data_SMR-7c5761675b2d3ca3e262a854742886b1_1
_entry.id SMR-7c5761675b2d3ca3e262a854742886b1_1
_struct.entry_id SMR-7c5761675b2d3ca3e262a854742886b1_1
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q10124 (isoform 2)/ PQE1_CAEEL, Putative RNA exonuclease pqe-1

Estimated model accuracy of this model is 0.017, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q10124 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 138276.918 1 .
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#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP PQE1_CAEEL Q10124 1
;MFNGGYGSGNSFNLQNYAPIDPMTGIPGFGPSQNAQQQQQQASAPGTSSGGPSQAVSGASSGASMKTEPV
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SSSMSSSTLSYCKKSKETPMSYEEIEQQKKAKRQRNCKTREENRERKRLAQLEELESSETTGVRRTLRST
QDNSDPLDASLATTIEEFRKTKVRRCGGDNV
;
'Putative RNA exonuclease pqe-1'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1081 1 1081
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . PQE1_CAEEL Q10124 Q10124-2 1 1081 6239 'Caenorhabditis elegans'
2003-08-22 65508969A16EB989
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no C
;MFNGGYGSGNSFNLQNYAPIDPMTGIPGFGPSQNAQQQQQQASAPGTSSGGPSQAVSGASSGASMKTEPV
ARQVSTAQMKRDLEQAAVYVPTPIPEGSTQPQQRQQQQSQPQARQMSTQQAANLRKNAAAAGTPPKQAMQ
GASREQGNAHQPTAGQIPQSSNQPAQQTHNVPRMPQPLQQVPHPSPVRGSHPAAQQVQNAPQRIPQHVPM
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TLDEDAPRRVQVKQEIPEVSSTSDATKSDAAPTARGAVRIKQEVESDVAPNTILISAKKFERMKAEAEDK
EDMKKKIAALQEALFNIQEERRVEKEIAAFATTNQAVPQNQPASSVQIAQVSTSESDAPGTSEAAATETM
TSPKTKNNVIVETEGEQEEDEDEIPIKKSKKRRAKIVSNDEEEEPVRHPKRRSDEKREKRHVSYAESDDD
MPVVKKKRRNQSPEDPEYSAASPSEDEDDDIGSFVVSDNEDDDADSFVVGDDEPIEYEEEDEDDMIERRS
SRKRRSDSRSKKSATPTDRRRSRDTPTGSRSMRSTSPNDRRKSRETPPGNRSMRRTSPSDGRKSRDTPTA
SSSMSSSTLSYCKKSKETPMSYEEIEQQKKAKRQRNCKTREENRERKRLAQLEELESSETTGVRRTLRST
QDNSDPLDASLATTIEEFRKTKVRRCGGDNV
;

;MFNGGYGSGNSFNLQNYAPIDPMTGIPGFGPSQNAQQQQQQASAPGTSSGGPSQAVSGASSGASMKTEPV
ARQVSTAQMKRDLEQAAVYVPTPIPEGSTQPQQRQQQQSQPQARQMSTQQAANLRKNAAAAGTPPKQAMQ
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QDNSDPLDASLATTIEEFRKTKVRRCGGDNV
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
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1 1 MET .
1 2 PHE .
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1 5 GLY .
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1 11 SER .
1 12 PHE .
1 13 ASN .
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1 15 GLN .
1 16 ASN .
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1 135 PRO .
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1 154 ALA .
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1 159 GLN .
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1 161 SER .
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1 163 GLN .
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1 166 GLN .
1 167 GLN .
1 168 THR .
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1 173 ARG .
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1 186 PRO .
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1 1040 THR .
1 1041 THR .
1 1042 GLY .
1 1043 VAL .
1 1044 ARG .
1 1045 ARG .
1 1046 THR .
1 1047 LEU .
1 1048 ARG .
1 1049 SER .
1 1050 THR .
1 1051 GLN .
1 1052 ASP .
1 1053 ASN .
1 1054 SER .
1 1055 ASP .
1 1056 PRO .
1 1057 LEU .
1 1058 ASP .
1 1059 ALA .
1 1060 SER .
1 1061 LEU .
1 1062 ALA .
1 1063 THR .
1 1064 THR .
1 1065 ILE .
1 1066 GLU .
1 1067 GLU .
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1 1071 THR .
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1 1073 VAL .
1 1074 ARG .
1 1075 ARG .
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1 1078 GLY .
1 1079 ASP .
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1 1081 VAL .
#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
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_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
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A 1 2 PHE 2 ? ? ? C .
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A 1 9 GLY 9 ? ? ? C .
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A 1 703 MET 703 703 MET MET C .
A 1 704 LYS 704 704 LYS LYS C .
A 1 705 LYS 705 705 LYS LYS C .
A 1 706 LYS 706 706 LYS LYS C .
A 1 707 ILE 707 707 ILE ILE C .
A 1 708 ALA 708 708 ALA ALA C .
A 1 709 ALA 709 709 ALA ALA C .
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A 1 711 GLN 711 711 GLN GLN C .
A 1 712 GLU 712 712 GLU GLU C .
A 1 713 ALA 713 713 ALA ALA C .
A 1 714 LEU 714 714 LEU LEU C .
A 1 715 PHE 715 715 PHE PHE C .
A 1 716 ASN 716 716 ASN ASN C .
A 1 717 ILE 717 717 ILE ILE C .
A 1 718 GLN 718 718 GLN GLN C .
A 1 719 GLU 719 719 GLU GLU C .
A 1 720 GLU 720 720 GLU GLU C .
A 1 721 ARG 721 721 ARG ARG C .
A 1 722 ARG 722 722 ARG ARG C .
A 1 723 VAL 723 723 VAL VAL C .
A 1 724 GLU 724 724 GLU GLU C .
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A 1 731 ALA 731 731 ALA ALA C .
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A 1 807 VAL 807 ? ? ? C .
A 1 808 SER 808 ? ? ? C .
A 1 809 ASN 809 ? ? ? C .
A 1 810 ASP 810 ? ? ? C .
A 1 811 GLU 811 ? ? ? C .
A 1 812 GLU 812 ? ? ? C .
A 1 813 GLU 813 ? ? ? C .
A 1 814 GLU 814 ? ? ? C .
A 1 815 PRO 815 ? ? ? C .
A 1 816 VAL 816 ? ? ? C .
A 1 817 ARG 817 ? ? ? C .
A 1 818 HIS 818 ? ? ? C .
A 1 819 PRO 819 ? ? ? C .
A 1 820 LYS 820 ? ? ? C .
A 1 821 ARG 821 ? ? ? C .
A 1 822 ARG 822 ? ? ? C .
A 1 823 SER 823 ? ? ? C .
A 1 824 ASP 824 ? ? ? C .
A 1 825 GLU 825 ? ? ? C .
A 1 826 LYS 826 ? ? ? C .
A 1 827 ARG 827 ? ? ? C .
A 1 828 GLU 828 ? ? ? C .
A 1 829 LYS 829 ? ? ? C .
A 1 830 ARG 830 ? ? ? C .
A 1 831 HIS 831 ? ? ? C .
A 1 832 VAL 832 ? ? ? C .
A 1 833 SER 833 ? ? ? C .
A 1 834 TYR 834 ? ? ? C .
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A 1 836 GLU 836 ? ? ? C .
A 1 837 SER 837 ? ? ? C .
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A 1 839 ASP 839 ? ? ? C .
A 1 840 ASP 840 ? ? ? C .
A 1 841 MET 841 ? ? ? C .
A 1 842 PRO 842 ? ? ? C .
A 1 843 VAL 843 ? ? ? C .
A 1 844 VAL 844 ? ? ? C .
A 1 845 LYS 845 ? ? ? C .
A 1 846 LYS 846 ? ? ? C .
A 1 847 LYS 847 ? ? ? C .
A 1 848 ARG 848 ? ? ? C .
A 1 849 ARG 849 ? ? ? C .
A 1 850 ASN 850 ? ? ? C .
A 1 851 GLN 851 ? ? ? C .
A 1 852 SER 852 ? ? ? C .
A 1 853 PRO 853 ? ? ? C .
A 1 854 GLU 854 ? ? ? C .
A 1 855 ASP 855 ? ? ? C .
A 1 856 PRO 856 ? ? ? C .
A 1 857 GLU 857 ? ? ? C .
A 1 858 TYR 858 ? ? ? C .
A 1 859 SER 859 ? ? ? C .
A 1 860 ALA 860 ? ? ? C .
A 1 861 ALA 861 ? ? ? C .
A 1 862 SER 862 ? ? ? C .
A 1 863 PRO 863 ? ? ? C .
A 1 864 SER 864 ? ? ? C .
A 1 865 GLU 865 ? ? ? C .
A 1 866 ASP 866 ? ? ? C .
A 1 867 GLU 867 ? ? ? C .
A 1 868 ASP 868 ? ? ? C .
A 1 869 ASP 869 ? ? ? C .
A 1 870 ASP 870 ? ? ? C .
A 1 871 ILE 871 ? ? ? C .
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A 1 874 PHE 874 ? ? ? C .
A 1 875 VAL 875 ? ? ? C .
A 1 876 VAL 876 ? ? ? C .
A 1 877 SER 877 ? ? ? C .
A 1 878 ASP 878 ? ? ? C .
A 1 879 ASN 879 ? ? ? C .
A 1 880 GLU 880 ? ? ? C .
A 1 881 ASP 881 ? ? ? C .
A 1 882 ASP 882 ? ? ? C .
A 1 883 ASP 883 ? ? ? C .
A 1 884 ALA 884 ? ? ? C .
A 1 885 ASP 885 ? ? ? C .
A 1 886 SER 886 ? ? ? C .
A 1 887 PHE 887 ? ? ? C .
A 1 888 VAL 888 ? ? ? C .
A 1 889 VAL 889 ? ? ? C .
A 1 890 GLY 890 ? ? ? C .
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A 1 892 ASP 892 ? ? ? C .
A 1 893 GLU 893 ? ? ? C .
A 1 894 PRO 894 ? ? ? C .
A 1 895 ILE 895 ? ? ? C .
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A 1 897 TYR 897 ? ? ? C .
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A 1 903 ASP 903 ? ? ? C .
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A 1 905 MET 905 ? ? ? C .
A 1 906 ILE 906 ? ? ? C .
A 1 907 GLU 907 ? ? ? C .
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A 1 909 ARG 909 ? ? ? C .
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A 1 911 SER 911 ? ? ? C .
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A 1 913 LYS 913 ? ? ? C .
A 1 914 ARG 914 ? ? ? C .
A 1 915 ARG 915 ? ? ? C .
A 1 916 SER 916 ? ? ? C .
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A 1 918 SER 918 ? ? ? C .
A 1 919 ARG 919 ? ? ? C .
A 1 920 SER 920 ? ? ? C .
A 1 921 LYS 921 ? ? ? C .
A 1 922 LYS 922 ? ? ? C .
A 1 923 SER 923 ? ? ? C .
A 1 924 ALA 924 ? ? ? C .
A 1 925 THR 925 ? ? ? C .
A 1 926 PRO 926 ? ? ? C .
A 1 927 THR 927 ? ? ? C .
A 1 928 ASP 928 ? ? ? C .
A 1 929 ARG 929 ? ? ? C .
A 1 930 ARG 930 ? ? ? C .
A 1 931 ARG 931 ? ? ? C .
A 1 932 SER 932 ? ? ? C .
A 1 933 ARG 933 ? ? ? C .
A 1 934 ASP 934 ? ? ? C .
A 1 935 THR 935 ? ? ? C .
A 1 936 PRO 936 ? ? ? C .
A 1 937 THR 937 ? ? ? C .
A 1 938 GLY 938 ? ? ? C .
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A 1 941 SER 941 ? ? ? C .
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A 1 943 ARG 943 ? ? ? C .
A 1 944 SER 944 ? ? ? C .
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A 1 946 SER 946 ? ? ? C .
A 1 947 PRO 947 ? ? ? C .
A 1 948 ASN 948 ? ? ? C .
A 1 949 ASP 949 ? ? ? C .
A 1 950 ARG 950 ? ? ? C .
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A 1 969 SER 969 ? ? ? C .
A 1 970 ASP 970 ? ? ? C .
A 1 971 GLY 971 ? ? ? C .
A 1 972 ARG 972 ? ? ? C .
A 1 973 LYS 973 ? ? ? C .
A 1 974 SER 974 ? ? ? C .
A 1 975 ARG 975 ? ? ? C .
A 1 976 ASP 976 ? ? ? C .
A 1 977 THR 977 ? ? ? C .
A 1 978 PRO 978 ? ? ? C .
A 1 979 THR 979 ? ? ? C .
A 1 980 ALA 980 ? ? ? C .
A 1 981 SER 981 ? ? ? C .
A 1 982 SER 982 ? ? ? C .
A 1 983 SER 983 ? ? ? C .
A 1 984 MET 984 ? ? ? C .
A 1 985 SER 985 ? ? ? C .
A 1 986 SER 986 ? ? ? C .
A 1 987 SER 987 ? ? ? C .
A 1 988 THR 988 ? ? ? C .
A 1 989 LEU 989 ? ? ? C .
A 1 990 SER 990 ? ? ? C .
A 1 991 TYR 991 ? ? ? C .
A 1 992 CYS 992 ? ? ? C .
A 1 993 LYS 993 ? ? ? C .
A 1 994 LYS 994 ? ? ? C .
A 1 995 SER 995 ? ? ? C .
A 1 996 LYS 996 ? ? ? C .
A 1 997 GLU 997 ? ? ? C .
A 1 998 THR 998 ? ? ? C .
A 1 999 PRO 999 ? ? ? C .
A 1 1000 MET 1000 ? ? ? C .
A 1 1001 SER 1001 ? ? ? C .
A 1 1002 TYR 1002 ? ? ? C .
A 1 1003 GLU 1003 ? ? ? C .
A 1 1004 GLU 1004 ? ? ? C .
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A 1 1006 GLU 1006 ? ? ? C .
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A 1 1008 GLN 1008 ? ? ? C .
A 1 1009 LYS 1009 ? ? ? C .
A 1 1010 LYS 1010 ? ? ? C .
A 1 1011 ALA 1011 ? ? ? C .
A 1 1012 LYS 1012 ? ? ? C .
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A 1 1014 GLN 1014 ? ? ? C .
A 1 1015 ARG 1015 ? ? ? C .
A 1 1016 ASN 1016 ? ? ? C .
A 1 1017 CYS 1017 ? ? ? C .
A 1 1018 LYS 1018 ? ? ? C .
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A 1 1021 GLU 1021 ? ? ? C .
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A 1 1026 ARG 1026 ? ? ? C .
A 1 1027 LYS 1027 ? ? ? C .
A 1 1028 ARG 1028 ? ? ? C .
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A 1 1033 GLU 1033 ? ? ? C .
A 1 1034 GLU 1034 ? ? ? C .
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A 1 1036 GLU 1036 ? ? ? C .
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A 1 1045 ARG 1045 ? ? ? C .
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A 1 1051 GLN 1051 ? ? ? C .
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A 1 1060 SER 1060 ? ? ? C .
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A 1 1062 ALA 1062 ? ? ? C .
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A 1 1067 GLU 1067 ? ? ? C .
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A 1 1075 ARG 1075 ? ? ? C .
A 1 1076 CYS 1076 ? ? ? C .
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A 1 1078 GLY 1078 ? ? ? C .
A 1 1079 ASP 1079 ? ? ? C .
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A 1 1081 VAL 1081 ? ? ? C .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'DNA gyrase subunit A {PDB ID=4tma, label_asym_id=C, auth_asym_id=C, SMTL ID=4tma.1.C}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 4tma, label_asym_id=C'
'target-template alignment' .
4 'model 1' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-26
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-03-21
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A C 1 1 C
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MSDLAREITPVNIEEELKSSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLYAMNVLGNDWNKAYKKSARVV
GDVIGKYHPHGDSAVYDTIVRMAQPFSLRYMLVDGQGNFGSIDGDSAAAMRYTEIRLAKIAHELMADLEK
ETVDFVDNYDGTEKIPDVMPTKIPNLLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLTEVINGCLAYIDDEDISIEGLME
HIPGPDFPTAAIINGRRGIEEAYRTGRGKVYIRARAEVEVDAKTGRETIIVHEIPYQVNKARLIEKIAEL
VKEKRVEGISALRDESDKDGMRIVIEVKRDAVGEVVLNNLYSQTQLQVSFGINMVALHHGQPKIMNLKDI
IAAFVRHRREVVTRRTIFELRKARDRAHILEALAVALANIDPIIELIRHAPTPAEAKTALVANPWQLGNV
AAMLERAGDDAARPEWLEPEFGVRDGLYYLTEQQAQAILDLRLQKLTGLEHEKLLDEYKELLDQIAELLR
ILGSADRLMEVIREELELVREQFGDKRRTEITANS
;

;MSDLAREITPVNIEEELKSSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLYAMNVLGNDWNKAYKKSARVV
GDVIGKYHPHGDSAVYDTIVRMAQPFSLRYMLVDGQGNFGSIDGDSAAAMRYTEIRLAKIAHELMADLEK
ETVDFVDNYDGTEKIPDVMPTKIPNLLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLTEVINGCLAYIDDEDISIEGLME
HIPGPDFPTAAIINGRRGIEEAYRTGRGKVYIRARAEVEVDAKTGRETIIVHEIPYQVNKARLIEKIAEL
VKEKRVEGISALRDESDKDGMRIVIEVKRDAVGEVVLNNLYSQTQLQVSFGINMVALHHGQPKIMNLKDI
IAAFVRHRREVVTRRTIFELRKARDRAHILEALAVALANIDPIIELIRHAPTPAEAKTALVANPWQLGNV
AAMLERAGDDAARPEWLEPEFGVRDGLYYLTEQQAQAILDLRLQKLTGLEHEKLLDEYKELLDQIAELLR
ILGSADRLMEVIREELELVREQFGDKRRTEITANS
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 471 514
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 4tma 2023-09-27
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1081
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1082 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 39.000 11.628
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MFNGGYGSGNSFNLQNYAPIDPMTGIPGFGPSQNAQQQQQQASAPGTSSGGPSQAVSGASSGASMKTEPVARQVSTAQMKRDLEQAAVYVPTPIPEGSTQPQQRQQQQSQPQARQMSTQQAANLRKNAAAAGTPPKQAMQGASREQGNAHQPTAGQIPQSSNQPAQQTHNVPRMPQPLQQVPHPSPVRGSHPAAQQVQNAPQRIPQHVPMPQGVAPHQVIQQVRAPNIGASQMVQQAPSRGHTGAAPASRMAQQPVPLHQGVAPHQAAPQTIQQTPARGRPANAQLAQNAQQRNPQQVPMPQGVAPHHIPPQALGPHGAAPQMTQQAPARGPSGAAQHAQNAHRMTHQQVPLQAPVQGPHRGAPQMAQQPGPHGAAQHPSSGTVAPMHITSLPGNHPLNRTHLLFNRQVVPALDIRNLIAQHRLMVDDFVRAQICYRLPENHQDYWPPGGHPIPMQQQQMRQGAGLPNMAMPPPPLMRHPGPHQNPIHAMQSMQVQPPLSPDQMNMQMFQQRALMMQQQAMQMQMQNPPPVHQQPPPQQPPQQQRQKQQRSQPAPARVPPQVPSQVPVTGGVAADEPPPPCSYSPVAQSSESKIEPVDVKPRVAPVPPQVPVTPTKPVITNNKKKRIDVVTLDEDAPRRVQVKQEIPEVSSTSDATKSDAAPTARGAVRIKQEVESDVAPNTILISAKKFERMKAEAEDKEDMKKKIAALQEALFNIQEERR-VEKEIAAFATTNQAVPQNQPASSVQIAQVSTSESDAPGTSEAAATETMTSPKTKNNVIVETEGEQEEDEDEIPIKKSKKRRAKIVSNDEEEEPVRHPKRRSDEKREKRHVSYAESDDDMPVVKKKRRNQSPEDPEYSAASPSEDEDDDIGSFVVSDNEDDDADSFVVGDDEPIEYEEEDEDDMIERRSSRKRRSDSRSKKSATPTDRRRSRDTPTGSRSMRSTSPNDRRKSRETPPGNRSMRRTSPSDGRKSRDTPTASSSMSSSTLSYCKKSKETPMSYEEIEQQKKAKRQRNCKTREENRERKRLAQLEELESSETTGVRRTLRSTQDNSDPLDASLATTIEEFRKTKVRRCGGDNV
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HEKLLDEYKELLDQIAELLRILGSADRLMEVIREELELVREQFG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
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_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4tma.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
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ATOM 3 C C . MET 693 693 ? A 81.892 104.155 445.419 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 4 O O . MET 693 693 ? A 81.191 103.516 446.195 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 5 C CB . MET 693 693 ? A 81.268 105.473 443.401 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 6 C CG . MET 693 693 ? A 80.228 104.421 442.944 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 7 S SD . MET 693 693 ? A 80.028 104.296 441.143 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 8 C CE . MET 693 693 ? A 81.557 103.388 440.781 1 1 C MET 0.600 1
ATOM 9 N N . LYS 694 694 ? A 83.061 103.649 444.964 1 1 C LYS 0.590 1
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ATOM 11 C C . LYS 694 694 ? A 83.859 102.368 446.945 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 12 O O . LYS 694 694 ? A 83.490 101.406 447.609 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 13 C CB . LYS 694 694 ? A 84.932 102.059 444.691 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 14 C CG . LYS 694 694 ? A 84.724 101.721 443.204 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 15 C CD . LYS 694 694 ? A 86.049 101.438 442.472 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 16 C CE . LYS 694 694 ? A 85.868 101.051 441.001 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 17 N NZ . LYS 694 694 ? A 87.188 100.833 440.363 1 1 C LYS 0.590 1
ATOM 18 N N . ALA 695 695 ? A 84.394 103.466 447.517 1 1 C ALA 0.750 1
ATOM 19 C CA . ALA 695 695 ? A 84.592 103.616 448.949 1 1 C ALA 0.750 1
ATOM 20 C C . ALA 695 695 ? A 83.325 103.385 449.768 1 1 C ALA 0.750 1
ATOM 21 O O . ALA 695 695 ? A 83.231 102.458 450.567 1 1 C ALA 0.750 1
ATOM 22 C CB . ALA 695 695 ? A 85.130 105.042 449.186 1 1 C ALA 0.750 1
ATOM 23 N N . GLU 696 696 ? A 82.262 104.140 449.469 1 1 C GLU 0.700 1
ATOM 24 C CA . GLU 696 696 ? A 80.971 104.016 450.099 1 1 C GLU 0.700 1
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ATOM 26 O O . GLU 696 696 ? A 79.508 102.199 450.682 1 1 C GLU 0.700 1
ATOM 27 C CB . GLU 696 696 ? A 80.063 105.195 449.671 1 1 C GLU 0.700 1
ATOM 28 C CG . GLU 696 696 ? A 80.683 106.617 449.897 1 1 C GLU 0.700 1
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ATOM 30 O OE1 . GLU 696 696 ? A 82.192 108.238 448.912 1 1 C GLU 0.700 1
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ATOM 39 C C . GLU 698 698 ? A 82.438 98.968 451.661 1 1 C GLU 0.730 1
ATOM 40 O O . GLU 698 698 ? A 82.017 98.001 452.311 1 1 C GLU 0.730 1
ATOM 41 C CB . GLU 698 698 ? A 84.364 99.003 450.005 1 1 C GLU 0.730 1
ATOM 42 C CG . GLU 698 698 ? A 84.864 98.522 448.614 1 1 C GLU 0.730 1
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ATOM 44 O OE1 . GLU 698 698 ? A 87.044 99.515 449.017 1 1 C GLU 0.730 1
ATOM 45 O OE2 . GLU 698 698 ? A 86.700 98.441 447.104 1 1 C GLU 0.730 1
ATOM 46 N N . ASP 699 699 ? A 82.395 100.221 452.164 1 1 C ASP 0.740 1
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ATOM 49 O O . ASP 699 699 ? A 80.207 99.394 454.750 1 1 C ASP 0.740 1
ATOM 50 C CB . ASP 699 699 ? A 81.879 102.103 453.708 1 1 C ASP 0.740 1
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ATOM 53 O OD2 . ASP 699 699 ? A 83.284 104.012 453.697 1 1 C ASP 0.740 1
ATOM 54 N N . LYS 700 700 ? A 79.558 100.195 452.769 1 1 C LYS 0.760 1
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ATOM 59 C CG . LYS 700 700 ? A 75.917 99.628 451.641 1 1 C LYS 0.760 1
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ATOM 66 O O . GLU 701 701 ? A 79.149 94.462 454.111 1 1 C GLU 0.760 1
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ATOM 72 N N . ASP 702 702 ? A 80.726 96.033 453.941 1 1 C ASP 0.770 1
ATOM 73 C CA . ASP 702 702 ? A 81.336 95.769 455.234 1 1 C ASP 0.770 1
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ATOM 76 C CB . ASP 702 702 ? A 82.690 96.502 455.310 1 1 C ASP 0.770 1
ATOM 77 C CG . ASP 702 702 ? A 83.728 95.775 454.442 1 1 C ASP 0.770 1
ATOM 78 O OD1 . ASP 702 702 ? A 83.477 94.612 453.990 1 1 C ASP 0.770 1
ATOM 79 O OD2 . ASP 702 702 ? A 84.827 96.358 454.274 1 1 C ASP 0.770 1
ATOM 80 N N . MET 703 703 ? A 79.615 97.142 456.361 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 81 C CA . MET 703 703 ? A 78.507 97.360 457.275 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 82 C C . MET 703 703 ? A 77.434 96.266 457.223 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 83 O O . MET 703 703 ? A 76.923 95.852 458.268 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 84 C CB . MET 703 703 ? A 77.899 98.776 457.120 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 85 C CG . MET 703 703 ? A 78.830 99.913 457.605 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 86 S SD . MET 703 703 ? A 79.402 99.817 459.334 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 87 C CE . MET 703 703 ? A 77.768 100.047 460.087 1 1 C MET 0.740 1
ATOM 88 N N . LYS 704 704 ? A 77.061 95.733 456.046 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 89 C CA . LYS 704 704 ? A 76.179 94.572 455.955 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 90 C C . LYS 704 704 ? A 76.713 93.301 456.594 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 91 O O . LYS 704 704 ? A 75.999 92.585 457.297 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 92 C CB . LYS 704 704 ? A 75.761 94.271 454.520 1 1 C LYS 0.760 1
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ATOM 95 C CE . LYS 704 704 ? A 73.790 96.098 451.802 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 96 N NZ . LYS 704 704 ? A 73.783 95.678 450.396 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 97 N N . LYS 705 705 ? A 78.009 93.020 456.399 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 98 C CA . LYS 705 705 ? A 78.723 91.976 457.109 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 99 C C . LYS 705 705 ? A 78.752 92.196 458.616 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 100 O O . LYS 705 705 ? A 78.553 91.274 459.407 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 101 C CB . LYS 705 705 ? A 80.169 91.884 456.587 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 102 C CG . LYS 705 705 ? A 80.279 91.411 455.131 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 103 C CD . LYS 705 705 ? A 81.733 91.442 454.642 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 104 C CE . LYS 705 705 ? A 81.889 91.017 453.187 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 105 N NZ . LYS 705 705 ? A 83.304 91.190 452.795 1 1 C LYS 0.760 1
ATOM 106 N N . LYS 706 706 ? A 78.980 93.447 459.047 1 1 C LYS 0.750 1
ATOM 107 C CA . LYS 706 706 ? A 78.907 93.843 460.435 1 1 C LYS 0.750 1
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ATOM 115 N N . ILE 707 707 ? A 76.436 94.163 460.464 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 116 C CA . ILE 707 707 ? A 75.083 93.974 460.993 1 1 C ILE 0.740 1
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ATOM 118 O O . ILE 707 707 ? A 74.100 92.071 462.046 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 119 C CB . ILE 707 707 ? A 73.977 94.809 460.329 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 120 C CG1 . ILE 707 707 ? A 73.762 94.422 458.852 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 121 C CG2 . ILE 707 707 ? A 74.316 96.297 460.541 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 122 C CD1 . ILE 707 707 ? A 72.688 95.187 458.072 1 1 C ILE 0.740 1
ATOM 123 N N . ALA 708 708 ? A 75.085 91.691 460.052 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 124 C CA . ALA 708 708 ? A 74.893 90.253 460.068 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 125 C C . ALA 708 708 ? A 75.562 89.599 461.282 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 126 O O . ALA 708 708 ? A 74.894 88.991 462.120 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 127 C CB . ALA 708 708 ? A 75.427 89.664 458.746 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 128 N N . ALA 709 709 ? A 76.869 89.862 461.487 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 129 C CA . ALA 709 709 ? A 77.635 89.404 462.635 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 130 C C . ALA 709 709 ? A 77.093 89.875 463.988 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 131 O O . ALA 709 709 ? A 77.044 89.124 464.963 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 132 C CB . ALA 709 709 ? A 79.102 89.853 462.471 1 1 C ALA 0.800 1
ATOM 133 N N . LEU 710 710 ? A 76.639 91.141 464.090 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 134 C CA . LEU 710 710 ? A 75.945 91.645 465.265 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 135 C C . LEU 710 710 ? A 74.614 90.957 465.573 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 136 O O . LEU 710 710 ? A 74.324 90.627 466.723 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 137 C CB . LEU 710 710 ? A 75.720 93.170 465.169 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 138 C CG . LEU 710 710 ? A 76.991 94.025 465.332 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 139 C CD1 . LEU 710 710 ? A 76.636 95.497 465.097 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 140 C CD2 . LEU 710 710 ? A 77.643 93.844 466.707 1 1 C LEU 0.710 1
ATOM 141 N N . GLN 711 711 ? A 73.771 90.697 464.558 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 142 C CA . GLN 711 711 ? A 72.547 89.925 464.712 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 143 C C . GLN 711 711 ? A 72.803 88.475 465.121 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 144 O O . GLN 711 711 ? A 72.129 87.936 466.001 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 145 C CB . GLN 711 711 ? A 71.698 89.992 463.423 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 146 C CG . GLN 711 711 ? A 71.082 91.387 463.153 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 147 C CD . GLN 711 711 ? A 70.336 91.403 461.817 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 148 O OE1 . GLN 711 711 ? A 70.592 90.615 460.908 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 149 N NE2 . GLN 711 711 ? A 69.358 92.332 461.681 1 1 C GLN 0.710 1
ATOM 150 N N . GLU 712 712 ? A 73.825 87.832 464.530 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 151 C CA . GLU 712 712 ? A 74.313 86.517 464.923 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 152 C C . GLU 712 712 ? A 74.771 86.474 466.388 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 153 O O . GLU 712 712 ? A 74.398 85.559 467.144 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 154 C CB . GLU 712 712 ? A 75.461 86.081 463.972 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 155 C CG . GLU 712 712 ? A 75.012 85.766 462.520 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 156 C CD . GLU 712 712 ? A 76.174 85.498 461.553 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 157 O OE1 . GLU 712 712 ? A 77.355 85.624 461.967 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 158 O OE2 . GLU 712 712 ? A 75.869 85.162 460.379 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 159 N N . ALA 713 713 ? A 75.537 87.479 466.862 1 1 C ALA 0.690 1
ATOM 160 C CA . ALA 713 713 ? A 75.919 87.633 468.260 1 1 C ALA 0.690 1
ATOM 161 C C . ALA 713 713 ? A 74.742 87.818 469.232 1 1 C ALA 0.690 1
ATOM 162 O O . ALA 713 713 ? A 74.669 87.147 470.257 1 1 C ALA 0.690 1
ATOM 163 C CB . ALA 713 713 ? A 76.920 88.801 468.401 1 1 C ALA 0.690 1
ATOM 164 N N . LEU 714 714 ? A 73.769 88.698 468.906 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 165 C CA . LEU 714 714 ? A 72.553 88.910 469.693 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 166 C C . LEU 714 714 ? A 71.642 87.692 469.783 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 167 O O . LEU 714 714 ? A 71.002 87.438 470.802 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 168 C CB . LEU 714 714 ? A 71.704 90.086 469.148 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 169 C CG . LEU 714 714 ? A 72.277 91.497 469.376 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 170 C CD1 . LEU 714 714 ? A 71.380 92.542 468.700 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 171 C CD2 . LEU 714 714 ? A 72.422 91.833 470.865 1 1 C LEU 0.640 1
ATOM 172 N N . PHE 715 715 ? A 71.531 86.921 468.688 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 173 C CA . PHE 715 715 ? A 70.757 85.696 468.634 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 174 C C . PHE 715 715 ? A 71.248 84.606 469.590 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 175 O O . PHE 715 715 ? A 70.454 83.965 470.278 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 176 C CB . PHE 715 715 ? A 70.784 85.197 467.166 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 177 C CG . PHE 715 715 ? A 69.957 83.965 466.952 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 178 C CD1 . PHE 715 715 ? A 70.578 82.708 466.884 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 179 C CD2 . PHE 715 715 ? A 68.558 84.045 466.875 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 180 C CE1 . PHE 715 715 ? A 69.810 81.544 466.766 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 181 C CE2 . PHE 715 715 ? A 67.789 82.882 466.745 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 182 C CZ . PHE 715 715 ? A 68.416 81.631 466.691 1 1 C PHE 0.630 1
ATOM 183 N N . ASN 716 716 ? A 72.574 84.370 469.658 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 184 C CA . ASN 716 716 ? A 73.117 83.260 470.412 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 185 C C . ASN 716 716 ? A 73.977 83.735 471.577 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 186 O O . ASN 716 716 ? A 75.153 84.096 471.408 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 187 C CB . ASN 716 716 ? A 73.936 82.325 469.476 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 188 C CG . ASN 716 716 ? A 74.308 81.021 470.183 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 189 O OD1 . ASN 716 716 ? A 73.881 80.736 471.306 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 190 N ND2 . ASN 716 716 ? A 75.148 80.182 469.526 1 1 C ASN 0.650 1
ATOM 191 N N . ILE 717 717 ? A 73.446 83.596 472.810 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 192 C CA . ILE 717 717 ? A 74.093 83.908 474.087 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 193 C C . ILE 717 717 ? A 75.368 83.132 474.265 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 194 O O . ILE 717 717 ? A 76.340 83.567 474.887 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 195 C CB . ILE 717 717 ? A 73.180 83.602 475.274 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 196 C CG1 . ILE 717 717 ? A 71.924 84.492 475.200 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 197 C CG2 . ILE 717 717 ? A 73.918 83.826 476.618 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 198 C CD1 . ILE 717 717 ? A 70.840 84.111 476.210 1 1 C ILE 0.650 1
ATOM 199 N N . GLN 718 718 ? A 75.419 81.911 473.720 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 200 C CA . GLN 718 718 ? A 76.627 81.141 473.807 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 201 C C . GLN 718 718 ? A 77.788 81.761 473.055 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 202 O O . GLN 718 718 ? A 78.911 81.774 473.557 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 203 C CB . GLN 718 718 ? A 76.438 79.720 473.281 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 204 C CG . GLN 718 718 ? A 75.413 78.852 474.033 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 205 C CD . GLN 718 718 ? A 75.263 77.588 473.184 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 206 O OE1 . GLN 718 718 ? A 76.144 77.255 472.380 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 207 N NE2 . GLN 718 718 ? A 74.113 76.893 473.317 1 1 C GLN 0.670 1
ATOM 208 N N . GLU 719 719 ? A 77.533 82.304 471.845 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 209 C CA . GLU 719 719 ? A 78.526 83.066 471.123 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 210 C C . GLU 719 719 ? A 78.960 84.315 471.860 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 211 O O . GLU 719 719 ? A 80.155 84.563 472.042 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 212 C CB . GLU 719 719 ? A 78.099 83.417 469.674 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 213 C CG . GLU 719 719 ? A 79.311 83.846 468.801 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 214 C CD . GLU 719 719 ? A 80.352 82.719 468.639 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 215 O OE1 . GLU 719 719 ? A 81.408 82.977 468.018 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 216 O OE2 . GLU 719 719 ? A 80.091 81.576 469.144 1 1 C GLU 0.660 1
ATOM 217 N N . GLU 720 720 ? A 78.006 85.076 472.406 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 218 C CA . GLU 720 720 ? A 78.256 86.242 473.250 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 219 C C . GLU 720 720 ? A 79.128 85.979 474.472 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 220 O O . GLU 720 720 ? A 80.040 86.747 474.791 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 221 C CB . GLU 720 720 ? A 76.911 86.800 473.748 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 222 C CG . GLU 720 720 ? A 77.024 88.091 474.592 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 223 C CD . GLU 720 720 ? A 75.694 88.498 475.228 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 224 O OE1 . GLU 720 720 ? A 74.714 87.710 475.137 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 225 O OE2 . GLU 720 720 ? A 75.673 89.584 475.860 1 1 C GLU 0.670 1
ATOM 226 N N . ARG 721 721 ? A 78.904 84.862 475.178 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 227 C CA . ARG 721 721 ? A 79.834 84.396 476.185 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 228 C C . ARG 721 721 ? A 81.170 83.954 475.603 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 229 O O . ARG 721 721 ? A 82.209 84.344 476.110 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 230 C CB . ARG 721 721 ? A 79.223 83.293 477.060 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 231 C CG . ARG 721 721 ? A 78.039 83.778 477.911 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 232 C CD . ARG 721 721 ? A 77.420 82.605 478.648 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 233 N NE . ARG 721 721 ? A 76.273 83.141 479.436 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 234 C CZ . ARG 721 721 ? A 75.408 82.351 480.080 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 235 N NH1 . ARG 721 721 ? A 75.539 81.026 480.042 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 236 N NH2 . ARG 721 721 ? A 74.409 82.886 480.776 1 1 C ARG 0.650 1
ATOM 237 N N . ARG 722 722 ? A 81.213 83.196 474.489 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 238 C CA . ARG 722 722 ? A 82.458 82.760 473.860 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 239 C C . ARG 722 722 ? A 83.321 83.886 473.297 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 240 O O . ARG 722 722 ? A 84.535 83.718 473.131 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 241 C CB . ARG 722 722 ? A 82.228 81.799 472.678 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 242 C CG . ARG 722 722 ? A 81.820 80.371 473.057 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 243 C CD . ARG 722 722 ? A 81.823 79.459 471.833 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 244 N NE . ARG 722 722 ? A 80.643 79.807 470.990 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 245 C CZ . ARG 722 722 ? A 79.481 79.141 470.997 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 246 N NH1 . ARG 722 722 ? A 79.255 78.153 471.856 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 247 N NH2 . ARG 722 722 ? A 78.545 79.495 470.120 1 1 C ARG 0.610 1
ATOM 248 N N . VAL 723 723 ? A 82.725 85.053 472.988 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 249 C CA . VAL 723 723 ? A 83.374 86.342 472.701 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 250 C C . VAL 723 723 ? A 84.239 86.841 473.876 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 251 O O . VAL 723 723 ? A 85.171 87.624 473.667 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 252 C CB . VAL 723 723 ? A 82.342 87.369 472.196 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 253 C CG1 . VAL 723 723 ? A 82.778 88.846 472.222 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 254 C CG2 . VAL 723 723 ? A 81.927 87.045 470.742 1 1 C VAL 0.630 1
ATOM 255 N N . GLU 724 724 ? A 84.109 86.277 475.107 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 256 C CA . GLU 724 724 ? A 85.083 86.359 476.212 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 257 C C . GLU 724 724 ? A 86.557 86.010 475.920 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 258 O O . GLU 724 724 ? A 87.425 86.067 476.790 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 259 C CB . GLU 724 724 ? A 84.661 85.532 477.465 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 260 C CG . GLU 724 724 ? A 84.978 84.013 477.388 1 1 C GLU 0.610 1
ATOM 261 C CD . GLU 724 724 ? A 84.374 83.122 478.486 1 1 C GLU 0.610 1
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ATOM 279 C CD . GLU 726 726 ? A 85.235 91.626 474.333 1 1 C GLU 0.620 1
ATOM 280 O OE1 . GLU 726 726 ? A 84.831 91.838 475.506 1 1 C GLU 0.620 1
ATOM 281 O OE2 . GLU 726 726 ? A 84.681 92.078 473.299 1 1 C GLU 0.620 1
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ATOM 316 N N . THR 732 732 ? A 96.355 87.803 478.347 1 1 C THR 0.590 1
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ATOM 322 C CG2 . THR 732 732 ? A 98.615 87.431 475.254 1 1 C THR 0.590 1
ATOM 323 N N . THR 733 733 ? A 97.647 90.207 477.466 1 1 C THR 0.580 1
ATOM 324 C CA . THR 733 733 ? A 98.320 91.514 477.352 1 1 C THR 0.580 1
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ATOM 330 N N . ASN 734 734 ? A 98.028 92.121 479.735 1 1 C ASN 0.570 1
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ATOM 338 N N . GLN 735 735 ? A 98.722 90.716 482.017 1 1 C GLN 0.550 1
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ATOM 347 O OXT . GLN 735 735 ? A 100.976 89.320 484.501 1 1 C GLN 0.550 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.675
2 1 3 0.017
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 693 MET 1 0.600
2 1 A 694 LYS 1 0.590
3 1 A 695 ALA 1 0.750
4 1 A 696 GLU 1 0.700
5 1 A 697 ALA 1 0.780
6 1 A 698 GLU 1 0.730
7 1 A 699 ASP 1 0.740
8 1 A 700 LYS 1 0.760
9 1 A 701 GLU 1 0.760
10 1 A 702 ASP 1 0.770
11 1 A 703 MET 1 0.740
12 1 A 704 LYS 1 0.760
13 1 A 705 LYS 1 0.760
14 1 A 706 LYS 1 0.750
15 1 A 707 ILE 1 0.740
16 1 A 708 ALA 1 0.800
17 1 A 709 ALA 1 0.800
18 1 A 710 LEU 1 0.710
19 1 A 711 GLN 1 0.710
20 1 A 712 GLU 1 0.670
21 1 A 713 ALA 1 0.690
22 1 A 714 LEU 1 0.640
23 1 A 715 PHE 1 0.630
24 1 A 716 ASN 1 0.650
25 1 A 717 ILE 1 0.650
26 1 A 718 GLN 1 0.670
27 1 A 719 GLU 1 0.660
28 1 A 720 GLU 1 0.670
29 1 A 721 ARG 1 0.650
30 1 A 722 ARG 1 0.610
31 1 A 723 VAL 1 0.630
32 1 A 724 GLU 1 0.610
33 1 A 725 LYS 1 0.620
34 1 A 726 GLU 1 0.620
35 1 A 727 ILE 1 0.620
36 1 A 728 ALA 1 0.650
37 1 A 729 ALA 1 0.650
38 1 A 730 PHE 1 0.570
39 1 A 731 ALA 1 0.630
40 1 A 732 THR 1 0.590
41 1 A 733 THR 1 0.580
42 1 A 734 ASN 1 0.570
43 1 A 735 GLN 1 0.550
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#