data_SMR-21628fd0f041744a9d2f7ad06d2f11f2_15 _entry.id SMR-21628fd0f041744a9d2f7ad06d2f11f2_15 _struct.entry_id SMR-21628fd0f041744a9d2f7ad06d2f11f2_15 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P82094 (isoform 2)/ TMF1_HUMAN, TATA element modulatory factor Estimated model accuracy of this model is 0.025, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P82094 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-04.4 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 143041.035 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP TMF1_HUMAN P82094 1 ;MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSIWAETIPYGEPGISSPVSGGWDTSTWGLKSNTEP QSPPIASPKAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPTDVQTIQKSPVVSKPPAKSQRPEEEVKSSLHESLHIG QSRTPETTESQVKDSSLCVSGETLAAGTSSPKTEGKHEETVNKESDMKVPTVSLKVSESVIDVKTTMESI SNTSTQSLTAETKDIALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSTFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETT DSKSSLHLMQTSFQLLSASACPEYNRLDDFQKLTESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELSG KGYALVPIIVNSSTPKSKTVESAEGKSEEVNETLVIPTEEAEMEESGRSATPVNCEQPDILVSSTPINEG QTVLDKVAEQCEPAESQPEALSEKEDVCKVTLTVEFLNEKLEKREAQLLSLSKEKALLEEAFDNLKDEMF RVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEIKNIKEELATRLNSSETADLLKEKDEQIRG LMEEGEKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKENENMVAKLNKKVKELEEELQHLKQVLDGKEEVEKQHRENIKK LNSMVERQEKDLGRLQVDMDELEEKNRSIQAALDSAYKELTDLHKANAAKDSEAQEAALSREMKAKEELS AALEKAQEEARQQQETLAIQVGDLRLALQRTEQAAARKEDYLRHEIGELQQRLQEAENRNQELSQSVSST TRPLLRQIENLQATLGSQTSSWEKLEKNLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSMESQNSL LRQENSRFQAQLESEKNRLCKLEDENNRYQVELENLKDEYVRTLEETRKEKTLLNSQLEMERMKVEQERK KAIFTQETIKEKERKPFSVSSTPTMSRSSSISGVDMAGLQTSFLSQDESHDHSFGPMPISANGSNLYDAV RMGAGSSIIENLQSQLKLREGEITHLQLEIGNLEKTRSIMAEELVKLTNQNDELEEKVKEIPKLRTQLRD LDQRYNTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQSLS ; 'TATA element modulatory factor' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1096 1 1096 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . TMF1_HUMAN P82094 P82094-2 1 1096 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-12-16 A539A619EE47842D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSIWAETIPYGEPGISSPVSGGWDTSTWGLKSNTEP QSPPIASPKAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPTDVQTIQKSPVVSKPPAKSQRPEEEVKSSLHESLHIG QSRTPETTESQVKDSSLCVSGETLAAGTSSPKTEGKHEETVNKESDMKVPTVSLKVSESVIDVKTTMESI SNTSTQSLTAETKDIALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSTFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETT DSKSSLHLMQTSFQLLSASACPEYNRLDDFQKLTESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELSG KGYALVPIIVNSSTPKSKTVESAEGKSEEVNETLVIPTEEAEMEESGRSATPVNCEQPDILVSSTPINEG QTVLDKVAEQCEPAESQPEALSEKEDVCKVTLTVEFLNEKLEKREAQLLSLSKEKALLEEAFDNLKDEMF RVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEIKNIKEELATRLNSSETADLLKEKDEQIRG LMEEGEKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKENENMVAKLNKKVKELEEELQHLKQVLDGKEEVEKQHRENIKK 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RVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEIKNIKEELATRLNSSETADLLKEKDEQIRG LMEEGEKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKENENMVAKLNKKVKELEEELQHLKQVLDGKEEVEKQHRENIKK LNSMVERQEKDLGRLQVDMDELEEKNRSIQAALDSAYKELTDLHKANAAKDSEAQEAALSREMKAKEELS AALEKAQEEARQQQETLAIQVGDLRLALQRTEQAAARKEDYLRHEIGELQQRLQEAENRNQELSQSVSST TRPLLRQIENLQATLGSQTSSWEKLEKNLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSMESQNSL LRQENSRFQAQLESEKNRLCKLEDENNRYQVELENLKDEYVRTLEETRKEKTLLNSQLEMERMKVEQERK KAIFTQETIKEKERKPFSVSSTPTMSRSSSISGVDMAGLQTSFLSQDESHDHSFGPMPISANGSNLYDAV RMGAGSSIIENLQSQLKLREGEITHLQLEIGNLEKTRSIMAEELVKLTNQNDELEEKVKEIPKLRTQLRD LDQRYNTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQSLS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 TRP . 1 4 PHE . 1 5 ASN . 1 6 ALA . 1 7 SER . 1 8 GLN . 1 9 LEU . 1 10 SER . 1 11 SER . 1 12 PHE . 1 13 ALA . 1 14 LYS . 1 15 GLN . 1 16 ALA . 1 17 LEU . 1 18 SER . 1 19 GLN . 1 20 ALA . 1 21 GLN . 1 22 LYS . 1 23 SER . 1 24 ILE . 1 25 ASP . 1 26 ARG . 1 27 VAL . 1 28 LEU . 1 29 ASP . 1 30 ILE . 1 31 GLN . 1 32 GLU . 1 33 GLU . 1 34 GLU . 1 35 PRO . 1 36 SER . 1 37 ILE . 1 38 TRP . 1 39 ALA . 1 40 GLU . 1 41 THR . 1 42 ILE . 1 43 PRO . 1 44 TYR . 1 45 GLY . 1 46 GLU . 1 47 PRO . 1 48 GLY . 1 49 ILE . 1 50 SER . 1 51 SER . 1 52 PRO . 1 53 VAL . 1 54 SER . 1 55 GLY . 1 56 GLY . 1 57 TRP . 1 58 ASP . 1 59 THR . 1 60 SER . 1 61 THR . 1 62 TRP . 1 63 GLY . 1 64 LEU . 1 65 LYS . 1 66 SER . 1 67 ASN . 1 68 THR . 1 69 GLU . 1 70 PRO . 1 71 GLN . 1 72 SER . 1 73 PRO . 1 74 PRO . 1 75 ILE . 1 76 ALA . 1 77 SER . 1 78 PRO . 1 79 LYS . 1 80 ALA . 1 81 ILE . 1 82 THR . 1 83 LYS . 1 84 PRO . 1 85 VAL . 1 86 ARG . 1 87 ARG . 1 88 THR . 1 89 VAL . 1 90 VAL . 1 91 ASP . 1 92 GLU . 1 93 SER . 1 94 GLU . 1 95 ASN . 1 96 PHE . 1 97 PHE . 1 98 SER . 1 99 ALA . 1 100 PHE . 1 101 LEU . 1 102 SER . 1 103 PRO . 1 104 THR . 1 105 ASP . 1 106 VAL . 1 107 GLN . 1 108 THR . 1 109 ILE . 1 110 GLN . 1 111 LYS . 1 112 SER . 1 113 PRO . 1 114 VAL . 1 115 VAL . 1 116 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A 1 1091 LEU 1091 1091 LEU LEU D . A 1 1092 ARG 1092 ? ? ? D . A 1 1093 GLN 1093 ? ? ? D . A 1 1094 SER 1094 ? ? ? D . A 1 1095 LEU 1095 ? ? ? D . A 1 1096 SER 1096 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Chromosome partition protein MukB {PDB ID=9gm6, label_asym_id=D, auth_asym_id=A, SMTL ID=9gm6.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 9gm6, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 15' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-06 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-05-30 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MIERGKFRSLTLVNWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAAFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGATS GSRDKGLHGKLRAGVCYSTLDVINSRHQRVVVGVRLQQVAGRDRKVDIKPFMIQGLPTAIQPTQLLTENV GERQARVLPLNELKDRLDEMEGVQFKQFNSITDYHAQMFDLGVIPKRLRSASDRSKFYRLIEASLYGGIS SAITRSLRDYLLPENSGVRKAFQDMEAALRENRITLEAIRVTQSDRDLFKHLITEATSYVSADYMRHANE RRTHLDEALALRGELFGSHKQLATEQYRHVEMARELAEQSGASSDLETDHQAASDHLNLVQTAMRQQEKI DRYQVDLEELSYRLEEQTDVVEEAGELQAEYEARTEATEQEVDELKSQLADYQQALDVQQTRAIQYQQAL QALERARELCRLPDLSVDNAEEWLETFQAKEQQATEALLALEQKLSVADAAHNQFEQAYQLVKNIVGETS RSEAWQSARELLRDWPSQRHLADRVQPLRMRLSELEQRLNNQQNAERLLSEFCKRQGRQYQAEDLEALQN ELEARQEALSLSVNEGGERRMEMRQELEQLKQKIQSLTARAPVWLAAQDTLNQLCEQSGETLASSNDVTE YMQQLLEREREATVERDEVAAQKRELEKQIERLSQPSGAEDSRMIALAERFGGVLLSEIYDDITIDDAPY FSALYGPARHGIVVPDLSLVRPHLETLEDCPEDLYLIEGDPQSFDDSVFNAEEQTNAVLVKSSDRQWRYS RYPELPLFGRAARENRLEALNLERDALAERYATLSFDVQKIQRAHQAFSQFVGKHLSVAFDTDPEAEIRE LRQRHTELEREVSRFEDQTQQQRQQYAQAKESLTTLNRLIPQVTLLLDETLIDRVEEVREEMDEAQEAAR FLQQHGSALTKLEPMVAVLQSDPQQHEQLQQDYETAKHSQHQAKQQAFALVEIVQRRVHFSYSDSAGMLS ENADLNDKLRQRLEHAESDRSRAREQLRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQAD ANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVVSAKAGWCAV MRMVKDNGVERRLHRRELAYMEGGALRSMSDKALGALRLAVADNEHLRDALRLSEDPKRPERKVQFFIAV YQHLRERIRQDIIRTDDPVDAIEQMEIELARLTEELTAREQKLAISSKSVANIIRKTIQREQNRIRMLNQ GLQAVSFGQVRGVRLNVNVRESHAILLDVLSEQQEQHQDLFNSQRLTFSEAMAKLYQRLNPQVDMGQRLP QTIGEELLDYRNYLELDVEVNRGSDGWLKAESGALSTGEAIGTGMSILVMVVQSWEEESRRLRGKDISPC RLLFLDEAARLDAKSIATLFELCERLQMQLIIAAPENISPEKGTTYKLVRKVFKNHEHVHVVGLRGFGQD APATQLISDVTA ; ;MIERGKFRSLTLVNWNGFFARTFDLDELVTTLSGGNGAGKSTTMAAFVTALIPDLTLLHFRNTTEAGATS GSRDKGLHGKLRAGVCYSTLDVINSRHQRVVVGVRLQQVAGRDRKVDIKPFMIQGLPTAIQPTQLLTENV GERQARVLPLNELKDRLDEMEGVQFKQFNSITDYHAQMFDLGVIPKRLRSASDRSKFYRLIEASLYGGIS SAITRSLRDYLLPENSGVRKAFQDMEAALRENRITLEAIRVTQSDRDLFKHLITEATSYVSADYMRHANE RRTHLDEALALRGELFGSHKQLATEQYRHVEMARELAEQSGASSDLETDHQAASDHLNLVQTAMRQQEKI DRYQVDLEELSYRLEEQTDVVEEAGELQAEYEARTEATEQEVDELKSQLADYQQALDVQQTRAIQYQQAL QALERARELCRLPDLSVDNAEEWLETFQAKEQQATEALLALEQKLSVADAAHNQFEQAYQLVKNIVGETS RSEAWQSARELLRDWPSQRHLADRVQPLRMRLSELEQRLNNQQNAERLLSEFCKRQGRQYQAEDLEALQN ELEARQEALSLSVNEGGERRMEMRQELEQLKQKIQSLTARAPVWLAAQDTLNQLCEQSGETLASSNDVTE YMQQLLEREREATVERDEVAAQKRELEKQIERLSQPSGAEDSRMIALAERFGGVLLSEIYDDITIDDAPY FSALYGPARHGIVVPDLSLVRPHLETLEDCPEDLYLIEGDPQSFDDSVFNAEEQTNAVLVKSSDRQWRYS RYPELPLFGRAARENRLEALNLERDALAERYATLSFDVQKIQRAHQAFSQFVGKHLSVAFDTDPEAEIRE LRQRHTELEREVSRFEDQTQQQRQQYAQAKESLTTLNRLIPQVTLLLDETLIDRVEEVREEMDEAQEAAR FLQQHGSALTKLEPMVAVLQSDPQQHEQLQQDYETAKHSQHQAKQQAFALVEIVQRRVHFSYSDSAGMLS ENADLNDKLRQRLEHAESDRSRAREQLRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQAD ANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVVSAKAGWCAV MRMVKDNGVERRLHRRELAYMEGGALRSMSDKALGALRLAVADNEHLRDALRLSEDPKRPERKVQFFIAV YQHLRERIRQDIIRTDDPVDAIEQMEIELARLTEELTAREQKLAISSKSVANIIRKTIQREQNRIRMLNQ GLQAVSFGQVRGVRLNVNVRESHAILLDVLSEQQEQHQDLFNSQRLTFSEAMAKLYQRLNPQVDMGQRLP QTIGEELLDYRNYLELDVEVNRGSDGWLKAESGALSTGEAIGTGMSILVMVVQSWEEESRRLRGKDISPC RLLFLDEAARLDAKSIATLFELCERLQMQLIIAAPENISPEKGTTYKLVRKVFKNHEHVHVVGLRGFGQD APATQLISDVTA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1007 1111 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9gm6 2025-05-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1096 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1098 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.031 13.592 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSWFNASQLSSFAKQALSQAQKSIDRVLDIQEEEPSIWAETIPYGEPGISSPVSGGWDTSTWGLKSNTEPQSPPIASPKAITKPVRRTVVDESENFFSAFLSPTDVQTIQKSPVVSKPPAKSQRPEEEVKSSLHESLHIGQSRTPETTESQVKDSSLCVSGETLAAGTSSPKTEGKHEETVNKESDMKVPTVSLKVSESVIDVKTTMESISNTSTQSLTAETKDIALEPKEQKHEDRQSNTPSPPVSTFSSGTSTTSDIEVLDHESVISESSASSRQETTDSKSSLHLMQTSFQLLSASACPEYNRLDDFQKLTESCCSSDAFERIDSFSVQSLDSRSVSEINSDDELSGKGYALVPIIVNSSTPKSKTVESAEGKSEEVNETLVIPTEEAEMEESGRSATPVNCEQPDILVSSTPINEGQTVLDKVAEQCEPAESQPEALSEKEDVCKVTLTVEFLNEKLEKREAQLLSLSKEKALLEEAFDNLKDEMFRVKEESSSISSLKDEFTQRIAEAEKKVQLACKERDAAKKEIKNIKEELATRLNSSETADLLKEKDEQIRGLMEEGEKLSKQQLHNSNIIKKLRAKDKENENMVAKLNKKVKELEEELQHLKQVLDGKEEVEKQHRENIKKLNSMVERQEKDLGRLQVDMDELEEKNRSIQAALDSAYKELTDLHKANAAKDSEAQEAALSREMKAKEELSAALEKAQEEARQQQETLAIQVGDLRLALQRTEQAAARKEDYLRHEIGELQQRLQEAENRNQELSQSVSSTTRPLLRQIENLQATLGSQTSSWEKLEKNLSDRLGESQTLLAAAVERERAATEELLANKIQMSSMESQNSLLRQENSRFQAQLESEKNRLCKLEDENNRYQVELENLKDEYVRTLEETRKEKTLLNSQLEMERMKVEQERKKAIFTQETIKEKERKPFSVSSTPTMSRSSSISGVDMAGLQTSFLSQDESHDHSFGPMPISANGSNLYDAVRMGAGSSIIENLQSQLKLREGEITHLQLEIGNLEKTRSIMAEELVKLTNQNDELE--EKVKEIPKLRTQLRDLDQRYNTILQMYGEKAEEAEELRLDLEDVKNMYKTQIDELLRQSLS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRQQQAQYSQFNQVLASLKSSYETKQDMLKELLQEMKDIGVQADANAEMRARERRDRLHEALSVNRSRVNQLEKQIAFCEAEMENVQKKLRKLERDYYQIREQVV----- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9gm6.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 15' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 1037 1037 ? A 214.245 270.592 184.663 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 2 C CA . LYS 1037 1037 ? A 215.355 269.761 185.259 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 3 C C . LYS 1037 1037 ? A 215.318 269.732 186.798 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 4 O O . LYS 1037 1037 ? A 215.376 268.661 187.405 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 5 C CB . LYS 1037 1037 ? A 216.737 270.287 184.786 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 6 C CG . LYS 1037 1037 ? A 217.916 269.402 185.243 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 7 C CD . LYS 1037 1037 ? A 219.277 269.903 184.725 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 8 C CE . LYS 1037 1037 ? A 220.451 269.027 185.186 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 9 N NZ . LYS 1037 1037 ? A 221.731 269.534 184.641 1 1 D LYS 0.390 1 ATOM 10 N N . VAL 1038 1038 ? A 215.188 270.904 187.448 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 11 C CA . VAL 1038 1038 ? A 215.012 271.038 188.893 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 12 C C . VAL 1038 1038 ? A 213.675 270.526 189.453 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 13 O O . VAL 1038 1038 ? A 213.495 270.394 190.587 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 14 C CB . VAL 1038 1038 ? A 215.267 272.467 189.447 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 15 C CG1 . VAL 1038 1038 ? A 215.314 272.567 190.993 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 16 C CG2 . VAL 1038 1038 ? A 216.628 273.014 188.963 1 1 D VAL 0.440 1 ATOM 17 N N . LYS 1039 1039 ? A 212.648 270.191 188.655 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 18 C CA . LYS 1039 1039 ? A 211.643 269.354 189.274 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 19 C C . LYS 1039 1039 ? A 212.049 267.876 189.476 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 20 O O . LYS 1039 1039 ? A 211.813 267.316 190.566 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 21 C CB . LYS 1039 1039 ? A 210.353 269.482 188.500 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 22 C CG . LYS 1039 1039 ? A 209.224 268.736 189.179 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 23 C CD . LYS 1039 1039 ? A 208.005 269.075 188.352 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 24 C CE . LYS 1039 1039 ? A 206.770 268.320 188.777 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 25 N NZ . LYS 1039 1039 ? A 205.624 268.671 187.917 1 1 D LYS 0.600 1 ATOM 26 N N . GLU 1040 1040 ? A 212.644 267.217 188.484 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 27 C CA . GLU 1040 1040 ? A 212.985 265.794 188.486 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 28 C C . GLU 1040 1040 ? A 214.099 265.412 189.459 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 29 O O . GLU 1040 1040 ? A 213.930 264.497 190.288 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 30 C CB . GLU 1040 1040 ? A 213.342 265.437 187.036 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 31 C CG . GLU 1040 1040 ? A 213.667 263.956 186.767 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 32 C CD . GLU 1040 1040 ? A 213.959 263.724 185.282 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 33 O OE1 . GLU 1040 1040 ? A 213.921 264.717 184.503 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 34 O OE2 . GLU 1040 1040 ? A 214.236 262.552 184.930 1 1 D GLU 0.610 1 ATOM 35 N N . ILE 1041 1041 ? A 215.233 266.129 189.460 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 36 C CA . ILE 1041 1041 ? A 216.362 265.894 190.365 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 37 C C . ILE 1041 1041 ? A 216.013 266.019 191.876 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 38 O O . ILE 1041 1041 ? A 216.388 265.132 192.613 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 39 C CB . ILE 1041 1041 ? A 217.614 266.687 189.949 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 40 C CG1 . ILE 1041 1041 ? A 218.123 266.270 188.543 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 41 C CG2 . ILE 1041 1041 ? A 218.744 266.520 190.994 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 42 C CD1 . ILE 1041 1041 ? A 219.218 267.206 188.012 1 1 D ILE 0.630 1 ATOM 43 N N . PRO 1042 1042 ? A 215.310 267.013 192.434 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 44 C CA . PRO 1042 1042 ? A 214.905 267.013 193.837 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 45 C C . PRO 1042 1042 ? A 213.901 265.978 194.228 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 46 O O . PRO 1042 1042 ? A 213.941 265.548 195.380 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 47 C CB . PRO 1042 1042 ? A 214.224 268.364 194.037 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 48 C CG . PRO 1042 1042 ? A 214.881 269.303 193.035 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 49 C CD . PRO 1042 1042 ? A 215.292 268.371 191.897 1 1 D PRO 0.680 1 ATOM 50 N N . LYS 1043 1043 ? A 212.957 265.610 193.335 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 51 C CA . LYS 1043 1043 ? A 212.082 264.482 193.593 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 52 C C . LYS 1043 1043 ? A 212.888 263.197 193.674 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 53 O O . LYS 1043 1043 ? A 212.697 262.391 194.571 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 54 C CB . LYS 1043 1043 ? A 210.903 264.355 192.601 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 55 C CG . LYS 1043 1043 ? A 209.868 265.472 192.791 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 56 C CD . LYS 1043 1043 ? A 208.652 265.289 191.881 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 57 C CE . LYS 1043 1043 ? A 207.593 266.356 192.125 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 58 N NZ . LYS 1043 1043 ? A 206.439 266.042 191.264 1 1 D LYS 0.710 1 ATOM 59 N N . LEU 1044 1044 ? A 213.885 263.026 192.786 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 60 C CA . LEU 1044 1044 ? A 214.873 261.968 192.910 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 61 C C . LEU 1044 1044 ? A 215.709 262.022 194.193 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 62 O O . LEU 1044 1044 ? A 215.953 261.008 194.842 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 63 C CB . LEU 1044 1044 ? A 215.810 261.968 191.678 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 64 C CG . LEU 1044 1044 ? A 215.154 261.446 190.387 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 65 C CD1 . LEU 1044 1044 ? A 216.037 261.756 189.168 1 1 D LEU 0.720 1 ATOM 66 C CD2 . LEU 1044 1044 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.683 2 1 3 0.025 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1037 LYS 1 0.390 2 1 A 1038 VAL 1 0.440 3 1 A 1039 LYS 1 0.600 4 1 A 1040 GLU 1 0.610 5 1 A 1041 ILE 1 0.630 6 1 A 1042 PRO 1 0.680 7 1 A 1043 LYS 1 0.710 8 1 A 1044 LEU 1 0.720 9 1 A 1045 ARG 1 0.690 10 1 A 1046 THR 1 0.740 11 1 A 1047 GLN 1 0.720 12 1 A 1048 LEU 1 0.740 13 1 A 1049 ARG 1 0.710 14 1 A 1050 ASP 1 0.740 15 1 A 1051 LEU 1 0.730 16 1 A 1052 ASP 1 0.730 17 1 A 1053 GLN 1 0.720 18 1 A 1054 ARG 1 0.700 19 1 A 1055 TYR 1 0.690 20 1 A 1056 ASN 1 0.730 21 1 A 1057 THR 1 0.720 22 1 A 1058 ILE 1 0.680 23 1 A 1059 LEU 1 0.690 24 1 A 1060 GLN 1 0.680 25 1 A 1061 MET 1 0.660 26 1 A 1062 TYR 1 0.650 27 1 A 1063 GLY 1 0.710 28 1 A 1064 GLU 1 0.690 29 1 A 1065 LYS 1 0.700 30 1 A 1066 ALA 1 0.740 31 1 A 1067 GLU 1 0.720 32 1 A 1068 GLU 1 0.720 33 1 A 1069 ALA 1 0.760 34 1 A 1070 GLU 1 0.710 35 1 A 1071 GLU 1 0.720 36 1 A 1072 LEU 1 0.720 37 1 A 1073 ARG 1 0.680 38 1 A 1074 LEU 1 0.710 39 1 A 1075 ASP 1 0.710 40 1 A 1076 LEU 1 0.700 41 1 A 1077 GLU 1 0.690 42 1 A 1078 ASP 1 0.690 43 1 A 1079 VAL 1 0.700 44 1 A 1080 LYS 1 0.720 45 1 A 1081 ASN 1 0.710 46 1 A 1082 MET 1 0.670 47 1 A 1083 TYR 1 0.680 48 1 A 1084 LYS 1 0.700 49 1 A 1085 THR 1 0.700 50 1 A 1086 GLN 1 0.660 51 1 A 1087 ILE 1 0.640 52 1 A 1088 ASP 1 0.620 53 1 A 1089 GLU 1 0.620 54 1 A 1090 LEU 1 0.670 55 1 A 1091 LEU 1 0.630 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #