data_SMR-fce8e7f341196f236ff8a96e60f974c2_1 _entry.id SMR-fce8e7f341196f236ff8a96e60f974c2_1 _struct.entry_id SMR-fce8e7f341196f236ff8a96e60f974c2_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q9H7U1/ CCSE2_HUMAN, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9H7U1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 108684.397 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CCSE2_HUMAN Q9H7U1 1 ;MEEKTQIKTFLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMPNGTPVNLLGTSKNSNVKSYIKNNGSDCPSSHSFNWRKAN KYQLCAQGVEEPNNTQNSHDKIIDPEKRVPTQGMFDKNGIKGGLKSVSLFTSKLAKPSTMFVSSTEELNQ KSFSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSINTPKSQLNGFYGNRSAGSMQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDSS KSINCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLSIRVPLRSSMLTRNSRQPEVL NGNEHLGYGFNRPYAAGGKKLALPNGPGVTSTLGYRMVHPSLLKSSRSPFSGTMTVDGNKNSPADTCVEE DATVLAKDRAANKDQELIENESYRTKNNQTMKHDAKMRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFID IEDSNRTRITPEEMSLKEEKHENGPPQDMFDSPKENEKAFSKTDEWIDISVSDRSECTKHTSGNNLVSPD TDYRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDL PEDAPLENVECDNMNRFDRPDRNVRQPQEGFWKRPPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLSRGSPYRES PLGHFESYGGMPFFQAQKMFVDVPENTVILDEMTLRHMVQDCTAVKTQLLKLKRLLHQHDGSGSLHDIQL SLPSSPEPEDGDKVYKNEDLLNEIKQLKDEIKKKDEKIQLLELQLATQHICHQKCKEEKCTYADKYTQTP WRRIPGGYSAPSFSPWQGSFQGIPRTVPPHRRQTSSTTAFQQPSQTHRSHPGKTNKATTYRGPQ ; 'Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 834 1 834 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CCSE2_HUMAN Q9H7U1 . 1 834 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-11-13 036713F1975242A3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MEEKTQIKTFLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMPNGTPVNLLGTSKNSNVKSYIKNNGSDCPSSHSFNWRKAN KYQLCAQGVEEPNNTQNSHDKIIDPEKRVPTQGMFDKNGIKGGLKSVSLFTSKLAKPSTMFVSSTEELNQ KSFSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSINTPKSQLNGFYGNRSAGSMQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDSS KSINCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLSIRVPLRSSMLTRNSRQPEVL NGNEHLGYGFNRPYAAGGKKLALPNGPGVTSTLGYRMVHPSLLKSSRSPFSGTMTVDGNKNSPADTCVEE DATVLAKDRAANKDQELIENESYRTKNNQTMKHDAKMRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFID IEDSNRTRITPEEMSLKEEKHENGPPQDMFDSPKENEKAFSKTDEWIDISVSDRSECTKHTSGNNLVSPD TDYRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDL PEDAPLENVECDNMNRFDRPDRNVRQPQEGFWKRPPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLSRGSPYRES PLGHFESYGGMPFFQAQKMFVDVPENTVILDEMTLRHMVQDCTAVKTQLLKLKRLLHQHDGSGSLHDIQL SLPSSPEPEDGDKVYKNEDLLNEIKQLKDEIKKKDEKIQLLELQLATQHICHQKCKEEKCTYADKYTQTP WRRIPGGYSAPSFSPWQGSFQGIPRTVPPHRRQTSSTTAFQQPSQTHRSHPGKTNKATTYRGPQ ; ;MEEKTQIKTFLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMPNGTPVNLLGTSKNSNVKSYIKNNGSDCPSSHSFNWRKAN KYQLCAQGVEEPNNTQNSHDKIIDPEKRVPTQGMFDKNGIKGGLKSVSLFTSKLAKPSTMFVSSTEELNQ KSFSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSINTPKSQLNGFYGNRSAGSMQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDSS KSINCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLSIRVPLRSSMLTRNSRQPEVL NGNEHLGYGFNRPYAAGGKKLALPNGPGVTSTLGYRMVHPSLLKSSRSPFSGTMTVDGNKNSPADTCVEE DATVLAKDRAANKDQELIENESYRTKNNQTMKHDAKMRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFID IEDSNRTRITPEEMSLKEEKHENGPPQDMFDSPKENEKAFSKTDEWIDISVSDRSECTKHTSGNNLVSPD TDYRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDL PEDAPLENVECDNMNRFDRPDRNVRQPQEGFWKRPPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLSRGSPYRES PLGHFESYGGMPFFQAQKMFVDVPENTVILDEMTLRHMVQDCTAVKTQLLKLKRLLHQHDGSGSLHDIQL SLPSSPEPEDGDKVYKNEDLLNEIKQLKDEIKKKDEKIQLLELQLATQHICHQKCKEEKCTYADKYTQTP WRRIPGGYSAPSFSPWQGSFQGIPRTVPPHRRQTSSTTAFQQPSQTHRSHPGKTNKATTYRGPQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 GLU . 1 4 LYS . 1 5 THR . 1 6 GLN . 1 7 ILE . 1 8 LYS . 1 9 THR . 1 10 PHE . 1 11 LEU . 1 12 GLY . 1 13 SER . 1 14 LYS . 1 15 LEU . 1 16 PRO . 1 17 LYS . 1 18 TYR . 1 19 GLY . 1 20 THR . 1 21 LYS . 1 22 SER . 1 23 VAL . 1 24 ARG . 1 25 SER . 1 26 THR . 1 27 LEU . 1 28 GLN . 1 29 PRO . 1 30 MET . 1 31 PRO . 1 32 ASN . 1 33 GLY . 1 34 THR . 1 35 PRO . 1 36 VAL . 1 37 ASN . 1 38 LEU . 1 39 LEU . 1 40 GLY . 1 41 THR . 1 42 SER . 1 43 LYS . 1 44 ASN . 1 45 SER . 1 46 ASN . 1 47 VAL . 1 48 LYS . 1 49 SER . 1 50 TYR . 1 51 ILE . 1 52 LYS . 1 53 ASN . 1 54 ASN . 1 55 GLY . 1 56 SER . 1 57 ASP . 1 58 CYS . 1 59 PRO . 1 60 SER . 1 61 SER . 1 62 HIS . 1 63 SER . 1 64 PHE . 1 65 ASN . 1 66 TRP . 1 67 ARG . 1 68 LYS . 1 69 ALA . 1 70 ASN . 1 71 LYS . 1 72 TYR . 1 73 GLN . 1 74 LEU . 1 75 CYS . 1 76 ALA . 1 77 GLN . 1 78 GLY . 1 79 VAL . 1 80 GLU . 1 81 GLU . 1 82 PRO . 1 83 ASN . 1 84 ASN . 1 85 THR . 1 86 GLN . 1 87 ASN . 1 88 SER . 1 89 HIS . 1 90 ASP . 1 91 LYS . 1 92 ILE . 1 93 ILE . 1 94 ASP . 1 95 PRO . 1 96 GLU . 1 97 LYS . 1 98 ARG . 1 99 VAL . 1 100 PRO . 1 101 THR . 1 102 GLN . 1 103 GLY . 1 104 MET . 1 105 PHE . 1 106 ASP . 1 107 LYS . 1 108 ASN . 1 109 GLY . 1 110 ILE . 1 111 LYS . 1 112 GLY . 1 113 GLY . 1 114 LEU . 1 115 LYS . 1 116 SER . 1 117 VAL . 1 118 SER . 1 119 LEU . 1 120 PHE . 1 121 THR . 1 122 SER . 1 123 LYS . 1 124 LEU . 1 125 ALA . 1 126 LYS . 1 127 PRO . 1 128 SER . 1 129 THR . 1 130 MET . 1 131 PHE . 1 132 VAL . 1 133 SER . 1 134 SER . 1 135 THR . 1 136 GLU . 1 137 GLU . 1 138 LEU . 1 139 ASN . 1 140 GLN . 1 141 LYS . 1 142 SER . 1 143 PHE . 1 144 SER . 1 145 GLY . 1 146 PRO . 1 147 SER . 1 148 ASN . 1 149 LEU . 1 150 GLY . 1 151 LYS . 1 152 PHE . 1 153 THR . 1 154 LYS . 1 155 GLY . 1 156 THR . 1 157 LEU . 1 158 LEU . 1 159 GLY . 1 160 ARG . 1 161 THR . 1 162 SER . 1 163 TYR . 1 164 SER . 1 165 SER . 1 166 ILE . 1 167 ASN . 1 168 THR . 1 169 PRO . 1 170 LYS . 1 171 SER . 1 172 GLN . 1 173 LEU . 1 174 ASN . 1 175 GLY . 1 176 PHE . 1 177 TYR . 1 178 GLY . 1 179 ASN . 1 180 ARG . 1 181 SER . 1 182 ALA . 1 183 GLY . 1 184 SER . 1 185 MET . 1 186 GLN . 1 187 ARG . 1 188 PRO . 1 189 ARG . 1 190 ALA . 1 191 ASN . 1 192 SER . 1 193 CYS . 1 194 ALA . 1 195 THR . 1 196 ARG . 1 197 SER . 1 198 SER . 1 199 SER . 1 200 GLY . 1 201 GLU . 1 202 SER . 1 203 LEU . 1 204 ALA . 1 205 GLN . 1 206 SER . 1 207 PRO . 1 208 ASP . 1 209 SER . 1 210 SER . 1 211 LYS . 1 212 SER . 1 213 ILE . 1 214 ASN . 1 215 CYS . 1 216 GLU . 1 217 LYS . 1 218 MET . 1 219 VAL . 1 220 ARG . 1 221 SER . 1 222 GLN . 1 223 SER . 1 224 PHE . 1 225 SER . 1 226 HIS . 1 227 SER . 1 228 ILE . 1 229 GLN . 1 230 ASN . 1 231 SER . 1 232 PHE . 1 233 LEU . 1 234 PRO . 1 235 PRO . 1 236 SER . 1 237 SER . 1 238 ILE . 1 239 THR . 1 240 ARG . 1 241 SER . 1 242 HIS . 1 243 SER . 1 244 PHE . 1 245 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Liprin-beta-2 {PDB ID=3qh9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3qh9.1.B}' 'template structure' . 2 'Liprin-beta-2 {PDB ID=3qh9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3qh9.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 3qh9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 3qh9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;KLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEI ERLHSQLSRTA ; ;KLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEI ERLHSQLSRTA ; 2 ;KLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEI ERLHSQLSRTA ; ;KLKLVGMEKEQREQEEKQRKAEELLQELRHLKIKVEELENERNQYEWKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEI ERLHSQLSRTA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 47 78 2 2 47 78 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3qh9 2024-02-21 2 PDB . 3qh9 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 834 2 2 B 1 834 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 834 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 834 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 10.000 31.250 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 10.000 31.250 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEEKTQIKTFLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMPNGTPVNLLGTSKNSNVKSYIKNNGSDCPSSHSFNWRKANKYQLCAQGVEEPNNTQNSHDKIIDPEKRVPTQGMFDKNGIKGGLKSVSLFTSKLAKPSTMFVSSTEELNQKSFSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSINTPKSQLNGFYGNRSAGSMQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDSSKSINCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLSIRVPLRSSMLTRNSRQPEVLNGNEHLGYGFNRPYAAGGKKLALPNGPGVTSTLGYRMVHPSLLKSSRSPFSGTMTVDGNKNSPADTCVEEDATVLAKDRAANKDQELIENESYRTKNNQTMKHDAKMRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTRITPEEMSLKEEKHENGPPQDMFDSPKENEKAFSKTDEWIDISVSDRSECTKHTSGNNLVSPDTDYRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDAPLENVECDNMNRFDRPDRNVRQPQEGFWKRPPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLSRGSPYRESPLGHFESYGGMPFFQAQKMFVDVPENTVILDEMTLRHMVQDCTAVKTQLLKLKRLLHQHDGSGSLHDIQLSLPSSPEPEDGDKVYKNEDLLNEIKQLKDEIKKKDEKIQLLELQLATQHICHQKCKEEKCTYADKYTQTPWRRIPGGYSAPSFSPWQGSFQGIPRTVPPHRRQTSSTTAFQQPSQTHRSHPGKTNKATTYRGPQ 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------WKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLS---------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MEEKTQIKTFLGSKLPKYGTKSVRSTLQPMPNGTPVNLLGTSKNSNVKSYIKNNGSDCPSSHSFNWRKANKYQLCAQGVEEPNNTQNSHDKIIDPEKRVPTQGMFDKNGIKGGLKSVSLFTSKLAKPSTMFVSSTEELNQKSFSGPSNLGKFTKGTLLGRTSYSSINTPKSQLNGFYGNRSAGSMQRPRANSCATRSSSGESLAQSPDSSKSINCEKMVRSQSFSHSIQNSFLPPSSITRSHSFNRAVDLTKPYQNQQLSIRVPLRSSMLTRNSRQPEVLNGNEHLGYGFNRPYAAGGKKLALPNGPGVTSTLGYRMVHPSLLKSSRSPFSGTMTVDGNKNSPADTCVEEDATVLAKDRAANKDQELIENESYRTKNNQTMKHDAKMRYLSDDVDDISLSSLSSSDKNDLSEDFSDDFIDIEDSNRTRITPEEMSLKEEKHENGPPQDMFDSPKENEKAFSKTDEWIDISVSDRSECTKHTSGNNLVSPDTDYRAGSSFELSPSDSSDGTYMWDEEGLEPIGNVHPVGSYESSEMNSIDILNNLESCDLEDDDLMLDVDLPEDAPLENVECDNMNRFDRPDRNVRQPQEGFWKRPPQRWSGQEHYHLSHPDHYHHHGKSDLSRGSPYRESPLGHFESYGGMPFFQAQKMFVDVPENTVILDEMTLRHMVQDCTAVKTQLLKLKRLLHQHDGSGSLHDIQLSLPSSPEPEDGDKVYKNEDLLNEIKQLKDEIKKKDEKIQLLELQLATQHICHQKCKEEKCTYADKYTQTPWRRIPGGYSAPSFSPWQGSFQGIPRTVPPHRRQTSSTTAFQQPSQTHRSHPGKTNKATTYRGPQ 4 2 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------WKLKATKAEVAQLQEQVALKDAEIERLHSQLS---------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.254}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3qh9.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 715 715 ? A 4.767 19.665 4.033 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 2 C CA . TYR 715 715 ? A 5.789 18.568 3.956 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 3 C C . TYR 715 715 ? A 5.629 17.534 5.086 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 4 O O . TYR 715 715 ? A 5.492 16.364 4.820 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 5 C CB . TYR 715 715 ? A 7.173 19.258 3.844 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 6 C CG . TYR 715 715 ? A 8.246 18.252 3.560 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 715 715 ? A 9.075 17.807 4.599 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 715 715 ? A 8.411 17.706 2.274 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 715 715 ? A 10.096 16.882 4.346 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 715 715 ? A 9.428 16.775 2.027 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 11 C CZ . TYR 715 715 ? A 10.296 16.399 3.053 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 12 O OH . TYR 715 715 ? A 11.358 15.522 2.762 1 1 A TYR 0.430 1 ATOM 13 N N . LYS 716 716 ? A 5.498 17.916 6.390 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 14 C CA . LYS 716 716 ? A 5.287 16.900 7.423 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 15 C C . LYS 716 716 ? A 4.012 16.042 7.264 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 16 O O . LYS 716 716 ? A 3.998 14.858 7.585 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 17 C CB . LYS 716 716 ? A 5.297 17.539 8.835 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 18 C CG . LYS 716 716 ? A 5.126 16.547 10.012 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 19 C CD . LYS 716 716 ? A 6.041 15.298 10.005 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 20 C CE . LYS 716 716 ? A 5.549 14.194 10.961 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 21 N NZ . LYS 716 716 ? A 5.795 12.845 10.391 1 1 A LYS 0.510 1 ATOM 22 N N . ASN 717 717 ? A 2.907 16.633 6.736 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 23 C CA . ASN 717 717 ? A 1.701 15.919 6.314 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 24 C C . ASN 717 717 ? A 1.948 14.912 5.195 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 25 O O . ASN 717 717 ? A 1.435 13.805 5.251 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 26 C CB . ASN 717 717 ? A 0.589 16.883 5.803 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 27 C CG . ASN 717 717 ? A 0.068 17.720 6.961 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 28 O OD1 . ASN 717 717 ? A 0.219 17.378 8.127 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 29 N ND2 . ASN 717 717 ? A -0.573 18.867 6.627 1 1 A ASN 0.700 1 ATOM 30 N N . GLU 718 718 ? A 2.761 15.295 4.176 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 31 C CA . GLU 718 718 ? A 3.248 14.442 3.103 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 32 C C . GLU 718 718 ? A 4.080 13.279 3.629 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 33 O O . GLU 718 718 ? A 3.791 12.122 3.326 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 34 C CB . GLU 718 718 ? A 4.120 15.276 2.132 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 35 C CG . GLU 718 718 ? A 4.669 14.488 0.923 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 36 C CD . GLU 718 718 ? A 5.527 15.391 0.041 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 37 O OE1 . GLU 718 718 ? A 5.651 16.605 0.370 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 38 O OE2 . GLU 718 718 ? A 6.049 14.862 -0.971 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 39 N N . ASP 719 719 ? A 5.063 13.539 4.522 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 40 C CA . ASP 719 719 ? A 5.877 12.525 5.174 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 41 C C . ASP 719 719 ? A 5.087 11.538 6.006 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 42 O O . ASP 719 719 ? A 5.327 10.339 6.013 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 43 C CB . ASP 719 719 ? A 6.893 13.176 6.141 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 44 C CG . ASP 719 719 ? A 7.982 13.883 5.372 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 45 O OD1 . ASP 719 719 ? A 8.160 13.583 4.169 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 46 O OD2 . ASP 719 719 ? A 8.649 14.713 6.039 1 1 A ASP 0.740 1 ATOM 47 N N . LEU 720 720 ? A 4.094 12.056 6.749 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 48 C CA . LEU 720 720 ? A 3.158 11.260 7.497 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 49 C C . LEU 720 720 ? A 2.263 10.370 6.628 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 50 O O . LEU 720 720 ? A 2.021 9.208 6.919 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 51 C CB . LEU 720 720 ? A 2.340 12.220 8.374 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 52 C CG . LEU 720 720 ? A 1.662 11.504 9.540 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 53 C CD1 . LEU 720 720 ? A 2.668 10.968 10.554 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 54 C CD2 . LEU 720 720 ? A 0.792 12.465 10.327 1 1 A LEU 0.760 1 ATOM 55 N N . LEU 721 721 ? A 1.793 10.893 5.481 1 1 A LEU 0.780 1 ATOM 56 C CA . LEU 721 721 ? A 1.100 10.114 4.477 1 1 A LEU 0.780 1 ATOM 57 C C . LEU 721 721 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.753 2 1 3 0 3 1 4 0.254 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 715 TYR 1 0.430 2 1 A 716 LYS 1 0.510 3 1 A 717 ASN 1 0.700 4 1 A 718 GLU 1 0.730 5 1 A 719 ASP 1 0.740 6 1 A 720 LEU 1 0.760 7 1 A 721 LEU 1 0.780 8 1 A 722 ASN 1 0.820 9 1 A 723 GLU 1 0.830 10 1 A 724 ILE 1 0.830 11 1 A 725 LYS 1 0.850 12 1 A 726 GLN 1 0.860 13 1 A 727 LEU 1 0.860 14 1 A 728 LYS 1 0.860 15 1 A 729 ASP 1 0.850 16 1 A 730 GLU 1 0.840 17 1 A 731 ILE 1 0.830 18 1 A 732 LYS 1 0.830 19 1 A 733 LYS 1 0.830 20 1 A 734 LYS 1 0.820 21 1 A 735 ASP 1 0.820 22 1 A 736 GLU 1 0.800 23 1 A 737 LYS 1 0.790 24 1 A 738 ILE 1 0.790 25 1 A 739 GLN 1 0.760 26 1 A 740 LEU 1 0.770 27 1 A 741 LEU 1 0.780 28 1 A 742 GLU 1 0.750 29 1 A 743 LEU 1 0.750 30 1 A 744 GLN 1 0.700 31 1 A 745 LEU 1 0.440 32 1 A 746 ALA 1 0.390 33 1 B 715 TYR 1 0.420 34 1 B 716 LYS 1 0.510 35 1 B 717 ASN 1 0.700 36 1 B 718 GLU 1 0.720 37 1 B 719 ASP 1 0.740 38 1 B 720 LEU 1 0.760 39 1 B 721 LEU 1 0.780 40 1 B 722 ASN 1 0.820 41 1 B 723 GLU 1 0.830 42 1 B 724 ILE 1 0.830 43 1 B 725 LYS 1 0.850 44 1 B 726 GLN 1 0.860 45 1 B 727 LEU 1 0.860 46 1 B 728 LYS 1 0.860 47 1 B 729 ASP 1 0.850 48 1 B 730 GLU 1 0.840 49 1 B 731 ILE 1 0.830 50 1 B 732 LYS 1 0.830 51 1 B 733 LYS 1 0.830 52 1 B 734 LYS 1 0.820 53 1 B 735 ASP 1 0.820 54 1 B 736 GLU 1 0.800 55 1 B 737 LYS 1 0.790 56 1 B 738 ILE 1 0.790 57 1 B 739 GLN 1 0.760 58 1 B 740 LEU 1 0.770 59 1 B 741 LEU 1 0.780 60 1 B 742 GLU 1 0.750 61 1 B 743 LEU 1 0.750 62 1 B 744 GLN 1 0.700 63 1 B 745 LEU 1 0.440 64 1 B 746 ALA 1 0.390 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #