data_SMR-6fdb5469085784ff9f8b7467871a272d_2
_entry.id SMR-6fdb5469085784ff9f8b7467871a272d_2
_struct.entry_id SMR-6fdb5469085784ff9f8b7467871a272d_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q66JY2/ IN80D_MOUSE, INO80 complex subunit D

Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q66JY2'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 130894.170 1 .
#
#
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_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP IN80D_MOUSE Q66JY2 1
;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
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SLSTPPTTSNSETTQPAFATVTPSSSSVLPGLPQTSFSGMGPSAELMASTSPKQQLPQFSAAFGHQLSSH
SGIPKDLQPSHSSIAPPTGFTATGATATSTNNASPPFPSPN
;
'INO80 complex subunit D'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1021 1 1021
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . IN80D_MOUSE Q66JY2 . 1 1021 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2019-07-31
CD85869DE1DCB876
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no B
;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
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SGIPKDLQPSHSSIAPPTGFTATGATATSTNNASPPFPSPN
;

;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
DRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKTDPVDEVKARHQMDAMAFSLTVPTLALKMPNGLDSMSLSPPGARVPL
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 TYR .
1 3 GLU .
1 4 GLY .
1 5 LYS .
1 6 HIS .
1 7 ILE .
1 8 HIS .
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1 11 GLU .
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1 13 ASP .
1 14 ASN .
1 15 LYS .
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1 17 LEU .
1 18 CYS .
1 19 SER .
1 20 TYR .
1 21 SER .
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1 23 LYS .
1 24 LEU .
1 25 CYS .
1 26 LYS .
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1 29 ARG .
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1 35 PHE .
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1 73 ARG .
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1 88 LYS .
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1 92 LYS .
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1 158 ASP .
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1 162 LYS .
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1 166 VAL .
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1 192 GLU .
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1 198 PRO .
1 199 THR .
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A 1 6 HIS 6 ? ? ? B .
A 1 7 ILE 7 ? ? ? B .
A 1 8 HIS 8 ? ? ? B .
A 1 9 PHE 9 ? ? ? B .
A 1 10 SER 10 ? ? ? B .
A 1 11 GLU 11 ? ? ? B .
A 1 12 VAL 12 ? ? ? B .
A 1 13 ASP 13 ? ? ? B .
A 1 14 ASN 14 ? ? ? B .
A 1 15 LYS 15 ? ? ? B .
A 1 16 PRO 16 ? ? ? B .
A 1 17 LEU 17 ? ? ? B .
A 1 18 CYS 18 ? ? ? B .
A 1 19 SER 19 ? ? ? B .
A 1 20 TYR 20 ? ? ? B .
A 1 21 SER 21 ? ? ? B .
A 1 22 PRO 22 ? ? ? B .
A 1 23 LYS 23 ? ? ? B .
A 1 24 LEU 24 ? ? ? B .
A 1 25 CYS 25 ? ? ? B .
A 1 26 LYS 26 ? ? ? B .
A 1 27 GLN 27 ? ? ? B .
A 1 28 ARG 28 ? ? ? B .
A 1 29 ARG 29 ? ? ? B .
A 1 30 LEU 30 ? ? ? B .
A 1 31 ASN 31 ? ? ? B .
A 1 32 GLY 32 ? ? ? B .
A 1 33 TYR 33 ? ? ? B .
A 1 34 ALA 34 ? ? ? B .
A 1 35 PHE 35 ? ? ? B .
A 1 36 CYS 36 ? ? ? B .
A 1 37 ILE 37 ? ? ? B .
A 1 38 ARG 38 ? ? ? B .
A 1 39 HIS 39 ? ? ? B .
A 1 40 VAL 40 ? ? ? B .
A 1 41 LEU 41 ? ? ? B .
A 1 42 GLU 42 ? ? ? B .
A 1 43 ASP 43 ? ? ? B .
A 1 44 LYS 44 ? ? ? B .
A 1 45 THR 45 ? ? ? B .
A 1 46 ALA 46 ? ? ? B .
A 1 47 PRO 47 ? ? ? B .
A 1 48 PHE 48 ? ? ? B .
A 1 49 LYS 49 ? ? ? B .
A 1 50 GLN 50 ? ? ? B .
A 1 51 CYS 51 ? ? ? B .
A 1 52 GLU 52 ? ? ? B .
A 1 53 TYR 53 ? ? ? B .
A 1 54 VAL 54 ? ? ? B .
A 1 55 ALA 55 ? ? ? B .
A 1 56 LYS 56 ? ? ? B .
A 1 57 TYR 57 ? ? ? B .
A 1 58 ASN 58 ? ? ? B .
A 1 59 SER 59 ? ? ? B .
A 1 60 GLN 60 ? ? ? B .
A 1 61 ARG 61 ? ? ? B .
A 1 62 CYS 62 ? ? ? B .
A 1 63 THR 63 ? ? ? B .
A 1 64 ASN 64 ? ? ? B .
A 1 65 PRO 65 ? ? ? B .
A 1 66 ILE 66 ? ? ? B .
A 1 67 PRO 67 ? ? ? B .
A 1 68 LYS 68 ? ? ? B .
A 1 69 SER 69 ? ? ? B .
A 1 70 GLU 70 ? ? ? B .
A 1 71 ASP 71 ? ? ? B .
A 1 72 ARG 72 ? ? ? B .
A 1 73 ARG 73 ? ? ? B .
A 1 74 TYR 74 ? ? ? B .
A 1 75 CYS 75 ? ? ? B .
A 1 76 ASN 76 ? ? ? B .
A 1 77 SER 77 ? ? ? B .
A 1 78 HIS 78 ? ? ? B .
A 1 79 LEU 79 ? ? ? B .
A 1 80 GLN 80 ? ? ? B .
A 1 81 VAL 81 ? ? ? B .
A 1 82 LEU 82 ? ? ? B .
A 1 83 GLY 83 ? ? ? B .
A 1 84 PHE 84 ? ? ? B .
A 1 85 ILE 85 ? ? ? B .
A 1 86 PRO 86 ? ? ? B .
A 1 87 LYS 87 ? ? ? B .
A 1 88 LYS 88 ? ? ? B .
A 1 89 GLU 89 ? ? ? B .
A 1 90 ARG 90 ? ? ? B .
A 1 91 LYS 91 ? ? ? B .
A 1 92 LYS 92 ? ? ? B .
A 1 93 LYS 93 ? ? ? B .
A 1 94 THR 94 ? ? ? B .
A 1 95 ASP 95 ? ? ? B .
A 1 96 PRO 96 ? ? ? B .
A 1 97 VAL 97 ? ? ? B .
A 1 98 ASP 98 ? ? ? B .
A 1 99 GLU 99 ? ? ? B .
A 1 100 VAL 100 ? ? ? B .
A 1 101 LYS 101 ? ? ? B .
A 1 102 ALA 102 ? ? ? B .
A 1 103 ARG 103 ? ? ? B .
A 1 104 HIS 104 ? ? ? B .
A 1 105 GLN 105 ? ? ? B .
A 1 106 MET 106 ? ? ? B .
A 1 107 ASP 107 ? ? ? B .
A 1 108 ALA 108 ? ? ? B .
A 1 109 MET 109 ? ? ? B .
A 1 110 ALA 110 ? ? ? B .
A 1 111 PHE 111 ? ? ? B .
A 1 112 SER 112 ? ? ? B .
A 1 113 LEU 113 ? ? ? B .
A 1 114 THR 114 ? ? ? B .
A 1 115 VAL 115 ? ? ? B .
A 1 116 PRO 116 ? ? ? B .
A 1 117 THR 117 ? ? ? B .
A 1 118 LEU 118 ? ? ? B .
A 1 119 ALA 119 ? ? ? B .
A 1 120 LEU 120 ? ? ? B .
A 1 121 LYS 121 ? ? ? B .
A 1 122 MET 122 ? ? ? B .
A 1 123 PRO 123 ? ? ? B .
A 1 124 ASN 124 ? ? ? B .
A 1 125 GLY 125 ? ? ? B .
A 1 126 LEU 126 ? ? ? B .
A 1 127 ASP 127 ? ? ? B .
A 1 128 SER 128 ? ? ? B .
A 1 129 MET 129 ? ? ? B .
A 1 130 SER 130 ? ? ? B .
A 1 131 LEU 131 ? ? ? B .
A 1 132 SER 132 ? ? ? B .
A 1 133 PRO 133 ? ? ? B .
A 1 134 PRO 134 ? ? ? B .
A 1 135 GLY 135 ? ? ? B .
A 1 136 ALA 136 ? ? ? B .
A 1 137 ARG 137 ? ? ? B .
A 1 138 VAL 138 ? ? ? B .
A 1 139 PRO 139 ? ? ? B .
A 1 140 LEU 140 ? ? ? B .
A 1 141 HIS 141 ? ? ? B .
A 1 142 TYR 142 ? ? ? B .
A 1 143 LEU 143 ? ? ? B .
A 1 144 ASP 144 ? ? ? B .
A 1 145 THR 145 ? ? ? B .
A 1 146 GLU 146 ? ? ? B .
A 1 147 LEU 147 ? ? ? B .
A 1 148 GLU 148 ? ? ? B .
A 1 149 ASP 149 ? ? ? B .
A 1 150 PRO 150 ? ? ? B .
A 1 151 PHE 151 ? ? ? B .
A 1 152 ALA 152 ? ? ? B .
A 1 153 PHE 153 ? ? ? B .
A 1 154 ASN 154 ? ? ? B .
A 1 155 GLU 155 ? ? ? B .
A 1 156 GLU 156 ? ? ? B .
A 1 157 ASP 157 ? ? ? B .
A 1 158 ASP 158 ? ? ? B .
A 1 159 ASP 159 ? ? ? B .
A 1 160 LEU 160 ? ? ? B .
A 1 161 LYS 161 ? ? ? B .
A 1 162 LYS 162 ? ? ? B .
A 1 163 GLY 163 ? ? ? B .
A 1 164 VAL 164 ? ? ? B .
A 1 165 THR 165 ? ? ? B .
A 1 166 VAL 166 ? ? ? B .
A 1 167 ARG 167 ? ? ? B .
A 1 168 LYS 168 ? ? ? B .
A 1 169 LYS 169 ? ? ? B .
A 1 170 LEU 170 ? ? ? B .
A 1 171 GLN 171 ? ? ? B .
A 1 172 SER 172 ? ? ? B .
A 1 173 LYS 173 ? ? ? B .
A 1 174 LEU 174 ? ? ? B .
A 1 175 ALA 175 ? ? ? B .
A 1 176 GLN 176 ? ? ? B .
A 1 177 ASN 177 ? ? ? B .
A 1 178 ARG 178 ? ? ? B .
A 1 179 GLN 179 ? ? ? B .
A 1 180 ARG 180 ? ? ? B .
A 1 181 GLN 181 ? ? ? B .
A 1 182 ARG 182 ? ? ? B .
A 1 183 GLU 183 ? ? ? B .
A 1 184 THR 184 ? ? ? B .
A 1 185 GLU 185 ? ? ? B .
A 1 186 ILE 186 ? ? ? B .
A 1 187 LEU 187 ? ? ? B .
A 1 188 LYS 188 ? ? ? B .
A 1 189 VAL 189 ? ? ? B .
A 1 190 ARG 190 ? ? ? B .
A 1 191 GLN 191 ? ? ? B .
A 1 192 GLU 192 ? ? ? B .
A 1 193 HIS 193 ? ? ? B .
A 1 194 PHE 194 ? ? ? B .
A 1 195 SER 195 ? ? ? B .
A 1 196 THR 196 ? ? ? B .
A 1 197 PRO 197 ? ? ? B .
A 1 198 PRO 198 ? ? ? B .
A 1 199 THR 199 ? ? ? B .
A 1 200 PRO 200 ? ? ? B .
A 1 201 PRO 201 ? ? ? B .
A 1 202 GLN 202 ? ? ? B .
A 1 203 GLN 203 ? ? ? B .
A 1 204 HIS 204 ? ? ? B .
A 1 205 THR 205 ? ? ? B .
A 1 206 HIS 206 ? ? ? B .
A 1 207 LEU 207 ? ? ? B .
A 1 208 SER 208 ? ? ? B .
A 1 209 PRO 209 ? ? ? B .
A 1 210 LEU 210 ? ? ? B .
A 1 211 SER 211 ? ? ? B .
A 1 212 THR 212 ? ? ? B .
A 1 213 SER 213 ? ? ? B .
A 1 214 LEU 214 ? ? ? B .
A 1 215 LYS 215 ? ? ? B .
A 1 216 PRO 216 ? ? ? B .
A 1 217 PRO 217 ? ? ? B .
A 1 218 ALA 218 ? ? ? B .
A 1 219 PRO 219 ? ? ? B .
A 1 220 PRO 220 ? ? ? B .
A 1 221 GLN 221 ? ? ? B .
A 1 222 GLY 222 ? ? ? B .
A 1 223 SER 223 ? ? ? B .
A 1 224 VAL 224 ? ? ? B .
A 1 225 CYS 225 ? ? ? B .
A 1 226 LYS 226 ? ? ? B .
A 1 227 SER 227 ? ? ? B .
A 1 228 PRO 228 ? ? ? B .
A 1 229 GLN 229 ? ? ? B .
A 1 230 PRO 230 ? ? ? B .
A 1 231 GLN 231 ? ? ? B .
A 1 232 ASN 232 ? ? ? B .
A 1 233 THR 233 ? ? ? B .
A 1 234 SER 234 ? ? ? B .
A 1 235 LEU 235 ? ? ? B .
A 1 236 PRO 236 ? ? ? B .
A 1 237 MET 237 ? ? ? B .
A 1 238 GLN 238 ? ? ? B .
A 1 239 GLY 239 ? ? ? B .
A 1 240 VAL 240 ? ? ? B .
A 1 241 ALA 241 ? ? ? B .
A 1 242 PRO 242 ? ? ? B .
A 1 243 THR 243 ? ? ? B .
A 1 244 THR 244 ? ? ? B .
A 1 245 HIS 245 ? ? ? B .
A 1 246 SER 246 ? ? ? B .
A 1 247 ILE 247 ? ? ? B .
A 1 248 ALA 248 ? ? ? B .
A 1 249 GLN 249 ? ? ? B .
A 1 250 ILE 250 ? ? ? B .
A 1 251 ARG 251 ? ? ? B .
A 1 252 GLN 252 ? ? ? B .
A 1 253 ALA 253 ? ? ? B .
A 1 254 SER 254 ? ? ? B .
A 1 255 HIS 255 ? ? ? B .
A 1 256 LYS 256 ? ? ? B .
A 1 257 ARG 257 ? ? ? B .
A 1 258 PRO 258 ? ? ? B .
A 1 259 LEU 259 ? ? ? B .
A 1 260 PRO 260 ? ? ? B .
A 1 261 LEU 261 ? ? ? B .
A 1 262 LEU 262 ? ? ? B .
A 1 263 PRO 263 ? ? ? B .
A 1 264 SER 264 ? ? ? B .
A 1 265 SER 265 ? ? ? B .
A 1 266 ARG 266 ? ? ? B .
A 1 267 ALA 267 ? ? ? B .
A 1 268 PRO 268 ? ? ? B .
A 1 269 ILE 269 ? ? ? B .
A 1 270 SER 270 ? ? ? B .
A 1 271 ASP 271 ? ? ? B .
A 1 272 ALA 272 ? ? ? B .
A 1 273 PRO 273 ? ? ? B .
A 1 274 ARG 274 ? ? ? B .
A 1 275 THR 275 ? ? ? B .
A 1 276 ASP 276 ? ? ? B .
A 1 277 ARG 277 ? ? ? B .
A 1 278 ILE 278 ? ? ? B .
A 1 279 LEU 279 ? ? ? B .
A 1 280 MET 280 ? ? ? B .
A 1 281 LYS 281 ? ? ? B .
A 1 282 ALA 282 ? ? ? B .
A 1 283 ALA 283 ? ? ? B .
A 1 284 ALA 284 ? ? ? B .
A 1 285 PHE 285 ? ? ? B .
A 1 286 SER 286 ? ? ? B .
A 1 287 PRO 287 ? ? ? B .
A 1 288 HIS 288 ? ? ? B .
A 1 289 LEU 289 ? ? ? B .
A 1 290 SER 290 ? ? ? B .
A 1 291 CYS 291 ? ? ? B .
A 1 292 ILE 292 ? ? ? B .
A 1 293 SER 293 ? ? ? B .
A 1 294 ARG 294 ? ? ? B .
A 1 295 LEU 295 ? ? ? B .
A 1 296 GLN 296 ? ? ? B .
A 1 297 ARG 297 ? ? ? B .
A 1 298 LEU 298 ? ? ? B .
A 1 299 VAL 299 ? ? ? B .
A 1 300 LYS 300 ? ? ? B .
A 1 301 LEU 301 ? ? ? B .
A 1 302 CYS 302 ? ? ? B .
A 1 303 THR 303 ? ? ? B .
A 1 304 GLN 304 ? ? ? B .
A 1 305 LYS 305 ? ? ? B .
A 1 306 ARG 306 ? ? ? B .
A 1 307 GLN 307 ? ? ? B .
A 1 308 LEU 308 ? ? ? B .
A 1 309 ASP 309 ? ? ? B .
A 1 310 ALA 310 ? ? ? B .
A 1 311 ASP 311 ? ? ? B .
A 1 312 LEU 312 ? ? ? B .
A 1 313 PHE 313 ? ? ? B .
A 1 314 PRO 314 ? ? ? B .
A 1 315 HIS 315 ? ? ? B .
A 1 316 LEU 316 ? ? ? B .
A 1 317 GLY 317 ? ? ? B .
A 1 318 LEU 318 ? ? ? B .
A 1 319 ASP 319 ? ? ? B .
A 1 320 TRP 320 ? ? ? B .
A 1 321 SER 321 ? ? ? B .
A 1 322 GLU 322 ? ? ? B .
A 1 323 GLU 323 ? ? ? B .
A 1 324 SER 324 ? ? ? B .
A 1 325 GLY 325 ? ? ? B .
A 1 326 GLU 326 ? ? ? B .
A 1 327 GLU 327 ? ? ? B .
A 1 328 LEU 328 ? ? ? B .
A 1 329 GLU 329 ? ? ? B .
A 1 330 ASP 330 ? ? ? B .
A 1 331 ALA 331 ? ? ? B .
A 1 332 ASP 332 ? ? ? B .
A 1 333 GLN 333 ? ? ? B .
A 1 334 ALA 334 ? ? ? B .
A 1 335 SER 335 ? ? ? B .
A 1 336 PRO 336 ? ? ? B .
A 1 337 TYR 337 ? ? ? B .
A 1 338 GLN 338 ? ? ? B .
A 1 339 VAL 339 ? ? ? B .
A 1 340 ALA 340 ? ? ? B .
A 1 341 TRP 341 ? ? ? B .
A 1 342 SER 342 ? ? ? B .
A 1 343 ILE 343 ? ? ? B .
A 1 344 ARG 344 ? ? ? B .
A 1 345 GLU 345 ? ? ? B .
A 1 346 THR 346 ? ? ? B .
A 1 347 LEU 347 ? ? ? B .
A 1 348 ARG 348 ? ? ? B .
A 1 349 HIS 349 ? ? ? B .
A 1 350 GLU 350 ? ? ? B .
A 1 351 ARG 351 ? ? ? B .
A 1 352 HIS 352 ? ? ? B .
A 1 353 THR 353 ? ? ? B .
A 1 354 SER 354 ? ? ? B .
A 1 355 ASP 355 ? ? ? B .
A 1 356 ASP 356 ? ? ? B .
A 1 357 ASP 357 ? ? ? B .
A 1 358 ASP 358 ? ? ? B .
A 1 359 MET 359 ? ? ? B .
A 1 360 GLU 360 ? ? ? B .
A 1 361 SER 361 361 SER SER B .
A 1 362 ARG 362 362 ARG ARG B .
A 1 363 SER 363 363 SER SER B .
A 1 364 SER 364 364 SER SER B .
A 1 365 ARG 365 365 ARG ARG B .
A 1 366 VAL 366 366 VAL VAL B .
A 1 367 THR 367 367 THR THR B .
A 1 368 GLN 368 368 GLN GLN B .
A 1 369 LEU 369 369 LEU LEU B .
A 1 370 CYS 370 370 CYS CYS B .
A 1 371 THR 371 371 THR THR B .
A 1 372 TYR 372 372 TYR TYR B .
A 1 373 PHE 373 373 PHE PHE B .
A 1 374 GLN 374 374 GLN GLN B .
A 1 375 GLN 375 375 GLN GLN B .
A 1 376 LYS 376 376 LYS LYS B .
A 1 377 TYR 377 377 TYR TYR B .
A 1 378 LYS 378 378 LYS LYS B .
A 1 379 HIS 379 379 HIS HIS B .
A 1 380 LEU 380 380 LEU LEU B .
A 1 381 CYS 381 381 CYS CYS B .
A 1 382 ARG 382 382 ARG ARG B .
A 1 383 LEU 383 383 LEU LEU B .
A 1 384 GLU 384 384 GLU GLU B .
A 1 385 ARG 385 385 ARG ARG B .
A 1 386 ALA 386 386 ALA ALA B .
A 1 387 GLU 387 ? ? ? B .
A 1 388 SER 388 ? ? ? B .
A 1 389 ARG 389 ? ? ? B .
A 1 390 GLN 390 ? ? ? B .
A 1 391 LYS 391 ? ? ? B .
A 1 392 LYS 392 ? ? ? B .
A 1 393 CYS 393 ? ? ? B .
A 1 394 ARG 394 ? ? ? B .
A 1 395 HIS 395 ? ? ? B .
A 1 396 THR 396 ? ? ? B .
A 1 397 PHE 397 ? ? ? B .
A 1 398 ARG 398 ? ? ? B .
A 1 399 LYS 399 ? ? ? B .
A 1 400 ALA 400 ? ? ? B .
A 1 401 LEU 401 ? ? ? B .
A 1 402 LEU 402 ? ? ? B .
A 1 403 GLN 403 ? ? ? B .
A 1 404 ALA 404 ? ? ? B .
A 1 405 ALA 405 ? ? ? B .
A 1 406 SER 406 ? ? ? B .
A 1 407 LYS 407 ? ? ? B .
A 1 408 GLU 408 ? ? ? B .
A 1 409 PRO 409 ? ? ? B .
A 1 410 GLU 410 ? ? ? B .
A 1 411 CYS 411 ? ? ? B .
A 1 412 THR 412 ? ? ? B .
A 1 413 GLY 413 ? ? ? B .
A 1 414 GLN 414 ? ? ? B .
A 1 415 LEU 415 ? ? ? B .
A 1 416 ILE 416 ? ? ? B .
A 1 417 GLN 417 ? ? ? B .
A 1 418 GLU 418 ? ? ? B .
A 1 419 LEU 419 ? ? ? B .
A 1 420 ARG 420 ? ? ? B .
A 1 421 ARG 421 ? ? ? B .
A 1 422 ALA 422 ? ? ? B .
A 1 423 ALA 423 ? ? ? B .
A 1 424 CYS 424 ? ? ? B .
A 1 425 SER 425 ? ? ? B .
A 1 426 ARG 426 ? ? ? B .
A 1 427 ALA 427 ? ? ? B .
A 1 428 SER 428 ? ? ? B .
A 1 429 LEU 429 ? ? ? B .
A 1 430 ARG 430 ? ? ? B .
A 1 431 GLN 431 ? ? ? B .
A 1 432 THR 432 ? ? ? B .
A 1 433 LYS 433 ? ? ? B .
A 1 434 LEU 434 ? ? ? B .
A 1 435 LYS 435 ? ? ? B .
A 1 436 GLU 436 ? ? ? B .
A 1 437 VAL 437 ? ? ? B .
A 1 438 GLU 438 ? ? ? B .
A 1 439 PRO 439 ? ? ? B .
A 1 440 ALA 440 ? ? ? B .
A 1 441 ALA 441 ? ? ? B .
A 1 442 CYS 442 ? ? ? B .
A 1 443 SER 443 ? ? ? B .
A 1 444 GLY 444 ? ? ? B .
A 1 445 THR 445 ? ? ? B .
A 1 446 VAL 446 ? ? ? B .
A 1 447 LYS 447 ? ? ? B .
A 1 448 GLY 448 ? ? ? B .
A 1 449 GLU 449 ? ? ? B .
A 1 450 GLN 450 ? ? ? B .
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A 1 453 LYS 453 ? ? ? B .
A 1 454 GLN 454 ? ? ? B .
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A 1 782 LEU 782 ? ? ? B .
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A 1 785 GLY 785 ? ? ? B .
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A 1 788 ALA 788 ? ? ? B .
A 1 789 SER 789 ? ? ? B .
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A 1 793 HIS 793 ? ? ? B .
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A 1 795 ALA 795 ? ? ? B .
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A 1 797 LEU 797 ? ? ? B .
A 1 798 LEU 798 ? ? ? B .
A 1 799 SER 799 ? ? ? B .
A 1 800 LYS 800 ? ? ? B .
A 1 801 ALA 801 ? ? ? B .
A 1 802 ASP 802 ? ? ? B .
A 1 803 ASP 803 ? ? ? B .
A 1 804 LEU 804 ? ? ? B .
A 1 805 ILE 805 ? ? ? B .
A 1 806 THR 806 ? ? ? B .
A 1 807 SER 807 ? ? ? B .
A 1 808 ARG 808 ? ? ? B .
A 1 809 GLN 809 ? ? ? B .
A 1 810 GLN 810 ? ? ? B .
A 1 811 TYR 811 ? ? ? B .
A 1 812 SER 812 ? ? ? B .
A 1 813 SER 813 ? ? ? B .
A 1 814 ASP 814 ? ? ? B .
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A 1 816 SER 816 ? ? ? B .
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A 1 818 SER 818 ? ? ? B .
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A 1 845 TYR 845 ? ? ? B .
A 1 846 SER 846 ? ? ? B .
A 1 847 GLY 847 ? ? ? B .
A 1 848 ASP 848 ? ? ? B .
A 1 849 ASN 849 ? ? ? B .
A 1 850 MET 850 ? ? ? B .
A 1 851 ALA 851 ? ? ? B .
A 1 852 ALA 852 ? ? ? B .
A 1 853 THR 853 ? ? ? B .
A 1 854 PHE 854 ? ? ? B .
A 1 855 SER 855 ? ? ? B .
A 1 856 ALA 856 ? ? ? B .
A 1 857 GLU 857 ? ? ? B .
A 1 858 MET 858 ? ? ? B .
A 1 859 PRO 859 ? ? ? B .
A 1 860 ILE 860 ? ? ? B .
A 1 861 MET 861 ? ? ? B .
A 1 862 ALA 862 ? ? ? B .
A 1 863 GLN 863 ? ? ? B .
A 1 864 HIS 864 ? ? ? B .
A 1 865 LEU 865 ? ? ? B .
A 1 866 LEU 866 ? ? ? B .
A 1 867 PRO 867 ? ? ? B .
A 1 868 THR 868 ? ? ? B .
A 1 869 GLN 869 ? ? ? B .
A 1 870 LEU 870 ? ? ? B .
A 1 871 GLU 871 ? ? ? B .
A 1 872 VAL 872 ? ? ? B .
A 1 873 PRO 873 ? ? ? B .
A 1 874 LEU 874 ? ? ? B .
A 1 875 GLY 875 ? ? ? B .
A 1 876 GLY 876 ? ? ? B .
A 1 877 VAL 877 ? ? ? B .
A 1 878 VAL 878 ? ? ? B .
A 1 879 ASN 879 ? ? ? B .
A 1 880 PRO 880 ? ? ? B .
A 1 881 ARG 881 ? ? ? B .
A 1 882 THR 882 ? ? ? B .
A 1 883 HIS 883 ? ? ? B .
A 1 884 TRP 884 ? ? ? B .
A 1 885 GLY 885 ? ? ? B .
A 1 886 ASN 886 ? ? ? B .
A 1 887 LEU 887 ? ? ? B .
A 1 888 PRO 888 ? ? ? B .
A 1 889 VAL 889 ? ? ? B .
A 1 890 ASN 890 ? ? ? B .
A 1 891 LEU 891 ? ? ? B .
A 1 892 GLY 892 ? ? ? B .
A 1 893 ASP 893 ? ? ? B .
A 1 894 PRO 894 ? ? ? B .
A 1 895 SER 895 ? ? ? B .
A 1 896 ALA 896 ? ? ? B .
A 1 897 PHE 897 ? ? ? B .
A 1 898 SER 898 ? ? ? B .
A 1 899 ASN 899 ? ? ? B .
A 1 900 LEU 900 ? ? ? B .
A 1 901 LEU 901 ? ? ? B .
A 1 902 GLY 902 ? ? ? B .
A 1 903 ALA 903 ? ? ? B .
A 1 904 ASP 904 ? ? ? B .
A 1 905 GLY 905 ? ? ? B .
A 1 906 HIS 906 ? ? ? B .
A 1 907 LEU 907 ? ? ? B .
A 1 908 LEU 908 ? ? ? B .
A 1 909 SER 909 ? ? ? B .
A 1 910 THR 910 ? ? ? B .
A 1 911 SER 911 ? ? ? B .
A 1 912 LEU 912 ? ? ? B .
A 1 913 SER 913 ? ? ? B .
A 1 914 THR 914 ? ? ? B .
A 1 915 PRO 915 ? ? ? B .
A 1 916 PRO 916 ? ? ? B .
A 1 917 THR 917 ? ? ? B .
A 1 918 THR 918 ? ? ? B .
A 1 919 SER 919 ? ? ? B .
A 1 920 ASN 920 ? ? ? B .
A 1 921 SER 921 ? ? ? B .
A 1 922 GLU 922 ? ? ? B .
A 1 923 THR 923 ? ? ? B .
A 1 924 THR 924 ? ? ? B .
A 1 925 GLN 925 ? ? ? B .
A 1 926 PRO 926 ? ? ? B .
A 1 927 ALA 927 ? ? ? B .
A 1 928 PHE 928 ? ? ? B .
A 1 929 ALA 929 ? ? ? B .
A 1 930 THR 930 ? ? ? B .
A 1 931 VAL 931 ? ? ? B .
A 1 932 THR 932 ? ? ? B .
A 1 933 PRO 933 ? ? ? B .
A 1 934 SER 934 ? ? ? B .
A 1 935 SER 935 ? ? ? B .
A 1 936 SER 936 ? ? ? B .
A 1 937 SER 937 ? ? ? B .
A 1 938 VAL 938 ? ? ? B .
A 1 939 LEU 939 ? ? ? B .
A 1 940 PRO 940 ? ? ? B .
A 1 941 GLY 941 ? ? ? B .
A 1 942 LEU 942 ? ? ? B .
A 1 943 PRO 943 ? ? ? B .
A 1 944 GLN 944 ? ? ? B .
A 1 945 THR 945 ? ? ? B .
A 1 946 SER 946 ? ? ? B .
A 1 947 PHE 947 ? ? ? B .
A 1 948 SER 948 ? ? ? B .
A 1 949 GLY 949 ? ? ? B .
A 1 950 MET 950 ? ? ? B .
A 1 951 GLY 951 ? ? ? B .
A 1 952 PRO 952 ? ? ? B .
A 1 953 SER 953 ? ? ? B .
A 1 954 ALA 954 ? ? ? B .
A 1 955 GLU 955 ? ? ? B .
A 1 956 LEU 956 ? ? ? B .
A 1 957 MET 957 ? ? ? B .
A 1 958 ALA 958 ? ? ? B .
A 1 959 SER 959 ? ? ? B .
A 1 960 THR 960 ? ? ? B .
A 1 961 SER 961 ? ? ? B .
A 1 962 PRO 962 ? ? ? B .
A 1 963 LYS 963 ? ? ? B .
A 1 964 GLN 964 ? ? ? B .
A 1 965 GLN 965 ? ? ? B .
A 1 966 LEU 966 ? ? ? B .
A 1 967 PRO 967 ? ? ? B .
A 1 968 GLN 968 ? ? ? B .
A 1 969 PHE 969 ? ? ? B .
A 1 970 SER 970 ? ? ? B .
A 1 971 ALA 971 ? ? ? B .
A 1 972 ALA 972 ? ? ? B .
A 1 973 PHE 973 ? ? ? B .
A 1 974 GLY 974 ? ? ? B .
A 1 975 HIS 975 ? ? ? B .
A 1 976 GLN 976 ? ? ? B .
A 1 977 LEU 977 ? ? ? B .
A 1 978 SER 978 ? ? ? B .
A 1 979 SER 979 ? ? ? B .
A 1 980 HIS 980 ? ? ? B .
A 1 981 SER 981 ? ? ? B .
A 1 982 GLY 982 ? ? ? B .
A 1 983 ILE 983 ? ? ? B .
A 1 984 PRO 984 ? ? ? B .
A 1 985 LYS 985 ? ? ? B .
A 1 986 ASP 986 ? ? ? B .
A 1 987 LEU 987 ? ? ? B .
A 1 988 GLN 988 ? ? ? B .
A 1 989 PRO 989 ? ? ? B .
A 1 990 SER 990 ? ? ? B .
A 1 991 HIS 991 ? ? ? B .
A 1 992 SER 992 ? ? ? B .
A 1 993 SER 993 ? ? ? B .
A 1 994 ILE 994 ? ? ? B .
A 1 995 ALA 995 ? ? ? B .
A 1 996 PRO 996 ? ? ? B .
A 1 997 PRO 997 ? ? ? B .
A 1 998 THR 998 ? ? ? B .
A 1 999 GLY 999 ? ? ? B .
A 1 1000 PHE 1000 ? ? ? B .
A 1 1001 THR 1001 ? ? ? B .
A 1 1002 ALA 1002 ? ? ? B .
A 1 1003 THR 1003 ? ? ? B .
A 1 1004 GLY 1004 ? ? ? B .
A 1 1005 ALA 1005 ? ? ? B .
A 1 1006 THR 1006 ? ? ? B .
A 1 1007 ALA 1007 ? ? ? B .
A 1 1008 THR 1008 ? ? ? B .
A 1 1009 SER 1009 ? ? ? B .
A 1 1010 THR 1010 ? ? ? B .
A 1 1011 ASN 1011 ? ? ? B .
A 1 1012 ASN 1012 ? ? ? B .
A 1 1013 ALA 1013 ? ? ? B .
A 1 1014 SER 1014 ? ? ? B .
A 1 1015 PRO 1015 ? ? ? B .
A 1 1016 PRO 1016 ? ? ? B .
A 1 1017 PHE 1017 ? ? ? B .
A 1 1018 PRO 1018 ? ? ? B .
A 1 1019 SER 1019 ? ? ? B .
A 1 1020 PRO 1020 ? ? ? B .
A 1 1021 ASN 1021 ? ? ? B .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Catenin alpha-1 {PDB ID=5y04, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5y04.1.B}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 5y04, label_asym_id=B'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;GPGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQA
LQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKT
;

;GPGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQA
LQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKT
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 53 80
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5y04 2024-03-27
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1021
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1021 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 120.000 17.857
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKTDPVDEVKARHQMDAMAFSLTVPTLALKMPNGLDSMSLSPPGARVPLHYLDTELEDPFAFNEEDDDLKKGVTVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSTPPTPPQQHTHLSPLSTSLKPPAPPQGSVCKSPQPQNTSLPMQGVAPTTHSIAQIRQASHKRPLPLLPSSRAPISDAPRTDRILMKAAAFSPHLSCISRLQRLVKLCTQKRQLDADLFPHLGLDWSEESGEELEDADQASPYQVAWSIRETLRHERHTSDDDDMESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASKEPECTGQLIQELRRAACSRASLRQTKLKEVEPAACSGTVKGEQCTKQALPFTRHCFQHILLNRSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDNSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPTSVSLPVEASQMRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFADVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQAVTSLECLSTIGVLSQSDGVPVQGLSDRGMGVFSTGTDASGIQSLSREVNTDLGELLNGRIVHDSFSSLELDENLLHSAPLSSPPTALAGQIQGQFSAPASAGLTSATLLSQSALGERAFPGQFHGLHDGSHASQRPHPAQLLSKADDLITSRQQYSSDHSHSSPHGSHYDSEHVPSPYSDHITSPHTSYSGDNMAATFSAEMPIMAQHLLPTQLEVPLGGVVNPRTHWGNLPVNLGDPSAFSNLLGADGHLLSTSLSTPPTTSNSETTQPAFATVTPSSSSVLPGLPQTSFSGMGPSAELMASTSPKQQLPQFSAAFGHQLSSHSGIPKDLQPSHSSIAPPTGFTATGATATSTNNASPPFPSPN
2 1 2
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5y04.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . SER 361 361 ? A 7.398 34.382 22.269 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 2 C CA . SER 361 361 ? A 7.356 35.074 20.924 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 3 C C . SER 361 361 ? A 8.400 34.622 19.913 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 4 O O . SER 361 361 ? A 8.193 34.753 18.717 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 5 C CB . SER 361 361 ? A 7.511 36.609 21.104 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 6 O OG . SER 361 361 ? A 8.770 36.918 21.709 1 1 B SER 0.470 1
ATOM 7 N N . ARG 362 362 ? A 9.561 34.057 20.336 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 8 C CA . ARG 362 362 ? A 10.566 33.589 19.395 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 9 C C . ARG 362 362 ? A 10.104 32.517 18.424 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 10 O O . ARG 362 362 ? A 10.369 32.624 17.241 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 11 C CB . ARG 362 362 ? A 11.794 32.991 20.105 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 12 C CG . ARG 362 362 ? A 12.516 33.908 21.103 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 13 C CD . ARG 362 362 ? A 13.926 33.365 21.350 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 14 N NE . ARG 362 362 ? A 14.472 33.987 22.592 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 15 C CZ . ARG 362 362 ? A 15.759 33.877 22.951 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 16 N NH1 . ARG 362 362 ? A 16.654 33.305 22.151 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 17 N NH2 . ARG 362 362 ? A 16.159 34.326 24.137 1 1 B ARG 0.430 1
ATOM 18 N N . SER 363 363 ? A 9.380 31.480 18.894 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 19 C CA . SER 363 363 ? A 8.861 30.440 18.019 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 20 C C . SER 363 363 ? A 7.920 30.969 16.960 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 21 O O . SER 363 363 ? A 8.068 30.654 15.791 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 22 C CB . SER 363 363 ? A 8.086 29.361 18.807 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 23 O OG . SER 363 363 ? A 8.922 28.769 19.800 1 1 B SER 0.510 1
ATOM 24 N N . SER 364 364 ? A 6.970 31.852 17.351 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 25 C CA . SER 364 364 ? A 6.064 32.530 16.435 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 26 C C . SER 364 364 ? A 6.768 33.457 15.452 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 27 O O . SER 364 364 ? A 6.412 33.516 14.288 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 28 C CB . SER 364 364 ? A 4.866 33.246 17.122 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 29 O OG . SER 364 364 ? A 5.242 34.217 18.107 1 1 B SER 0.530 1
ATOM 30 N N . ARG 365 365 ? A 7.813 34.181 15.890 1 1 B ARG 0.500 1
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ATOM 32 C C . ARG 365 365 ? A 9.538 34.155 14.038 1 1 B ARG 0.500 1
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ATOM 116 N NE2 . GLN 374 374 ? A 7.019 26.440 5.232 1 1 B GLN 0.630 1
ATOM 117 N N . GLN 375 375 ? A 6.654 32.060 1.355 1 1 B GLN 0.640 1
ATOM 118 C CA . GLN 375 375 ? A 5.842 32.875 0.487 1 1 B GLN 0.640 1
ATOM 119 C C . GLN 375 375 ? A 6.561 33.483 -0.710 1 1 B GLN 0.640 1
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ATOM 147 N N . LYS 378 378 ? A 7.605 30.583 -3.055 1 1 B LYS 0.630 1
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ATOM 154 C CE . LYS 378 378 ? A 4.740 27.149 0.008 1 1 B LYS 0.630 1
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ATOM 156 N N . HIS 379 379 ? A 6.038 32.391 -4.666 1 1 B HIS 0.560 1
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ATOM 165 N NE2 . HIS 379 379 ? A 5.460 37.368 -7.725 1 1 B HIS 0.560 1
ATOM 166 N N . LEU 380 380 ? A 8.059 33.278 -6.549 1 1 B LEU 0.580 1
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ATOM 172 C CD1 . LEU 380 380 ? A 12.115 33.977 -8.431 1 1 B LEU 0.580 1
ATOM 173 C CD2 . LEU 380 380 ? A 12.933 32.495 -6.545 1 1 B LEU 0.580 1
ATOM 174 N N . CYS 381 381 ? A 8.542 30.845 -7.943 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 175 C CA . CYS 381 381 ? A 8.353 29.641 -8.727 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 176 C C . CYS 381 381 ? A 7.005 29.554 -9.437 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 177 O O . CYS 381 381 ? A 6.862 28.856 -10.438 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 178 C CB . CYS 381 381 ? A 8.498 28.415 -7.797 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 179 S SG . CYS 381 381 ? A 10.169 28.287 -7.082 1 1 B CYS 0.580 1
ATOM 180 N N . ARG 382 382 ? A 5.962 30.258 -8.950 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 181 C CA . ARG 382 382 ? A 4.702 30.417 -9.660 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 182 C C . ARG 382 382 ? A 4.841 31.394 -10.810 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 183 O O . ARG 382 382 ? A 4.187 31.264 -11.831 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 184 C CB . ARG 382 382 ? A 3.565 30.909 -8.729 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 185 C CG . ARG 382 382 ? A 3.112 29.905 -7.651 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 186 C CD . ARG 382 382 ? A 2.128 30.541 -6.667 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 187 N NE . ARG 382 382 ? A 1.874 29.556 -5.564 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 188 C CZ . ARG 382 382 ? A 1.072 29.817 -4.523 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 189 N NH1 . ARG 382 382 ? A 0.443 30.982 -4.413 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 190 N NH2 . ARG 382 382 ? A 0.869 28.891 -3.587 1 1 B ARG 0.510 1
ATOM 191 N N . LEU 383 383 ? A 5.718 32.400 -10.660 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 192 C CA . LEU 383 383 ? A 6.000 33.358 -11.700 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 193 C C . LEU 383 383 ? A 6.932 32.838 -12.789 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 194 O O . LEU 383 383 ? A 6.771 33.172 -13.958 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 195 C CB . LEU 383 383 ? A 6.561 34.641 -11.058 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 196 C CG . LEU 383 383 ? A 6.717 35.832 -12.021 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 197 C CD1 . LEU 383 383 ? A 5.386 36.232 -12.679 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 198 C CD2 . LEU 383 383 ? A 7.342 37.030 -11.294 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 199 N N . GLU 384 384 ? A 7.939 32.005 -12.439 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 200 C CA . GLU 384 384 ? A 8.810 31.374 -13.420 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 201 C C . GLU 384 384 ? A 8.090 30.391 -14.330 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 202 O O . GLU 384 384 ? A 8.243 30.401 -15.546 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 203 C CB . GLU 384 384 ? A 9.928 30.582 -12.713 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 204 C CG . GLU 384 384 ? A 10.920 29.900 -13.689 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 205 C CD . GLU 384 384 ? A 11.980 29.065 -12.976 1 1 B GLU 0.480 1
ATOM 206 O OE1 . GLU 384 384 ? A 12.850 28.515 -13.698 1 1 B GLU 0.480 1
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ATOM 208 N N . ARG 385 385 ? A 7.261 29.512 -13.725 1 1 B ARG 0.460 1
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ATOM 210 C C . ARG 385 385 ? A 5.350 29.252 -15.296 1 1 B ARG 0.460 1
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ATOM 214 C CD . ARG 385 385 ? A 5.826 25.373 -12.242 1 1 B ARG 0.460 1
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ATOM 217 N NH1 . ARG 385 385 ? A 6.813 25.565 -9.535 1 1 B ARG 0.460 1
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ATOM 219 N N . ALA 386 386 ? A 4.788 30.348 -14.750 1 1 B ALA 0.570 1
ATOM 220 C CA . ALA 386 386 ? A 3.678 31.094 -15.281 1 1 B ALA 0.570 1
ATOM 221 C C . ALA 386 386 ? A 2.296 30.434 -14.986 1 1 B ALA 0.570 1
ATOM 222 O O . ALA 386 386 ? A 2.255 29.376 -14.294 1 1 B ALA 0.570 1
ATOM 223 C CB . ALA 386 386 ? A 3.911 31.549 -16.742 1 1 B ALA 0.570 1
ATOM 224 O OXT . ALA 386 386 ? A 1.264 31.035 -15.395 1 1 B ALA 0.570 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.557
2 1 3 0.005
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 361 SER 1 0.470
2 1 A 362 ARG 1 0.430
3 1 A 363 SER 1 0.510
4 1 A 364 SER 1 0.530
5 1 A 365 ARG 1 0.500
6 1 A 366 VAL 1 0.590
7 1 A 367 THR 1 0.570
8 1 A 368 GLN 1 0.580
9 1 A 369 LEU 1 0.580
10 1 A 370 CYS 1 0.610
11 1 A 371 THR 1 0.610
12 1 A 372 TYR 1 0.580
13 1 A 373 PHE 1 0.580
14 1 A 374 GLN 1 0.630
15 1 A 375 GLN 1 0.640
16 1 A 376 LYS 1 0.630
17 1 A 377 TYR 1 0.600
18 1 A 378 LYS 1 0.630
19 1 A 379 HIS 1 0.560
20 1 A 380 LEU 1 0.580
21 1 A 381 CYS 1 0.580
22 1 A 382 ARG 1 0.510
23 1 A 383 LEU 1 0.480
24 1 A 384 GLU 1 0.480
25 1 A 385 ARG 1 0.460
26 1 A 386 ALA 1 0.570
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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