data_SMR-8b298c86946306c1d90a117fd0567f7c_1 _entry.id SMR-8b298c86946306c1d90a117fd0567f7c_1 _struct.entry_id SMR-8b298c86946306c1d90a117fd0567f7c_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q7TQH0 (isoform 2)/ ATX2L_MOUSE, Ataxin-2-like protein Estimated model accuracy of this model is 0.039, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q7TQH0 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 132500.649 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ATX2L_MOUSE Q7TQH0 1 ;MLKPQPPQQTSQPQQPPPTQQAVARRSPGGTSPPNGGLPGPLTATAAPPGPPAAVSPCLGPAAAAGSGLR RGAESILAASAPPQHQERPGAVAIGSVRGQTTGKGPPQSPVFEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNG TTYEGIFKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVLLVHFRNVDFNYATKDKFTDSA IAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGDSNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGVKTTYDSSLSSYTVPLE KDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEKHSAVQRQGSGRESPSLVSREGKYIPL PQRVREGPRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPHHLDNSSPGPGSEARGINGGPSRMSPKAQRPLRGAKTL SSPSNRPSGEASVPPTSAVGRMYPPRSPKSAAPAPVSASCPEPPIGSAVASSASIPVTSSVVDPGAGSIS PASPKLSLTPTDVKELPTKEPSRNLEAQELARIAGKVPGLQNEQKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPETG LDPFPSRILKEEAKGKEKEVDGLLTSDPMGSPVSSKTESILDKEDKVPMAGVGGTEGPEQLPAPCPSQTG SPPVGLIKGDEKEEGPVTEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTPSIPVLTAGQS GLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAKGSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAA AAGPPLVAATPYSSYIPYNPQQFPGQPAMMQPMAHYPSQPVFAPMLQSNPRMLTSGSHPQAIVSSSTPQY PAAEQPTPQALYATVHQSYPHHATQLHGHQPQPATTPTGSQPQSQHAAPSPVQHQAGQAPHLGSGQPQQN LYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPAAVYAIHPHQQLPHGFTNMAHVTQAHVQTGVTAAPPPHPG APHPPQVMLLHPPQGHGGPPQGAVPPSGVPALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRIREFSL AGGIWHGRAEGLQVGQDARVLGGD ; 'Ataxin-2-like protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1074 1 1074 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ATX2L_MOUSE Q7TQH0 Q7TQH0-2 1 1074 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2003-10-01 B1D4892E2506AC59 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 5 ;MLKPQPPQQTSQPQQPPPTQQAVARRSPGGTSPPNGGLPGPLTATAAPPGPPAAVSPCLGPAAAAGSGLR RGAESILAASAPPQHQERPGAVAIGSVRGQTTGKGPPQSPVFEGVYNNSRMLHFLTAVVGSTCDVKVKNG TTYEGIFKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVLLVHFRNVDFNYATKDKFTDSA IAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGDSNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGVKTTYDSSLSSYTVPLE KDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEKHSAVQRQGSGRESPSLVSREGKYIPL PQRVREGPRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPHHLDNSSPGPGSEARGINGGPSRMSPKAQRPLRGAKTL SSPSNRPSGEASVPPTSAVGRMYPPRSPKSAAPAPVSASCPEPPIGSAVASSASIPVTSSVVDPGAGSIS PASPKLSLTPTDVKELPTKEPSRNLEAQELARIAGKVPGLQNEQKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPETG LDPFPSRILKEEAKGKEKEVDGLLTSDPMGSPVSSKTESILDKEDKVPMAGVGGTEGPEQLPAPCPSQTG 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A 1 981 ALA 981 ? ? ? 5 . A 1 982 PRO 982 ? ? ? 5 . A 1 983 HIS 983 ? ? ? 5 . A 1 984 PRO 984 ? ? ? 5 . A 1 985 PRO 985 ? ? ? 5 . A 1 986 GLN 986 ? ? ? 5 . A 1 987 VAL 987 ? ? ? 5 . A 1 988 MET 988 ? ? ? 5 . A 1 989 LEU 989 ? ? ? 5 . A 1 990 LEU 990 ? ? ? 5 . A 1 991 HIS 991 ? ? ? 5 . A 1 992 PRO 992 ? ? ? 5 . A 1 993 PRO 993 ? ? ? 5 . A 1 994 GLN 994 ? ? ? 5 . A 1 995 GLY 995 ? ? ? 5 . A 1 996 HIS 996 ? ? ? 5 . A 1 997 GLY 997 ? ? ? 5 . A 1 998 GLY 998 ? ? ? 5 . A 1 999 PRO 999 ? ? ? 5 . A 1 1000 PRO 1000 ? ? ? 5 . A 1 1001 GLN 1001 ? ? ? 5 . A 1 1002 GLY 1002 ? ? ? 5 . A 1 1003 ALA 1003 ? ? ? 5 . A 1 1004 VAL 1004 ? ? ? 5 . A 1 1005 PRO 1005 ? ? ? 5 . A 1 1006 PRO 1006 ? ? ? 5 . A 1 1007 SER 1007 ? ? ? 5 . A 1 1008 GLY 1008 ? ? ? 5 . A 1 1009 VAL 1009 ? ? ? 5 . A 1 1010 PRO 1010 ? ? ? 5 . A 1 1011 ALA 1011 ? ? ? 5 . A 1 1012 LEU 1012 ? ? ? 5 . A 1 1013 SER 1013 ? ? ? 5 . A 1 1014 ALA 1014 ? ? ? 5 . A 1 1015 SER 1015 ? ? ? 5 . A 1 1016 THR 1016 ? ? ? 5 . A 1 1017 PRO 1017 ? ? ? 5 . A 1 1018 SER 1018 ? ? ? 5 . A 1 1019 PRO 1019 ? ? ? 5 . A 1 1020 TYR 1020 ? ? ? 5 . A 1 1021 PRO 1021 ? ? ? 5 . A 1 1022 TYR 1022 ? ? ? 5 . A 1 1023 ILE 1023 ? ? ? 5 . A 1 1024 GLY 1024 ? ? ? 5 . A 1 1025 HIS 1025 ? ? ? 5 . A 1 1026 PRO 1026 ? ? ? 5 . A 1 1027 GLN 1027 ? ? ? 5 . A 1 1028 GLY 1028 ? ? ? 5 . A 1 1029 GLU 1029 ? ? ? 5 . A 1 1030 GLN 1030 ? ? ? 5 . A 1 1031 PRO 1031 ? ? ? 5 . A 1 1032 GLY 1032 ? ? ? 5 . A 1 1033 GLN 1033 ? ? ? 5 . A 1 1034 ALA 1034 ? ? ? 5 . A 1 1035 PRO 1035 ? ? ? 5 . A 1 1036 GLY 1036 ? ? ? 5 . A 1 1037 PHE 1037 ? ? ? 5 . A 1 1038 PRO 1038 ? ? ? 5 . A 1 1039 GLY 1039 ? ? ? 5 . A 1 1040 GLY 1040 ? ? ? 5 . A 1 1041 ALA 1041 ? ? ? 5 . A 1 1042 ASP 1042 ? ? ? 5 . A 1 1043 ASP 1043 ? ? ? 5 . A 1 1044 ARG 1044 ? ? ? 5 . A 1 1045 ILE 1045 ? ? ? 5 . A 1 1046 ARG 1046 ? ? ? 5 . A 1 1047 GLU 1047 ? ? ? 5 . A 1 1048 PHE 1048 ? ? ? 5 . A 1 1049 SER 1049 ? ? ? 5 . A 1 1050 LEU 1050 ? ? ? 5 . A 1 1051 ALA 1051 ? ? ? 5 . A 1 1052 GLY 1052 ? ? ? 5 . A 1 1053 GLY 1053 ? ? ? 5 . A 1 1054 ILE 1054 ? ? ? 5 . A 1 1055 TRP 1055 ? ? ? 5 . A 1 1056 HIS 1056 ? ? ? 5 . A 1 1057 GLY 1057 ? ? ? 5 . A 1 1058 ARG 1058 ? ? ? 5 . A 1 1059 ALA 1059 ? ? ? 5 . A 1 1060 GLU 1060 ? ? ? 5 . A 1 1061 GLY 1061 ? ? ? 5 . A 1 1062 LEU 1062 ? ? ? 5 . A 1 1063 GLN 1063 ? ? ? 5 . A 1 1064 VAL 1064 ? ? ? 5 . A 1 1065 GLY 1065 ? ? ? 5 . A 1 1066 GLN 1066 ? ? ? 5 . A 1 1067 ASP 1067 ? ? ? 5 . A 1 1068 ALA 1068 ? ? ? 5 . A 1 1069 ARG 1069 ? ? ? 5 . A 1 1070 VAL 1070 ? ? ? 5 . A 1 1071 LEU 1071 ? ? ? 5 . A 1 1072 GLY 1072 ? ? ? 5 . A 1 1073 GLY 1073 ? ? ? 5 . A 1 1074 ASP 1074 ? ? ? 5 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Probable small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 {PDB ID=8ro1, label_asym_id=FA, auth_asym_id=d, SMTL ID=8ro1.1.5}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8ro1, label_asym_id=FA' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-05-21 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-16 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A FA 32 1 d # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSAQAKPRSEMTAEELAAKEDEEFNVGPLSILTNSVKNNHQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENV KEMWTEVPKTGKGKKKAKSVAKDRFISKMFLRGDSVILVVKNPLAQAE ; ;MSAQAKPRSEMTAEELAAKEDEEFNVGPLSILTNSVKNNHQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENV KEMWTEVPKTGKGKKKAKSVAKDRFISKMFLRGDSVILVVKNPLAQAE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 25 111 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8ro1 2024-08-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1074 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1085 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.008 19.737 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MLKPQPPQQTSQPQQPPPTQQAVARRSPGGTSPPNGGLPGPLTATAAPPGPPAAVSPCLGPAAAAGSGLRRGAESILAASAPPQHQERPGAVAIGSVRGQTTGKGPPQSPVFEGVYNNSRMLHFLTAVV--GSTCDVKVKNGTTYEGIFKTLSSKFELAVDAVHRKASEPA--GG----P---RREDIVDTMVFKPSDVLLVHFRNVDFNYATKDKFTDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGDSNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFNEENYGVKTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEEKHSAVQRQGSGRESPSLVSREGKYIPLPQRVREGPRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPHHLDNSSPGPGSEARGINGGPSRMSPKAQRPLRGAKTLSSPSNRPSGEASVPPTSAVGRMYPPRSPKSAAPAPVSASCPEPPIGSAVASSASIPVTSSVVDPGAGSISPASPKLSLTPTDVKELPTKEPSRNLEAQELARIAGKVPGLQNEQKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPETGLDPFPSRILKEEAKGKEKEVDGLLTSDPMGSPVSSKTESILDKEDKVPMAGVGGTEGPEQLPAPCPSQTGSPPVGLIKGDEKEEGPVTEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTPSIPVLTAGQSGLYSPQYISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAKGSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAAAGPPLVAATPYSSYIPYNPQQFPGQPAMMQPMAHYPSQPVFAPMLQSNPRMLTSGSHPQAIVSSSTPQYPAAEQPTPQALYATVHQSYPHHATQLHGHQPQPATTPTGSQPQSQHAAPSPVQHQAGQAPHLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPAAVYAIHPHQQLPHGFTNMAHVTQAHVQTGVTAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQGHGGPPQGAVPPSGVPALSASTPSPYPYIGHPQGEQPGQAPGFPGGADDRIREFSLAGGIWHGRAEGLQVGQDARVLGGD 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NVGPLSILTNSVKNNHQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKTGKGKKKAKSVAKDRFISKMFLRGDSVILVVK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8ro1.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASN 118 118 ? A 237.861 353.343 379.971 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 2 C CA . ASN 118 118 ? A 236.667 353.625 380.851 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 3 C C . ASN 118 118 ? A 236.947 354.129 382.271 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 4 O O . ASN 118 118 ? A 236.031 354.595 382.929 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 5 C CB . ASN 118 118 ? A 235.756 352.361 380.861 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 6 C CG . ASN 118 118 ? A 235.094 352.268 379.490 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 7 O OD1 . ASN 118 118 ? A 234.303 353.130 379.143 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 8 N ND2 . ASN 118 118 ? A 235.518 351.293 378.654 1 1 5 ASN 0.240 1 ATOM 9 N N . SER 119 119 ? A 238.200 354.079 382.779 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 10 C CA . SER 119 119 ? A 238.469 354.424 384.179 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 11 C C . SER 119 119 ? A 239.774 355.167 384.420 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 12 O O . SER 119 119 ? A 239.930 355.864 385.413 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 13 C CB . SER 119 119 ? A 238.564 353.117 385.009 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 14 O OG . SER 119 119 ? A 239.481 352.191 384.404 1 1 5 SER 0.220 1 ATOM 15 N N . ARG 120 120 ? A 240.760 355.039 383.515 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 16 C CA . ARG 120 120 ? A 242.035 355.721 383.634 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 17 C C . ARG 120 120 ? A 241.958 357.157 383.147 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 18 O O . ARG 120 120 ? A 241.009 357.507 382.468 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 19 C CB . ARG 120 120 ? A 243.091 355.011 382.748 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 20 C CG . ARG 120 120 ? A 243.373 353.541 383.113 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 21 C CD . ARG 120 120 ? A 244.452 352.951 382.198 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 22 N NE . ARG 120 120 ? A 244.672 351.528 382.594 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 23 C CZ . ARG 120 120 ? A 245.514 350.702 381.957 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 24 N NH1 . ARG 120 120 ? A 246.221 351.097 380.902 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 25 N NH2 . ARG 120 120 ? A 245.642 349.450 382.389 1 1 5 ARG 0.210 1 ATOM 26 N N . MET 121 121 ? A 243.024 357.960 383.405 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 27 C CA . MET 121 121 ? A 243.274 359.323 382.924 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 28 C C . MET 121 121 ? A 242.908 359.664 381.471 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 29 O O . MET 121 121 ? A 242.616 360.803 381.112 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 30 C CB . MET 121 121 ? A 244.788 359.607 383.095 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 31 C CG . MET 121 121 ? A 245.267 359.606 384.561 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 32 S SD . MET 121 121 ? A 244.467 360.851 385.620 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 33 C CE . MET 121 121 ? A 245.177 362.322 384.825 1 1 5 MET 0.280 1 ATOM 34 N N . LEU 122 122 ? A 242.879 358.646 380.599 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 35 C CA . LEU 122 122 ? A 242.357 358.672 379.253 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 36 C C . LEU 122 122 ? A 240.842 358.862 379.156 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 37 O O . LEU 122 122 ? A 240.290 358.961 378.064 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 38 C CB . LEU 122 122 ? A 242.740 357.328 378.593 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 39 C CG . LEU 122 122 ? A 244.259 357.112 378.477 1 1 5 LEU 0.350 1 ATOM 40 C CD1 . LEU 122 122 ? 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A 242.287 376.435 365.595 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 340 C CG . HIS 162 162 ? A 240.959 376.711 364.952 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 341 N ND1 . HIS 162 162 ? A 240.889 377.599 363.895 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 342 C CD2 . HIS 162 162 ? A 239.735 376.169 365.190 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 343 C CE1 . HIS 162 162 ? A 239.629 377.578 363.508 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 344 N NE2 . HIS 162 162 ? A 238.885 376.730 364.259 1 1 5 HIS 0.570 1 ATOM 345 N N . ARG 163 163 ? A 245.565 375.486 364.737 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 346 C CA . ARG 163 163 ? A 246.894 375.437 365.301 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 347 C C . ARG 163 163 ? A 247.301 376.857 365.596 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 348 O O . ARG 163 163 ? A 247.192 377.734 364.747 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 349 C CB . ARG 163 163 ? A 247.893 374.780 364.329 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 350 C CG . ARG 163 163 ? A 249.347 374.719 364.836 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 351 C CD . ARG 163 163 ? A 250.282 374.251 363.718 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 352 N NE . ARG 163 163 ? A 251.694 374.252 364.188 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 353 C CZ . ARG 163 163 ? A 252.448 375.361 364.162 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 354 N NH1 . ARG 163 163 ? A 251.977 376.518 363.705 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 355 N NH2 . ARG 163 163 ? A 253.709 375.303 364.587 1 1 5 ARG 0.610 1 ATOM 356 N N . LYS 164 164 ? A 247.766 377.127 366.825 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 357 C CA . LYS 164 164 ? A 248.201 378.452 367.198 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 358 C C . LYS 164 164 ? A 249.473 378.319 367.986 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 359 O O . LYS 164 164 ? A 249.670 377.392 368.771 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 360 C CB . LYS 164 164 ? A 247.163 379.230 368.043 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 361 C CG . LYS 164 164 ? A 245.877 379.525 367.267 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 362 C CD . LYS 164 164 ? A 244.878 380.375 368.055 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 363 C CE . LYS 164 164 ? A 243.609 380.610 367.236 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 364 N NZ . LYS 164 164 ? A 242.696 381.496 367.976 1 1 5 LYS 0.630 1 ATOM 365 N N . ALA 165 165 ? 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A 252.859 387.026 370.507 1 1 5 GLY 0.360 1 ATOM 405 N N . PRO 172 172 ? A 254.814 387.261 369.471 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 406 C CA . PRO 172 172 ? A 254.229 387.268 368.137 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 407 C C . PRO 172 172 ? A 253.489 385.998 367.793 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 408 O O . PRO 172 172 ? A 254.098 384.934 367.759 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 409 C CB . PRO 172 172 ? A 255.409 387.479 367.173 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 410 C CG . PRO 172 172 ? A 256.512 388.103 368.028 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 411 C CD . PRO 172 172 ? A 256.240 387.560 369.429 1 1 5 PRO 0.310 1 ATOM 412 N N . ARG 173 173 ? A 252.192 386.084 367.478 1 1 5 ARG 0.310 1 ATOM 413 C CA . ARG 173 173 ? A 251.413 384.902 367.193 1 1 5 ARG 0.310 1 ATOM 414 C C . ARG 173 173 ? A 251.317 384.611 365.713 1 1 5 ARG 0.310 1 ATOM 415 O O . ARG 173 173 ? A 251.312 385.502 364.857 1 1 5 ARG 0.310 1 ATOM 416 C CB . ARG 173 173 ? A 249.991 385.001 367.790 1 1 5 ARG 0.310 1 ATOM 417 C CG . ARG 173 173 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #