data_SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _entry.id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _struct.entry_id SMR-21ce9a7073d8e44ee565689b38e0b4a9_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - C8YR32/ LOXH1_MOUSE, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.019, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries C8YR32' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' c59120ae913c122b22dc2ebae5eb59cce9b022ff package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 273295.196 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LOXH1_MOUSE C8YR32 1 ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC GSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFD LLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILD IAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWT SYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVW HDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETG NGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKR ELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYE PGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVE KVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV ; 'Lipoxygenase homology domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2068 1 2068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . LOXH1_MOUSE C8YR32 . 1 2068 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2009-11-03 65B9CEE21632016B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGE NGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYF NCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGTDADVFINIFGEYGDTGERRLEN EKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDG KIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHID LAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKK RLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIR AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG 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AWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVC TGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSG SGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGAST DSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSV QIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYG EEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNET TYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGD KKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGW FVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDAN IFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVD IRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQ IFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTK WCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKM ADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSC 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A 1 1848 SER 1848 ? ? ? B . A 1 1849 SER 1849 ? ? ? B . A 1 1850 ARG 1850 ? ? ? B . A 1 1851 GLN 1851 ? ? ? B . A 1 1852 ARG 1852 ? ? ? B . A 1 1853 ALA 1853 ? ? ? B . A 1 1854 PHE 1854 ? ? ? B . A 1 1855 ARG 1855 ? ? ? B . A 1 1856 LYS 1856 ? ? ? B . A 1 1857 GLY 1857 ? ? ? B . A 1 1858 THR 1858 ? ? ? B . A 1 1859 THR 1859 ? ? ? B . A 1 1860 ASP 1860 ? ? ? B . A 1 1861 THR 1861 ? ? ? B . A 1 1862 PHE 1862 ? ? ? B . A 1 1863 GLU 1863 ? ? ? B . A 1 1864 PHE 1864 ? ? ? B . A 1 1865 ASP 1865 ? ? ? B . A 1 1866 SER 1866 ? ? ? B . A 1 1867 ILE 1867 ? ? ? B . A 1 1868 PHE 1868 ? ? ? B . A 1 1869 LEU 1869 ? ? ? B . A 1 1870 GLY 1870 ? ? ? B . A 1 1871 ASP 1871 ? ? ? B . A 1 1872 ILE 1872 ? ? ? B . A 1 1873 ALA 1873 ? ? ? B . A 1 1874 SER 1874 ? ? ? B . A 1 1875 LEU 1875 ? ? ? B . A 1 1876 CYS 1876 ? ? ? B . A 1 1877 VAL 1877 ? ? ? B . A 1 1878 GLY 1878 ? ? ? B . A 1 1879 HIS 1879 ? ? ? B . A 1 1880 LEU 1880 ? ? ? B . A 1 1881 ALA 1881 ? ? ? B . A 1 1882 ARG 1882 ? ? ? B . A 1 1883 GLU 1883 ? ? ? B . A 1 1884 ASP 1884 ? ? ? B . A 1 1885 ARG 1885 ? ? ? B . A 1 1886 PHE 1886 ? ? ? B . A 1 1887 ILE 1887 ? ? ? B . A 1 1888 PRO 1888 ? ? ? B . A 1 1889 LYS 1889 ? ? ? B . A 1 1890 ARG 1890 ? ? ? B . A 1 1891 GLU 1891 ? ? ? B . A 1 1892 LEU 1892 ? ? ? B . A 1 1893 VAL 1893 ? ? ? B . A 1 1894 TRP 1894 ? ? ? B . A 1 1895 HIS 1895 ? ? ? B . A 1 1896 VAL 1896 ? ? ? B . A 1 1897 LYS 1897 ? ? ? B . A 1 1898 THR 1898 ? ? ? B . A 1 1899 ILE 1899 ? ? ? B . A 1 1900 THR 1900 ? ? ? B . A 1 1901 ILE 1901 ? ? ? B . A 1 1902 THR 1902 ? ? ? B . A 1 1903 GLU 1903 ? ? ? B . A 1 1904 MET 1904 ? ? ? B . A 1 1905 GLU 1905 ? ? ? B . A 1 1906 TYR 1906 ? ? ? B . A 1 1907 GLY 1907 ? ? ? B . A 1 1908 ASN 1908 ? ? ? B . A 1 1909 VAL 1909 ? ? ? B . A 1 1910 TYR 1910 ? ? ? B . A 1 1911 PHE 1911 ? ? ? B . A 1 1912 PHE 1912 ? ? ? B . A 1 1913 ASN 1913 ? ? ? B . A 1 1914 CYS 1914 ? ? ? B . A 1 1915 ASP 1915 ? ? ? B . A 1 1916 CYS 1916 ? ? ? B . A 1 1917 LEU 1917 ? ? ? B . A 1 1918 ILE 1918 ? ? ? B . A 1 1919 PRO 1919 ? ? ? B . A 1 1920 LEU 1920 ? ? ? B . A 1 1921 LYS 1921 ? ? ? B . A 1 1922 ARG 1922 ? ? ? B . A 1 1923 LYS 1923 ? ? ? B . A 1 1924 ARG 1924 ? ? ? B . A 1 1925 LYS 1925 ? ? ? B . A 1 1926 TYR 1926 ? ? ? B . A 1 1927 PHE 1927 ? ? ? B . A 1 1928 LYS 1928 ? ? ? B . A 1 1929 VAL 1929 ? ? ? B . A 1 1930 PHE 1930 ? ? ? B . A 1 1931 GLU 1931 ? ? ? B . A 1 1932 VAL 1932 ? ? ? B . A 1 1933 THR 1933 ? ? ? B . A 1 1934 LYS 1934 ? ? ? B . A 1 1935 THR 1935 ? ? ? B . A 1 1936 THR 1936 ? ? ? B . A 1 1937 GLU 1937 ? ? ? B . A 1 1938 SER 1938 ? ? ? B . A 1 1939 PHE 1939 ? ? ? B . A 1 1940 ALA 1940 ? ? ? B . A 1 1941 SER 1941 ? ? ? B . A 1 1942 LYS 1942 ? ? ? B . A 1 1943 ILE 1943 ? ? ? B . A 1 1944 GLN 1944 ? ? ? B . A 1 1945 SER 1945 ? ? ? B . A 1 1946 LEU 1946 ? ? ? B . A 1 1947 VAL 1947 ? ? ? B . A 1 1948 PRO 1948 ? ? ? B . A 1 1949 VAL 1949 ? ? ? B . A 1 1950 LYS 1950 ? ? ? B . A 1 1951 TYR 1951 ? ? ? B . A 1 1952 GLU 1952 ? ? ? B . A 1 1953 VAL 1953 ? ? ? B . A 1 1954 ILE 1954 ? ? ? B . A 1 1955 VAL 1955 ? ? ? B . A 1 1956 THR 1956 ? ? ? B . A 1 1957 THR 1957 ? ? ? B . A 1 1958 GLY 1958 ? ? ? B . A 1 1959 TYR 1959 ? ? ? B . A 1 1960 GLU 1960 ? ? ? B . A 1 1961 PRO 1961 ? ? ? B . A 1 1962 GLY 1962 ? ? ? B . A 1 1963 ALA 1963 ? ? ? B . A 1 1964 GLY 1964 ? ? ? B . A 1 1965 THR 1965 ? ? ? B . A 1 1966 ASP 1966 ? ? ? B . A 1 1967 ALA 1967 ? ? ? B . A 1 1968 ASN 1968 ? ? ? B . A 1 1969 VAL 1969 ? ? ? B . A 1 1970 PHE 1970 ? ? ? B . A 1 1971 VAL 1971 ? ? ? B . A 1 1972 THR 1972 ? ? ? B . A 1 1973 ILE 1973 ? ? ? B . A 1 1974 PHE 1974 ? ? ? B . A 1 1975 GLY 1975 ? ? ? B . A 1 1976 ALA 1976 ? ? ? B . A 1 1977 ASN 1977 ? ? ? B . A 1 1978 GLY 1978 ? ? ? B . A 1 1979 ASP 1979 ? ? ? B . A 1 1980 THR 1980 ? ? ? B . A 1 1981 GLY 1981 ? ? ? B . A 1 1982 LYS 1982 ? ? ? B . A 1 1983 ARG 1983 ? ? ? B . A 1 1984 GLU 1984 ? ? ? B . A 1 1985 LEU 1985 ? ? ? B . A 1 1986 LYS 1986 ? ? ? B . A 1 1987 GLN 1987 ? ? ? B . A 1 1988 LYS 1988 ? ? ? B . A 1 1989 MET 1989 ? ? ? B . A 1 1990 ARG 1990 ? ? ? B . A 1 1991 ASN 1991 ? ? ? B . A 1 1992 LEU 1992 ? ? ? B . A 1 1993 PHE 1993 ? ? ? B . A 1 1994 GLU 1994 ? ? ? B . A 1 1995 ARG 1995 ? ? ? B . A 1 1996 GLY 1996 ? ? ? B . A 1 1997 SER 1997 ? ? ? B . A 1 1998 THR 1998 ? ? ? B . A 1 1999 ASP 1999 ? ? ? B . A 1 2000 ARG 2000 ? ? ? B . A 1 2001 PHE 2001 ? ? ? B . A 1 2002 PHE 2002 ? ? ? B . A 1 2003 LEU 2003 ? ? ? B . A 1 2004 GLU 2004 ? ? ? B . A 1 2005 THR 2005 ? ? ? B . A 1 2006 LEU 2006 ? ? ? B . A 1 2007 GLU 2007 ? ? ? B . A 1 2008 LEU 2008 ? ? ? B . A 1 2009 GLY 2009 ? ? ? B . A 1 2010 GLU 2010 ? ? ? B . A 1 2011 LEU 2011 ? ? ? B . A 1 2012 ARG 2012 ? ? ? B . A 1 2013 LYS 2013 ? ? ? B . A 1 2014 VAL 2014 ? ? ? B . A 1 2015 ARG 2015 ? ? ? B . A 1 2016 LEU 2016 ? ? ? B . A 1 2017 GLU 2017 ? ? ? B . A 1 2018 HIS 2018 ? ? ? B . A 1 2019 ASP 2019 ? ? ? B . A 1 2020 SER 2020 ? ? ? B . A 1 2021 SER 2021 ? ? ? B . A 1 2022 GLY 2022 ? ? ? B . A 1 2023 TYR 2023 ? ? ? B . A 1 2024 TYR 2024 ? ? ? B . A 1 2025 SER 2025 ? ? ? B . A 1 2026 GLY 2026 ? ? ? B . A 1 2027 TRP 2027 ? ? ? B . A 1 2028 LEU 2028 ? ? ? B . A 1 2029 VAL 2029 ? ? ? B . A 1 2030 GLU 2030 ? ? ? B . A 1 2031 LYS 2031 ? ? ? B . A 1 2032 VAL 2032 ? ? ? B . A 1 2033 GLU 2033 ? ? ? B . A 1 2034 VAL 2034 ? ? ? B . A 1 2035 THR 2035 ? ? ? B . A 1 2036 ASN 2036 ? ? ? B . A 1 2037 THR 2037 ? ? ? B . A 1 2038 SER 2038 ? ? ? B . A 1 2039 THR 2039 ? ? ? B . A 1 2040 GLY 2040 ? ? ? B . A 1 2041 VAL 2041 ? ? ? B . A 1 2042 ALA 2042 ? ? ? B . A 1 2043 THR 2043 ? ? ? B . A 1 2044 ILE 2044 ? ? ? B . A 1 2045 PHE 2045 ? ? ? B . A 1 2046 SER 2046 ? ? ? B . A 1 2047 CYS 2047 ? ? ? B . A 1 2048 GLY 2048 ? ? ? B . A 1 2049 ARG 2049 ? ? ? B . A 1 2050 TRP 2050 ? ? ? B . A 1 2051 LEU 2051 ? ? ? B . A 1 2052 ASP 2052 ? ? ? B . A 1 2053 LYS 2053 ? ? ? B . A 1 2054 SER 2054 ? ? ? B . A 1 2055 ARG 2055 ? ? ? B . A 1 2056 GLY 2056 ? ? ? B . A 1 2057 ASP 2057 ? ? ? B . A 1 2058 GLY 2058 ? ? ? B . A 1 2059 LEU 2059 ? ? ? B . A 1 2060 THR 2060 ? ? ? B . A 1 2061 TRP 2061 ? ? ? B . A 1 2062 ARG 2062 ? ? ? B . A 1 2063 GLU 2063 ? ? ? B . A 1 2064 LEU 2064 ? ? ? B . A 1 2065 PHE 2065 ? ? ? B . A 1 2066 PRO 2066 ? ? ? B . A 1 2067 SER 2067 ? ? ? B . A 1 2068 VAL 2068 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rab6-interacting protein 1 {PDB ID=3cwz, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3cwz.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 3cwz, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-05-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-01 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; ;EHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKRMLVEKMGREAVE LGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLSTSGILLDS ERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTKKLYK RYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGS LERVLVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 250 362 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3cwz 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2069 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2e-07 32.143 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMAQKKKRRKKDIDFLGLYEEELLNYDSEDGEDELEHEYYKAKVYEVVTATGDVRGAGTDANVFITLFGENGLSPKLHLTSKSESAFEKANVDVFRVRTNNVGLIYKIRIEHDNTGLNASWYLDRVIVTDMKRPHLRYYFNCNNWLSKVEGDRQWCRDLLASFDPMDMPRGNKYEIKVYTGDVIGAGT-DADVFINIFGEYGDTGERRLENEKDNFEKGAEDKFTLDAPDLGQLMKINVGHNNKGGSAGWFLSKIIIEDIGNKRKYDFPLNRWLALDEDDGKIQRDILVGGAETTAITYIVTVFTGDIRGAGTKSKIYLVMYGARGNKNSGKIFLEGGVFDRGRTDIFHIDLAVLLSPLSRVSIGHGNIGVNRGWYCEKVVILCPFTGIQQTFPCSNWLDEKKADGLIERQLYEMVSLRKKRLKKYPWSLWVWTTDLKKAGTNSPIFIQIYGKKGRTDEILLNPNNKWFKPGIIEKFRMELPDLGRFYKIRAWHDRQNPGSGWHLEKMTLMNTINKDKYNFNCNRWLDANEDDNEIVREMTAEGPTVRRIMGMARYRVTVCTGELEGAGTDANVYLCLFGDVGDTGERLLYNCRNNTDLFEKGNADEFTIESVTMRKVRRVRVRHDGKGSGSGWYLDRVLVREEGQPESDNVEFPCLRWLDKDKDDGQLVRELLPSDSNATLKNFRYHISVKTGDVSGASTDSRVYIKLYGEKSDTIKQVLLVSDNNLKDYFERGRVDEFTLETLNIGTINRLVIGHDSTGMHAGWFLGSVQIRVPRQGKQYTFPANRWLDKNQADGRLEVELYPSEVVEIQKLVHYEIEIWTGDVGGAGTTSRVFVQIYGEEGKTEVLFLSSRSKVFDRGSKDIFQTDTFTIYAIDLGALTKIRIRHDNTGNRPGWFLDRVDITDVNNETTYYFPCQRWLAVEEDDGQLSRELLPVDESYVLPSEDEEGGGQGDNNPLDNLALEQKDKSTTFSVTIKTGDKKNAGTDANVFITLFGTQDNNGMTLLKSSKTNSDKFERDSIEIFTVETLDLGDLWKVRIGHDNTGKAPGWFVDWVEVDAPSLGKCMTFPCGRWLAKNEDDGSIVRDLFHAELQTRLYTPFVPYEITLYTSDVFAAGTDANIFIVIYGCDAVCTRQKFLCTNKREQKLFFERKSASRFIVELEDVGEIIEKIRIGHDNTGINPGWHCSHVDIRRLLPEKDGTETLTFPCDRWLATSEDDKKTIRELVPYDIFTEKYMKDGSLRQVYKEVEEPLDIVLYSVQIFTGNVPGAGTDAKVYITIYGDLGDTGERYLGKSENRTNKFEKGTADTFIIEAADLGVIYKIKLRHDNTKWCADWYVEKVEIWNDTNEDEFLFLCGRWLSLKKEDGRLERLFYEKEYTGDRSSNCSSPADFWEIALSSKMADVDIDTVTGPMVDYVQDGPVIPYYVSVTTGKHKEAATDSRAFVLLIGEDDECTNRIWLDYPQGKRGFSCGSVEEFYVGGLDVGIIKKIELGHDGASPESCWLVEELCLAVPTQGTKYTLRCNCWLAKDRGDGVTSRVFDLLDAMVVNIGKKVLYEMTVWTGDVVGGGTDSNIFMTLYGINGSTEEVQLDKKKARFEREQNDTFIMEILDIAPFTKMRIRIDGMGSRPEWFLERILLKNMNTGDLTMFYYGDWLSQKKGKKTLVCEICAVIDGEEMMEWTSYTVSVKTSDILGAGTDANVFIIIFGENGDSGTLALKQSANWNKFERNNTDTFNFSDMLSLGHLCKLRVWHDNKGIFPGWHLSYVDVKDNSRDETFRFQCDCWLSKSEGDRQTLRDFACANNEIRDELEETTYEIVIETGNGGETRENVWLILEGRKNRSKEFLVENSSRQRAFRKGTTDTFEFDSIFLGDIASLCVGHLAREDRFIPKRELVWHVKTITITEMEYGNVYFFNCDCLIPLKRKRKYFKVFEVTKTTESFASKIQSLVPVKYEVIVTTGYEPGAGTDANVFVTIFGANGDTGKRELKQKMRNLFERGSTDRFFLETLELGELRKVRLEHDSSGYYSGWLVEKVEVTNTSTGVATIFSCGRWLDKSRGDGLTWRELFPSV 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET--QILQIPRNVLE------MTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLER-VLVGELLTS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3cwz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . TYR 174 174 ? A -14.436 41.984 167.120 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 2 C CA . TYR 174 174 ? A -14.894 43.219 166.397 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 3 C C . TYR 174 174 ? A -15.458 44.223 167.368 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 4 O O . TYR 174 174 ? A -16.490 43.973 167.989 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 5 C CB . TYR 174 174 ? A -15.948 42.936 165.280 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 6 C CG . TYR 174 174 ? A -15.335 42.127 164.177 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 7 C CD1 . TYR 174 174 ? A -15.246 40.735 164.303 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 8 C CD2 . TYR 174 174 ? A -14.790 42.747 163.041 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 9 C CE1 . TYR 174 174 ? A -14.596 39.974 163.325 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 10 C CE2 . TYR 174 174 ? A -14.142 41.984 162.057 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 11 C CZ . TYR 174 174 ? A -14.050 40.596 162.199 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 12 O OH . TYR 174 174 ? A -13.440 39.797 161.216 1 1 B TYR 0.590 1 ATOM 13 N N . GLU 175 175 ? A -14.791 45.374 167.534 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 14 C CA . GLU 175 175 ? A -15.229 46.455 168.386 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 15 C C . GLU 175 175 ? A -16.158 47.239 167.528 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 16 O O . GLU 175 175 ? A -15.786 47.614 166.422 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 17 C CB . GLU 175 175 ? A -14.058 47.366 168.743 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 18 C CG . GLU 175 175 ? A -14.371 48.525 169.713 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 19 C CD . GLU 175 175 ? A -13.063 49.201 170.141 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 20 O OE1 . GLU 175 175 ? A -11.983 48.605 169.878 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 21 O OE2 . GLU 175 175 ? A -13.141 50.280 170.773 1 1 B GLU 0.600 1 ATOM 22 N N . ILE 176 176 ? A -17.425 47.398 167.887 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 23 C CA . ILE 176 176 ? A -18.384 48.054 167.026 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 24 C C . ILE 176 176 ? A -18.372 49.502 167.524 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 25 O O . ILE 176 176 ? A -17.482 49.824 168.326 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 26 C CB . ILE 176 176 ? A -19.717 47.307 167.129 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 27 C CG1 . ILE 176 176 ? A -19.588 45.776 166.816 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 28 C CG2 . ILE 176 176 ? A -20.899 48.016 166.436 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 29 C CD1 . ILE 176 176 ? A -20.703 44.875 167.420 1 1 B ILE 0.570 1 ATOM 30 N N . LYS 177 177 ? A -19.185 50.474 167.060 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 31 C CA . LYS 177 177 ? A -19.436 51.767 167.672 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 32 C C . LYS 177 177 ? A -20.611 52.434 167.002 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 33 O O . LYS 177 177 ? A -20.558 52.862 165.853 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 34 C CB . LYS 177 177 ? A -18.222 52.716 167.902 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 35 C CG . LYS 177 177 ? A -18.555 54.119 168.428 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 36 C CD . LYS 177 177 ? A -17.261 54.928 168.628 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 37 C CE . LYS 177 177 ? A -17.508 56.371 169.064 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 38 N NZ . LYS 177 177 ? A -16.217 57.074 169.196 1 1 B LYS 0.520 1 ATOM 39 N N . VAL 178 178 ? A -21.771 52.499 167.683 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 40 C CA . VAL 178 178 ? A -22.988 53.087 167.150 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 41 C C . VAL 178 178 ? A -22.872 54.578 167.465 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 42 O O . VAL 178 178 ? A -22.710 54.904 168.585 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 43 C CB . VAL 178 178 ? A -24.230 52.533 167.869 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 44 C CG1 . VAL 178 178 ? A -25.495 53.238 167.378 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 45 C CG2 . VAL 178 178 ? A -24.347 51.015 167.626 1 1 B VAL 0.550 1 ATOM 46 N N . TYR 179 179 ? A -22.894 55.498 166.479 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 47 C CA . TYR 179 179 ? A -22.802 56.916 166.828 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 48 C C . TYR 179 179 ? A -24.165 57.532 166.541 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 49 O O . TYR 179 179 ? A -24.568 57.737 165.389 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 50 C CB . TYR 179 179 ? A -21.629 57.556 166.028 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 51 C CG . TYR 179 179 ? A -21.356 59.000 166.378 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 52 C CD1 . TYR 179 179 ? A -21.817 59.974 165.487 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 53 C CD2 . TYR 179 179 ? A -20.648 59.427 167.517 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 54 C CE1 . TYR 179 179 ? A -21.665 61.337 165.746 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 55 C CE2 . TYR 179 179 ? A -20.425 60.797 167.743 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 56 C CZ . TYR 179 179 ? A -20.943 61.753 166.861 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 57 O OH . TYR 179 179 ? A -20.705 63.129 167.030 1 1 B TYR 0.540 1 ATOM 58 N N . THR 180 180 ? A -24.927 57.815 167.613 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 59 C CA . THR 180 180 ? A -26.254 58.436 167.572 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 60 C C . THR 180 180 ? A -26.114 59.914 167.314 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 61 O O . THR 180 180 ? A -25.177 60.550 167.791 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 62 C CB . THR 180 180 ? A -27.058 58.203 168.856 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 63 O OG1 . THR 180 180 ? A -27.196 56.807 169.075 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 64 C CG2 . THR 180 180 ? A -28.496 58.752 168.854 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 65 N N . GLY 181 181 ? A -27.026 60.535 166.539 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 66 C CA . GLY 181 181 ? A -26.982 61.984 166.361 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 67 C C . GLY 181 181 ? A -27.461 62.704 167.592 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 68 O O . GLY 181 181 ? A -28.663 62.870 167.777 1 1 B GLY 0.550 1 ATOM 69 N N . 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A -30.540 65.910 167.193 1 1 B VAL 0.290 1 ATOM 83 C CG2 . VAL 183 183 ? A -30.156 68.421 167.608 1 1 B VAL 0.290 1 ATOM 84 N N . ILE 184 184 ? A -31.350 67.631 170.425 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 85 C CA . ILE 184 184 ? A -32.693 67.694 170.976 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 86 C C . ILE 184 184 ? A -33.693 66.919 170.127 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 87 O O . ILE 184 184 ? A -33.722 67.028 168.905 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 88 C CB . ILE 184 184 ? A -33.144 69.151 171.089 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 89 C CG1 . ILE 184 184 ? A -32.209 69.920 172.054 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 90 C CG2 . ILE 184 184 ? A -34.627 69.265 171.528 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 91 C CD1 . ILE 184 184 ? A -32.422 71.439 172.034 1 1 B ILE 0.170 1 ATOM 92 N N . GLY 185 185 ? A -34.556 66.107 170.780 1 1 B GLY 0.330 1 ATOM 93 C CA . GLY 185 185 ? A -35.588 65.349 170.080 1 1 B GLY 0.330 1 ATOM 94 C C . GLY 185 185 ? A -35.120 64.031 169.513 1 1 B GLY 0.330 1 ATOM 95 O O . GLY 185 185 ? A -35.774 63.452 168.658 1 1 B GLY 0.330 1 ATOM 96 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.504 2 1 3 0.019 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 174 TYR 1 0.590 2 1 A 175 GLU 1 0.600 3 1 A 176 ILE 1 0.570 4 1 A 177 LYS 1 0.520 5 1 A 178 VAL 1 0.550 6 1 A 179 TYR 1 0.540 7 1 A 180 THR 1 0.550 8 1 A 181 GLY 1 0.550 9 1 A 182 ASP 1 0.460 10 1 A 183 VAL 1 0.290 11 1 A 184 ILE 1 0.170 12 1 A 185 GLY 1 0.330 13 1 A 186 ALA 1 0.420 14 1 A 187 GLY 1 0.410 15 1 A 188 THR 1 0.500 16 1 A 189 ASP 1 0.530 17 1 A 190 ALA 1 0.550 18 1 A 191 ASP 1 0.530 19 1 A 192 VAL 1 0.570 20 1 A 193 PHE 1 0.530 21 1 A 194 ILE 1 0.550 22 1 A 195 ASN 1 0.550 23 1 A 196 ILE 1 0.590 24 1 A 197 PHE 1 0.610 25 1 A 198 GLY 1 0.630 26 1 A 199 GLU 1 0.600 27 1 A 200 TYR 1 0.580 28 1 A 201 GLY 1 0.630 29 1 A 202 ASP 1 0.570 30 1 A 203 THR 1 0.590 31 1 A 204 GLY 1 0.500 32 1 A 205 GLU 1 0.450 33 1 A 206 ARG 1 0.270 34 1 A 207 ARG 1 0.310 35 1 A 208 LEU 1 0.380 36 1 A 209 GLU 1 0.340 37 1 A 210 ASN 1 0.450 38 1 A 211 GLU 1 0.380 39 1 A 212 LYS 1 0.490 40 1 A 213 ASP 1 0.520 41 1 A 214 ASN 1 0.460 42 1 A 215 PHE 1 0.360 43 1 A 216 GLU 1 0.470 44 1 A 217 LYS 1 0.340 45 1 A 218 GLY 1 0.300 46 1 A 219 ALA 1 0.310 47 1 A 220 GLU 1 0.410 48 1 A 221 ASP 1 0.400 49 1 A 222 LYS 1 0.480 50 1 A 223 PHE 1 0.470 51 1 A 224 THR 1 0.600 52 1 A 225 LEU 1 0.620 53 1 A 226 ASP 1 0.600 54 1 A 227 ALA 1 0.600 55 1 A 228 PRO 1 0.600 56 1 A 229 ASP 1 0.640 57 1 A 230 LEU 1 0.640 58 1 A 231 GLY 1 0.690 59 1 A 232 GLN 1 0.640 60 1 A 233 LEU 1 0.640 61 1 A 234 MET 1 0.600 62 1 A 235 LYS 1 0.590 63 1 A 236 ILE 1 0.590 64 1 A 237 ASN 1 0.540 65 1 A 238 VAL 1 0.560 66 1 A 239 GLY 1 0.520 67 1 A 240 HIS 1 0.550 68 1 A 241 ASN 1 0.540 69 1 A 242 ASN 1 0.520 70 1 A 243 LYS 1 0.530 71 1 A 244 GLY 1 0.500 72 1 A 245 GLY 1 0.470 73 1 A 246 SER 1 0.490 74 1 A 247 ALA 1 0.540 75 1 A 248 GLY 1 0.510 76 1 A 249 TRP 1 0.510 77 1 A 250 PHE 1 0.530 78 1 A 251 LEU 1 0.540 79 1 A 252 SER 1 0.590 80 1 A 253 LYS 1 0.590 81 1 A 254 ILE 1 0.600 82 1 A 255 ILE 1 0.620 83 1 A 256 ILE 1 0.660 84 1 A 257 GLU 1 0.640 85 1 A 258 ASP 1 0.650 86 1 A 259 ILE 1 0.500 87 1 A 260 GLY 1 0.500 88 1 A 261 ASN 1 0.500 89 1 A 262 LYS 1 0.540 90 1 A 263 ARG 1 0.560 91 1 A 264 LYS 1 0.610 92 1 A 265 TYR 1 0.630 93 1 A 266 ASP 1 0.640 94 1 A 267 PHE 1 0.620 95 1 A 268 PRO 1 0.640 96 1 A 269 LEU 1 0.590 97 1 A 270 ASN 1 0.560 98 1 A 271 ARG 1 0.510 99 1 A 272 TRP 1 0.480 100 1 A 273 LEU 1 0.500 101 1 A 274 ALA 1 0.500 102 1 A 275 LEU 1 0.420 103 1 A 276 ASP 1 0.380 104 1 A 277 GLU 1 0.380 105 1 A 278 ASP 1 0.360 106 1 A 279 ASP 1 0.400 107 1 A 280 GLY 1 0.470 108 1 A 281 LYS 1 0.470 109 1 A 282 ILE 1 0.470 110 1 A 283 GLN 1 0.470 111 1 A 284 ARG 1 0.420 112 1 A 285 ASP 1 0.380 113 1 A 286 ILE 1 0.460 114 1 A 287 LEU 1 0.430 115 1 A 288 VAL 1 0.510 116 1 A 289 GLY 1 0.460 117 1 A 290 GLY 1 0.440 118 1 A 291 ALA 1 0.530 119 1 A 292 GLU 1 0.240 120 1 A 293 THR 1 0.170 121 1 A 294 THR 1 0.210 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #