data_SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_6 _entry.id SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_6 _struct.entry_id SMR-8152a71e90ecc3d6fdbb8c4d2fd22b5f_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8NG31/ KNL1_HUMAN, Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8NG31' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 307898.585 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KNL1_HUMAN Q8NG31 1 ;MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQT ESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLS APIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLA NLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASST HQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFN HTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAE THIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYC NPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNV NCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQ SKSSSDECEEITKSRNEPFQRSDIIAKNSLTDTWNKDKDWVLKILPYLDKDSPQSADCNQEIATSHNIVY CGGVLDKQITNRNTVSWEQSLFSTTKPLFSSGQFSMKNHDTAISSHTVKSVLGQNSKLAEPLRKSLSNPT PDYCHDKMIICSEEEQNMDLTKSHTVVIGFGPSELQELGKTNLEHTTGQLTTMNRQIAVKVEKCGKSPIE KSGVLKSNCIMDVLEDESVQKPKFPKEKQNVKIWGRKSVGGPKIDKTIVFSEDDKNDMDITKSYTIEINH RPLLEKRDCHLVPLAGTSETILYTCRQDDMEITRSHTTALECKTVSPDEITTRPMDKTVVFVDNHVELEM TESHTVFIDYQEKERTDRPNFELSQRKSLGTPTVICTPTEESVFFPGNGESDRLVANDSQLTPLEEWSNN RGPVEVADNMELSKSATCKNIKDVQSPGFLNEPLSSKSQRRKSLKLKNDKTIVFSENHKNDMDITQSCMV EIDNESALEDKEDFHLAGASKTILYSCGQDDMEITRSHTTALECKTLLPNEIAIRPMDKTVLFTDNYSDL EVTDSHTVFIDCQATEKILEENPKFGIGKGKNLGVSFPKDNSCVQEIAEKQALAVGNKIVLHTEQKQQLF AATNRTTNEIIKFHSAAMDEKVIGKVVDQACTLEKAQVESCQLNNRDRRNVDFTSSHATAVCGSSDNYSC LPNVISCTDNLEGSAMLLCDKDEEKANYCPVQNDLAYANDFASEYYLESEGQPLSAPCPLLEKEEVIQTS TKGQLDCVITLHKDQDLIKDPRNLLANQTLVYSQDLGEMTKLNSKRVSFKLPKDQMKVYVDDIYVIPQPH FSTDQPPLPKKGQSSINKEEVILSKAGNKSLNIIENSSAPICENKPKILNSEEWFAAACKKELKENIQTT NYNTALDFHSNSDVTKQVIQTHVNAGEAPDPVITSNVPCFHSIKPNLNNLNGKTGEFLAFQTVHLPPLPE QLLELGNKAHNDMHIVQATEIHNINIISSNAKDSRDEENKKSHNGAETTSLPPKTVFKDKVRRCSLGIFL PRLPNKRNCSVTGIDDLEQIPADTTDINHLETQPVSSKDSGIGSVAGKLNLSPSQYINEENLPVYPDEIN SSDSINIETEEKALIETYQKEISPYENKMGKTCNSQKRTWVQEEEDIHKEKKIRKNEIKFSDTTQDREIF DHHTEEDIDKSANSVLIKNLSRTPSSCSSSLDSIKADGTSLDFSTYRSSQMESQFLRDTICEESLREKLQ DGRITIREFFILLQVHILIQKPRQSNLPGNFTVNTPPTPEDLMLSQYVYRPKIQIYREDCEARRQKIEEL KLSASNQDKLLVDINKNLWEKMRHCSDKELKAFGIYLNKIKSCFTKMTKVFTHQGKVALYGKLVQSAQNE REKLQIKIDEMDKILKKIDNCLTEMETETKNLEDEEKNNPVEEWDSEMRAAEKELEQLKTEEEELQRNLL ELEVQKEQTLAQIDFMQKQRNRTEELLDQLSLSEWDVVEWSDDQAVFTFVYDTIQLTITFEESVVGFPFL DKRYRKIVDVNFQSLLDEDQAPPSSLLVHKLIFQYVEEKESWKKTCTTQHQLPKMLEEFSLVVHHCRLLG EEIEYLKRWGPNYNLMNIDINNNELRLLFSSSAAFAKFEITLFLSAYYPSVPLPSTIQNHVGNTSQDDIA TILSKVPLENNYLKNVVKQIYQDLFQDCHFYH ; 'Outer kinetochore KNL1 complex subunit KNL1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2342 1 2342 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KNL1_HUMAN Q8NG31 . 1 2342 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-02-10 8E29150CA4F5B5C1 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no G ;MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQT ESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLS APIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLA NLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASST HQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFN HTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAE THIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYC NPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNV NCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQ 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QLLELGNKAHNDMHIVQATEIHNINIISSNAKDSRDEENKKSHNGAETTSLPPKTVFKDKVRRCSLGIFL PRLPNKRNCSVTGIDDLEQIPADTTDINHLETQPVSSKDSGIGSVAGKLNLSPSQYINEENLPVYPDEIN SSDSINIETEEKALIETYQKEISPYENKMGKTCNSQKRTWVQEEEDIHKEKKIRKNEIKFSDTTQDREIF DHHTEEDIDKSANSVLIKNLSRTPSSCSSSLDSIKADGTSLDFSTYRSSQMESQFLRDTICEESLREKLQ DGRITIREFFILLQVHILIQKPRQSNLPGNFTVNTPPTPEDLMLSQYVYRPKIQIYREDCEARRQKIEEL KLSASNQDKLLVDINKNLWEKMRHCSDKELKAFGIYLNKIKSCFTKMTKVFTHQGKVALYGKLVQSAQNE REKLQIKIDEMDKILKKIDNCLTEMETETKNLEDEEKNNPVEEWDSEMRAAEKELEQLKTEEEELQRNLL ELEVQKEQTLAQIDFMQKQRNRTEELLDQLSLSEWDVVEWSDDQAVFTFVYDTIQLTITFEESVVGFPFL DKRYRKIVDVNFQSLLDEDQAPPSSLLVHKLIFQYVEEKESWKKTCTTQHQLPKMLEEFSLVVHHCRLLG EEIEYLKRWGPNYNLMNIDINNNELRLLFSSSAAFAKFEITLFLSAYYPSVPLPSTIQNHVGNTSQDDIA TILSKVPLENNYLKNVVKQIYQDLFQDCHFYH ; ;MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQT ESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLS APIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLA 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G . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=8enc, label_asym_id=G, auth_asym_id=O, SMTL ID=8enc.1.G}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8enc, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-05 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-02-28 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 3 1 O # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; ;MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEK LELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEK MEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQ AEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALND MTSI ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 89 276 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8enc 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2342 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2345 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.034 15.676 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDGVSSEANEENDNIERPVRRRHSSILKPPRSPLQDLRGGNERVQESNALRNKKNSRRVSFADTIKVFQTESHMKIVRKSEMEGCSAMVPSQLQLLPPGFKRFSCLSLPETETGENLLLIQNKKLEDNYCEITGMNTLLSAPIHTQMQQKEFSIIEHTRERKHANDQTVIFSDENQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLANLKLHTEDSRMKKEVNFSVDQNTSSENKIDFNDFIKRLKTGKCSAFPDVPDKENFEIPIYSKEPNSASSTHQMHVSLKEDENNSNITRLFREKDDGMNFTQCHTANIQTLIPTSSETNSRESKGNDITIYGNDFMDLTFNHTLQILPATGNFSEIENQTQNAMDVTTGYGTKASGNKTVFKSKQNTAFQDLSINSADKIHITRSHIMGAETHIVSQTCNQDARILAMTPESIYSNPSIQGCKTVFYSSCNDAMEMTKCLSNMREEKNLLKHDSNYAKMYCNPDAMSSLTEKTIYSGEENMDITKSHTVAIDNQIFKQDQSNVQIAAAPTPEKEMMLQNLMTTSEDGKMNVNCNSVPHVSKERIQQSLSNPLSISLTDRKTELLSGENMDLTESHTSNLGSQVPLAAYNLAPESTSESHSQSKSSSDECEEITKSRNEPFQRSDIIAKNSLTDTWNKDKDWVLKILPYLDKDSPQSADCNQEIATSHNIVYCGGVLDKQITNRNTVSWEQSLFSTTKPLFSSGQFSMKNHDTAISSHTVKSVLGQNSKLAEPLRKSLSNPTPDYCHDKMIICSEEEQNMDLTKSHTVVIGFGPSELQELGKTNLEHTTGQLTTMNRQIAVKVEKCGKSPIEKSGVLKSNCIMDVLEDESVQKPKFPKEKQNVKIWGRKSVGGPKIDKTIVFSEDDKNDMDITKSYTIEINHRPLLEKRDCHLVPLAGTSETILYTCRQDDMEITRSHTTALECKTVSPDEITTRPMDKTVVFVDNHVELEMTESHTVFIDYQEKERTDRPNFELSQRKSLGTPTVICTPTEESVFFPGNGESDRLVANDSQLTPLEEWSNNRGPVEVADNMELSKSATCKNIKDVQSPGFLNEPLSSKSQRRKSLKLKNDKTIVFSENHKNDMDITQSCMVEIDNESALEDKEDFHLAGASKTILYSCGQDDMEITRSHTTALECKTLLPNEIAIRPMDKTVLFTDNYSDLEVTDSHTVFIDCQATEKILEENPKFGIGKGKNLGVSFPKDNSCVQEIAEKQALAVGNKIVLHTEQKQQLFAATNRTTNEIIKFHSAAMDEKVIGKVVDQACTLEKAQVESCQLNNRDRRNVDFTSSHATAVCGSSDNYSCLPNVISCTDNLEGSAMLLCDKDEEKANYCPVQNDLAYANDFASEYYLESEGQPLSAPCPLLEKEEVIQTSTKGQLDCVITLHKDQDLIKDPRNLLANQTLVYSQDLGEMTKLNSKRVSFKLPKDQMKVYVDDIYVIPQPHFSTDQPPLPKKGQSSINKEEVILSKAGNKSLNIIENSSAPICENKPKILNSEEWFAAACKKELKENIQTTNYNTALDFHSNSDVTKQVIQTHVNAGEAPDPVITSNVPCFHSIKPNLNNLNGKTGEFLAFQTVHLPPLPEQLLELGNKAHNDMHIVQATEIHNINIISSNAKDSRDEENKKSHNGAETTSLPPKTVFKDKVRRCSLGIFLPRLPNKRNCSVTGIDDLEQIPADTTDINHLETQPVSSKDSGIGSVAGKLNLSPSQYINEENLPVYPDEINSSDSINIETEEKALIETYQKEISPYENKMGKTCNSQKRTWVQEEEDIHKEKKIRKNEIKFSDTTQDREIFDHHTEEDIDKSANSVLIKNLSRTPSSCSSSLDSIKADGTSLDFSTYRSSQMESQFLRDTICEESLREKLQDGRITIREFFILLQVHILIQKPRQSNLPGNFTVNTPPTPEDLMLSQYVYRPKIQIYREDCEARRQKIEELKLSASNQDKLLVDINKNLW--EKMRHCSDKELKAFGIYLNKIKSCFTKMT-KVFTHQGKVALYGKLVQSAQNEREKLQIKIDEMDKILKKIDNCLTEMETETKNLEDEEKNNPVEEWDSEMRAAEKELEQLKTEEEELQRNLLELEVQKEQTLAQIDFMQKQRNRTEELLDQLSLSEWDVVEWSDDQAVFTFVYDTIQLTITFEESVVGFPFLDKRYRKIVDVNFQSLLDEDQAPPSSLLVHKLIFQYVEEKESWKKTCTTQHQLPKMLEEFSLVVHHCRLLGEEIEYLKRWGPNYNLMNIDINNNELRLLFSSSAAFAKFEITLFLSAYYPSVPLPSTIQNHVGNTSQDDIATILSKVPLENNYLKNVVKQIYQDLFQDCHFYH 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQ-----KEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDH--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.015}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8enc.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ARG 1940 1940 ? A 283.587 225.595 300.692 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 2 C CA . ARG 1940 1940 ? A 284.549 226.352 299.801 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 3 C C . ARG 1940 1940 ? A 285.579 225.604 298.945 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 4 O O . ARG 1940 1940 ? A 286.231 226.305 298.187 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 5 C CB . ARG 1940 1940 ? A 285.265 227.476 300.597 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 6 C CG . ARG 1940 1940 ? A 284.348 228.558 301.208 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 7 C CD . ARG 1940 1940 ? A 285.166 229.574 302.013 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 8 N NE . ARG 1940 1940 ? A 284.210 230.547 302.634 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 9 C CZ . ARG 1940 1940 ? A 284.597 231.487 303.509 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 10 N NH1 . ARG 1940 1940 ? A 285.866 231.594 303.887 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 11 N NH2 . ARG 1940 1940 ? A 283.707 232.339 304.011 1 1 G ARG 0.520 1 ATOM 12 N N . PRO 1941 1941 ? A 285.756 224.277 298.947 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 13 C CA . PRO 1941 1941 ? A 286.511 223.613 297.878 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 14 C C . PRO 1941 1941 ? A 285.542 222.921 296.922 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 15 O O . PRO 1941 1941 ? A 285.961 222.415 295.893 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 16 C CB . PRO 1941 1941 ? A 287.440 222.642 298.630 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 17 C CG . PRO 1941 1941 ? A 286.718 222.308 299.943 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 18 C CD . PRO 1941 1941 ? A 285.766 223.483 300.183 1 1 G PRO 0.500 1 ATOM 19 N N . LYS 1942 1942 ? A 284.221 222.894 297.226 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 20 C CA . LYS 1942 1942 ? A 283.224 222.366 296.301 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 21 C C . LYS 1942 1942 ? A 282.509 223.454 295.511 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 22 O O . LYS 1942 1942 ? A 281.859 223.182 294.511 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 23 C CB . LYS 1942 1942 ? A 282.124 221.567 297.039 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 24 C CG . LYS 1942 1942 ? A 282.651 220.289 297.701 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 25 C CD . LYS 1942 1942 ? A 281.515 219.470 298.336 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 26 C CE . LYS 1942 1942 ? A 282.013 218.168 298.975 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 27 N NZ . LYS 1942 1942 ? A 280.889 217.428 299.591 1 1 G LYS 0.590 1 ATOM 28 N N . ILE 1943 1943 ? A 282.632 224.736 295.928 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 29 C CA . ILE 1943 1943 ? A 282.024 225.868 295.237 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 30 C C . ILE 1943 1943 ? A 282.616 226.072 293.844 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 31 O O . ILE 1943 1943 ? A 281.901 226.388 292.902 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 32 C CB . ILE 1943 1943 ? A 282.087 227.178 296.039 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 33 C CG1 . ILE 1943 1943 ? A 283.542 227.609 296.355 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 34 C CG2 . ILE 1943 1943 ? A 281.209 227.036 297.306 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 35 C CD1 . ILE 1943 1943 ? A 283.701 228.962 297.061 1 1 G ILE 0.430 1 ATOM 36 N N . GLN 1944 1944 ? A 283.951 225.872 293.681 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 37 C CA . GLN 1944 1944 ? A 284.661 225.962 292.417 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 38 C C . GLN 1944 1944 ? A 284.229 224.888 291.437 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 39 O O . GLN 1944 1944 ? A 284.028 225.180 290.266 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 40 C CB . GLN 1944 1944 ? A 286.209 225.938 292.580 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 41 C CG . GLN 1944 1944 ? A 286.776 227.203 293.276 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 42 C CD . GLN 1944 1944 ? A 286.647 227.101 294.795 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 43 O OE1 . GLN 1944 1944 ? A 286.306 226.058 295.341 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 44 N NE2 . GLN 1944 1944 ? A 286.860 228.237 295.502 1 1 G GLN 0.490 1 ATOM 45 N N . ILE 1945 1945 ? A 284.022 223.642 291.932 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 46 C CA . ILE 1945 1945 ? A 283.461 222.520 291.182 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 47 C C . ILE 1945 1945 ? A 282.047 222.830 290.697 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 48 O O . ILE 1945 1945 ? A 281.705 222.666 289.537 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 49 C CB . ILE 1945 1945 ? A 283.461 221.234 292.018 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 50 C CG1 . ILE 1945 1945 ? A 284.914 220.792 292.343 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 51 C CG2 . ILE 1945 1945 ? A 282.697 220.111 291.264 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 52 C CD1 . ILE 1945 1945 ? A 284.989 219.665 293.385 1 1 G ILE 0.540 1 ATOM 53 N N . TYR 1946 1946 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.549 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1940 ARG 1 0.520 2 1 A 1941 PRO 1 0.500 3 1 A 1942 LYS 1 0.590 4 1 A 1943 ILE 1 0.430 5 1 A 1944 GLN 1 0.490 6 1 A 1945 ILE 1 0.540 7 1 A 1946 TYR 1 0.560 8 1 A 1947 ARG 1 0.580 9 1 A 1948 GLU 1 0.590 10 1 A 1949 ASP 1 0.660 11 1 A 1950 CYS 1 0.680 12 1 A 1951 GLU 1 0.650 13 1 A 1952 ALA 1 0.700 14 1 A 1953 ARG 1 0.600 15 1 A 1954 ARG 1 0.590 16 1 A 1955 GLN 1 0.640 17 1 A 1956 LYS 1 0.600 18 1 A 1957 ILE 1 0.630 19 1 A 1958 GLU 1 0.620 20 1 A 1959 GLU 1 0.610 21 1 A 1960 LEU 1 0.610 22 1 A 1961 LYS 1 0.640 23 1 A 1962 LEU 1 0.620 24 1 A 1963 SER 1 0.650 25 1 A 1964 ALA 1 0.640 26 1 A 1965 SER 1 0.640 27 1 A 1966 ASN 1 0.610 28 1 A 1967 GLN 1 0.560 29 1 A 1968 ASP 1 0.620 30 1 A 1969 LYS 1 0.550 31 1 A 1970 LEU 1 0.550 32 1 A 1971 LEU 1 0.570 33 1 A 1972 VAL 1 0.470 34 1 A 1973 ASP 1 0.440 35 1 A 1974 ILE 1 0.450 36 1 A 1975 ASN 1 0.390 37 1 A 1976 LYS 1 0.360 38 1 A 1977 ASN 1 0.360 39 1 A 1978 LEU 1 0.340 40 1 A 1979 TRP 1 0.250 41 1 A 1980 GLU 1 0.360 42 1 A 1981 LYS 1 0.390 43 1 A 1982 MET 1 0.360 44 1 A 1983 ARG 1 0.370 45 1 A 1984 HIS 1 0.380 46 1 A 1985 CYS 1 0.520 47 1 A 1986 SER 1 0.560 48 1 A 1987 ASP 1 0.570 49 1 A 1988 LYS 1 0.510 50 1 A 1989 GLU 1 0.480 51 1 A 1990 LEU 1 0.550 52 1 A 1991 LYS 1 0.520 53 1 A 1992 ALA 1 0.520 54 1 A 1993 PHE 1 0.550 55 1 A 1994 GLY 1 0.640 56 1 A 1995 ILE 1 0.510 57 1 A 1996 TYR 1 0.490 58 1 A 1997 LEU 1 0.540 59 1 A 1998 ASN 1 0.540 60 1 A 1999 LYS 1 0.500 61 1 A 2000 ILE 1 0.550 62 1 A 2001 LYS 1 0.560 63 1 A 2002 SER 1 0.500 64 1 A 2003 CYS 1 0.550 65 1 A 2004 PHE 1 0.450 66 1 A 2005 THR 1 0.520 67 1 A 2006 LYS 1 0.490 68 1 A 2007 MET 1 0.460 69 1 A 2008 THR 1 0.520 70 1 A 2009 LYS 1 0.500 71 1 A 2010 VAL 1 0.500 72 1 A 2011 PHE 1 0.350 73 1 A 2012 THR 1 0.530 74 1 A 2013 HIS 1 0.430 75 1 A 2014 GLN 1 0.510 76 1 A 2015 GLY 1 0.570 77 1 A 2016 LYS 1 0.530 78 1 A 2017 VAL 1 0.550 79 1 A 2018 ALA 1 0.610 80 1 A 2019 LEU 1 0.520 81 1 A 2020 TYR 1 0.500 82 1 A 2021 GLY 1 0.590 83 1 A 2022 LYS 1 0.560 84 1 A 2023 LEU 1 0.560 85 1 A 2024 VAL 1 0.590 86 1 A 2025 GLN 1 0.520 87 1 A 2026 SER 1 0.580 88 1 A 2027 ALA 1 0.610 89 1 A 2028 GLN 1 0.570 90 1 A 2029 ASN 1 0.610 91 1 A 2030 GLU 1 0.590 92 1 A 2031 ARG 1 0.570 93 1 A 2032 GLU 1 0.600 94 1 A 2033 LYS 1 0.640 95 1 A 2034 LEU 1 0.610 96 1 A 2035 GLN 1 0.610 97 1 A 2036 ILE 1 0.630 98 1 A 2037 LYS 1 0.640 99 1 A 2038 ILE 1 0.640 100 1 A 2039 ASP 1 0.660 101 1 A 2040 GLU 1 0.650 102 1 A 2041 MET 1 0.620 103 1 A 2042 ASP 1 0.630 104 1 A 2043 LYS 1 0.640 105 1 A 2044 ILE 1 0.610 106 1 A 2045 LEU 1 0.600 107 1 A 2046 LYS 1 0.620 108 1 A 2047 LYS 1 0.610 109 1 A 2048 ILE 1 0.590 110 1 A 2049 ASP 1 0.580 111 1 A 2050 ASN 1 0.590 112 1 A 2051 CYS 1 0.560 113 1 A 2052 LEU 1 0.550 114 1 A 2053 THR 1 0.560 115 1 A 2054 GLU 1 0.520 116 1 A 2055 MET 1 0.480 117 1 A 2056 GLU 1 0.500 118 1 A 2057 THR 1 0.740 119 1 A 2058 GLU 1 0.590 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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