data_SMR-429541a261d241d6d346d84e0aae43dc_2 _entry.id SMR-429541a261d241d6d346d84e0aae43dc_2 _struct.entry_id SMR-429541a261d241d6d346d84e0aae43dc_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q99MU3/ DSRAD_MOUSE, Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase Estimated model accuracy of this model is 0.022, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q99MU3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 151839.688 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DSRAD_MOUSE Q99MU3 1 ;MSQGFRGPTGVFPHQTQSYLDPSHEHSKWRYPQPQGPESYPRSFQLQQIEFLKGRLPEAPLIGIQTQSLP PFLPGHWPRFPGPPAQDRQLEIWEFPRSVTLRNQGFHIGPPLPPPHSRGTPWRGADGLCSHFRELSISQS PEQKVLNRLEELGEGKATTAHVLARELRIPKRDINRILYSLEKKGKLHRGRGKPPLWSLVPLSQAWTQPP GVVNPDSCIQEFPRGEPGLDSEDGDPASDLEGPSEPLDMAEIKEKICDYLFNVSNSSALNLAKNIGLTKA RDVTSVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERLQMKRSTHSAPAPTPTAVPEATRSPSFPACHPPPA GASSSVAASKRVENGQEPAIKHESRHEARPGPMRLRPHAYHNGPSRAGYVASENGQWATDDIPDNLNSIH TAPGEFRAIMEMPSFYSPTLPRCSPYKKLTECQLKNPVSGLLEYAQFTSQTCDFNLIEQSGPSHEPRFKF QVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAVKAMAILLREAKAKDSGQPEDLSHCPMEEDSEKPAEAQAPSSSAT SLFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHDPKFQYCVAVGAQTFPPVSAPSKKVAKQMAAEEAM KALQEEAASSADDQSGGANTDSLDESMAPNKIRRIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLIDQSG PPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQDAADAALRVLIGESEKAEQLGFAEVTPVTGASLRRTMLL LSRSPDAHPKTLPLSGSTFHDQIAMLSHRCFNALTNSFQPSLLGRKILAAIIMKRDPEDMGVVVSLGTGN RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNHHTAKNSIFELARGGEKLQIKKTVSFHLYI STAPCGDGALFDKSCSDRAVESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERL RTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPVYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGKAFEDGLRYPFIV NHPKVGRVSVYDSKRQSGKTKETSVNWCMADGYDLEILDGTRGTVDGPGKELSRVSKKNIFLQFKKLCSF RARRDLLQLSYGEAKKAARDYDLAKNYFKKSLRDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPVPND ; 'Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1178 1 1178 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DSRAD_MOUSE Q99MU3 . 1 1178 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-11-14 8C28B71F00744724 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSQGFRGPTGVFPHQTQSYLDPSHEHSKWRYPQPQGPESYPRSFQLQQIEFLKGRLPEAPLIGIQTQSLP PFLPGHWPRFPGPPAQDRQLEIWEFPRSVTLRNQGFHIGPPLPPPHSRGTPWRGADGLCSHFRELSISQS PEQKVLNRLEELGEGKATTAHVLARELRIPKRDINRILYSLEKKGKLHRGRGKPPLWSLVPLSQAWTQPP GVVNPDSCIQEFPRGEPGLDSEDGDPASDLEGPSEPLDMAEIKEKICDYLFNVSNSSALNLAKNIGLTKA RDVTSVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERLQMKRSTHSAPAPTPTAVPEATRSPSFPACHPPPA GASSSVAASKRVENGQEPAIKHESRHEARPGPMRLRPHAYHNGPSRAGYVASENGQWATDDIPDNLNSIH TAPGEFRAIMEMPSFYSPTLPRCSPYKKLTECQLKNPVSGLLEYAQFTSQTCDFNLIEQSGPSHEPRFKF QVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAVKAMAILLREAKAKDSGQPEDLSHCPMEEDSEKPAEAQAPSSSAT SLFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHDPKFQYCVAVGAQTFPPVSAPSKKVAKQMAAEEAM KALQEEAASSADDQSGGANTDSLDESMAPNKIRRIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLIDQSG PPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQDAADAALRVLIGESEKAEQLGFAEVTPVTGASLRRTMLL LSRSPDAHPKTLPLSGSTFHDQIAMLSHRCFNALTNSFQPSLLGRKILAAIIMKRDPEDMGVVVSLGTGN RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNHHTAKNSIFELARGGEKLQIKKTVSFHLYI STAPCGDGALFDKSCSDRAVESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERL RTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPVYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGKAFEDGLRYPFIV NHPKVGRVSVYDSKRQSGKTKETSVNWCMADGYDLEILDGTRGTVDGPGKELSRVSKKNIFLQFKKLCSF RARRDLLQLSYGEAKKAARDYDLAKNYFKKSLRDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPVPND ; ;MSQGFRGPTGVFPHQTQSYLDPSHEHSKWRYPQPQGPESYPRSFQLQQIEFLKGRLPEAPLIGIQTQSLP PFLPGHWPRFPGPPAQDRQLEIWEFPRSVTLRNQGFHIGPPLPPPHSRGTPWRGADGLCSHFRELSISQS PEQKVLNRLEELGEGKATTAHVLARELRIPKRDINRILYSLEKKGKLHRGRGKPPLWSLVPLSQAWTQPP GVVNPDSCIQEFPRGEPGLDSEDGDPASDLEGPSEPLDMAEIKEKICDYLFNVSNSSALNLAKNIGLTKA RDVTSVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERLQMKRSTHSAPAPTPTAVPEATRSPSFPACHPPPA GASSSVAASKRVENGQEPAIKHESRHEARPGPMRLRPHAYHNGPSRAGYVASENGQWATDDIPDNLNSIH TAPGEFRAIMEMPSFYSPTLPRCSPYKKLTECQLKNPVSGLLEYAQFTSQTCDFNLIEQSGPSHEPRFKF QVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAVKAMAILLREAKAKDSGQPEDLSHCPMEEDSEKPAEAQAPSSSAT SLFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHDPKFQYCVAVGAQTFPPVSAPSKKVAKQMAAEEAM KALQEEAASSADDQSGGANTDSLDESMAPNKIRRIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLIDQSG PPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQDAADAALRVLIGESEKAEQLGFAEVTPVTGASLRRTMLL LSRSPDAHPKTLPLSGSTFHDQIAMLSHRCFNALTNSFQPSLLGRKILAAIIMKRDPEDMGVVVSLGTGN RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNHHTAKNSIFELARGGEKLQIKKTVSFHLYI STAPCGDGALFDKSCSDRAVESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERL RTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPVYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGKAFEDGLRYPFIV NHPKVGRVSVYDSKRQSGKTKETSVNWCMADGYDLEILDGTRGTVDGPGKELSRVSKKNIFLQFKKLCSF RARRDLLQLSYGEAKKAARDYDLAKNYFKKSLRDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPVPND ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 GLN . 1 4 GLY . 1 5 PHE . 1 6 ARG . 1 7 GLY . 1 8 PRO . 1 9 THR . 1 10 GLY . 1 11 VAL . 1 12 PHE . 1 13 PRO . 1 14 HIS . 1 15 GLN . 1 16 THR . 1 17 GLN . 1 18 SER . 1 19 TYR . 1 20 LEU . 1 21 ASP . 1 22 PRO . 1 23 SER . 1 24 HIS . 1 25 GLU . 1 26 HIS . 1 27 SER . 1 28 LYS . 1 29 TRP . 1 30 ARG . 1 31 TYR . 1 32 PRO . 1 33 GLN . 1 34 PRO . 1 35 GLN . 1 36 GLY . 1 37 PRO . 1 38 GLU . 1 39 SER . 1 40 TYR . 1 41 PRO . 1 42 ARG . 1 43 SER . 1 44 PHE . 1 45 GLN . 1 46 LEU . 1 47 GLN . 1 48 GLN . 1 49 ILE . 1 50 GLU . 1 51 PHE . 1 52 LEU . 1 53 LYS . 1 54 GLY . 1 55 ARG . 1 56 LEU . 1 57 PRO . 1 58 GLU . 1 59 ALA . 1 60 PRO . 1 61 LEU . 1 62 ILE . 1 63 GLY . 1 64 ILE . 1 65 GLN . 1 66 THR . 1 67 GLN . 1 68 SER . 1 69 LEU . 1 70 PRO . 1 71 PRO . 1 72 PHE . 1 73 LEU . 1 74 PRO . 1 75 GLY . 1 76 HIS . 1 77 TRP . 1 78 PRO . 1 79 ARG . 1 80 PHE . 1 81 PRO . 1 82 GLY . 1 83 PRO . 1 84 PRO . 1 85 ALA . 1 86 GLN . 1 87 ASP . 1 88 ARG . 1 89 GLN . 1 90 LEU . 1 91 GLU . 1 92 ILE . 1 93 TRP . 1 94 GLU . 1 95 PHE . 1 96 PRO . 1 97 ARG . 1 98 SER . 1 99 VAL . 1 100 THR . 1 101 LEU . 1 102 ARG . 1 103 ASN . 1 104 GLN . 1 105 GLY . 1 106 PHE . 1 107 HIS . 1 108 ILE . 1 109 GLY . 1 110 PRO . 1 111 PRO . 1 112 LEU . 1 113 PRO . 1 114 PRO . 1 115 PRO . 1 116 HIS . 1 117 SER . 1 118 ARG . 1 119 GLY . 1 120 THR . 1 121 PRO . 1 122 TRP . 1 123 ARG . 1 124 GLY . 1 125 ALA . 1 126 ASP . 1 127 GLY . 1 128 LEU . 1 129 CYS . 1 130 SER . 1 131 HIS . 1 132 PHE . 1 133 ARG . 1 134 GLU . 1 135 LEU . 1 136 SER . 1 137 ILE . 1 138 SER . 1 139 GLN . 1 140 SER . 1 141 PRO . 1 142 GLU . 1 143 GLN . 1 144 LYS . 1 145 VAL . 1 146 LEU . 1 147 ASN . 1 148 ARG . 1 149 LEU . 1 150 GLU . 1 151 GLU . 1 152 LEU . 1 153 GLY . 1 154 GLU . 1 155 GLY . 1 156 LYS . 1 157 ALA . 1 158 THR . 1 159 THR . 1 160 ALA . 1 161 HIS . 1 162 VAL . 1 163 LEU . 1 164 ALA . 1 165 ARG . 1 166 GLU . 1 167 LEU . 1 168 ARG . 1 169 ILE . 1 170 PRO . 1 171 LYS . 1 172 ARG . 1 173 ASP . 1 174 ILE . 1 175 ASN . 1 176 ARG . 1 177 ILE . 1 178 LEU . 1 179 TYR . 1 180 SER . 1 181 LEU . 1 182 GLU . 1 183 LYS . 1 184 LYS . 1 185 GLY . 1 186 LYS 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A 1 1022 GLN 1022 ? ? ? B . A 1 1023 GLY 1023 ? ? ? B . A 1 1024 HIS 1024 ? ? ? B . A 1 1025 LEU 1025 ? ? ? B . A 1 1026 THR 1026 ? ? ? B . A 1 1027 ARG 1027 ? ? ? B . A 1 1028 ALA 1028 ? ? ? B . A 1 1029 ILE 1029 ? ? ? B . A 1 1030 CYS 1030 ? ? ? B . A 1 1031 CYS 1031 ? ? ? B . A 1 1032 ARG 1032 ? ? ? B . A 1 1033 VAL 1033 ? ? ? B . A 1 1034 THR 1034 ? ? ? B . A 1 1035 ARG 1035 ? ? ? B . A 1 1036 ASP 1036 ? ? ? B . A 1 1037 GLY 1037 ? ? ? B . A 1 1038 LYS 1038 ? ? ? B . A 1 1039 ALA 1039 ? ? ? B . A 1 1040 PHE 1040 ? ? ? B . A 1 1041 GLU 1041 ? ? ? B . A 1 1042 ASP 1042 ? ? ? B . A 1 1043 GLY 1043 ? ? ? B . A 1 1044 LEU 1044 ? ? ? B . A 1 1045 ARG 1045 ? ? ? B . A 1 1046 TYR 1046 ? ? ? B . A 1 1047 PRO 1047 ? ? ? B . A 1 1048 PHE 1048 ? ? ? B . A 1 1049 ILE 1049 ? ? ? B . A 1 1050 VAL 1050 ? ? ? B . A 1 1051 ASN 1051 ? ? ? B . A 1 1052 HIS 1052 ? ? ? B . A 1 1053 PRO 1053 ? ? ? B . A 1 1054 LYS 1054 ? ? ? B . A 1 1055 VAL 1055 ? ? ? B . A 1 1056 GLY 1056 ? ? ? B . A 1 1057 ARG 1057 ? ? ? B . A 1 1058 VAL 1058 ? ? ? B . A 1 1059 SER 1059 ? ? ? B . A 1 1060 VAL 1060 ? ? ? B . A 1 1061 TYR 1061 ? ? ? B . A 1 1062 ASP 1062 ? ? ? B . A 1 1063 SER 1063 ? ? ? B . A 1 1064 LYS 1064 ? ? ? B . A 1 1065 ARG 1065 ? ? ? B . A 1 1066 GLN 1066 ? ? ? B . A 1 1067 SER 1067 ? ? ? B . A 1 1068 GLY 1068 ? ? ? B . A 1 1069 LYS 1069 ? ? ? B . A 1 1070 THR 1070 ? ? ? B . A 1 1071 LYS 1071 ? ? ? B . A 1 1072 GLU 1072 ? ? ? B . A 1 1073 THR 1073 ? ? ? B . A 1 1074 SER 1074 ? ? ? B . A 1 1075 VAL 1075 ? ? ? B . A 1 1076 ASN 1076 ? ? ? B . A 1 1077 TRP 1077 ? ? ? B . A 1 1078 CYS 1078 ? ? ? B . A 1 1079 MET 1079 ? ? ? B . A 1 1080 ALA 1080 ? ? ? B . A 1 1081 ASP 1081 ? ? ? B . A 1 1082 GLY 1082 ? ? ? B . A 1 1083 TYR 1083 ? ? ? B . A 1 1084 ASP 1084 ? ? ? B . A 1 1085 LEU 1085 ? ? ? B . A 1 1086 GLU 1086 ? ? ? B . A 1 1087 ILE 1087 ? ? ? B . A 1 1088 LEU 1088 ? ? ? B . A 1 1089 ASP 1089 ? ? ? B . A 1 1090 GLY 1090 ? ? ? B . A 1 1091 THR 1091 ? ? ? B . A 1 1092 ARG 1092 ? ? ? B . A 1 1093 GLY 1093 ? ? ? B . A 1 1094 THR 1094 ? ? ? B . A 1 1095 VAL 1095 ? ? ? B . A 1 1096 ASP 1096 ? ? ? B . A 1 1097 GLY 1097 ? ? ? B . A 1 1098 PRO 1098 ? ? ? B . A 1 1099 GLY 1099 ? ? ? B . A 1 1100 LYS 1100 ? ? ? B . A 1 1101 GLU 1101 ? ? ? B . A 1 1102 LEU 1102 ? ? ? B . A 1 1103 SER 1103 ? ? ? B . A 1 1104 ARG 1104 ? ? ? B . A 1 1105 VAL 1105 ? ? ? B . A 1 1106 SER 1106 ? ? ? B . A 1 1107 LYS 1107 ? ? ? B . A 1 1108 LYS 1108 ? ? ? B . A 1 1109 ASN 1109 ? ? ? B . A 1 1110 ILE 1110 ? ? ? B . A 1 1111 PHE 1111 ? ? ? B . A 1 1112 LEU 1112 ? ? ? B . A 1 1113 GLN 1113 ? ? ? B . A 1 1114 PHE 1114 ? ? ? B . A 1 1115 LYS 1115 ? ? ? B . A 1 1116 LYS 1116 ? ? ? B . A 1 1117 LEU 1117 ? ? ? B . A 1 1118 CYS 1118 ? ? ? B . A 1 1119 SER 1119 ? ? ? B . A 1 1120 PHE 1120 ? ? ? B . A 1 1121 ARG 1121 ? ? ? B . A 1 1122 ALA 1122 ? ? ? B . A 1 1123 ARG 1123 ? ? ? B . A 1 1124 ARG 1124 ? ? ? B . A 1 1125 ASP 1125 ? ? ? B . A 1 1126 LEU 1126 ? ? ? B . A 1 1127 LEU 1127 ? ? ? B . A 1 1128 GLN 1128 ? ? ? B . A 1 1129 LEU 1129 ? ? ? B . A 1 1130 SER 1130 ? ? ? B . A 1 1131 TYR 1131 ? ? ? B . A 1 1132 GLY 1132 ? ? ? B . A 1 1133 GLU 1133 ? ? ? B . A 1 1134 ALA 1134 ? ? ? B . A 1 1135 LYS 1135 ? ? ? B . A 1 1136 LYS 1136 ? ? ? B . A 1 1137 ALA 1137 ? ? ? B . A 1 1138 ALA 1138 ? ? ? B . A 1 1139 ARG 1139 ? ? ? B . A 1 1140 ASP 1140 ? ? ? B . A 1 1141 TYR 1141 ? ? ? B . A 1 1142 ASP 1142 ? ? ? B . A 1 1143 LEU 1143 ? ? ? B . A 1 1144 ALA 1144 ? ? ? B . A 1 1145 LYS 1145 ? ? ? B . A 1 1146 ASN 1146 ? ? ? B . A 1 1147 TYR 1147 ? ? ? B . A 1 1148 PHE 1148 ? ? ? B . A 1 1149 LYS 1149 ? ? ? B . A 1 1150 LYS 1150 ? ? ? B . A 1 1151 SER 1151 ? ? ? B . A 1 1152 LEU 1152 ? ? ? B . A 1 1153 ARG 1153 ? ? ? B . A 1 1154 ASP 1154 ? ? ? B . A 1 1155 MET 1155 ? ? ? B . A 1 1156 GLY 1156 ? ? ? B . A 1 1157 TYR 1157 ? ? ? B . A 1 1158 GLY 1158 ? ? ? B . A 1 1159 ASN 1159 ? ? ? B . A 1 1160 TRP 1160 ? ? ? B . A 1 1161 ILE 1161 ? ? ? B . A 1 1162 SER 1162 ? ? ? B . A 1 1163 LYS 1163 ? ? ? B . A 1 1164 PRO 1164 ? ? ? B . A 1 1165 GLN 1165 ? ? ? B . A 1 1166 GLU 1166 ? ? ? B . A 1 1167 GLU 1167 ? ? ? B . A 1 1168 LYS 1168 ? ? ? B . A 1 1169 ASN 1169 ? ? ? B . A 1 1170 PHE 1170 ? ? ? B . A 1 1171 TYR 1171 ? ? ? B . A 1 1172 LEU 1172 ? ? ? B . A 1 1173 CYS 1173 ? ? ? B . A 1 1174 PRO 1174 ? ? ? B . A 1 1175 VAL 1175 ? ? ? B . A 1 1176 PRO 1176 ? ? ? B . A 1 1177 ASN 1177 ? ? ? B . A 1 1178 ASP 1178 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Catabolite gene activator {PDB ID=3rdi, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3rdi.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3rdi, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-03-26 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-03-21 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MVLGKPQTDPTLEWFLSHCHIHKYPSKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGKEMILFYLNQGDF IGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLDV TGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIKITRQEIGQIVGCSRETVGRILKMLEDQNLISAHGKTIVVYGTR ; ;MVLGKPQTDPTLEWFLSHCHIHKYPSKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGKEMILFYLNQGDF IGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARRLQVTSEKVGNLAFLDV TGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIKITRQEIGQIVGCSRETVGRILKMLEDQNLISAHGKTIVVYGTR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 138 203 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3rdi 2023-09-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1178 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1189 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.000 14.545 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSQGFRGPTGVFPHQTQSYLDPSHEHSKWRYPQPQGPESYPRSFQLQQIEFLKGRLPEAPLIGIQTQSLPPFLPGHWPRFPGPPAQDRQLEIWEFPRSVTLRNQGFHIGPPLPPPHSRGTPWRGADGLCSHFRELSISQSPEQKVLNRLEELGEGK-----------ATTAHVLARELRIPKRDINRILYSLEKKGKLHRGRGKPPLWSLVPLSQAWTQPPGVVNPDSCIQEFPRGEPGLDSEDGDPASDLEGPSEPLDMAEIKEKICDYLFNVSNSSALNLAKNIGLTKARDVTSVLIDLERQGDVYRQGATPPIWYLTDKKRERLQMKRSTHSAPAPTPTAVPEATRSPSFPACHPPPAGASSSVAASKRVENGQEPAIKHESRHEARPGPMRLRPHAYHNGPSRAGYVASENGQWATDDIPDNLNSIHTAPGEFRAIMEMPSFYSPTLPRCSPYKKLTECQLKNPVSGLLEYAQFTSQTCDFNLIEQSGPSHEPRFKFQVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAVKAMAILLREAKAKDSGQPEDLSHCPMEEDSEKPAEAQAPSSSATSLFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHDPKFQYCVAVGAQTFPPVSAPSKKVAKQMAAEEAMKALQEEAASSADDQSGGANTDSLDESMAPNKIRRIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLIDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQDAADAALRVLIGESEKAEQLGFAEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPDAHPKTLPLSGSTFHDQIAMLSHRCFNALTNSFQPSLLGRKILAAIIMKRDPEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNHHTAKNSIFELARGGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAVESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPVYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGKAFEDGLRYPFIVNHPKVGRVSVYDSKRQSGKTKETSVNWCMADGYDLEILDGTRGTVDGPGKELSRVSKKNIFLQFKKLCSFRARRDLLQLSYGEAKKAARDYDLAKNYFKKSLRDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPVPND 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDVTGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIKITRQEIGQIVGCSRETVGRILKMLEDQNLISAHGKT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3rdi.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 139 139 ? A 40.228 38.872 28.940 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 2 C CA . GLN 139 139 ? A 39.890 37.833 27.910 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 3 C C . GLN 139 139 ? A 38.873 38.395 26.914 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 4 O O . GLN 139 139 ? A 37.868 38.937 27.342 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 5 C CB . GLN 139 139 ? A 39.366 36.563 28.650 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 6 C CG . GLN 139 139 ? A 40.473 35.781 29.408 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 7 C CD . GLN 139 139 ? A 39.900 34.499 30.031 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 139 139 ? A 38.755 34.469 30.450 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 139 139 ? A 40.737 33.433 30.103 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 10 N N . SER 140 140 ? A 39.135 38.339 25.580 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 11 C CA . SER 140 140 ? A 38.211 38.642 24.482 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 12 C C . SER 140 140 ? A 37.049 37.637 24.407 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 13 O O . SER 140 140 ? A 37.072 36.663 25.159 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 14 C CB . SER 140 140 ? A 39.012 38.700 23.131 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 15 O OG . SER 140 140 ? A 39.586 37.437 22.782 1 1 B SER 0.720 1 ATOM 16 N N . PRO 141 141 ? A 36.013 37.779 23.579 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 17 C CA . PRO 141 141 ? A 34.987 36.749 23.379 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 18 C C . PRO 141 141 ? A 35.513 35.345 23.088 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 19 O O . PRO 141 141 ? A 34.977 34.396 23.634 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 20 C CB . PRO 141 141 ? A 34.110 37.305 22.243 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 21 C CG . PRO 141 141 ? A 34.300 38.834 22.266 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 22 C CD . PRO 141 141 ? A 35.625 39.067 22.998 1 1 B PRO 0.610 1 ATOM 23 N N . GLU 142 142 ? A 36.571 35.189 22.254 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 24 C CA . GLU 142 142 ? A 37.176 33.889 21.975 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 25 C C . GLU 142 142 ? A 37.859 33.279 23.194 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 26 O O . GLU 142 142 ? A 37.671 32.117 23.533 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 27 C CB . GLU 142 142 ? A 38.187 33.967 20.787 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 28 C CG . GLU 142 142 ? A 38.747 32.575 20.355 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 29 C CD . GLU 142 142 ? A 39.734 32.547 19.187 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 30 O OE1 . GLU 142 142 ? A 40.009 33.584 18.543 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 31 O OE2 . GLU 142 142 ? A 40.279 31.430 18.933 1 1 B GLU 0.570 1 ATOM 32 N N . GLN 143 143 ? A 38.645 34.100 23.923 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 33 C CA . GLN 143 143 ? A 39.395 33.698 25.099 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 34 C C . GLN 143 143 ? A 38.513 33.291 26.261 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 35 O O . GLN 143 143 ? A 38.781 32.328 26.967 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 36 C CB . GLN 143 143 ? A 40.243 34.880 25.593 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 37 C CG . GLN 143 143 ? A 41.400 35.258 24.659 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 38 C CD . GLN 143 143 ? A 42.084 36.500 25.228 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 39 O OE1 . GLN 143 143 ? A 42.658 36.505 26.302 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 40 N NE2 . GLN 143 143 ? A 41.914 37.644 24.517 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 41 N N . LYS 144 144 ? A 37.422 34.057 26.481 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 42 C CA . LYS 144 144 ? A 36.408 33.730 27.452 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 43 C C . LYS 144 144 ? A 35.662 32.431 27.111 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 44 O O . LYS 144 144 ? A 35.429 31.619 27.996 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 45 C CB . LYS 144 144 ? A 35.376 34.862 27.575 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 46 C CG . LYS 144 144 ? A 35.828 36.191 28.176 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 47 C CD . LYS 144 144 ? A 34.620 37.138 28.218 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 48 C CE . LYS 144 144 ? A 34.958 38.463 28.888 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 49 N NZ . LYS 144 144 ? A 33.832 39.408 28.789 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 50 N N . VAL 145 145 ? A 35.312 32.191 25.803 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 51 C CA . VAL 145 145 ? A 34.728 30.930 25.310 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 52 C C . VAL 145 145 ? A 35.651 29.774 25.572 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 53 O O . VAL 145 145 ? A 35.242 28.737 26.072 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 54 C CB . VAL 145 145 ? A 34.282 30.918 23.829 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 55 C CG1 . VAL 145 145 ? A 33.684 29.553 23.426 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 56 C CG2 . VAL 145 145 ? A 33.133 31.893 23.528 1 1 B VAL 0.620 1 ATOM 57 N N . LEU 146 146 ? A 36.956 29.946 25.324 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 58 C CA . LEU 146 146 ? A 37.905 28.928 25.674 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 59 C C . LEU 146 146 ? A 38.014 28.607 27.176 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 60 O O . LEU 146 146 ? A 37.979 27.441 27.558 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 61 C CB . LEU 146 146 ? A 39.244 29.406 25.106 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 62 C CG . LEU 146 146 ? A 40.388 28.412 25.318 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 63 C CD1 . LEU 146 146 ? A 40.096 27.060 24.640 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 64 C CD2 . LEU 146 146 ? A 41.691 29.047 24.821 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 65 N N . ASN 147 147 ? A 38.079 29.643 28.056 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 66 C CA . ASN 147 147 ? A 38.111 29.512 29.512 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 67 C C . ASN 147 147 ? A 36.863 28.826 30.033 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 68 O O . ASN 147 147 ? A 36.907 27.892 30.826 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 69 C CB . ASN 147 147 ? A 38.240 30.933 30.154 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 70 C CG . ASN 147 147 ? A 38.496 30.841 31.663 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 71 O OD1 . ASN 147 147 ? A 38.742 29.786 32.190 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 72 N ND2 . ASN 147 147 ? A 38.424 31.996 32.381 1 1 B ASN 0.640 1 ATOM 73 N N . ARG 148 148 ? A 35.683 29.220 29.519 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 74 C CA . ARG 148 148 ? A 34.448 28.621 29.953 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 75 C C . ARG 148 148 ? A 34.400 27.120 29.772 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 76 O O . ARG 148 148 ? A 33.938 26.407 30.649 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 77 C CB . ARG 148 148 ? A 33.266 29.249 29.196 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 78 C CG . ARG 148 148 ? A 31.862 28.743 29.579 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 79 C CD . ARG 148 148 ? A 31.422 29.173 30.981 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 80 N NE . ARG 148 148 ? A 31.992 28.282 32.012 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 81 C CZ . ARG 148 148 ? A 31.812 28.537 33.313 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 82 N NH1 . ARG 148 148 ? A 31.243 29.639 33.775 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 83 N NH2 . ARG 148 148 ? A 32.253 27.664 34.210 1 1 B ARG 0.570 1 ATOM 84 N N . LEU 149 149 ? A 34.923 26.620 28.636 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 85 C CA . LEU 149 149 ? A 34.981 25.209 28.345 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 86 C C . LEU 149 149 ? A 35.894 24.424 29.265 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 87 O O . LEU 149 149 ? A 35.523 23.345 29.710 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 88 C CB . LEU 149 149 ? A 35.313 24.981 26.858 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 89 C CG . LEU 149 149 ? A 34.221 25.559 25.927 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 90 C CD1 . LEU 149 149 ? A 34.634 25.461 24.452 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 91 C CD2 . LEU 149 149 ? A 32.839 24.915 26.151 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 92 N N . GLU 150 150 ? A 37.073 24.974 29.635 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 93 C CA . GLU 150 150 ? A 37.912 24.397 30.673 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 94 C C . GLU 150 150 ? A 37.207 24.246 32.018 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 95 O O . GLU 150 150 ? A 37.135 23.159 32.587 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 96 C CB . GLU 150 150 ? A 39.107 25.342 30.914 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 97 C CG . GLU 150 150 ? A 40.062 24.858 32.032 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 98 C CD . GLU 150 150 ? A 41.214 25.824 32.280 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 99 O OE1 . GLU 150 150 ? 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A 32.445 21.045 32.898 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 114 C CB . LEU 152 152 ? A 32.168 23.602 31.178 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 115 C CG . LEU 152 152 ? A 31.255 24.844 31.187 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 116 C CD1 . LEU 152 152 ? A 30.716 25.081 29.772 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 117 C CD2 . LEU 152 152 ? A 30.112 24.786 32.217 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 118 N N . GLY 153 153 ? A 34.587 21.572 32.422 1 1 B GLY 0.620 1 ATOM 119 C CA . GLY 153 153 ? A 35.086 20.213 32.494 1 1 B GLY 0.620 1 ATOM 120 C C . GLY 153 153 ? A 35.188 19.555 31.152 1 1 B GLY 0.620 1 ATOM 121 O O . GLY 153 153 ? A 34.520 19.928 30.183 1 1 B GLY 0.620 1 ATOM 122 N N . GLU 154 154 ? A 36.050 18.526 31.061 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 123 C CA . GLU 154 154 ? A 36.237 17.719 29.873 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 124 C C . GLU 154 154 ? A 34.956 17.038 29.388 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 125 O O . GLU 154 154 ? A 34.333 16.259 30.106 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 126 C CB . GLU 154 154 ? A 37.319 16.641 30.118 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 127 C CG . GLU 154 154 ? A 37.686 15.821 28.856 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 128 C CD . GLU 154 154 ? A 38.778 14.790 29.124 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 129 O OE1 . GLU 154 154 ? A 39.130 14.085 28.145 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 130 O OE2 . GLU 154 154 ? A 39.264 14.705 30.280 1 1 B GLU 0.480 1 ATOM 131 N N . GLY 155 155 ? A 34.516 17.348 28.145 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 132 C CA . GLY 155 155 ? A 33.324 16.746 27.548 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 133 C C . GLY 155 155 ? A 32.031 17.114 28.226 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 134 O O . GLY 155 155 ? A 31.194 16.262 28.521 1 1 B GLY 0.490 1 ATOM 135 N N . LYS 156 156 ? A 31.828 18.413 28.505 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 136 C CA . LYS 156 156 ? A 30.618 18.881 29.137 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 137 C C . LYS 156 156 ? A 29.551 19.227 28.116 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 138 O O . LYS 156 156 ? A 29.730 20.099 27.275 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 139 C CB . LYS 156 156 ? A 30.888 20.136 30.004 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 140 C CG . LYS 156 156 ? A 29.645 20.725 30.705 1 1 B LYS 0.530 1 ATOM 141 C CD . LYS 156 156 ? 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A 28.133 23.583 26.855 1 1 B THR 0.530 1 ATOM 156 N N . THR 159 159 ? A 24.249 23.807 25.805 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 157 C CA . THR 159 159 ? A 23.775 24.494 24.609 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 158 C C . THR 159 159 ? A 24.688 25.656 24.281 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 159 O O . THR 159 159 ? A 25.367 26.218 25.136 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 160 C CB . THR 159 159 ? A 22.290 24.924 24.562 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 161 O OG1 . THR 159 159 ? A 21.969 26.171 25.162 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 162 C CG2 . THR 159 159 ? A 21.410 23.864 25.233 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 163 N N . ALA 160 160 ? A 24.711 26.098 23.009 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 164 C CA . ALA 160 160 ? A 25.477 27.271 22.658 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 165 C C . ALA 160 160 ? A 24.914 28.560 23.296 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 166 O O . ALA 160 160 ? A 25.632 29.508 23.552 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 167 C CB . ALA 160 160 ? A 25.566 27.373 21.119 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 168 N N . HIS 161 161 ? A 23.593 28.582 23.616 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 169 C CA . HIS 161 161 ? 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A 24.795 35.834 14.104 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 268 N NE . ARG 172 172 ? A 25.453 36.022 12.769 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 269 C CZ . ARG 172 172 ? A 25.187 37.066 11.973 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 270 N NH1 . ARG 172 172 ? A 24.272 37.963 12.313 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 271 N NH2 . ARG 172 172 ? A 25.817 37.207 10.808 1 1 B ARG 0.610 1 ATOM 272 N N . ASP 173 173 ? A 27.418 34.238 17.833 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 273 C CA . ASP 173 173 ? A 28.845 34.389 18.054 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 274 C C . ASP 173 173 ? A 29.497 33.174 18.667 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 275 O O . ASP 173 173 ? A 30.578 32.775 18.237 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 276 C CB . ASP 173 173 ? A 29.110 35.638 18.902 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 277 C CG . ASP 173 173 ? A 28.844 36.855 18.038 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 278 O OD1 . ASP 173 173 ? A 28.756 36.710 16.783 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 279 O OD2 . ASP 173 173 ? A 28.715 37.950 18.622 1 1 B ASP 0.660 1 ATOM 280 N N . ILE 174 174 ? A 28.806 32.507 19.621 1 1 B ILE 0.650 1 ATOM 281 C CA . ILE 174 174 ? 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A 30.709 17.713 23.293 1 1 B LYS 0.340 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.587 2 1 3 0.022 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 139 GLN 1 0.530 2 1 A 140 SER 1 0.720 3 1 A 141 PRO 1 0.610 4 1 A 142 GLU 1 0.570 5 1 A 143 GLN 1 0.590 6 1 A 144 LYS 1 0.620 7 1 A 145 VAL 1 0.620 8 1 A 146 LEU 1 0.590 9 1 A 147 ASN 1 0.640 10 1 A 148 ARG 1 0.570 11 1 A 149 LEU 1 0.590 12 1 A 150 GLU 1 0.590 13 1 A 151 GLU 1 0.620 14 1 A 152 LEU 1 0.620 15 1 A 153 GLY 1 0.620 16 1 A 154 GLU 1 0.480 17 1 A 155 GLY 1 0.490 18 1 A 156 LYS 1 0.530 19 1 A 157 ALA 1 0.530 20 1 A 158 THR 1 0.530 21 1 A 159 THR 1 0.550 22 1 A 160 ALA 1 0.650 23 1 A 161 HIS 1 0.590 24 1 A 162 VAL 1 0.640 25 1 A 163 LEU 1 0.630 26 1 A 164 ALA 1 0.650 27 1 A 165 ARG 1 0.580 28 1 A 166 GLU 1 0.560 29 1 A 167 LEU 1 0.590 30 1 A 168 ARG 1 0.570 31 1 A 169 ILE 1 0.600 32 1 A 170 PRO 1 0.630 33 1 A 171 LYS 1 0.640 34 1 A 172 ARG 1 0.610 35 1 A 173 ASP 1 0.660 36 1 A 174 ILE 1 0.650 37 1 A 175 ASN 1 0.650 38 1 A 176 ARG 1 0.630 39 1 A 177 ILE 1 0.650 40 1 A 178 LEU 1 0.620 41 1 A 179 TYR 1 0.600 42 1 A 180 SER 1 0.660 43 1 A 181 LEU 1 0.650 44 1 A 182 GLU 1 0.600 45 1 A 183 LYS 1 0.640 46 1 A 184 LYS 1 0.650 47 1 A 185 GLY 1 0.640 48 1 A 186 LYS 1 0.610 49 1 A 187 LEU 1 0.530 50 1 A 188 HIS 1 0.480 51 1 A 189 ARG 1 0.440 52 1 A 190 GLY 1 0.440 53 1 A 191 ARG 1 0.380 54 1 A 192 GLY 1 0.620 55 1 A 193 LYS 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #