data_SMR-ee86d003b762b218fea538b4227e9a61_2 _entry.id SMR-ee86d003b762b218fea538b4227e9a61_2 _struct.entry_id SMR-ee86d003b762b218fea538b4227e9a61_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8IXJ9/ ASXL1_HUMAN, Polycomb group protein ASXL1 Estimated model accuracy of this model is 0.056, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8IXJ9' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 2 . 4 2 4 . 5 2 5 . 6 2 6 . 7 3 1 . 8 3 4 . 9 4 1 . 10 4 2 . 11 4 4 . 12 5 3 . 13 6 1 . 14 6 3 . 15 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 193380.829 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ASXL1_HUMAN Q8IXJ9 1 ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQEEAEIKSGLCVPGESVRIQRGPATRQRDGHFKKRSRPDLRTRA RRNLYKKQESEQAGVAKDAKSVASDVPLYKDGEAKTDPAGLSSPHLPGTSSAAPDLEGPEFPVESVASRI QAEPDNLARASASPDRIPSLPQETVDQEPKDQKRKSFEQAASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKP QPTKEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVVKGQPTYQICPRIIPTTESSCRGWTGARTLADIKARALQVRGARGH HCHREAATTAIGGGGGPGGGGGGATDEGGGRGSSSGDGGEACGHPEPRGGPSTPGKCTSDLQRTQLLPPY PLNGEHTQAGTAMSRARREDLPSLRKEESCLLQRATVGLTDGLGDASQLPVAPTGDQPCQALPLLSSQTS VAERLVEQPQLHPDVRTECESGTTSWESDDEEQGPTVPADNGPIPSLVGDDTLEKGTGQALDSHPTMKDP VNVTPSSTPESSPTDCLQNRAFDDELGLGGSCPPMRESDTRQENLKTKALVSNSSLHWIPIPSNDEVVKQ PKPESREHIPSVEPQVGEEWEKAAPTPPALPGDLTAEEGLDPLDSLTSLWTVPSRGGSDSNGSYCQQVDI EKLKINGDSEALSPHGESTDTASDFEGHLTEDSSEADTREAAVTKGSSVDKDEKPNWNQSAPLSKVNGDM RLVTRTDGMVAPQSWVSRVCAVRQKIPDSLLLASTEYQPRAVCLSMPGSSVEATNPLVMQLLQGSLPLEK VLPPAHDDSMSESPQVPLTKDQSHGSLRMGSLHGLGKNSGMVDGSSPSSLRALKEPLLPDSCETGTGLAR IEATQAPGAPQKNCKAVPSFDSLHPVTNPITSSRKLEEMDSKEQFSSFSCEDQKEVRAMSQDSNSNAAPG KSPGDLTTSRTPRFSSPNVISFGPEQTGRALGDQSNVTGQGKKLFGSGNVAATLQRPRPADPMPLPAEIP PVFPSGKLGPSTNSMSGGVQTPREDWAPKPHAFVGSVKNEKTFVGGPLKANAENRKATGHSPLELVGHLE GMPFVMDLPFWKLPREPGKGLSEPLEPSSLPSQLSIKQAFYGKLSKLQLSSTSFNYSSSSPTFPKGLAGS VVQLSHKANFGASHSASLSLQMFTDSSTVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVV R ; 'Polycomb group protein ASXL1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1541 1 1541 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ASXL1_HUMAN Q8IXJ9 . 1 1541 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28 8FCE072F3295AA34 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no N ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQEEAEIKSGLCVPGESVRIQRGPATRQRDGHFKKRSRPDLRTRA RRNLYKKQESEQAGVAKDAKSVASDVPLYKDGEAKTDPAGLSSPHLPGTSSAAPDLEGPEFPVESVASRI QAEPDNLARASASPDRIPSLPQETVDQEPKDQKRKSFEQAASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKP QPTKEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVVKGQPTYQICPRIIPTTESSCRGWTGARTLADIKARALQVRGARGH 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VAL . 1 38 ILE . 1 39 GLU . 1 40 ALA . 1 41 GLU . 1 42 GLY . 1 43 LEU . 1 44 LYS . 1 45 GLU . 1 46 MET . 1 47 ARG . 1 48 SER . 1 49 GLY . 1 50 THR . 1 51 SER . 1 52 PRO . 1 53 LEU . 1 54 ALA . 1 55 CYS . 1 56 LEU . 1 57 ASN . 1 58 ALA . 1 59 MET . 1 60 LEU . 1 61 HIS . 1 62 SER . 1 63 ASN . 1 64 SER . 1 65 ARG . 1 66 GLY . 1 67 GLY . 1 68 GLU . 1 69 GLY . 1 70 LEU . 1 71 PHE . 1 72 TYR . 1 73 LYS . 1 74 LEU . 1 75 PRO . 1 76 GLY . 1 77 ARG . 1 78 ILE . 1 79 SER . 1 80 LEU . 1 81 PHE . 1 82 THR . 1 83 LEU . 1 84 LYS . 1 85 LYS . 1 86 ASP . 1 87 ALA . 1 88 LEU . 1 89 GLN . 1 90 TRP . 1 91 SER . 1 92 ARG . 1 93 HIS . 1 94 PRO . 1 95 ALA . 1 96 THR . 1 97 VAL . 1 98 GLU . 1 99 GLY . 1 100 GLU . 1 101 GLU . 1 102 PRO . 1 103 GLU . 1 104 ASP . 1 105 THR . 1 106 ALA . 1 107 ASP . 1 108 VAL . 1 109 GLU . 1 110 SER . 1 111 CYS . 1 112 GLY . 1 113 SER . 1 114 ASN . 1 115 GLU . 1 116 ALA . 1 117 SER . 1 118 THR . 1 119 VAL . 1 120 SER . 1 121 GLY . 1 122 GLU . 1 123 ASN . 1 124 ASP . 1 125 VAL . 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A 1 1500 GLU 1500 ? ? ? N . A 1 1501 SER 1501 ? ? ? N . A 1 1502 ILE 1502 ? ? ? N . A 1 1503 SER 1503 ? ? ? N . A 1 1504 LEU 1504 ? ? ? N . A 1 1505 GLN 1505 ? ? ? N . A 1 1506 CYS 1506 ? ? ? N . A 1 1507 ALA 1507 ? ? ? N . A 1 1508 CYS 1508 ? ? ? N . A 1 1509 SER 1509 ? ? ? N . A 1 1510 LEU 1510 ? ? ? N . A 1 1511 LYS 1511 ? ? ? N . A 1 1512 ALA 1512 ? ? ? N . A 1 1513 MET 1513 ? ? ? N . A 1 1514 ILE 1514 ? ? ? N . A 1 1515 MET 1515 ? ? ? N . A 1 1516 CYS 1516 ? ? ? N . A 1 1517 GLN 1517 ? ? ? N . A 1 1518 GLY 1518 ? ? ? N . A 1 1519 CYS 1519 ? ? ? N . A 1 1520 GLY 1520 ? ? ? N . A 1 1521 ALA 1521 ? ? ? N . A 1 1522 PHE 1522 ? ? ? N . A 1 1523 CYS 1523 ? ? ? N . A 1 1524 HIS 1524 ? ? ? N . A 1 1525 ASP 1525 ? ? ? N . A 1 1526 ASP 1526 ? ? ? N . A 1 1527 CYS 1527 ? ? ? N . A 1 1528 ILE 1528 ? ? ? N . A 1 1529 GLY 1529 ? ? ? N . A 1 1530 PRO 1530 ? ? ? N . A 1 1531 SER 1531 ? ? ? N . A 1 1532 LYS 1532 ? ? ? N . A 1 1533 LEU 1533 ? ? ? N . A 1 1534 CYS 1534 ? ? ? N . A 1 1535 VAL 1535 ? ? ? N . A 1 1536 LEU 1536 ? ? ? N . A 1 1537 CYS 1537 ? ? ? N . A 1 1538 LEU 1538 ? ? ? N . A 1 1539 VAL 1539 ? ? ? N . A 1 1540 VAL 1540 ? ? ? N . A 1 1541 ARG 1541 ? ? ? N . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Polycomb group protein ASXL1 {PDB ID=8h1t, label_asym_id=N, auth_asym_id=N, SMTL ID=8h1t.1.N}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8h1t, label_asym_id=N' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'AlphaFold DB' 'reference database' . 8 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 1 7 5 2 8 6 3 2 7 3 1 8 3 3 9 4 1 10 4 3 11 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-05-07 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-02 7 'AlphaFold DB' https://alphafold.ebi.ac.uk v4 . # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A N 10 1 N # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQE ; ;MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGL FYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTES QSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSL ALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHF QQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQW KEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 377 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8h1t 2024-07-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1541 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1541 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6e-89 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGLFYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSLALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHFQQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQWKEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQEEAEIKSGLCVPGESVRIQRGPATRQRDGHFKKRSRPDLRTRARRNLYKKQESEQAGVAKDAKSVASDVPLYKDGEAKTDPAGLSSPHLPGTSSAAPDLEGPEFPVESVASRIQAEPDNLARASASPDRIPSLPQETVDQEPKDQKRKSFEQAASASFPEKKPRLEDRQSFRNTIESVHTEKPQPTKEEPKVPPIRIQLSRIKPPWVVKGQPTYQICPRIIPTTESSCRGWTGARTLADIKARALQVRGARGHHCHREAATTAIGGGGGPGGGGGGATDEGGGRGSSSGDGGEACGHPEPRGGPSTPGKCTSDLQRTQLLPPYPLNGEHTQAGTAMSRARREDLPSLRKEESCLLQRATVGLTDGLGDASQLPVAPTGDQPCQALPLLSSQTSVAERLVEQPQLHPDVRTECESGTTSWESDDEEQGPTVPADNGPIPSLVGDDTLEKGTGQALDSHPTMKDPVNVTPSSTPESSPTDCLQNRAFDDELGLGGSCPPMRESDTRQENLKTKALVSNSSLHWIPIPSNDEVVKQPKPESREHIPSVEPQVGEEWEKAAPTPPALPGDLTAEEGLDPLDSLTSLWTVPSRGGSDSNGSYCQQVDIEKLKINGDSEALSPHGESTDTASDFEGHLTEDSSEADTREAAVTKGSSVDKDEKPNWNQSAPLSKVNGDMRLVTRTDGMVAPQSWVSRVCAVRQKIPDSLLLASTEYQPRAVCLSMPGSSVEATNPLVMQLLQGSLPLEKVLPPAHDDSMSESPQVPLTKDQSHGSLRMGSLHGLGKNSGMVDGSSPSSLRALKEPLLPDSCETGTGLARIEATQAPGAPQKNCKAVPSFDSLHPVTNPITSSRKLEEMDSKEQFSSFSCEDQKEVRAMSQDSNSNAAPGKSPGDLTTSRTPRFSSPNVISFGPEQTGRALGDQSNVTGQGKKLFGSGNVAATLQRPRPADPMPLPAEIPPVFPSGKLGPSTNSMSGGVQTPREDWAPKPHAFVGSVKNEKTFVGGPLKANAENRKATGHSPLELVGHLEGMPFVMDLPFWKLPREPGKGLSEPLEPSSLPSQLSIKQAFYGKLSKLQLSSTSFNYSSSSPTFPKGLAGSVVQLSHKANFGASHSASLSLQMFTDSSTVESISLQCACSLKAMIMCQGCGAFCHDDCIGPSKLCVLCLVVR 2 1 2 MKDKQKKKKERTWAEAARLVLENYSDAPMTPKQILQVIEAEGLKEMRSGTSPLACLNAMLHSNSRGGEGLFYKLPGRISLFTLKKDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSNPRDSYRASSQANKQKKKTGVMLPRVVLTPLKVNGAHVESASGFSGCHADGESGSPSSSSSGSLALGSAAIRGQAEVTQDPAPLLRGFRKPATGQMKRNRGEEIDFETPGSILVNTNLRALINSRTFHALPSHFQQQLLFLLPEVDRQVGTDGLLRLSSSALNNEFFTHAAQSWRERLADGEFTHEMQVRIRQEMEKEKKVEQWKEKFFEDYYGQKLGLTKEESLQQNVGQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB & AlphaFold DB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL, target not predicted to be a monomer {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8h1t.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 247 247 ? A 175.856 188.266 217.506 1 1 N GLY 0.360 1 ATOM 2 C CA . GLY 247 247 ? A 176.444 186.905 217.806 1 1 N GLY 0.360 1 ATOM 3 C C . GLY 247 247 ? A 177.545 187.049 218.828 1 1 N GLY 0.360 1 ATOM 4 O O . GLY 247 247 ? A 177.746 188.155 219.317 1 1 N GLY 0.360 1 ATOM 5 N N . GLU 248 248 ? A 178.267 185.968 219.172 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 6 C CA . GLU 248 248 ? A 179.297 185.997 220.202 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 7 C C . GLU 248 248 ? A 180.653 185.628 219.634 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 8 O O . GLU 248 248 ? A 181.677 186.220 219.967 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 9 C CB . GLU 248 248 ? A 178.963 184.952 221.291 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 10 C CG . GLU 248 248 ? A 177.615 185.219 221.996 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 11 C CD . GLU 248 248 ? A 177.314 184.207 223.103 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 12 O OE1 . GLU 248 248 ? A 178.240 183.467 223.519 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 13 O OE2 . GLU 248 248 ? A 176.130 184.175 223.524 1 1 N GLU 0.430 1 ATOM 14 N N . GLU 249 249 ? A 180.683 184.651 218.716 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 15 C CA . GLU 249 249 ? A 181.879 184.209 218.051 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 16 C C . GLU 249 249 ? A 181.968 184.907 216.705 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 17 O O . GLU 249 249 ? A 181.006 185.495 216.218 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 18 C CB . GLU 249 249 ? A 181.938 182.655 218.033 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 19 C CG . GLU 249 249 ? A 180.692 181.883 217.524 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 20 C CD . GLU 249 249 ? A 180.644 181.638 216.014 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 21 O OE1 . GLU 249 249 ? A 181.717 181.685 215.362 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 22 O OE2 . GLU 249 249 ? A 179.513 181.353 215.546 1 1 N GLU 0.490 1 ATOM 23 N N . ILE 250 250 ? A 183.191 184.959 216.143 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 24 C CA . ILE 250 250 ? A 183.498 185.472 214.823 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 25 C C . ILE 250 250 ? A 183.544 184.311 213.837 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 26 O O . ILE 250 250 ? A 184.324 183.376 213.989 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 27 C CB . ILE 250 250 ? A 184.814 186.276 214.807 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 28 C CG1 . ILE 250 250 ? A 185.249 186.701 213.376 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 29 C CG2 . ILE 250 250 ? A 185.942 185.533 215.578 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 30 C CD1 . ILE 250 250 ? A 184.261 187.626 212.651 1 1 N ILE 0.440 1 ATOM 31 N N . ASP 251 251 ? A 182.709 184.356 212.777 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 32 C CA . ASP 251 251 ? A 182.633 183.325 211.760 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 33 C C . ASP 251 251 ? A 183.902 183.121 210.919 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 34 O O . ASP 251 251 ? A 184.245 183.935 210.057 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 35 C CB . ASP 251 251 ? A 181.507 183.621 210.737 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 36 C CG . ASP 251 251 ? A 180.105 183.676 211.327 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 37 O OD1 . ASP 251 251 ? A 179.580 182.604 211.706 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 38 O OD2 . ASP 251 251 ? A 179.515 184.788 211.277 1 1 N ASP 0.460 1 ATOM 39 N N . PHE 252 252 ? A 184.603 181.979 211.101 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 40 C CA . PHE 252 252 ? A 185.750 181.609 210.276 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 41 C C . PHE 252 252 ? A 185.483 180.396 209.386 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 42 O O . PHE 252 252 ? A 186.243 180.109 208.466 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 43 C CB . PHE 252 252 ? A 186.966 181.249 211.178 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 44 C CG . PHE 252 252 ? A 187.767 182.479 211.517 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 45 C CD1 . PHE 252 252 ? A 187.351 183.356 212.530 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 46 C CD2 . PHE 252 252 ? A 188.965 182.756 210.835 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 47 C CE1 . PHE 252 252 ? A 188.113 184.484 212.860 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 48 C CE2 . PHE 252 252 ? A 189.735 183.880 211.171 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 49 C CZ . PHE 252 252 ? A 189.307 184.747 212.182 1 1 N PHE 0.490 1 ATOM 50 N N . GLU 253 253 ? A 184.406 179.639 209.633 1 1 N GLU 0.590 1 ATOM 51 C CA . GLU 253 253 ? A 184.217 178.345 209.007 1 1 N GLU 0.590 1 ATOM 52 C C . GLU 253 253 ? A 183.502 178.348 207.664 1 1 N GLU 0.590 1 ATOM 53 O O . GLU 253 253 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #