data_SMR-fe550918475eb98e993b45800a1841f4_1 _entry.id SMR-fe550918475eb98e993b45800a1841f4_1 _struct.entry_id SMR-fe550918475eb98e993b45800a1841f4_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q8IYF1/ ELOA2_HUMAN, Elongin-A2 Estimated model accuracy of this model is 0.056, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IYF1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 97623.634 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ELOA2_HUMAN Q8IYF1 1 ;MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQHVGDFARDLA ARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWGFPENATAPRSPSHSPEHRRTARRTPPGQQ RPHPRSHSREPRAERKCPRIAPADSGRYRASPTRTAPLRMPEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQGGPLLCPG CQGQPQGKAVVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDFK TDKEGGQAGSGQRVPALEEAPDSHQKRPQHSHSNKKRPSLDGRDPGNGTHGLSPEEKEQLSNDRETQEGK PPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQLRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGT RESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGPKTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTSQAKPE ALSSPKFREEAAFPGRRVNAKMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLE GWRPDQLYRRKKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSAR GNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEKSAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQSSSGGGRDSSSS ILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKTRKQAAKKVAPLMAKAIRDYKRRFSRR ; Elongin-A2 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 753 1 753 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ELOA2_HUMAN Q8IYF1 . 1 753 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-04-17 A4CFDF5A0D3AD529 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQHVGDFARDLA ARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWGFPENATAPRSPSHSPEHRRTARRTPPGQQ RPHPRSHSREPRAERKCPRIAPADSGRYRASPTRTAPLRMPEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQGGPLLCPG CQGQPQGKAVVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDFK TDKEGGQAGSGQRVPALEEAPDSHQKRPQHSHSNKKRPSLDGRDPGNGTHGLSPEEKEQLSNDRETQEGK PPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQLRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGT RESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGPKTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTSQAKPE ALSSPKFREEAAFPGRRVNAKMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLE GWRPDQLYRRKKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSAR GNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEKSAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQSSSGGGRDSSSS ILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKTRKQAAKKVAPLMAKAIRDYKRRFSRR ; ;MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQHVGDFARDLA ARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWGFPENATAPRSPSHSPEHRRTARRTPPGQQ RPHPRSHSREPRAERKCPRIAPADSGRYRASPTRTAPLRMPEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQGGPLLCPG CQGQPQGKAVVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDFK TDKEGGQAGSGQRVPALEEAPDSHQKRPQHSHSNKKRPSLDGRDPGNGTHGLSPEEKEQLSNDRETQEGK PPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQLRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGT RESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGPKTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTSQAKPE ALSSPKFREEAAFPGRRVNAKMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLE GWRPDQLYRRKKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSAR GNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEKSAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQSSSGGGRDSSSS ILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKTRKQAAKKVAPLMAKAIRDYKRRFSRR ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 GLY . 1 5 SER . 1 6 THR . 1 7 THR . 1 8 LEU . 1 9 HIS . 1 10 ALA . 1 11 VAL . 1 12 GLU . 1 13 LYS . 1 14 LEU . 1 15 GLN . 1 16 VAL . 1 17 ARG . 1 18 LEU . 1 19 ALA . 1 20 THR . 1 21 LYS . 1 22 THR . 1 23 GLU . 1 24 PRO . 1 25 LYS . 1 26 LYS . 1 27 LEU . 1 28 GLU . 1 29 LYS . 1 30 TYR . 1 31 LEU . 1 32 GLN . 1 33 LYS . 1 34 LEU . 1 35 SER . 1 36 ALA . 1 37 LEU . 1 38 PRO . 1 39 MET . 1 40 THR . 1 41 ALA . 1 42 ASP . 1 43 ILE . 1 44 LEU . 1 45 ALA . 1 46 GLU . 1 47 THR . 1 48 GLY . 1 49 ILE . 1 50 ARG . 1 51 LYS . 1 52 THR . 1 53 VAL . 1 54 LYS . 1 55 ARG . 1 56 LEU . 1 57 ARG . 1 58 LYS . 1 59 HIS . 1 60 GLN . 1 61 HIS . 1 62 VAL . 1 63 GLY . 1 64 ASP . 1 65 PHE . 1 66 ALA . 1 67 ARG . 1 68 ASP . 1 69 LEU . 1 70 ALA . 1 71 ALA . 1 72 ARG . 1 73 TRP . 1 74 LYS . 1 75 LYS . 1 76 LEU . 1 77 VAL . 1 78 LEU . 1 79 VAL . 1 80 ASP . 1 81 ARG . 1 82 ASN . 1 83 THR . 1 84 ARG . 1 85 PRO . 1 86 GLY . 1 87 PRO . 1 88 GLN . 1 89 ASP . 1 90 PRO . 1 91 GLU . 1 92 GLU 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B 1 594 LYS 594 594 LYS LYS B . B 1 595 GLU 595 595 GLU GLU B . B 1 596 GLU 596 596 GLU GLU B . B 1 597 LYS 597 597 LYS LYS B . B 1 598 PRO 598 598 PRO PRO B . B 1 599 GLN 599 599 GLN GLN B . B 1 600 GLU 600 600 GLU GLU B . B 1 601 ASN 601 601 ASN ASN B . B 1 602 LYS 602 602 LYS LYS B . B 1 603 THR 603 603 THR THR B . B 1 604 TRP 604 604 TRP TRP B . B 1 605 ARG 605 605 ARG ARG B . B 1 606 GLU 606 606 GLU GLU B . B 1 607 GLN 607 607 GLN GLN B . B 1 608 TYR 608 608 TYR TYR B . B 1 609 LEU 609 609 LEU LEU B . B 1 610 ARG 610 610 ARG ARG B . B 1 611 LEU 611 611 LEU LEU B . B 1 612 PRO 612 612 PRO PRO B . B 1 613 ASP 613 613 ASP ASP B . B 1 614 ALA 614 614 ALA ALA B . B 1 615 PRO 615 615 PRO PRO B . B 1 616 GLU 616 616 GLU GLU B . B 1 617 GLN 617 617 GLN GLN B . B 1 618 ARG 618 618 ARG ARG B . B 1 619 LEU 619 619 LEU LEU B . B 1 620 ARG 620 620 ARG ARG B . B 1 621 VAL 621 621 VAL VAL B . B 1 622 MET 622 622 MET MET B . B 1 623 THR 623 ? ? ? B . B 1 624 THR 624 ? ? ? B . B 1 625 ASN 625 ? ? ? B . B 1 626 ILE 626 ? ? ? B . B 1 627 ARG 627 ? ? ? B . B 1 628 SER 628 ? ? ? B . B 1 629 ALA 629 ? ? ? B . B 1 630 ARG 630 ? ? ? B . B 1 631 GLY 631 ? ? ? B . B 1 632 ASN 632 ? ? ? B . B 1 633 ASN 633 ? ? ? B . B 1 634 PRO 634 ? ? ? B . B 1 635 ASN 635 ? ? ? B . B 1 636 GLY 636 ? ? ? B . B 1 637 ARG 637 ? ? ? B . B 1 638 GLU 638 ? ? ? B . B 1 639 ALA 639 ? ? ? B . B 1 640 LYS 640 ? ? ? B . B 1 641 MET 641 ? ? ? B . B 1 642 ILE 642 ? ? ? B . B 1 643 CYS 643 ? ? ? B . B 1 644 PHE 644 ? ? ? B . B 1 645 LYS 645 ? ? ? B . B 1 646 SER 646 ? ? ? B . B 1 647 VAL 647 ? ? ? B . B 1 648 ALA 648 ? ? ? B . B 1 649 LYS 649 ? ? ? B . B 1 650 THR 650 ? ? ? B . B 1 651 PRO 651 ? ? ? B . B 1 652 TYR 652 ? ? ? B . B 1 653 ASP 653 ? ? ? B . B 1 654 THR 654 ? ? ? B . B 1 655 SER 655 ? ? ? B . B 1 656 ARG 656 ? ? ? B . B 1 657 ARG 657 ? ? ? B . B 1 658 GLN 658 ? ? ? B . B 1 659 GLU 659 ? ? ? B . B 1 660 LYS 660 ? ? ? B . B 1 661 SER 661 ? ? ? B . B 1 662 ALA 662 ? ? ? B . B 1 663 GLY 663 ? ? ? B . B 1 664 ASP 664 ? ? ? B . B 1 665 ALA 665 ? ? ? B . B 1 666 ASP 666 ? ? ? B . B 1 667 PRO 667 ? ? ? B . B 1 668 GLU 668 ? ? ? B . B 1 669 ASN 669 ? ? ? B . B 1 670 GLY 670 ? ? ? B . B 1 671 GLU 671 ? ? ? B . B 1 672 ILE 672 ? ? ? B . B 1 673 LYS 673 ? ? ? B . B 1 674 PRO 674 ? ? ? B . B 1 675 ALA 675 ? ? ? B . B 1 676 SER 676 ? ? ? B . B 1 677 LYS 677 ? ? ? B . B 1 678 PRO 678 ? ? ? B . B 1 679 ALA 679 ? ? ? B . B 1 680 GLY 680 ? ? ? B . B 1 681 SER 681 ? ? ? B . B 1 682 SER 682 ? ? ? B . B 1 683 HIS 683 ? ? ? B . B 1 684 THR 684 ? ? ? B . B 1 685 PRO 685 ? ? ? B . B 1 686 SER 686 ? ? ? B . B 1 687 SER 687 ? ? ? B . B 1 688 GLN 688 ? ? ? B . B 1 689 SER 689 ? ? ? B . B 1 690 SER 690 ? ? ? B . B 1 691 SER 691 ? ? ? B . B 1 692 GLY 692 ? ? ? B . B 1 693 GLY 693 ? ? ? B . B 1 694 GLY 694 ? ? ? B . B 1 695 ARG 695 ? ? ? B . B 1 696 ASP 696 ? ? ? B . B 1 697 SER 697 ? ? ? B . B 1 698 SER 698 ? ? ? B . B 1 699 SER 699 ? ? ? B . B 1 700 SER 700 ? ? ? B . B 1 701 ILE 701 ? ? ? B . B 1 702 LEU 702 ? ? ? B . B 1 703 ARG 703 ? ? ? B . B 1 704 TRP 704 ? ? ? B . B 1 705 LEU 705 ? ? ? B . B 1 706 PRO 706 ? ? ? B . B 1 707 GLU 707 ? ? ? B . B 1 708 LYS 708 ? ? ? B . B 1 709 ARG 709 ? ? ? B . B 1 710 ALA 710 ? ? ? B . B 1 711 ASN 711 ? ? ? B . B 1 712 PRO 712 ? ? ? B . B 1 713 CYS 713 ? ? ? B . B 1 714 LEU 714 ? ? ? B . B 1 715 SER 715 ? ? ? B . B 1 716 SER 716 ? ? ? B . B 1 717 SER 717 ? ? ? B . B 1 718 ASN 718 ? ? ? B . B 1 719 GLU 719 ? ? ? B . B 1 720 HIS 720 ? ? ? B . B 1 721 ALA 721 ? ? ? B . B 1 722 ALA 722 ? ? ? B . B 1 723 PRO 723 ? ? ? B . B 1 724 ALA 724 ? ? ? B . B 1 725 ALA 725 ? ? ? B . B 1 726 LYS 726 ? ? ? B . B 1 727 THR 727 ? ? ? B . B 1 728 ARG 728 ? ? ? B . B 1 729 LYS 729 ? ? ? B . B 1 730 GLN 730 ? ? ? B . B 1 731 ALA 731 ? ? ? B . B 1 732 ALA 732 ? ? ? B . B 1 733 LYS 733 ? ? ? B . B 1 734 LYS 734 ? ? ? B . B 1 735 VAL 735 ? ? ? B . B 1 736 ALA 736 ? ? ? B . B 1 737 PRO 737 ? ? ? B . B 1 738 LEU 738 ? ? ? B . B 1 739 MET 739 ? ? ? B . B 1 740 ALA 740 ? ? ? B . B 1 741 LYS 741 ? ? ? B . B 1 742 ALA 742 ? ? ? B . B 1 743 ILE 743 ? ? ? B . B 1 744 ARG 744 ? ? ? B . B 1 745 ASP 745 ? ? ? B . B 1 746 TYR 746 ? ? ? B . B 1 747 LYS 747 ? ? ? B . B 1 748 ARG 748 ? ? ? B . B 1 749 ARG 749 ? ? ? B . B 1 750 PHE 750 ? ? ? B . B 1 751 SER 751 ? ? ? B . B 1 752 ARG 752 ? ? ? B . B 1 753 ARG 753 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Transcription elongation factor B polypeptide 3 {PDB ID=4hfx, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4hfx.1.A}' 'template structure' . 2 'Transcription elongation factor B polypeptide 3 {PDB ID=4hfx, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=4hfx.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 4hfx, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 4hfx, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-26 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-03-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B D 1 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGHHHHHHSHMGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREM YLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP ; ;MGHHHHHHSHMGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREM YLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP ; 2 ;MGHHHHHHSHMGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREM YLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP ; ;MGHHHHHHSHMGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREM YLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 13 97 2 2 13 97 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4hfx 2024-10-30 2 PDB . 4hfx 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 753 2 2 B 1 753 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 753 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 753 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.33e-28 62.353 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 1.33e-28 62.353 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQHVGDFARDLAARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWGFPENATAPRSPSHSPEHRRTARRTPPGQQRPHPRSHSREPRAERKCPRIAPADSGRYRASPTRTAPLRMPEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQGGPLLCPGCQGQPQGKAVVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDFKTDKEGGQAGSGQRVPALEEAPDSHQKRPQHSHSNKKRPSLDGRDPGNGTHGLSPEEKEQLSNDRETQEGKPPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQLRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGTRESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGPKTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTSQAKPEALSSPKFREEAAFPGRRVNAKMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLEGWRPDQLYRRKKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSARGNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEKSAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQSSSGGGRDSSSSILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKTRKQAAKKVAPLMAKAIRDYKRRFSRR 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQHVGDFARDLAARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWGFPENATAPRSPSHSPEHRRTARRTPPGQQRPHPRSHSREPRAERKCPRIAPADSGRYRASPTRTAPLRMPEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQGGPLLCPGCQGQPQGKAVVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDFKTDKEGGQAGSGQRVPALEEAPDSHQKRPQHSHSNKKRPSLDGRDPGNGTHGLSPEEKEQLSNDRETQEGKPPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQLRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGTRESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGPKTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTSQAKPEALSSPKFREEAAFPGRRVNAKMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLEGWRPDQLYRRKKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSARGNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEKSAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQSSSGGGRDSSSSILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKTRKQAAKKVAPLMAKAIRDYKRRFSRR 4 2 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.166}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4hfx.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 557 557 ? A 24.032 34.929 14.488 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 2 C CA . PRO 557 557 ? A 22.974 35.132 13.451 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 3 C C . PRO 557 557 ? A 22.458 33.796 12.987 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 4 O O . PRO 557 557 ? A 21.263 33.564 13.094 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 5 C CB . PRO 557 557 ? A 23.626 36.031 12.388 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 6 C CG . PRO 557 557 ? A 24.999 36.436 12.960 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 7 C CD . PRO 557 557 ? A 25.371 35.323 13.936 1 1 A PRO 0.530 1 ATOM 8 N N . VAL 558 558 ? A 23.296 32.865 12.473 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 9 C CA . VAL 558 558 ? A 22.773 31.613 11.933 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 10 C C . VAL 558 558 ? A 22.074 30.755 12.989 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 11 O O . VAL 558 558 ? A 20.944 30.334 12.776 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 12 C CB . VAL 558 558 ? A 23.824 30.816 11.163 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 13 C CG1 . VAL 558 558 ? A 23.140 29.730 10.313 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 14 C CG2 . VAL 558 558 ? A 24.596 31.731 10.192 1 1 A VAL 0.590 1 ATOM 15 N N . LEU 559 559 ? A 22.678 30.597 14.196 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 16 C CA . LEU 559 559 ? A 22.116 29.887 15.347 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 17 C C . LEU 559 559 ? A 20.725 30.341 15.794 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 18 O O . LEU 559 559 ? A 19.959 29.571 16.367 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 19 C CB . LEU 559 559 ? A 23.035 30.012 16.598 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 20 C CG . LEU 559 559 ? A 24.456 29.423 16.477 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 21 C CD1 . LEU 559 559 ? A 25.236 29.620 17.786 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 22 C CD2 . LEU 559 559 ? A 24.423 27.929 16.142 1 1 A LEU 0.670 1 ATOM 23 N N . GLU 560 560 ? A 20.366 31.613 15.550 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 24 C CA . GLU 560 560 ? A 19.113 32.213 15.961 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 25 C C . GLU 560 560 ? A 17.931 31.753 15.111 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 26 O O . GLU 560 560 ? A 16.776 31.824 15.524 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 27 C CB . GLU 560 560 ? A 19.281 33.748 15.858 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 28 C CG . GLU 560 560 ? A 20.334 34.301 16.856 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 29 C CD . GLU 560 560 ? A 21.071 35.540 16.369 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 30 O OE1 . GLU 560 560 ? A 20.433 36.539 15.977 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 31 O OE2 . GLU 560 560 ? A 22.332 35.471 16.353 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 32 N N . GLY 561 561 ? A 18.193 31.216 13.898 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 33 C CA . GLY 561 561 ? A 17.155 30.623 13.060 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 34 C C . GLY 561 561 ? A 16.836 29.188 13.398 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 35 O O . GLY 561 561 ? A 15.866 28.624 12.884 1 1 A GLY 0.700 1 ATOM 36 N N . TRP 562 562 ? A 17.659 28.557 14.256 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 37 C CA . TRP 562 562 ? A 17.648 27.128 14.499 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 38 C C . TRP 562 562 ? A 16.585 26.672 15.484 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 39 O O . TRP 562 562 ? A 16.181 27.369 16.415 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 40 C CB . TRP 562 562 ? A 19.013 26.609 15.025 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 41 C CG . TRP 562 562 ? A 20.222 26.745 14.112 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 42 C CD1 . TRP 562 562 ? A 20.445 27.511 13.010 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 43 C CD2 . TRP 562 562 ? A 21.443 26.027 14.337 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 44 N NE1 . TRP 562 562 ? A 21.760 27.386 12.597 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 45 C CE2 . TRP 562 562 ? A 22.390 26.478 13.410 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 46 C CE3 . TRP 562 562 ? A 21.755 25.047 15.243 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 47 C CZ2 . TRP 562 562 ? A 23.694 25.967 13.401 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 48 C CZ3 . TRP 562 562 ? A 23.005 24.445 15.151 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 49 C CH2 . TRP 562 562 ? A 23.980 24.893 14.253 1 1 A TRP 0.700 1 ATOM 50 N N . ARG 563 563 ? A 16.119 25.426 15.300 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 51 C CA . ARG 563 563 ? A 15.211 24.772 16.210 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 52 C C . ARG 563 563 ? A 15.893 24.346 17.503 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 53 O O . ARG 563 563 ? A 17.126 24.256 17.563 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 54 C CB . ARG 563 563 ? A 14.659 23.479 15.588 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 55 C CG . ARG 563 563 ? A 13.893 23.639 14.268 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 56 C CD . ARG 563 563 ? A 13.135 22.356 13.901 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 57 N NE . ARG 563 563 ? A 14.082 21.195 13.966 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 58 C CZ . ARG 563 563 ? A 14.749 20.636 12.953 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 59 N NH1 . ARG 563 563 ? A 14.643 21.061 11.703 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 60 N NH2 . ARG 563 563 ? A 15.598 19.643 13.200 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 61 N N . PRO 564 564 ? A 15.152 24.033 18.563 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 62 C CA . PRO 564 564 ? A 15.746 23.592 19.804 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 63 C C . PRO 564 564 ? A 16.625 22.368 19.714 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 64 O O . PRO 564 564 ? A 17.643 22.347 20.416 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 65 C CB . PRO 564 564 ? A 14.556 23.352 20.728 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 66 C CG . PRO 564 564 ? A 13.536 24.389 20.262 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 67 C CD . PRO 564 564 ? A 13.742 24.407 18.749 1 1 A PRO 0.790 1 ATOM 68 N N . ASP 565 565 ? A 16.241 21.367 18.894 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 69 C CA . ASP 565 565 ? A 16.977 20.143 18.667 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 70 C C . ASP 565 565 ? A 18.279 20.357 17.908 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 71 O O . ASP 565 565 ? A 19.326 19.863 18.310 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 72 C CB . ASP 565 565 ? A 16.068 19.080 17.982 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 73 C CG . ASP 565 565 ? A 15.800 19.354 16.513 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 74 O OD1 . ASP 565 565 ? A 15.537 20.521 16.147 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 75 O OD2 . ASP 565 565 ? A 15.895 18.411 15.684 1 1 A ASP 0.790 1 ATOM 76 N N . GLN 566 566 ? A 18.250 21.156 16.823 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 77 C CA . GLN 566 566 ? A 19.408 21.537 16.035 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 78 C C . GLN 566 566 ? A 20.426 22.257 16.895 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 79 O O . GLN 566 566 ? A 21.616 21.944 16.914 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 80 C CB . GLN 566 566 ? A 18.977 22.514 14.910 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 81 C CG . GLN 566 566 ? A 18.153 21.846 13.796 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 82 C CD . GLN 566 566 ? A 17.603 22.864 12.792 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 83 O OE1 . GLN 566 566 ? A 17.203 23.981 13.123 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 84 N NE2 . GLN 566 566 ? A 17.530 22.447 11.510 1 1 A GLN 0.770 1 ATOM 85 N N . LEU 567 567 ? A 19.932 23.215 17.703 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 86 C CA . LEU 567 567 ? A 20.718 23.974 18.648 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 87 C C . LEU 567 567 ? A 21.263 23.107 19.772 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 88 O O . LEU 567 567 ? A 22.352 23.330 20.287 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 89 C CB . LEU 567 567 ? A 19.873 25.157 19.179 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 90 C CG . LEU 567 567 ? A 20.626 26.168 20.063 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 91 C CD1 . LEU 567 567 ? A 21.764 26.846 19.284 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 92 C CD2 . LEU 567 567 ? A 19.663 27.235 20.598 1 1 A LEU 0.770 1 ATOM 93 N N . TYR 568 568 ? A 20.518 22.069 20.203 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 94 C CA . TYR 568 568 ? A 21.027 21.056 21.115 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 95 C C . TYR 568 568 ? A 22.126 20.188 20.504 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 96 O O . TYR 568 568 ? A 23.163 19.973 21.127 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 97 C CB . TYR 568 568 ? A 19.855 20.174 21.637 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 98 C CG . TYR 568 568 ? A 20.290 19.230 22.727 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 99 C CD1 . TYR 568 568 ? A 20.388 19.661 24.060 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 100 C CD2 . TYR 568 568 ? A 20.623 17.900 22.414 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 101 C CE1 . TYR 568 568 ? A 20.837 18.781 25.055 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 102 C CE2 . TYR 568 568 ? A 21.073 17.022 23.411 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 103 C CZ . TYR 568 568 ? A 21.184 17.471 24.730 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 104 O OH . TYR 568 568 ? A 21.638 16.621 25.754 1 1 A TYR 0.740 1 ATOM 105 N N . ARG 569 569 ? A 21.934 19.697 19.262 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 106 C CA . ARG 569 569 ? A 22.863 18.818 18.581 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 107 C C . ARG 569 569 ? A 24.202 19.463 18.305 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 108 O O . ARG 569 569 ? A 25.227 18.815 18.401 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 109 C CB . ARG 569 569 ? A 22.272 18.236 17.271 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 110 C CG . ARG 569 569 ? A 21.139 17.218 17.514 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 111 C CD . ARG 569 569 ? A 20.797 16.338 16.300 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 112 N NE . ARG 569 569 ? A 20.207 17.180 15.212 1 1 A ARG 0.700 1 ATOM 113 C CZ . ARG 569 569 ? 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VAL 558 558 ? B -2.039 19.847 21.245 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 674 C C . VAL 558 558 ? B -0.877 19.770 20.262 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 675 O O . VAL 558 558 ? B 0.192 20.327 20.506 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 676 C CB . VAL 558 558 ? B -2.161 18.589 22.105 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 677 C CG1 . VAL 558 558 ? B -0.872 18.329 22.906 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 678 C CG2 . VAL 558 558 ? B -3.341 18.753 23.082 1 1 B VAL 0.690 1 ATOM 679 N N . LEU 559 559 ? B -1.093 19.148 19.080 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 680 C CA . LEU 559 559 ? B -0.129 19.065 17.987 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 681 C C . LEU 559 559 ? B 0.314 20.431 17.472 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 682 O O . LEU 559 559 ? B 1.492 20.654 17.190 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 683 C CB . LEU 559 559 ? B -0.686 18.250 16.788 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 684 C CG . LEU 559 559 ? B -0.482 16.728 16.865 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 685 C CD1 . LEU 559 559 ? B -1.209 16.056 18.030 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 686 C CD2 . LEU 559 559 ? B -0.924 16.063 15.563 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 687 N N . GLU 560 560 ? B -0.614 21.404 17.386 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 688 C CA . GLU 560 560 ? B -0.332 22.770 16.976 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 689 C C . GLU 560 560 ? B 0.615 23.536 17.900 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 690 O O . GLU 560 560 ? B 1.245 24.511 17.486 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 691 C CB . GLU 560 560 ? B -1.630 23.597 16.893 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 692 C CG . GLU 560 560 ? B -2.623 23.138 15.802 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 693 C CD . GLU 560 560 ? B -3.883 24.005 15.787 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 694 O OE1 . GLU 560 560 ? B -3.934 25.009 16.543 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 695 O OE2 . GLU 560 560 ? B -4.808 23.657 15.015 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 696 N N . GLY 561 561 ? B 0.766 23.111 19.174 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 697 C CA . GLY 561 561 ? B 1.738 23.694 20.099 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 698 C C . GLY 561 561 ? B 3.136 23.141 19.968 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 699 O O . GLY 561 561 ? B 4.109 23.772 20.372 1 1 B GLY 0.690 1 ATOM 700 N N . TRP 562 562 ? B 3.289 21.937 19.391 1 1 B TRP 0.700 1 ATOM 701 C CA . TRP 562 562 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.582 2 1 3 0.056 3 1 4 0.166 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 557 PRO 1 0.530 2 1 A 558 VAL 1 0.590 3 1 A 559 LEU 1 0.670 4 1 A 560 GLU 1 0.650 5 1 A 561 GLY 1 0.700 6 1 A 562 TRP 1 0.700 7 1 A 563 ARG 1 0.750 8 1 A 564 PRO 1 0.790 9 1 A 565 ASP 1 0.790 10 1 A 566 GLN 1 0.770 11 1 A 567 LEU 1 0.770 12 1 A 568 TYR 1 0.740 13 1 A 569 ARG 1 0.700 14 1 A 570 ARG 1 0.670 15 1 A 571 LYS 1 0.690 16 1 A 572 LYS 1 0.660 17 1 A 573 ASP 1 0.640 18 1 A 574 ASN 1 0.610 19 1 A 575 HIS 1 0.560 20 1 A 576 ALA 1 0.700 21 1 A 577 LEU 1 0.640 22 1 A 578 VAL 1 0.670 23 1 A 579 ARG 1 0.570 24 1 A 580 GLU 1 0.620 25 1 A 581 THR 1 0.680 26 1 A 582 ASP 1 0.690 27 1 A 583 GLU 1 0.680 28 1 A 584 LEU 1 0.740 29 1 A 585 ARG 1 0.680 30 1 A 586 ARG 1 0.640 31 1 A 587 ASN 1 0.700 32 1 A 588 HIS 1 0.730 33 1 A 589 CYS 1 0.650 34 1 A 590 PHE 1 0.580 35 1 A 591 GLN 1 0.590 36 1 A 592 ASP 1 0.580 37 1 A 593 PHE 1 0.590 38 1 A 594 LYS 1 0.530 39 1 A 595 GLU 1 0.470 40 1 A 596 GLU 1 0.340 41 1 A 597 LYS 1 0.480 42 1 A 598 PRO 1 0.590 43 1 A 599 GLN 1 0.550 44 1 A 600 GLU 1 0.610 45 1 A 601 ASN 1 0.650 46 1 A 602 LYS 1 0.650 47 1 A 603 THR 1 0.710 48 1 A 604 TRP 1 0.620 49 1 A 605 ARG 1 0.640 50 1 A 606 GLU 1 0.720 51 1 A 607 GLN 1 0.690 52 1 A 608 TYR 1 0.720 53 1 A 609 LEU 1 0.760 54 1 A 610 ARG 1 0.700 55 1 A 611 LEU 1 0.710 56 1 A 612 PRO 1 0.780 57 1 A 613 ASP 1 0.750 58 1 A 614 ALA 1 0.720 59 1 A 615 PRO 1 0.710 60 1 A 616 GLU 1 0.740 61 1 A 617 GLN 1 0.690 62 1 A 618 ARG 1 0.600 63 1 A 619 LEU 1 0.600 64 1 A 620 ARG 1 0.560 65 1 A 621 VAL 1 0.540 66 1 A 622 MET 1 0.500 67 1 A 623 THR 1 0.530 68 1 A 624 THR 1 0.480 69 1 A 625 ASN 1 0.310 70 1 B 551 PRO 1 0.340 71 1 B 552 TYR 1 0.320 72 1 B 553 TRP 1 0.440 73 1 B 554 VAL 1 0.530 74 1 B 555 LEU 1 0.600 75 1 B 556 GLU 1 0.590 76 1 B 557 PRO 1 0.620 77 1 B 558 VAL 1 0.690 78 1 B 559 LEU 1 0.680 79 1 B 560 GLU 1 0.610 80 1 B 561 GLY 1 0.690 81 1 B 562 TRP 1 0.700 82 1 B 563 ARG 1 0.670 83 1 B 564 PRO 1 0.740 84 1 B 565 ASP 1 0.780 85 1 B 566 GLN 1 0.750 86 1 B 567 LEU 1 0.730 87 1 B 568 TYR 1 0.720 88 1 B 569 ARG 1 0.720 89 1 B 570 ARG 1 0.700 90 1 B 571 LYS 1 0.670 91 1 B 572 LYS 1 0.680 92 1 B 573 ASP 1 0.680 93 1 B 574 ASN 1 0.660 94 1 B 575 HIS 1 0.600 95 1 B 576 ALA 1 0.590 96 1 B 577 LEU 1 0.590 97 1 B 578 VAL 1 0.460 98 1 B 579 ARG 1 0.410 99 1 B 580 GLU 1 0.480 100 1 B 581 THR 1 0.420 101 1 B 582 ASP 1 0.430 102 1 B 583 GLU 1 0.460 103 1 B 584 LEU 1 0.310 104 1 B 585 ARG 1 0.330 105 1 B 586 ARG 1 0.360 106 1 B 587 ASN 1 0.310 107 1 B 588 HIS 1 0.220 108 1 B 589 CYS 1 0.220 109 1 B 590 PHE 1 0.250 110 1 B 591 GLN 1 0.230 111 1 B 592 ASP 1 0.230 112 1 B 593 PHE 1 0.250 113 1 B 594 LYS 1 0.360 114 1 B 595 GLU 1 0.390 115 1 B 596 GLU 1 0.360 116 1 B 597 LYS 1 0.250 117 1 B 598 PRO 1 0.510 118 1 B 599 GLN 1 0.490 119 1 B 600 GLU 1 0.490 120 1 B 601 ASN 1 0.540 121 1 B 602 LYS 1 0.560 122 1 B 603 THR 1 0.570 123 1 B 604 TRP 1 0.340 124 1 B 605 ARG 1 0.470 125 1 B 606 GLU 1 0.620 126 1 B 607 GLN 1 0.600 127 1 B 608 TYR 1 0.600 128 1 B 609 LEU 1 0.680 129 1 B 610 ARG 1 0.600 130 1 B 611 LEU 1 0.580 131 1 B 612 PRO 1 0.690 132 1 B 613 ASP 1 0.690 133 1 B 614 ALA 1 0.670 134 1 B 615 PRO 1 0.650 135 1 B 616 GLU 1 0.700 136 1 B 617 GLN 1 0.630 137 1 B 618 ARG 1 0.510 138 1 B 619 LEU 1 0.490 139 1 B 620 ARG 1 0.440 140 1 B 621 VAL 1 0.380 141 1 B 622 MET 1 0.330 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #