data_SMR-dcd2931991b8e84a35e69995ca582765_1 _entry.id SMR-dcd2931991b8e84a35e69995ca582765_1 _struct.entry_id SMR-dcd2931991b8e84a35e69995ca582765_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9ULD9/ ZN608_HUMAN, Zinc finger protein 608 Estimated model accuracy of this model is 0.008, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9ULD9' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 189672.317 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZN608_HUMAN Q9ULD9 1 ;MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSSSNSKDCGGPAS SGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLPSAALYGIPEISSTGKRQEVQ GRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAGAGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKS RKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGAKSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSM LVKKEEEEEESHRRIKKLKTEKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSV GVNTCEVGVVTEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCE SPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRRTPPNCAAEDI KASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPETTFLDQGCSSPVLIDCPHPNC NKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEEGLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGA GNPPGTPKGKRELMSNGPGSIIGAKAGKNSGKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKL EAEGLIDKKNLGDKEKGKKATNCKTDKNLSKLKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGLPS LTTTVVQATPKSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETGSPKMDAKLGKLE DSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYTFTDNAPSPSIGSASRLECSTLV NGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADDGGSDSRSEGMRSKASSPSDIISSKDSVVKGHS STTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSPSYMHPGQVGAPAAGNSGSTQGMKIKKESEEDAEKKDKAEQLDSK KVDHNSASLQPQHQSVITQRHPALAQSLYYGQYAYGLYMDQKSLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAEQKMA QTGRGDCERKSELPLKELGKEETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQ QQLQADSFKAKQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEEL DREKKLKEDSPRKTPNKESGVPSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQSMEESKLKNDDRKTPVNWKDSRGTRV AVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSPGFHYPVYGKMSGREETEKVN TSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAEREREAERERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGM GYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQASASGMFPGQRRE ; 'Zinc finger protein 608' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1512 1 1512 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZN608_HUMAN Q9ULD9 . 1 1512 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 46A41B939FEBD054 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSSSNSKDCGGPAS SGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLPSAALYGIPEISSTGKRQEVQ GRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAGAGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKS RKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGAKSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSM LVKKEEEEEESHRRIKKLKTEKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSV GVNTCEVGVVTEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCE SPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRRTPPNCAAEDI KASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPETTFLDQGCSSPVLIDCPHPNC NKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEEGLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGA 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SGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLPSAALYGIPEISSTGKRQEVQ GRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAGAGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKS RKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGAKSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSM LVKKEEEEEESHRRIKKLKTEKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSV GVNTCEVGVVTEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCE SPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRRTPPNCAAEDI KASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPETTFLDQGCSSPVLIDCPHPNC NKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEEGLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGA GNPPGTPKGKRELMSNGPGSIIGAKAGKNSGKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKL EAEGLIDKKNLGDKEKGKKATNCKTDKNLSKLKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGLPS LTTTVVQATPKSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETGSPKMDAKLGKLE DSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYTFTDNAPSPSIGSASRLECSTLV NGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADDGGSDSRSEGMRSKASSPSDIISSKDSVVKGHS STTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSPSYMHPGQVGAPAAGNSGSTQGMKIKKESEEDAEKKDKAEQLDSK KVDHNSASLQPQHQSVITQRHPALAQSLYYGQYAYGLYMDQKSLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAEQKMA QTGRGDCERKSELPLKELGKEETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQ QQLQADSFKAKQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEEL DREKKLKEDSPRKTPNKESGVPSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQSMEESKLKNDDRKTPVNWKDSRGTRV AVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSPGFHYPVYGKMSGREETEKVN TSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAEREREAERERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGM GYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQASASGMFPGQRRE ; # # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id _pdbx_entity_nonpoly.ma_model_mode 2 'ZINC ION' ZN implicit # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 VAL . 1 4 ASN . 1 5 ILE . 1 6 SER . 1 7 THR . 1 8 ALA . 1 9 GLY . 1 10 LYS . 1 11 GLY . 1 12 VAL . 1 13 ASP . 1 14 PRO . 1 15 ASN . 1 16 THR . 1 17 VAL . 1 18 ASP . 1 19 THR . 1 20 TYR . 1 21 ASP . 1 22 SER . 1 23 GLY . 1 24 ASP . 1 25 ASP . 1 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B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Early endosome antigen 1 {PDB ID=3mjh, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=3mjh.2.B}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=3mjh, label_asym_id=J, auth_asym_id=D, SMTL ID=3mjh.2._.3}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 3mjh, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-02-26 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 2 1 D 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B J 5 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 SSSEGFICPQCMKSLGSADELFKHYEAVHDAGND SSSEGFICPQCMKSLGSADELFKHYEAVHDAGND # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 32 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3mjh 2024-02-21 2 PDB . 3mjh 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1512 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 1512 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.310 25.926 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSVNISTAGKGVDPNTVDTYDSGDDWEIGVGNLIIDLDADLEKDRQKFEMNNSTTTTSSSNSKDCGGPASSGAGATAALADGLKFASVQASAPQGNSHKETSKSKVKRSKTSKDANKSLPSAALYGIPEISSTGKRQEVQGRPGEATGMNSALGQSVSSGGSGNPNSNSTSTSTSAATAGAGSCGKSKEEKPGKSQSSRGAKRDKDAGKSRKDKHDLLQGHQNGSGSQAPSGGHLYGFGAKSNGGGASPFHCGGTGSGSVAAAGEVSKSAPDSGLMGNSMLVKKEEEEEESHRRIKKLKTEKVDPLFTVPAPPPPISSSLTPQILPSYFSPSSSNIAAPVEQLLVRTRSVGVNTCEVGVVTEPECLGPCEPGTSVNLEGIVWHETEEGVLVVNVTWRNKTYVGTLLDCTKHDWAPPRFCESPTSDLEMRGGRGRGKRARSAAAAPGSEASFTESRGLQNKNRGGANGKGRRGSLNASGRRTPPNCAAEDIKASPSSTNKRKNKPPMELDLNSSSEDNKPGKRVRTNSRSTPTTPQGKPETTFLDQGCSSPVLIDCPHPNCNKKYKHINGLRYHQAHAHLDPENKLEFEPDSEDKISDCEEGLSNVALECSEPSTSVSAYDQLKAPASPGAGNPPGTPKGKRELMSNGPGSIIGAKAGKNSGKKKGLNNELNNLPVISNMTAALDSCSAADGSLAAEMPKLEAEGLIDKKNLGDKEKGKKATNCKTDKNLSKLKSARPIAPAPAPTPPQLIAIPTATFTTTTTGTIPGLPSLTTTVVQATPKSPPLKPIQPKPTIMGEPITVNPALVSLKDKKKKEKRKLKDKEGKETGSPKMDAKLGKLEDSKGASKDLPGHFLKDHLNKNEGLANGLSESQESRMASIKAEADKVYTFTDNAPSPSIGSASRLECSTLVNGQAPMAPLHVLTQNGAESSAAKTSSPAYSDISDAADDGGSDSRSEGMRSKASSPSDIISSKDSVVKGHSSTTAQSSQLKESHSPYYHSYDPYYSPSYMHPGQVGAPAAGNSGSTQGMKIKKESEEDAEKKDKAEQLDSKKVDHNSASLQPQHQSVITQRHPALAQSLYYGQYAYGLYMDQKSLMATSPAYRQQYEKYYEDQRLAEQKMAQTGRGDCERKSELPLKELGKEETKQKNMPSATISKAPSTPEPNKNHSKLGPSVPNKTEETGKSQLLSNHQQQLQADSFKAKQMENHQLIKEAVEMKSVMDSMKQTGVDPTSRFKQDPDSRTWHHYVYQPKYLDQQKSEELDREKKLKEDSPRKTPNKESGVPSLPVSLTSIKEEPKEAKHPDSQSMEESKLKNDDRKTPVNWKDSRGTRVAVSSPMSQHQSYIQYLHAYPYPQMYDPSHPAYRAVSPVLMHSYPGAYLSPGFHYPVYGKMSGREETEKVNTSPSVNTKTTTESKALDLLQQHANQYRSKSPAPVEKATAEREREAERERDRHSPFGQRHLHTHHHTHVGMGYPLIPGQYDPFQGLTSAALVASQQVAAQASASGMFPGQRRE 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FICPQ--CMKSLGSADELFKHYEAVHDAG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3mjh.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ILE 553 553 ? A 18.509 12.838 14.228 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 2 C CA . ILE 553 553 ? A 17.689 11.694 13.755 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 3 C C . ILE 553 553 ? A 18.104 10.424 14.490 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 4 O O . ILE 553 553 ? A 18.933 9.645 14.045 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 5 C CB . ILE 553 553 ? A 17.808 11.747 12.231 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 6 C CG1 . ILE 553 553 ? A 16.876 12.829 11.648 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 7 C CG2 . ILE 553 553 ? A 17.327 10.476 11.565 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 8 C CD1 . ILE 553 553 ? A 17.482 14.209 11.423 1 1 B ILE 0.490 1 ATOM 9 N N . ASP 554 554 ? A 17.549 10.242 15.705 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 10 C CA . ASP 554 554 ? A 17.803 9.141 16.595 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 11 C C . ASP 554 554 ? A 16.488 8.361 16.600 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 12 O O . ASP 554 554 ? A 15.405 8.946 16.538 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 13 C CB . ASP 554 554 ? A 18.236 9.748 17.966 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 14 C CG . ASP 554 554 ? A 18.763 8.716 18.952 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 15 O OD1 . ASP 554 554 ? A 18.193 7.608 19.008 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 16 O OD2 . ASP 554 554 ? A 19.767 9.049 19.635 1 1 B ASP 0.510 1 ATOM 17 N N . CYS 555 555 ? A 16.562 7.019 16.548 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 18 C CA . CYS 555 555 ? A 15.414 6.152 16.655 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 19 C C . CYS 555 555 ? A 15.010 5.991 18.114 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 20 O O . CYS 555 555 ? A 15.811 5.442 18.855 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 21 C CB . CYS 555 555 ? A 15.730 4.739 16.090 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 22 S SG . CYS 555 555 ? A 14.313 3.580 16.193 1 1 B CYS 0.780 1 ATOM 23 N N . PRO 556 556 ? A 13.788 6.311 18.563 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 24 C CA . PRO 556 556 ? A 13.396 6.324 19.971 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 25 C C . PRO 556 556 ? A 13.103 4.932 20.507 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 26 O O . PRO 556 556 ? A 12.425 4.794 21.521 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 27 C CB . PRO 556 556 ? A 12.097 7.162 19.966 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 28 C CG . PRO 556 556 ? A 11.475 6.904 18.593 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 29 C CD . PRO 556 556 ? A 12.678 6.651 17.693 1 1 B PRO 0.700 1 ATOM 30 N N . HIS 557 557 ? A 13.627 3.871 19.865 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 31 C CA . HIS 557 557 ? A 13.646 2.531 20.428 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 32 C C . HIS 557 557 ? A 14.521 2.509 21.689 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 33 O O . HIS 557 557 ? A 15.733 2.681 21.553 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 34 C CB . HIS 557 557 ? A 14.251 1.469 19.481 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 35 C CG . HIS 557 557 ? A 14.235 0.038 19.970 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 36 N ND1 . HIS 557 557 ? A 15.105 -0.365 20.953 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 37 C CD2 . HIS 557 557 ? A 13.599 -1.042 19.464 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 38 C CE1 . HIS 557 557 ? A 14.996 -1.673 21.013 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 39 N NE2 . HIS 557 557 ? A 14.093 -2.146 20.124 1 1 B HIS 0.510 1 ATOM 40 N N . PRO 558 558 ? A 13.988 2.269 22.879 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 41 C CA . PRO 558 558 ? A 14.627 2.574 24.159 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 42 C C . PRO 558 558 ? A 15.888 1.777 24.457 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 43 O O . PRO 558 558 ? A 16.725 2.246 25.224 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 44 C CB . PRO 558 558 ? A 13.508 2.330 25.196 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 45 C CG . PRO 558 558 ? A 12.483 1.429 24.498 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 46 C CD . PRO 558 558 ? A 12.622 1.790 23.031 1 1 B PRO 0.490 1 ATOM 47 N N . ASN 559 559 ? A 16.017 0.570 23.877 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 48 C CA . ASN 559 559 ? A 17.096 -0.373 24.090 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 49 C C . ASN 559 559 ? A 18.041 -0.395 22.873 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 50 O O . ASN 559 559 ? A 18.947 -1.222 22.802 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 51 C CB . ASN 559 559 ? A 16.519 -1.806 24.295 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 52 C CG . ASN 559 559 ? A 15.695 -1.964 25.575 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 53 O OD1 . ASN 559 559 ? A 16.070 -1.545 26.667 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 54 N ND2 . ASN 559 559 ? A 14.543 -2.672 25.459 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 55 N N . CYS 560 560 ? A 17.855 0.515 21.883 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 56 C CA . CYS 560 560 ? A 18.687 0.607 20.693 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 57 C C . CYS 560 560 ? A 19.195 2.035 20.546 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 58 O O . CYS 560 560 ? A 20.402 2.247 20.584 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 59 C CB . CYS 560 560 ? A 17.990 0.143 19.361 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 60 S SG . CYS 560 560 ? A 17.978 -1.655 19.030 1 1 B CYS 0.460 1 ATOM 61 N N . ASN 561 561 ? A 18.314 3.046 20.331 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 62 C CA . ASN 561 561 ? A 18.693 4.455 20.164 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 63 C C . ASN 561 561 ? A 19.755 4.674 19.078 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 64 O O . ASN 561 561 ? A 20.722 5.417 19.200 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 65 C CB . ASN 561 561 ? A 19.079 5.139 21.501 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 66 C CG . ASN 561 561 ? A 17.943 5.060 22.520 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 67 O OD1 . ASN 561 561 ? A 16.819 5.518 22.315 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 68 N ND2 . ASN 561 561 ? A 18.239 4.456 23.698 1 1 B ASN 0.660 1 ATOM 69 N N . LYS 562 562 ? A 19.601 3.943 17.951 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 70 C CA . LYS 562 562 ? A 20.451 4.113 16.793 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 71 C C . LYS 562 562 ? A 20.248 5.422 16.046 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 72 O O . LYS 562 562 ? A 19.140 5.789 15.670 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 73 C CB . LYS 562 562 ? A 20.272 2.971 15.776 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 74 C CG . LYS 562 562 ? A 20.714 1.593 16.278 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 75 C CD . LYS 562 562 ? A 20.513 0.541 15.176 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 76 C CE . LYS 562 562 ? A 20.903 -0.886 15.550 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 77 N NZ . LYS 562 562 ? A 20.671 -1.776 14.386 1 1 B LYS 0.710 1 ATOM 78 N N . LYS 563 563 ? A 21.369 6.115 15.759 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 79 C CA . LYS 563 563 ? A 21.373 7.426 15.166 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 80 C C . LYS 563 563 ? A 21.689 7.307 13.699 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 81 O O . LYS 563 563 ? A 22.619 6.616 13.290 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 82 C CB . LYS 563 563 ? A 22.415 8.347 15.846 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 83 C CG . LYS 563 563 ? A 22.057 8.622 17.311 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 84 C CD . LYS 563 563 ? A 23.045 9.565 18.010 1 1 B LYS 0.720 1 ATOM 85 C CE . LYS 563 563 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #