAKKYSPPPYSKQQTVFWDTAI 4 2 2 --------------------QYVEKAAL--FDKDVYRNNLQRQTYERLLRSETDVSYREVARTFIAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.087}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4bjm.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 21 21 ? A 3.384 22.597 6.193 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 2 C CA . GLN 21 21 ? A 2.658 22.969 7.451 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 3 C C . GLN 21 21 ? A 3.102 24.327 7.971 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 4 O O . GLN 21 21 ? A 2.298 25.213 8.079 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 5 C CB . GLN 21 21 ? A 2.838 21.813 8.475 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 6 C CG . GLN 21 21 ? A 2.211 20.462 7.991 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 7 C CD . GLN 21 21 ? A 2.892 19.234 8.633 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 21 21 ? A 3.958 19.330 9.183 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 21 21 ? A 2.255 18.034 8.480 1 1 A GLN 0.420 1 ATOM 10 N N . TYR 22 22 ? A 4.422 24.574 8.205 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 11 C CA . TYR 22 22 ? A 4.896 25.823 8.774 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 12 C C . TYR 22 22 ? A 4.423 27.096 8.035 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 13 O O . TYR 22 22 ? A 3.881 28.005 8.635 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 14 C CB . TYR 22 22 ? A 6.447 25.671 8.799 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 15 C CG . TYR 22 22 ? A 7.193 26.798 9.450 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 16 C CD1 . TYR 22 22 ? A 7.056 27.062 10.822 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 17 C CD2 . TYR 22 22 ? A 8.124 27.537 8.702 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 18 C CE1 . TYR 22 22 ? A 7.830 28.060 11.431 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 19 C CE2 . TYR 22 22 ? A 8.906 28.527 9.313 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 20 C CZ . TYR 22 22 ? A 8.757 28.786 10.680 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 21 O OH . TYR 22 22 ? A 9.554 29.753 11.320 1 1 A TYR 0.440 1 ATOM 22 N N . ILE 23 23 ? A 4.515 27.150 6.682 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 23 C CA . ILE 23 23 ? A 3.937 28.250 5.914 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 24 C C . ILE 23 23 ? A 2.411 28.326 5.997 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 25 O O . ILE 23 23 ? A 1.857 29.406 6.152 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 26 C CB . ILE 23 23 ? A 4.480 28.265 4.483 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 27 C CG1 . ILE 23 23 ? A 6.005 28.556 4.518 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 28 C CG2 . ILE 23 23 ? A 3.782 29.367 3.657 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 29 C CD1 . ILE 23 23 ? A 6.688 28.492 3.141 1 1 A ILE 0.510 1 ATOM 30 N N . GLU 24 24 ? A 1.681 27.196 5.963 1 1 A GLU 0.530 1 ATOM 31 C CA . GLU 24 24 ? 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A -0.584 13.323 -13.357 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 273 C CD . LYS 54 54 ? A -1.746 13.359 -12.354 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 274 C CE . LYS 54 54 ? A -1.356 12.831 -10.969 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 275 N NZ . LYS 54 54 ? A -2.505 12.951 -10.045 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 276 N N . LEU 55 55 ? A -0.597 15.329 -17.561 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 277 C CA . LEU 55 55 ? A -1.008 15.602 -18.929 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 278 C C . LEU 55 55 ? A 0.064 15.287 -19.964 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 279 O O . LEU 55 55 ? A -0.200 14.663 -20.995 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 280 C CB . LEU 55 55 ? A -1.378 17.100 -19.070 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 281 C CG . LEU 55 55 ? A -1.830 17.554 -20.484 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 282 C CD1 . LEU 55 55 ? A -3.114 16.847 -20.961 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 283 C CD2 . LEU 55 55 ? A -2.017 19.081 -20.531 1 1 A LEU 0.560 1 ATOM 284 N N . ALA 56 56 ? A 1.322 15.694 -19.702 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 285 C CA . ALA 56 56 ? A 2.440 15.370 -20.555 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 286 C C . ALA 56 56 ? A 2.742 13.881 -20.633 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 287 O O . ALA 56 56 ? A 2.854 13.341 -21.725 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 288 C CB . ALA 56 56 ? A 3.700 16.115 -20.077 1 1 A ALA 0.630 1 ATOM 289 N N . TYR 57 57 ? A 2.794 13.158 -19.486 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 290 C CA . TYR 57 57 ? A 3.074 11.733 -19.466 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 291 C C . TYR 57 57 ? A 2.047 10.920 -20.237 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 292 O O . TYR 57 57 ? A 2.396 10.037 -21.011 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 293 C CB . TYR 57 57 ? A 3.129 11.226 -17.993 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 294 C CG . TYR 57 57 ? A 3.375 9.741 -17.914 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 295 C CD1 . TYR 57 57 ? A 4.611 9.207 -18.303 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 296 C CD2 . TYR 57 57 ? A 2.321 8.867 -17.600 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 297 C CE1 . TYR 57 57 ? A 4.799 7.817 -18.356 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 298 C CE2 . TYR 57 57 ? A 2.514 7.481 -17.634 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 299 C CZ . TYR 57 57 ? A 3.756 6.957 -18.003 1 1 A TYR 0.650 1 ATOM 300 O OH . TYR 57 57 ? 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A 0.501 14.361 -25.724 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 315 C CD . LYS 59 59 ? A 0.422 15.890 -25.847 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 316 C CE . LYS 59 59 ? A 0.524 16.360 -27.303 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 317 N NZ . LYS 59 59 ? A 0.423 17.834 -27.374 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 318 N N . GLU 60 60 ? A 2.779 11.852 -24.054 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 319 C CA . GLU 60 60 ? A 4.051 11.303 -24.485 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 320 C C . GLU 60 60 ? A 4.070 9.784 -24.496 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 321 O O . GLU 60 60 ? A 4.607 9.157 -25.402 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 322 C CB . GLU 60 60 ? A 5.200 11.863 -23.616 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 323 C CG . GLU 60 60 ? A 5.457 13.370 -23.888 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 324 C CD . GLU 60 60 ? A 6.543 14.001 -23.018 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 325 O OE1 . GLU 60 60 ? A 7.106 13.308 -22.136 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 326 O OE2 . GLU 60 60 ? A 6.798 15.214 -23.256 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 327 N N . LYS 61 61 ? A 3.427 9.136 -23.503 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 328 C CA . LYS 61 61 ? A 3.215 7.700 -23.483 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 329 C C . LYS 61 61 ? A 2.386 7.175 -24.645 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 330 O O . LYS 61 61 ? A 2.657 6.096 -25.179 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 331 C CB . LYS 61 61 ? A 2.517 7.263 -22.176 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 332 C CG . LYS 61 61 ? A 2.355 5.740 -22.042 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 333 C CD . LYS 61 61 ? A 1.712 5.345 -20.708 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 334 C CE . LYS 61 61 ? A 1.634 3.828 -20.491 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 335 N NZ . LYS 61 61 ? A 1.069 3.498 -19.161 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 336 N N . ASN 62 62 ? A 1.341 7.914 -25.071 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 337 C CA . ASN 62 62 ? A 0.574 7.575 -26.257 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 338 C C . ASN 62 62 ? A 1.392 7.597 -27.530 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 339 O O . ASN 62 62 ? A 1.293 6.677 -28.336 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 340 C CB . ASN 62 62 ? A -0.628 8.532 -26.457 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 341 C CG . ASN 62 62 ? A -1.717 8.184 -25.453 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 342 O OD1 . ASN 62 62 ? A -1.836 7.042 -25.026 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 343 N ND2 . ASN 62 62 ? A -2.567 9.197 -25.140 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 344 N N . GLU 63 63 ? A 2.232 8.634 -27.716 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 345 C CA . GLU 63 63 ? A 3.159 8.694 -28.836 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 346 C C . GLU 63 63 ? A 4.275 7.654 -28.767 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 347 O O . GLU 63 63 ? A 4.658 7.061 -29.768 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 348 C CB . GLU 63 63 ? A 3.761 10.114 -28.985 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 349 C CG . GLU 63 63 ? A 4.624 10.373 -30.270 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 350 C CD . GLU 63 63 ? A 3.958 10.235 -31.637 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 351 O OE1 . GLU 63 63 ? A 2.819 9.743 -31.734 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 352 O OE2 . GLU 63 63 ? A 4.615 10.586 -32.665 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 353 N N . LYS 64 64 ? A 4.821 7.383 -27.562 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 354 C CA . LYS 64 64 ? A 5.805 6.340 -27.336 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 355 C C . LYS 64 64 ? A 5.333 4.923 -27.632 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 356 O O . LYS 64 64 ? A 6.070 4.125 -28.171 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 357 C CB . LYS 64 64 ? A 6.272 6.372 -25.861 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 358 C CG . LYS 64 64 ? A 7.376 5.348 -25.537 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 359 C CD . LYS 64 64 ? A 7.847 5.412 -24.078 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 360 C CE . LYS 64 64 ? A 8.920 4.361 -23.764 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 361 N NZ . LYS 64 64 ? A 9.351 4.475 -22.352 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 362 N N . ARG 65 65 ? A 4.089 4.571 -27.243 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 363 C CA . ARG 65 65 ? A 3.504 3.275 -27.552 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 364 C C . ARG 65 65 ? A 3.124 3.082 -29.022 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 365 O O . ARG 65 65 ? A 3.049 1.978 -29.527 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 366 C CB . ARG 65 65 ? A 2.192 3.148 -26.738 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 367 C CG . ARG 65 65 ? A 1.454 1.792 -26.876 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 368 C CD . ARG 65 65 ? A 0.035 1.729 -26.290 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 369 N NE . ARG 65 65 ? A -0.822 2.705 -27.072 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 370 C CZ . ARG 65 65 ? A -1.288 3.892 -26.648 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 371 N NH1 . ARG 65 65 ? A -1.036 4.362 -25.434 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 372 N NH2 . ARG 65 65 ? A -1.998 4.668 -27.466 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 373 N N . ARG 66 66 ? A 2.805 4.192 -29.720 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 374 C CA . ARG 66 66 ? A 2.556 4.211 -31.146 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 375 C C . ARG 66 66 ? A 3.771 3.913 -32.022 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 376 O O . ARG 66 66 ? A 3.625 3.374 -33.117 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 377 C CB . ARG 66 66 ? A 2.016 5.618 -31.514 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 378 C CG . ARG 66 66 ? A 1.565 5.784 -32.981 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 379 C CD . ARG 66 66 ? A 1.032 7.183 -33.314 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 380 N NE . ARG 66 66 ? A 2.191 8.072 -33.587 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 381 C CZ . ARG 66 66 ? A 2.855 8.187 -34.735 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 382 N NH1 . ARG 66 66 ? A 2.571 7.399 -35.766 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 383 N NH2 . ARG 66 66 ? A 3.797 9.116 -34.848 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 384 N N . ARG 67 67 ? 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B 8.237 30.192 -31.296 1 1 B ASN 0.670 1 ATOM 539 N ND2 . ASN 38 38 ? B 8.437 30.432 -33.508 1 1 B ASN 0.670 1 ATOM 540 N N . ALA 39 39 ? B 4.201 27.044 -32.602 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 541 C CA . ALA 39 39 ? B 2.830 26.567 -32.617 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 542 C C . ALA 39 39 ? B 2.496 25.660 -31.432 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 543 O O . ALA 39 39 ? B 1.443 25.785 -30.806 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 544 C CB . ALA 39 39 ? B 2.580 25.791 -33.930 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 545 N N . SER 40 40 ? B 3.430 24.752 -31.071 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 546 C CA . SER 40 40 ? B 3.347 23.913 -29.880 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 547 C C . SER 40 40 ? B 3.303 24.690 -28.568 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 548 O O . SER 40 40 ? B 2.510 24.357 -27.688 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 549 C CB . SER 40 40 ? B 4.522 22.909 -29.736 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 550 O OG . SER 40 40 ? B 4.452 21.838 -30.677 1 1 B SER 0.640 1 ATOM 551 N N . ASP 41 41 ? B 4.136 25.742 -28.397 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 552 C CA . ASP 41 41 ? 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B 2.009 30.600 -31.606 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 567 N N . ALA 43 43 ? B -0.162 26.556 -28.435 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 568 C CA . ALA 43 43 ? B -1.180 25.596 -28.073 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 569 C C . ALA 43 43 ? B -1.209 25.280 -26.580 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 570 O O . ALA 43 43 ? B -2.260 25.278 -25.959 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 571 C CB . ALA 43 43 ? B -0.983 24.310 -28.904 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 572 N N . ARG 44 44 ? B -0.031 25.068 -25.957 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 573 C CA . ARG 44 44 ? B 0.065 24.818 -24.535 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 574 C C . ARG 44 44 ? B -0.314 26.006 -23.646 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 575 O O . ARG 44 44 ? B -1.011 25.843 -22.651 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 576 C CB . ARG 44 44 ? B 1.510 24.402 -24.187 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 577 C CG . ARG 44 44 ? B 1.965 23.027 -24.717 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 578 C CD . ARG 44 44 ? B 3.437 22.753 -24.373 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 579 N NE . ARG 44 44 ? B 3.796 21.408 -24.941 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 580 C CZ . ARG 44 44 ? B 5.037 20.896 -24.915 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 581 N NH1 . ARG 44 44 ? B 6.042 21.557 -24.358 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 582 N NH2 . ARG 44 44 ? B 5.298 19.700 -25.443 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 583 N N . GLU 45 45 ? B 0.129 27.241 -23.967 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 584 C CA . GLU 45 45 ? B -0.291 28.436 -23.252 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 585 C C . GLU 45 45 ? B -1.776 28.720 -23.381 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 586 O O . GLU 45 45 ? B -2.452 28.983 -22.394 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 587 C CB . GLU 45 45 ? B 0.532 29.658 -23.706 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 588 C CG . GLU 45 45 ? B 2.002 29.588 -23.228 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 589 C CD . GLU 45 45 ? B 2.836 30.796 -23.643 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 590 O OE1 . GLU 45 45 ? B 2.353 31.641 -24.432 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 591 O OE2 . GLU 45 45 ? B 3.972 30.865 -23.107 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 592 N N . ASN 46 46 ? B -2.346 28.587 -24.595 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 593 C CA . ASN 46 46 ? B -3.777 28.717 -24.806 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 594 C C . ASN 46 46 ? B -4.625 27.692 -24.054 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 595 O O . ASN 46 46 ? B -5.692 28.023 -23.543 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 596 C CB . ASN 46 46 ? B -4.126 28.615 -26.311 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 597 C CG . ASN 46 46 ? B -3.657 29.876 -27.038 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 598 O OD1 . ASN 46 46 ? B -3.486 30.931 -26.473 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 599 N ND2 . ASN 46 46 ? B -3.505 29.754 -28.385 1 1 B ASN 0.630 1 ATOM 600 N N . ASP 47 47 ? B -4.181 26.419 -23.969 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 601 C CA . ASP 47 47 ? B -4.842 25.398 -23.193 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 602 C C . ASP 47 47 ? B -4.860 25.699 -21.696 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 603 O O . ASP 47 47 ? B -5.889 25.674 -21.025 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 604 C CB . ASP 47 47 ? B -4.131 24.060 -23.486 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 605 C CG . ASP 47 47 ? B -5.191 23.008 -23.304 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 606 O OD1 . ASP 47 47 ? B -5.050 22.142 -22.413 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 607 O OD2 . ASP 47 47 ? B -6.201 23.141 -24.057 1 1 B ASP 0.570 1 ATOM 608 N N . ARG 48 48 ? B -3.690 26.113 -21.171 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 609 C CA . ARG 48 48 ? B -3.553 26.587 -19.811 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 610 C C . ARG 48 48 ? B -4.356 27.835 -19.498 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 611 O O . ARG 48 48 ? B -4.935 27.921 -18.420 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 612 C CB . ARG 48 48 ? B -2.078 26.802 -19.419 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 613 C CG . ARG 48 48 ? B -1.306 25.471 -19.323 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 614 C CD . ARG 48 48 ? B 0.047 25.578 -18.610 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 615 N NE . ARG 48 48 ? B 0.925 26.503 -19.418 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 616 C CZ . ARG 48 48 ? B 1.730 26.069 -20.399 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 617 N NH1 . ARG 48 48 ? B 1.838 24.771 -20.659 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 618 N NH2 . ARG 48 48 ? B 2.432 26.948 -21.124 1 1 B ARG 0.500 1 ATOM 619 N N . LEU 49 49 ? B -4.468 28.818 -20.418 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 620 C CA . LEU 49 49 ? B -5.355 29.958 -20.247 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 621 C C . LEU 49 49 ? B -6.812 29.541 -20.058 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 622 O O . LEU 49 49 ? 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B -5.427 28.826 -15.358 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 651 C CG . GLU 52 52 ? B -4.210 27.913 -15.101 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 652 C CD . GLU 52 52 ? B -4.238 27.419 -13.664 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 653 O OE1 . GLU 52 52 ? B -4.215 28.278 -12.734 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 654 O OE2 . GLU 52 52 ? B -4.204 26.191 -13.458 1 1 B GLU 0.520 1 ATOM 655 N N . THR 53 53 ? B -8.575 29.515 -16.152 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 656 C CA . THR 53 53 ? B -9.841 30.251 -16.036 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 657 C C . THR 53 53 ? B -10.930 29.402 -15.422 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 658 O O . THR 53 53 ? B -11.677 29.849 -14.557 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 659 C CB . THR 53 53 ? B -10.336 30.806 -17.366 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 660 O OG1 . THR 53 53 ? B -9.480 31.856 -17.768 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 661 C CG2 . THR 53 53 ? B -11.719 31.469 -17.298 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 662 N N . LYS 54 54 ? B -11.023 28.115 -15.816 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 663 C CA . LYS 54 54 ? B -11.921 27.171 -15.180 1 1 B LYS 0.680 1 ATOM 664 C C . LYS 54 54 ? 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B -15.373 30.962 1.994 1 1 B ARG 0.560 1 ATOM 777 N NH1 . ARG 66 66 ? B -15.174 30.321 0.860 1 1 B ARG 0.560 1 ATOM 778 N NH2 . ARG 66 66 ? B -14.571 31.987 2.281 1 1 B ARG 0.560 1 ATOM 779 N N . ARG 67 67 ? B -20.491 33.258 0.762 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 780 C CA . ARG 67 67 ? B -20.603 34.548 1.404 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 781 C C . ARG 67 67 ? B -21.770 35.410 0.862 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 782 O O . ARG 67 67 ? B -22.535 34.950 -0.021 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 783 C CB . ARG 67 67 ? B -19.329 35.362 1.099 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 784 C CG . ARG 67 67 ? B -18.024 34.787 1.670 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 785 C CD . ARG 67 67 ? B -16.842 35.636 1.200 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 786 N NE . ARG 67 67 ? B -15.595 35.189 1.924 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 787 C CZ . ARG 67 67 ? B -14.675 36.019 2.430 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 788 N NH1 . ARG 67 67 ? B -14.840 37.335 2.397 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 789 N NH2 . ARG 67 67 ? B -13.510 35.538 2.866 1 1 B ARG 0.540 1 ATOM 790 O OXT . ARG 67 67 ? B -21.866 36.582 1.328 1 1 B ARG 0.540 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 4 QSQE 'Global Quaternary Structure Quality Estimate predicts the expected accuracy of the modelled interfaces.' 'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.586 2 1 3 0.013 3 1 4 0.087 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 21 GLN 1 0.420 2 1 A 22 TYR 1 0.440 3 1 A 23 ILE 1 0.510 4 1 A 24 GLU 1 0.530 5 1 A 25 ASP 1 0.530 6 1 A 26 MET 1 0.520 7 1 A 27 GLY 1 0.590 8 1 A 28 MET 1 0.530 9 1 A 29 LYS 1 0.540 10 1 A 30 ALA 1 0.550 11 1 A 31 TYR 1 0.490 12 1 A 32 ASP 1 0.560 13 1 A 33 GLY 1 0.560 14 1 A 34 LEU 1 0.520 15 1 A 35 VAL 1 0.670 16 1 A 36 ILE 1 0.610 17 1 A 37 GLN 1 0.700 18 1 A 38 ASN 1 0.650 19 1 A 39 ALA 1 0.720 20 1 A 40 SER 1 0.630 21 1 A 41 ASP 1 0.570 22 1 A 42 ILE 1 0.630 23 1 A 43 ALA 1 0.690 24 1 A 44 ARG 1 0.520 25 1 A 45 GLU 1 0.560 26 1 A 46 ASN 1 0.620 27 1 A 47 ASP 1 0.560 28 1 A 48 ARG 1 0.480 29 1 A 49 LEU 1 0.530 30 1 A 50 ARG 1 0.540 31 1 A 51 ASN 1 0.550 32 1 A 52 GLU 1 0.530 33 1 A 53 THR 1 0.670 34 1 A 54 LYS 1 0.680 35 1 A 55 LEU 1 0.560 36 1 A 56 ALA 1 0.630 37 1 A 57 TYR 1 0.650 38 1 A 58 LEU 1 0.620 39 1 A 59 LYS 1 0.620 40 1 A 60 GLU 1 0.610 41 1 A 61 LYS 1 0.630 42 1 A 62 ASN 1 0.640 43 1 A 63 GLU 1 0.620 44 1 A 64 LYS 1 0.620 45 1 A 65 ARG 1 0.530 46 1 A 66 ARG 1 0.560 47 1 A 67 ARG 1 0.540 48 1 B 21 GLN 1 0.450 49 1 B 22 TYR 1 0.460 50 1 B 23 ILE 1 0.560 51 1 B 24 GLU 1 0.570 52 1 B 25 ASP 1 0.580 53 1 B 26 MET 1 0.510 54 1 B 27 GLY 1 0.630 55 1 B 28 MET 1 0.540 56 1 B 29 LYS 1 0.540 57 1 B 30 ALA 1 0.550 58 1 B 31 TYR 1 0.520 59 1 B 32 ASP 1 0.620 60 1 B 33 GLY 1 0.550 61 1 B 34 LEU 1 0.530 62 1 B 35 VAL 1 0.690 63 1 B 36 ILE 1 0.650 64 1 B 37 GLN 1 0.710 65 1 B 38 ASN 1 0.670 66 1 B 39 ALA 1 0.740 67 1 B 40 SER 1 0.640 68 1 B 41 ASP 1 0.590 69 1 B 42 ILE 1 0.660 70 1 B 43 ALA 1 0.700 71 1 B 44 ARG 1 0.540 72 1 B 45 GLU 1 0.570 73 1 B 46 ASN 1 0.630 74 1 B 47 ASP 1 0.570 75 1 B 48 ARG 1 0.500 76 1 B 49 LEU 1 0.540 77 1 B 50 ARG 1 0.540 78 1 B 51 ASN 1 0.550 79 1 B 52 GLU 1 0.520 80 1 B 53 THR 1 0.650 81 1 B 54 LYS 1 0.680 82 1 B 55 LEU 1 0.540 83 1 B 56 ALA 1 0.630 84 1 B 57 TYR 1 0.660 85 1 B 58 LEU 1 0.640 86 1 B 59 LYS 1 0.620 87 1 B 60 GLU 1 0.620 88 1 B 61 LYS 1 0.640 89 1 B 62 ASN 1 0.650 90 1 B 63 GLU 1 0.630 91 1 B 64 LYS 1 0.630 92 1 B 65 ARG 1 0.540 93 1 B 66 ARG 1 0.560 94 1 B 67 ARG 1 0.540 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #