data_SMR-77fd80c9a252e117af95a118344286c4_3 _entry.id SMR-77fd80c9a252e117af95a118344286c4_3 _struct.entry_id SMR-77fd80c9a252e117af95a118344286c4_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q86UU0 (isoform 2)/ BCL9L_HUMAN, B-cell CLL/lymphoma 9-like protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q86UU0 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183565.557 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BCL9L_HUMAN Q86UU0 1 ;MRILANKTRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNVGSKGV GAGNHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVPPFSSLKGKVKRDRSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKR RCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIGATHNCNVADPAMAAPQLGPGQTTQLPLSESSVPGAPHGPPP GLRPDAPGGGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRADSILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPT PEPLPLSTPSAGTPQSQPPPLPPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDSSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNT PTATTANNPLPPGGDPSSAPGPALLGEAAAPGNGQRSLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSG ETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPPPPQQPPTAPPSGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPPGG DMGQQMNMMIQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGSRPLQDMMGMGGMMVRGPPPPYH SKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRGGPPFPGPRFPGNQIQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRP GMGWTEDLPPMGGPSNFAQNTMPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMGQS MEMERMMQAHRQMDPAMFPGQMAGGEGLAGTPMGMEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMNMN VNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDLMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGVMGGPQKMLMPSQFPNQG QQGFSGGQGPYQAMSQDMGNTQDMFSPDQSSMPMSNVGTTRLSHMPLPPASNPPGTVHSAPNRGLGRRPS DLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLGSSLSV RSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLNMNSSTTLSNMEQGTLPPSGPRSSSSA PPANPPSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMTQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPLLP PPPPPQGSGPGISNSQPSQMHLNSAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPAMLPSPTPLGSNIPLHPNAQGTG GPPQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMPFPPRLQQPHGAMAPTGGGGGGPGLQQHYPSGMALPPED LPNQPPGPMPPQQHLMGKAMAGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKP SSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLNMSMCHPGQMSLLGRTGV PPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYSQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLR QRSVSLDSQMGYLPAPGGMANLPF ; 'B-cell CLL/lymphoma 9-like protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1494 1 1494 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . BCL9L_HUMAN Q86UU0 Q86UU0-2 1 1494 9606 'Homo sapiens (Human)' 2003-06-01 2D591F45FF3AEE36 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MRILANKTRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNVGSKGV GAGNHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVPPFSSLKGKVKRDRSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKR RCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIGATHNCNVADPAMAAPQLGPGQTTQLPLSESSVPGAPHGPPP GLRPDAPGGGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRADSILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPT PEPLPLSTPSAGTPQSQPPPLPPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDSSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNT PTATTANNPLPPGGDPSSAPGPALLGEAAAPGNGQRSLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSG ETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPPPPQQPPTAPPSGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPPGG DMGQQMNMMIQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGSRPLQDMMGMGGMMVRGPPPPYH SKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRGGPPFPGPRFPGNQIQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRP 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GAGNHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVPPFSSLKGKVKRDRSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKR RCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIGATHNCNVADPAMAAPQLGPGQTTQLPLSESSVPGAPHGPPP GLRPDAPGGGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRADSILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPT PEPLPLSTPSAGTPQSQPPPLPPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDSSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNT PTATTANNPLPPGGDPSSAPGPALLGEAAAPGNGQRSLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSG ETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPPPPQQPPTAPPSGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPPGG DMGQQMNMMIQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGSRPLQDMMGMGGMMVRGPPPPYH SKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRGGPPFPGPRFPGNQIQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRP GMGWTEDLPPMGGPSNFAQNTMPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMGQS MEMERMMQAHRQMDPAMFPGQMAGGEGLAGTPMGMEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMNMN VNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDLMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGVMGGPQKMLMPSQFPNQG QQGFSGGQGPYQAMSQDMGNTQDMFSPDQSSMPMSNVGTTRLSHMPLPPASNPPGTVHSAPNRGLGRRPS DLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLGSSLSV RSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLNMNSSTTLSNMEQGTLPPSGPRSSSSA 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1 42 HIS . 1 43 GLY . 1 44 LYS . 1 45 THR . 1 46 GLY . 1 47 ASN . 1 48 GLY . 1 49 GLY . 1 50 ALA . 1 51 GLN . 1 52 SER . 1 53 GLN . 1 54 HIS . 1 55 GLN . 1 56 ASN . 1 57 VAL . 1 58 ASN . 1 59 GLN . 1 60 GLY . 1 61 PRO . 1 62 THR . 1 63 CYS . 1 64 ASN . 1 65 VAL . 1 66 GLY . 1 67 SER . 1 68 LYS . 1 69 GLY . 1 70 VAL . 1 71 GLY . 1 72 ALA . 1 73 GLY . 1 74 ASN . 1 75 HIS . 1 76 GLY . 1 77 ALA . 1 78 LYS . 1 79 ALA . 1 80 ASN . 1 81 GLN . 1 82 ILE . 1 83 SER . 1 84 PRO . 1 85 SER . 1 86 ASN . 1 87 SER . 1 88 SER . 1 89 LEU . 1 90 LYS . 1 91 ASN . 1 92 PRO . 1 93 GLN . 1 94 ALA . 1 95 GLY . 1 96 VAL . 1 97 PRO . 1 98 PRO . 1 99 PHE . 1 100 SER . 1 101 SER . 1 102 LEU . 1 103 LYS . 1 104 GLY . 1 105 LYS . 1 106 VAL . 1 107 LYS . 1 108 ARG . 1 109 ASP . 1 110 ARG . 1 111 SER . 1 112 VAL . 1 113 SER . 1 114 VAL . 1 115 ASP . 1 116 SER . 1 117 GLY . 1 118 GLU . 1 119 GLN . 1 120 ARG . 1 121 GLU . 1 122 ALA . 1 123 GLY . 1 124 THR . 1 125 PRO . 1 126 SER . 1 127 LEU . 1 128 ASP . 1 129 SER . 1 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'B-CELL CLL/LYMPHOMA 9 PROTEIN {PDB ID=2vp7, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=2vp7.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2vp7, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-05-21 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-16 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 AAKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI AAKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 33 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2vp7 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1494 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1494 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.4e-13 50.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRILANKTRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNVGSKGVGAGNHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVPPFSSLKGKVKRDRSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIGATHNCNVADPAMAAPQLGPGQTTQLPLSESSVPGAPHGPPPGLRPDAPGGGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRADSILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPTPEPLPLSTPSAGTPQSQPPPLPPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDSSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNTPTATTANNPLPPGGDPSSAPGPALLGEAAAPGNGQRSLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPPPPQQPPTAPPSGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPPGGDMGQQMNMMIQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGSRPLQDMMGMGGMMVRGPPPPYHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRGGPPFPGPRFPGNQIQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRPGMGWTEDLPPMGGPSNFAQNTMPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMGQSMEMERMMQAHRQMDPAMFPGQMAGGEGLAGTPMGMEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMNMNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDLMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGVMGGPQKMLMPSQFPNQGQQGFSGGQGPYQAMSQDMGNTQDMFSPDQSSMPMSNVGTTRLSHMPLPPASNPPGTVHSAPNRGLGRRPSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLGSSLSVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLNMNSSTTLSNMEQGTLPPSGPRSSSSAPPANPPSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMTQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPLLPPPPPPQGSGPGISNSQPSQMHLNSAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPAMLPSPTPLGSNIPLHPNAQGTGGPPQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMPFPPRLQQPHGAMAPTGGGGGGPGLQQHYPSGMALPPEDLPNQPPGPMPPQQHLMGKAMAGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKPSSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLNMSMCHPGQMSLLGRTGVPPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYSQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLRQRSVSLDSQMGYLPAPGGMANLPF 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2vp7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 232 232 ? A 21.374 -5.939 43.230 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 2 C CA . SER 232 232 ? A 20.140 -5.084 43.049 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 3 C C . SER 232 232 ? A 20.605 -3.664 42.777 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 4 O O . SER 232 232 ? A 21.753 -3.358 43.074 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 5 C CB . SER 232 232 ? A 19.220 -5.154 44.315 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 6 O OG . SER 232 232 ? A 19.948 -4.856 45.508 1 1 B SER 0.230 1 ATOM 7 N N . GLN 233 233 ? A 19.778 -2.784 42.175 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 8 C CA . GLN 233 233 ? A 20.200 -1.445 41.820 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 9 C C . GLN 233 233 ? A 18.976 -0.583 42.015 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 10 O O . GLN 233 233 ? A 17.867 -1.012 41.703 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 11 C CB . GLN 233 233 ? A 20.632 -1.375 40.328 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 12 C CG . GLN 233 233 ? A 21.076 0.010 39.793 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 13 C CD . GLN 233 233 ? A 22.367 0.453 40.474 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 14 O OE1 . GLN 233 233 ? A 23.356 -0.280 40.481 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 15 N NE2 . GLN 233 233 ? A 22.383 1.667 41.067 1 1 B GLN 0.270 1 ATOM 16 N N . PHE 234 234 ? A 19.145 0.638 42.555 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 17 C CA . PHE 234 234 ? A 18.084 1.617 42.647 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 18 C C . PHE 234 234 ? A 18.155 2.469 41.401 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 19 O O . PHE 234 234 ? A 19.224 2.955 41.027 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 20 C CB . PHE 234 234 ? A 18.231 2.567 43.862 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 21 C CG . PHE 234 234 ? A 18.110 1.810 45.147 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 22 C CD1 . PHE 234 234 ? A 16.851 1.640 45.744 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 23 C CD2 . PHE 234 234 ? A 19.247 1.291 45.788 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 24 C CE1 . PHE 234 234 ? A 16.731 0.978 46.971 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 25 C CE2 . PHE 234 234 ? A 19.128 0.621 47.013 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 26 C CZ . PHE 234 234 ? A 17.869 0.471 47.608 1 1 B PHE 0.010 1 ATOM 27 N N . VAL 235 235 ? A 17.006 2.646 40.730 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 28 C CA . VAL 235 235 ? A 16.862 3.512 39.584 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 29 C C . VAL 235 235 ? A 15.768 4.495 39.923 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 30 O O . VAL 235 235 ? A 14.867 4.205 40.709 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 31 C CB . VAL 235 235 ? A 16.546 2.791 38.269 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 32 C CG1 . VAL 235 235 ? A 17.674 1.785 37.964 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 33 C CG2 . VAL 235 235 ? A 15.166 2.099 38.282 1 1 B VAL 0.340 1 ATOM 34 N N . TYR 236 236 ? A 15.830 5.706 39.349 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 35 C CA . TYR 236 236 ? A 14.894 6.764 39.661 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 36 C C . TYR 236 236 ? A 13.983 6.941 38.470 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 37 O O . TYR 236 236 ? A 14.429 7.038 37.328 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 38 C CB . TYR 236 236 ? A 15.615 8.090 39.996 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 39 C CG . TYR 236 236 ? A 16.449 7.877 41.228 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 40 C CD1 . TYR 236 236 ? A 15.860 7.908 42.502 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 41 C CD2 . TYR 236 236 ? A 17.818 7.584 41.122 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 42 C CE1 . TYR 236 236 ? A 16.628 7.648 43.647 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 43 C CE2 . TYR 236 236 ? A 18.591 7.341 42.264 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 44 C CZ . TYR 236 236 ? A 17.992 7.371 43.527 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 45 O OH . TYR 236 236 ? A 18.760 7.108 44.676 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 46 N N . VAL 237 237 ? A 12.663 6.945 38.718 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 47 C CA . VAL 237 237 ? A 11.660 6.960 37.676 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 48 C C . VAL 237 237 ? A 11.142 8.373 37.515 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 49 O O . VAL 237 237 ? A 10.642 8.993 38.451 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 50 C CB . VAL 237 237 ? A 10.506 6.014 37.983 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 51 C CG1 . VAL 237 237 ? A 9.557 5.939 36.771 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 52 C CG2 . VAL 237 237 ? A 11.059 4.609 38.301 1 1 B VAL 0.450 1 ATOM 53 N N . PHE 238 238 ? A 11.257 8.923 36.296 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 54 C CA . PHE 238 238 ? A 10.872 10.282 36.001 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 55 C C . PHE 238 238 ? A 9.593 10.253 35.192 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 56 O O . PHE 238 238 ? A 9.484 9.579 34.171 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 57 C CB . PHE 238 238 ? A 11.940 11.032 35.156 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 58 C CG . PHE 238 238 ? A 13.162 11.373 35.965 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 59 C CD1 . PHE 238 238 ? A 13.421 12.709 36.315 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 60 C CD2 . PHE 238 238 ? A 14.083 10.385 36.356 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 61 C CE1 . PHE 238 238 ? A 14.565 13.051 37.044 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 62 C CE2 . PHE 238 238 ? A 15.221 10.722 37.097 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 63 C CZ . PHE 238 238 ? A 15.460 12.055 37.444 1 1 B PHE 0.520 1 ATOM 64 N N . THR 239 239 ? A 8.581 11.028 35.632 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 65 C CA . THR 239 239 ? A 7.469 11.441 34.783 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 66 C C . THR 239 239 ? A 7.974 12.439 33.757 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 67 O O . THR 239 239 ? A 9.054 13.010 33.904 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 68 C CB . THR 239 239 ? A 6.252 12.059 35.503 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 69 O OG1 . THR 239 239 ? A 6.489 13.349 36.057 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 70 C CG2 . THR 239 239 ? A 5.812 11.188 36.682 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 71 N N . THR 240 240 ? A 7.199 12.717 32.693 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 72 C CA . THR 240 240 ? A 7.534 13.763 31.720 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 73 C C . THR 240 240 ? A 7.687 15.144 32.345 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 74 O O . THR 240 240 ? A 8.609 15.893 32.034 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 75 C CB . THR 240 240 ? A 6.486 13.860 30.622 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 76 O OG1 . THR 240 240 ? A 6.410 12.621 29.938 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 77 C CG2 . THR 240 240 ? A 6.828 14.936 29.581 1 1 B THR 0.560 1 ATOM 78 N N . HIS 241 241 ? A 6.797 15.500 33.300 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 79 C CA . HIS 241 241 ? A 6.902 16.731 34.074 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 80 C C . HIS 241 241 ? A 8.195 16.806 34.882 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 81 O O . HIS 241 241 ? A 8.910 17.802 34.858 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 82 C CB . HIS 241 241 ? A 5.706 16.848 35.055 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 83 C CG . HIS 241 241 ? A 5.749 18.055 35.940 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 84 N ND1 . HIS 241 241 ? A 5.447 19.280 35.389 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 85 C CD2 . HIS 241 241 ? A 6.090 18.193 37.248 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 86 C CE1 . HIS 241 241 ? A 5.605 20.145 36.369 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 87 N NE2 . HIS 241 241 ? A 5.993 19.541 37.521 1 1 B HIS 0.560 1 ATOM 88 N N . LEU 242 242 ? A 8.555 15.711 35.588 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 89 C CA . LEU 242 242 ? A 9.797 15.627 36.343 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 90 C C . LEU 242 242 ? A 11.049 15.715 35.480 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 91 O O . LEU 242 242 ? A 11.992 16.425 35.816 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 92 C CB . LEU 242 242 ? A 9.866 14.323 37.172 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 93 C CG . LEU 242 242 ? A 8.830 14.223 38.310 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 242 242 ? A 8.836 12.806 38.901 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 242 242 ? A 9.047 15.273 39.416 1 1 B LEU 0.620 1 ATOM 96 N N . ALA 243 243 ? A 11.077 15.015 34.328 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 97 C CA . ALA 243 243 ? A 12.184 15.058 33.390 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 98 C C . ALA 243 243 ? A 12.440 16.452 32.807 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 99 O O . ALA 243 243 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #