data_SMR-96e8fab5321a4f870aee0c908d8b527e_9 _entry.id SMR-96e8fab5321a4f870aee0c908d8b527e_9 _struct.entry_id SMR-96e8fab5321a4f870aee0c908d8b527e_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q70IV5 (isoform 2)/ SYNEM_MOUSE, Synemin Estimated model accuracy of this model is 0.037, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q70IV5 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 163735.563 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SYNEM_MOUSE Q70IV5 1 ;MLSWRLQTGSEKAELQELNARLYDYVCRVRELERENLLLEEELRSRLSREDRWAEDQALYAEEARSLRQQ LDELNWSTALAEGERDALRRELLELQREGVEAGTARSRLDAELGAQRRELEEALGARAALEALLGRLETE RRDLDAAHERQVRDLRARAASLTMHFRARATSPAAPPPRLRDVHDSYALLVAESWRESVQLYEDEVRELE QALRRGQESRLQAEDEARLCAQEADALRNQALELEQLRARLEDELLRMREEYGMQAEERQRVIDSLEDEK EALTLAMADRLRDYQELLQVKTGLSLEVATYRALLEGESNPEILIWTENIENVPQEPRNTSYRYTNSVLQ RKNEKNLFPRRKTPWAAVNHSSASYSNWPGHLDSQTTTAVGSAARRGLLTSRHSSSATTSGQQKPLEKTI SSRANLRPVTPTHGFLRNTDAQMKTLPHRSKVEGTGDTHARRATESVITRESYRGHQGHVAAGAVSSTPS NERTVILGKKLEAQATKEQERDRSGVIRIKPEEKMFDSKEKASEERNLRWEELTKLDRDARKRESRHLRD EAREKEALKERSVKEREVPISLEVSRGSRAEVSTIHLQSPGRKDVSHSGGREAETKETRFRLDTQDTASS LQSDSTTETIAESIVTTILKQFTQSPGAEEEATSFPDTKVTYVDRKEFPGDGKTKTEIVVESKLTDVVDV SDEAGLDYLLSKDVKEVGLKGKSTETMIGEMINLGLKGREGRAKVVNVEIVEEPMSYIGGGKIDFSTPFQ VEEVDDVSPSPKGFVEEEDGEGETHMAFSMRPHQTKQPQGTIPHVEEVTEAGDSEGEQSYFVSTPDEYPG GHDREDDGSVYGQIHIEEESTIRYSWQDEIAQGTWRRKMRGDVGGEKPVKVLEVPALSLGGAIGSAHLKE EASGELRAEPTVIEKEIKIPHEFHTSIKGVFSSEPRHQLVEVIGQLEETLPERMKEELSALTRQSQGESG SVSVDVKKVQSAAGGSVTLMAEVNLSQTVDADQLDLEQLSRDEAGEIERAVESVVRESLAKRSSPVPRSP DREDGEEVPAGGILFKRWATRELYSPSGERDDAGQVSPSSDQRVTQGPVSATVEVTSPTGFVQSHVLEDV SQSVRHVKLGPTEMWRTEQVTFGGPTAQVVEMDLSDTRAIRSWTRDTGSEVEAHGVSHRGGWRIAHSRDE RVASTGSGASPGDAHQAPGEKGTEQAGFDKTVQLQRMVDQRSVASDEKKVALLYLDNEEEEEEEGEGWF ; Synemin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1259 1 1259 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SYNEM_MOUSE Q70IV5 Q70IV5-2 1 1259 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2009-03-03 50FC7B65F0948C69 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MLSWRLQTGSEKAELQELNARLYDYVCRVRELERENLLLEEELRSRLSREDRWAEDQALYAEEARSLRQQ LDELNWSTALAEGERDALRRELLELQREGVEAGTARSRLDAELGAQRRELEEALGARAALEALLGRLETE RRDLDAAHERQVRDLRARAASLTMHFRARATSPAAPPPRLRDVHDSYALLVAESWRESVQLYEDEVRELE QALRRGQESRLQAEDEARLCAQEADALRNQALELEQLRARLEDELLRMREEYGMQAEERQRVIDSLEDEK EALTLAMADRLRDYQELLQVKTGLSLEVATYRALLEGESNPEILIWTENIENVPQEPRNTSYRYTNSVLQ RKNEKNLFPRRKTPWAAVNHSSASYSNWPGHLDSQTTTAVGSAARRGLLTSRHSSSATTSGQQKPLEKTI SSRANLRPVTPTHGFLRNTDAQMKTLPHRSKVEGTGDTHARRATESVITRESYRGHQGHVAAGAVSSTPS NERTVILGKKLEAQATKEQERDRSGVIRIKPEEKMFDSKEKASEERNLRWEELTKLDRDARKRESRHLRD EAREKEALKERSVKEREVPISLEVSRGSRAEVSTIHLQSPGRKDVSHSGGREAETKETRFRLDTQDTASS 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 LEU . 1 3 SER . 1 4 TRP . 1 5 ARG . 1 6 LEU . 1 7 GLN . 1 8 THR . 1 9 GLY . 1 10 SER . 1 11 GLU . 1 12 LYS . 1 13 ALA . 1 14 GLU . 1 15 LEU . 1 16 GLN . 1 17 GLU . 1 18 LEU . 1 19 ASN . 1 20 ALA . 1 21 ARG . 1 22 LEU . 1 23 TYR . 1 24 ASP . 1 25 TYR . 1 26 VAL . 1 27 CYS . 1 28 ARG . 1 29 VAL . 1 30 ARG . 1 31 GLU . 1 32 LEU . 1 33 GLU . 1 34 ARG . 1 35 GLU . 1 36 ASN . 1 37 LEU . 1 38 LEU . 1 39 LEU . 1 40 GLU . 1 41 GLU . 1 42 GLU . 1 43 LEU . 1 44 ARG . 1 45 SER . 1 46 ARG . 1 47 LEU . 1 48 SER . 1 49 ARG . 1 50 GLU . 1 51 ASP . 1 52 ARG . 1 53 TRP . 1 54 ALA . 1 55 GLU . 1 56 ASP . 1 57 GLN . 1 58 ALA . 1 59 LEU . 1 60 TYR . 1 61 ALA . 1 62 GLU . 1 63 GLU . 1 64 ALA . 1 65 ARG . 1 66 SER . 1 67 LEU . 1 68 ARG . 1 69 GLN . 1 70 GLN . 1 71 LEU . 1 72 ASP . 1 73 GLU . 1 74 LEU . 1 75 ASN . 1 76 TRP . 1 77 SER . 1 78 THR . 1 79 ALA . 1 80 LEU . 1 81 ALA . 1 82 GLU . 1 83 GLY . 1 84 GLU . 1 85 ARG . 1 86 ASP . 1 87 ALA . 1 88 LEU . 1 89 ARG . 1 90 ARG . 1 91 GLU . 1 92 LEU . 1 93 LEU . 1 94 GLU . 1 95 LEU . 1 96 GLN . 1 97 ARG . 1 98 GLU . 1 99 GLY . 1 100 VAL . 1 101 GLU . 1 102 ALA . 1 103 GLY . 1 104 THR . 1 105 ALA . 1 106 ARG . 1 107 SER . 1 108 ARG . 1 109 LEU . 1 110 ASP . 1 111 ALA . 1 112 GLU . 1 113 LEU . 1 114 GLY . 1 115 ALA . 1 116 GLN . 1 117 ARG . 1 118 ARG . 1 119 GLU . 1 120 LEU . 1 121 GLU . 1 122 GLU . 1 123 ALA . 1 124 LEU . 1 125 GLY . 1 126 ALA . 1 127 ARG . 1 128 ALA . 1 129 ALA . 1 130 LEU . 1 131 GLU . 1 132 ALA . 1 133 LEU . 1 134 LEU . 1 135 GLY . 1 136 ARG . 1 137 LEU . 1 138 GLU . 1 139 THR . 1 140 GLU . 1 141 ARG . 1 142 ARG . 1 143 ASP . 1 144 LEU . 1 145 ASP . 1 146 ALA . 1 147 ALA . 1 148 HIS . 1 149 GLU . 1 150 ARG . 1 151 GLN . 1 152 VAL . 1 153 ARG . 1 154 ASP . 1 155 LEU . 1 156 ARG . 1 157 ALA . 1 158 ARG . 1 159 ALA . 1 160 ALA . 1 161 SER . 1 162 LEU . 1 163 THR . 1 164 MET . 1 165 HIS . 1 166 PHE . 1 167 ARG . 1 168 ALA . 1 169 ARG . 1 170 ALA . 1 171 THR . 1 172 SER 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A 1 1012 ASP 1012 ? ? ? B . A 1 1013 GLN 1013 ? ? ? B . A 1 1014 LEU 1014 ? ? ? B . A 1 1015 ASP 1015 ? ? ? B . A 1 1016 LEU 1016 ? ? ? B . A 1 1017 GLU 1017 ? ? ? B . A 1 1018 GLN 1018 ? ? ? B . A 1 1019 LEU 1019 ? ? ? B . A 1 1020 SER 1020 ? ? ? B . A 1 1021 ARG 1021 ? ? ? B . A 1 1022 ASP 1022 ? ? ? B . A 1 1023 GLU 1023 ? ? ? B . A 1 1024 ALA 1024 ? ? ? B . A 1 1025 GLY 1025 ? ? ? B . A 1 1026 GLU 1026 ? ? ? B . A 1 1027 ILE 1027 ? ? ? B . A 1 1028 GLU 1028 ? ? ? B . A 1 1029 ARG 1029 ? ? ? B . A 1 1030 ALA 1030 ? ? ? B . A 1 1031 VAL 1031 ? ? ? B . A 1 1032 GLU 1032 ? ? ? B . A 1 1033 SER 1033 ? ? ? B . A 1 1034 VAL 1034 ? ? ? B . A 1 1035 VAL 1035 ? ? ? B . A 1 1036 ARG 1036 ? ? ? B . A 1 1037 GLU 1037 ? ? ? B . A 1 1038 SER 1038 ? ? ? B . A 1 1039 LEU 1039 ? ? ? B . A 1 1040 ALA 1040 ? ? ? B . A 1 1041 LYS 1041 ? ? ? B . A 1 1042 ARG 1042 ? ? ? B . A 1 1043 SER 1043 ? ? ? B . A 1 1044 SER 1044 ? ? ? B . A 1 1045 PRO 1045 ? ? ? B . A 1 1046 VAL 1046 ? ? ? B . A 1 1047 PRO 1047 ? ? ? B . A 1 1048 ARG 1048 ? ? ? B . A 1 1049 SER 1049 ? ? ? B . A 1 1050 PRO 1050 ? ? ? B . A 1 1051 ASP 1051 ? ? ? B . A 1 1052 ARG 1052 ? ? ? B . A 1 1053 GLU 1053 ? ? ? B . A 1 1054 ASP 1054 ? ? ? B . A 1 1055 GLY 1055 ? ? ? B . A 1 1056 GLU 1056 ? ? ? B . A 1 1057 GLU 1057 ? ? ? B . A 1 1058 VAL 1058 ? ? ? B . A 1 1059 PRO 1059 ? ? ? B . A 1 1060 ALA 1060 ? ? ? B . A 1 1061 GLY 1061 ? ? ? B . A 1 1062 GLY 1062 ? ? ? B . A 1 1063 ILE 1063 ? ? ? B . A 1 1064 LEU 1064 ? ? ? B . A 1 1065 PHE 1065 ? ? ? B . A 1 1066 LYS 1066 ? ? ? B . A 1 1067 ARG 1067 ? ? ? B . A 1 1068 TRP 1068 ? ? ? B . A 1 1069 ALA 1069 ? ? ? B . A 1 1070 THR 1070 ? ? ? B . A 1 1071 ARG 1071 ? ? ? B . A 1 1072 GLU 1072 ? ? ? B . A 1 1073 LEU 1073 ? ? ? B . A 1 1074 TYR 1074 ? ? ? B . A 1 1075 SER 1075 ? ? ? B . A 1 1076 PRO 1076 ? ? ? B . A 1 1077 SER 1077 ? ? ? B . A 1 1078 GLY 1078 ? ? ? B . A 1 1079 GLU 1079 ? ? ? B . A 1 1080 ARG 1080 ? ? ? B . A 1 1081 ASP 1081 ? ? ? B . A 1 1082 ASP 1082 ? ? ? B . A 1 1083 ALA 1083 ? ? ? B . A 1 1084 GLY 1084 ? ? ? B . A 1 1085 GLN 1085 ? ? ? B . A 1 1086 VAL 1086 ? ? ? B . A 1 1087 SER 1087 ? ? ? B . A 1 1088 PRO 1088 ? ? ? B . A 1 1089 SER 1089 ? ? ? B . A 1 1090 SER 1090 ? ? ? B . A 1 1091 ASP 1091 ? ? ? B . A 1 1092 GLN 1092 ? ? ? B . A 1 1093 ARG 1093 ? ? ? B . A 1 1094 VAL 1094 ? ? ? B . A 1 1095 THR 1095 ? ? ? B . A 1 1096 GLN 1096 ? ? ? B . A 1 1097 GLY 1097 ? ? ? B . A 1 1098 PRO 1098 ? ? ? B . A 1 1099 VAL 1099 ? ? ? B . A 1 1100 SER 1100 ? ? ? B . A 1 1101 ALA 1101 ? ? ? B . A 1 1102 THR 1102 ? ? ? B . A 1 1103 VAL 1103 ? ? ? B . A 1 1104 GLU 1104 ? ? ? B . A 1 1105 VAL 1105 ? ? ? B . A 1 1106 THR 1106 ? ? ? B . A 1 1107 SER 1107 ? ? ? B . A 1 1108 PRO 1108 ? ? ? B . A 1 1109 THR 1109 ? ? ? B . A 1 1110 GLY 1110 ? ? ? B . A 1 1111 PHE 1111 ? ? ? B . A 1 1112 VAL 1112 ? ? ? B . A 1 1113 GLN 1113 ? ? ? B . A 1 1114 SER 1114 ? ? ? B . A 1 1115 HIS 1115 ? ? ? B . A 1 1116 VAL 1116 ? ? ? B . A 1 1117 LEU 1117 ? ? ? B . A 1 1118 GLU 1118 ? ? ? B . A 1 1119 ASP 1119 ? ? ? B . A 1 1120 VAL 1120 ? ? ? B . A 1 1121 SER 1121 ? ? ? B . A 1 1122 GLN 1122 ? ? ? B . A 1 1123 SER 1123 ? ? ? B . A 1 1124 VAL 1124 ? ? ? B . A 1 1125 ARG 1125 ? ? ? B . A 1 1126 HIS 1126 ? ? ? B . A 1 1127 VAL 1127 ? ? ? B . A 1 1128 LYS 1128 ? ? ? B . A 1 1129 LEU 1129 ? ? ? B . A 1 1130 GLY 1130 ? ? ? B . A 1 1131 PRO 1131 ? ? ? B . A 1 1132 THR 1132 ? ? ? B . A 1 1133 GLU 1133 ? ? ? B . A 1 1134 MET 1134 ? ? ? B . A 1 1135 TRP 1135 ? ? ? B . A 1 1136 ARG 1136 ? ? ? B . A 1 1137 THR 1137 ? ? ? B . A 1 1138 GLU 1138 ? ? ? B . A 1 1139 GLN 1139 ? ? ? B . A 1 1140 VAL 1140 ? ? ? B . A 1 1141 THR 1141 ? ? ? B . A 1 1142 PHE 1142 ? ? ? B . A 1 1143 GLY 1143 ? ? ? B . A 1 1144 GLY 1144 ? ? ? B . A 1 1145 PRO 1145 ? ? ? B . A 1 1146 THR 1146 ? ? ? B . A 1 1147 ALA 1147 ? ? ? B . A 1 1148 GLN 1148 ? ? ? B . A 1 1149 VAL 1149 ? ? ? B . A 1 1150 VAL 1150 ? ? ? B . A 1 1151 GLU 1151 ? ? ? B . A 1 1152 MET 1152 ? ? ? B . A 1 1153 ASP 1153 ? ? ? B . A 1 1154 LEU 1154 ? ? ? B . A 1 1155 SER 1155 ? ? ? B . A 1 1156 ASP 1156 ? ? ? B . A 1 1157 THR 1157 ? ? ? B . A 1 1158 ARG 1158 ? ? ? B . A 1 1159 ALA 1159 ? ? ? B . A 1 1160 ILE 1160 ? ? ? B . A 1 1161 ARG 1161 ? ? ? B . A 1 1162 SER 1162 ? ? ? B . A 1 1163 TRP 1163 ? ? ? B . A 1 1164 THR 1164 ? ? ? B . A 1 1165 ARG 1165 ? ? ? B . A 1 1166 ASP 1166 ? ? ? B . A 1 1167 THR 1167 ? ? ? B . A 1 1168 GLY 1168 ? ? ? B . A 1 1169 SER 1169 ? ? ? B . A 1 1170 GLU 1170 ? ? ? B . A 1 1171 VAL 1171 ? ? ? B . A 1 1172 GLU 1172 ? ? ? B . A 1 1173 ALA 1173 ? ? ? B . A 1 1174 HIS 1174 ? ? ? B . A 1 1175 GLY 1175 ? ? ? B . A 1 1176 VAL 1176 ? ? ? B . A 1 1177 SER 1177 ? ? ? B . A 1 1178 HIS 1178 ? ? ? B . A 1 1179 ARG 1179 ? ? ? B . A 1 1180 GLY 1180 ? ? ? B . A 1 1181 GLY 1181 ? ? ? B . A 1 1182 TRP 1182 ? ? ? B . A 1 1183 ARG 1183 ? ? ? B . A 1 1184 ILE 1184 ? ? ? B . A 1 1185 ALA 1185 ? ? ? B . A 1 1186 HIS 1186 ? ? ? B . A 1 1187 SER 1187 ? ? ? B . A 1 1188 ARG 1188 ? ? ? B . A 1 1189 ASP 1189 ? ? ? B . A 1 1190 GLU 1190 ? ? ? B . A 1 1191 ARG 1191 ? ? ? B . A 1 1192 VAL 1192 ? ? ? B . A 1 1193 ALA 1193 ? ? ? B . A 1 1194 SER 1194 ? ? ? B . A 1 1195 THR 1195 ? ? ? B . A 1 1196 GLY 1196 ? ? ? B . A 1 1197 SER 1197 ? ? ? B . A 1 1198 GLY 1198 ? ? ? B . A 1 1199 ALA 1199 ? ? ? B . A 1 1200 SER 1200 ? ? ? B . A 1 1201 PRO 1201 ? ? ? B . A 1 1202 GLY 1202 ? ? ? B . A 1 1203 ASP 1203 ? ? ? B . A 1 1204 ALA 1204 ? ? ? B . A 1 1205 HIS 1205 ? ? ? B . A 1 1206 GLN 1206 ? ? ? B . A 1 1207 ALA 1207 ? ? ? B . A 1 1208 PRO 1208 ? ? ? B . A 1 1209 GLY 1209 ? ? ? B . A 1 1210 GLU 1210 ? ? ? B . A 1 1211 LYS 1211 ? ? ? B . A 1 1212 GLY 1212 ? ? ? B . A 1 1213 THR 1213 ? ? ? B . A 1 1214 GLU 1214 ? ? ? B . A 1 1215 GLN 1215 ? ? ? B . A 1 1216 ALA 1216 ? ? ? B . A 1 1217 GLY 1217 ? ? ? B . A 1 1218 PHE 1218 ? ? ? B . A 1 1219 ASP 1219 ? ? ? B . A 1 1220 LYS 1220 ? ? ? B . A 1 1221 THR 1221 ? ? ? B . A 1 1222 VAL 1222 ? ? ? B . A 1 1223 GLN 1223 ? ? ? B . A 1 1224 LEU 1224 ? ? ? B . A 1 1225 GLN 1225 ? ? ? B . A 1 1226 ARG 1226 ? ? ? B . A 1 1227 MET 1227 ? ? ? B . A 1 1228 VAL 1228 ? ? ? B . A 1 1229 ASP 1229 ? ? ? B . A 1 1230 GLN 1230 ? ? ? B . A 1 1231 ARG 1231 ? ? ? B . A 1 1232 SER 1232 ? ? ? B . A 1 1233 VAL 1233 ? ? ? B . A 1 1234 ALA 1234 ? ? ? B . A 1 1235 SER 1235 ? ? ? B . A 1 1236 ASP 1236 ? ? ? B . A 1 1237 GLU 1237 ? ? ? B . A 1 1238 LYS 1238 ? ? ? B . A 1 1239 LYS 1239 ? ? ? B . A 1 1240 VAL 1240 ? ? ? B . A 1 1241 ALA 1241 ? ? ? B . A 1 1242 LEU 1242 ? ? ? B . A 1 1243 LEU 1243 ? ? ? B . A 1 1244 TYR 1244 ? ? ? B . A 1 1245 LEU 1245 ? ? ? B . A 1 1246 ASP 1246 ? ? ? B . A 1 1247 ASN 1247 ? ? ? B . A 1 1248 GLU 1248 ? ? ? B . A 1 1249 GLU 1249 ? ? ? B . A 1 1250 GLU 1250 ? ? ? B . A 1 1251 GLU 1251 ? ? ? B . A 1 1252 GLU 1252 ? ? ? B . A 1 1253 GLU 1253 ? ? ? B . A 1 1254 GLU 1254 ? ? ? B . A 1 1255 GLY 1255 ? ? ? B . A 1 1256 GLU 1256 ? ? ? B . A 1 1257 GLY 1257 ? ? ? B . A 1 1258 TRP 1258 ? ? ? B . A 1 1259 PHE 1259 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Keratin, type II cytoskeletal 1 {PDB ID=4zry, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4zry.2.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 4zry, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKD AKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIATYRTLLEGE ; ;ESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKD AKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIATYRTLLEGE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 120 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4zry 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1259 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1259 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1e-18 28.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLSWRLQTGSEKAELQELNARLYDYVCRVRELERENLLLEEELRSRLSREDRWAEDQALYAEEARSLRQQLDELNWSTALAEGERDALRRELLELQREGVEAGTARSRLDAELGAQRRELEEALGARAALEALLGRLETERRDLDAAHERQVRDLRARAASLTMHFRARATSPAAPPPRLRDVHDSYALLVAESWRESVQLYEDEVRELEQALRRGQESRLQAEDEARLCAQEADALRNQALELEQLRARLEDELLRMREEYGMQAEERQRVIDSLEDEKEALTLAMADRLRDYQELLQVKTGLSLEVATYRALLEGESNPEILIWTENIENVPQEPRNTSYRYTNSVLQRKNEKNLFPRRKTPWAAVNHSSASYSNWPGHLDSQTTTAVGSAARRGLLTSRHSSSATTSGQQKPLEKTISSRANLRPVTPTHGFLRNTDAQMKTLPHRSKVEGTGDTHARRATESVITRESYRGHQGHVAAGAVSSTPSNERTVILGKKLEAQATKEQERDRSGVIRIKPEEKMFDSKEKASEERNLRWEELTKLDRDARKRESRHLRDEAREKEALKERSVKEREVPISLEVSRGSRAEVSTIHLQSPGRKDVSHSGGREAETKETRFRLDTQDTASSLQSDSTTETIAESIVTTILKQFTQSPGAEEEATSFPDTKVTYVDRKEFPGDGKTKTEIVVESKLTDVVDVSDEAGLDYLLSKDVKEVGLKGKSTETMIGEMINLGLKGREGRAKVVNVEIVEEPMSYIGGGKIDFSTPFQVEEVDDVSPSPKGFVEEEDGEGETHMAFSMRPHQTKQPQGTIPHVEEVTEAGDSEGEQSYFVSTPDEYPGGHDREDDGSVYGQIHIEEESTIRYSWQDEIAQGTWRRKMRGDVGGEKPVKVLEVPALSLGGAIGSAHLKEEASGELRAEPTVIEKEIKIPHEFHTSIKGVFSSEPRHQLVEVIGQLEETLPERMKEELSALTRQSQGESGSVSVDVKKVQSAAGGSVTLMAEVNLSQTVDADQLDLEQLSRDEAGEIERAVESVVRESLAKRSSPVPRSPDREDGEEVPAGGILFKRWATRELYSPSGERDDAGQVSPSSDQRVTQGPVSATVEVTSPTGFVQSHVLEDVSQSVRHVKLGPTEMWRTEQVTFGGPTAQVVEMDLSDTRAIRSWTRDTGSEVEAHGVSHRGGWRIAHSRDERVASTGSGASPGDAHQAPGEKGTEQAGFDKTVQLQRMVDQRSVASDEKKVALLYLDNEEEEEEEGEGWF 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIATYRTLLEGE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4zry.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 215 215 ? A 50.675 -37.360 -6.101 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 2 C CA . ARG 215 215 ? A 50.592 -36.140 -6.937 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 3 C C . ARG 215 215 ? A 49.475 -35.175 -6.544 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 4 O O . ARG 215 215 ? A 49.704 -34.251 -5.780 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 5 C CB . ARG 215 215 ? A 50.464 -36.571 -8.418 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 6 C CG . ARG 215 215 ? A 51.738 -36.468 -9.276 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 7 C CD . ARG 215 215 ? A 51.362 -36.654 -10.751 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 8 N NE . ARG 215 215 ? A 52.608 -36.578 -11.566 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 9 C CZ . ARG 215 215 ? A 52.605 -36.628 -12.906 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 215 215 ? A 51.468 -36.708 -13.590 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 215 215 ? A 53.752 -36.604 -13.579 1 1 B ARG 0.440 1 ATOM 12 N N . GLY 216 216 ? A 48.227 -35.360 -7.045 1 1 B GLY 0.500 1 ATOM 13 C CA . GLY 216 216 ? A 47.131 -34.412 -6.826 1 1 B GLY 0.500 1 ATOM 14 C C . GLY 216 216 ? A 46.565 -34.381 -5.429 1 1 B GLY 0.500 1 ATOM 15 O O . GLY 216 216 ? A 46.482 -33.336 -4.823 1 1 B GLY 0.500 1 ATOM 16 N N . GLN 217 217 ? A 46.196 -35.551 -4.865 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 17 C CA . GLN 217 217 ? A 45.830 -35.720 -3.470 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 18 C C . GLN 217 217 ? A 46.949 -35.375 -2.513 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 19 O O . GLN 217 217 ? A 46.728 -34.677 -1.536 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 20 C CB . GLN 217 217 ? A 45.331 -37.168 -3.182 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 21 C CG . GLN 217 217 ? A 44.772 -37.371 -1.750 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 22 C CD . GLN 217 217 ? A 43.602 -36.409 -1.536 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 23 O OE1 . GLN 217 217 ? A 42.845 -36.119 -2.463 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 24 N NE2 . GLN 217 217 ? A 43.482 -35.845 -0.312 1 1 B GLN 0.730 1 ATOM 25 N N . GLU 218 218 ? A 48.192 -35.800 -2.808 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 26 C CA . GLU 218 218 ? A 49.371 -35.423 -2.051 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 27 C C . GLU 218 218 ? A 49.619 -33.923 -2.021 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 28 O O . GLU 218 218 ? A 49.975 -33.399 -0.984 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 29 C CB . GLU 218 218 ? A 50.606 -36.122 -2.627 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 30 C CG . GLU 218 218 ? A 50.537 -37.664 -2.499 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 31 C CD . GLU 218 218 ? A 51.647 -38.339 -3.298 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 32 O OE1 . GLU 218 218 ? A 52.276 -37.635 -4.116 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 33 O OE2 . GLU 218 218 ? A 51.863 -39.561 -3.156 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 34 N N . SER 219 219 ? A 49.412 -33.188 -3.138 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 35 C CA . SER 219 219 ? A 49.458 -31.728 -3.218 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 36 C C . SER 219 219 ? A 48.331 -31.051 -2.447 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 37 O O . SER 219 219 ? A 48.550 -30.077 -1.731 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 38 C CB . SER 219 219 ? A 49.494 -31.242 -4.695 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 39 O OG . SER 219 219 ? A 49.697 -29.832 -4.810 1 1 B SER 0.750 1 ATOM 40 N N . ARG 220 220 ? A 47.093 -31.603 -2.520 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 41 C CA . ARG 220 220 ? A 45.966 -31.167 -1.701 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 42 C C . ARG 220 220 ? A 46.271 -31.291 -0.213 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 43 O O . ARG 220 220 ? A 46.106 -30.342 0.540 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 44 C CB . ARG 220 220 ? A 44.664 -31.963 -2.025 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 45 C CG . ARG 220 220 ? A 44.058 -31.678 -3.417 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 46 C CD . ARG 220 220 ? A 42.624 -32.202 -3.599 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 47 N NE . ARG 220 220 ? A 42.670 -33.674 -3.926 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 48 C CZ . ARG 220 220 ? A 42.785 -34.189 -5.156 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 49 N NH1 . ARG 220 220 ? A 42.874 -33.416 -6.231 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 50 N NH2 . ARG 220 220 ? A 42.742 -35.511 -5.299 1 1 B ARG 0.630 1 ATOM 51 N N . LEU 221 221 ? A 46.834 -32.446 0.202 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 52 C CA . LEU 221 221 ? A 47.361 -32.679 1.534 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 53 C C . LEU 221 221 ? A 48.527 -31.764 1.884 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 54 O O . LEU 221 221 ? A 48.533 -31.141 2.943 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 55 C CB . LEU 221 221 ? A 47.759 -34.174 1.670 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 56 C CG . LEU 221 221 ? A 46.540 -35.125 1.701 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 57 C CD1 . LEU 221 221 ? A 46.994 -36.596 1.648 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 58 C CD2 . LEU 221 221 ? A 45.650 -34.865 2.932 1 1 B LEU 0.720 1 ATOM 59 N N . GLN 222 222 ? A 49.488 -31.572 0.951 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 60 C CA . GLN 222 222 ? A 50.703 -30.790 1.115 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 61 C C . GLN 222 222 ? A 50.414 -29.344 1.459 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 62 O O . GLN 222 222 ? A 51.203 -28.692 2.125 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 63 C CB . GLN 222 222 ? A 51.602 -30.832 -0.164 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 64 C CG . GLN 222 222 ? A 53.029 -30.226 -0.056 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 65 C CD . GLN 222 222 ? A 53.890 -31.014 0.930 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 66 O OE1 . GLN 222 222 ? A 53.929 -32.243 0.891 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 67 N NE2 . GLN 222 222 ? A 54.619 -30.314 1.828 1 1 B GLN 0.720 1 ATOM 68 N N . ALA 223 223 ? A 49.269 -28.796 1.009 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 69 C CA . ALA 223 223 ? A 48.872 -27.447 1.318 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 70 C C . ALA 223 223 ? A 48.132 -27.307 2.657 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 71 O O . ALA 223 223 ? A 48.108 -26.230 3.253 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 72 C CB . ALA 223 223 ? A 47.980 -26.973 0.156 1 1 B ALA 0.770 1 ATOM 73 N N . GLU 224 224 ? A 47.542 -28.393 3.204 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 74 C CA . GLU 224 224 ? A 46.765 -28.320 4.427 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 75 C C . GLU 224 224 ? A 47.613 -28.630 5.651 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 76 O O . GLU 224 224 ? A 47.316 -28.172 6.755 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 77 C CB . GLU 224 224 ? A 45.531 -29.246 4.341 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 78 C CG . GLU 224 224 ? A 44.518 -28.809 3.247 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 79 C CD . GLU 224 224 ? A 43.299 -29.728 3.159 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 80 O OE1 . GLU 224 224 ? A 42.442 -29.460 2.276 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 81 O OE2 . GLU 224 224 ? A 43.205 -30.689 3.965 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 82 N N . ASP 225 225 ? A 48.776 -29.305 5.487 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 83 C CA . ASP 225 225 ? A 49.775 -29.395 6.536 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 84 C C . ASP 225 225 ? A 50.361 -28.036 6.883 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 85 O O . ASP 225 225 ? A 50.562 -27.717 8.058 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 86 C CB . ASP 225 225 ? A 50.885 -30.426 6.212 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 87 C CG . ASP 225 225 ? A 50.276 -31.814 6.325 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 88 O OD1 . ASP 225 225 ? A 50.430 -32.666 5.427 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 89 O OD2 . ASP 225 225 ? A 49.606 -32.049 7.357 1 1 B ASP 0.720 1 ATOM 90 N N . GLU 226 226 ? A 50.561 -27.191 5.848 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 91 C CA . GLU 226 226 ? A 51.130 -25.861 5.920 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 92 C C . GLU 226 226 ? A 50.255 -24.880 6.681 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 93 O O . GLU 226 226 ? A 50.733 -23.915 7.264 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 94 C CB . GLU 226 226 ? A 51.373 -25.297 4.496 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 95 C CG . GLU 226 226 ? A 52.363 -26.130 3.642 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 96 C CD . GLU 226 226 ? A 53.795 -26.152 4.170 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 97 O OE1 . GLU 226 226 ? A 54.198 -25.173 4.844 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 98 O OE2 . GLU 226 226 ? A 54.498 -27.155 3.875 1 1 B GLU 0.700 1 ATOM 99 N N . ALA 227 227 ? 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ALA 241 241 ? A 53.701 -10.855 22.683 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 209 O O . ALA 241 241 ? A 54.278 -9.928 23.246 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 210 C CB . ALA 241 241 ? A 53.840 -11.354 20.201 1 1 B ALA 0.800 1 ATOM 211 N N . LEU 242 242 ? A 52.479 -11.288 23.071 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 212 C CA . LEU 242 242 ? A 51.736 -10.751 24.195 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 213 C C . LEU 242 242 ? A 52.468 -10.909 25.508 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 214 O O . LEU 242 242 ? A 52.511 -9.980 26.310 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 215 C CB . LEU 242 242 ? A 50.362 -11.448 24.328 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 216 C CG . LEU 242 242 ? A 49.408 -11.186 23.146 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 217 C CD1 . LEU 242 242 ? A 48.154 -12.068 23.283 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 218 C CD2 . LEU 242 242 ? A 49.047 -9.696 22.997 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 219 N N . GLU 243 243 ? A 53.105 -12.076 25.762 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 220 C CA . GLU 243 243 ? A 53.908 -12.252 26.952 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 221 C C . GLU 243 243 ? A 55.092 -11.293 27.003 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 222 O O . GLU 243 243 ? A 55.272 -10.575 27.980 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 223 C CB . GLU 243 243 ? A 54.411 -13.705 27.093 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 224 C CG . GLU 243 243 ? A 55.160 -13.949 28.427 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 225 C CD . GLU 243 243 ? A 55.636 -15.384 28.622 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 226 O OE1 . GLU 243 243 ? A 55.407 -16.231 27.729 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 227 O OE2 . GLU 243 243 ? A 56.260 -15.615 29.691 1 1 B GLU 0.770 1 ATOM 228 N N . LEU 244 244 ? A 55.889 -11.161 25.926 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 229 C CA . LEU 244 244 ? A 57.036 -10.268 25.909 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 230 C C . LEU 244 244 ? A 56.721 -8.788 26.124 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 231 O O . LEU 244 244 ? A 57.412 -8.088 26.864 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 232 C CB . LEU 244 244 ? A 57.796 -10.409 24.578 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 233 C CG . LEU 244 244 ? A 59.060 -9.523 24.463 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 234 C CD1 . LEU 244 244 ? A 60.132 -9.861 25.521 1 1 B LEU 0.770 1 ATOM 235 C CD2 . LEU 244 244 ? 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A 104.338 46.791 106.938 1 1 B GLU 0.530 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.701 2 1 3 0.037 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 215 ARG 1 0.440 2 1 A 216 GLY 1 0.500 3 1 A 217 GLN 1 0.730 4 1 A 218 GLU 1 0.690 5 1 A 219 SER 1 0.750 6 1 A 220 ARG 1 0.630 7 1 A 221 LEU 1 0.720 8 1 A 222 GLN 1 0.720 9 1 A 223 ALA 1 0.770 10 1 A 224 GLU 1 0.700 11 1 A 225 ASP 1 0.720 12 1 A 226 GLU 1 0.700 13 1 A 227 ALA 1 0.790 14 1 A 228 ARG 1 0.670 15 1 A 229 LEU 1 0.700 16 1 A 230 CYS 1 0.710 17 1 A 231 ALA 1 0.790 18 1 A 232 GLN 1 0.740 19 1 A 233 GLU 1 0.740 20 1 A 234 ALA 1 0.810 21 1 A 235 ASP 1 0.770 22 1 A 236 ALA 1 0.840 23 1 A 237 LEU 1 0.760 24 1 A 238 ARG 1 0.710 25 1 A 239 ASN 1 0.780 26 1 A 240 GLN 1 0.770 27 1 A 241 ALA 1 0.800 28 1 A 242 LEU 1 0.770 29 1 A 243 GLU 1 0.770 30 1 A 244 LEU 1 0.770 31 1 A 245 GLU 1 0.750 32 1 A 246 GLN 1 0.750 33 1 A 247 LEU 1 0.790 34 1 A 248 ARG 1 0.710 35 1 A 249 ALA 1 0.810 36 1 A 250 ARG 1 0.750 37 1 A 251 LEU 1 0.780 38 1 A 252 GLU 1 0.750 39 1 A 253 ASP 1 0.770 40 1 A 254 GLU 1 0.740 41 1 A 255 LEU 1 0.750 42 1 A 256 LEU 1 0.740 43 1 A 257 ARG 1 0.710 44 1 A 258 MET 1 0.700 45 1 A 259 ARG 1 0.680 46 1 A 260 GLU 1 0.720 47 1 A 261 GLU 1 0.720 48 1 A 262 TYR 1 0.720 49 1 A 263 GLY 1 0.770 50 1 A 264 MET 1 0.730 51 1 A 265 GLN 1 0.730 52 1 A 266 ALA 1 0.800 53 1 A 267 GLU 1 0.740 54 1 A 268 GLU 1 0.730 55 1 A 269 ARG 1 0.700 56 1 A 270 GLN 1 0.730 57 1 A 271 ARG 1 0.700 58 1 A 272 VAL 1 0.720 59 1 A 273 ILE 1 0.710 60 1 A 274 ASP 1 0.750 61 1 A 275 SER 1 0.750 62 1 A 276 LEU 1 0.710 63 1 A 277 GLU 1 0.730 64 1 A 278 ASP 1 0.740 65 1 A 279 GLU 1 0.710 66 1 A 280 LYS 1 0.720 67 1 A 281 GLU 1 0.700 68 1 A 282 ALA 1 0.720 69 1 A 283 LEU 1 0.670 70 1 A 284 THR 1 0.670 71 1 A 285 LEU 1 0.650 72 1 A 286 ALA 1 0.710 73 1 A 287 MET 1 0.640 74 1 A 288 ALA 1 0.700 75 1 A 289 ASP 1 0.680 76 1 A 290 ARG 1 0.640 77 1 A 291 LEU 1 0.660 78 1 A 292 ARG 1 0.640 79 1 A 293 ASP 1 0.650 80 1 A 294 TYR 1 0.610 81 1 A 295 GLN 1 0.620 82 1 A 296 GLU 1 0.630 83 1 A 297 LEU 1 0.620 84 1 A 298 LEU 1 0.620 85 1 A 299 GLN 1 0.610 86 1 A 300 VAL 1 0.640 87 1 A 301 LYS 1 0.630 88 1 A 302 THR 1 0.640 89 1 A 303 GLY 1 0.660 90 1 A 304 LEU 1 0.650 91 1 A 305 SER 1 0.650 92 1 A 306 LEU 1 0.650 93 1 A 307 GLU 1 0.650 94 1 A 308 VAL 1 0.660 95 1 A 309 ALA 1 0.690 96 1 A 310 THR 1 0.660 97 1 A 311 TYR 1 0.670 98 1 A 312 ARG 1 0.660 99 1 A 313 ALA 1 0.680 100 1 A 314 LEU 1 0.640 101 1 A 315 LEU 1 0.630 102 1 A 316 GLU 1 0.600 103 1 A 317 GLY 1 0.580 104 1 A 318 GLU 1 0.530 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #