data_SMR-ce57a44a88f2d54485ebf94a107672b7_2 _entry.id SMR-ce57a44a88f2d54485ebf94a107672b7_2 _struct.entry_id SMR-ce57a44a88f2d54485ebf94a107672b7_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P59759/ MRTFB_MOUSE, Myocardin-related transcription factor B Estimated model accuracy of this model is 0.031, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P59759' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 137105.956 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MRTFB_MOUSE P59759 1 ;MIDSSKKQPQGFPEILTAEDFEPFKEKECLEGSNQKSLKEVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGP MELVEKNILPVDSSVKEAIIGVVKEDYPHTHGEFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSASP PPVTASTPAQFTSVSPAVPEFLKTPLTADQPPTRSTAPVLPTNTVSSAKSGPMLVKQSHPKNPNDKHRSK KCKDPKPRVKKLKYHQYIPPNQKGEKSEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQQQQQQQQHYNYQTILP APIKTDKNSSSGSNSGSSSSMPARRPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVT SSNLATGSIVAVSSATIVTSNPEVTVALPVTTLHNAVTSSVSTFKADLALPATSSVPHVENAHSPLPISP SPSEQSSLSTDDTNMTDTFTEIMTMMSPSQLLCSSPLRVVSHDDSLSPSSSTLSTLELDAAEKDRKLQEK EKQIEELKRKLEQEQKLVEVLKMQLEVEKRGQQRPPDPQPSDPPHPFNTSDPKHGSVGSSIKDEASLPDC SSPQQPITVPGHSVGQPISTGSQTLVAKKTVVVKQEVPMAQAEQQNVVSQFYLSSQGQPPALVAQPQALL TTQTTQLLLPVSIQGSNVTSVQLPVGSLQLQTPAQGRVQAQPHVAAATQVPAAALPSALTSALPQKQEAF PQHVLGQPQPVRKVFTNSAPNTVLQYQRQPGPTNQQPFVSKTSNPALQSRTAPLAPLQNGPSLASKPSSP PPPQQFVVQHSLFATPITKTKDPPRYEEAIKQTRSTQPALPEVSSVHSQQMDDLFDILIKSGEISFPIKE EPSPISKMKPVTASITTMPVNTVVSRPPPQVQIAPPVSLEPVNSLSASLENQLEAFLDGTLPSATDTGPL QNSSEDRESFSLIEDLQNDLLSHSSMLYQSHSPMETSEAQLVSGTPCLSLDLSDSNLDNMEWLDITMPTT SSGLTPLSTTAPSMFSADFLDPQDLPLPWD ; 'Myocardin-related transcription factor B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1080 1 1080 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MRTFB_MOUSE P59759 . 1 1080 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-06-27 1781D8EF34517DAC # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MIDSSKKQPQGFPEILTAEDFEPFKEKECLEGSNQKSLKEVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGP MELVEKNILPVDSSVKEAIIGVVKEDYPHTHGEFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSASP PPVTASTPAQFTSVSPAVPEFLKTPLTADQPPTRSTAPVLPTNTVSSAKSGPMLVKQSHPKNPNDKHRSK KCKDPKPRVKKLKYHQYIPPNQKGEKSEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQQQQQQQQHYNYQTILP APIKTDKNSSSGSNSGSSSSMPARRPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVT SSNLATGSIVAVSSATIVTSNPEVTVALPVTTLHNAVTSSVSTFKADLALPATSSVPHVENAHSPLPISP SPSEQSSLSTDDTNMTDTFTEIMTMMSPSQLLCSSPLRVVSHDDSLSPSSSTLSTLELDAAEKDRKLQEK EKQIEELKRKLEQEQKLVEVLKMQLEVEKRGQQRPPDPQPSDPPHPFNTSDPKHGSVGSSIKDEASLPDC SSPQQPITVPGHSVGQPISTGSQTLVAKKTVVVKQEVPMAQAEQQNVVSQFYLSSQGQPPALVAQPQALL TTQTTQLLLPVSIQGSNVTSVQLPVGSLQLQTPAQGRVQAQPHVAAATQVPAAALPSALTSALPQKQEAF PQHVLGQPQPVRKVFTNSAPNTVLQYQRQPGPTNQQPFVSKTSNPALQSRTAPLAPLQNGPSLASKPSSP PPPQQFVVQHSLFATPITKTKDPPRYEEAIKQTRSTQPALPEVSSVHSQQMDDLFDILIKSGEISFPIKE EPSPISKMKPVTASITTMPVNTVVSRPPPQVQIAPPVSLEPVNSLSASLENQLEAFLDGTLPSATDTGPL QNSSEDRESFSLIEDLQNDLLSHSSMLYQSHSPMETSEAQLVSGTPCLSLDLSDSNLDNMEWLDITMPTT SSGLTPLSTTAPSMFSADFLDPQDLPLPWD ; ;MIDSSKKQPQGFPEILTAEDFEPFKEKECLEGSNQKSLKEVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAF HEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGP MELVEKNILPVDSSVKEAIIGVVKEDYPHTHGEFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSASP PPVTASTPAQFTSVSPAVPEFLKTPLTADQPPTRSTAPVLPTNTVSSAKSGPMLVKQSHPKNPNDKHRSK KCKDPKPRVKKLKYHQYIPPNQKGEKSEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQQQQQQQQHYNYQTILP APIKTDKNSSSGSNSGSSSSMPARRPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVT SSNLATGSIVAVSSATIVTSNPEVTVALPVTTLHNAVTSSVSTFKADLALPATSSVPHVENAHSPLPISP 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GLU . 1 29 CYS . 1 30 LEU . 1 31 GLU . 1 32 GLY . 1 33 SER . 1 34 ASN . 1 35 GLN . 1 36 LYS . 1 37 SER . 1 38 LEU . 1 39 LYS . 1 40 GLU . 1 41 VAL . 1 42 LEU . 1 43 GLN . 1 44 LEU . 1 45 ARG . 1 46 LEU . 1 47 GLN . 1 48 GLN . 1 49 ARG . 1 50 ARG . 1 51 THR . 1 52 ARG . 1 53 GLU . 1 54 GLN . 1 55 LEU . 1 56 VAL . 1 57 ASP . 1 58 GLN . 1 59 GLY . 1 60 ILE . 1 61 MET . 1 62 PRO . 1 63 PRO . 1 64 LEU . 1 65 LYS . 1 66 SER . 1 67 PRO . 1 68 ALA . 1 69 ALA . 1 70 PHE . 1 71 HIS . 1 72 GLU . 1 73 GLN . 1 74 ILE . 1 75 LYS . 1 76 SER . 1 77 LEU . 1 78 GLU . 1 79 ARG . 1 80 ALA . 1 81 ARG . 1 82 THR . 1 83 GLU . 1 84 ASN . 1 85 PHE . 1 86 LEU . 1 87 LYS . 1 88 HIS . 1 89 LYS . 1 90 ILE . 1 91 ARG . 1 92 SER . 1 93 ARG . 1 94 PRO . 1 95 ASP . 1 96 ARG . 1 97 SER . 1 98 GLU . 1 99 LEU . 1 100 VAL . 1 101 ARG . 1 102 MET . 1 103 HIS . 1 104 ILE . 1 105 LEU . 1 106 GLU . 1 107 GLU . 1 108 THR . 1 109 PHE . 1 110 ALA . 1 111 GLU . 1 112 PRO . 1 113 SER . 1 114 LEU . 1 115 GLN . 1 116 ALA . 1 117 THR . 1 118 GLN . 1 119 MET . 1 120 LYS . 1 121 LEU . 1 122 LYS . 1 123 ARG . 1 124 ALA . 1 125 ARG . 1 126 LEU . 1 127 ALA . 1 128 ASP . 1 129 ASP . 1 130 LEU . 1 131 ASN . 1 132 GLU . 1 133 LYS . 1 134 ILE . 1 135 ALA . 1 136 GLN . 1 137 ARG . 1 138 PRO . 1 139 GLY . 1 140 PRO . 1 141 MET . 1 142 GLU . 1 143 LEU . 1 144 VAL . 1 145 GLU . 1 146 LYS . 1 147 ASN . 1 148 ILE . 1 149 LEU . 1 150 PRO . 1 151 VAL . 1 152 ASP . 1 153 SER . 1 154 SER . 1 155 VAL . 1 156 LYS . 1 157 GLU . 1 158 ALA . 1 159 ILE . 1 160 ILE . 1 161 GLY . 1 162 VAL . 1 163 VAL . 1 164 LYS . 1 165 GLU . 1 166 ASP . 1 167 TYR . 1 168 PRO . 1 169 HIS . 1 170 THR . 1 171 HIS . 1 172 GLY . 1 173 GLU . 1 174 PHE . 1 175 SER . 1 176 PHE . 1 177 ASP . 1 178 GLU . 1 179 ASP . 1 180 SER . 1 181 SER . 1 182 ASP . 1 183 ALA . 1 184 LEU . 1 185 SER . 1 186 PRO . 1 187 ASP . 1 188 GLN . 1 189 PRO . 1 190 ALA . 1 191 SER . 1 192 GLN . 1 193 GLU . 1 194 SER . 1 195 GLN . 1 196 GLY . 1 197 SER . 1 198 ALA . 1 199 ALA . 1 200 SER . 1 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MKL/myocardin-like protein 1 {PDB ID=2kvu, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2kvu.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2kvu, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGHHHHHHSHMSTPLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAP KAPAA ; ;MGHHHHHHSHMSTPLTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPVPGAP KAPAA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 15 66 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2kvu 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1080 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1080 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.5e-07 61.538 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MIDSSKKQPQGFPEILTAEDFEPFKEKECLEGSNQKSLKEVLQLRLQQRRTREQLVDQGIMPPLKSPAAFHEQIKSLERARTENFLKHKIRSRPDRSELVRMHILEETFAEPSLQATQMKLKRARLADDLNEKIAQRPGPMELVEKNILPVDSSVKEAIIGVVKEDYPHTHGEFSFDEDSSDALSPDQPASQESQGSAASPSEPKVSASPPPVTASTPAQFTSVSPAVPEFLKTPLTADQPPTRSTAPVLPTNTVSSAKSGPMLVKQSHPKNPNDKHRSKKCKDPKPRVKKLKYHQYIPPNQKGEKSEPQMDSNYARLLQQQQLFLQLQILSQQQQQQQQQHYNYQTILPAPIKTDKNSSSGSNSGSSSSMPARRPGPLPSSLDDLKVSELKTELKLRGLPVSGTKPDLIERLKPYQEVTSSNLATGSIVAVSSATIVTSNPEVTVALPVTTLHNAVTSSVSTFKADLALPATSSVPHVENAHSPLPISPSPSEQSSLSTDDTNMTDTFTEIMTMMSPSQLLCSSPLRVVSHDDSLSPSSSTLSTLELDAAEKDRKLQEKEKQIEELKRKLEQEQKLVEVLKMQLEVEKRGQQRPPDPQPSDPPHPFNTSDPKHGSVGSSIKDEASLPDCSSPQQPITVPGHSVGQPISTGSQTLVAKKTVVVKQEVPMAQAEQQNVVSQFYLSSQGQPPALVAQPQALLTTQTTQLLLPVSIQGSNVTSVQLPVGSLQLQTPAQGRVQAQPHVAAATQVPAAALPSALTSALPQKQEAFPQHVLGQPQPVRKVFTNSAPNTVLQYQRQPGPTNQQPFVSKTSNPALQSRTAPLAPLQNGPSLASKPSSPPPPQQFVVQHSLFATPITKTKDPPRYEEAIKQTRSTQPALPEVSSVHSQQMDDLFDILIKSGEISFPIKEEPSPISKMKPVTASITTMPVNTVVSRPPPQVQIAPPVSLEPVNSLSASLENQLEAFLDGTLPSATDTGPLQNSSEDRESFSLIEDLQNDLLSHSSMLYQSHSPMETSEAQLVSGTPCLSLDLSDSNLDNMEWLDITMPTTSSGLTPLSTTAPSMFSADFLDPQDLPLPWD 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LTGKPGALPANLDDMKVAELKQELKLRSLPVSGTKTELIERLRAYQDQISPV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2kvu.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 372 372 ? A 11.915 0.071 -8.309 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 2 C CA . PRO 372 372 ? A 11.399 -0.434 -9.626 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 3 C C . PRO 372 372 ? A 10.717 -1.757 -9.374 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 4 O O . PRO 372 372 ? A 11.381 -2.779 -9.442 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 5 C CB . PRO 372 372 ? A 12.686 -0.503 -10.458 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 6 C CG . PRO 372 372 ? A 13.831 -0.826 -9.472 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 7 C CD . PRO 372 372 ? A 13.327 -0.432 -8.092 1 1 A PRO 0.310 1 ATOM 8 N N . ALA 373 373 ? A 9.402 -1.786 -9.082 1 1 A ALA 0.370 1 ATOM 9 C CA . ALA 373 373 ? A 8.696 -3.029 -8.913 1 1 A ALA 0.370 1 ATOM 10 C C . ALA 373 373 ? A 7.272 -2.728 -9.319 1 1 A ALA 0.370 1 ATOM 11 O O . ALA 373 373 ? A 6.851 -1.576 -9.243 1 1 A ALA 0.370 1 ATOM 12 C CB . ALA 373 373 ? A 8.750 -3.510 -7.447 1 1 A ALA 0.370 1 ATOM 13 N N . ARG 374 374 ? A 6.530 -3.744 -9.801 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 14 C CA . ARG 374 374 ? A 5.151 -3.581 -10.225 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 15 C C . ARG 374 374 ? A 4.225 -4.534 -9.495 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 16 O O . ARG 374 374 ? A 3.211 -4.138 -8.930 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 17 C CB . ARG 374 374 ? A 5.064 -3.874 -11.748 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 18 C CG . ARG 374 374 ? A 3.653 -3.827 -12.365 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 19 C CD . ARG 374 374 ? A 3.661 -3.901 -13.884 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 20 N NE . ARG 374 374 ? A 2.229 -3.800 -14.314 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 21 C CZ . ARG 374 374 ? A 1.855 -3.868 -15.598 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 22 N NH1 . ARG 374 374 ? A 2.764 -4.058 -16.549 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 23 N NH2 . ARG 374 374 ? A 0.576 -3.737 -15.937 1 1 A ARG 0.460 1 ATOM 24 N N . ARG 375 375 ? A 4.558 -5.837 -9.469 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 25 C CA . ARG 375 375 ? A 3.735 -6.832 -8.818 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 26 C C . ARG 375 375 ? A 4.639 -7.812 -8.111 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 27 O O . ARG 375 375 ? A 5.014 -8.831 -8.689 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 28 C CB . ARG 375 375 ? A 2.851 -7.596 -9.827 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 29 C CG . ARG 375 375 ? A 1.661 -6.743 -10.308 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 30 C CD . ARG 375 375 ? A 0.791 -7.409 -11.374 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 31 N NE . ARG 375 375 ? A 0.120 -8.580 -10.723 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 32 C CZ . ARG 375 375 ? A -1.022 -8.510 -10.024 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 33 N NH1 . ARG 375 375 ? A -1.695 -7.374 -9.873 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 34 N NH2 . ARG 375 375 ? A -1.509 -9.614 -9.458 1 1 A ARG 0.530 1 ATOM 35 N N . PRO 376 376 ? A 5.023 -7.540 -6.881 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 36 C CA . PRO 376 376 ? A 5.685 -8.505 -6.037 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 37 C C . PRO 376 376 ? A 4.656 -9.359 -5.272 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 38 O O . PRO 376 376 ? A 3.462 -9.051 -5.275 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 39 C CB . PRO 376 376 ? A 6.522 -7.551 -5.159 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 40 C CG . PRO 376 376 ? A 5.658 -6.307 -4.950 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 41 C CD . PRO 376 376 ? A 4.765 -6.281 -6.181 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 42 N N . GLY 377 377 ? A 5.118 -10.468 -4.654 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 43 C CA . GLY 377 377 ? A 4.426 -11.309 -3.671 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 44 C C . GLY 377 377 ? A 4.647 -10.940 -2.202 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 45 O O . GLY 377 377 ? A 3.877 -11.426 -1.397 1 1 A GLY 0.540 1 ATOM 46 N N . PRO 378 378 ? A 5.625 -10.080 -1.811 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 47 C CA . PRO 378 378 ? A 5.615 -9.500 -0.472 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 48 C C . PRO 378 378 ? A 5.481 -7.974 -0.468 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 49 O O . PRO 378 378 ? A 4.822 -7.421 -1.351 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 50 C CB . PRO 378 378 ? A 6.956 -9.976 0.104 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 51 C CG . PRO 378 378 ? A 7.921 -10.063 -1.083 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 52 C CD . PRO 378 378 ? A 7.006 -10.187 -2.301 1 1 A PRO 0.570 1 ATOM 53 N N . LEU 379 379 ? A 6.050 -7.283 0.557 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 54 C CA . LEU 379 379 ? A 6.114 -5.835 0.708 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 55 C C . LEU 379 379 ? A 7.527 -5.414 1.079 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 56 O O . LEU 379 379 ? A 8.217 -6.177 1.760 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 57 C CB . LEU 379 379 ? A 5.200 -5.315 1.850 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 58 C CG . LEU 379 379 ? A 3.722 -5.343 1.460 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 59 C CD1 . LEU 379 379 ? A 2.823 -5.113 2.678 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 60 C CD2 . LEU 379 379 ? A 3.392 -4.383 0.312 1 1 A LEU 0.660 1 ATOM 61 N N . PRO 380 380 ? A 8.013 -4.237 0.679 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 62 C CA . PRO 380 380 ? A 9.226 -3.648 1.234 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 63 C C . PRO 380 380 ? A 9.035 -3.296 2.705 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 64 O O . PRO 380 380 ? A 7.923 -3.013 3.136 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 65 C CB . PRO 380 380 ? A 9.472 -2.405 0.347 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 66 C CG . PRO 380 380 ? A 8.091 -2.010 -0.192 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 67 C CD . PRO 380 380 ? A 7.330 -3.333 -0.254 1 1 A PRO 0.730 1 ATOM 68 N N . SER 381 381 ? A 10.103 -3.274 3.524 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 69 C CA . SER 381 381 ? A 9.996 -3.006 4.952 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 70 C C . SER 381 381 ? A 10.047 -1.516 5.264 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 71 O O . SER 381 381 ? A 10.143 -1.104 6.415 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 72 C CB . SER 381 381 ? A 11.155 -3.706 5.714 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 73 O OG . SER 381 381 ? A 12.430 -3.340 5.172 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 74 N N . SER 382 382 ? A 9.937 -0.676 4.218 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 75 C CA . SER 382 382 ? A 10.125 0.761 4.232 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 76 C C . SER 382 382 ? A 8.851 1.491 3.837 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 77 O O . SER 382 382 ? A 8.884 2.646 3.430 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 78 C CB . SER 382 382 ? A 11.285 1.163 3.274 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 79 O OG . SER 382 382 ? A 11.088 0.668 1.943 1 1 A SER 0.710 1 ATOM 80 N N . LEU 383 383 ? A 7.664 0.849 3.963 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 81 C CA . LEU 383 383 ? A 6.381 1.400 3.524 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 82 C C . LEU 383 383 ? A 6.017 2.753 4.110 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 83 O O . LEU 383 383 ? A 5.552 3.652 3.414 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 84 C CB . LEU 383 383 ? A 5.217 0.463 3.928 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 85 C CG . LEU 383 383 ? A 5.260 -0.911 3.253 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 86 C CD1 . 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A 10.618 5.263 4.897 1 1 A ASP 0.680 1 ATOM 101 C CG . ASP 385 385 ? A 11.163 5.376 6.307 1 1 A ASP 0.680 1 ATOM 102 O OD1 . ASP 385 385 ? A 11.604 6.500 6.657 1 1 A ASP 0.680 1 ATOM 103 O OD2 . ASP 385 385 ? A 11.185 4.335 7.011 1 1 A ASP 0.680 1 ATOM 104 N N . LEU 386 386 ? A 8.081 5.614 2.667 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 105 C CA . LEU 386 386 ? A 7.571 6.032 1.385 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 106 C C . LEU 386 386 ? A 6.418 7.025 1.526 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 107 O O . LEU 386 386 ? A 5.885 7.303 2.597 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 108 C CB . LEU 386 386 ? A 7.207 4.842 0.471 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 109 C CG . LEU 386 386 ? A 8.367 3.855 0.208 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 110 C CD1 . LEU 386 386 ? A 7.852 2.689 -0.651 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 111 C CD2 . LEU 386 386 ? A 9.602 4.511 -0.442 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 112 N N . LYS 387 387 ? A 6.035 7.670 0.415 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 113 C CA . LYS 387 387 ? A 5.035 8.718 0.391 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 114 C C . LYS 387 387 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #