data_SMR-d39e40cce2e8f0e6bc229269c754f09a_4 _entry.id SMR-d39e40cce2e8f0e6bc229269c754f09a_4 _struct.entry_id SMR-d39e40cce2e8f0e6bc229269c754f09a_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9QZQ1 (isoform 2)/ AFAD_MOUSE, Afadin Estimated model accuracy of this model is 0.016, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9QZQ1 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 237346.624 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFAD_MOUSE Q9QZQ1 1 ;MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQD VIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPAKKA QSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKKEKEALRQASDKEERPSQGDDSENSRLAAEVYKDMPETS FTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDTADFAVAE SLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDY IPKKMKKHVEGKSLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVELSPDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDD NSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQD HVLSKRSVDGGLMVKGPRHKPGAVQETTFELGGDVHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPM IRLDQEQEYRRRENRTQDATGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYV LSSQHRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLSRITLDA QDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLRRCRVNAALTIQ LFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAADCHLSRIVQATTLLTM DKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVAVAENTADELARSDGRDVQLEE DPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLVPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLMRENA ELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRS LVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNS AQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKGPYTSGTAAKITSVSTGNL CTEEQSPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPPQSQWPNYEEKPHVHTESNHSSIAIQRVTRS QEELREEKVYQLERHRVEAGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKT PAAVLPTPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYTSEFDGIPMDLPLPPPPANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQ RWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASFSPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQP RTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAEESDRL RKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARMQDEERRRQQQLEEMRKREAEDR VRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHEEAARRLLEPEEPGLSRPPLPRDYEPPSL SSAPCAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYDEEEEDYGPAGPNSYSGSAGTAVGAYDAPREARE KLTRSQDADLPGSSGAPENLTFKERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK ; Afadin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1805 1 1805 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFAD_MOUSE Q9QZQ1 Q9QZQ1-2 1 1805 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-07-10 5987A16BA9F28C2E # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQD VIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPAKKA QSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKKEKEALRQASDKEERPSQGDDSENSRLAAEVYKDMPETS FTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDTADFAVAE SLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDY IPKKMKKHVEGKSLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVELSPDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDD NSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQD HVLSKRSVDGGLMVKGPRHKPGAVQETTFELGGDVHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPM IRLDQEQEYRRRENRTQDATGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYV 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KLTRSQDADLPGSSGAPENLTFKERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 ALA . 1 4 GLY . 1 5 GLY . 1 6 ARG . 1 7 ASP . 1 8 GLU . 1 9 GLU . 1 10 ARG . 1 11 ARG . 1 12 LYS . 1 13 LEU . 1 14 ALA . 1 15 ASP . 1 16 ILE . 1 17 ILE . 1 18 HIS . 1 19 HIS . 1 20 TRP . 1 21 ASN . 1 22 ALA . 1 23 ASN . 1 24 ARG . 1 25 LEU . 1 26 ASP . 1 27 LEU . 1 28 PHE . 1 29 GLU . 1 30 ILE . 1 31 SER . 1 32 GLN . 1 33 PRO . 1 34 THR . 1 35 GLU . 1 36 ASP . 1 37 LEU . 1 38 GLU . 1 39 PHE . 1 40 HIS . 1 41 GLY . 1 42 VAL . 1 43 MET . 1 44 ARG . 1 45 PHE . 1 46 TYR . 1 47 PHE . 1 48 GLN . 1 49 ASP . 1 50 LYS . 1 51 ALA . 1 52 ALA . 1 53 GLY . 1 54 ASN . 1 55 PHE . 1 56 ALA . 1 57 THR . 1 58 LYS . 1 59 CYS . 1 60 ILE . 1 61 ARG . 1 62 VAL . 1 63 SER . 1 64 SER . 1 65 THR . 1 66 ALA . 1 67 THR . 1 68 THR . 1 69 GLN . 1 70 ASP . 1 71 VAL . 1 72 ILE . 1 73 GLU . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 ALA . 1 77 GLU 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A 1 1717 ASP 1717 ? ? ? G . A 1 1718 GLU 1718 ? ? ? G . A 1 1719 GLU 1719 ? ? ? G . A 1 1720 GLU 1720 ? ? ? G . A 1 1721 GLU 1721 ? ? ? G . A 1 1722 ASP 1722 ? ? ? G . A 1 1723 TYR 1723 ? ? ? G . A 1 1724 GLY 1724 ? ? ? G . A 1 1725 PRO 1725 ? ? ? G . A 1 1726 ALA 1726 ? ? ? G . A 1 1727 GLY 1727 ? ? ? G . A 1 1728 PRO 1728 ? ? ? G . A 1 1729 ASN 1729 ? ? ? G . A 1 1730 SER 1730 ? ? ? G . A 1 1731 TYR 1731 ? ? ? G . A 1 1732 SER 1732 ? ? ? G . A 1 1733 GLY 1733 ? ? ? G . A 1 1734 SER 1734 ? ? ? G . A 1 1735 ALA 1735 ? ? ? G . A 1 1736 GLY 1736 ? ? ? G . A 1 1737 THR 1737 ? ? ? G . A 1 1738 ALA 1738 ? ? ? G . A 1 1739 VAL 1739 ? ? ? G . A 1 1740 GLY 1740 ? ? ? G . A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? G . A 1 1742 TYR 1742 ? ? ? G . A 1 1743 ASP 1743 ? ? ? G . A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? G . A 1 1745 PRO 1745 ? ? ? G . A 1 1746 ARG 1746 ? ? ? G . A 1 1747 GLU 1747 ? ? ? G . A 1 1748 ALA 1748 ? ? ? G . A 1 1749 ARG 1749 ? ? ? G . A 1 1750 GLU 1750 ? ? ? G . A 1 1751 LYS 1751 ? ? ? G . A 1 1752 LEU 1752 ? ? ? G . A 1 1753 THR 1753 ? ? ? G . A 1 1754 ARG 1754 ? ? ? G . A 1 1755 SER 1755 ? ? ? G . A 1 1756 GLN 1756 ? ? ? G . A 1 1757 ASP 1757 ? ? ? G . A 1 1758 ALA 1758 ? ? ? G . A 1 1759 ASP 1759 ? ? ? G . A 1 1760 LEU 1760 ? ? ? G . A 1 1761 PRO 1761 ? ? ? G . A 1 1762 GLY 1762 ? ? ? G . A 1 1763 SER 1763 ? ? ? G . A 1 1764 SER 1764 ? ? ? G . A 1 1765 GLY 1765 ? ? ? G . A 1 1766 ALA 1766 ? ? ? G . A 1 1767 PRO 1767 ? ? ? G . A 1 1768 GLU 1768 ? ? ? G . A 1 1769 ASN 1769 ? ? ? G . A 1 1770 LEU 1770 ? ? ? G . A 1 1771 THR 1771 ? ? ? G . A 1 1772 PHE 1772 ? ? ? G . A 1 1773 LYS 1773 ? ? ? G . A 1 1774 GLU 1774 ? ? ? G . A 1 1775 ARG 1775 ? ? ? G . A 1 1776 GLN 1776 ? ? ? G . A 1 1777 ARG 1777 ? ? ? G . A 1 1778 LEU 1778 ? ? ? G . A 1 1779 PHE 1779 ? ? ? G . A 1 1780 SER 1780 ? ? ? G . A 1 1781 GLN 1781 ? ? ? G . A 1 1782 GLY 1782 ? ? ? G . A 1 1783 GLN 1783 ? ? ? G . A 1 1784 ASP 1784 ? ? ? G . A 1 1785 VAL 1785 ? ? ? G . A 1 1786 SER 1786 ? ? ? G . A 1 1787 ASP 1787 ? ? ? G . A 1 1788 LYS 1788 ? ? ? G . A 1 1789 VAL 1789 ? ? ? G . A 1 1790 LYS 1790 ? ? ? G . A 1 1791 ALA 1791 ? ? ? G . A 1 1792 SER 1792 ? ? ? G . A 1 1793 ARG 1793 ? ? ? G . A 1 1794 LYS 1794 ? ? ? G . A 1 1795 LEU 1795 ? ? ? G . A 1 1796 THR 1796 ? ? ? G . A 1 1797 GLU 1797 ? ? ? G . A 1 1798 LEU 1798 ? ? ? G . A 1 1799 GLU 1799 ? ? ? G . A 1 1800 ASN 1800 ? ? ? G . A 1 1801 GLU 1801 ? ? ? G . A 1 1802 LEU 1802 ? ? ? G . A 1 1803 ASN 1803 ? ? ? G . A 1 1804 THR 1804 ? ? ? G . A 1 1805 LYS 1805 ? ? ? G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Afadin {PDB ID=9dva, label_asym_id=G, auth_asym_id=G, SMTL ID=9dva.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 9dva, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-05 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-28 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 3 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGTRELRGSANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASF SPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLE KQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQ RLEAERRAR ; ;SGTRELRGSANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASF SPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLE KQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQ RLEAERRAR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 219 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9dva 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1805 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1805 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.1e-50 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSAGGRDEERRKLADIIHHWNANRLDLFEISQPTEDLEFHGVMRFYFQDKAAGNFATKCIRVSSTATTQDVIETLAEKFRPDMRMLSSPKYSLYEVHVSGERRLDIDEKPLVVQLNWNKDDREGRFVLKNENDAIPAKKAQSNGPEKQEKEGVIQNFKRTLSKKEKKEKKKKEKEALRQASDKEERPSQGDDSENSRLAAEVYKDMPETSFTRTISNPEVVMKRRRQQKLEKRMQEFRSSDGRPDSGGTLRIYADSLKPNIPYKTILLSTTDTADFAVAESLEKYGLEKENPKDYCIARVMLPPGAQHSDERGAKEIILDDDECPLQIFREWPSDKGILVFQLKRRPPDYIPKKMKKHVEGKSLKGKDRADGSGYGSALPPEKLPYLVELSPDGSDSRDKPKLYRLQLSVTEVGTEKFDDNSIQLFGPGIQPHHCDLTNMDGVVTVTPRSMDAETYVDGQRISETTMLQSGMRLQFGTSHVFKFVDPIQDHVLSKRSVDGGLMVKGPRHKPGAVQETTFELGGDVHSGTALPASRSTTRLDSDRVSSASSTAERGMVKPMIRLDQEQEYRRRENRTQDATGPELILPASIEFRESSEDSFLSAIINYTNSSTVHFKLSPTYVLYMACRYVLSSQHRPDISPTERTHKAIAVVNKMVSMMEGVIQKQKNIAGALAFWMANASELLNFIKQDRDLSRITLDAQDVLAHLVQMAFKYLVHCLQSELNNYMPAFLDDPEENSLQRPKIDDVLHTLTGAMSLLRRCRVNAALTIQLFSQLFHFINMWLFNRLVTDPDSGLCSHYWGAIIRQQLGHIEAWAEKQGLELAADCHLSRIVQATTLLTMDKYVPDDIPNINSTCFKLNSLQLQALLQNYHCAPDEPFIPTDLIENVVAVAENTADELARSDGRDVQLEEDPDLQLPFLLPEDGYSCDVVRNIPNGLQEFLDPLCQRGFCRLVPHTRSPGTWTIYFEGADYESHLMRENAELAQPLRKEPEIITVTLKKQNGMGLSIVAAKGAGQDKLGIYVKSVVKGGAADVDGRLAAGDQLLSVDGRSLVGLSQERAAELMTRTSSVVTLEVAKQGAIYHGLATLLNQPSPMMQRISDRRGSGKPRPKSEGFELYNNSAQNGSPESPQMPWTEYSEPKKLPGDDRLMKNRADHRSSPNVANQPPSPGGKGPYTSGTAAKITSVSTGNLCTEEQSPPPRPEAYPIPTQTYTREYFTFPASKSQDRMAPPQSQWPNYEEKPHVHTESNHSSIAIQRVTRSQEELREEKVYQLERHRVEAGMDRKCDSDMWINQSSSVESSTSSQEHLNHSSKSVTPASTLTKSGPGRWKTPAAVLPTPVAVSQPIRTDLPPPPPPPPVHYTSEFDGIPMDLPLPPPPANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASFSPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRARMQDEERRRQQQLEEMRKREAEDRVRQEEDGRHQEEERVKRDAEEKRRQEEGYYSRLEAERRRQHEEAARRLLEPEEPGLSRPPLPRDYEPPSLSSAPCAPPPPPQRNASYLKTQVLSPDSLFTAKFVAYDEEEEDYGPAGPNSYSGSAGTAVGAYDAPREAREKLTRSQDADLPGSSGAPENLTFKERQRLFSQGQDVSDKVKASRKLTELENELNTK 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ANQAGPQSAQVAAAEWKKREEHQRWYEKEKARLEEERERKRREQERKLGQMRSQTLNPASFSPLATQAKPEKPSTLQRPQETVIRELQPQQQPRTIERKDLQYITISKEELSSGDSLSPDPWKRDAREKLEKQQQMHIVDMLSKEIHELQNKVDRTAEESDRLRKLMLEWQFQKRLQESKQKDEDDDEEEDDDVDTMLIMQRLEAERRAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9dva.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 234.189 232.784 261.464 1 1 G LEU 0.260 1 ATOM 15 N N . SER 1495 1495 ? A 233.461 233.705 256.432 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 16 C CA . SER 1495 1495 ? A 232.760 233.160 255.298 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 17 C C . SER 1495 1495 ? A 233.458 233.693 254.043 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 18 O O . SER 1495 1495 ? A 234.205 234.675 254.138 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 19 C CB . SER 1495 1495 ? A 231.263 233.571 255.343 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 20 O OG . SER 1495 1495 ? A 231.121 234.979 255.558 1 1 G SER 0.470 1 ATOM 21 N N . PRO 1496 1496 ? A 233.304 233.061 252.873 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 22 C CA . PRO 1496 1496 ? A 233.704 233.606 251.568 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 23 C C . PRO 1496 1496 ? A 233.126 234.978 251.239 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 24 O O . PRO 1496 1496 ? A 231.901 235.136 251.216 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 25 C CB . PRO 1496 1496 ? A 233.235 232.541 250.556 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 26 C CG . PRO 1496 1496 ? A 233.135 231.236 251.349 1 1 G PRO 0.660 1 ATOM 27 C CD . PRO 1496 1496 ? 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A 224.001 251.507 218.137 1 1 G ASP 0.360 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.572 2 1 3 0.016 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1493 SER 1 0.360 2 1 A 1494 LEU 1 0.260 3 1 A 1495 SER 1 0.470 4 1 A 1496 PRO 1 0.660 5 1 A 1497 ASP 1 0.600 6 1 A 1498 PRO 1 0.650 7 1 A 1499 TRP 1 0.530 8 1 A 1500 LYS 1 0.600 9 1 A 1501 ARG 1 0.620 10 1 A 1502 ASP 1 0.620 11 1 A 1503 ALA 1 0.540 12 1 A 1504 ARG 1 0.430 13 1 A 1505 GLU 1 0.450 14 1 A 1506 LYS 1 0.420 15 1 A 1507 LEU 1 0.450 16 1 A 1508 GLU 1 0.430 17 1 A 1509 LYS 1 0.470 18 1 A 1510 GLN 1 0.440 19 1 A 1511 GLN 1 0.430 20 1 A 1512 GLN 1 0.490 21 1 A 1513 MET 1 0.580 22 1 A 1514 HIS 1 0.600 23 1 A 1515 ILE 1 0.590 24 1 A 1516 VAL 1 0.620 25 1 A 1517 ASP 1 0.630 26 1 A 1518 MET 1 0.620 27 1 A 1519 LEU 1 0.700 28 1 A 1520 SER 1 0.640 29 1 A 1521 LYS 1 0.600 30 1 A 1522 GLU 1 0.640 31 1 A 1523 ILE 1 0.760 32 1 A 1524 HIS 1 0.770 33 1 A 1525 GLU 1 0.690 34 1 A 1526 LEU 1 0.740 35 1 A 1527 GLN 1 0.660 36 1 A 1528 ASN 1 0.740 37 1 A 1529 LYS 1 0.610 38 1 A 1530 VAL 1 0.570 39 1 A 1531 ASP 1 0.590 40 1 A 1532 ARG 1 0.540 41 1 A 1533 THR 1 0.630 42 1 A 1534 ALA 1 0.610 43 1 A 1535 GLU 1 0.630 44 1 A 1536 GLU 1 0.640 45 1 A 1537 SER 1 0.610 46 1 A 1538 ASP 1 0.650 47 1 A 1539 ARG 1 0.600 48 1 A 1540 LEU 1 0.710 49 1 A 1541 ARG 1 0.550 50 1 A 1542 LYS 1 0.610 51 1 A 1543 LEU 1 0.720 52 1 A 1544 MET 1 0.680 53 1 A 1545 LEU 1 0.620 54 1 A 1546 GLU 1 0.520 55 1 A 1547 TRP 1 0.550 56 1 A 1548 GLN 1 0.480 57 1 A 1549 PHE 1 0.500 58 1 A 1550 GLN 1 0.490 59 1 A 1551 LYS 1 0.480 60 1 A 1552 ARG 1 0.400 61 1 A 1553 LEU 1 0.560 62 1 A 1554 GLN 1 0.520 63 1 A 1555 GLU 1 0.530 64 1 A 1556 SER 1 0.560 65 1 A 1557 LYS 1 0.620 66 1 A 1558 GLN 1 0.600 67 1 A 1559 LYS 1 0.650 68 1 A 1560 ASP 1 0.670 69 1 A 1561 GLU 1 0.630 70 1 A 1562 ASP 1 0.440 71 1 A 1563 ASP 1 0.360 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #