data_SMR-ddaf478262196f2bd4370436ec2d7788_5
_entry.id SMR-ddaf478262196f2bd4370436ec2d7788_5
_struct.entry_id SMR-ddaf478262196f2bd4370436ec2d7788_5
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q9ULV0 (isoform 2)/ MYO5B_HUMAN, Unconventional myosin-Vb

Estimated model accuracy of this model is 0.01, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9ULV0 (isoform 2)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
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_citation.title
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_citation.journal_volume
_citation.page_first
_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 129248.031 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP MYO5B_HUMAN Q9ULV0 1
;MEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKARRELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQ
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TIQAQLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
;
'Unconventional myosin-Vb'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 963 1 963
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . MYO5B_HUMAN Q9ULV0 Q9ULV0-2 1 963 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18
14C45F254C2AFAB5
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no H
;MEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKARRELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQ
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;

;MEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKARRELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQ
LQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVERLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSER
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TIQAQLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 GLU .
1 3 HIS .
1 4 LYS .
1 5 ALA .
1 6 THR .
1 7 THR .
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1 9 GLN .
1 10 LYS .
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1 12 VAL .
1 13 ARG .
1 14 GLY .
1 15 TRP .
1 16 MET .
1 17 ALA .
1 18 ARG .
1 19 ARG .
1 20 HIS .
1 21 PHE .
1 22 GLN .
1 23 ARG .
1 24 LEU .
1 25 ARG .
1 26 ASP .
1 27 ALA .
1 28 ALA .
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1 31 ILE .
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1 36 ARG .
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1 42 ARG .
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1 46 ALA .
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1 48 ARG .
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1 65 GLU .
1 66 ASN .
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1 68 VAL .
1 69 VAL .
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1 71 LEU .
1 72 GLN .
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1 77 GLU .
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1 93 THR .
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1 95 THR .
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1 97 THR .
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1 99 GLU .
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1 101 GLU .
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1 105 LYS .
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1 112 GLN .
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1 155 ARG .
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1 157 ARG .
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1 159 ALA .
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1 161 LEU .
1 162 GLU .
1 163 GLN .
1 164 GLU .
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1 166 ALA .
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1 168 LEU .
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1 170 ASP .
1 171 GLU .
1 172 LYS .
1 173 GLU .
1 174 GLN .
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1 176 ASN .
1 177 ASN .
1 178 GLN .
1 179 ILE .
1 180 LEU .
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1 182 GLN .
1 183 SER .
1 184 LYS .
1 185 ASP .
1 186 GLU .
1 187 PHE .
1 188 ALA .
1 189 GLN .
1 190 ASN .
1 191 SER .
1 192 VAL .
1 193 LYS .
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1 196 LEU .
1 197 MET .
1 198 LYS .
1 199 LYS .
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1 202 GLU .
1 203 GLU .
1 204 GLU .
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1 232 ILE .
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A 1 40 ALA 40 ? ? ? H .
A 1 41 ARG 41 ? ? ? H .
A 1 42 ARG 42 ? ? ? H .
A 1 43 GLU 43 ? ? ? H .
A 1 44 LEU 44 ? ? ? H .
A 1 45 LYS 45 ? ? ? H .
A 1 46 ALA 46 ? ? ? H .
A 1 47 LEU 47 ? ? ? H .
A 1 48 ARG 48 ? ? ? H .
A 1 49 ILE 49 ? ? ? H .
A 1 50 GLU 50 ? ? ? H .
A 1 51 ALA 51 ? ? ? H .
A 1 52 ARG 52 ? ? ? H .
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A 1 293 ARG 293 293 ARG ARG H .
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A 1 295 ARG 295 295 ARG ARG H .
A 1 296 GLU 296 296 GLU GLU H .
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A 1 300 GLU 300 300 GLU GLU H .
A 1 301 ARG 301 301 ARG ARG H .
A 1 302 LYS 302 302 LYS LYS H .
A 1 303 LYS 303 303 LYS LYS H .
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A 1 310 LYS 310 310 LYS LYS H .
A 1 311 ARG 311 311 ARG ARG H .
A 1 312 GLU 312 312 GLU GLU H .
A 1 313 GLN 313 313 GLN GLN H .
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A 1 872 ALA 872 ? ? ? H .
A 1 873 GLU 873 ? ? ? H .
A 1 874 ALA 874 ? ? ? H .
A 1 875 ILE 875 ? ? ? H .
A 1 876 CYS 876 ? ? ? H .
A 1 877 SER 877 ? ? ? H .
A 1 878 LEU 878 ? ? ? H .
A 1 879 CYS 879 ? ? ? H .
A 1 880 THR 880 ? ? ? H .
A 1 881 SER 881 ? ? ? H .
A 1 882 LEU 882 ? ? ? H .
A 1 883 SER 883 ? ? ? H .
A 1 884 THR 884 ? ? ? H .
A 1 885 GLN 885 ? ? ? H .
A 1 886 GLN 886 ? ? ? H .
A 1 887 ILE 887 ? ? ? H .
A 1 888 VAL 888 ? ? ? H .
A 1 889 LYS 889 ? ? ? H .
A 1 890 ILE 890 ? ? ? H .
A 1 891 LEU 891 ? ? ? H .
A 1 892 ASN 892 ? ? ? H .
A 1 893 LEU 893 ? ? ? H .
A 1 894 TYR 894 ? ? ? H .
A 1 895 THR 895 ? ? ? H .
A 1 896 PRO 896 ? ? ? H .
A 1 897 LEU 897 ? ? ? H .
A 1 898 ASN 898 ? ? ? H .
A 1 899 GLU 899 ? ? ? H .
A 1 900 PHE 900 ? ? ? H .
A 1 901 GLU 901 ? ? ? H .
A 1 902 GLU 902 ? ? ? H .
A 1 903 ARG 903 ? ? ? H .
A 1 904 VAL 904 ? ? ? H .
A 1 905 THR 905 ? ? ? H .
A 1 906 VAL 906 ? ? ? H .
A 1 907 ALA 907 ? ? ? H .
A 1 908 PHE 908 ? ? ? H .
A 1 909 ILE 909 ? ? ? H .
A 1 910 ARG 910 ? ? ? H .
A 1 911 THR 911 ? ? ? H .
A 1 912 ILE 912 ? ? ? H .
A 1 913 GLN 913 ? ? ? H .
A 1 914 ALA 914 ? ? ? H .
A 1 915 GLN 915 ? ? ? H .
A 1 916 LEU 916 ? ? ? H .
A 1 917 GLN 917 ? ? ? H .
A 1 918 GLU 918 ? ? ? H .
A 1 919 ARG 919 ? ? ? H .
A 1 920 ASN 920 ? ? ? H .
A 1 921 ASP 921 ? ? ? H .
A 1 922 PRO 922 ? ? ? H .
A 1 923 GLN 923 ? ? ? H .
A 1 924 GLN 924 ? ? ? H .
A 1 925 LEU 925 ? ? ? H .
A 1 926 LEU 926 ? ? ? H .
A 1 927 LEU 927 ? ? ? H .
A 1 928 ASP 928 ? ? ? H .
A 1 929 ALA 929 ? ? ? H .
A 1 930 LYS 930 ? ? ? H .
A 1 931 HIS 931 ? ? ? H .
A 1 932 MET 932 ? ? ? H .
A 1 933 PHE 933 ? ? ? H .
A 1 934 PRO 934 ? ? ? H .
A 1 935 VAL 935 ? ? ? H .
A 1 936 LEU 936 ? ? ? H .
A 1 937 PHE 937 ? ? ? H .
A 1 938 PRO 938 ? ? ? H .
A 1 939 PHE 939 ? ? ? H .
A 1 940 ASN 940 ? ? ? H .
A 1 941 PRO 941 ? ? ? H .
A 1 942 SER 942 ? ? ? H .
A 1 943 SER 943 ? ? ? H .
A 1 944 LEU 944 ? ? ? H .
A 1 945 THR 945 ? ? ? H .
A 1 946 MET 946 ? ? ? H .
A 1 947 ASP 947 ? ? ? H .
A 1 948 SER 948 ? ? ? H .
A 1 949 ILE 949 ? ? ? H .
A 1 950 HIS 950 ? ? ? H .
A 1 951 ILE 951 ? ? ? H .
A 1 952 PRO 952 ? ? ? H .
A 1 953 ALA 953 ? ? ? H .
A 1 954 CYS 954 ? ? ? H .
A 1 955 LEU 955 ? ? ? H .
A 1 956 ASN 956 ? ? ? H .
A 1 957 LEU 957 ? ? ? H .
A 1 958 GLU 958 ? ? ? H .
A 1 959 PHE 959 ? ? ? H .
A 1 960 LEU 960 ? ? ? H .
A 1 961 ASN 961 ? ? ? H .
A 1 962 GLU 962 ? ? ? H .
A 1 963 VAL 963 ? ? ? H .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'DUF4201 domain-containing protein {PDB ID=8tek, label_asym_id=H, auth_asym_id=P, SMTL ID=8tek.1.H}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 8tek, label_asym_id=H'
'target-template alignment' .
4 'model 5' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-04-16
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-04-11
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A H 8 1 P
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MASEDGEMPSQFEGIDPEQLTESQMQQYMMEMQRQGLLDSNMEGGQYEEGYEEGQEGEGYGEEYGDQDYD
GNQNEYDSQQDSQQQGHDQVNEMHQDRYDRRVNSEISGNYEADDETLRKIRRDLLDNINLERRHRDLQPV
YIDLTTNNISQYYSEYLVNNEHNQDFYENAKVRYNNLGECELCHITAKFEPDADITKEYIYDYFMEIGYL
FLESEEEKRIILNPANNHIGIGVFFDEIQIVVVLILSEKVLCIQKISQPEQNKIEIRGKMLDENFGIYAI
RIMNVDDQKKDIKGVGPEFIEYTRSTQEWMASFELELYNQDRMAIEYYTRVSPDSIPYKKKQSKNEKLTY
KHLQLRLRTPFQIYPDPKYAAEDEKERIRKEQEILAHEEQERKEREENDAKRLKQSRKDYGDGQYDDDEH
GQDDFNSQSDISDKDKHHDSMHAEQEQNQQAAQQQQDTISNKEIRQELEMAITEAQRQHDEFMLQNHKLQ
EEIKLLKNKNDGFVDRSNETAMNEHKYLNTLAHVHQIRLDLKQTQTRYNQMSQELQKKLEQKQKKCNEIK
YAFLELKREVAKKAANSRTDKPIPEQQINEWEKAELQKSKELQELRLQILRLRNAYVKNQKILKKKEELA
EGLHLIDFEQLKIENQTLNEKIEERNEELHKLKKKNTTTIQILTHTREKLGFVQGENGELNSQNVRKDQE
LDDMRKQLTQQKKTKDKLRSVNLTLKQQTGIVNSEELGQDYRDLRTRVSKLEEEKKRLEQKLRSMHEAIK
TANQISTQNMQSQNNSLKKPYQPY
;

;MASEDGEMPSQFEGIDPEQLTESQMQQYMMEMQRQGLLDSNMEGGQYEEGYEEGQEGEGYGEEYGDQDYD
GNQNEYDSQQDSQQQGHDQVNEMHQDRYDRRVNSEISGNYEADDETLRKIRRDLLDNINLERRHRDLQPV
YIDLTTNNISQYYSEYLVNNEHNQDFYENAKVRYNNLGECELCHITAKFEPDADITKEYIYDYFMEIGYL
FLESEEEKRIILNPANNHIGIGVFFDEIQIVVVLILSEKVLCIQKISQPEQNKIEIRGKMLDENFGIYAI
RIMNVDDQKKDIKGVGPEFIEYTRSTQEWMASFELELYNQDRMAIEYYTRVSPDSIPYKKKQSKNEKLTY
KHLQLRLRTPFQIYPDPKYAAEDEKERIRKEQEILAHEEQERKEREENDAKRLKQSRKDYGDGQYDDDEH
GQDDFNSQSDISDKDKHHDSMHAEQEQNQQAAQQQQDTISNKEIRQELEMAITEAQRQHDEFMLQNHKLQ
EEIKLLKNKNDGFVDRSNETAMNEHKYLNTLAHVHQIRLDLKQTQTRYNQMSQELQKKLEQKQKKCNEIK
YAFLELKREVAKKAANSRTDKPIPEQQINEWEKAELQKSKELQELRLQILRLRNAYVKNQKILKKKEELA
EGLHLIDFEQLKIENQTLNEKIEERNEELHKLKKKNTTTIQILTHTREKLGFVQGENGELNSQNVRKDQE
LDDMRKQLTQQKKTKDKLRSVNLTLKQQTGIVNSEELGQDYRDLRTRVSKLEEEKKRLEQKLRSMHEAIK
TANQISTQNMQSQNNSLKKPYQPY
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 743 767
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 8tek 2023-09-27
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 963
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 963 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 18.000 36.000
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKARRELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQLQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVERLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDAHSREKDELRKRVADLEQENALLKDEKEQLNNQILCQSKDEFAQNSVKENLMKKELEEERSRYQNLVKEYSQLEQRYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEKAAMDMTVFLKLQKRVRELEQERKKLQVQLEKREQQDSKKVQAEPPQTDIDLDPNADLAYNSLKRQELESENKKLKNDLNELRKAVADQATQNNSSHGSPDSYSLLLNQLKLAHEELEVRKEEVLILRTQIVSADQRRLAGRNAEPNINARSSWPNSEKHVDQEDAIEAYHGVCQTNRLLEAQLQAQSLEHEEEVEHLKAQLEALKEEMDKQQQTFCQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQDLEAAQALAQSERKRHELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALLIRNLVTDLKPQMLSGTVPCLPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKHNDDFEMTSFWLSNTCRLLHCLKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVSAMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIILQVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEPLIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQAQLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
2 1 2
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DLRTRVSKLEEEKKRLEQKLRSMHE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8tek.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . LYS 289 289 ? A 281.739 183.147 309.289 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 2 C CA . LYS 289 289 ? A 282.951 183.709 308.573 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 3 C C . LYS 289 289 ? A 283.791 184.714 309.331 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 4 O O . LYS 289 289 ? A 284.999 184.687 309.201 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 5 C CB . LYS 289 289 ? A 282.596 184.283 307.179 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 6 C CG . LYS 289 289 ? A 282.113 183.209 306.193 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 7 C CD . LYS 289 289 ? A 281.730 183.793 304.822 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 8 C CE . LYS 289 289 ? A 281.216 182.728 303.840 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 9 N NZ . LYS 289 289 ? A 280.797 183.347 302.562 1 1 H LYS 0.280 1
ATOM 10 N N . LEU 290 290 ? A 283.205 185.579 310.189 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 11 C CA . LEU 290 290 ? A 283.957 186.501 311.020 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 12 C C . LEU 290 290 ? A 284.968 185.818 311.947 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 13 O O . LEU 290 290 ? A 286.081 186.293 312.099 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 14 C CB . LEU 290 290 ? A 282.970 187.416 311.774 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 15 C CG . LEU 290 290 ? A 283.615 188.603 312.517 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 16 C CD1 . LEU 290 290 ? A 284.556 189.446 311.635 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 17 C CD2 . LEU 290 290 ? A 282.514 189.497 313.104 1 1 H LEU 0.350 1
ATOM 18 N N . GLN 291 291 ? A 284.640 184.606 312.465 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 19 C CA . GLN 291 291 ? A 285.563 183.734 313.175 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 20 C C . GLN 291 291 ? A 286.852 183.454 312.401 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 21 O O . GLN 291 291 ? A 287.942 183.622 312.919 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 22 C CB . GLN 291 291 ? A 284.868 182.373 313.447 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 23 C CG . GLN 291 291 ? A 283.684 182.444 314.444 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 24 C CD . GLN 291 291 ? A 283.013 181.068 314.556 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 25 O OE1 . GLN 291 291 ? A 282.988 180.311 313.592 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 26 N NE2 . GLN 291 291 ? A 282.434 180.760 315.740 1 1 H GLN 0.670 1
ATOM 27 N N . LYS 292 292 ? A 286.750 183.057 311.111 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 28 C CA . LYS 292 292 ? A 287.890 182.846 310.230 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 29 C C . LYS 292 292 ? A 288.572 184.111 309.733 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 30 O O . LYS 292 292 ? A 289.792 184.147 309.608 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 31 C CB . LYS 292 292 ? A 287.528 181.966 309.017 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 32 C CG . LYS 292 292 ? A 287.176 180.532 309.434 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 33 C CD . LYS 292 292 ? A 286.855 179.642 308.224 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 34 C CE . LYS 292 292 ? A 286.525 178.190 308.600 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 35 N NZ . LYS 292 292 ? A 286.168 177.406 307.394 1 1 H LYS 0.680 1
ATOM 36 N N . ARG 293 293 ? A 287.794 185.166 309.431 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 37 C CA . ARG 293 293 ? A 288.262 186.453 308.953 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 38 C C . ARG 293 293 ? A 289.139 187.208 309.954 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 39 O O . ARG 293 293 ? A 290.145 187.807 309.595 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 40 C CB . ARG 293 293 ? A 287.045 187.312 308.518 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 41 C CG . ARG 293 293 ? A 287.461 188.492 307.622 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 42 C CD . ARG 293 293 ? A 286.318 189.313 306.997 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 43 N NE . ARG 293 293 ? A 285.652 190.181 308.040 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 44 C CZ . ARG 293 293 ? A 286.191 191.291 308.572 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 45 N NH1 . ARG 293 293 ? A 287.424 191.681 308.273 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 46 N NH2 . ARG 293 293 ? A 285.490 192.033 309.429 1 1 H ARG 0.600 1
ATOM 47 N N . VAL 294 294 ? A 288.765 187.173 311.254 1 1 H VAL 0.760 1
ATOM 48 C CA . VAL 294 294 ? A 289.627 187.554 312.369 1 1 H VAL 0.760 1
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ATOM 50 O O . VAL 294 294 ? A 291.946 186.985 312.701 1 1 H VAL 0.760 1
ATOM 51 C CB . VAL 294 294 ? A 288.825 187.649 313.670 1 1 H VAL 0.760 1
ATOM 52 C CG1 . VAL 294 294 ? A 289.741 187.881 314.893 1 1 H VAL 0.760 1
ATOM 53 C CG2 . VAL 294 294 ? A 287.824 188.818 313.546 1 1 H VAL 0.760 1
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ATOM 65 N N . GLU 296 296 ? A 292.661 184.460 310.464 1 1 H GLU 0.720 1
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ATOM 104 C CB . GLU 300 300 ? A 297.909 188.138 308.758 1 1 H GLU 0.740 1
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ATOM 108 O OE2 . GLU 300 300 ? A 298.410 190.938 309.183 1 1 H GLU 0.740 1
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ATOM 117 C CZ . ARG 301 301 ? A 296.146 192.955 315.219 1 1 H ARG 0.670 1
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ATOM 120 N N . LYS 302 302 ? A 301.768 187.690 312.759 1 1 H LYS 0.730 1
ATOM 121 C CA . LYS 302 302 ? A 302.947 186.863 312.936 1 1 H LYS 0.730 1
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ATOM 125 C CG . LYS 302 302 ? A 303.820 184.564 313.761 1 1 H LYS 0.730 1
ATOM 126 C CD . LYS 302 302 ? A 304.700 185.076 314.925 1 1 H LYS 0.730 1
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ATOM 144 C CD1 . LEU 304 304 ? A 301.552 193.188 308.574 1 1 H LEU 0.750 1
ATOM 145 C CD2 . LEU 304 304 ? A 303.440 192.474 307.077 1 1 H LEU 0.750 1
ATOM 146 N N . GLN 305 305 ? A 305.382 190.391 311.634 1 1 H GLN 0.750 1
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ATOM 148 C C . GLN 305 305 ? A 307.681 189.714 312.336 1 1 H GLN 0.750 1
ATOM 149 O O . GLN 305 305 ? A 308.759 190.241 312.541 1 1 H GLN 0.750 1
ATOM 150 C CB . GLN 305 305 ? A 305.830 190.004 314.055 1 1 H GLN 0.750 1
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ATOM 152 C CD . GLN 305 305 ? A 307.003 191.806 315.451 1 1 H GLN 0.750 1
ATOM 153 O OE1 . GLN 305 305 ? A 306.250 192.641 314.955 1 1 H GLN 0.750 1
ATOM 154 N NE2 . GLN 305 305 ? A 308.073 192.166 316.191 1 1 H GLN 0.750 1
ATOM 155 N N . VAL 306 306 ? A 307.620 188.492 311.735 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 156 C CA . VAL 306 306 ? A 308.827 187.745 311.345 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 157 C C . VAL 306 306 ? A 309.664 188.499 310.309 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 158 O O . VAL 306 306 ? A 310.883 188.528 310.388 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 159 C CB . VAL 306 306 ? A 308.582 186.268 310.951 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 160 C CG1 . VAL 306 306 ? A 307.816 186.114 309.625 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 161 C CG2 . VAL 306 306 ? A 309.887 185.435 311.023 1 1 H VAL 0.790 1
ATOM 162 N N . GLN 307 307 ? A 309.020 189.202 309.346 1 1 H GLN 0.730 1
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ATOM 164 C C . GLN 307 307 ? A 310.034 191.397 308.791 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 165 O O . GLN 307 307 ? A 310.781 192.140 308.151 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 166 C CB . GLN 307 307 ? A 308.773 190.045 307.056 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 167 C CG . GLN 307 307 ? A 308.463 188.668 306.409 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 168 C CD . GLN 307 307 ? A 309.741 187.921 306.026 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 169 O OE1 . GLN 307 307 ? A 310.629 188.428 305.350 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 170 N NE2 . GLN 307 307 ? A 309.861 186.643 306.467 1 1 H GLN 0.730 1
ATOM 171 N N . LEU 308 308 ? A 309.518 191.811 309.965 1 1 H LEU 0.710 1
ATOM 172 C CA . LEU 308 308 ? A 309.900 193.039 310.630 1 1 H LEU 0.710 1
ATOM 173 C C . LEU 308 308 ? A 311.125 192.802 311.523 1 1 H LEU 0.710 1
ATOM 174 O O . LEU 308 308 ? A 312.141 193.455 311.319 1 1 H LEU 0.710 1
ATOM 175 C CB . LEU 308 308 ? A 308.685 193.653 311.364 1 1 H LEU 0.710 1
ATOM 176 C CG . LEU 308 308 ? A 308.946 195.015 312.039 1 1 H LEU 0.710 1
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ATOM 198 C CA . ARG 311 311 ? A 315.256 193.342 309.362 1 1 H ARG 0.550 1
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ATOM 200 O O . ARG 311 311 ? A 316.977 194.772 310.155 1 1 H ARG 0.550 1
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ATOM 223 C CD . GLN 313 313 ? A 317.992 188.638 315.625 1 1 H GLN 0.380 1
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ATOM 226 O OXT . GLN 313 313 ? A 321.032 191.075 312.173 1 1 H GLN 0.380 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
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_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
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_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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1 1 2 0.645
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#
#
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1 1 A 289 LYS 1 0.280
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3 1 A 291 GLN 1 0.670
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5 1 A 293 ARG 1 0.600
6 1 A 294 VAL 1 0.760
7 1 A 295 ARG 1 0.640
8 1 A 296 GLU 1 0.720
9 1 A 297 LEU 1 0.700
10 1 A 298 GLU 1 0.710
11 1 A 299 GLN 1 0.730
12 1 A 300 GLU 1 0.740
13 1 A 301 ARG 1 0.670
14 1 A 302 LYS 1 0.730
15 1 A 303 LYS 1 0.740
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17 1 A 305 GLN 1 0.750
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19 1 A 307 GLN 1 0.730
20 1 A 308 LEU 1 0.710
21 1 A 309 GLU 1 0.680
22 1 A 310 LYS 1 0.650
23 1 A 311 ARG 1 0.550
24 1 A 312 GLU 1 0.420
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#
#
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_pdbx_data_usage.type
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1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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