data_SMR-0f0f6ff04d676aeaa822ad16a951ac07_1 _entry.id SMR-0f0f6ff04d676aeaa822ad16a951ac07_1 _struct.entry_id SMR-0f0f6ff04d676aeaa822ad16a951ac07_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q69YH5/ CDCA2_HUMAN, Cell division cycle-associated protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q69YH5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 131254.269 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CDCA2_HUMAN Q69YH5 1 ;MDANSKDKPPETKESAMNNAGNASFILGTGKIVTPQKHAELPPNPCTPDTFKSPLNFSTVTVEQLGITPE SFVRNSAGKSSSYLKKCRRRSAVGARGSPETNHLIRFIARQQNIKNARKSPLAQDSPSQGSPALYRNVNT LRERISAFQSAFHSIKENEKMTGCLEFSEAGKESEMTDLTRKEGLSACQQSGFPAVLSSKRRRISYQRDS DENLTDAEGKVIGLQIFNIDTDRACAVETSVDLSEISSKLGSTQSGFLVEESLPLSELTETSNALKVADC VVGKGSSDAVSPDTFTAEVSSDAVPDVRSPATPACRRDLPTPKTFVLRSVLKKPSVKMCLESLQEHCNNL YDDDGTHPSLISNLPNCCKEKEAEDEENFEAPAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTP VCKKDFSGLSSLLLEQSPVPEPLPQPDFDDKGENLENIEPLQVSFAVLSSPNKSSISETLSGTDTFSSSN NHEKISSPKVGRITRTSNRRNQLVSVVEESVCNLLNTEVQPCKEKKINRRKSQETKCTKRALPKKSQVLK SCRKKKGKGKKSVQKSLYGERDIASKKPLLSPIPELPEVPEMTPSIPSIRRLGSGYFSSNGKLEEVKTPK NPVKRKDLLRHDPDLHMHQGYDKYDVSEFCSYIKSSSSLGNATSDEDPNTNIMNINENKNIPKAKNKSES ENEPKAGTDSPVSCASVTEERVASDSPKPALTLQQGQEFSAGGQNAENLCQFFKISPDLNIKCERKDDFL GAAEGKLQCNRLMPNSQKDCHCLGDVLIENTKESKSQSEDLGRKPMESSSVVSCRDRKDRRRSMCYSDGR SLHLEKNGNHTPSSSVGSSVEISLENSELFKDLSDAIEQTFQRRNSETKVRRSTRLQKDLENEGLVWISL PLPSTSQKAKRRTICTFDSSGFESMSPIKETVSSRQKPQMAPPVSDPENSQGPAAGSSDEPGKRRKSFCI STLANTKATSQFKGYRRRSSLNGKGESSLTALERIEHNGERKQ ; 'Cell division cycle-associated protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1023 1 1023 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CDCA2_HUMAN Q69YH5 . 1 1023 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-10-05 2A073D6DD928B1E5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MDANSKDKPPETKESAMNNAGNASFILGTGKIVTPQKHAELPPNPCTPDTFKSPLNFSTVTVEQLGITPE SFVRNSAGKSSSYLKKCRRRSAVGARGSPETNHLIRFIARQQNIKNARKSPLAQDSPSQGSPALYRNVNT LRERISAFQSAFHSIKENEKMTGCLEFSEAGKESEMTDLTRKEGLSACQQSGFPAVLSSKRRRISYQRDS DENLTDAEGKVIGLQIFNIDTDRACAVETSVDLSEISSKLGSTQSGFLVEESLPLSELTETSNALKVADC VVGKGSSDAVSPDTFTAEVSSDAVPDVRSPATPACRRDLPTPKTFVLRSVLKKPSVKMCLESLQEHCNNL YDDDGTHPSLISNLPNCCKEKEAEDEENFEAPAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTP VCKKDFSGLSSLLLEQSPVPEPLPQPDFDDKGENLENIEPLQVSFAVLSSPNKSSISETLSGTDTFSSSN NHEKISSPKVGRITRTSNRRNQLVSVVEESVCNLLNTEVQPCKEKKINRRKSQETKCTKRALPKKSQVLK SCRKKKGKGKKSVQKSLYGERDIASKKPLLSPIPELPEVPEMTPSIPSIRRLGSGYFSSNGKLEEVKTPK NPVKRKDLLRHDPDLHMHQGYDKYDVSEFCSYIKSSSSLGNATSDEDPNTNIMNINENKNIPKAKNKSES ENEPKAGTDSPVSCASVTEERVASDSPKPALTLQQGQEFSAGGQNAENLCQFFKISPDLNIKCERKDDFL GAAEGKLQCNRLMPNSQKDCHCLGDVLIENTKESKSQSEDLGRKPMESSSVVSCRDRKDRRRSMCYSDGR SLHLEKNGNHTPSSSVGSSVEISLENSELFKDLSDAIEQTFQRRNSETKVRRSTRLQKDLENEGLVWISL PLPSTSQKAKRRTICTFDSSGFESMSPIKETVSSRQKPQMAPPVSDPENSQGPAAGSSDEPGKRRKSFCI STLANTKATSQFKGYRRRSSLNGKGESSLTALERIEHNGERKQ ; ;MDANSKDKPPETKESAMNNAGNASFILGTGKIVTPQKHAELPPNPCTPDTFKSPLNFSTVTVEQLGITPE SFVRNSAGKSSSYLKKCRRRSAVGARGSPETNHLIRFIARQQNIKNARKSPLAQDSPSQGSPALYRNVNT LRERISAFQSAFHSIKENEKMTGCLEFSEAGKESEMTDLTRKEGLSACQQSGFPAVLSSKRRRISYQRDS DENLTDAEGKVIGLQIFNIDTDRACAVETSVDLSEISSKLGSTQSGFLVEESLPLSELTETSNALKVADC VVGKGSSDAVSPDTFTAEVSSDAVPDVRSPATPACRRDLPTPKTFVLRSVLKKPSVKMCLESLQEHCNNL YDDDGTHPSLISNLPNCCKEKEAEDEENFEAPAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTP VCKKDFSGLSSLLLEQSPVPEPLPQPDFDDKGENLENIEPLQVSFAVLSSPNKSSISETLSGTDTFSSSN NHEKISSPKVGRITRTSNRRNQLVSVVEESVCNLLNTEVQPCKEKKINRRKSQETKCTKRALPKKSQVLK SCRKKKGKGKKSVQKSLYGERDIASKKPLLSPIPELPEVPEMTPSIPSIRRLGSGYFSSNGKLEEVKTPK NPVKRKDLLRHDPDLHMHQGYDKYDVSEFCSYIKSSSSLGNATSDEDPNTNIMNINENKNIPKAKNKSES ENEPKAGTDSPVSCASVTEERVASDSPKPALTLQQGQEFSAGGQNAENLCQFFKISPDLNIKCERKDDFL GAAEGKLQCNRLMPNSQKDCHCLGDVLIENTKESKSQSEDLGRKPMESSSVVSCRDRKDRRRSMCYSDGR SLHLEKNGNHTPSSSVGSSVEISLENSELFKDLSDAIEQTFQRRNSETKVRRSTRLQKDLENEGLVWISL PLPSTSQKAKRRTICTFDSSGFESMSPIKETVSSRQKPQMAPPVSDPENSQGPAAGSSDEPGKRRKSFCI STLANTKATSQFKGYRRRSSLNGKGESSLTALERIEHNGERKQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 ALA . 1 4 ASN . 1 5 SER . 1 6 LYS . 1 7 ASP . 1 8 LYS . 1 9 PRO . 1 10 PRO . 1 11 GLU . 1 12 THR . 1 13 LYS . 1 14 GLU . 1 15 SER . 1 16 ALA . 1 17 MET . 1 18 ASN . 1 19 ASN . 1 20 ALA . 1 21 GLY . 1 22 ASN . 1 23 ALA . 1 24 SER . 1 25 PHE . 1 26 ILE . 1 27 LEU . 1 28 GLY . 1 29 THR . 1 30 GLY . 1 31 LYS . 1 32 ILE . 1 33 VAL . 1 34 THR . 1 35 PRO . 1 36 GLN . 1 37 LYS . 1 38 HIS . 1 39 ALA . 1 40 GLU . 1 41 LEU . 1 42 PRO . 1 43 PRO . 1 44 ASN . 1 45 PRO . 1 46 CYS . 1 47 THR . 1 48 PRO . 1 49 ASP . 1 50 THR . 1 51 PHE . 1 52 LYS . 1 53 SER . 1 54 PRO . 1 55 LEU . 1 56 ASN . 1 57 PHE . 1 58 SER . 1 59 THR . 1 60 VAL . 1 61 THR . 1 62 VAL . 1 63 GLU . 1 64 GLN . 1 65 LEU . 1 66 GLY . 1 67 ILE . 1 68 THR . 1 69 PRO . 1 70 GLU . 1 71 SER . 1 72 PHE . 1 73 VAL . 1 74 ARG . 1 75 ASN . 1 76 SER . 1 77 ALA . 1 78 GLY . 1 79 LYS . 1 80 SER . 1 81 SER . 1 82 SER . 1 83 TYR . 1 84 LEU . 1 85 LYS . 1 86 LYS . 1 87 CYS . 1 88 ARG . 1 89 ARG . 1 90 ARG . 1 91 SER . 1 92 ALA . 1 93 VAL . 1 94 GLY . 1 95 ALA . 1 96 ARG . 1 97 GLY . 1 98 SER . 1 99 PRO . 1 100 GLU . 1 101 THR . 1 102 ASN . 1 103 HIS . 1 104 LEU . 1 105 ILE . 1 106 ARG . 1 107 PHE . 1 108 ILE . 1 109 ALA . 1 110 ARG . 1 111 GLN . 1 112 GLN . 1 113 ASN . 1 114 ILE . 1 115 LYS . 1 116 ASN . 1 117 ALA . 1 118 ARG . 1 119 LYS . 1 120 SER . 1 121 PRO . 1 122 LEU . 1 123 ALA . 1 124 GLN . 1 125 ASP . 1 126 SER . 1 127 PRO . 1 128 SER . 1 129 GLN . 1 130 GLY . 1 131 SER . 1 132 PRO . 1 133 ALA . 1 134 LEU . 1 135 TYR . 1 136 ARG . 1 137 ASN . 1 138 VAL . 1 139 ASN . 1 140 THR . 1 141 LEU . 1 142 ARG . 1 143 GLU . 1 144 ARG . 1 145 ILE . 1 146 SER . 1 147 ALA . 1 148 PHE . 1 149 GLN . 1 150 SER . 1 151 ALA . 1 152 PHE . 1 153 HIS . 1 154 SER . 1 155 ILE . 1 156 LYS . 1 157 GLU . 1 158 ASN . 1 159 GLU . 1 160 LYS . 1 161 MET . 1 162 THR . 1 163 GLY . 1 164 CYS . 1 165 LEU . 1 166 GLU . 1 167 PHE . 1 168 SER . 1 169 GLU . 1 170 ALA . 1 171 GLY . 1 172 LYS . 1 173 GLU . 1 174 SER . 1 175 GLU . 1 176 MET . 1 177 THR . 1 178 ASP . 1 179 LEU . 1 180 THR . 1 181 ARG . 1 182 LYS . 1 183 GLU . 1 184 GLY . 1 185 LEU . 1 186 SER . 1 187 ALA . 1 188 CYS . 1 189 GLN . 1 190 GLN . 1 191 SER . 1 192 GLY . 1 193 PHE . 1 194 PRO . 1 195 ALA . 1 196 VAL . 1 197 LEU . 1 198 SER . 1 199 SER . 1 200 LYS . 1 201 ARG . 1 202 ARG . 1 203 ARG . 1 204 ILE . 1 205 SER . 1 206 TYR . 1 207 GLN . 1 208 ARG . 1 209 ASP . 1 210 SER . 1 211 ASP 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A 1 838 ASP 838 ? ? ? B . A 1 839 GLY 839 ? ? ? B . A 1 840 ARG 840 ? ? ? B . A 1 841 SER 841 ? ? ? B . A 1 842 LEU 842 ? ? ? B . A 1 843 HIS 843 ? ? ? B . A 1 844 LEU 844 ? ? ? B . A 1 845 GLU 845 ? ? ? B . A 1 846 LYS 846 ? ? ? B . A 1 847 ASN 847 ? ? ? B . A 1 848 GLY 848 ? ? ? B . A 1 849 ASN 849 ? ? ? B . A 1 850 HIS 850 ? ? ? B . A 1 851 THR 851 ? ? ? B . A 1 852 PRO 852 ? ? ? B . A 1 853 SER 853 ? ? ? B . A 1 854 SER 854 ? ? ? B . A 1 855 SER 855 ? ? ? B . A 1 856 VAL 856 ? ? ? B . A 1 857 GLY 857 ? ? ? B . A 1 858 SER 858 ? ? ? B . A 1 859 SER 859 ? ? ? B . A 1 860 VAL 860 ? ? ? B . A 1 861 GLU 861 ? ? ? B . A 1 862 ILE 862 ? ? ? B . A 1 863 SER 863 ? ? ? B . A 1 864 LEU 864 ? ? ? B . A 1 865 GLU 865 ? ? ? B . A 1 866 ASN 866 ? ? ? B . A 1 867 SER 867 ? ? ? B . A 1 868 GLU 868 ? ? ? B . A 1 869 LEU 869 ? ? ? B . A 1 870 PHE 870 ? ? ? B . A 1 871 LYS 871 ? ? ? B . A 1 872 ASP 872 ? ? ? B . A 1 873 LEU 873 ? ? ? B . A 1 874 SER 874 ? ? ? B . A 1 875 ASP 875 ? ? ? B . 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A 1 914 SER 914 ? ? ? B . A 1 915 THR 915 ? ? ? B . A 1 916 SER 916 ? ? ? B . A 1 917 GLN 917 ? ? ? B . A 1 918 LYS 918 ? ? ? B . A 1 919 ALA 919 ? ? ? B . A 1 920 LYS 920 ? ? ? B . A 1 921 ARG 921 ? ? ? B . A 1 922 ARG 922 ? ? ? B . A 1 923 THR 923 ? ? ? B . A 1 924 ILE 924 ? ? ? B . A 1 925 CYS 925 ? ? ? B . A 1 926 THR 926 ? ? ? B . A 1 927 PHE 927 ? ? ? B . A 1 928 ASP 928 ? ? ? B . A 1 929 SER 929 ? ? ? B . A 1 930 SER 930 ? ? ? B . A 1 931 GLY 931 ? ? ? B . A 1 932 PHE 932 ? ? ? B . A 1 933 GLU 933 ? ? ? B . A 1 934 SER 934 ? ? ? B . A 1 935 MET 935 ? ? ? B . A 1 936 SER 936 ? ? ? B . A 1 937 PRO 937 ? ? ? B . A 1 938 ILE 938 ? ? ? B . A 1 939 LYS 939 ? ? ? B . A 1 940 GLU 940 ? ? ? B . A 1 941 THR 941 ? ? ? B . A 1 942 VAL 942 ? ? ? B . A 1 943 SER 943 ? ? ? B . A 1 944 SER 944 ? ? ? B . A 1 945 ARG 945 ? ? ? B . A 1 946 GLN 946 ? ? ? B . A 1 947 LYS 947 ? ? ? B . A 1 948 PRO 948 ? ? ? B . A 1 949 GLN 949 ? ? ? B . A 1 950 MET 950 ? ? ? B . A 1 951 ALA 951 ? ? ? B . A 1 952 PRO 952 ? ? ? B . A 1 953 PRO 953 ? ? ? B . A 1 954 VAL 954 ? ? ? B . A 1 955 SER 955 ? ? ? B . A 1 956 ASP 956 ? ? ? B . A 1 957 PRO 957 ? ? ? B . A 1 958 GLU 958 ? ? ? B . A 1 959 ASN 959 ? ? ? B . A 1 960 SER 960 ? ? ? B . A 1 961 GLN 961 ? ? ? B . A 1 962 GLY 962 ? ? ? B . A 1 963 PRO 963 ? ? ? B . A 1 964 ALA 964 ? ? ? B . A 1 965 ALA 965 ? ? ? B . A 1 966 GLY 966 ? ? ? B . A 1 967 SER 967 ? ? ? B . A 1 968 SER 968 ? ? ? B . A 1 969 ASP 969 ? ? ? B . A 1 970 GLU 970 ? ? ? B . A 1 971 PRO 971 ? ? ? B . A 1 972 GLY 972 ? ? ? B . A 1 973 LYS 973 ? ? ? B . A 1 974 ARG 974 ? ? ? B . A 1 975 ARG 975 ? ? ? B . A 1 976 LYS 976 ? ? ? B . A 1 977 SER 977 ? ? ? B . A 1 978 PHE 978 ? ? ? B . A 1 979 CYS 979 ? ? ? B . A 1 980 ILE 980 ? ? ? B . A 1 981 SER 981 ? ? ? B . A 1 982 THR 982 ? ? ? B . A 1 983 LEU 983 ? ? ? B . A 1 984 ALA 984 ? ? ? B . A 1 985 ASN 985 ? ? ? B . A 1 986 THR 986 ? ? ? B . A 1 987 LYS 987 ? ? ? B . A 1 988 ALA 988 ? ? ? B . A 1 989 THR 989 ? ? ? B . A 1 990 SER 990 ? ? ? B . A 1 991 GLN 991 ? ? ? B . A 1 992 PHE 992 ? ? ? B . A 1 993 LYS 993 ? ? ? B . A 1 994 GLY 994 ? ? ? B . A 1 995 TYR 995 ? ? ? B . A 1 996 ARG 996 ? ? ? B . A 1 997 ARG 997 ? ? ? B . A 1 998 ARG 998 ? ? ? B . A 1 999 SER 999 ? ? ? B . A 1 1000 SER 1000 ? ? ? B . A 1 1001 LEU 1001 ? ? ? B . A 1 1002 ASN 1002 ? ? ? B . A 1 1003 GLY 1003 ? ? ? B . A 1 1004 LYS 1004 ? ? ? B . A 1 1005 GLY 1005 ? ? ? B . A 1 1006 GLU 1006 ? ? ? B . A 1 1007 SER 1007 ? ? ? B . A 1 1008 SER 1008 ? ? ? B . A 1 1009 LEU 1009 ? ? ? B . A 1 1010 THR 1010 ? ? ? B . A 1 1011 ALA 1011 ? ? ? B . A 1 1012 LEU 1012 ? ? ? B . A 1 1013 GLU 1013 ? ? ? B . A 1 1014 ARG 1014 ? ? ? B . A 1 1015 ILE 1015 ? ? ? B . A 1 1016 GLU 1016 ? ? ? B . A 1 1017 HIS 1017 ? ? ? B . A 1 1018 ASN 1018 ? ? ? B . A 1 1019 GLY 1019 ? ? ? B . A 1 1020 GLU 1020 ? ? ? B . A 1 1021 ARG 1021 ? ? ? B . A 1 1022 LYS 1022 ? ? ? B . A 1 1023 GLN 1023 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Cell division cycle-associated protein 2 {PDB ID=5ioh, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5ioh.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5ioh, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-04-16 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-04-11 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GAMGYAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTPVCKKDFSGLSSLLLEQSPVPE GAMGYAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTPVCKKDFSGLSSLLLEQSPVPE # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 64 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5ioh 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1023 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1023 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.4e-20 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDANSKDKPPETKESAMNNAGNASFILGTGKIVTPQKHAELPPNPCTPDTFKSPLNFSTVTVEQLGITPESFVRNSAGKSSSYLKKCRRRSAVGARGSPETNHLIRFIARQQNIKNARKSPLAQDSPSQGSPALYRNVNTLRERISAFQSAFHSIKENEKMTGCLEFSEAGKESEMTDLTRKEGLSACQQSGFPAVLSSKRRRISYQRDSDENLTDAEGKVIGLQIFNIDTDRACAVETSVDLSEISSKLGSTQSGFLVEESLPLSELTETSNALKVADCVVGKGSSDAVSPDTFTAEVSSDAVPDVRSPATPACRRDLPTPKTFVLRSVLKKPSVKMCLESLQEHCNNLYDDDGTHPSLISNLPNCCKEKEAEDEENFEAPAFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTPVCKKDFSGLSSLLLEQSPVPEPLPQPDFDDKGENLENIEPLQVSFAVLSSPNKSSISETLSGTDTFSSSNNHEKISSPKVGRITRTSNRRNQLVSVVEESVCNLLNTEVQPCKEKKINRRKSQETKCTKRALPKKSQVLKSCRKKKGKGKKSVQKSLYGERDIASKKPLLSPIPELPEVPEMTPSIPSIRRLGSGYFSSNGKLEEVKTPKNPVKRKDLLRHDPDLHMHQGYDKYDVSEFCSYIKSSSSLGNATSDEDPNTNIMNINENKNIPKAKNKSESENEPKAGTDSPVSCASVTEERVASDSPKPALTLQQGQEFSAGGQNAENLCQFFKISPDLNIKCERKDDFLGAAEGKLQCNRLMPNSQKDCHCLGDVLIENTKESKSQSEDLGRKPMESSSVVSCRDRKDRRRSMCYSDGRSLHLEKNGNHTPSSSVGSSVEISLENSELFKDLSDAIEQTFQRRNSETKVRRSTRLQKDLENEGLVWISLPLPSTSQKAKRRTICTFDSSGFESMSPIKETVSSRQKPQMAPPVSDPENSQGPAAGSSDEPGKRRKSFCISTLANTKATSQFKGYRRRSSLNGKGESSLTALERIEHNGERKQ 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AFLNMRKRKRVTFGEDLSPEVFDESLPANTPLRKGGTPVCKKDFSGLSSLLLEQSPVPE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5ioh.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.609 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 391 LYS 1 0.180 2 1 A 392 ARG 1 0.180 3 1 A 393 VAL 1 0.520 4 1 A 394 THR 1 0.470 5 1 A 395 PHE 1 0.370 6 1 A 396 GLY 1 0.450 7 1 A 397 GLU 1 0.510 8 1 A 398 ASP 1 0.610 9 1 A 399 LEU 1 0.650 10 1 A 400 SER 1 0.720 11 1 A 401 PRO 1 0.740 12 1 A 402 GLU 1 0.720 13 1 A 403 VAL 1 0.700 14 1 A 404 PHE 1 0.650 15 1 A 405 ASP 1 0.670 16 1 A 406 GLU 1 0.660 17 1 A 407 SER 1 0.920 18 1 A 408 LEU 1 0.660 19 1 A 409 PRO 1 0.650 20 1 A 410 ALA 1 0.640 21 1 A 411 ASN 1 0.630 22 1 A 412 THR 1 0.680 23 1 A 413 PRO 1 0.680 24 1 A 414 LEU 1 0.660 25 1 A 415 ARG 1 0.650 26 1 A 416 LYS 1 0.690 27 1 A 417 GLY 1 0.740 28 1 A 418 GLY 1 0.730 29 1 A 419 THR 1 0.670 30 1 A 420 PRO 1 0.560 31 1 A 421 VAL 1 0.430 32 1 A 422 CYS 1 0.690 33 1 A 423 LYS 1 0.620 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #