data_SMR-b5a4894842b66f2d2722041350e6ef9a_14
_entry.id SMR-b5a4894842b66f2d2722041350e6ef9a_14
_struct.entry_id SMR-b5a4894842b66f2d2722041350e6ef9a_14
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - P75471/ HMW2_MYCPN, Cytadherence high molecular weight protein 2

Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries P75471'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
#
loop_
_citation.id
_citation.title
_citation.journal_abbrev
_citation.journal_volume
_citation.page_first
_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 248722.800 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP HMW2_MYCPN P75471 1
;MNDTDKKFPLQPVYDTGFDDGYLQRDYEKCLESAAANDAQTVELQTQLLAEIKNLENEIKALKAQESRQP
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LEKNQQETAAKSERELKVALEKLNQAKKAFLQIRKQQLLEIASVKQQLAQKANLLKNQQAELDKQTEELE
AAFLEQDTDKKELEKALHSVKSKQELLERERSFLLQKQREFAEHVAGFKRQVHFKTTQMQRLSEFNKQQQ
SEQIKRETELKIAFADLKKDYQLFELQKNQEFQQIEQKHKELELLAQKQAELKQELEQKATALASQDQDT
VQAKLDLARQQHELELRQNAFNQASLSLNKQREQLTNQVKVLHGELKKRHEKLTLKDRLLAEKEKDQHKK
DAEINQRFKQFENEYADFDQAKKRELQELNQIRRNLEQSNASLLKKRNQLTLDFALLRKVQHNTQTNRVQ
LNTQIKEFLLEKKNFQKASDEAALQKALLIKRLRSFASKLQLQREALAIQKLEFDKRDEQQKSEINNAKL
QLEQFKLEKQNFDEAKQKQLIEFKDQCQRLDVEKRLLKQKLVQLKNLSKSYLTYKNRADLSQQQLQHKYA
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TTLSKLHRELKAQNEATAHKNREVLEIENYYKKELQRLTTEKSEFDNNKNRLFEYFRKIRNEIEKKEAHI
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AEREREINNKDSLLTQKIQTAKQKLSEKEARILKLLEKMRAVEQQYQAEITRLKTRNADLEKNDNKHLFP
PLFKINGNDMNYPYPYPWFYPQQKQEDSSNQIRHLFEQQLQFMQQRYENELTELRRQRALLEKKLDQIQL
ESQLSAKKNDFEKVEQMMQKLLEKTEQKLSAFDQKINALAEQINTQKAEHADSEKQQLLLRIEQLEKQNL
AQAVQTPQPVQPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAEINSIKKLIAQKAAK
;
'Cytadherence high molecular weight protein 2'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1818 1 1818
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . HMW2_MYCPN P75471 . 1 1818 272634
'Mycoplasma pneumoniae (strain ATCC 29342 / M129 / Subtype 1)(Mycoplasmoides pneumoniae)'
1997-02-01 66DF4B08F0FCFBC0
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no G
;MNDTDKKFPLQPVYDTGFDDGYLQRDYEKCLESAAANDAQTVELQTQLLAEIKNLENEIKALKAQESRQP
DPHNNARIQSLEASLNRLVNEYNNFEFQKNYMVDRVAELNNKARFFKDELKRLQQENAAFVNSRYANWAD
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;

;MNDTDKKFPLQPVYDTGFDDGYLQRDYEKCLESAAANDAQTVELQTQLLAEIKNLENEIKALKAQESRQP
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AQAVQTPQPVQPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAEINSIKKLIAQKAAK
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ASN .
1 3 ASP .
1 4 THR .
1 5 ASP .
1 6 LYS .
1 7 LYS .
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1 9 PRO .
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1 11 GLN .
1 12 PRO .
1 13 VAL .
1 14 TYR .
1 15 ASP .
1 16 THR .
1 17 GLY .
1 18 PHE .
1 19 ASP .
1 20 ASP .
1 21 GLY .
1 22 TYR .
1 23 LEU .
1 24 GLN .
1 25 ARG .
1 26 ASP .
1 27 TYR .
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1 29 LYS .
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1 32 GLU .
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1 34 ALA .
1 35 ALA .
1 36 ALA .
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1 38 ASP .
1 39 ALA .
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1 41 THR .
1 42 VAL .
1 43 GLU .
1 44 LEU .
1 45 GLN .
1 46 THR .
1 47 GLN .
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1 49 LEU .
1 50 ALA .
1 51 GLU .
1 52 ILE .
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1 57 ASN .
1 58 GLU .
1 59 ILE .
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1 72 PRO .
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1 75 ASN .
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1 89 VAL .
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1 93 ASN .
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1 1803 ALA .
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1 1810 LYS .
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#
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_struct_asym.entity_id
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A 1 .
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A 1 303 ASP 303 ? ? ? G .
A 1 304 LEU 304 ? ? ? G .
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A 1 307 LYS 307 ? ? ? G .
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A 1 309 ASN 309 ? ? ? G .
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#
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_ma_data.content_type_other_details
1
'Kinetochore scaffold 1 {PDB ID=8ppr, label_asym_id=G, auth_asym_id=K, SMTL ID=8ppr.1.G}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 8ppr, label_asym_id=G'
'target-template alignment' .
4 'model 14' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
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#
#
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_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-05-07
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-02
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
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A 1 .
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1.000000 0 0 0
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1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 7 1 K
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_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
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;

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;

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#
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_ma_template_poly_segment.template_id
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1 1 1989 2128
#
#
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1 PDB . 8ppr 2024-07-03
#
#
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1 1 A 1 1818
#
#
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_ma_alignment_info.data_id
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_ma_alignment_info.alignment_length
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1 3 1 1828 'target-template pairwise alignment' local
#
#
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1 1 1 A 'HHblits e-value' . 470.000 18.462
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
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#
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1 1 1
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2 1 2
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#
#
loop_
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_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8ppr.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 14' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
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_atom_site.Cartn_z
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_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
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_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . ALA 338 338 ? A 254.866 271.540 156.354 1 1 G ALA 0.610 1
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ATOM 3 C C . ALA 338 338 ? A 253.851 272.684 158.460 1 1 G ALA 0.610 1
ATOM 4 O O . ALA 338 338 ? A 254.138 272.643 159.646 1 1 G ALA 0.610 1
ATOM 5 C CB . ALA 338 338 ? A 255.204 273.981 156.720 1 1 G ALA 0.610 1
ATOM 6 N N . GLU 339 339 ? A 252.551 272.754 158.072 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 7 C CA . GLU 339 339 ? A 251.379 272.639 158.940 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 8 C C . GLU 339 339 ? A 251.258 271.348 159.749 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 9 O O . GLU 339 339 ? A 250.865 271.352 160.906 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 10 C CB . GLU 339 339 ? A 250.124 272.797 158.073 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 11 C CG . GLU 339 339 ? A 249.990 274.185 157.406 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 12 C CD . GLU 339 339 ? A 248.758 274.222 156.501 1 1 G GLU 0.600 1
ATOM 13 O OE1 . GLU 339 339 ? A 248.179 273.134 156.248 1 1 G GLU 0.600 1
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ATOM 15 N N . LYS 340 340 ? A 251.622 270.186 159.165 1 1 G LYS 0.630 1
ATOM 16 C CA . LYS 340 340 ? A 251.755 268.950 159.924 1 1 G LYS 0.630 1
ATOM 17 C C . LYS 340 340 ? A 252.798 269.014 161.048 1 1 G LYS 0.630 1
ATOM 18 O O . LYS 340 340 ? A 252.480 268.738 162.196 1 1 G LYS 0.630 1
ATOM 19 C CB . LYS 340 340 ? A 252.055 267.777 158.964 1 1 G LYS 0.630 1
ATOM 20 C CG . LYS 340 340 ? A 250.863 267.493 158.036 1 1 G LYS 0.630 1
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ATOM 31 O OD2 . ASP 341 341 ? A 257.486 270.215 158.869 1 1 G ASP 0.660 1
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ATOM 33 C CA . SER 342 342 ? A 253.523 272.765 163.433 1 1 G SER 0.680 1
ATOM 34 C C . SER 342 342 ? A 252.499 272.159 164.379 1 1 G SER 0.680 1
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ATOM 36 C CB . SER 342 342 ? A 253.011 274.124 162.842 1 1 G SER 0.680 1
ATOM 37 O OG . SER 342 342 ? A 251.874 273.973 162.003 1 1 G SER 0.680 1
ATOM 38 N N . PHE 343 343 ? A 251.520 271.391 163.852 1 1 G PHE 0.670 1
ATOM 39 C CA . PHE 343 343 ? A 250.557 270.613 164.616 1 1 G PHE 0.670 1
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ATOM 49 N N . GLU 344 344 ? A 252.192 268.770 165.034 1 1 G GLU 0.730 1
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ATOM 55 C CD . GLU 344 344 ? A 254.262 265.030 163.400 1 1 G GLU 0.730 1
ATOM 56 O OE1 . GLU 344 344 ? A 255.490 265.291 163.452 1 1 G GLU 0.730 1
ATOM 57 O OE2 . GLU 344 344 ? A 253.762 264.034 162.816 1 1 G GLU 0.730 1
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ATOM 84 N NE . ARG 347 347 ? A 251.671 264.332 168.905 1 1 G ARG 0.690 1
ATOM 85 C CZ . ARG 347 347 ? A 252.314 263.547 168.032 1 1 G ARG 0.690 1
ATOM 86 N NH1 . ARG 347 347 ? A 251.647 262.861 167.112 1 1 G ARG 0.690 1
ATOM 87 N NH2 . ARG 347 347 ? A 253.644 263.491 168.053 1 1 G ARG 0.690 1
ATOM 88 N N . ASN 348 348 ? A 252.992 267.840 170.929 1 1 G ASN 0.740 1
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ATOM 92 C CB . ASN 348 348 ? A 255.439 267.540 171.088 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 93 C CG . ASN 348 348 ? A 255.522 266.403 170.067 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 94 O OD1 . ASN 348 348 ? A 254.722 265.475 169.975 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 95 N ND2 . ASN 348 348 ? A 256.597 266.486 169.236 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 96 N N . THR 349 349 ? A 253.973 269.832 172.764 1 1 G THR 0.750 1
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ATOM 100 C CB . THR 349 349 ? A 253.714 272.277 173.276 1 1 G THR 0.750 1
ATOM 101 O OG1 . THR 349 349 ? A 254.890 272.612 172.556 1 1 G THR 0.750 1
ATOM 102 C CG2 . THR 349 349 ? A 253.598 273.345 174.377 1 1 G THR 0.750 1
ATOM 103 N N . ALA 350 350 ? A 251.449 270.266 174.163 1 1 G ALA 0.780 1
ATOM 104 C CA . ALA 350 350 ? A 250.272 269.895 174.931 1 1 G ALA 0.780 1
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ATOM 106 O O . ALA 350 350 ? A 250.150 268.660 176.991 1 1 G ALA 0.780 1
ATOM 107 C CB . ALA 350 350 ? A 249.072 269.674 173.976 1 1 G ALA 0.780 1
ATOM 108 N N . LEU 351 351 ? A 251.124 267.584 175.284 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 109 C CA . LEU 351 351 ? A 251.543 266.409 176.045 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 110 C C . LEU 351 351 ? A 252.529 266.703 177.167 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 111 O O . LEU 351 351 ? A 252.411 266.171 178.269 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 112 C CB . LEU 351 351 ? A 252.163 265.337 175.116 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 113 C CG . LEU 351 351 ? A 251.125 264.449 174.406 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 114 C CD1 . LEU 351 351 ? A 251.801 263.653 173.278 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 115 C CD2 . LEU 351 351 ? A 250.441 263.496 175.404 1 1 G LEU 0.710 1
ATOM 116 N N . ASN 352 352 ? A 253.521 267.581 176.923 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 117 C CA . ASN 352 352 ? A 254.419 268.062 177.961 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 118 C C . ASN 352 352 ? A 253.707 268.817 179.076 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 119 O O . ASN 352 352 ? A 253.962 268.553 180.249 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 120 C CB . ASN 352 352 ? A 255.520 268.982 177.385 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 121 C CG . ASN 352 352 ? A 256.508 268.147 176.583 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 122 O OD1 . ASN 352 352 ? A 256.669 266.949 176.784 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 123 N ND2 . ASN 352 352 ? A 257.260 268.818 175.677 1 1 G ASN 0.720 1
ATOM 124 N N . ASP 353 353 ? A 252.775 269.732 178.742 1 1 G ASP 0.710 1
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ATOM 127 O O . ASP 353 353 ? A 250.975 269.560 181.723 1 1 G ASP 0.710 1
ATOM 128 C CB . ASP 353 353 ? A 251.071 271.502 178.986 1 1 G ASP 0.710 1
ATOM 129 C CG . ASP 353 353 ? A 251.956 272.662 178.536 1 1 G ASP 0.710 1
ATOM 130 O OD1 . ASP 353 353 ? A 253.109 272.786 179.044 1 1 G ASP 0.710 1
ATOM 131 O OD2 . ASP 353 353 ? A 251.474 273.458 177.693 1 1 G ASP 0.710 1
ATOM 132 N N . ILE 354 354 ? A 250.434 268.433 179.838 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 133 C CA . ILE 354 354 ? A 249.710 267.332 180.484 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 134 C C . ILE 354 354 ? A 250.577 266.604 181.506 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 135 O O . ILE 354 354 ? A 250.234 266.565 182.682 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 136 C CB . ILE 354 354 ? A 249.050 266.347 179.498 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 137 C CG1 . ILE 354 354 ? A 247.933 267.050 178.683 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 138 C CG2 . ILE 354 354 ? A 248.463 265.110 180.225 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 139 C CD1 . ILE 354 354 ? A 247.451 266.277 177.446 1 1 G ILE 0.690 1
ATOM 140 N N . ASN 355 355 ? A 251.786 266.128 181.125 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 141 C CA . ASN 355 355 ? A 252.691 265.472 182.059 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 142 C C . ASN 355 355 ? A 253.090 266.353 183.243 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 143 O O . ASN 355 355 ? A 253.110 265.900 184.383 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 144 C CB . ASN 355 355 ? A 253.980 265.009 181.335 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 145 C CG . ASN 355 355 ? A 253.658 263.865 180.379 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 146 O OD1 . ASN 355 355 ? A 252.665 263.165 180.488 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 147 N ND2 . ASN 355 355 ? A 254.562 263.629 179.396 1 1 G ASN 0.740 1
ATOM 148 N N . ARG 356 356 ? A 253.387 267.651 183.012 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 149 C CA . ARG 356 356 ? A 253.698 268.593 184.079 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 150 C C . ARG 356 356 ? A 252.561 268.795 185.086 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 151 O O . ARG 356 356 ? A 252.767 268.639 186.286 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 152 C CB . ARG 356 356 ? A 254.074 269.975 183.496 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 153 C CG . ARG 356 356 ? A 255.419 270.020 182.748 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 154 C CD . ARG 356 356 ? A 255.634 271.375 182.078 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 155 N NE . ARG 356 356 ? A 256.949 271.297 181.365 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 156 C CZ . ARG 356 356 ? A 257.420 272.286 180.598 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 157 N NH1 . ARG 356 356 ? A 256.699 273.379 180.389 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 158 N NH2 . ARG 356 356 ? A 258.597 272.166 179.989 1 1 G ARG 0.660 1
ATOM 159 N N . MET 357 357 ? A 251.316 269.071 184.623 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 160 C CA . MET 357 357 ? A 250.161 269.217 185.504 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 161 C C . MET 357 357 ? A 249.801 267.929 186.258 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 162 O O . MET 357 357 ? A 249.452 267.956 187.436 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 163 C CB . MET 357 357 ? A 248.935 269.909 184.824 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 164 C CG . MET 357 357 ? A 248.197 269.133 183.712 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 165 S SD . MET 357 357 ? A 246.811 270.058 182.960 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 166 C CE . MET 357 357 ? A 246.343 268.880 181.658 1 1 G MET 0.670 1
ATOM 167 N N . GLU 358 358 ? A 249.927 266.739 185.630 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 168 C CA . GLU 358 358 ? A 249.807 265.450 186.303 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 169 C C . GLU 358 358 ? A 250.847 265.214 187.401 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 170 O O . GLU 358 358 ? A 250.531 264.710 188.480 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 171 C CB . GLU 358 358 ? A 249.845 264.299 185.282 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 172 C CG . GLU 358 358 ? A 248.592 264.244 184.376 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 173 C CD . GLU 358 358 ? A 248.669 263.107 183.358 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 174 O OE1 . GLU 358 358 ? A 249.691 262.377 183.346 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 175 O OE2 . GLU 358 358 ? A 247.671 262.951 182.608 1 1 G GLU 0.700 1
ATOM 176 N N . GLN 359 359 ? A 252.117 265.618 187.177 1 1 G GLN 0.710 1
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ATOM 185 N N . GLU 360 360 ? A 252.353 267.832 189.082 1 1 G GLU 0.690 1
ATOM 186 C CA . GLU 360 360 ? A 251.853 268.789 190.065 1 1 G GLU 0.690 1
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ATOM 267 O OXT . GLU 369 369 ? A 249.403 261.582 204.499 1 1 G GLU 0.570 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.682
2 1 3 0
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
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_ma_qa_metric_local.metric_id
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1 1 A 338 ALA 1 0.610
2 1 A 339 GLU 1 0.600
3 1 A 340 LYS 1 0.630
4 1 A 341 ASP 1 0.660
5 1 A 342 SER 1 0.680
6 1 A 343 PHE 1 0.670
7 1 A 344 GLU 1 0.730
8 1 A 345 ARG 1 0.690
9 1 A 346 LEU 1 0.740
10 1 A 347 ARG 1 0.690
11 1 A 348 ASN 1 0.740
12 1 A 349 THR 1 0.750
13 1 A 350 ALA 1 0.780
14 1 A 351 LEU 1 0.710
15 1 A 352 ASN 1 0.720
16 1 A 353 ASP 1 0.710
17 1 A 354 ILE 1 0.690
18 1 A 355 ASN 1 0.740
19 1 A 356 ARG 1 0.660
20 1 A 357 MET 1 0.670
21 1 A 358 GLU 1 0.700
22 1 A 359 GLN 1 0.710
23 1 A 360 GLU 1 0.690
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25 1 A 362 ALA 1 0.750
26 1 A 363 LEU 1 0.680
27 1 A 364 PHE 1 0.630
28 1 A 365 ALA 1 0.710
29 1 A 366 LYS 1 0.620
30 1 A 367 HIS 1 0.590
31 1 A 368 LEU 1 0.590
32 1 A 369 GLU 1 0.570
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
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the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#