data_SMR-98fdbe55c0ca74fc57744943b612adf7_7
_entry.id SMR-98fdbe55c0ca74fc57744943b612adf7_7
_struct.entry_id SMR-98fdbe55c0ca74fc57744943b612adf7_7
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - O60486/ PLXC1_HUMAN, Plexin-C1

Estimated model accuracy of this model is 0.009, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries O60486'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.1
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 204192.728 1 .
#
#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP PLXC1_HUMAN O60486 1
;MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVASGSCLDQLDY
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;
Plexin-C1
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1568 1 1568
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . PLXC1_HUMAN O60486 . 1 1568 9606 'Homo sapiens (Human)' 1998-08-01
EA0CE5519BEF925D .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVASGSCLDQLDY
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;

;MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVASGSCLDQLDY
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#
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_entity_poly_seq.num
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_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
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1 5 ARG .
1 6 ARG .
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1 49 ILE .
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1 51 ALA .
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A 1 64 CYS 64 ? ? ? A .
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A 1 904 THR 904 ? ? ? A .
A 1 905 ILE 905 ? ? ? A .
A 1 906 LEU 906 ? ? ? A .
A 1 907 CYS 907 ? ? ? A .
A 1 908 LYS 908 ? ? ? A .
A 1 909 ILE 909 ? ? ? A .
A 1 910 LYS 910 ? ? ? A .
A 1 911 GLY 911 ? ? ? A .
A 1 912 ILE 912 ? ? ? A .
A 1 913 LYS 913 ? ? ? A .
A 1 914 THR 914 ? ? ? A .
A 1 915 ALA 915 ? ? ? A .
A 1 916 SER 916 ? ? ? A .
A 1 917 THR 917 ? ? ? A .
A 1 918 ILE 918 ? ? ? A .
A 1 919 ALA 919 ? ? ? A .
A 1 920 ASN 920 ? ? ? A .
A 1 921 SER 921 ? ? ? A .
A 1 922 SER 922 ? ? ? A .
A 1 923 LYS 923 ? ? ? A .
A 1 924 LYS 924 ? ? ? A .
A 1 925 VAL 925 ? ? ? A .
A 1 926 ARG 926 ? ? ? A .
A 1 927 VAL 927 ? ? ? A .
A 1 928 LYS 928 ? ? ? A .
A 1 929 LEU 929 ? ? ? A .
A 1 930 GLY 930 ? ? ? A .
A 1 931 ASN 931 ? ? ? A .
A 1 932 LEU 932 ? ? ? A .
A 1 933 GLU 933 ? ? ? A .
A 1 934 LEU 934 ? ? ? A .
A 1 935 TYR 935 ? ? ? A .
A 1 936 VAL 936 ? ? ? A .
A 1 937 GLU 937 ? ? ? A .
A 1 938 GLN 938 ? ? ? A .
A 1 939 GLU 939 ? ? ? A .
A 1 940 SER 940 ? ? ? A .
A 1 941 VAL 941 ? ? ? A .
A 1 942 PRO 942 ? ? ? A .
A 1 943 SER 943 ? ? ? A .
A 1 944 THR 944 ? ? ? A .
A 1 945 TRP 945 ? ? ? A .
A 1 946 TYR 946 ? ? ? A .
A 1 947 PHE 947 ? ? ? A .
A 1 948 LEU 948 ? ? ? A .
A 1 949 ILE 949 ? ? ? A .
A 1 950 VAL 950 ? ? ? A .
A 1 951 LEU 951 ? ? ? A .
A 1 952 PRO 952 ? ? ? A .
A 1 953 VAL 953 ? ? ? A .
A 1 954 LEU 954 ? ? ? A .
A 1 955 LEU 955 ? ? ? A .
A 1 956 VAL 956 ? ? ? A .
A 1 957 ILE 957 ? ? ? A .
A 1 958 VAL 958 ? ? ? A .
A 1 959 ILE 959 959 ILE ILE A .
A 1 960 PHE 960 960 PHE PHE A .
A 1 961 ALA 961 961 ALA ALA A .
A 1 962 ALA 962 962 ALA ALA A .
A 1 963 VAL 963 963 VAL VAL A .
A 1 964 GLY 964 964 GLY GLY A .
A 1 965 VAL 965 965 VAL VAL A .
A 1 966 THR 966 966 THR THR A .
A 1 967 ARG 967 967 ARG ARG A .
A 1 968 HIS 968 968 HIS HIS A .
A 1 969 LYS 969 969 LYS LYS A .
A 1 970 SER 970 970 SER SER A .
A 1 971 LYS 971 971 LYS LYS A .
A 1 972 GLU 972 972 GLU GLU A .
A 1 973 LEU 973 973 LEU LEU A .
A 1 974 SER 974 974 SER SER A .
A 1 975 ARG 975 975 ARG ARG A .
A 1 976 LYS 976 976 LYS LYS A .
A 1 977 GLN 977 977 GLN GLN A .
A 1 978 SER 978 978 SER SER A .
A 1 979 GLN 979 979 GLN GLN A .
A 1 980 GLN 980 980 GLN GLN A .
A 1 981 LEU 981 981 LEU LEU A .
A 1 982 GLU 982 982 GLU GLU A .
A 1 983 LEU 983 983 LEU LEU A .
A 1 984 LEU 984 984 LEU LEU A .
A 1 985 GLU 985 985 GLU GLU A .
A 1 986 SER 986 986 SER SER A .
A 1 987 GLU 987 ? ? ? A .
A 1 988 LEU 988 ? ? ? A .
A 1 989 ARG 989 ? ? ? A .
A 1 990 LYS 990 ? ? ? A .
A 1 991 GLU 991 ? ? ? A .
A 1 992 ILE 992 ? ? ? A .
A 1 993 ARG 993 ? ? ? A .
A 1 994 ASP 994 ? ? ? A .
A 1 995 GLY 995 ? ? ? A .
A 1 996 PHE 996 ? ? ? A .
A 1 997 ALA 997 ? ? ? A .
A 1 998 GLU 998 ? ? ? A .
A 1 999 LEU 999 ? ? ? A .
A 1 1000 GLN 1000 ? ? ? A .
A 1 1001 MET 1001 ? ? ? A .
A 1 1002 ASP 1002 ? ? ? A .
A 1 1003 LYS 1003 ? ? ? A .
A 1 1004 LEU 1004 ? ? ? A .
A 1 1005 ASP 1005 ? ? ? A .
A 1 1006 VAL 1006 ? ? ? A .
A 1 1007 VAL 1007 ? ? ? A .
A 1 1008 ASP 1008 ? ? ? A .
A 1 1009 SER 1009 ? ? ? A .
A 1 1010 PHE 1010 ? ? ? A .
A 1 1011 GLY 1011 ? ? ? A .
A 1 1012 THR 1012 ? ? ? A .
A 1 1013 VAL 1013 ? ? ? A .
A 1 1014 PRO 1014 ? ? ? A .
A 1 1015 PHE 1015 ? ? ? A .
A 1 1016 LEU 1016 ? ? ? A .
A 1 1017 ASP 1017 ? ? ? A .
A 1 1018 TYR 1018 ? ? ? A .
A 1 1019 LYS 1019 ? ? ? A .
A 1 1020 HIS 1020 ? ? ? A .
A 1 1021 PHE 1021 ? ? ? A .
A 1 1022 ALA 1022 ? ? ? A .
A 1 1023 LEU 1023 ? ? ? A .
A 1 1024 ARG 1024 ? ? ? A .
A 1 1025 THR 1025 ? ? ? A .
A 1 1026 PHE 1026 ? ? ? A .
A 1 1027 PHE 1027 ? ? ? A .
A 1 1028 PRO 1028 ? ? ? A .
A 1 1029 GLU 1029 ? ? ? A .
A 1 1030 SER 1030 ? ? ? A .
A 1 1031 GLY 1031 ? ? ? A .
A 1 1032 GLY 1032 ? ? ? A .
A 1 1033 PHE 1033 ? ? ? A .
A 1 1034 THR 1034 ? ? ? A .
A 1 1035 HIS 1035 ? ? ? A .
A 1 1036 ILE 1036 ? ? ? A .
A 1 1037 PHE 1037 ? ? ? A .
A 1 1038 THR 1038 ? ? ? A .
A 1 1039 GLU 1039 ? ? ? A .
A 1 1040 ASP 1040 ? ? ? A .
A 1 1041 MET 1041 ? ? ? A .
A 1 1042 HIS 1042 ? ? ? A .
A 1 1043 ASN 1043 ? ? ? A .
A 1 1044 ARG 1044 ? ? ? A .
A 1 1045 ASP 1045 ? ? ? A .
A 1 1046 ALA 1046 ? ? ? A .
A 1 1047 ASN 1047 ? ? ? A .
A 1 1048 ASP 1048 ? ? ? A .
A 1 1049 LYS 1049 ? ? ? A .
A 1 1050 ASN 1050 ? ? ? A .
A 1 1051 GLU 1051 ? ? ? A .
A 1 1052 SER 1052 ? ? ? A .
A 1 1053 LEU 1053 ? ? ? A .
A 1 1054 THR 1054 ? ? ? A .
A 1 1055 ALA 1055 ? ? ? A .
A 1 1056 LEU 1056 ? ? ? A .
A 1 1057 ASP 1057 ? ? ? A .
A 1 1058 ALA 1058 ? ? ? A .
A 1 1059 LEU 1059 ? ? ? A .
A 1 1060 ILE 1060 ? ? ? A .
A 1 1061 CYS 1061 ? ? ? A .
A 1 1062 ASN 1062 ? ? ? A .
A 1 1063 LYS 1063 ? ? ? A .
A 1 1064 SER 1064 ? ? ? A .
A 1 1065 PHE 1065 ? ? ? A .
A 1 1066 LEU 1066 ? ? ? A .
A 1 1067 VAL 1067 ? ? ? A .
A 1 1068 THR 1068 ? ? ? A .
A 1 1069 VAL 1069 ? ? ? A .
A 1 1070 ILE 1070 ? ? ? A .
A 1 1071 HIS 1071 ? ? ? A .
A 1 1072 THR 1072 ? ? ? A .
A 1 1073 LEU 1073 ? ? ? A .
A 1 1074 GLU 1074 ? ? ? A .
A 1 1075 LYS 1075 ? ? ? A .
A 1 1076 GLN 1076 ? ? ? A .
A 1 1077 LYS 1077 ? ? ? A .
A 1 1078 ASN 1078 ? ? ? A .
A 1 1079 PHE 1079 ? ? ? A .
A 1 1080 SER 1080 ? ? ? A .
A 1 1081 VAL 1081 ? ? ? A .
A 1 1082 LYS 1082 ? ? ? A .
A 1 1083 ASP 1083 ? ? ? A .
A 1 1084 ARG 1084 ? ? ? A .
A 1 1085 CYS 1085 ? ? ? A .
A 1 1086 LEU 1086 ? ? ? A .
A 1 1087 PHE 1087 ? ? ? A .
A 1 1088 ALA 1088 ? ? ? A .
A 1 1089 SER 1089 ? ? ? A .
A 1 1090 PHE 1090 ? ? ? A .
A 1 1091 LEU 1091 ? ? ? A .
A 1 1092 THR 1092 ? ? ? A .
A 1 1093 ILE 1093 ? ? ? A .
A 1 1094 ALA 1094 ? ? ? A .
A 1 1095 LEU 1095 ? ? ? A .
A 1 1096 GLN 1096 ? ? ? A .
A 1 1097 THR 1097 ? ? ? A .
A 1 1098 LYS 1098 ? ? ? A .
A 1 1099 LEU 1099 ? ? ? A .
A 1 1100 VAL 1100 ? ? ? A .
A 1 1101 TYR 1101 ? ? ? A .
A 1 1102 LEU 1102 ? ? ? A .
A 1 1103 THR 1103 ? ? ? A .
A 1 1104 SER 1104 ? ? ? A .
A 1 1105 ILE 1105 ? ? ? A .
A 1 1106 LEU 1106 ? ? ? A .
A 1 1107 GLU 1107 ? ? ? A .
A 1 1108 VAL 1108 ? ? ? A .
A 1 1109 LEU 1109 ? ? ? A .
A 1 1110 THR 1110 ? ? ? A .
A 1 1111 ARG 1111 ? ? ? A .
A 1 1112 ASP 1112 ? ? ? A .
A 1 1113 LEU 1113 ? ? ? A .
A 1 1114 MET 1114 ? ? ? A .
A 1 1115 GLU 1115 ? ? ? A .
A 1 1116 GLN 1116 ? ? ? A .
A 1 1117 CYS 1117 ? ? ? A .
A 1 1118 SER 1118 ? ? ? A .
A 1 1119 ASN 1119 ? ? ? A .
A 1 1120 MET 1120 ? ? ? A .
A 1 1121 GLN 1121 ? ? ? A .
A 1 1122 PRO 1122 ? ? ? A .
A 1 1123 LYS 1123 ? ? ? A .
A 1 1124 LEU 1124 ? ? ? A .
A 1 1125 MET 1125 ? ? ? A .
A 1 1126 LEU 1126 ? ? ? A .
A 1 1127 ARG 1127 ? ? ? A .
A 1 1128 ARG 1128 ? ? ? A .
A 1 1129 THR 1129 ? ? ? A .
A 1 1130 GLU 1130 ? ? ? A .
A 1 1131 SER 1131 ? ? ? A .
A 1 1132 VAL 1132 ? ? ? A .
A 1 1133 VAL 1133 ? ? ? A .
A 1 1134 GLU 1134 ? ? ? A .
A 1 1135 LYS 1135 ? ? ? A .
A 1 1136 LEU 1136 ? ? ? A .
A 1 1137 LEU 1137 ? ? ? A .
A 1 1138 THR 1138 ? ? ? A .
A 1 1139 ASN 1139 ? ? ? A .
A 1 1140 TRP 1140 ? ? ? A .
A 1 1141 MET 1141 ? ? ? A .
A 1 1142 SER 1142 ? ? ? A .
A 1 1143 VAL 1143 ? ? ? A .
A 1 1144 CYS 1144 ? ? ? A .
A 1 1145 LEU 1145 ? ? ? A .
A 1 1146 SER 1146 ? ? ? A .
A 1 1147 GLY 1147 ? ? ? A .
A 1 1148 PHE 1148 ? ? ? A .
A 1 1149 LEU 1149 ? ? ? A .
A 1 1150 ARG 1150 ? ? ? A .
A 1 1151 GLU 1151 ? ? ? A .
A 1 1152 THR 1152 ? ? ? A .
A 1 1153 VAL 1153 ? ? ? A .
A 1 1154 GLY 1154 ? ? ? A .
A 1 1155 GLU 1155 ? ? ? A .
A 1 1156 PRO 1156 ? ? ? A .
A 1 1157 PHE 1157 ? ? ? A .
A 1 1158 TYR 1158 ? ? ? A .
A 1 1159 LEU 1159 ? ? ? A .
A 1 1160 LEU 1160 ? ? ? A .
A 1 1161 VAL 1161 ? ? ? A .
A 1 1162 THR 1162 ? ? ? A .
A 1 1163 THR 1163 ? ? ? A .
A 1 1164 LEU 1164 ? ? ? A .
A 1 1165 ASN 1165 ? ? ? A .
A 1 1166 GLN 1166 ? ? ? A .
A 1 1167 LYS 1167 ? ? ? A .
A 1 1168 ILE 1168 ? ? ? A .
A 1 1169 ASN 1169 ? ? ? A .
A 1 1170 LYS 1170 ? ? ? A .
A 1 1171 GLY 1171 ? ? ? A .
A 1 1172 PRO 1172 ? ? ? A .
A 1 1173 VAL 1173 ? ? ? A .
A 1 1174 ASP 1174 ? ? ? A .
A 1 1175 VAL 1175 ? ? ? A .
A 1 1176 ILE 1176 ? ? ? A .
A 1 1177 THR 1177 ? ? ? A .
A 1 1178 CYS 1178 ? ? ? A .
A 1 1179 LYS 1179 ? ? ? A .
A 1 1180 ALA 1180 ? ? ? A .
A 1 1181 LEU 1181 ? ? ? A .
A 1 1182 TYR 1182 ? ? ? A .
A 1 1183 THR 1183 ? ? ? A .
A 1 1184 LEU 1184 ? ? ? A .
A 1 1185 ASN 1185 ? ? ? A .
A 1 1186 GLU 1186 ? ? ? A .
A 1 1187 ASP 1187 ? ? ? A .
A 1 1188 TRP 1188 ? ? ? A .
A 1 1189 LEU 1189 ? ? ? A .
A 1 1190 LEU 1190 ? ? ? A .
A 1 1191 TRP 1191 ? ? ? A .
A 1 1192 GLN 1192 ? ? ? A .
A 1 1193 VAL 1193 ? ? ? A .
A 1 1194 PRO 1194 ? ? ? A .
A 1 1195 GLU 1195 ? ? ? A .
A 1 1196 PHE 1196 ? ? ? A .
A 1 1197 SER 1197 ? ? ? A .
A 1 1198 THR 1198 ? ? ? A .
A 1 1199 VAL 1199 ? ? ? A .
A 1 1200 ALA 1200 ? ? ? A .
A 1 1201 LEU 1201 ? ? ? A .
A 1 1202 ASN 1202 ? ? ? A .
A 1 1203 VAL 1203 ? ? ? A .
A 1 1204 VAL 1204 ? ? ? A .
A 1 1205 PHE 1205 ? ? ? A .
A 1 1206 GLU 1206 ? ? ? A .
A 1 1207 LYS 1207 ? ? ? A .
A 1 1208 ILE 1208 ? ? ? A .
A 1 1209 PRO 1209 ? ? ? A .
A 1 1210 GLU 1210 ? ? ? A .
A 1 1211 ASN 1211 ? ? ? A .
A 1 1212 GLU 1212 ? ? ? A .
A 1 1213 SER 1213 ? ? ? A .
A 1 1214 ALA 1214 ? ? ? A .
A 1 1215 ASP 1215 ? ? ? A .
A 1 1216 VAL 1216 ? ? ? A .
A 1 1217 CYS 1217 ? ? ? A .
A 1 1218 ARG 1218 ? ? ? A .
A 1 1219 ASN 1219 ? ? ? A .
A 1 1220 ILE 1220 ? ? ? A .
A 1 1221 SER 1221 ? ? ? A .
A 1 1222 VAL 1222 ? ? ? A .
A 1 1223 ASN 1223 ? ? ? A .
A 1 1224 VAL 1224 ? ? ? A .
A 1 1225 LEU 1225 ? ? ? A .
A 1 1226 ASP 1226 ? ? ? A .
A 1 1227 CYS 1227 ? ? ? A .
A 1 1228 ASP 1228 ? ? ? A .
A 1 1229 THR 1229 ? ? ? A .
A 1 1230 ILE 1230 ? ? ? A .
A 1 1231 GLY 1231 ? ? ? A .
A 1 1232 GLN 1232 ? ? ? A .
A 1 1233 ALA 1233 ? ? ? A .
A 1 1234 LYS 1234 ? ? ? A .
A 1 1235 GLU 1235 ? ? ? A .
A 1 1236 LYS 1236 ? ? ? A .
A 1 1237 ILE 1237 ? ? ? A .
A 1 1238 PHE 1238 ? ? ? A .
A 1 1239 GLN 1239 ? ? ? A .
A 1 1240 ALA 1240 ? ? ? A .
A 1 1241 PHE 1241 ? ? ? A .
A 1 1242 LEU 1242 ? ? ? A .
A 1 1243 SER 1243 ? ? ? A .
A 1 1244 LYS 1244 ? ? ? A .
A 1 1245 ASN 1245 ? ? ? A .
A 1 1246 GLY 1246 ? ? ? A .
A 1 1247 SER 1247 ? ? ? A .
A 1 1248 PRO 1248 ? ? ? A .
A 1 1249 TYR 1249 ? ? ? A .
A 1 1250 GLY 1250 ? ? ? A .
A 1 1251 LEU 1251 ? ? ? A .
A 1 1252 GLN 1252 ? ? ? A .
A 1 1253 LEU 1253 ? ? ? A .
A 1 1254 ASN 1254 ? ? ? A .
A 1 1255 GLU 1255 ? ? ? A .
A 1 1256 ILE 1256 ? ? ? A .
A 1 1257 GLY 1257 ? ? ? A .
A 1 1258 LEU 1258 ? ? ? A .
A 1 1259 GLU 1259 ? ? ? A .
A 1 1260 LEU 1260 ? ? ? A .
A 1 1261 GLN 1261 ? ? ? A .
A 1 1262 MET 1262 ? ? ? A .
A 1 1263 GLY 1263 ? ? ? A .
A 1 1264 THR 1264 ? ? ? A .
A 1 1265 ARG 1265 ? ? ? A .
A 1 1266 GLN 1266 ? ? ? A .
A 1 1267 LYS 1267 ? ? ? A .
A 1 1268 GLU 1268 ? ? ? A .
A 1 1269 LEU 1269 ? ? ? A .
A 1 1270 LEU 1270 ? ? ? A .
A 1 1271 ASP 1271 ? ? ? A .
A 1 1272 ILE 1272 ? ? ? A .
A 1 1273 ASP 1273 ? ? ? A .
A 1 1274 SER 1274 ? ? ? A .
A 1 1275 SER 1275 ? ? ? A .
A 1 1276 SER 1276 ? ? ? A .
A 1 1277 VAL 1277 ? ? ? A .
A 1 1278 ILE 1278 ? ? ? A .
A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? A .
A 1 1280 GLU 1280 ? ? ? A .
A 1 1281 ASP 1281 ? ? ? A .
A 1 1282 GLY 1282 ? ? ? A .
A 1 1283 ILE 1283 ? ? ? A .
A 1 1284 THR 1284 ? ? ? A .
A 1 1285 LYS 1285 ? ? ? A .
A 1 1286 LEU 1286 ? ? ? A .
A 1 1287 ASN 1287 ? ? ? A .
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A 1 1289 ILE 1289 ? ? ? A .
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A 1 1293 GLU 1293 ? ? ? A .
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A 1 1300 ILE 1300 ? ? ? A .
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A 1 1408 ILE 1408 ? ? ? A .
A 1 1409 TRP 1409 ? ? ? A .
A 1 1410 LYS 1410 ? ? ? A .
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A 1 1522 THR 1522 ? ? ? A .
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A 1 1553 LEU 1553 ? ? ? A .
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A 1 1557 VAL 1557 ? ? ? A .
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A 1 1559 PHE 1559 ? ? ? A .
A 1 1560 ASP 1560 ? ? ? A .
A 1 1561 GLU 1561 ? ? ? A .
A 1 1562 LYS 1562 ? ? ? A .
A 1 1563 LYS 1563 ? ? ? A .
A 1 1564 LYS 1564 ? ? ? A .
A 1 1565 CYS 1565 ? ? ? A .
A 1 1566 LYS 1566 ? ? ? A .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Calcium release-activated calcium channel protein 1 {PDB ID=4hks, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4hks.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 4hks, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 7' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
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9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-12
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-06
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
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_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
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_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MSQSGEDLHSPTYLSWRKLQLSRAKLKASSWTSALLSGFAMVAMVEVQLDHDTNVPPGMLIAFAICTTLL
VAVHMLALMISTCILPNIETVSNLHSISLVHESPHERLHWYIETAWAFSTLLGLILFLLEIAILCWVKFY
DLSRRAAWSATVVLIPVMIIFMAFAIHFYRSLVSHKYEVTVSGIRELEMLKEQMEQDHLEHHNNIRNNGE
GEEF
;

;MSQSGEDLHSPTYLSWRKLQLSRAKLKASSWTSALLSGFAMVAMVEVQLDHDTNVPPGMLIAFAICTTLL
VAVHMLALMISTCILPNIETVSNLHSISLVHESPHERLHWYIETAWAFSTLLGLILFLLEIAILCWVKFY
DLSRRAAWSATVVLIPVMIIFMAFAIHFYRSLVSHKYEVTVSGIRELEMLKEQMEQDHLEHHNNIRNNGE
GEEF
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 162 189
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 4hks 2024-02-28
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1568
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1568 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
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_ma_alignment_details.alignment_id
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_ma_alignment_details.target_asym_id
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_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 66.000 14.286
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
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1 1 1
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2 1 2
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MAFAIHFYRSLVSHKYEVTVSGIRELEM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
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_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
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_ma_protocol_step.software_group_id
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_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
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'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4hks.1, oligomeric state (monomer) as predicted'
4 3 5
#
#
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_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 7' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
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_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
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_atom_site.type_symbol
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_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
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_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
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ATOM 4 O O . ILE 959 959 ? A 80.316 39.453 56.690 1 1 A ILE 0.180 1
ATOM 5 C CB . ILE 959 959 ? A 79.286 38.257 53.675 1 1 A ILE 0.180 1
ATOM 6 C CG1 . ILE 959 959 ? A 77.941 37.899 52.998 1 1 A ILE 0.180 1
ATOM 7 C CG2 . ILE 959 959 ? A 79.877 36.998 54.371 1 1 A ILE 0.180 1
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ATOM 13 C CB . PHE 960 960 ? A 83.529 41.330 54.633 1 1 A PHE 0.200 1
ATOM 14 C CG . PHE 960 960 ? A 84.867 41.697 55.193 1 1 A PHE 0.200 1
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ATOM 16 C CD2 . PHE 960 960 ? A 85.912 40.765 55.202 1 1 A PHE 0.200 1
ATOM 17 C CE1 . PHE 960 960 ? A 86.284 43.278 56.377 1 1 A PHE 0.200 1
ATOM 18 C CE2 . PHE 960 960 ? A 87.142 41.092 55.783 1 1 A PHE 0.200 1
ATOM 19 C CZ . PHE 960 960 ? A 87.330 42.349 56.369 1 1 A PHE 0.200 1
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ATOM 45 C CB . VAL 965 965 ? A 79.801 42.476 63.824 1 1 A VAL 0.360 1
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ATOM 87 C C . SER 970 970 ? A 83.279 35.306 71.196 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 88 O O . SER 970 970 ? A 83.330 34.553 72.162 1 1 A SER 0.700 1
ATOM 89 C CB . SER 970 970 ? A 82.351 34.348 69.095 1 1 A SER 0.700 1
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ATOM 107 O OE1 . GLU 972 972 ? A 86.837 42.526 74.559 1 1 A GLU 0.680 1
ATOM 108 O OE2 . GLU 972 972 ? A 84.720 43.108 74.052 1 1 A GLU 0.680 1
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#
#
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_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
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1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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1 1 2 0.528
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#
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1 1 A 959 ILE 1 0.180
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3 1 A 961 ALA 1 0.230
4 1 A 962 ALA 1 0.250
5 1 A 963 VAL 1 0.220
6 1 A 964 GLY 1 0.260
7 1 A 965 VAL 1 0.360
8 1 A 966 THR 1 0.450
9 1 A 967 ARG 1 0.390
10 1 A 968 HIS 1 0.450
11 1 A 969 LYS 1 0.370
12 1 A 970 SER 1 0.700
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#
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_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
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1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#