data_SMR-ac68e002750239dc7d1b332473bf0f9b_5 _entry.id SMR-ac68e002750239dc7d1b332473bf0f9b_5 _struct.entry_id SMR-ac68e002750239dc7d1b332473bf0f9b_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q68DK2/ ZFY26_HUMAN, Zinc finger FYVE domain-containing protein 26 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q68DK2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 330669.625 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZFY26_HUMAN Q68DK2 1 ;MNHPFGKEEAASQKQLFGFFCECLRRGEWELAQACVPQLQEGQGDIPKRVEDILQALVVCPNLLRCGQDI NPQRVAWVWLLVLEKWLAREKKLLPVVFRRKLEFLLLSEDLQGDIPENILEELYETLTQGAVGHVPDGNP RRESWTPRLSSEAVSVLWDLLRQSPQPAQALLELLLEEDDGTGLCHWPLQNALVDLIRKALRALQGPDSV PPGVVDAIYGALRTLRCPAEPLGVELHLLCEELLEACRTEGSPLREERLLSCLLHKASRGLLSLYGHTYA EKVTEKPPRATASGKVSPDHLDPERAMLALFSNPNPAEAWKVAYFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEED FPNLGCLLDREFRPLSCLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLHRTQGPGCDELLRDACDGLWAHLEVLEWCI QQSSNPIPKRDLLYHLHGGDSHSVLYTLHHLTNLPALREEDVLKLLQKVPAKDPQQEPDAVDAPVPEHLS QCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVNSHQHSQCQDCKDSLSEDLASATEPANDSLSSPGAANLFSTYLARCQ QYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKSPSGLRSPSESPQHIAHPERKS ERGSLGVPKTLAYTMPSHVKAEPKDSYPGPHRHSFLDLKHFTSGISGFLADEFAIGAFLRLLQEQLDEIS SRSPPEKPKQESQSCSGSRDGLQSRLHRLSKVVSEAQWRHKVVTSNHRSEEQPSRRYQPATRHPSLRRGR RTRRSQADGRDRGSNPSLESTSSELSTSTSEGSLSAMSGRNELHSRLHPHPQSSLIPMMFSPPESLLASC ILRGNFAEAHQVLFTFNLKSSPSSGELMFMERYQEVIQELAQVEHKIENQNSDAGSSTIRRTGSGRSTLQ AIGSAAAAGMVFYSISDVTDKLLNTSGDPIPMLQEDFWISTALVEPTAPLREVLEDLSPPAMAAFDLACS QCQLWKTCKQLLETAERRLNSSLERRGRRIDHVLLNADGIRGFPVVLQQISKSLNYLLMSASQTKSESVE EKGGGPPRCSITELLQMCWPSLSEDCVASHTTLSQQLDQVLQSLREALELPEPRTPPLSSLVEQAAQKAP EAEAHPVQIQTQLLQKNLGKQTPSGSRQMDYLGTFFSYCSTLAAVLLQSLSSEPDHVEVKVGNPFVLLQQ SSSQLVSHLLFERQVPPERLAALLAQENLSLSVPQVIVSCCCEPLALCSSRQSQQTSSLLTRLGTLAQLH ASHCLDDLPLSTPSSPRTTENPTLERKPYSSPRDSSLPALTSSALAFLKSRSKLLATVACLGASPRLKVS KPSLSWKELRGRREVPLAAEQVARECERLLEQFPLFEAFLLAAWEPLRGSLQQGQSLAVNLCGWASLSTV LLGLHSPIALDVLSEAFEESLVARDWSRALQLTEVYGRDVDDLSSIKDAVLSCAVACDKEGWQYLFPVKD ASLRSRLALQFVDRWPLESCLEILAYCISDTAVQEGLKCELQRKLAELQVYQKILGLQSPPVWCDWQTLR SCCVEDPSTVMNMILEAQEYELCEEWGCLYPIPREHLISLHQKHLLHLLERRDHDKALQLLRRIPDPTMC LEVTEQSLDQHTSLATSHFLANYLTTHFYGQLTAVRHREIQALYVGSKILLTLPEQHRASYSHLSSNPLF MLEQLLMNMKVDWATVAVQTLQQLLVGQEIGFTMDEVDSLLSRYAEKALDFPYPQREKRSDSVIHLQEIV HQAADPETLPRSPSAEFSPAAPPGISSIHSPSLRERSFPPTQPSQEFVPPATPPARHQWVPDETESICMV CCREHFTMFNRRHHCRRCGRLVCSSCSTKKMVVEGCRENPARVCDQCYSYCNKDVPEEPSEKPEALDSSK NESPPYSFVVRVPKADEVEWILDLKEEENELVRSEFYYEQAPSASLCIAILNLHRDSIACGHQLIEHCCR LSKGLTNPEVDAGLLTDIMKQLLFSAKMMFVKAGQSQDLALCDSYISKVDVLNILVAAAYRHVPSLDQIL QPAAVTRLRNQLLEAEYYQLGVEVSTKTGLDTTGAWHAWGMACLKAGNLTAAREKFSRCLKPPFDLNQLN HGSRLVQDVVEYLESTVRPFVSLQDDDYFATLRELEATLRTQSLSLAVIPEGKIMNNTYYQECLFYLHNY STNLAIISFYVRHSCLREALLHLLNKESPPEVFIEGIFQPSYKSGKLHTLENLLESIDPTLESWGKYLIA ACQHLQKKNYYHILYELQQFMKDQVRAAMTCIRFFSHKAKSYTELGEKLSWLLKAKDHLKIYLQETSRSS GRKKTTFFRKKMTAADVSRHMNTLQLQMEVTRFLHRCESAGTSQITTLPLPTLFGNNHMKMDVACKVMLG GKNVEDGFGIAFRVLQDFQLDAAMTYCRAARQLVEKEKYSEIQQLLKCVSESGMAAKSDGDTILLNCLEA FKRIPPQELEGLIQAIHNDDNKVRAYLICCKLRSAYLIAVKQEHSRATALVQQVQQAAKSSGDAVVQDIC AQWLLTSHPRGAHGPGSRK ; 'Zinc finger FYVE domain-containing protein 26' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2539 1 2539 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZFY26_HUMAN Q68DK2 . 1 2539 9606 'Homo sapiens (Human)' 2023-06-28 85484EB6BACC8566 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MNHPFGKEEAASQKQLFGFFCECLRRGEWELAQACVPQLQEGQGDIPKRVEDILQALVVCPNLLRCGQDI NPQRVAWVWLLVLEKWLAREKKLLPVVFRRKLEFLLLSEDLQGDIPENILEELYETLTQGAVGHVPDGNP RRESWTPRLSSEAVSVLWDLLRQSPQPAQALLELLLEEDDGTGLCHWPLQNALVDLIRKALRALQGPDSV PPGVVDAIYGALRTLRCPAEPLGVELHLLCEELLEACRTEGSPLREERLLSCLLHKASRGLLSLYGHTYA EKVTEKPPRATASGKVSPDHLDPERAMLALFSNPNPAEAWKVAYFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEED FPNLGCLLDREFRPLSCLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLHRTQGPGCDELLRDACDGLWAHLEVLEWCI QQSSNPIPKRDLLYHLHGGDSHSVLYTLHHLTNLPALREEDVLKLLQKVPAKDPQQEPDAVDAPVPEHLS QCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVNSHQHSQCQDCKDSLSEDLASATEPANDSLSSPGAANLFSTYLARCQ QYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKSPSGLRSPSESPQHIAHPERKS 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;MNHPFGKEEAASQKQLFGFFCECLRRGEWELAQACVPQLQEGQGDIPKRVEDILQALVVCPNLLRCGQDI NPQRVAWVWLLVLEKWLAREKKLLPVVFRRKLEFLLLSEDLQGDIPENILEELYETLTQGAVGHVPDGNP RRESWTPRLSSEAVSVLWDLLRQSPQPAQALLELLLEEDDGTGLCHWPLQNALVDLIRKALRALQGPDSV PPGVVDAIYGALRTLRCPAEPLGVELHLLCEELLEACRTEGSPLREERLLSCLLHKASRGLLSLYGHTYA EKVTEKPPRATASGKVSPDHLDPERAMLALFSNPNPAEAWKVAYFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEED FPNLGCLLDREFRPLSCLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLHRTQGPGCDELLRDACDGLWAHLEVLEWCI QQSSNPIPKRDLLYHLHGGDSHSVLYTLHHLTNLPALREEDVLKLLQKVPAKDPQQEPDAVDAPVPEHLS QCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVNSHQHSQCQDCKDSLSEDLASATEPANDSLSSPGAANLFSTYLARCQ QYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKSPSGLRSPSESPQHIAHPERKS ERGSLGVPKTLAYTMPSHVKAEPKDSYPGPHRHSFLDLKHFTSGISGFLADEFAIGAFLRLLQEQLDEIS SRSPPEKPKQESQSCSGSRDGLQSRLHRLSKVVSEAQWRHKVVTSNHRSEEQPSRRYQPATRHPSLRRGR RTRRSQADGRDRGSNPSLESTSSELSTSTSEGSLSAMSGRNELHSRLHPHPQSSLIPMMFSPPESLLASC ILRGNFAEAHQVLFTFNLKSSPSSGELMFMERYQEVIQELAQVEHKIENQNSDAGSSTIRRTGSGRSTLQ AIGSAAAAGMVFYSISDVTDKLLNTSGDPIPMLQEDFWISTALVEPTAPLREVLEDLSPPAMAAFDLACS 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_ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ALQFVQDPHIRFDLALEYGNLDAALDEAKKLNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLY LVTGDVNKLSKMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAAASAFLEQ AEVDEQDVTLPDQMDASNFVQRPVISKPLEKWPLKEA ; ;ALQFVQDPHIRFDLALEYGNLDAALDEAKKLNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLY LVTGDVNKLSKMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAAASAFLEQ AEVDEQDVTLPDQMDASNFVQRPVISKPLEKWPLKEA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 20 141 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3mkq 2024-02-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2539 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2545 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 49.000 10.345 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNHPFGKEEAASQKQLFGFFCECLRRGEWELAQACVPQLQEGQGDIPKRVEDILQALVVCPNLLRCGQDINPQRVAWVWLLVLEKWLAREKKLLPVVFRRKLEFLLLSEDLQGDIPENILEELYETLTQGAVGHVPDGNPRRESWTPRLSSEAVSVLWDLLRQSPQPAQALLELLLEEDDGTGLCHWPLQNALVDLIRKALRALQGPDSVPPGVVDAIYGALRTLRCPAEPLGVELHLLCEELLEACRTEGSPLREERLLSCLLHKASRGLLSLYGHTYAEKVTEKPPRATASGKVSPDHLDPERAMLALFSNPNPAEAWKVAYFYCLSNNKHFLEQILVTALTLLKEEDFPNLGCLLDREFRPLSCLLVLLGWTHCQSLESAKRLLQTLHRTQGPGCDELLRDACDGLWAHLEVLEWCIQQSSNPIPKRDLLYHLHGGDSHSVLYTLHHLTNLPALREEDVLKLLQKVPAKDPQQEPDAVDAPVPEHLSQCQNLTLYQGFCAMKYAIYALCVNSHQHSQCQDCKDSLSEDLASATEPANDSLSSPGAANLFSTYLARCQQYLCSIPDSLCLELLENIFSLLLITSADLHPEPHLPEDYAEDDDIEGKSPSGLRSPSESPQHIAHPERKSERGSLGVPKTLAYTMPSHVKAEPKDSYPGPHRHSFLDLKHFTSGISGFLADEFAIGAFLRLLQEQLDEISSRSPPEKPKQESQSCSGSRDGLQSRLHRLSKVVSEAQWRHKVVTSNHRSEEQPSRRYQPATRHPSLRRGRRTRRSQADGRDRGSNPSLESTSSELSTSTSEGSLSAMSGRNELHSRLHPHPQSSLIPMMFSPPESLLASCILRGNFAEAHQVLFTFNLKSSPSSGELMFMERYQEVIQELAQVEHKIENQNSDAGSSTIRRTGSGRSTLQAIGSAAAAGMVFYSISDVTDKLLNTSGDPIPMLQEDFWISTALVEPTAPLREVLEDLSPPAMAAFDLACSQCQLWKTCKQLLETAERRLNSSLERRGRRIDHVLLNADGIRGFPVVLQQISKSLNYLLMSASQTKSESVEEKGGGPPRCSITELLQMCWPSLSEDCVASHTTLSQQLDQVLQSLREALELPEPRTPPLSSLVEQAAQKAPEAEAHPVQIQTQLLQKNLGKQTPSGSRQMDYLGTFFSYCSTLAAVLLQSLSSEPDHVEVKVGNPFVLLQQSSSQLVSHLLFERQVPPERLAALLAQENLSLSVPQVIVSCCCEPLALCSSRQSQQTSSLLTRLGTLAQLHASHCLDDLPLSTPSSPRTTENPTLERKPYSSPRDSSLPALTSSALAFLKSRSKLLATVACLGASPRLKVSKPSLSWKELRGRREVPLAAEQVARECERLLEQFPLFEAFLLAAWEPLRGSLQQGQSLAVNLCGWASLSTVLLGLHSPIALDVLSEAFEESLVARDWSRALQLTEVYGRDVDDLSSIKDAVLSCAVACDKEGWQYLFPVKDASLRSRLALQFVDRWPLESCLEILAYCISDTAVQEGLKCELQRKLAELQVYQKILGLQSPPVWCDWQTLRSCCVEDPSTVMNMILEAQEYELCEEWGCLYPIPREHLISLHQKHLLHLLERRDHDKALQLLRRIPDPTMCLEVTEQSLDQHTSLATSHFLANYLTTHFYGQLTAVRHREIQALYVGSKILLTLPEQHRASYSHLSSNPLFMLEQLLMNMKVDWATVAVQTLQQLLVGQEIGFTMDEVDSLLSRYAEKALDFPYPQREKRSDSVIHLQEIVHQAADPETLPRSPSAEFSPAAPPGISSIHSPSLRERSFPPTQPSQEFVPPATPPARHQWVPDETESICMVCCREHFTMFNRRHHCRRCGRLVCSSCSTKKMVVEGCRENPARVCDQCYSYCNKDVPEEPSEKPEALDSSKNESPPYSFVVRVPKADEVEWILDLKEEENELVRSEFYYEQAPSASLCIAILNLHRDSIACGHQLIEHCCRLSKGLTNPEVDAGLLTDIMKQLLFSAKMMFVKAGQSQDLALCDSYISKVDVLNILVAAAYRHVPSLDQILQPAAVTRLRNQLLEAEYYQLGVEVSTKTGLDTTGAWHAWGMACLKAGNLTAAREKFSRCLKPPFDLNQLNHGSRLVQDVVEYLESTVRPFVSLQDDDYFATLRELEATLRTQSLSLAVIPEGKIMNNTYYQECLFYLHNYSTNLAIISFYVRHSCLREALLHLLNKESPPEVFIEGIFQPSYKSGKLHTLENLLESIDPTLESWGKYLIAACQHLQKKNYYHILYELQQFMKDQVRAAMTCIRFFSHKAKSYTELGEKLSWLLKAKDHLKIYLQETSRSSGRKKTTFFRKKMTAADVSRHMNTLQLQMEVTRFLHRCESAGTSQITTLPLPTLFGNNHMKMDVACKVMLGGKNVEDGFGIAFRVLQDFQLDAAMTYCRAARQLVEKEKYSEIQQLLKCVSESGMAA-----KSDGDTILLNCLEAFKRI-PPQELEGLIQAIHNDDNKVRAYLICCKLRSAYLIAVKQEHSRATALVQQVQQAAKSSGDAVVQDICAQWLLTSHPRGAHGPGSRK 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLDAALDEAKK--LNDSITWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLYLVTGDVNKLS-KMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGD---EAAASAFLEQA------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3mkq.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 2387 2387 ? A -27.320 158.600 174.557 1 1 B GLY 0.560 1 ATOM 2 C CA . GLY 2387 2387 ? A -27.641 158.842 176.014 1 1 B GLY 0.560 1 ATOM 3 C C . GLY 2387 2387 ? A -26.926 157.887 176.929 1 1 B GLY 0.560 1 ATOM 4 O O . GLY 2387 2387 ? A -27.290 156.729 177.033 1 1 B GLY 0.560 1 ATOM 5 N N . PHE 2388 2388 ? A -25.837 158.343 177.566 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 6 C CA . PHE 2388 2388 ? A -24.842 157.491 178.196 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 7 C C . PHE 2388 2388 ? A -25.301 156.938 179.521 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 8 O O . PHE 2388 2388 ? A -25.157 155.752 179.779 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 9 C CB . PHE 2388 2388 ? A -23.514 158.257 178.410 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 10 C CG . PHE 2388 2388 ? A -22.851 158.565 177.093 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 11 C CD1 . PHE 2388 2388 ? A -23.495 159.191 176.002 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 12 C CD2 . PHE 2388 2388 ? A -21.526 158.158 176.922 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 13 C CE1 . PHE 2388 2388 ? A -22.903 159.245 174.745 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 14 C CE2 . PHE 2388 2388 ? A -20.904 158.269 175.682 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 15 C CZ . PHE 2388 2388 ? A -21.620 158.746 174.592 1 1 B PHE 0.490 1 ATOM 16 N N . GLY 2389 2389 ? A -25.932 157.783 180.367 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 17 C CA . GLY 2389 2389 ? A -26.511 157.341 181.638 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 18 C C . GLY 2389 2389 ? A -27.583 156.292 181.470 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 19 O O . GLY 2389 2389 ? A -27.694 155.340 182.234 1 1 B GLY 0.660 1 ATOM 20 N N . ILE 2390 2390 ? A -28.378 156.422 180.393 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 21 C CA . ILE 2390 2390 ? A -29.325 155.413 179.954 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 22 C C . ILE 2390 2390 ? A -28.635 154.143 179.465 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 23 O O . ILE 2390 2390 ? A -29.037 153.033 179.809 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 24 C CB . ILE 2390 2390 ? A -30.244 155.989 178.876 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 25 C CG1 . ILE 2390 2390 ? A -31.100 157.140 179.460 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 26 C CG2 . ILE 2390 2390 ? A -31.126 154.878 178.267 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 27 C CD1 . ILE 2390 2390 ? A -31.890 157.924 178.406 1 1 B ILE 0.670 1 ATOM 28 N N . ALA 2391 2391 ? A -27.560 154.278 178.665 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 29 C CA . ALA 2391 2391 ? A -26.775 153.159 178.185 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 30 C C . ALA 2391 2391 ? A -26.091 152.350 179.279 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 31 O O . ALA 2391 2391 ? A -26.181 151.128 179.282 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 32 C CB . ALA 2391 2391 ? A -25.720 153.654 177.178 1 1 B ALA 0.650 1 ATOM 33 N N . PHE 2392 2392 ? A -25.445 153.007 180.266 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 34 C CA . PHE 2392 2392 ? A -24.853 152.361 181.429 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 35 C C . PHE 2392 2392 ? A -25.894 151.642 182.281 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 36 O O . PHE 2392 2392 ? A -25.679 150.525 182.745 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 37 C CB . PHE 2392 2392 ? A -24.059 153.390 182.280 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 38 C CG . PHE 2392 2392 ? A -23.334 152.727 183.427 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 39 C CD1 . PHE 2392 2392 ? A -23.894 152.732 184.717 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 40 C CD2 . PHE 2392 2392 ? A -22.121 152.053 183.214 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 41 C CE1 . PHE 2392 2392 ? A -23.265 152.057 185.770 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 42 C CE2 . PHE 2392 2392 ? A -21.486 151.380 184.266 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 43 C CZ . PHE 2392 2392 ? A -22.061 151.378 185.544 1 1 B PHE 0.510 1 ATOM 44 N N . ARG 2393 2393 ? A -27.081 152.254 182.471 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 45 C CA . ARG 2393 2393 ? A -28.175 151.634 183.196 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 46 C C . ARG 2393 2393 ? A -28.622 150.310 182.585 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 47 O O . ARG 2393 2393 ? A -28.688 149.296 183.266 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 48 C CB . ARG 2393 2393 ? A -29.364 152.625 183.225 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 49 C CG . ARG 2393 2393 ? A -30.603 152.145 184.005 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 50 C CD . ARG 2393 2393 ? A -31.772 153.134 183.956 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 51 N NE . ARG 2393 2393 ? A -32.267 153.174 182.542 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 52 C CZ . ARG 2393 2393 ? A -33.103 154.101 182.058 1 1 B ARG 0.520 1 ATOM 53 N NH1 . ARG 2393 2393 ? 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A -24.325 148.746 180.196 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 67 C CG . LEU 2395 2395 ? A -22.929 148.123 180.027 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 68 C CD1 . LEU 2395 2395 ? A -22.077 149.127 179.276 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 69 C CD2 . LEU 2395 2395 ? A -22.230 147.803 181.347 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 70 N N . GLN 2396 2396 ? A -25.595 147.565 182.811 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 71 C CA . GLN 2396 2396 ? A -25.520 146.878 184.082 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 72 C C . GLN 2396 2396 ? A -26.506 145.725 184.223 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 73 O O . GLN 2396 2396 ? A -26.169 144.662 184.743 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 74 C CB . GLN 2396 2396 ? A -25.739 147.904 185.214 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 75 C CG . GLN 2396 2396 ? A -25.529 147.341 186.635 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 76 C CD . GLN 2396 2396 ? A -24.088 146.880 186.844 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 77 O OE1 . GLN 2396 2396 ? A -23.132 147.655 186.822 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 78 N NE2 . GLN 2396 2396 ? A -23.910 145.557 187.067 1 1 B GLN 0.530 1 ATOM 79 N N . ASP 2397 2397 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.504 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2387 GLY 1 0.560 2 1 A 2388 PHE 1 0.490 3 1 A 2389 GLY 1 0.660 4 1 A 2390 ILE 1 0.670 5 1 A 2391 ALA 1 0.650 6 1 A 2392 PHE 1 0.510 7 1 A 2393 ARG 1 0.520 8 1 A 2394 VAL 1 0.640 9 1 A 2395 LEU 1 0.540 10 1 A 2396 GLN 1 0.530 11 1 A 2397 ASP 1 0.620 12 1 A 2398 PHE 1 0.500 13 1 A 2399 GLN 1 0.410 14 1 A 2400 LEU 1 0.390 15 1 A 2401 ASP 1 0.410 16 1 A 2402 ALA 1 0.360 17 1 A 2403 ALA 1 0.600 18 1 A 2404 MET 1 0.580 19 1 A 2405 THR 1 0.630 20 1 A 2406 TYR 1 0.550 21 1 A 2407 CYS 1 0.650 22 1 A 2408 ARG 1 0.590 23 1 A 2409 ALA 1 0.590 24 1 A 2410 ALA 1 0.660 25 1 A 2411 ARG 1 0.650 26 1 A 2412 GLN 1 0.650 27 1 A 2413 LEU 1 0.640 28 1 A 2414 VAL 1 0.720 29 1 A 2415 GLU 1 0.700 30 1 A 2416 LYS 1 0.650 31 1 A 2417 GLU 1 0.670 32 1 A 2418 LYS 1 0.680 33 1 A 2419 TYR 1 0.550 34 1 A 2420 SER 1 0.630 35 1 A 2421 GLU 1 0.610 36 1 A 2422 ILE 1 0.590 37 1 A 2423 GLN 1 0.530 38 1 A 2424 GLN 1 0.620 39 1 A 2425 LEU 1 0.670 40 1 A 2426 LEU 1 0.540 41 1 A 2427 LYS 1 0.560 42 1 A 2428 CYS 1 0.470 43 1 A 2429 VAL 1 0.460 44 1 A 2430 SER 1 0.470 45 1 A 2431 GLU 1 0.460 46 1 A 2432 SER 1 0.500 47 1 A 2433 GLY 1 0.460 48 1 A 2434 MET 1 0.400 49 1 A 2435 ALA 1 0.440 50 1 A 2436 ALA 1 0.450 51 1 A 2437 LYS 1 0.440 52 1 A 2438 SER 1 0.470 53 1 A 2439 ASP 1 0.440 54 1 A 2440 GLY 1 0.440 55 1 A 2441 ASP 1 0.450 56 1 A 2442 THR 1 0.450 57 1 A 2443 ILE 1 0.450 58 1 A 2444 LEU 1 0.450 59 1 A 2445 LEU 1 0.460 60 1 A 2446 ASN 1 0.440 61 1 A 2447 CYS 1 0.440 62 1 A 2448 LEU 1 0.530 63 1 A 2449 GLU 1 0.470 64 1 A 2450 ALA 1 0.430 65 1 A 2451 PHE 1 0.340 66 1 A 2452 LYS 1 0.370 67 1 A 2453 ARG 1 0.310 68 1 A 2454 ILE 1 0.310 69 1 A 2455 PRO 1 0.340 70 1 A 2456 PRO 1 0.360 71 1 A 2457 GLN 1 0.400 72 1 A 2458 GLU 1 0.430 73 1 A 2459 LEU 1 0.440 74 1 A 2460 GLU 1 0.520 75 1 A 2461 GLY 1 0.500 76 1 A 2462 LEU 1 0.470 77 1 A 2463 ILE 1 0.530 78 1 A 2464 GLN 1 0.520 79 1 A 2465 ALA 1 0.530 80 1 A 2466 ILE 1 0.520 81 1 A 2467 HIS 1 0.470 82 1 A 2468 ASN 1 0.510 83 1 A 2469 ASP 1 0.530 84 1 A 2470 ASP 1 0.490 85 1 A 2471 ASN 1 0.520 86 1 A 2472 LYS 1 0.540 87 1 A 2473 VAL 1 0.580 88 1 A 2474 ARG 1 0.500 89 1 A 2475 ALA 1 0.510 90 1 A 2476 TYR 1 0.460 91 1 A 2477 LEU 1 0.380 92 1 A 2478 ILE 1 0.350 93 1 A 2479 CYS 1 0.390 94 1 A 2480 CYS 1 0.320 95 1 A 2481 LYS 1 0.410 96 1 A 2482 LEU 1 0.390 97 1 A 2483 ARG 1 0.420 98 1 A 2484 SER 1 0.550 99 1 A 2485 ALA 1 0.550 100 1 A 2486 TYR 1 0.510 101 1 A 2487 LEU 1 0.520 102 1 A 2488 ILE 1 0.530 103 1 A 2489 ALA 1 0.580 104 1 A 2490 VAL 1 0.550 105 1 A 2491 LYS 1 0.480 106 1 A 2492 GLN 1 0.510 107 1 A 2493 GLU 1 0.440 108 1 A 2494 HIS 1 0.350 109 1 A 2495 SER 1 0.390 110 1 A 2496 ARG 1 0.380 111 1 A 2497 ALA 1 0.520 112 1 A 2498 THR 1 0.540 113 1 A 2499 ALA 1 0.610 114 1 A 2500 LEU 1 0.520 115 1 A 2501 VAL 1 0.580 116 1 A 2502 GLN 1 0.520 117 1 A 2503 GLN 1 0.520 118 1 A 2504 VAL 1 0.520 119 1 A 2505 GLN 1 0.470 120 1 A 2506 GLN 1 0.460 121 1 A 2507 ALA 1 0.400 122 1 A 2508 ALA 1 0.370 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #