data_SMR-d8474b86e87b775ed37f98ecf0b46201_7 _entry.id SMR-d8474b86e87b775ed37f98ecf0b46201_7 _struct.entry_id SMR-d8474b86e87b775ed37f98ecf0b46201_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9WUJ3/ MYOME_RAT, Myomegalin Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9WUJ3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 304233.402 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP MYOME_RAT Q9WUJ3 1 ;MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEVSREDVYKRNIELKVEVESLKRELQDRKQHLH KTWADEEDLNSQNEAELRRQVEEPQQETEHVYELLDNNIQLLQEESRFAKDEATQMETLVEAEKGCNLEL SERWKDATKNREDAPGDQVKLDQYSAALAQRDRRIEELRQSLAAQEGLVEQLSREKQQLLHLLEEPGGME VQPMPKGLPTQQKPDLNETPTTQPSVSDSHLAELQDKIQQTEVTNKILQEKLNDMSCELRSAQESSQKQD TTIQSLKEMLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLPEMLHQSQLGQLQSSEGIAPAQQQVALLDLQSALFC SQLEIQKLQRLLRQKERQLADGKRCMQFVEAAAQEREQQKEAAWKHNQELRKALQHLQGELHSKSQQLHV LEAEKYNEIRTQGQNIQHLSHSLSHKEQLIQELQELLQYRDTTDKTLDTNEVFLEKLRQRIQDRAVALER VIDEKFSALEEKDKELRQLRLAVRDRDHDLERLRCVLSANEATMQSMESLLRARGLEVEQLIATCQNLQW LKEELETKFGHWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLHKLGPGQSEVAEELCQRLQRKERVLQDL LSDRNKQAMEHEMEVQGLLQSMGTREQERQAVAEKMVQAFMERNSELQALRQYLGGKELMAASQAFISNQ PAGATSVGPHHGEQTDQGSTQMPSRDDSTSLTAREEASIPRSTLGDSDTVAGLEKELSNAKEELELMAKK ERESQIELSALQSMMAVQEEELQVQAADLESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDMPAMERLTQEVLLLR EKVASVEPQGQEGSENRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAQPETFERDRTLQVELE GAQVLRSRLEEVLGRSLERLSRLETLAAIGGATAGDETEDTSTQFTDSIEEEAAHNSHQQLIKVSLEKSL TTMETQNTCLQPPSPVGEDGNRHLQEEMLHLRAEIHQPLEEKRKAEAELKELKAQIEEAGFSSVSHIRNT MLSLCLENAELKEQMGEAMSDGWEVEEDKEKGEVMVETVVAKGGLSEDSLQAEFRKVQGRLKSAYNIINL LKEQLVLRSSEGNTKEMPEFLVRLAREVDRMNMGLPSSEKHQHQEQENMTARPGPRPQSLKLGTALSVDG YQLENKSQAQDSGHQPEFSLPGSTKHLRSQLAQCRQRYQDLQEKLLISEATVFAQANQLEKYRAILSESL VKQDSKQIQVDLQDLGYETCGRSENEAEREETTSPECEEHGNLKPVVLVEGLCSEQGYLDPVLVSSPVKN PWRTSQEARGVQAQGTSDDSSLLRKDIRDLKAQLQNAYKVIQNLRSRVRSLSATSDYSSSLERPRKLRAV ATLEGASPHSVTDEDEGLLSDGTGAFYPPGLQAKKNLENLIQRVSQLEAQLPKTGLEGKLAEELKSASWP GKYDSLIQDQARKTVISASENTKREKDLFSSHPTFERYVKSFEDLLRNNDLTTYLGQSFREQLSSRRSVT DRLTSKFSTKDHKSEKEEAGLEPLALRLSRELQEKEKVIEVLQAKLDTRFSSPPSSHAASDSHRSASSTS FLSDDIEACSDMDVASEYTHYEEKKPSPSNSAASASQGLKGEPRSSSISLPTPQNPPKEASQAQPGFHFN SIPKPASLSQAPMHFTVPSFMPFGPSGPPLLGCCETPVVSLAEAQQELQMLQKQLGRSVSIAPPTSTSTL LSNHTEASSPRYSNPAQPHSPARGTIELGRILEPGYLGSGQWDMMRPQKGSISGELSSGSSMYQLNSKPT GADLLEEHLGEIRNLRQRLEESICVNDRLREQLQHRLSSTARENGSTSHFYSQGLESMPQLYNENRALRE ENQSLQTRLSHASRGHSQEVDHLREALLSSSSQLQELEKELEQQKAERRQLLEDLQEKQDEIVHFREERL SLQENNSRLQHKLALLQQQCEEKQQLSLSLQSELQIYESLYENPKKGLKAFSLDSCYQVPGELSCLVAEI RALRVQLEQSIQVNNRLRLQLEQQMDHGAGKASLSSCPVNQSFSAKAELANQQPPFQGSAASPPVRDVGL NSPPVVLPSNSCSVPGSDSAIISRTNNGSDESAATKTPPKMEVDAADGPFASGHGRHVIGHVDDYDALQQ QIGEGKLLIQKILSLTRPARSVPALDAQGTEAPGTKSVHELRSSARALNHSLEESASLLTMFWRAALPNS HGSVLVGEEGNLMEKELLDLRAQVSQQQQLLQSTAVRLKTANQRKKSMEQFIVSHLTRTHDVLKKARTNL EMKSFRALMCTPAL ; Myomegalin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2324 1 2324 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . MYOME_RAT Q9WUJ3 . 1 2324 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 1999-11-01 305EE824A44D38B9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 7 ;MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEVSREDVYKRNIELKVEVESLKRELQDRKQHLH KTWADEEDLNSQNEAELRRQVEEPQQETEHVYELLDNNIQLLQEESRFAKDEATQMETLVEAEKGCNLEL SERWKDATKNREDAPGDQVKLDQYSAALAQRDRRIEELRQSLAAQEGLVEQLSREKQQLLHLLEEPGGME VQPMPKGLPTQQKPDLNETPTTQPSVSDSHLAELQDKIQQTEVTNKILQEKLNDMSCELRSAQESSQKQD TTIQSLKEMLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLPEMLHQSQLGQLQSSEGIAPAQQQVALLDLQSALFC SQLEIQKLQRLLRQKERQLADGKRCMQFVEAAAQEREQQKEAAWKHNQELRKALQHLQGELHSKSQQLHV LEAEKYNEIRTQGQNIQHLSHSLSHKEQLIQELQELLQYRDTTDKTLDTNEVFLEKLRQRIQDRAVALER VIDEKFSALEEKDKELRQLRLAVRDRDHDLERLRCVLSANEATMQSMESLLRARGLEVEQLIATCQNLQW LKEELETKFGHWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLHKLGPGQSEVAEELCQRLQRKERVLQDL 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A 1 2221 SER 2221 ? ? ? 7 . A 1 2222 LEU 2222 ? ? ? 7 . A 1 2223 GLU 2223 ? ? ? 7 . A 1 2224 GLU 2224 ? ? ? 7 . A 1 2225 SER 2225 ? ? ? 7 . A 1 2226 ALA 2226 ? ? ? 7 . A 1 2227 SER 2227 ? ? ? 7 . A 1 2228 LEU 2228 ? ? ? 7 . A 1 2229 LEU 2229 ? ? ? 7 . A 1 2230 THR 2230 ? ? ? 7 . A 1 2231 MET 2231 ? ? ? 7 . A 1 2232 PHE 2232 ? ? ? 7 . A 1 2233 TRP 2233 ? ? ? 7 . A 1 2234 ARG 2234 ? ? ? 7 . A 1 2235 ALA 2235 ? ? ? 7 . A 1 2236 ALA 2236 ? ? ? 7 . A 1 2237 LEU 2237 ? ? ? 7 . A 1 2238 PRO 2238 ? ? ? 7 . A 1 2239 ASN 2239 ? ? ? 7 . A 1 2240 SER 2240 ? ? ? 7 . A 1 2241 HIS 2241 ? ? ? 7 . A 1 2242 GLY 2242 ? ? ? 7 . A 1 2243 SER 2243 ? ? ? 7 . A 1 2244 VAL 2244 ? ? ? 7 . A 1 2245 LEU 2245 ? ? ? 7 . A 1 2246 VAL 2246 ? ? ? 7 . A 1 2247 GLY 2247 ? ? ? 7 . A 1 2248 GLU 2248 ? ? ? 7 . A 1 2249 GLU 2249 ? ? ? 7 . A 1 2250 GLY 2250 ? ? ? 7 . A 1 2251 ASN 2251 ? ? ? 7 . A 1 2252 LEU 2252 ? ? ? 7 . A 1 2253 MET 2253 ? ? ? 7 . A 1 2254 GLU 2254 ? ? ? 7 . A 1 2255 LYS 2255 ? ? ? 7 . A 1 2256 GLU 2256 ? ? ? 7 . A 1 2257 LEU 2257 ? ? ? 7 . A 1 2258 LEU 2258 ? ? ? 7 . A 1 2259 ASP 2259 ? ? ? 7 . A 1 2260 LEU 2260 ? ? ? 7 . A 1 2261 ARG 2261 ? ? ? 7 . A 1 2262 ALA 2262 ? ? ? 7 . A 1 2263 GLN 2263 ? ? ? 7 . A 1 2264 VAL 2264 ? ? ? 7 . A 1 2265 SER 2265 ? ? ? 7 . A 1 2266 GLN 2266 ? ? ? 7 . A 1 2267 GLN 2267 ? ? ? 7 . A 1 2268 GLN 2268 ? ? ? 7 . A 1 2269 GLN 2269 ? ? ? 7 . A 1 2270 LEU 2270 ? ? ? 7 . A 1 2271 LEU 2271 ? ? ? 7 . A 1 2272 GLN 2272 ? ? ? 7 . A 1 2273 SER 2273 ? ? ? 7 . A 1 2274 THR 2274 ? ? ? 7 . A 1 2275 ALA 2275 ? ? ? 7 . A 1 2276 VAL 2276 ? ? ? 7 . A 1 2277 ARG 2277 ? ? ? 7 . A 1 2278 LEU 2278 ? ? ? 7 . A 1 2279 LYS 2279 ? ? ? 7 . A 1 2280 THR 2280 ? ? ? 7 . A 1 2281 ALA 2281 ? ? ? 7 . A 1 2282 ASN 2282 ? ? ? 7 . A 1 2283 GLN 2283 ? ? ? 7 . A 1 2284 ARG 2284 ? ? ? 7 . A 1 2285 LYS 2285 ? ? ? 7 . A 1 2286 LYS 2286 ? ? ? 7 . A 1 2287 SER 2287 ? ? ? 7 . A 1 2288 MET 2288 ? ? ? 7 . A 1 2289 GLU 2289 ? ? ? 7 . A 1 2290 GLN 2290 ? ? ? 7 . A 1 2291 PHE 2291 ? ? ? 7 . A 1 2292 ILE 2292 ? ? ? 7 . A 1 2293 VAL 2293 ? ? ? 7 . A 1 2294 SER 2294 ? ? ? 7 . A 1 2295 HIS 2295 ? ? ? 7 . A 1 2296 LEU 2296 ? ? ? 7 . A 1 2297 THR 2297 ? ? ? 7 . A 1 2298 ARG 2298 ? ? ? 7 . A 1 2299 THR 2299 ? ? ? 7 . A 1 2300 HIS 2300 ? ? ? 7 . A 1 2301 ASP 2301 ? ? ? 7 . A 1 2302 VAL 2302 ? ? ? 7 . A 1 2303 LEU 2303 ? ? ? 7 . A 1 2304 LYS 2304 ? ? ? 7 . A 1 2305 LYS 2305 ? ? ? 7 . A 1 2306 ALA 2306 ? ? ? 7 . A 1 2307 ARG 2307 ? ? ? 7 . A 1 2308 THR 2308 ? ? ? 7 . A 1 2309 ASN 2309 ? ? ? 7 . A 1 2310 LEU 2310 ? ? ? 7 . A 1 2311 GLU 2311 ? ? ? 7 . A 1 2312 MET 2312 ? ? ? 7 . A 1 2313 LYS 2313 ? ? ? 7 . A 1 2314 SER 2314 ? ? ? 7 . A 1 2315 PHE 2315 ? ? ? 7 . A 1 2316 ARG 2316 ? ? ? 7 . A 1 2317 ALA 2317 ? ? ? 7 . A 1 2318 LEU 2318 ? ? ? 7 . A 1 2319 MET 2319 ? ? ? 7 . A 1 2320 CYS 2320 ? ? ? 7 . A 1 2321 THR 2321 ? ? ? 7 . A 1 2322 PRO 2322 ? ? ? 7 . A 1 2323 ALA 2323 ? ? ? 7 . A 1 2324 LEU 2324 ? ? ? 7 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin 3 {PDB ID=8iah, label_asym_id=HA, auth_asym_id=X, SMTL ID=8iah.1.7}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8iah, label_asym_id=HA' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-05 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-28 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A HA 8 1 X # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERL ATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDL ERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQNLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILTDKLKEAETRAEFAERSV AKLEKTIDDLEDKLKCTKEEHLCTQRMLDQTLLDLNEM ; ;MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERL ATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDL ERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQNLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILTDKLKEAETRAEFAERSV AKLEKTIDDLEDKLKCTKEEHLCTQRMLDQTLLDLNEM ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 46 232 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8iah 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2324 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2329 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.210 12.637 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSNGYRTLSQHLNDLKKENFSLKLRIYFLEERMQQKYEVSREDVYKRNIELKVEVESLKRELQDRKQHLHKTWADEEDLNSQNEAELRRQVEEPQQETEHVYELLDNNIQLLQEESRFAKDEATQMETLVEAEKGCNLELSERWKDATKNREDAPGDQVKLDQYSAALAQRDRRIEELRQSLAAQEGLVEQLSREKQQLLHLLEEPGGMEVQPMPKGLPTQQKPDLNETPTTQPSVSDSHLAELQDKIQQTEVTNKILQEKLNDMSCELRSAQESSQKQDTTIQSLKEMLKSRESETEELYQVIEGQNDTMAKLPEMLHQS--QLGQLQSS-EGI--APAQQQVALLDLQSALFCSQLEIQKLQRLLRQKERQLADGKRCMQFVEAAAQEREQQKEAAWKHNQELRKALQHLQGELHSKSQQLHVLEAEKYNEIRTQGQNIQHLSHSLSHKEQLIQELQELLQYRDTTDKTLDTNEVFLEKLRQRIQDRAVALERVIDEKFSALEEKDKELRQLRLAVRDRDHDLERLRCVLSANEATMQSMESLLRARGLEVEQLIATCQNLQWLKEELETKFGHWQKEQESIIQQLQTSLHDRNKEVEDLSATLLHKLGPGQSEVAEELCQRLQRKERVLQDLLSDRNKQAMEHEMEVQGLLQSMGTREQERQAVAEKMVQAFMERNSELQALRQYLGGKELMAASQAFISNQPAGATSVGPHHGEQTDQGSTQMPSRDDSTSLTAREEASIPRSTLGDSDTVAGLEKELSNAKEELELMAKKERESQIELSALQSMMAVQEEELQVQAADLESLTRNIQIKEDLIKDLQMQLVDPEDMPAMERLTQEVLLLREKVASVEPQGQEGSENRRQQLLLMLEGLVDERSRLNEALQAERQLYSSLVKFHAQPETFERDRTLQVELEGAQVLRSRLEEVLGRSLERLSRLETLAAIGGATAGDETEDTSTQFTDSIEEEAAHNSHQQLIKVSLEKSLTTMETQNTCLQPPSPVGEDGNRHLQEEMLHLRAEIHQPLEEKRKAEAELKELKAQIEEAGFSSVSHIRNTMLSLCLENAELKEQMGEAMSDGWEVEEDKEKGEVMVETVVAKGGLSEDSLQAEFRKVQGRLKSAYNIINLLKEQLVLRSSEGNTKEMPEFLVRLAREVDRMNMGLPSSEKHQHQEQENMTARPGPRPQSLKLGTALSVDGYQLENKSQAQDSGHQPEFSLPGSTKHLRSQLAQCRQRYQDLQEKLLISEATVFAQANQLEKYRAILSESLVKQDSKQIQVDLQDLGYETCGRSENEAEREETTSPECEEHGNLKPVVLVEGLCSEQGYLDPVLVSSPVKNPWRTSQEARGVQAQGTSDDSSLLRKDIRDLKAQLQNAYKVIQNLRSRVRSLSATSDYSSSLERPRKLRAVATLEGASPHSVTDEDEGLLSDGTGAFYPPGLQAKKNLENLIQRVSQLEAQLPKTGLEGKLAEELKSASWPGKYDSLIQDQARKTVISASENTKREKDLFSSHPTFERYVKSFEDLLRNNDLTTYLGQSFREQLSSRRSVTDRLTSKFSTKDHKSEKEEAGLEPLALRLSRELQEKEKVIEVLQAKLDTRFSSPPSSHAASDSHRSASSTSFLSDDIEACSDMDVASEYTHYEEKKPSPSNSAASASQGLKGEPRSSSISLPTPQNPPKEASQAQPGFHFNSIPKPASLSQAPMHFTVPSFMPFGPSGPPLLGCCETPVVSLAEAQQELQMLQKQLGRSVSIAPPTSTSTLLSNHTEASSPRYSNPAQPHSPARGTIELGRILEPGYLGSGQWDMMRPQKGSISGELSSGSSMYQLNSKPTGADLLEEHLGEIRNLRQRLEESICVNDRLREQLQHRLSSTARENGSTSHFYSQGLESMPQLYNENRALREENQSLQTRLSHASRGHSQEVDHLREALLSSSSQLQELEKELEQQKAERRQLLEDLQEKQDEIVHFREERLSLQENNSRLQHKLALLQQQCEEKQQLSLSLQSELQIYESLYENPKKGLKAFSLDSCYQVPGELSCLVAEIRALRVQLEQSIQVNNRLRLQLEQQMDHGAGKASLSSCPVNQSFSAKAELANQQPPFQGSAASPPVRDVGLNSPPVVLPSNSCSVPGSDSAIISRTNNGSDESAATKTPPKMEVDAADGPFASGHGRHVIGHVDDYDALQQQIGEGKLLIQKILSLTRPARSVPALDAQGTEAPGTKSVHELRSSARALNHSLEESASLLTMFWRAALPNSHGSVLVGEEGNLMEKELLDLRAQVSQQQQLLQSTAVRLKTANQRKKSMEQFIVSHLTRTHDVLKKARTNLEMKSFRALMCTPAL 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQNLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILTDKLKEAETRAEFAERSVAKLEKTIDDLEDKLKCTKEEHL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.135}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8iah.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 332.976 283.454 403.346 1 1 7 ASN 0.740 1 ATOM 145 N N . LYS 256 256 ? A 328.903 280.620 401.135 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 146 C CA . LYS 256 256 ? A 328.416 279.430 400.460 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 147 C C . LYS 256 256 ? A 327.235 279.681 399.531 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 148 O O . LYS 256 256 ? A 327.241 279.247 398.380 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 149 C CB . LYS 256 256 ? A 328.031 278.344 401.487 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 150 C CG . LYS 256 256 ? A 329.246 277.755 402.214 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 151 C CD . LYS 256 256 ? A 328.844 276.684 403.238 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 152 C CE . LYS 256 256 ? A 330.070 276.108 403.944 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 153 N NZ . LYS 256 256 ? A 329.697 275.189 405.038 1 1 7 LYS 0.740 1 ATOM 154 N N . ILE 257 257 ? A 326.224 280.448 399.998 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 155 C CA . ILE 257 257 ? A 325.056 280.834 399.209 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 156 C C . ILE 257 257 ? A 325.440 281.682 398.005 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 157 O O . ILE 257 257 ? 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A 313.537 290.209 330.816 1 1 7 VAL 0.690 1 ATOM 535 N N . ILE 304 304 ? A 309.791 292.919 331.531 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 536 C CA . ILE 304 304 ? A 308.416 293.411 331.403 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 537 C C . ILE 304 304 ? A 308.364 294.761 330.699 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 538 O O . ILE 304 304 ? A 307.554 294.969 329.796 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 539 C CB . ILE 304 304 ? A 307.690 293.471 332.752 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 540 C CG1 . ILE 304 304 ? A 307.497 292.045 333.320 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 541 C CG2 . ILE 304 304 ? A 306.322 294.190 332.634 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 542 C CD1 . ILE 304 304 ? A 307.104 292.020 334.803 1 1 7 ILE 0.690 1 ATOM 543 N N . GLU 305 305 ? A 309.284 295.692 331.042 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 544 C CA . GLU 305 305 ? A 309.442 296.953 330.329 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 545 C C . GLU 305 305 ? A 309.733 296.765 328.843 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 546 O O . GLU 305 305 ? A 309.035 297.294 327.979 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 547 C CB . GLU 305 305 ? A 310.601 297.765 330.952 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 548 C CG . GLU 305 305 ? A 310.888 299.131 330.276 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 549 C CD . GLU 305 305 ? A 312.058 299.875 330.927 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 550 O OE1 . GLU 305 305 ? A 312.342 301.015 330.477 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 551 O OE2 . GLU 305 305 ? A 312.671 299.320 331.874 1 1 7 GLU 0.670 1 ATOM 552 N N . GLY 306 306 ? A 310.724 295.908 328.510 1 1 7 GLY 0.700 1 ATOM 553 C CA . GLY 306 306 ? A 311.119 295.671 327.125 1 1 7 GLY 0.700 1 ATOM 554 C C . GLY 306 306 ? A 310.092 294.974 326.266 1 1 7 GLY 0.700 1 ATOM 555 O O . GLY 306 306 ? A 309.948 295.251 325.078 1 1 7 GLY 0.700 1 ATOM 556 N N . GLN 307 307 ? A 309.325 294.039 326.855 1 1 7 GLN 0.640 1 ATOM 557 C CA . GLN 307 307 ? A 308.192 293.402 326.209 1 1 7 GLN 0.640 1 ATOM 558 C C . GLN 307 307 ? A 307.069 294.365 325.891 1 1 7 GLN 0.640 1 ATOM 559 O O . GLN 307 307 ? A 306.516 294.311 324.796 1 1 7 GLN 0.640 1 ATOM 560 C CB . GLN 307 307 ? 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A 307.311 297.708 325.279 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 574 C CA . ASP 309 309 ? A 307.743 298.481 324.123 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 575 C C . ASP 309 309 ? A 307.657 297.720 322.819 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 576 O O . ASP 309 309 ? A 307.148 298.221 321.817 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 577 C CB . ASP 309 309 ? A 309.231 298.879 324.219 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 578 C CG . ASP 309 309 ? A 309.476 300.091 325.093 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 579 O OD1 . ASP 309 309 ? A 308.492 300.710 325.574 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 580 O OD2 . ASP 309 309 ? A 310.671 300.468 325.151 1 1 7 ASP 0.630 1 ATOM 581 N N . THR 310 310 ? A 308.145 296.462 322.804 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 582 C CA . THR 310 310 ? A 308.082 295.603 321.618 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 583 C C . THR 310 310 ? A 306.629 295.367 321.221 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 584 O O . THR 310 310 ? A 306.258 295.477 320.052 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 585 C CB . THR 310 310 ? A 308.760 294.248 321.784 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 586 O OG1 . THR 310 310 ? A 310.153 294.414 322.014 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 587 C CG2 . THR 310 310 ? A 308.666 293.371 320.523 1 1 7 THR 0.640 1 ATOM 588 N N . MET 311 311 ? A 305.755 295.105 322.213 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 589 C CA . MET 311 311 ? A 304.330 294.900 321.982 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 590 C C . MET 311 311 ? A 303.511 296.177 321.768 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 591 O O . MET 311 311 ? A 302.337 296.090 321.425 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 592 C CB . MET 311 311 ? A 303.578 294.264 323.162 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 593 C CG . MET 311 311 ? A 303.880 292.815 323.489 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 594 S SD . MET 311 311 ? A 302.964 292.308 324.981 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 595 C CE . MET 311 311 ? A 301.276 292.365 324.286 1 1 7 MET 0.560 1 ATOM 596 N N . ALA 312 312 ? A 304.058 297.383 321.918 1 1 7 ALA 0.660 1 ATOM 597 C CA . ALA 312 312 ? A 303.369 298.562 321.438 1 1 7 ALA 0.660 1 ATOM 598 C C . ALA 312 312 ? A 303.816 298.932 320.032 1 1 7 ALA 0.660 1 ATOM 599 O O . ALA 312 312 ? A 302.988 299.232 319.175 1 1 7 ALA 0.660 1 ATOM 600 C CB . ALA 312 312 ? A 303.589 299.724 322.412 1 1 7 ALA 0.660 1 ATOM 601 N N . LYS 313 313 ? A 305.137 298.841 319.736 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 602 C CA . LYS 313 313 ? A 305.698 299.173 318.433 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 603 C C . LYS 313 313 ? A 305.181 298.315 317.288 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 604 O O . LYS 313 313 ? A 304.882 298.808 316.204 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 605 C CB . LYS 313 313 ? A 307.242 299.088 318.479 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 606 C CG . LYS 313 313 ? A 307.865 300.198 319.338 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 607 C CD . LYS 313 313 ? A 309.391 300.072 319.441 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 608 C CE . LYS 313 313 ? A 310.005 301.158 320.327 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 609 N NZ . LYS 313 313 ? A 311.466 300.956 320.443 1 1 7 LYS 0.610 1 ATOM 610 N N . LEU 314 314 ? A 305.044 296.990 317.506 1 1 7 LEU 0.570 1 ATOM 611 C CA . LEU 314 314 ? A 304.449 296.098 316.524 1 1 7 LEU 0.570 1 ATOM 612 C C . LEU 314 314 ? 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A 304.755 298.444 312.630 1 1 7 MET 0.510 1 ATOM 639 C CG . MET 317 317 ? A 306.012 299.185 313.115 1 1 7 MET 0.510 1 ATOM 640 S SD . MET 317 317 ? A 307.467 298.110 313.325 1 1 7 MET 0.510 1 ATOM 641 C CE . MET 317 317 ? A 307.749 297.784 311.561 1 1 7 MET 0.510 1 ATOM 642 N N . LEU 318 318 ? A 301.670 297.675 312.416 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 643 C CA . LEU 318 318 ? A 300.535 296.950 311.851 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 644 C C . LEU 318 318 ? A 299.362 297.830 311.439 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 645 O O . LEU 318 318 ? A 298.694 297.561 310.444 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 646 C CB . LEU 318 318 ? A 299.999 295.872 312.825 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 647 C CG . LEU 318 318 ? A 300.937 294.676 313.076 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 648 C CD1 . LEU 318 318 ? A 300.381 293.806 314.217 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 649 C CD2 . LEU 318 318 ? A 301.175 293.847 311.803 1 1 7 LEU 0.440 1 ATOM 650 N N . HIS 319 319 ? A 299.100 298.923 312.185 1 1 7 HIS 0.420 1 ATOM 651 C CA . HIS 319 319 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #