data_SMR-af319f9f327145f565cae4a44bf3c66f_6 _entry.id SMR-af319f9f327145f565cae4a44bf3c66f_6 _struct.entry_id SMR-af319f9f327145f565cae4a44bf3c66f_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q13625 (isoform 2)/ ASPP2_HUMAN, Apoptosis-stimulating of p53 protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.042, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q13625 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 129646.745 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ASPP2_HUMAN Q13625 1 ;MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKV RALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAEL DRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKG SKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFG TLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTK PKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMY TQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSS VQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDM PAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPE ITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITAL HNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKC EEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLN DKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA ; 'Apoptosis-stimulating of p53 protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1005 1 1005 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ASPP2_HUMAN Q13625 Q13625-2 1 1005 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-08-15 3DF4FF49EB589F20 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 7 ;MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKV RALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAEL DRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKG SKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFG TLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTK PKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMY TQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSS VQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDM PAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPE ITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITAL HNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKC EEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLN DKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA ; ;MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKV RALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAEL DRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKG SKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFG TLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTK PKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMY TQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSS VQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDM PAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPE ITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITAL HNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKC EEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLN DKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 LEU . 1 4 THR . 1 5 LEU . 1 6 ALA . 1 7 GLU . 1 8 LEU . 1 9 GLN . 1 10 GLU . 1 11 MET . 1 12 ALA . 1 13 SER . 1 14 ARG . 1 15 GLN . 1 16 GLN . 1 17 GLN . 1 18 GLN . 1 19 ILE . 1 20 GLU . 1 21 ALA . 1 22 GLN . 1 23 GLN . 1 24 GLN . 1 25 LEU . 1 26 LEU . 1 27 ALA . 1 28 THR . 1 29 LYS . 1 30 GLU . 1 31 GLN . 1 32 ARG . 1 33 LEU . 1 34 LYS . 1 35 PHE . 1 36 LEU . 1 37 LYS . 1 38 GLN . 1 39 GLN . 1 40 ASP . 1 41 GLN . 1 42 ARG . 1 43 GLN . 1 44 GLN . 1 45 GLN . 1 46 GLN . 1 47 VAL . 1 48 ALA . 1 49 GLU . 1 50 GLN . 1 51 GLU . 1 52 LYS . 1 53 LEU . 1 54 LYS . 1 55 ARG . 1 56 LEU . 1 57 LYS . 1 58 GLU . 1 59 ILE . 1 60 ALA . 1 61 GLU . 1 62 ASN . 1 63 GLN . 1 64 GLU . 1 65 ALA . 1 66 LYS . 1 67 LEU . 1 68 LYS . 1 69 LYS . 1 70 VAL . 1 71 ARG . 1 72 ALA . 1 73 LEU . 1 74 LYS . 1 75 GLY . 1 76 HIS . 1 77 VAL . 1 78 GLU . 1 79 GLN . 1 80 LYS . 1 81 ARG . 1 82 LEU . 1 83 SER . 1 84 ASN . 1 85 GLY . 1 86 LYS . 1 87 LEU . 1 88 VAL . 1 89 GLU . 1 90 GLU . 1 91 ILE . 1 92 GLU . 1 93 GLN . 1 94 MET . 1 95 ASN . 1 96 ASN . 1 97 LEU . 1 98 PHE . 1 99 GLN . 1 100 GLN . 1 101 LYS . 1 102 GLN . 1 103 ARG . 1 104 GLU . 1 105 LEU . 1 106 VAL . 1 107 LEU . 1 108 ALA . 1 109 VAL . 1 110 SER . 1 111 LYS . 1 112 VAL . 1 113 GLU . 1 114 GLU . 1 115 LEU . 1 116 THR . 1 117 ARG . 1 118 GLN . 1 119 LEU . 1 120 GLU . 1 121 MET . 1 122 LEU . 1 123 LYS . 1 124 ASN . 1 125 GLY . 1 126 ARG . 1 127 ILE . 1 128 ASP . 1 129 SER . 1 130 HIS . 1 131 HIS . 1 132 ASP . 1 133 ASN . 1 134 GLN . 1 135 SER . 1 136 ALA . 1 137 VAL . 1 138 ALA . 1 139 GLU . 1 140 LEU . 1 141 ASP . 1 142 ARG . 1 143 LEU . 1 144 TYR . 1 145 LYS . 1 146 GLU . 1 147 LEU . 1 148 GLN . 1 149 LEU . 1 150 ARG . 1 151 ASN . 1 152 LYS . 1 153 LEU . 1 154 ASN . 1 155 GLN . 1 156 GLU . 1 157 GLN . 1 158 ASN . 1 159 ALA . 1 160 LYS . 1 161 LEU . 1 162 GLN . 1 163 GLN . 1 164 GLN . 1 165 ARG . 1 166 GLU . 1 167 CYS . 1 168 LEU . 1 169 ASN . 1 170 LYS . 1 171 ARG . 1 172 ASN . 1 173 SER . 1 174 GLU . 1 175 VAL . 1 176 ALA . 1 177 VAL . 1 178 MET . 1 179 ASP . 1 180 LYS . 1 181 ARG . 1 182 VAL . 1 183 ASN . 1 184 GLU . 1 185 LEU . 1 186 ARG . 1 187 ASP . 1 188 ARG . 1 189 LEU . 1 190 TRP . 1 191 LYS . 1 192 LYS . 1 193 LYS . 1 194 ALA . 1 195 ALA . 1 196 LEU . 1 197 GLN . 1 198 GLN . 1 199 LYS . 1 200 GLU . 1 201 ASN . 1 202 LEU . 1 203 PRO . 1 204 VAL . 1 205 SER . 1 206 SER . 1 207 ASP . 1 208 GLY . 1 209 ASN . 1 210 LEU . 1 211 PRO . 1 212 GLN . 1 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A 1 1005 ALA 1005 ? ? ? 7 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Outer dynein arm protein 1 {PDB ID=7kzm, label_asym_id=HA, auth_asym_id=Y, SMTL ID=7kzm.1.7}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7kzm, label_asym_id=HA' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A HA 18 1 Y # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MPSADATRGGGSAGSMGKGTLGAGDTLGHKSVLDKQRAAIEKLRAQNEQLKTELLLENKFSVRPGDPFAQ ALINRLQDEGDMLARKIVLEMRKTKMLDQQLSEMGSTLTTTRNNMGGIFSAKEQSTAVQKRIKLLENRLE KAYVKYNQSITHNKQLRESINNLRRERIMFESIQSNLERELAKLKRDMADMIQQANGAFEAREKAIGEMN ALKAQADKEQQGFEEEWRQLTTIIEEDKKERERARAQELAMRERETQELLKMGTLSSAEKKKRITKGSWN VGYNKAMAQNVAAEKVEMYGQAFKRIQDATGIEDIDQLVNTFLAAEDQNYTLFNYVNEVNQEIEKLEDQI NIMRGEINKYRETGRELDMTKSRELTEEEARLAASEAQSQLYEKRTDSALSMTTALKAGINDLFERIGCN TPAVRDLLGEEGVTEANLTAYLGIIEQRTNEILQIYAKRKAQQGTDGLAEALLAQPLTQPGNRIIIEPPS TTQEEEVEGLEPEPVEEDRPLTREHLESKVQRTLPRKLETAIKVRPAGADATGGKRGSPTRR ; ;MPSADATRGGGSAGSMGKGTLGAGDTLGHKSVLDKQRAAIEKLRAQNEQLKTELLLENKFSVRPGDPFAQ ALINRLQDEGDMLARKIVLEMRKTKMLDQQLSEMGSTLTTTRNNMGGIFSAKEQSTAVQKRIKLLENRLE KAYVKYNQSITHNKQLRESINNLRRERIMFESIQSNLERELAKLKRDMADMIQQANGAFEAREKAIGEMN ALKAQADKEQQGFEEEWRQLTTIIEEDKKERERARAQELAMRERETQELLKMGTLSSAEKKKRITKGSWN VGYNKAMAQNVAAEKVEMYGQAFKRIQDATGIEDIDQLVNTFLAAEDQNYTLFNYVNEVNQEIEKLEDQI NIMRGEINKYRETGRELDMTKSRELTEEEARLAASEAQSQLYEKRTDSALSMTTALKAGINDLFERIGCN TPAVRDLLGEEGVTEANLTAYLGIIEQRTNEILQIYAKRKAQQGTDGLAEALLAQPLTQPGNRIIIEPPS TTQEEEVEGLEPEPVEEDRPLTREHLESKVQRTLPRKLETAIKVRPAGADATGGKRGSPTRR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 34 239 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7kzm 2024-03-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1005 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1029 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.035 15.385 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQR--------------------QQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLRNKLNQ---EQNAKLQQQRECLNKR-NSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLLYQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA 2 1 2 ------------DKQRAAIEKLRAQNEQLKTELLLENKFSVRPGDPFAQALINRLQDEGDMLARKIVLEMRKTKMLDQQLSEMGSTLTTTRNNMGGIFSAKEQSTAVQKRIKLLENRLEKAYVKYNQSITHNKQLRESINNLRRERIMFESIQSNLERELAKLKRDMADMIQQANGAFEAREKAIGEMNALKAQADKEQQGFEEEWRQLTTIIEEDKK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7kzm.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 134 134 ? A 508.862 508.696 689.412 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 2 C CA . GLN 134 134 ? A 508.549 510.070 688.882 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 3 C C . GLN 134 134 ? A 509.320 510.490 687.652 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 4 O O . GLN 134 134 ? A 508.706 510.970 686.714 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 5 C CB . GLN 134 134 ? A 508.711 511.118 689.993 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 6 C CG . GLN 134 134 ? A 507.737 510.932 691.179 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 7 C CD . GLN 134 134 ? A 508.066 511.979 692.246 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 134 134 ? A 509.208 512.424 692.331 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 134 134 ? A 507.077 512.362 693.079 1 1 7 GLN 0.590 1 ATOM 10 N N . SER 135 135 ? A 510.654 510.265 687.582 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 11 C CA . SER 135 135 ? A 511.416 510.481 686.339 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 12 C C . SER 135 135 ? A 510.856 509.669 685.158 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 13 O O . SER 135 135 ? A 510.553 510.238 684.121 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 14 C CB . SER 135 135 ? A 512.931 510.193 686.576 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 15 O OG . SER 135 135 ? A 513.833 510.799 685.655 1 1 7 SER 0.630 1 ATOM 16 N N . ALA 136 136 ? A 510.523 508.362 685.350 1 1 7 ALA 0.610 1 ATOM 17 C CA . ALA 136 136 ? A 509.874 507.522 684.338 1 1 7 ALA 0.610 1 ATOM 18 C C . ALA 136 136 ? A 508.625 508.110 683.653 1 1 7 ALA 0.610 1 ATOM 19 O O . ALA 136 136 ? A 508.442 507.955 682.450 1 1 7 ALA 0.610 1 ATOM 20 C CB . ALA 136 136 ? A 509.557 506.121 684.927 1 1 7 ALA 0.610 1 ATOM 21 N N . VAL 137 137 ? A 507.763 508.853 684.390 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 22 C CA . VAL 137 137 ? A 506.619 509.596 683.854 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 23 C C . VAL 137 137 ? A 507.094 510.610 682.796 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 24 O O . VAL 137 137 ? A 506.589 510.647 681.680 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 25 C CB . VAL 137 137 ? A 505.829 510.258 685.004 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 26 C CG1 . VAL 137 137 ? A 504.691 511.159 684.480 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 27 C CG2 . VAL 137 137 ? A 505.258 509.180 685.963 1 1 7 VAL 0.570 1 ATOM 28 N N . ALA 138 138 ? A 508.174 511.370 683.091 1 1 7 ALA 0.640 1 ATOM 29 C CA . ALA 138 138 ? A 508.775 512.358 682.212 1 1 7 ALA 0.640 1 ATOM 30 C C . ALA 138 138 ? A 509.371 511.797 680.913 1 1 7 ALA 0.640 1 ATOM 31 O O . ALA 138 138 ? A 509.228 512.405 679.849 1 1 7 ALA 0.640 1 ATOM 32 C CB . ALA 138 138 ? A 509.879 513.154 682.950 1 1 7 ALA 0.640 1 ATOM 33 N N . GLU 139 139 ? A 510.081 510.638 680.951 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 34 C CA . GLU 139 139 ? A 510.487 509.926 679.736 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 35 C C . GLU 139 139 ? A 509.310 509.390 678.940 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 36 O O . GLU 139 139 ? A 509.278 509.529 677.716 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 37 C CB . GLU 139 139 ? A 511.476 508.737 679.910 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 38 C CG . GLU 139 139 ? A 512.918 509.119 680.326 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 39 C CD . GLU 139 139 ? A 513.164 509.344 681.815 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 40 O OE1 . GLU 139 139 ? A 512.635 508.570 682.653 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 41 O OE2 . GLU 139 139 ? A 513.929 510.310 682.096 1 1 7 GLU 0.620 1 ATOM 42 N N . LEU 140 140 ? A 508.309 508.779 679.612 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 43 C CA . LEU 140 140 ? A 507.106 508.268 678.967 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 44 C C . LEU 140 140 ? A 506.316 509.376 678.254 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 45 O O . LEU 140 140 ? A 506.010 509.247 677.068 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 46 C CB . LEU 140 140 ? A 506.218 507.445 679.946 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 47 C CG . LEU 140 140 ? A 506.507 505.914 680.008 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 48 C CD1 . LEU 140 140 ? A 506.186 505.204 678.681 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 49 C CD2 . LEU 140 140 ? A 507.924 505.526 680.463 1 1 7 LEU 0.630 1 ATOM 50 N N . ASP 141 141 ? A 506.066 510.528 678.906 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 51 C CA . ASP 141 141 ? A 505.403 511.695 678.331 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 52 C C . ASP 141 141 ? A 506.097 512.263 677.085 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 53 O O . ASP 141 141 ? A 505.468 512.587 676.072 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 54 C CB . ASP 141 141 ? A 505.312 512.821 679.395 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 55 C CG . ASP 141 141 ? A 504.305 512.510 680.500 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 56 O OD1 . ASP 141 141 ? A 503.488 511.570 680.333 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 57 O OD2 . ASP 141 141 ? A 504.335 513.256 681.513 1 1 7 ASP 0.640 1 ATOM 58 N N . ARG 142 142 ? A 507.446 512.360 677.115 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 59 C CA . ARG 142 142 ? A 508.257 512.705 675.954 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 60 C C . ARG 142 142 ? A 508.163 511.690 674.828 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 61 O O . ARG 142 142 ? A 508.072 512.058 673.657 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 62 C CB . ARG 142 142 ? A 509.763 512.889 676.280 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 63 C CG . ARG 142 142 ? A 510.070 514.148 677.111 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 64 C CD . ARG 142 142 ? A 511.548 514.578 677.108 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 65 N NE . ARG 142 142 ? A 512.382 513.542 677.815 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 66 C CZ . ARG 142 142 ? A 512.645 513.510 679.135 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 67 N NH1 . ARG 142 142 ? A 512.136 514.399 679.980 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 68 N NH2 . ARG 142 142 ? A 513.418 512.540 679.630 1 1 7 ARG 0.640 1 ATOM 69 N N . LEU 143 143 ? A 508.183 510.386 675.164 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 70 C CA . LEU 143 143 ? A 508.017 509.310 674.206 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 71 C C . LEU 143 143 ? A 506.653 509.346 673.503 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 72 O O . LEU 143 143 ? A 506.585 509.296 672.276 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 73 C CB . LEU 143 143 ? A 508.307 507.948 674.896 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 74 C CG . LEU 143 143 ? A 508.686 506.792 673.944 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 75 C CD1 . LEU 143 143 ? A 509.617 505.778 674.630 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 76 C CD2 . LEU 143 143 ? A 507.469 506.061 673.368 1 1 7 LEU 0.670 1 ATOM 77 N N . TYR 144 144 ? A 505.530 509.514 674.244 1 1 7 TYR 0.650 1 ATOM 78 C CA . TYR 144 144 ? A 504.187 509.652 673.669 1 1 7 TYR 0.650 1 ATOM 79 C C . TYR 144 144 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #