data_SMR-25cbc77d251ad5e8be0b499dd91535ef_1 _entry.id SMR-25cbc77d251ad5e8be0b499dd91535ef_1 _struct.entry_id SMR-25cbc77d251ad5e8be0b499dd91535ef_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - F1M3L7/ EPS8_RAT, Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries F1M3L7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 106844.041 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP EPS8_RAT F1M3L7 1 ;MNGHMSNHSSGYGIYPSQMNGYGSSPPYSQMDREHCSRTSAKALYEQRKNYARDSVSSVSDVSQYRVEHL TTFVLDRKDAMITVDDGIRKLKLLDAKGKVWTQDMILQVDDRAVSLIDLESKNELENFPLNTIQHCQAVA HTCSYDSILALVCKEPTQNKPDLHLFQCDEVKANLISEDIESAISDSKGGKQKRRPEALRMIAKADPGIP PPPRAPAPVPPGTVTQVDVRSRVAAWSAWAADQGDFEKPRQYHEQEETPEMMAARIDRDVQILNHILDDI EFFITKLQKAAEAFSELSKRKKSKKSKRKGPGEGVLTLRAKPPPPDEFVDCFQKFKHGFNLLAKLKSHIQ NPSASDLVHFLFTPLNMVVQATGGPELASSVLSPLLTKDTVDFLNYTVKAEERQLWMSLGETWMKVRAEW PKEQFIPPYVPRFRNGWEPPMLNFMGAPTEQDMYQLAESVANAAEQQRKQDSKRQSTEHSSMSDYPPADG YTFSNSMYHRGPHVDQGEAALALKSTPNRHVDRNYDPVKTQPKKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEI LDDRKQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPESGVGRTDPPYTHTIQKQRTEYGPRSADTPSAPSPPPTP APVPVPLPPSAPAPVPVPKVPANVTRQNSSSSESGGSIARDSQRYKQLPVDRRKSQMEEVQDELFQRLTI GRSAAQRKFHVPRQNVPVINITYDSSPEEVKTWLQSKGFNPVTVSSLGVLNGAQLFSLNKDELRSVCPEG ARVFSQITVQKAALEDSSGSSELQEIMRRRQEKISAAASDSGVESFDEGSSH ; 'Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 822 1 822 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . EPS8_RAT F1M3L7 . 1 822 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2013-04-03 48936318B28BF162 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MNGHMSNHSSGYGIYPSQMNGYGSSPPYSQMDREHCSRTSAKALYEQRKNYARDSVSSVSDVSQYRVEHL TTFVLDRKDAMITVDDGIRKLKLLDAKGKVWTQDMILQVDDRAVSLIDLESKNELENFPLNTIQHCQAVA HTCSYDSILALVCKEPTQNKPDLHLFQCDEVKANLISEDIESAISDSKGGKQKRRPEALRMIAKADPGIP PPPRAPAPVPPGTVTQVDVRSRVAAWSAWAADQGDFEKPRQYHEQEETPEMMAARIDRDVQILNHILDDI EFFITKLQKAAEAFSELSKRKKSKKSKRKGPGEGVLTLRAKPPPPDEFVDCFQKFKHGFNLLAKLKSHIQ NPSASDLVHFLFTPLNMVVQATGGPELASSVLSPLLTKDTVDFLNYTVKAEERQLWMSLGETWMKVRAEW PKEQFIPPYVPRFRNGWEPPMLNFMGAPTEQDMYQLAESVANAAEQQRKQDSKRQSTEHSSMSDYPPADG YTFSNSMYHRGPHVDQGEAALALKSTPNRHVDRNYDPVKTQPKKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEI LDDRKQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPESGVGRTDPPYTHTIQKQRTEYGPRSADTPSAPSPPPTP APVPVPLPPSAPAPVPVPKVPANVTRQNSSSSESGGSIARDSQRYKQLPVDRRKSQMEEVQDELFQRLTI GRSAAQRKFHVPRQNVPVINITYDSSPEEVKTWLQSKGFNPVTVSSLGVLNGAQLFSLNKDELRSVCPEG ARVFSQITVQKAALEDSSGSSELQEIMRRRQEKISAAASDSGVESFDEGSSH ; ;MNGHMSNHSSGYGIYPSQMNGYGSSPPYSQMDREHCSRTSAKALYEQRKNYARDSVSSVSDVSQYRVEHL TTFVLDRKDAMITVDDGIRKLKLLDAKGKVWTQDMILQVDDRAVSLIDLESKNELENFPLNTIQHCQAVA HTCSYDSILALVCKEPTQNKPDLHLFQCDEVKANLISEDIESAISDSKGGKQKRRPEALRMIAKADPGIP PPPRAPAPVPPGTVTQVDVRSRVAAWSAWAADQGDFEKPRQYHEQEETPEMMAARIDRDVQILNHILDDI EFFITKLQKAAEAFSELSKRKKSKKSKRKGPGEGVLTLRAKPPPPDEFVDCFQKFKHGFNLLAKLKSHIQ NPSASDLVHFLFTPLNMVVQATGGPELASSVLSPLLTKDTVDFLNYTVKAEERQLWMSLGETWMKVRAEW PKEQFIPPYVPRFRNGWEPPMLNFMGAPTEQDMYQLAESVANAAEQQRKQDSKRQSTEHSSMSDYPPADG YTFSNSMYHRGPHVDQGEAALALKSTPNRHVDRNYDPVKTQPKKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEI LDDRKQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPESGVGRTDPPYTHTIQKQRTEYGPRSADTPSAPSPPPTP APVPVPLPPSAPAPVPVPKVPANVTRQNSSSSESGGSIARDSQRYKQLPVDRRKSQMEEVQDELFQRLTI GRSAAQRKFHVPRQNVPVINITYDSSPEEVKTWLQSKGFNPVTVSSLGVLNGAQLFSLNKDELRSVCPEG ARVFSQITVQKAALEDSSGSSELQEIMRRRQEKISAAASDSGVESFDEGSSH ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 GLY . 1 4 HIS . 1 5 MET . 1 6 SER . 1 7 ASN . 1 8 HIS . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 GLY . 1 12 TYR . 1 13 GLY . 1 14 ILE . 1 15 TYR . 1 16 PRO . 1 17 SER . 1 18 GLN . 1 19 MET . 1 20 ASN . 1 21 GLY . 1 22 TYR . 1 23 GLY . 1 24 SER . 1 25 SER . 1 26 PRO . 1 27 PRO . 1 28 TYR . 1 29 SER . 1 30 GLN . 1 31 MET . 1 32 ASP . 1 33 ARG . 1 34 GLU . 1 35 HIS . 1 36 CYS . 1 37 SER . 1 38 ARG . 1 39 THR . 1 40 SER . 1 41 ALA . 1 42 LYS . 1 43 ALA . 1 44 LEU . 1 45 TYR . 1 46 GLU . 1 47 GLN . 1 48 ARG . 1 49 LYS . 1 50 ASN . 1 51 TYR . 1 52 ALA . 1 53 ARG . 1 54 ASP . 1 55 SER . 1 56 VAL . 1 57 SER . 1 58 SER . 1 59 VAL . 1 60 SER . 1 61 ASP . 1 62 VAL . 1 63 SER . 1 64 GLN . 1 65 TYR . 1 66 ARG . 1 67 VAL . 1 68 GLU . 1 69 HIS . 1 70 LEU . 1 71 THR . 1 72 THR . 1 73 PHE . 1 74 VAL . 1 75 LEU . 1 76 ASP . 1 77 ARG . 1 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163 LEU . 1 164 HIS . 1 165 LEU . 1 166 PHE . 1 167 GLN . 1 168 CYS . 1 169 ASP . 1 170 GLU . 1 171 VAL . 1 172 LYS . 1 173 ALA . 1 174 ASN . 1 175 LEU . 1 176 ILE . 1 177 SER . 1 178 GLU . 1 179 ASP . 1 180 ILE . 1 181 GLU . 1 182 SER . 1 183 ALA . 1 184 ILE . 1 185 SER . 1 186 ASP . 1 187 SER . 1 188 LYS . 1 189 GLY . 1 190 GLY . 1 191 LYS . 1 192 GLN . 1 193 LYS . 1 194 ARG . 1 195 ARG . 1 196 PRO . 1 197 GLU . 1 198 ALA . 1 199 LEU . 1 200 ARG . 1 201 MET . 1 202 ILE . 1 203 ALA . 1 204 LYS . 1 205 ALA . 1 206 ASP . 1 207 PRO . 1 208 GLY . 1 209 ILE . 1 210 PRO . 1 211 PRO . 1 212 PRO . 1 213 PRO . 1 214 ARG . 1 215 ALA . 1 216 PRO . 1 217 ALA . 1 218 PRO . 1 219 VAL . 1 220 PRO . 1 221 PRO . 1 222 GLY . 1 223 THR . 1 224 VAL . 1 225 THR . 1 226 GLN . 1 227 VAL . 1 228 ASP . 1 229 VAL . 1 230 ARG . 1 231 SER . 1 232 ARG . 1 233 VAL . 1 234 ALA . 1 235 ALA . 1 236 TRP . 1 237 SER . 1 238 ALA . 1 239 TRP . 1 240 ALA . 1 241 ALA . 1 242 ASP . 1 243 GLN . 1 244 GLY . 1 245 ASP . 1 246 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'EPS8 {PDB ID=1aoj, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1aoj.1.A}' 'template structure' . 2 'EPS8 {PDB ID=1aoj, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=1aoj.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 1aoj, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 1aoj, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE 2 KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 60 2 2 1 60 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1aoj 2024-05-22 2 PDB . 1aoj 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 822 2 2 B 1 822 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 822 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 822 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.93e-33 98.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 1.93e-33 98.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNGHMSNHSSGYGIYPSQMNGYGSSPPYSQMDREHCSRTSAKALYEQRKNYARDSVSSVSDVSQYRVEHLTTFVLDRKDAMITVDDGIRKLKLLDAKGKVWTQDMILQVDDRAVSLIDLESKNELENFPLNTIQHCQAVAHTCSYDSILALVCKEPTQNKPDLHLFQCDEVKANLISEDIESAISDSKGGKQKRRPEALRMIAKADPGIPPPPRAPAPVPPGTVTQVDVRSRVAAWSAWAADQGDFEKPRQYHEQEETPEMMAARIDRDVQILNHILDDIEFFITKLQKAAEAFSELSKRKKSKKSKRKGPGEGVLTLRAKPPPPDEFVDCFQKFKHGFNLLAKLKSHIQNPSASDLVHFLFTPLNMVVQATGGPELASSVLSPLLTKDTVDFLNYTVKAEERQLWMSLGETWMKVRAEWPKEQFIPPYVPRFRNGWEPPMLNFMGAPTEQDMYQLAESVANAAEQQRKQDSKRQSTEHSSMSDYPPADGYTFSNSMYHRGPHVDQGEAALALKSTPNRHVDRNYDPVKTQPKKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRKQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPESGVGRTDPPYTHTIQKQRTEYGPRSADTPSAPSPPPTPAPVPVPLPPSAPAPVPVPKVPANVTRQNSSSSESGGSIARDSQRYKQLPVDRRKSQMEEVQDELFQRLTIGRSAAQRKFHVPRQNVPVINITYDSSPEEVKTWLQSKGFNPVTVSSLGVLNGAQLFSLNKDELRSVCPEGARVFSQITVQKAALEDSSGSSELQEIMRRRQEKISAAASDSGVESFDEGSSH 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MNGHMSNHSSGYGIYPSQMNGYGSSPPYSQMDREHCSRTSAKALYEQRKNYARDSVSSVSDVSQYRVEHLTTFVLDRKDAMITVDDGIRKLKLLDAKGKVWTQDMILQVDDRAVSLIDLESKNELENFPLNTIQHCQAVAHTCSYDSILALVCKEPTQNKPDLHLFQCDEVKANLISEDIESAISDSKGGKQKRRPEALRMIAKADPGIPPPPRAPAPVPPGTVTQVDVRSRVAAWSAWAADQGDFEKPRQYHEQEETPEMMAARIDRDVQILNHILDDIEFFITKLQKAAEAFSELSKRKKSKKSKRKGPGEGVLTLRAKPPPPDEFVDCFQKFKHGFNLLAKLKSHIQNPSASDLVHFLFTPLNMVVQATGGPELASSVLSPLLTKDTVDFLNYTVKAEERQLWMSLGETWMKVRAEWPKEQFIPPYVPRFRNGWEPPMLNFMGAPTEQDMYQLAESVANAAEQQRKQDSKRQSTEHSSMSDYPPADGYTFSNSMYHRGPHVDQGEAALALKSTPNRHVDRNYDPVKTQPKKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRKQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPESGVGRTDPPYTHTIQKQRTEYGPRSADTPSAPSPPPTPAPVPVPLPPSAPAPVPVPKVPANVTRQNSSSSESGGSIARDSQRYKQLPVDRRKSQMEEVQDELFQRLTIGRSAAQRKFHVPRQNVPVINITYDSSPEEVKTWLQSKGFNPVTVSSLGVLNGAQLFSLNKDELRSVCPEGARVFSQITVQKAALEDSSGSSELQEIMRRRQEKISAAASDSGVESFDEGSSH 4 2 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KKYAKSKYDFVARNSSELSVMKDDVLEILDDRRQWWKVRNASGDSGFVPNNILDIMRTPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.366}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1aoj.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 533 533 ? A 1.185 -1.146 -19.744 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 2 C CA . LYS 533 533 ? A 0.589 -1.100 -18.373 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 3 C C . LYS 533 533 ? A 0.768 -2.441 -17.727 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 4 O O . LYS 533 533 ? A 1.136 -3.393 -18.413 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 5 C CB . LYS 533 533 ? A -0.888 -0.630 -18.382 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 6 C CG . LYS 533 533 ? A -1.764 -1.027 -19.576 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 7 C CD . LYS 533 533 ? A -3.227 -0.550 -19.436 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 8 C CE . LYS 533 533 ? A -3.477 0.936 -19.131 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 9 N NZ . LYS 533 533 ? A -2.689 1.809 -20.027 1 1 A LYS 0.380 1 ATOM 10 N N . LYS 534 534 ? A 0.583 -2.535 -16.406 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 11 C CA . LYS 534 534 ? A 0.868 -3.753 -15.676 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 12 C C . LYS 534 534 ? A -0.406 -4.333 -15.164 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 13 O O . LYS 534 534 ? A -1.239 -3.632 -14.608 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 14 C CB . LYS 534 534 ? A 1.808 -3.536 -14.460 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 15 C CG . LYS 534 534 ? A 2.294 -4.825 -13.762 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 16 C CD . LYS 534 534 ? A 3.487 -5.463 -14.497 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 17 C CE . LYS 534 534 ? A 4.855 -4.886 -14.117 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 18 N NZ . LYS 534 534 ? A 5.949 -5.815 -14.473 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 19 N N . TYR 535 535 ? A -0.580 -5.642 -15.328 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 20 C CA . TYR 535 535 ? A -1.759 -6.315 -14.851 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 21 C C . TYR 535 535 ? A -1.415 -7.410 -13.869 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 22 O O . TYR 535 535 ? A -0.409 -8.109 -13.981 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 23 C CB . TYR 535 535 ? A -2.578 -6.912 -16.016 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 24 C CG . TYR 535 535 ? A -3.297 -5.832 -16.784 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 25 C CD1 . TYR 535 535 ? A -4.390 -5.173 -16.196 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 26 C CD2 . TYR 535 535 ? A -2.922 -5.481 -18.095 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 27 C CE1 . TYR 535 535 ? A -5.097 -4.188 -16.899 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 28 C CE2 . TYR 535 535 ? A -3.634 -4.500 -18.803 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 29 C CZ . TYR 535 535 ? A -4.727 -3.862 -18.206 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 30 O OH . TYR 535 535 ? A -5.466 -2.909 -18.938 1 1 A TYR 0.700 1 ATOM 31 N N . ALA 536 536 ? A -2.277 -7.592 -12.862 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 32 C CA . ALA 536 536 ? A -2.190 -8.703 -11.953 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 33 C C . ALA 536 536 ? A -3.560 -9.303 -11.804 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 34 O O . ALA 536 536 ? A -4.569 -8.605 -11.837 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 35 C CB . ALA 536 536 ? A -1.641 -8.307 -10.573 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 36 N N . LYS 537 537 ? A -3.635 -10.628 -11.646 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 37 C CA . LYS 537 537 ? A -4.888 -11.300 -11.415 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 38 C C . LYS 537 537 ? A -4.952 -11.745 -9.976 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 39 O O . LYS 537 537 ? A -4.065 -12.413 -9.455 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 40 C CB . LYS 537 537 ? A -5.125 -12.475 -12.393 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 41 C CG . LYS 537 537 ? A -6.558 -13.030 -12.319 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 42 C CD . LYS 537 537 ? A -6.908 -14.079 -13.387 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 43 C CE . LYS 537 537 ? A -6.167 -15.411 -13.236 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 44 N NZ . LYS 537 537 ? A -6.331 -15.946 -11.880 1 1 A LYS 0.790 1 ATOM 45 N N . SER 538 538 ? A -6.013 -11.347 -9.268 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 46 C CA . SER 538 538 ? A -6.230 -11.747 -7.893 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 47 C C . SER 538 538 ? A -6.458 -13.245 -7.726 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 48 O O . SER 538 538 ? A -7.219 -13.874 -8.462 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 49 C CB . SER 538 538 ? A -7.397 -10.984 -7.251 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 50 O OG . SER 538 538 ? A -7.318 -11.089 -5.832 1 1 A SER 0.810 1 ATOM 51 N N . LYS 539 539 ? A -5.787 -13.874 -6.751 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 52 C CA . LYS 539 539 ? A -5.813 -15.314 -6.589 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 53 C C . LYS 539 539 ? A -6.812 -15.748 -5.531 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 54 O O . LYS 539 539 ? A -7.217 -16.910 -5.462 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 55 C CB . LYS 539 539 ? A -4.394 -15.782 -6.199 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 56 C CG . LYS 539 539 ? A -4.019 -17.173 -6.727 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 57 C CD . LYS 539 539 ? A -3.499 -18.108 -5.633 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 58 C CE . LYS 539 539 ? A -2.598 -19.206 -6.186 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 59 N NZ . LYS 539 539 ? A -2.337 -20.188 -5.117 1 1 A LYS 0.730 1 ATOM 60 N N . TYR 540 540 ? A -7.276 -14.787 -4.718 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 61 C CA . TYR 540 540 ? A -8.194 -15.008 -3.626 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 62 C C . TYR 540 540 ? A -9.031 -13.763 -3.501 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 63 O O . TYR 540 540 ? A -8.692 -12.705 -4.030 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 64 C CB . TYR 540 540 ? A -7.476 -15.179 -2.254 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 65 C CG . TYR 540 540 ? A -6.519 -16.346 -2.248 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 66 C CD1 . TYR 540 540 ? A -6.972 -17.669 -2.114 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 67 C CD2 . TYR 540 540 ? A -5.140 -16.120 -2.374 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 68 C CE1 . TYR 540 540 ? A -6.064 -18.742 -2.144 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 69 C CE2 . TYR 540 540 ? A -4.228 -17.185 -2.389 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 70 C CZ . TYR 540 540 ? A -4.690 -18.502 -2.270 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 71 O OH . TYR 540 540 ? 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A -11.382 5.561 3.848 1 1 A SER 0.680 1 ATOM 128 N N . SER 548 548 ? A -8.994 3.452 2.104 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 129 C CA . SER 548 548 ? A -7.784 3.419 1.304 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 130 C C . SER 548 548 ? A -7.408 2.033 0.789 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 131 O O . SER 548 548 ? A -6.537 1.900 -0.070 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 132 C CB . SER 548 548 ? A -6.563 3.882 2.129 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 133 O OG . SER 548 548 ? A -6.777 5.193 2.643 1 1 A SER 0.740 1 ATOM 134 N N . GLU 549 549 ? A -8.051 0.959 1.288 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 135 C CA . GLU 549 549 ? A -7.815 -0.420 0.875 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 136 C C . GLU 549 549 ? A -8.907 -0.770 -0.159 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 137 O O . GLU 549 549 ? A -10.055 -0.361 -0.006 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 138 C CB . GLU 549 549 ? A -7.817 -1.412 2.104 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 139 C CG . GLU 549 549 ? A -6.842 -1.085 3.296 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 140 C CD . GLU 549 549 ? A -6.823 -2.092 4.445 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 141 O OE1 . GLU 549 549 ? 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A -12.595 -8.443 -10.253 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 196 O OD2 . ASP 556 556 ? A -12.318 -8.164 -8.070 1 1 A ASP 0.710 1 ATOM 197 N N . VAL 557 557 ? A -9.090 -8.818 -12.200 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 198 C CA . VAL 557 557 ? A -7.901 -8.418 -12.931 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 199 C C . VAL 557 557 ? A -7.668 -6.951 -12.658 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 200 O O . VAL 557 557 ? A -8.497 -6.089 -12.946 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 201 C CB . VAL 557 557 ? A -7.961 -8.717 -14.425 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 202 C CG1 . VAL 557 557 ? A -6.584 -8.474 -15.077 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 203 C CG2 . VAL 557 557 ? A -8.370 -10.189 -14.625 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 204 N N . LEU 558 558 ? A -6.520 -6.647 -12.034 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 205 C CA . LEU 558 558 ? A -6.218 -5.352 -11.475 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 206 C C . LEU 558 558 ? A -5.055 -4.727 -12.219 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 207 O O . LEU 558 558 ? A -4.096 -5.405 -12.585 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 208 C CB . LEU 558 558 ? A -5.819 -5.447 -9.975 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 209 C CG . LEU 558 558 ? A -6.910 -5.886 -8.973 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 210 C CD1 . LEU 558 558 ? A -8.246 -5.170 -9.201 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 211 C CD2 . LEU 558 558 ? A -7.106 -7.403 -8.957 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 212 N N . GLU 559 559 ? A -5.103 -3.402 -12.459 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 213 C CA . GLU 559 559 ? A -4.018 -2.671 -13.101 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 214 C C . GLU 559 559 ? A -3.044 -2.171 -12.046 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 215 O O . GLU 559 559 ? A -3.452 -1.529 -11.083 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 216 C CB . GLU 559 559 ? A -4.568 -1.491 -13.945 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 217 C CG . GLU 559 559 ? A -3.839 -1.218 -15.289 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 218 C CD . GLU 559 559 ? A -3.337 0.218 -15.447 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 219 O OE1 . GLU 559 559 ? A -4.151 1.159 -15.261 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 220 O OE2 . GLU 559 559 ? A -2.160 0.401 -15.857 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 221 N N . ILE 560 560 ? A -1.735 -2.475 -12.148 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 222 C CA . ILE 560 560 ? A -0.780 -2.088 -11.114 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 223 C C . ILE 560 560 ? A -0.183 -0.742 -11.429 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 224 O O . ILE 560 560 ? A 0.560 -0.538 -12.389 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 225 C CB . ILE 560 560 ? A 0.329 -3.085 -10.809 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 226 C CG1 . ILE 560 560 ? A -0.242 -4.452 -10.397 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 227 C CG2 . ILE 560 560 ? A 1.200 -2.549 -9.648 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 228 C CD1 . ILE 560 560 ? A 0.808 -5.546 -10.550 1 1 A ILE 0.770 1 ATOM 229 N N . LEU 561 561 ? A -0.510 0.215 -10.559 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 230 C CA . LEU 561 561 ? A -0.114 1.588 -10.657 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 231 C C . LEU 561 561 ? A 1.201 1.801 -9.931 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 232 O O . LEU 561 561 ? A 1.663 0.941 -9.181 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 233 C CB . LEU 561 561 ? A -1.206 2.493 -10.039 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 234 C CG . LEU 561 561 ? A -2.641 2.214 -10.544 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 235 C CD1 . LEU 561 561 ? A -3.653 2.744 -9.520 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 236 C CD2 . LEU 561 561 ? A -2.901 2.793 -11.940 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 237 N N . ASP 562 562 ? A 1.848 2.966 -10.158 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 238 C CA . ASP 562 562 ? A 3.045 3.373 -9.438 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 239 C C . ASP 562 562 ? A 4.204 2.395 -9.619 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 240 O O . ASP 562 562 ? A 4.905 2.035 -8.684 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 241 C CB . ASP 562 562 ? A 2.663 3.618 -7.954 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 242 C CG . ASP 562 562 ? A 3.302 4.872 -7.412 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 243 O OD1 . ASP 562 562 ? A 3.144 5.943 -8.063 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 244 O OD2 . ASP 562 562 ? A 3.891 4.815 -6.307 1 1 A ASP 0.630 1 ATOM 245 N N . ASP 563 563 ? A 4.368 1.907 -10.865 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 246 C CA . ASP 563 563 ? A 5.324 0.923 -11.350 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 247 C C . ASP 563 563 ? A 5.733 -0.176 -10.366 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 248 O O . ASP 563 563 ? A 6.905 -0.390 -10.050 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 249 C CB . ASP 563 563 ? A 6.528 1.582 -12.067 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 250 C CG . ASP 563 563 ? A 7.139 0.634 -13.094 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 251 O OD1 . ASP 563 563 ? A 6.587 -0.486 -13.302 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 252 O OD2 . ASP 563 563 ? A 8.164 1.031 -13.696 1 1 A ASP 0.560 1 ATOM 253 N N . ARG 564 564 ? A 4.722 -0.893 -9.822 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 254 C CA . ARG 564 564 ? A 4.906 -1.976 -8.872 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 255 C C . ARG 564 564 ? A 5.605 -1.575 -7.583 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 256 O O . ARG 564 564 ? A 6.108 -2.433 -6.852 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 257 C CB . ARG 564 564 ? A 5.636 -3.194 -9.500 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 258 C CG . ARG 564 564 ? A 4.724 -4.226 -10.178 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 259 C CD . ARG 564 564 ? A 5.422 -5.575 -10.376 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 260 N NE . ARG 564 564 ? A 6.685 -5.310 -11.133 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 261 C CZ . ARG 564 564 ? A 7.686 -6.190 -11.252 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 262 N NH1 . ARG 564 564 ? A 7.593 -7.434 -10.789 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 263 N NH2 . ARG 564 564 ? A 8.773 -5.815 -11.923 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 264 N N . LYS 565 565 ? 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A 7.263 -3.402 -3.580 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 279 C CD . GLN 566 566 ? A 7.480 -4.885 -3.344 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 280 O OE1 . GLN 566 566 ? A 8.461 -5.320 -2.742 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 281 N NE2 . GLN 566 566 ? A 6.507 -5.697 -3.805 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 282 N N . TRP 567 567 ? A 4.269 -0.692 -0.966 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 283 C CA . TRP 567 567 ? A 3.840 0.214 0.065 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 284 C C . TRP 567 567 ? A 3.637 -0.537 1.352 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 285 O O . TRP 567 567 ? A 3.399 -1.744 1.387 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 286 C CB . TRP 567 567 ? A 2.545 0.961 -0.322 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 287 C CG . TRP 567 567 ? A 2.698 1.843 -1.549 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 288 C CD1 . TRP 567 567 ? A 2.949 1.472 -2.842 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 289 C CD2 . TRP 567 567 ? A 2.486 3.267 -1.576 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 290 N NE1 . TRP 567 567 ? A 2.972 2.578 -3.661 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 291 C CE2 . TRP 567 567 ? A 2.673 3.685 -2.908 1 1 A TRP 0.640 1 ATOM 292 C CE3 . TRP 567 567 ? 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A 15.842 0.667 11.630 1 1 A ILE 0.590 1 ATOM 447 C CB . ILE 587 587 ? A 13.922 -1.305 10.073 1 1 A ILE 0.590 1 ATOM 448 C CG1 . ILE 587 587 ? A 13.078 -1.721 8.849 1 1 A ILE 0.590 1 ATOM 449 C CG2 . ILE 587 587 ? A 13.434 -2.089 11.318 1 1 A ILE 0.590 1 ATOM 450 C CD1 . ILE 587 587 ? A 11.582 -1.431 8.990 1 1 A ILE 0.590 1 ATOM 451 N N . MET 588 588 ? A 13.885 0.592 12.722 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 452 C CA . MET 588 588 ? A 14.445 0.900 14.017 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 453 C C . MET 588 588 ? A 14.405 -0.320 14.923 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 454 O O . MET 588 588 ? A 13.528 -1.180 14.832 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 455 C CB . MET 588 588 ? A 13.659 2.056 14.677 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 456 C CG . MET 588 588 ? A 13.776 3.386 13.907 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 457 S SD . MET 588 588 ? A 15.400 4.188 14.054 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 458 C CE . MET 588 588 ? A 14.802 5.653 14.943 1 1 A MET 0.480 1 ATOM 459 N N . ARG 589 589 ? A 15.387 -0.442 15.835 1 1 A ARG 0.290 1 ATOM 460 C CA . ARG 589 589 ? 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B 9.035 9.589 11.724 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 685 O O . ASP 556 556 ? B 9.552 8.758 10.980 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 686 C CB . ASP 556 556 ? B 7.587 11.094 10.371 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 687 C CG . ASP 556 556 ? B 6.792 12.385 10.490 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 688 O OD1 . ASP 556 556 ? B 6.974 13.130 11.481 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 689 O OD2 . ASP 556 556 ? B 5.920 12.589 9.604 1 1 B ASP 0.690 1 ATOM 690 N N . VAL 557 557 ? B 8.579 9.234 12.939 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 691 C CA . VAL 557 557 ? B 8.590 7.873 13.451 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 692 C C . VAL 557 557 ? B 7.216 7.245 13.309 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 693 O O . VAL 557 557 ? B 6.203 7.720 13.821 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 694 C CB . VAL 557 557 ? B 9.093 7.771 14.884 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 695 C CG1 . VAL 557 557 ? B 10.632 7.793 14.857 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 696 C CG2 . VAL 557 557 ? B 8.561 8.955 15.708 1 1 B VAL 0.790 1 ATOM 697 N N . LEU 558 558 ? B 7.166 6.138 12.552 1 1 B LEU 0.800 1 ATOM 698 C CA . LEU 558 558 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.667 2 1 3 0.021 3 1 4 0.366 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 533 LYS 1 0.380 2 1 A 534 LYS 1 0.620 3 1 A 535 TYR 1 0.700 4 1 A 536 ALA 1 0.820 5 1 A 537 LYS 1 0.790 6 1 A 538 SER 1 0.810 7 1 A 539 LYS 1 0.730 8 1 A 540 TYR 1 0.620 9 1 A 541 ASP 1 0.620 10 1 A 542 PHE 1 0.620 11 1 A 543 VAL 1 0.640 12 1 A 544 ALA 1 0.730 13 1 A 545 ARG 1 0.610 14 1 A 546 ASN 1 0.660 15 1 A 547 SER 1 0.680 16 1 A 548 SER 1 0.740 17 1 A 549 GLU 1 0.740 18 1 A 550 LEU 1 0.770 19 1 A 551 SER 1 0.800 20 1 A 552 VAL 1 0.780 21 1 A 553 MET 1 0.610 22 1 A 554 LYS 1 0.630 23 1 A 555 ASP 1 0.700 24 1 A 556 ASP 1 0.710 25 1 A 557 VAL 1 0.830 26 1 A 558 LEU 1 0.810 27 1 A 559 GLU 1 0.800 28 1 A 560 ILE 1 0.770 29 1 A 561 LEU 1 0.720 30 1 A 562 ASP 1 0.630 31 1 A 563 ASP 1 0.560 32 1 A 564 ARG 1 0.540 33 1 A 565 LYS 1 0.630 34 1 A 566 GLN 1 0.720 35 1 A 567 TRP 1 0.640 36 1 A 568 TRP 1 0.710 37 1 A 569 LYS 1 0.790 38 1 A 570 VAL 1 0.840 39 1 A 571 ARG 1 0.780 40 1 A 572 ASN 1 0.770 41 1 A 573 ALA 1 0.620 42 1 A 574 SER 1 0.540 43 1 A 575 GLY 1 0.750 44 1 A 576 ASP 1 0.730 45 1 A 577 SER 1 0.780 46 1 A 578 GLY 1 0.800 47 1 A 579 PHE 1 0.750 48 1 A 580 VAL 1 0.810 49 1 A 581 PRO 1 0.750 50 1 A 582 ASN 1 0.740 51 1 A 583 ASN 1 0.680 52 1 A 584 ILE 1 0.730 53 1 A 585 LEU 1 0.710 54 1 A 586 ASP 1 0.670 55 1 A 587 ILE 1 0.590 56 1 A 588 MET 1 0.480 57 1 A 589 ARG 1 0.290 58 1 A 590 THR 1 0.220 59 1 A 591 PRO 1 0.180 60 1 A 592 GLU 1 0.180 61 1 B 533 LYS 1 0.400 62 1 B 534 LYS 1 0.620 63 1 B 535 TYR 1 0.670 64 1 B 536 ALA 1 0.810 65 1 B 537 LYS 1 0.760 66 1 B 538 SER 1 0.810 67 1 B 539 LYS 1 0.730 68 1 B 540 TYR 1 0.640 69 1 B 541 ASP 1 0.650 70 1 B 542 PHE 1 0.640 71 1 B 543 VAL 1 0.660 72 1 B 544 ALA 1 0.710 73 1 B 545 ARG 1 0.550 74 1 B 546 ASN 1 0.640 75 1 B 547 SER 1 0.650 76 1 B 548 SER 1 0.740 77 1 B 549 GLU 1 0.720 78 1 B 550 LEU 1 0.760 79 1 B 551 SER 1 0.800 80 1 B 552 VAL 1 0.780 81 1 B 553 MET 1 0.610 82 1 B 554 LYS 1 0.640 83 1 B 555 ASP 1 0.680 84 1 B 556 ASP 1 0.690 85 1 B 557 VAL 1 0.790 86 1 B 558 LEU 1 0.800 87 1 B 559 GLU 1 0.800 88 1 B 560 ILE 1 0.760 89 1 B 561 LEU 1 0.680 90 1 B 562 ASP 1 0.560 91 1 B 563 ASP 1 0.560 92 1 B 564 ARG 1 0.490 93 1 B 565 LYS 1 0.640 94 1 B 566 GLN 1 0.730 95 1 B 567 TRP 1 0.630 96 1 B 568 TRP 1 0.660 97 1 B 569 LYS 1 0.790 98 1 B 570 VAL 1 0.830 99 1 B 571 ARG 1 0.760 100 1 B 572 ASN 1 0.720 101 1 B 573 ALA 1 0.660 102 1 B 574 SER 1 0.540 103 1 B 575 GLY 1 0.710 104 1 B 576 ASP 1 0.700 105 1 B 577 SER 1 0.780 106 1 B 578 GLY 1 0.790 107 1 B 579 PHE 1 0.750 108 1 B 580 VAL 1 0.800 109 1 B 581 PRO 1 0.750 110 1 B 582 ASN 1 0.740 111 1 B 583 ASN 1 0.700 112 1 B 584 ILE 1 0.700 113 1 B 585 LEU 1 0.780 114 1 B 586 ASP 1 0.760 115 1 B 587 ILE 1 0.670 116 1 B 588 MET 1 0.580 117 1 B 589 ARG 1 0.330 118 1 B 590 THR 1 0.260 119 1 B 591 PRO 1 0.200 120 1 B 592 GLU 1 0.190 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #