data_SMR-828ea8704188feaf0b5f126aa39ad3f9_3
_entry.id SMR-828ea8704188feaf0b5f126aa39ad3f9_3
_struct.entry_id SMR-828ea8704188feaf0b5f126aa39ad3f9_3
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q5DTI6 (isoform 2)/ KAL1L_MOUSE, KAT8 regulatory NSL complex subunit 1-like protein

Estimated model accuracy of this model is 0.007, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5DTI6 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
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_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 126017.241 1 .
#
#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
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_struct_ref.details
1 1 UNP KAL1L_MOUSE Q5DTI6 1
;MTPALKEATTKGICFSSLPNTMESDKMLCMESPRTVDEKLKGGDTFSQMLGFPTPEPTLNTNFVNLKHFA
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SSELGSAQQGTAESPFELPAESHSLCAQDSLSLNDGQEDKSLRWERRAFPLKDEDTAALLCQDERKDQTG
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;
'KAT8 regulatory NSL complex subunit 1-like protein'
#
#
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_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 956 1 956
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . KAL1L_MOUSE Q5DTI6 Q5DTI6-2 1 956 10090 'Mus musculus (Mouse)'
2011-07-27 39A48FC019BC39B9
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no 2
;MTPALKEATTKGICFSSLPNTMESDKMLCMESPRTVDEKLKGGDTFSQMLGFPTPEPTLNTNFVNLKHFA
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;

;MTPALKEATTKGICFSSLPNTMESDKMLCMESPRTVDEKLKGGDTFSQMLGFPTPEPTLNTNFVNLKHFA
SPQASKHFQTVLLMSSNSTLNKYNENYNQKKVMESNCSKLKNVLCNGSSIQLSKICPSHSENEFIKKELS
DTTSQCMKDIQIVLDSNLTKDANVDRLHLQNCKWYQKNALLDKFTDTKIKKGLLQCTQKKIGPSHSDVPT
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
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1 1 MET .
1 2 THR .
1 3 PRO .
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1 5 LEU .
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1 7 GLU .
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1 17 SER .
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1 27 MET .
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1 29 CYS .
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1 31 GLU .
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1 33 PRO .
1 34 ARG .
1 35 THR .
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1 88 SER .
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1 143 THR .
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1 181 LEU .
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1 183 LYS .
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1 191 LYS .
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1 197 THR .
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A 1 45 THR 45 ? ? ? 2 .
A 1 46 PHE 46 ? ? ? 2 .
A 1 47 SER 47 ? ? ? 2 .
A 1 48 GLN 48 ? ? ? 2 .
A 1 49 MET 49 ? ? ? 2 .
A 1 50 LEU 50 ? ? ? 2 .
A 1 51 GLY 51 ? ? ? 2 .
A 1 52 PHE 52 ? ? ? 2 .
A 1 53 PRO 53 ? ? ? 2 .
A 1 54 THR 54 ? ? ? 2 .
A 1 55 PRO 55 ? ? ? 2 .
A 1 56 GLU 56 ? ? ? 2 .
A 1 57 PRO 57 ? ? ? 2 .
A 1 58 THR 58 ? ? ? 2 .
A 1 59 LEU 59 ? ? ? 2 .
A 1 60 ASN 60 ? ? ? 2 .
A 1 61 THR 61 ? ? ? 2 .
A 1 62 ASN 62 ? ? ? 2 .
A 1 63 PHE 63 ? ? ? 2 .
A 1 64 VAL 64 ? ? ? 2 .
A 1 65 ASN 65 ? ? ? 2 .
A 1 66 LEU 66 ? ? ? 2 .
A 1 67 LYS 67 ? ? ? 2 .
A 1 68 HIS 68 ? ? ? 2 .
A 1 69 PHE 69 ? ? ? 2 .
A 1 70 ALA 70 ? ? ? 2 .
A 1 71 SER 71 ? ? ? 2 .
A 1 72 PRO 72 ? ? ? 2 .
A 1 73 GLN 73 ? ? ? 2 .
A 1 74 ALA 74 ? ? ? 2 .
A 1 75 SER 75 ? ? ? 2 .
A 1 76 LYS 76 ? ? ? 2 .
A 1 77 HIS 77 ? ? ? 2 .
A 1 78 PHE 78 ? ? ? 2 .
A 1 79 GLN 79 ? ? ? 2 .
A 1 80 THR 80 ? ? ? 2 .
A 1 81 VAL 81 ? ? ? 2 .
A 1 82 LEU 82 ? ? ? 2 .
A 1 83 LEU 83 ? ? ? 2 .
A 1 84 MET 84 ? ? ? 2 .
A 1 85 SER 85 ? ? ? 2 .
A 1 86 SER 86 ? ? ? 2 .
A 1 87 ASN 87 ? ? ? 2 .
A 1 88 SER 88 ? ? ? 2 .
A 1 89 THR 89 ? ? ? 2 .
A 1 90 LEU 90 ? ? ? 2 .
A 1 91 ASN 91 ? ? ? 2 .
A 1 92 LYS 92 ? ? ? 2 .
A 1 93 TYR 93 ? ? ? 2 .
A 1 94 ASN 94 ? ? ? 2 .
A 1 95 GLU 95 ? ? ? 2 .
A 1 96 ASN 96 ? ? ? 2 .
A 1 97 TYR 97 ? ? ? 2 .
A 1 98 ASN 98 ? ? ? 2 .
A 1 99 GLN 99 ? ? ? 2 .
A 1 100 LYS 100 ? ? ? 2 .
A 1 101 LYS 101 ? ? ? 2 .
A 1 102 VAL 102 ? ? ? 2 .
A 1 103 MET 103 ? ? ? 2 .
A 1 104 GLU 104 ? ? ? 2 .
A 1 105 SER 105 ? ? ? 2 .
A 1 106 ASN 106 ? ? ? 2 .
A 1 107 CYS 107 ? ? ? 2 .
A 1 108 SER 108 ? ? ? 2 .
A 1 109 LYS 109 ? ? ? 2 .
A 1 110 LEU 110 ? ? ? 2 .
A 1 111 LYS 111 ? ? ? 2 .
A 1 112 ASN 112 ? ? ? 2 .
A 1 113 VAL 113 ? ? ? 2 .
A 1 114 LEU 114 ? ? ? 2 .
A 1 115 CYS 115 ? ? ? 2 .
A 1 116 ASN 116 ? ? ? 2 .
A 1 117 GLY 117 ? ? ? 2 .
A 1 118 SER 118 ? ? ? 2 .
A 1 119 SER 119 ? ? ? 2 .
A 1 120 ILE 120 ? ? ? 2 .
A 1 121 GLN 121 ? ? ? 2 .
A 1 122 LEU 122 ? ? ? 2 .
A 1 123 SER 123 ? ? ? 2 .
A 1 124 LYS 124 ? ? ? 2 .
A 1 125 ILE 125 ? ? ? 2 .
A 1 126 CYS 126 ? ? ? 2 .
A 1 127 PRO 127 ? ? ? 2 .
A 1 128 SER 128 ? ? ? 2 .
A 1 129 HIS 129 ? ? ? 2 .
A 1 130 SER 130 ? ? ? 2 .
A 1 131 GLU 131 ? ? ? 2 .
A 1 132 ASN 132 ? ? ? 2 .
A 1 133 GLU 133 ? ? ? 2 .
A 1 134 PHE 134 ? ? ? 2 .
A 1 135 ILE 135 ? ? ? 2 .
A 1 136 LYS 136 ? ? ? 2 .
A 1 137 LYS 137 ? ? ? 2 .
A 1 138 GLU 138 ? ? ? 2 .
A 1 139 LEU 139 ? ? ? 2 .
A 1 140 SER 140 ? ? ? 2 .
A 1 141 ASP 141 ? ? ? 2 .
A 1 142 THR 142 ? ? ? 2 .
A 1 143 THR 143 ? ? ? 2 .
A 1 144 SER 144 ? ? ? 2 .
A 1 145 GLN 145 ? ? ? 2 .
A 1 146 CYS 146 ? ? ? 2 .
A 1 147 MET 147 ? ? ? 2 .
A 1 148 LYS 148 ? ? ? 2 .
A 1 149 ASP 149 ? ? ? 2 .
A 1 150 ILE 150 ? ? ? 2 .
A 1 151 GLN 151 ? ? ? 2 .
A 1 152 ILE 152 ? ? ? 2 .
A 1 153 VAL 153 ? ? ? 2 .
A 1 154 LEU 154 ? ? ? 2 .
A 1 155 ASP 155 ? ? ? 2 .
A 1 156 SER 156 ? ? ? 2 .
A 1 157 ASN 157 ? ? ? 2 .
A 1 158 LEU 158 ? ? ? 2 .
A 1 159 THR 159 ? ? ? 2 .
A 1 160 LYS 160 ? ? ? 2 .
A 1 161 ASP 161 ? ? ? 2 .
A 1 162 ALA 162 ? ? ? 2 .
A 1 163 ASN 163 ? ? ? 2 .
A 1 164 VAL 164 ? ? ? 2 .
A 1 165 ASP 165 ? ? ? 2 .
A 1 166 ARG 166 ? ? ? 2 .
A 1 167 LEU 167 ? ? ? 2 .
A 1 168 HIS 168 ? ? ? 2 .
A 1 169 LEU 169 ? ? ? 2 .
A 1 170 GLN 170 ? ? ? 2 .
A 1 171 ASN 171 ? ? ? 2 .
A 1 172 CYS 172 ? ? ? 2 .
A 1 173 LYS 173 ? ? ? 2 .
A 1 174 TRP 174 ? ? ? 2 .
A 1 175 TYR 175 ? ? ? 2 .
A 1 176 GLN 176 ? ? ? 2 .
A 1 177 LYS 177 ? ? ? 2 .
A 1 178 ASN 178 ? ? ? 2 .
A 1 179 ALA 179 ? ? ? 2 .
A 1 180 LEU 180 ? ? ? 2 .
A 1 181 LEU 181 ? ? ? 2 .
A 1 182 ASP 182 ? ? ? 2 .
A 1 183 LYS 183 ? ? ? 2 .
A 1 184 PHE 184 ? ? ? 2 .
A 1 185 THR 185 ? ? ? 2 .
A 1 186 ASP 186 ? ? ? 2 .
A 1 187 THR 187 ? ? ? 2 .
A 1 188 LYS 188 ? ? ? 2 .
A 1 189 ILE 189 ? ? ? 2 .
A 1 190 LYS 190 ? ? ? 2 .
A 1 191 LYS 191 ? ? ? 2 .
A 1 192 GLY 192 ? ? ? 2 .
A 1 193 LEU 193 ? ? ? 2 .
A 1 194 LEU 194 ? ? ? 2 .
A 1 195 GLN 195 ? ? ? 2 .
A 1 196 CYS 196 ? ? ? 2 .
A 1 197 THR 197 ? ? ? 2 .
A 1 198 GLN 198 ? ? ? 2 .
A 1 199 LYS 199 ? ? ? 2 .
A 1 200 LYS 200 ? ? ? 2 .
A 1 201 ILE 201 ? ? ? 2 .
A 1 202 GLY 202 ? ? ? 2 .
A 1 203 PRO 203 ? ? ? 2 .
A 1 204 SER 204 ? ? ? 2 .
A 1 205 HIS 205 ? ? ? 2 .
A 1 206 SER 206 ? ? ? 2 .
A 1 207 ASP 207 ? ? ? 2 .
A 1 208 VAL 208 ? ? ? 2 .
A 1 209 PRO 209 ? ? ? 2 .
A 1 210 THR 210 ? ? ? 2 .
A 1 211 SER 211 ? ? ? 2 .
A 1 212 SER 212 ? ? ? 2 .
A 1 213 SER 213 ? ? ? 2 .
A 1 214 ALA 214 ? ? ? 2 .
A 1 215 ALA 215 ? ? ? 2 .
A 1 216 GLU 216 ? ? ? 2 .
A 1 217 LYS 217 ? ? ? 2 .
A 1 218 GLU 218 ? ? ? 2 .
A 1 219 GLN 219 ? ? ? 2 .
A 1 220 GLU 220 ? ? ? 2 .
A 1 221 VAL 221 ? ? ? 2 .
A 1 222 ASN 222 ? ? ? 2 .
A 1 223 ALA 223 ? ? ? 2 .
A 1 224 ARG 224 ? ? ? 2 .
A 1 225 LEU 225 ? ? ? 2 .
A 1 226 LEU 226 ? ? ? 2 .
A 1 227 HIS 227 ? ? ? 2 .
A 1 228 CYS 228 ? ? ? 2 .
A 1 229 VAL 229 ? ? ? 2 .
A 1 230 SER 230 ? ? ? 2 .
A 1 231 LYS 231 ? ? ? 2 .
A 1 232 GLN 232 ? ? ? 2 .
A 1 233 LYS 233 ? ? ? 2 .
A 1 234 ILE 234 ? ? ? 2 .
A 1 235 LEU 235 ? ? ? 2 .
A 1 236 LEU 236 ? ? ? 2 .
A 1 237 SER 237 ? ? ? 2 .
A 1 238 GLN 238 ? ? ? 2 .
A 1 239 ALA 239 ? ? ? 2 .
A 1 240 ARG 240 ? ? ? 2 .
A 1 241 ARG 241 ? ? ? 2 .
A 1 242 THR 242 ? ? ? 2 .
A 1 243 GLN 243 ? ? ? 2 .
A 1 244 LYS 244 ? ? ? 2 .
A 1 245 HIS 245 ? ? ? 2 .
A 1 246 LEU 246 ? ? ? 2 .
A 1 247 GLN 247 ? ? ? 2 .
A 1 248 MET 248 ? ? ? 2 .
A 1 249 LEU 249 ? ? ? 2 .
A 1 250 LEU 250 ? ? ? 2 .
A 1 251 ALA 251 ? ? ? 2 .
A 1 252 LYS 252 ? ? ? 2 .
A 1 253 HIS 253 ? ? ? 2 .
A 1 254 VAL 254 ? ? ? 2 .
A 1 255 VAL 255 ? ? ? 2 .
A 1 256 LYS 256 ? ? ? 2 .
A 1 257 HIS 257 ? ? ? 2 .
A 1 258 TYR 258 ? ? ? 2 .
A 1 259 GLY 259 ? ? ? 2 .
A 1 260 GLN 260 ? ? ? 2 .
A 1 261 GLN 261 ? ? ? 2 .
A 1 262 MET 262 ? ? ? 2 .
A 1 263 LYS 263 ? ? ? 2 .
A 1 264 PHE 264 ? ? ? 2 .
A 1 265 SER 265 ? ? ? 2 .
A 1 266 MET 266 ? ? ? 2 .
A 1 267 LYS 267 ? ? ? 2 .
A 1 268 HIS 268 ? ? ? 2 .
A 1 269 GLN 269 ? ? ? 2 .
A 1 270 LEU 270 ? ? ? 2 .
A 1 271 PRO 271 ? ? ? 2 .
A 1 272 THR 272 ? ? ? 2 .
A 1 273 MET 273 ? ? ? 2 .
A 1 274 LYS 274 ? ? ? 2 .
A 1 275 ILE 275 ? ? ? 2 .
A 1 276 PHE 276 ? ? ? 2 .
A 1 277 HIS 277 ? ? ? 2 .
A 1 278 GLU 278 ? ? ? 2 .
A 1 279 PRO 279 ? ? ? 2 .
A 1 280 THR 280 ? ? ? 2 .
A 1 281 THR 281 ? ? ? 2 .
A 1 282 VAL 282 ? ? ? 2 .
A 1 283 LEU 283 ? ? ? 2 .
A 1 284 SER 284 ? ? ? 2 .
A 1 285 ASN 285 ? ? ? 2 .
A 1 286 SER 286 ? ? ? 2 .
A 1 287 LEU 287 ? ? ? 2 .
A 1 288 LEU 288 ? ? ? 2 .
A 1 289 GLU 289 ? ? ? 2 .
A 1 290 HIS 290 ? ? ? 2 .
A 1 291 THR 291 ? ? ? 2 .
A 1 292 GLU 292 ? ? ? 2 .
A 1 293 ILE 293 ? ? ? 2 .
A 1 294 LYS 294 ? ? ? 2 .
A 1 295 PRO 295 ? ? ? 2 .
A 1 296 GLU 296 ? ? ? 2 .
A 1 297 VAL 297 ? ? ? 2 .
A 1 298 ASN 298 ? ? ? 2 .
A 1 299 ILE 299 ? ? ? 2 .
A 1 300 LEU 300 ? ? ? 2 .
A 1 301 ALA 301 ? ? ? 2 .
A 1 302 SER 302 ? ? ? 2 .
A 1 303 GLU 303 ? ? ? 2 .
A 1 304 ASN 304 ? ? ? 2 .
A 1 305 LYS 305 ? ? ? 2 .
A 1 306 PHE 306 ? ? ? 2 .
A 1 307 TRP 307 ? ? ? 2 .
A 1 308 ASP 308 ? ? ? 2 .
A 1 309 ASP 309 ? ? ? 2 .
A 1 310 THR 310 ? ? ? 2 .
A 1 311 ASN 311 ? ? ? 2 .
A 1 312 ASN 312 ? ? ? 2 .
A 1 313 GLY 313 ? ? ? 2 .
A 1 314 PHE 314 ? ? ? 2 .
A 1 315 SER 315 ? ? ? 2 .
A 1 316 GLN 316 ? ? ? 2 .
A 1 317 CYS 317 ? ? ? 2 .
A 1 318 THR 318 ? ? ? 2 .
A 1 319 ALA 319 ? ? ? 2 .
A 1 320 ALA 320 ? ? ? 2 .
A 1 321 GLU 321 ? ? ? 2 .
A 1 322 ILE 322 ? ? ? 2 .
A 1 323 GLN 323 ? ? ? 2 .
A 1 324 ARG 324 ? ? ? 2 .
A 1 325 PHE 325 ? ? ? 2 .
A 1 326 ALA 326 ? ? ? 2 .
A 1 327 LEU 327 ? ? ? 2 .
A 1 328 SER 328 ? ? ? 2 .
A 1 329 ALA 329 ? ? ? 2 .
A 1 330 THR 330 ? ? ? 2 .
A 1 331 GLY 331 ? ? ? 2 .
A 1 332 LEU 332 ? ? ? 2 .
A 1 333 LEU 333 ? ? ? 2 .
A 1 334 SER 334 ? ? ? 2 .
A 1 335 HIS 335 ? ? ? 2 .
A 1 336 VAL 336 ? ? ? 2 .
A 1 337 GLU 337 ? ? ? 2 .
A 1 338 GLU 338 ? ? ? 2 .
A 1 339 GLY 339 ? ? ? 2 .
A 1 340 LEU 340 ? ? ? 2 .
A 1 341 ASP 341 ? ? ? 2 .
A 1 342 SER 342 ? ? ? 2 .
A 1 343 ASP 343 ? ? ? 2 .
A 1 344 ALA 344 ? ? ? 2 .
A 1 345 THR 345 ? ? ? 2 .
A 1 346 ASP 346 ? ? ? 2 .
A 1 347 SER 347 ? ? ? 2 .
A 1 348 SER 348 ? ? ? 2 .
A 1 349 SER 349 ? ? ? 2 .
A 1 350 ASP 350 ? ? ? 2 .
A 1 351 ASP 351 ? ? ? 2 .
A 1 352 GLU 352 ? ? ? 2 .
A 1 353 LEU 353 ? ? ? 2 .
A 1 354 ASP 354 ? ? ? 2 .
A 1 355 GLU 355 ? ? ? 2 .
A 1 356 TYR 356 ? ? ? 2 .
A 1 357 THR 357 ? ? ? 2 .
A 1 358 ILE 358 ? ? ? 2 .
A 1 359 ARG 359 ? ? ? 2 .
A 1 360 LYS 360 ? ? ? 2 .
A 1 361 ASN 361 ? ? ? 2 .
A 1 362 VAL 362 ? ? ? 2 .
A 1 363 ALA 363 ? ? ? 2 .
A 1 364 VAL 364 ? ? ? 2 .
A 1 365 ASN 365 ? ? ? 2 .
A 1 366 SER 366 ? ? ? 2 .
A 1 367 SER 367 ? ? ? 2 .
A 1 368 THR 368 ? ? ? 2 .
A 1 369 GLU 369 ? ? ? 2 .
A 1 370 TRP 370 ? ? ? 2 .
A 1 371 LYS 371 ? ? ? 2 .
A 1 372 TRP 372 ? ? ? 2 .
A 1 373 LEU 373 ? ? ? 2 .
A 1 374 VAL 374 ? ? ? 2 .
A 1 375 ASP 375 ? ? ? 2 .
A 1 376 ARG 376 ? ? ? 2 .
A 1 377 ALA 377 ? ? ? 2 .
A 1 378 GLN 378 ? ? ? 2 .
A 1 379 VAL 379 ? ? ? 2 .
A 1 380 GLY 380 ? ? ? 2 .
A 1 381 SER 381 381 SER SER 2 .
A 1 382 ARG 382 382 ARG ARG 2 .
A 1 383 TRP 383 383 TRP TRP 2 .
A 1 384 THR 384 384 THR THR 2 .
A 1 385 TRP 385 385 TRP TRP 2 .
A 1 386 LEU 386 386 LEU LEU 2 .
A 1 387 GLN 387 387 GLN GLN 2 .
A 1 388 ALA 388 388 ALA ALA 2 .
A 1 389 GLN 389 389 GLN GLN 2 .
A 1 390 ILE 390 390 ILE ILE 2 .
A 1 391 SER 391 391 SER SER 2 .
A 1 392 GLU 392 392 GLU GLU 2 .
A 1 393 LEU 393 393 LEU LEU 2 .
A 1 394 GLU 394 394 GLU GLU 2 .
A 1 395 TYR 395 395 TYR TYR 2 .
A 1 396 LYS 396 396 LYS LYS 2 .
A 1 397 ILE 397 397 ILE ILE 2 .
A 1 398 GLN 398 398 GLN GLN 2 .
A 1 399 GLN 399 399 GLN GLN 2 .
A 1 400 LEU 400 400 LEU LEU 2 .
A 1 401 THR 401 401 THR THR 2 .
A 1 402 ASP 402 402 ASP ASP 2 .
A 1 403 ILE 403 403 ILE ILE 2 .
A 1 404 HIS 404 404 HIS HIS 2 .
A 1 405 ARG 405 405 ARG ARG 2 .
A 1 406 GLN 406 406 GLN GLN 2 .
A 1 407 ILE 407 407 ILE ILE 2 .
A 1 408 ARG 408 408 ARG ARG 2 .
A 1 409 ALA 409 ? ? ? 2 .
A 1 410 SER 410 ? ? ? 2 .
A 1 411 LYS 411 ? ? ? 2 .
A 1 412 VAL 412 ? ? ? 2 .
A 1 413 PRO 413 ? ? ? 2 .
A 1 414 GLN 414 ? ? ? 2 .
A 1 415 ARG 415 ? ? ? 2 .
A 1 416 SER 416 ? ? ? 2 .
A 1 417 GLU 417 ? ? ? 2 .
A 1 418 GLU 418 ? ? ? 2 .
A 1 419 PRO 419 ? ? ? 2 .
A 1 420 LEU 420 ? ? ? 2 .
A 1 421 PRO 421 ? ? ? 2 .
A 1 422 GLU 422 ? ? ? 2 .
A 1 423 HIS 423 ? ? ? 2 .
A 1 424 ASP 424 ? ? ? 2 .
A 1 425 PHE 425 ? ? ? 2 .
A 1 426 GLU 426 ? ? ? 2 .
A 1 427 MET 427 ? ? ? 2 .
A 1 428 SER 428 ? ? ? 2 .
A 1 429 PRO 429 ? ? ? 2 .
A 1 430 SER 430 ? ? ? 2 .
A 1 431 SER 431 ? ? ? 2 .
A 1 432 PRO 432 ? ? ? 2 .
A 1 433 THR 433 ? ? ? 2 .
A 1 434 LEU 434 ? ? ? 2 .
A 1 435 LEU 435 ? ? ? 2 .
A 1 436 LEU 436 ? ? ? 2 .
A 1 437 ARG 437 ? ? ? 2 .
A 1 438 ASN 438 ? ? ? 2 .
A 1 439 ILE 439 ? ? ? 2 .
A 1 440 GLU 440 ? ? ? 2 .
A 1 441 LYS 441 ? ? ? 2 .
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A 1 443 SER 443 ? ? ? 2 .
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A 1 841 SER 841 ? ? ? 2 .
A 1 842 SER 842 ? ? ? 2 .
A 1 843 GLU 843 ? ? ? 2 .
A 1 844 LEU 844 ? ? ? 2 .
A 1 845 GLY 845 ? ? ? 2 .
A 1 846 SER 846 ? ? ? 2 .
A 1 847 ALA 847 ? ? ? 2 .
A 1 848 GLN 848 ? ? ? 2 .
A 1 849 GLN 849 ? ? ? 2 .
A 1 850 GLY 850 ? ? ? 2 .
A 1 851 THR 851 ? ? ? 2 .
A 1 852 ALA 852 ? ? ? 2 .
A 1 853 GLU 853 ? ? ? 2 .
A 1 854 SER 854 ? ? ? 2 .
A 1 855 PRO 855 ? ? ? 2 .
A 1 856 PHE 856 ? ? ? 2 .
A 1 857 GLU 857 ? ? ? 2 .
A 1 858 LEU 858 ? ? ? 2 .
A 1 859 PRO 859 ? ? ? 2 .
A 1 860 ALA 860 ? ? ? 2 .
A 1 861 GLU 861 ? ? ? 2 .
A 1 862 SER 862 ? ? ? 2 .
A 1 863 HIS 863 ? ? ? 2 .
A 1 864 SER 864 ? ? ? 2 .
A 1 865 LEU 865 ? ? ? 2 .
A 1 866 CYS 866 ? ? ? 2 .
A 1 867 ALA 867 ? ? ? 2 .
A 1 868 GLN 868 ? ? ? 2 .
A 1 869 ASP 869 ? ? ? 2 .
A 1 870 SER 870 ? ? ? 2 .
A 1 871 LEU 871 ? ? ? 2 .
A 1 872 SER 872 ? ? ? 2 .
A 1 873 LEU 873 ? ? ? 2 .
A 1 874 ASN 874 ? ? ? 2 .
A 1 875 ASP 875 ? ? ? 2 .
A 1 876 GLY 876 ? ? ? 2 .
A 1 877 GLN 877 ? ? ? 2 .
A 1 878 GLU 878 ? ? ? 2 .
A 1 879 ASP 879 ? ? ? 2 .
A 1 880 LYS 880 ? ? ? 2 .
A 1 881 SER 881 ? ? ? 2 .
A 1 882 LEU 882 ? ? ? 2 .
A 1 883 ARG 883 ? ? ? 2 .
A 1 884 TRP 884 ? ? ? 2 .
A 1 885 GLU 885 ? ? ? 2 .
A 1 886 ARG 886 ? ? ? 2 .
A 1 887 ARG 887 ? ? ? 2 .
A 1 888 ALA 888 ? ? ? 2 .
A 1 889 PHE 889 ? ? ? 2 .
A 1 890 PRO 890 ? ? ? 2 .
A 1 891 LEU 891 ? ? ? 2 .
A 1 892 LYS 892 ? ? ? 2 .
A 1 893 ASP 893 ? ? ? 2 .
A 1 894 GLU 894 ? ? ? 2 .
A 1 895 ASP 895 ? ? ? 2 .
A 1 896 THR 896 ? ? ? 2 .
A 1 897 ALA 897 ? ? ? 2 .
A 1 898 ALA 898 ? ? ? 2 .
A 1 899 LEU 899 ? ? ? 2 .
A 1 900 LEU 900 ? ? ? 2 .
A 1 901 CYS 901 ? ? ? 2 .
A 1 902 GLN 902 ? ? ? 2 .
A 1 903 ASP 903 ? ? ? 2 .
A 1 904 GLU 904 ? ? ? 2 .
A 1 905 ARG 905 ? ? ? 2 .
A 1 906 LYS 906 ? ? ? 2 .
A 1 907 ASP 907 ? ? ? 2 .
A 1 908 GLN 908 ? ? ? 2 .
A 1 909 THR 909 ? ? ? 2 .
A 1 910 GLY 910 ? ? ? 2 .
A 1 911 GLY 911 ? ? ? 2 .
A 1 912 THR 912 ? ? ? 2 .
A 1 913 SER 913 ? ? ? 2 .
A 1 914 THR 914 ? ? ? 2 .
A 1 915 ALA 915 ? ? ? 2 .
A 1 916 PHE 916 ? ? ? 2 .
A 1 917 HIS 917 ? ? ? 2 .
A 1 918 ASP 918 ? ? ? 2 .
A 1 919 GLU 919 ? ? ? 2 .
A 1 920 VAL 920 ? ? ? 2 .
A 1 921 PHE 921 ? ? ? 2 .
A 1 922 CYS 922 ? ? ? 2 .
A 1 923 SER 923 ? ? ? 2 .
A 1 924 THR 924 ? ? ? 2 .
A 1 925 THR 925 ? ? ? 2 .
A 1 926 PRO 926 ? ? ? 2 .
A 1 927 GLU 927 ? ? ? 2 .
A 1 928 SER 928 ? ? ? 2 .
A 1 929 GLY 929 ? ? ? 2 .
A 1 930 HIS 930 ? ? ? 2 .
A 1 931 PRO 931 ? ? ? 2 .
A 1 932 PRO 932 ? ? ? 2 .
A 1 933 LYS 933 ? ? ? 2 .
A 1 934 MET 934 ? ? ? 2 .
A 1 935 GLN 935 ? ? ? 2 .
A 1 936 LEU 936 ? ? ? 2 .
A 1 937 ASP 937 ? ? ? 2 .
A 1 938 GLY 938 ? ? ? 2 .
A 1 939 MET 939 ? ? ? 2 .
A 1 940 GLU 940 ? ? ? 2 .
A 1 941 GLU 941 ? ? ? 2 .
A 1 942 TYR 942 ? ? ? 2 .
A 1 943 LYS 943 ? ? ? 2 .
A 1 944 SER 944 ? ? ? 2 .
A 1 945 PHE 945 ? ? ? 2 .
A 1 946 GLY 946 ? ? ? 2 .
A 1 947 ILE 947 ? ? ? 2 .
A 1 948 GLY 948 ? ? ? 2 .
A 1 949 VAL 949 ? ? ? 2 .
A 1 950 THR 950 ? ? ? 2 .
A 1 951 ASN 951 ? ? ? 2 .
A 1 952 VAL 952 ? ? ? 2 .
A 1 953 LYS 953 ? ? ? 2 .
A 1 954 ARG 954 ? ? ? 2 .
A 1 955 ASN 955 ? ? ? 2 .
A 1 956 ARG 956 ? ? ? 2 .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'IL4I1 protein {PDB ID=7vop, label_asym_id=CA, auth_asym_id=c, SMTL ID=7vop.1.2}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 7vop, label_asym_id=CA'
'target-template alignment' .
4 'model 3' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A CA 15 1 c
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP
SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT
SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS
SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP
SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA
TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF
ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG
DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD
;

;MSGFNFGAASAGGFSFGNPKSTTTTAPTGFSFGAATAAPSGGFSFGTATPTPASTTGQTSGLFSFSNPAP
SLAPTSGFSFGAQVTSTPAPSSGGLAFGANTSKLNSGVGNQPAGGTTQTSQPMGGFSFGAATTQTQPSAT
SVGGFSFAGGVGSTSTNVFAQPAASTGITLQSAVSTAAAPTATTSQPTSTFSFGTQPQAAPALNFGLLSS
SSVLSTASTPAAAQPVAPTTGLSLNFGKPADTSAAVTSTGSTTTNTPSLSSLLGTSGPSLFSSVATSTVP
SVVSTVASGLSLTSTATSTGFGMKTLASSAVPTGTLATSTASLGVKAPLAGTIVQANAVGSAAATGISTA
TAMTYAQLENLINKWSLELEDQEKHFLQQATQVNAWDRTLMQNGERITTLHREMEKVKLDQKRLDQELDF
ILSQQKELEDLLTPLEESVKEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKEVIEHLNTSAGPG
DASNPLQQICKILNAHMDSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRRKEQERGFSIAFD
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 508 535
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 7vop 2024-06-19
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 956
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 956 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 19.000 21.429
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MTPALKEATTKGICFSSLPNTMESDKMLCMESPRTVDEKLKGGDTFSQMLGFPTPEPTLNTNFVNLKHFASPQASKHFQTVLLMSSNSTLNKYNENYNQKKVMESNCSKLKNVLCNGSSIQLSKICPSHSENEFIKKELSDTTSQCMKDIQIVLDSNLTKDANVDRLHLQNCKWYQKNALLDKFTDTKIKKGLLQCTQKKIGPSHSDVPTSSSAAEKEQEVNARLLHCVSKQKILLSQARRTQKHLQMLLAKHVVKHYGQQMKFSMKHQLPTMKIFHEPTTVLSNSLLEHTEIKPEVNILASENKFWDDTNNGFSQCTAAEIQRFALSATGLLSHVEEGLDSDATDSSSDDELDEYTIRKNVAVNSSTEWKWLVDRAQVGSRWTWLQAQISELEYKIQQLTDIHRQIRASKVPQRSEEPLPEHDFEMSPSSPTLLLRNIEKQSAQLTEIINSLIAPLNLSPTSSPLSSKSCSHKCLANGISRSASENLDELSSSSSWLLNQKHSKKRRKDRTRLKSPSLAIMSTAARTRPLQSFHKRKLYRLSPTFYWTPETLPSKEAFLSSTQTPYTGSPFSWDNWEQSSRSHLLREQVSKLDSSFHPVLSLPSEIPLHLHFETLFKKTDMKGELAENQFVGDCLISPPPVQGTSSLNQWRNGYSPICKPQIRSQPSVQLLQGRKKRHLSETALAGERTRFEEFAFQRSEPGSHCNFTAVSNANVTSRTQNPSSQNTSRRRLRSESSYDIDNIVIPMSLVAPAKLEKLQYKEILTPRWRKVVLQPLDEHNLNKEEIEDLSDDVFSLRHRKYEEREQARWSLWEQSKWHRRNNRAYSKNVEGQDLVLKEHSSELGSAQQGTAESPFELPAESHSLCAQDSLSLNDGQEDKSLRWERRAFPLKDEDTAALLCQDERKDQTGGTSTAFHDEVFCSTTPESGHPPKMQLDGMEEYKSFGIGVTNVKRNR
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DSLQWIDQNSALLQRKVEQVTKECESRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7vop.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . SER 381 381 ? A 209.209 422.955 414.034 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 2 C CA . SER 381 381 ? A 208.395 423.303 415.273 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 3 C C . SER 381 381 ? A 207.876 424.713 415.360 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 4 O O . SER 381 381 ? A 206.716 424.913 415.680 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 5 C CB . SER 381 381 ? A 209.173 422.967 416.571 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 6 O OG . SER 381 381 ? A 209.571 421.600 416.501 1 1 2 SER 0.500 1
ATOM 7 N N . ARG 382 382 ? A 208.699 425.738 415.024 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 8 C CA . ARG 382 382 ? A 208.246 427.115 414.947 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 9 C C . ARG 382 382 ? A 207.134 427.331 413.928 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 10 O O . ARG 382 382 ? A 206.135 427.944 414.252 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 11 C CB . ARG 382 382 ? A 209.438 428.038 414.612 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 12 C CG . ARG 382 382 ? A 210.474 428.141 415.749 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 13 C CD . ARG 382 382 ? A 211.652 429.028 415.345 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 14 N NE . ARG 382 382 ? A 212.612 429.071 416.495 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 15 C CZ . ARG 382 382 ? A 213.821 429.645 416.414 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 16 N NH1 . ARG 382 382 ? A 214.250 430.184 415.278 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 17 N NH2 . ARG 382 382 ? A 214.612 429.693 417.483 1 1 2 ARG 0.470 1
ATOM 18 N N . TRP 383 383 ? A 207.240 426.745 412.705 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 19 C CA . TRP 383 383 ? A 206.182 426.802 411.705 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 20 C C . TRP 383 383 ? A 204.863 426.206 412.204 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 21 O O . TRP 383 383 ? A 203.802 426.791 412.048 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 22 C CB . TRP 383 383 ? A 206.649 426.078 410.407 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 23 C CG . TRP 383 383 ? A 205.655 426.149 409.259 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 24 C CD1 . TRP 383 383 ? A 205.455 427.170 408.372 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 25 C CD2 . TRP 383 383 ? A 204.645 425.158 408.964 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 26 N NE1 . TRP 383 383 ? A 204.406 426.876 407.525 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 27 C CE2 . TRP 383 383 ? A 203.898 425.643 407.881 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 28 C CE3 . TRP 383 383 ? A 204.340 423.931 409.559 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 29 C CZ2 . TRP 383 383 ? A 202.840 424.909 407.352 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 30 C CZ3 . TRP 383 383 ? A 203.275 423.188 409.024 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 31 C CH2 . TRP 383 383 ? A 202.540 423.665 407.933 1 1 2 TRP 0.550 1
ATOM 32 N N . THR 384 384 ? A 204.934 425.044 412.892 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 33 C CA . THR 384 384 ? A 203.795 424.373 413.510 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 34 C C . THR 384 384 ? A 203.116 425.226 414.564 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 35 O O . THR 384 384 ? A 201.895 425.354 414.580 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 36 C CB . THR 384 384 ? A 204.199 423.062 414.184 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 37 O OG1 . THR 384 384 ? A 204.876 422.209 413.271 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 38 C CG2 . THR 384 384 ? A 202.973 422.312 414.738 1 1 2 THR 0.770 1
ATOM 39 N N . TRP 385 385 ? A 203.908 425.871 415.455 1 1 2 TRP 0.640 1
ATOM 40 C CA . TRP 385 385 ? A 203.411 426.819 416.438 1 1 2 TRP 0.640 1
ATOM 41 C C . TRP 385 385 ? A 202.773 428.043 415.803 1 1 2 TRP 0.640 1
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ATOM 59 C CD1 . LEU 386 386 ? A 206.085 431.251 412.392 1 1 2 LEU 0.790 1
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ATOM 119 C CB . GLU 394 394 ? A 191.738 432.073 411.659 1 1 2 GLU 0.790 1
ATOM 120 C CG . GLU 394 394 ? A 190.708 432.013 410.504 1 1 2 GLU 0.790 1
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ATOM 149 C CB . ILE 397 397 ? A 189.042 436.730 413.471 1 1 2 ILE 0.830 1
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ATOM 202 N N . HIS 404 404 ? A 178.834 439.389 415.728 1 1 2 HIS 0.780 1
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ATOM 220 C CZ . ARG 405 405 ? A 180.330 436.171 408.135 1 1 2 ARG 0.670 1
ATOM 221 N NH1 . ARG 405 405 ? A 180.079 434.872 408.263 1 1 2 ARG 0.670 1
ATOM 222 N NH2 . ARG 405 405 ? A 181.322 436.567 407.340 1 1 2 ARG 0.670 1
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ATOM 241 C CA . ARG 408 408 ? A 172.989 442.483 412.812 1 1 2 ARG 0.440 1
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ATOM 247 N NE . ARG 408 408 ? A 172.658 445.566 409.741 1 1 2 ARG 0.440 1
ATOM 248 C CZ . ARG 408 408 ? A 171.916 446.673 409.891 1 1 2 ARG 0.440 1
ATOM 249 N NH1 . ARG 408 408 ? A 171.838 447.290 411.068 1 1 2 ARG 0.440 1
ATOM 250 N NH2 . ARG 408 408 ? A 171.206 447.149 408.871 1 1 2 ARG 0.440 1
ATOM 251 O OXT . ARG 408 408 ? A 171.028 442.662 411.424 1 1 2 ARG 0.440 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
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1 1 2 0.731
2 1 3 0.007
#
#
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_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
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_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
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1 1 A 381 SER 1 0.500
2 1 A 382 ARG 1 0.470
3 1 A 383 TRP 1 0.550
4 1 A 384 THR 1 0.770
5 1 A 385 TRP 1 0.640
6 1 A 386 LEU 1 0.790
7 1 A 387 GLN 1 0.760
8 1 A 388 ALA 1 0.820
9 1 A 389 GLN 1 0.780
10 1 A 390 ILE 1 0.840
11 1 A 391 SER 1 0.810
12 1 A 392 GLU 1 0.780
13 1 A 393 LEU 1 0.850
14 1 A 394 GLU 1 0.790
15 1 A 395 TYR 1 0.840
16 1 A 396 LYS 1 0.790
17 1 A 397 ILE 1 0.830
18 1 A 398 GLN 1 0.780
19 1 A 399 GLN 1 0.760
20 1 A 400 LEU 1 0.820
21 1 A 401 THR 1 0.830
22 1 A 402 ASP 1 0.780
23 1 A 403 ILE 1 0.790
24 1 A 404 HIS 1 0.780
25 1 A 405 ARG 1 0.670
26 1 A 406 GLN 1 0.680
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28 1 A 408 ARG 1 0.440
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#