data_SMR-12da84be179508c263b2663749937a5d_8
_entry.id SMR-12da84be179508c263b2663749937a5d_8
_struct.entry_id SMR-12da84be179508c263b2663749937a5d_8
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q924T7 (isoform 2)/ RNF31_MOUSE, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31

Estimated model accuracy of this model is 0.023, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q924T7 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 137315.516 1 .
2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP RNF31_MOUSE Q924T7 1
;MPGDEERGFLAAREELASALRWDSAQVFPLEQLMPLLATSLPPAARYLQLDAGRLVRCNAHGEPRNYLNT
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LALGDSSLSSPDPANACLPWHCLTCATLNEPWAVFCAVCSQPKGCKVPGIEGSHGTGGLEPEPARDQWAC
QSCTFENEAAAVLCAICERPRLAQPPSLVVDSHDAGVCQQSLKQEDPLLTAAQPQVWYCDHCTFCNSGPV
WVCAMCNRTRDPIPTQPALQSYPSSLEKGRPKPGSSQHLGSSLPASCGDPEKQRQDKMRKEGLQLVSMIQ
EGETAGASPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELSYVLEMVAELAGQQDPELGAFSCQEARKAWLDRHGNLD
EAVEECVRARRRKVHELQSLGFGPKEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDRDPEPTPCWD
GLDRQSLVRRLLAVYTLPSWGRAELALALLQETPRNYELLDVVEAVRHSQDRAFLRRLLAQECAVCGWAL
PRNRMQALISCECTICPECFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDAQLLSYFSTLDIQLRESLDPD
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QAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYNAFYAKNKCPDPNCKVKKSLHGH
HPRDCLFYLRDWTAARLQKLLQDNNVMFNTEPPAGTRAVPGGGCRVMEQKEVHSGFRDEACGKETPPGYA
GLCQAHYKEYLVSLINAHSLDPATLYEVEELETATIRYLHLAPQPADGEDLPAYQARLLQKLREEVPLGQ
SIARRRK
;
'E3 ubiquitin-protein ligase RNF31'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1057 1 1057
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . RNF31_MOUSE Q924T7 Q924T7-2 1 1057 10090 'Mus musculus (Mouse)'
2004-03-15 4D25A3CC7BBA4415
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no B
;MPGDEERGFLAAREELASALRWDSAQVFPLEQLMPLLATSLPPAARYLQLDAGRLVRCNAHGEPRNYLNT
LSTALNILEKYGRNLLSPQRPRYWRSVKFNNPVFRSTVDAVQGGRDVLRLYGYTEERPDGLSFPEGQEEP
DEYQVAVVTLEVLLLRTELSLLLQNTHPRQNALDQLLRESVEDGMLQLSEFHPLLREIVPGPRPSAQGST
PGPCFLCGSAPGTLHCPACNQVSCPACDILFHGHPSRAHHLRQALPGSHQTASLSSSLPASSQPRPPSSS
LALGDSSLSSPDPANACLPWHCLTCATLNEPWAVFCAVCSQPKGCKVPGIEGSHGTGGLEPEPARDQWAC
QSCTFENEAAAVLCAICERPRLAQPPSLVVDSHDAGVCQQSLKQEDPLLTAAQPQVWYCDHCTFCNSGPV
WVCAMCNRTRDPIPTQPALQSYPSSLEKGRPKPGSSQHLGSSLPASCGDPEKQRQDKMRKEGLQLVSMIQ
EGETAGASPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELSYVLEMVAELAGQQDPELGAFSCQEARKAWLDRHGNLD
EAVEECVRARRRKVHELQSLGFGPKEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDRDPEPTPCWD
GLDRQSLVRRLLAVYTLPSWGRAELALALLQETPRNYELLDVVEAVRHSQDRAFLRRLLAQECAVCGWAL
PRNRMQALISCECTICPECFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDAQLLSYFSTLDIQLRESLDPD
AYALFHKKLTEAVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQCEDFQNWKRTNDPEY
QAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYNAFYAKNKCPDPNCKVKKSLHGH
HPRDCLFYLRDWTAARLQKLLQDNNVMFNTEPPAGTRAVPGGGCRVMEQKEVHSGFRDEACGKETPPGYA
GLCQAHYKEYLVSLINAHSLDPATLYEVEELETATIRYLHLAPQPADGEDLPAYQARLLQKLREEVPLGQ
SIARRRK
;

;MPGDEERGFLAAREELASALRWDSAQVFPLEQLMPLLATSLPPAARYLQLDAGRLVRCNAHGEPRNYLNT
LSTALNILEKYGRNLLSPQRPRYWRSVKFNNPVFRSTVDAVQGGRDVLRLYGYTEERPDGLSFPEGQEEP
DEYQVAVVTLEVLLLRTELSLLLQNTHPRQNALDQLLRESVEDGMLQLSEFHPLLREIVPGPRPSAQGST
PGPCFLCGSAPGTLHCPACNQVSCPACDILFHGHPSRAHHLRQALPGSHQTASLSSSLPASSQPRPPSSS
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GLDRQSLVRRLLAVYTLPSWGRAELALALLQETPRNYELLDVVEAVRHSQDRAFLRRLLAQECAVCGWAL
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SIARRRK
;

#
#
loop_
_pdbx_entity_nonpoly.entity_id
_pdbx_entity_nonpoly.name
_pdbx_entity_nonpoly.comp_id
_pdbx_entity_nonpoly.ma_model_mode
2 'ZINC ION' ZN implicit
#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 PRO .
1 3 GLY .
1 4 ASP .
1 5 GLU .
1 6 GLU .
1 7 ARG .
1 8 GLY .
1 9 PHE .
1 10 LEU .
1 11 ALA .
1 12 ALA .
1 13 ARG .
1 14 GLU .
1 15 GLU .
1 16 LEU .
1 17 ALA .
1 18 SER .
1 19 ALA .
1 20 LEU .
1 21 ARG .
1 22 TRP .
1 23 ASP .
1 24 SER .
1 25 ALA .
1 26 GLN .
1 27 VAL .
1 28 PHE .
1 29 PRO .
1 30 LEU .
1 31 GLU .
1 32 GLN .
1 33 LEU .
1 34 MET .
1 35 PRO .
1 36 LEU .
1 37 LEU .
1 38 ALA .
1 39 THR .
1 40 SER .
1 41 LEU .
1 42 PRO .
1 43 PRO .
1 44 ALA .
1 45 ALA .
1 46 ARG .
1 47 TYR .
1 48 LEU .
1 49 GLN .
1 50 LEU .
1 51 ASP .
1 52 ALA .
1 53 GLY .
1 54 ARG .
1 55 LEU .
1 56 VAL .
1 57 ARG .
1 58 CYS .
1 59 ASN .
1 60 ALA .
1 61 HIS .
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1 63 GLU .
1 64 PRO .
1 65 ARG .
1 66 ASN .
1 67 TYR .
1 68 LEU .
1 69 ASN .
1 70 THR .
1 71 LEU .
1 72 SER .
1 73 THR .
1 74 ALA .
1 75 LEU .
1 76 ASN .
1 77 ILE .
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1 79 GLU .
1 80 LYS .
1 81 TYR .
1 82 GLY .
1 83 ARG .
1 84 ASN .
1 85 LEU .
1 86 LEU .
1 87 SER .
1 88 PRO .
1 89 GLN .
1 90 ARG .
1 91 PRO .
1 92 ARG .
1 93 TYR .
1 94 TRP .
1 95 ARG .
1 96 SER .
1 97 VAL .
1 98 LYS .
1 99 PHE .
1 100 ASN .
1 101 ASN .
1 102 PRO .
1 103 VAL .
1 104 PHE .
1 105 ARG .
1 106 SER .
1 107 THR .
1 108 VAL .
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1 110 ALA .
1 111 VAL .
1 112 GLN .
1 113 GLY .
1 114 GLY .
1 115 ARG .
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1 117 VAL .
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1 119 ARG .
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1 123 TYR .
1 124 THR .
1 125 GLU .
1 126 GLU .
1 127 ARG .
1 128 PRO .
1 129 ASP .
1 130 GLY .
1 131 LEU .
1 132 SER .
1 133 PHE .
1 134 PRO .
1 135 GLU .
1 136 GLY .
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1 138 GLU .
1 139 GLU .
1 140 PRO .
1 141 ASP .
1 142 GLU .
1 143 TYR .
1 144 GLN .
1 145 VAL .
1 146 ALA .
1 147 VAL .
1 148 VAL .
1 149 THR .
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1 151 GLU .
1 152 VAL .
1 153 LEU .
1 154 LEU .
1 155 LEU .
1 156 ARG .
1 157 THR .
1 158 GLU .
1 159 LEU .
1 160 SER .
1 161 LEU .
1 162 LEU .
1 163 LEU .
1 164 GLN .
1 165 ASN .
1 166 THR .
1 167 HIS .
1 168 PRO .
1 169 ARG .
1 170 GLN .
1 171 ASN .
1 172 ALA .
1 173 LEU .
1 174 ASP .
1 175 GLN .
1 176 LEU .
1 177 LEU .
1 178 ARG .
1 179 GLU .
1 180 SER .
1 181 VAL .
1 182 GLU .
1 183 ASP .
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1 185 MET .
1 186 LEU .
1 187 GLN .
1 188 LEU .
1 189 SER .
1 190 GLU .
1 191 PHE .
1 192 HIS .
1 193 PRO .
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1 195 LEU .
1 196 ARG .
1 197 GLU .
1 198 ILE .
1 199 VAL .
1 200 PRO .
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1 203 ARG .
1 204 PRO .
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1 213 PRO .
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1 1024 GLN .
1 1025 PRO .
1 1026 ALA .
1 1027 ASP .
1 1028 GLY .
1 1029 GLU .
1 1030 ASP .
1 1031 LEU .
1 1032 PRO .
1 1033 ALA .
1 1034 TYR .
1 1035 GLN .
1 1036 ALA .
1 1037 ARG .
1 1038 LEU .
1 1039 LEU .
1 1040 GLN .
1 1041 LYS .
1 1042 LEU .
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1 1044 GLU .
1 1045 GLU .
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1 1047 PRO .
1 1048 LEU .
1 1049 GLY .
1 1050 GLN .
1 1051 SER .
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#
#
loop_
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A 1 .
B 2 .
#
#
loop_
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A 1 2 PRO 2 ? ? ? B .
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A 1 8 GLY 8 ? ? ? B .
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A 1 15 GLU 15 ? ? ? B .
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A 1 20 LEU 20 ? ? ? B .
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A 1 22 TRP 22 ? ? ? B .
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A 1 394 GLN 394 ? ? ? B .
A 1 395 GLU 395 ? ? ? B .
A 1 396 ASP 396 ? ? ? B .
A 1 397 PRO 397 ? ? ? B .
A 1 398 LEU 398 ? ? ? B .
A 1 399 LEU 399 ? ? ? B .
A 1 400 THR 400 ? ? ? B .
A 1 401 ALA 401 ? ? ? B .
A 1 402 ALA 402 ? ? ? B .
A 1 403 GLN 403 ? ? ? B .
A 1 404 PRO 404 ? ? ? B .
A 1 405 GLN 405 ? ? ? B .
A 1 406 VAL 406 ? ? ? B .
A 1 407 TRP 407 ? ? ? B .
A 1 408 TYR 408 ? ? ? B .
A 1 409 CYS 409 ? ? ? B .
A 1 410 ASP 410 ? ? ? B .
A 1 411 HIS 411 ? ? ? B .
A 1 412 CYS 412 ? ? ? B .
A 1 413 THR 413 ? ? ? B .
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A 1 415 CYS 415 ? ? ? B .
A 1 416 ASN 416 ? ? ? B .
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A 1 419 PRO 419 ? ? ? B .
A 1 420 VAL 420 ? ? ? B .
A 1 421 TRP 421 ? ? ? B .
A 1 422 VAL 422 ? ? ? B .
A 1 423 CYS 423 ? ? ? B .
A 1 424 ALA 424 ? ? ? B .
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A 1 426 CYS 426 ? ? ? B .
A 1 427 ASN 427 ? ? ? B .
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A 1 429 THR 429 ? ? ? B .
A 1 430 ARG 430 ? ? ? B .
A 1 431 ASP 431 ? ? ? B .
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A 1 440 GLN 440 ? ? ? B .
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A 1 449 GLY 449 ? ? ? B .
A 1 450 ARG 450 ? ? ? B .
A 1 451 PRO 451 ? ? ? B .
A 1 452 LYS 452 ? ? ? B .
A 1 453 PRO 453 ? ? ? B .
A 1 454 GLY 454 ? ? ? B .
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A 1 456 SER 456 ? ? ? B .
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A 1 475 GLN 475 ? ? ? B .
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A 1 477 LYS 477 ? ? ? B .
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A 1 480 LYS 480 ? ? ? B .
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A 1 565 GLU 565 ? ? ? B .
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A 1 571 ARG 571 ? ? ? B .
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A 1 650 TRP 650 ? ? ? B .
A 1 651 GLY 651 ? ? ? B .
A 1 652 ARG 652 ? ? ? B .
A 1 653 ALA 653 ? ? ? B .
A 1 654 GLU 654 ? ? ? B .
A 1 655 LEU 655 ? ? ? B .
A 1 656 ALA 656 ? ? ? B .
A 1 657 LEU 657 ? ? ? B .
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A 1 659 LEU 659 ? ? ? B .
A 1 660 LEU 660 ? ? ? B .
A 1 661 GLN 661 ? ? ? B .
A 1 662 GLU 662 ? ? ? B .
A 1 663 THR 663 ? ? ? B .
A 1 664 PRO 664 ? ? ? B .
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A 1 670 LEU 670 ? ? ? B .
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A 1 673 VAL 673 ? ? ? B .
A 1 674 GLU 674 ? ? ? B .
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A 1 687 ARG 687 ? ? ? B .
A 1 688 LEU 688 ? ? ? B .
A 1 689 LEU 689 ? ? ? B .
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A 1 765 GLU 765 ? ? ? B .
A 1 766 SER 766 ? ? ? B .
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A 1 778 LYS 778 ? ? ? B .
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A 1 800 PHE 800 ? ? ? B .
A 1 801 ILE 801 ? ? ? B .
A 1 802 TYR 802 ? ? ? B .
A 1 803 GLU 803 ? ? ? B .
A 1 804 ARG 804 ? ? ? B .
A 1 805 GLU 805 ? ? ? B .
A 1 806 GLN 806 ? ? ? B .
A 1 807 LEU 807 ? ? ? B .
A 1 808 GLU 808 ? ? ? B .
A 1 809 ALA 809 ? ? ? B .
A 1 810 THR 810 ? ? ? B .
A 1 811 CYS 811 ? ? ? B .
A 1 812 PRO 812 ? ? ? B .
A 1 813 GLN 813 ? ? ? B .
A 1 814 CYS 814 ? ? ? B .
A 1 815 HIS 815 ? ? ? B .
A 1 816 GLN 816 ? ? ? B .
A 1 817 THR 817 ? ? ? B .
A 1 818 PHE 818 ? ? ? B .
A 1 819 CYS 819 ? ? ? B .
A 1 820 VAL 820 ? ? ? B .
A 1 821 ARG 821 ? ? ? B .
A 1 822 CYS 822 ? ? ? B .
A 1 823 LYS 823 ? ? ? B .
A 1 824 ARG 824 ? ? ? B .
A 1 825 GLN 825 ? ? ? B .
A 1 826 CYS 826 ? ? ? B .
A 1 827 GLU 827 ? ? ? B .
A 1 828 ASP 828 ? ? ? B .
A 1 829 PHE 829 ? ? ? B .
A 1 830 GLN 830 ? ? ? B .
A 1 831 ASN 831 ? ? ? B .
A 1 832 TRP 832 ? ? ? B .
A 1 833 LYS 833 ? ? ? B .
A 1 834 ARG 834 ? ? ? B .
A 1 835 THR 835 ? ? ? B .
A 1 836 ASN 836 ? ? ? B .
A 1 837 ASP 837 ? ? ? B .
A 1 838 PRO 838 ? ? ? B .
A 1 839 GLU 839 ? ? ? B .
A 1 840 TYR 840 ? ? ? B .
A 1 841 GLN 841 ? ? ? B .
A 1 842 ALA 842 ? ? ? B .
A 1 843 GLN 843 ? ? ? B .
A 1 844 GLY 844 ? ? ? B .
A 1 845 LEU 845 ? ? ? B .
A 1 846 ALA 846 ? ? ? B .
A 1 847 MET 847 ? ? ? B .
A 1 848 TYR 848 ? ? ? B .
A 1 849 LEU 849 ? ? ? B .
A 1 850 GLN 850 ? ? ? B .
A 1 851 GLU 851 ? ? ? B .
A 1 852 ASN 852 ? ? ? B .
A 1 853 GLY 853 ? ? ? B .
A 1 854 ILE 854 ? ? ? B .
A 1 855 ASP 855 ? ? ? B .
A 1 856 CYS 856 ? ? ? B .
A 1 857 PRO 857 ? ? ? B .
A 1 858 LYS 858 ? ? ? B .
A 1 859 CYS 859 ? ? ? B .
A 1 860 LYS 860 ? ? ? B .
A 1 861 PHE 861 ? ? ? B .
A 1 862 SER 862 ? ? ? B .
A 1 863 TYR 863 ? ? ? B .
A 1 864 ALA 864 ? ? ? B .
A 1 865 LEU 865 ? ? ? B .
A 1 866 ALA 866 ? ? ? B .
A 1 867 ARG 867 ? ? ? B .
A 1 868 GLY 868 ? ? ? B .
A 1 869 GLY 869 ? ? ? B .
A 1 870 CYS 870 ? ? ? B .
A 1 871 MET 871 ? ? ? B .
A 1 872 HIS 872 ? ? ? B .
A 1 873 PHE 873 ? ? ? B .
A 1 874 HIS 874 ? ? ? B .
A 1 875 CYS 875 ? ? ? B .
A 1 876 THR 876 ? ? ? B .
A 1 877 GLN 877 ? ? ? B .
A 1 878 CYS 878 ? ? ? B .
A 1 879 ARG 879 ? ? ? B .
A 1 880 HIS 880 ? ? ? B .
A 1 881 GLN 881 ? ? ? B .
A 1 882 PHE 882 ? ? ? B .
A 1 883 CYS 883 ? ? ? B .
A 1 884 SER 884 ? ? ? B .
A 1 885 GLY 885 ? ? ? B .
A 1 886 CYS 886 ? ? ? B .
A 1 887 TYR 887 ? ? ? B .
A 1 888 ASN 888 ? ? ? B .
A 1 889 ALA 889 ? ? ? B .
A 1 890 PHE 890 ? ? ? B .
A 1 891 TYR 891 ? ? ? B .
A 1 892 ALA 892 ? ? ? B .
A 1 893 LYS 893 ? ? ? B .
A 1 894 ASN 894 ? ? ? B .
A 1 895 LYS 895 ? ? ? B .
A 1 896 CYS 896 ? ? ? B .
A 1 897 PRO 897 ? ? ? B .
A 1 898 ASP 898 ? ? ? B .
A 1 899 PRO 899 ? ? ? B .
A 1 900 ASN 900 ? ? ? B .
A 1 901 CYS 901 ? ? ? B .
A 1 902 LYS 902 ? ? ? B .
A 1 903 VAL 903 ? ? ? B .
A 1 904 LYS 904 ? ? ? B .
A 1 905 LYS 905 ? ? ? B .
A 1 906 SER 906 ? ? ? B .
A 1 907 LEU 907 ? ? ? B .
A 1 908 HIS 908 ? ? ? B .
A 1 909 GLY 909 ? ? ? B .
A 1 910 HIS 910 ? ? ? B .
A 1 911 HIS 911 ? ? ? B .
A 1 912 PRO 912 ? ? ? B .
A 1 913 ARG 913 ? ? ? B .
A 1 914 ASP 914 ? ? ? B .
A 1 915 CYS 915 ? ? ? B .
A 1 916 LEU 916 ? ? ? B .
A 1 917 PHE 917 ? ? ? B .
A 1 918 TYR 918 ? ? ? B .
A 1 919 LEU 919 ? ? ? B .
A 1 920 ARG 920 ? ? ? B .
A 1 921 ASP 921 ? ? ? B .
A 1 922 TRP 922 ? ? ? B .
A 1 923 THR 923 ? ? ? B .
A 1 924 ALA 924 ? ? ? B .
A 1 925 ALA 925 ? ? ? B .
A 1 926 ARG 926 ? ? ? B .
A 1 927 LEU 927 ? ? ? B .
A 1 928 GLN 928 ? ? ? B .
A 1 929 LYS 929 ? ? ? B .
A 1 930 LEU 930 ? ? ? B .
A 1 931 LEU 931 ? ? ? B .
A 1 932 GLN 932 ? ? ? B .
A 1 933 ASP 933 ? ? ? B .
A 1 934 ASN 934 ? ? ? B .
A 1 935 ASN 935 ? ? ? B .
A 1 936 VAL 936 ? ? ? B .
A 1 937 MET 937 ? ? ? B .
A 1 938 PHE 938 ? ? ? B .
A 1 939 ASN 939 ? ? ? B .
A 1 940 THR 940 ? ? ? B .
A 1 941 GLU 941 ? ? ? B .
A 1 942 PRO 942 ? ? ? B .
A 1 943 PRO 943 ? ? ? B .
A 1 944 ALA 944 ? ? ? B .
A 1 945 GLY 945 ? ? ? B .
A 1 946 THR 946 ? ? ? B .
A 1 947 ARG 947 ? ? ? B .
A 1 948 ALA 948 ? ? ? B .
A 1 949 VAL 949 ? ? ? B .
A 1 950 PRO 950 ? ? ? B .
A 1 951 GLY 951 ? ? ? B .
A 1 952 GLY 952 ? ? ? B .
A 1 953 GLY 953 ? ? ? B .
A 1 954 CYS 954 ? ? ? B .
A 1 955 ARG 955 ? ? ? B .
A 1 956 VAL 956 ? ? ? B .
A 1 957 MET 957 ? ? ? B .
A 1 958 GLU 958 ? ? ? B .
A 1 959 GLN 959 ? ? ? B .
A 1 960 LYS 960 ? ? ? B .
A 1 961 GLU 961 ? ? ? B .
A 1 962 VAL 962 ? ? ? B .
A 1 963 HIS 963 ? ? ? B .
A 1 964 SER 964 ? ? ? B .
A 1 965 GLY 965 ? ? ? B .
A 1 966 PHE 966 ? ? ? B .
A 1 967 ARG 967 ? ? ? B .
A 1 968 ASP 968 ? ? ? B .
A 1 969 GLU 969 ? ? ? B .
A 1 970 ALA 970 ? ? ? B .
A 1 971 CYS 971 ? ? ? B .
A 1 972 GLY 972 ? ? ? B .
A 1 973 LYS 973 ? ? ? B .
A 1 974 GLU 974 ? ? ? B .
A 1 975 THR 975 ? ? ? B .
A 1 976 PRO 976 ? ? ? B .
A 1 977 PRO 977 ? ? ? B .
A 1 978 GLY 978 ? ? ? B .
A 1 979 TYR 979 ? ? ? B .
A 1 980 ALA 980 ? ? ? B .
A 1 981 GLY 981 ? ? ? B .
A 1 982 LEU 982 ? ? ? B .
A 1 983 CYS 983 ? ? ? B .
A 1 984 GLN 984 ? ? ? B .
A 1 985 ALA 985 ? ? ? B .
A 1 986 HIS 986 ? ? ? B .
A 1 987 TYR 987 ? ? ? B .
A 1 988 LYS 988 ? ? ? B .
A 1 989 GLU 989 ? ? ? B .
A 1 990 TYR 990 ? ? ? B .
A 1 991 LEU 991 ? ? ? B .
A 1 992 VAL 992 ? ? ? B .
A 1 993 SER 993 ? ? ? B .
A 1 994 LEU 994 ? ? ? B .
A 1 995 ILE 995 ? ? ? B .
A 1 996 ASN 996 ? ? ? B .
A 1 997 ALA 997 ? ? ? B .
A 1 998 HIS 998 ? ? ? B .
A 1 999 SER 999 ? ? ? B .
A 1 1000 LEU 1000 ? ? ? B .
A 1 1001 ASP 1001 ? ? ? B .
A 1 1002 PRO 1002 ? ? ? B .
A 1 1003 ALA 1003 ? ? ? B .
A 1 1004 THR 1004 ? ? ? B .
A 1 1005 LEU 1005 ? ? ? B .
A 1 1006 TYR 1006 ? ? ? B .
A 1 1007 GLU 1007 ? ? ? B .
A 1 1008 VAL 1008 ? ? ? B .
A 1 1009 GLU 1009 ? ? ? B .
A 1 1010 GLU 1010 ? ? ? B .
A 1 1011 LEU 1011 ? ? ? B .
A 1 1012 GLU 1012 ? ? ? B .
A 1 1013 THR 1013 ? ? ? B .
A 1 1014 ALA 1014 ? ? ? B .
A 1 1015 THR 1015 ? ? ? B .
A 1 1016 ILE 1016 ? ? ? B .
A 1 1017 ARG 1017 ? ? ? B .
A 1 1018 TYR 1018 ? ? ? B .
A 1 1019 LEU 1019 ? ? ? B .
A 1 1020 HIS 1020 ? ? ? B .
A 1 1021 LEU 1021 ? ? ? B .
A 1 1022 ALA 1022 ? ? ? B .
A 1 1023 PRO 1023 ? ? ? B .
A 1 1024 GLN 1024 ? ? ? B .
A 1 1025 PRO 1025 ? ? ? B .
A 1 1026 ALA 1026 ? ? ? B .
A 1 1027 ASP 1027 ? ? ? B .
A 1 1028 GLY 1028 ? ? ? B .
A 1 1029 GLU 1029 ? ? ? B .
A 1 1030 ASP 1030 ? ? ? B .
A 1 1031 LEU 1031 ? ? ? B .
A 1 1032 PRO 1032 ? ? ? B .
A 1 1033 ALA 1033 ? ? ? B .
A 1 1034 TYR 1034 ? ? ? B .
A 1 1035 GLN 1035 ? ? ? B .
A 1 1036 ALA 1036 ? ? ? B .
A 1 1037 ARG 1037 ? ? ? B .
A 1 1038 LEU 1038 ? ? ? B .
A 1 1039 LEU 1039 ? ? ? B .
A 1 1040 GLN 1040 ? ? ? B .
A 1 1041 LYS 1041 ? ? ? B .
A 1 1042 LEU 1042 ? ? ? B .
A 1 1043 ARG 1043 ? ? ? B .
A 1 1044 GLU 1044 ? ? ? B .
A 1 1045 GLU 1045 ? ? ? B .
A 1 1046 VAL 1046 ? ? ? B .
A 1 1047 PRO 1047 ? ? ? B .
A 1 1048 LEU 1048 ? ? ? B .
A 1 1049 GLY 1049 ? ? ? B .
A 1 1050 GLN 1050 ? ? ? B .
A 1 1051 SER 1051 ? ? ? B .
A 1 1052 ILE 1052 ? ? ? B .
A 1 1053 ALA 1053 ? ? ? B .
A 1 1054 ARG 1054 ? ? ? B .
A 1 1055 ARG 1055 ? ? ? B .
A 1 1056 ARG 1056 ? ? ? B .
A 1 1057 LYS 1057 ? ? ? B .
#
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 ZN 1 4 4 ZN '_' .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Nuclear pore complex protein Nup153 {PDB ID=3gj8, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3gj8.1.B}'
'template structure' .
2 'ZINC ION {PDB ID=3gj8, label_asym_id=H, auth_asym_id=B, SMTL ID=3gj8.1._.4}'
'template structure' .
3 . target .
4 'ZINC ION' target .
5 'Target-template alignment by HHblits to 3gj8, label_asym_id=B'
'target-template alignment' .
6 'model 8' 'model coordinates' .
7 SMTL 'reference database' .
8 PDB 'reference database' .
9 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 3
2 1 7
3 1 8
4 2 9
5 3 3
6 3 4
7 3 1
8 3 2
9 3 5
10 4 1
11 4 2
12 4 5
13 4 4
14 5 6
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26
8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 3 'reference database'
2 4 .
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
B 2 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B
2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B H 5 1 B
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;GPLGSVGSWECPVCCVSNKAEDSRCVSCTSEKPGLVSASSSNSVPVSLPSGGCLGLDKFKKPEGSWDCEV
CLVQNKADSTKCIACESAKPGT
;

;GPLGSVGSWECPVCCVSNKAEDSRCVSCTSEKPGLVSASSSNSVPVSLPSGGCLGLDKFKKPEGSWDCEV
CLVQNKADSTKCIACESAKPGT
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 6 91
#
#
loop_
_ma_template_non_poly.template_id
_ma_template_non_poly.comp_id
_ma_template_non_poly.details
2 ZN 'ZINC ION'
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 3gj8 2023-09-06
2 PDB . 3gj8 2023-09-06
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1057
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 5 1 1066 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 8.5e-08 22.078
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MPGDEERGFLAAREELASALRWDSAQVFPLEQLMPLLATSLPPAARYLQLDAGRLVRCNAHGEPRNYLNTLSTALNILEKYGRNLLSPQRPRYWRSVKFNNPVFRSTVDAVQGGRDVLRLYGYTEERPDGLSFPEGQEEPDEYQVAVVTLEVLLLRTELSLLLQNTHPRQNALDQLLRESVEDGMLQLSEFHPLLREIVPGPRPSAQGSTPGPCFLCGSAPGTLHCPACNQVSCPACDILFHGHPSRAHHLRQALPGSHQTASLSSSLPASSQPRPPSSSLALGDSSLSSPDPANACLPWHCLTCATLNEPWAVFCAVCSQPKGCKVPGIEGSHG---------TGGLEPEPARDQWACQSCTFENEAAAVLCAICERPRLAQPPSLVVDSHDAGVCQQSLKQEDPLLTAAQPQVWYCDHCTFCNSGPVWVCAMCNRTRDPIPTQPALQSYPSSLEKGRPKPGSSQHLGSSLPASCGDPEKQRQDKMRKEGLQLVSMIQEGETAGASPEEVFSALQYSGTEVPLQWLRSELSYVLEMVAELAGQQDPELGAFSCQEARKAWLDRHGNLDEAVEECVRARRRKVHELQSLGFGPKEGSLQALFQHGGDVARALTELQRQRLEPFHQRLWDRDPEPTPCWDGLDRQSLVRRLLAVYTLPSWGRAELALALLQETPRNYELLDVVEAVRHSQDRAFLRRLLAQECAVCGWALPRNRMQALISCECTICPECFRQHFTIALKEKHITDMVCPACGRPDLTDDAQLLSYFSTLDIQLRESLDPDAYALFHKKLTEAVLMRDPKFLWCAQCSFGFIYEREQLEATCPQCHQTFCVRCKRQCEDFQNWKRTNDPEYQAQGLAMYLQENGIDCPKCKFSYALARGGCMHFHCTQCRHQFCSGCYNAFYAKNKCPDPNCKVKKSLHGHHPRDCLFYLRDWTAARLQKLLQDNNVMFNTEPPAGTRAVPGGGCRVMEQKEVHSGFRDEACGKETPPGYAGLCQAHYKEYLVSLINAHSLDPATLYEVEELETATIRYLHLAPQPADGEDLPAYQARLLQKLREEVPLGQSIARRRK
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VGSWECPVCCVSNKAEDSRCVSCTSEKPGLVSASSSNSVPVSLPSGGCLGLDKFKKPEGSWDCEVCLVQNKADSTKCIACESAKPG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3gj8.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
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ATOM 141 O O . CYS 364 364 ? A 72.588 0.348 23.507 1 1 B CYS 0.670 1
ATOM 142 C CB . CYS 364 364 ? A 70.299 0.279 21.587 1 1 B CYS 0.670 1
ATOM 143 S SG . CYS 364 364 ? A 68.911 0.967 22.561 1 1 B CYS 0.670 1
ATOM 144 N N . ALA 365 365 ? A 71.956 2.511 23.554 1 1 B ALA 0.700 1
ATOM 145 C CA . ALA 365 365 ? A 72.402 2.822 24.897 1 1 B ALA 0.700 1
ATOM 146 C C . ALA 365 365 ? A 71.764 1.963 25.990 1 1 B ALA 0.700 1
ATOM 147 O O . ALA 365 365 ? A 72.309 1.794 27.069 1 1 B ALA 0.700 1
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ATOM 157 N N . CYS 367 367 ? A 69.974 -1.479 25.173 1 1 B CYS 0.680 1
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ATOM 160 O O . CYS 367 367 ? A 71.036 -4.651 23.768 1 1 B CYS 0.680 1
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ATOM 163 N N . GLU 368 368 ? A 72.041 -2.626 23.761 1 1 B GLU 0.650 1
ATOM 164 C CA . GLU 368 368 ? A 73.271 -2.974 23.073 1 1 B GLU 0.650 1
ATOM 165 C C . GLU 368 368 ? A 73.135 -3.395 21.615 1 1 B GLU 0.650 1
ATOM 166 O O . GLU 368 368 ? A 74.089 -3.779 20.948 1 1 B GLU 0.650 1
ATOM 167 C CB . GLU 368 368 ? A 74.148 -3.960 23.871 1 1 B GLU 0.650 1
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ATOM 170 O OE1 . GLU 368 368 ? A 76.365 -4.591 26.316 1 1 B GLU 0.650 1
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ATOM 172 N N . ARG 369 369 ? A 71.925 -3.298 21.034 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 173 C CA . ARG 369 369 ? A 71.695 -3.672 19.655 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 174 C C . ARG 369 369 ? A 72.313 -2.700 18.671 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 175 O O . ARG 369 369 ? A 72.242 -1.497 18.918 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 176 C CB . ARG 369 369 ? A 70.183 -3.805 19.405 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 177 C CG . ARG 369 369 ? A 69.617 -5.006 20.178 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 178 C CD . ARG 369 369 ? A 70.025 -6.340 19.558 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 179 N NE . ARG 369 369 ? A 69.224 -7.406 20.235 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 180 C CZ . ARG 369 369 ? A 69.400 -8.709 19.971 1 1 B ARG 0.630 1
ATOM 181 N NH1 . ARG 369 369 ? A 70.256 -9.101 19.033 1 1 B ARG 0.630 1
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ATOM 183 N N . PRO 370 370 ? A 72.917 -3.133 17.568 1 1 B PRO 0.630 1
ATOM 184 C CA . PRO 370 370 ? A 73.477 -2.207 16.608 1 1 B PRO 0.630 1
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ATOM 199 N NH1 . ARG 371 371 ? A 72.638 7.079 12.963 1 1 B ARG 0.490 1
ATOM 200 N NH2 . ARG 371 371 ? A 71.375 6.949 11.091 1 1 B ARG 0.490 1
ATOM 201 N N . LEU 372 372 ? A 70.834 -0.178 12.455 1 1 B LEU 0.480 1
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ATOM 208 C CD2 . LEU 372 372 ? A 67.098 -0.443 9.239 1 1 B LEU 0.480 1
ATOM 209 O OXT . LEU 372 372 ? A 71.658 -0.230 8.927 1 1 B LEU 0.480 1
HETATM 210 ZN ZN . ZN . 4 ? B 67.542 -0.942 22.188 1 2 '_' ZN . 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
ZN
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.661
2 1 3 0.023
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 346 ASP 1 0.560
2 1 A 347 GLN 1 0.600
3 1 A 348 TRP 1 0.640
4 1 A 349 ALA 1 0.780
5 1 A 350 CYS 1 0.740
6 1 A 351 GLN 1 0.730
7 1 A 352 SER 1 0.760
8 1 A 353 CYS 1 0.740
9 1 A 354 THR 1 0.760
10 1 A 355 PHE 1 0.710
11 1 A 356 GLU 1 0.740
12 1 A 357 ASN 1 0.720
13 1 A 358 GLU 1 0.660
14 1 A 359 ALA 1 0.670
15 1 A 360 ALA 1 0.600
16 1 A 361 ALA 1 0.630
17 1 A 362 VAL 1 0.600
18 1 A 363 LEU 1 0.610
19 1 A 364 CYS 1 0.670
20 1 A 365 ALA 1 0.700
21 1 A 366 ILE 1 0.670
22 1 A 367 CYS 1 0.680
23 1 A 368 GLU 1 0.650
24 1 A 369 ARG 1 0.630
25 1 A 370 PRO 1 0.630
26 1 A 371 ARG 1 0.490
27 1 A 372 LEU 1 0.480
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
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can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
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the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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#