data_SMR-c5f3769e2822252d544d865eafb8a155_3 _entry.id SMR-c5f3769e2822252d544d865eafb8a155_3 _struct.entry_id SMR-c5f3769e2822252d544d865eafb8a155_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P28749/ RBL1_HUMAN, Retinoblastoma-like protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P28749' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 140230.559 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RBL1_HUMAN P28749 1 ;MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKS IIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYE PIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIF ANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFTASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFD RKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQAN VEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSV LLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEE QILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSG SLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQ TLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTK AQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNINDDFEMIDCDLE DATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHIKQQPGSPRRIS QQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQEN DDVLLKRLQDVVSERANH ; 'Retinoblastoma-like protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1068 1 1068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . RBL1_HUMAN P28749 . 1 1068 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-03-07 2BC4876EA04BDB31 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKS IIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYE PIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIF ANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFTASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFD RKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQAN VEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSV LLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEE QILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSG 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LLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEE QILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSG SLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQ TLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTK AQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNINDDFEMIDCDLE DATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHIKQQPGSPRRIS QQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQEN DDVLLKRLQDVVSERANH ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PHE . 1 3 GLU . 1 4 ASP . 1 5 LYS . 1 6 PRO . 1 7 HIS . 1 8 ALA . 1 9 GLU . 1 10 GLY . 1 11 ALA . 1 12 ALA . 1 13 VAL . 1 14 VAL . 1 15 ALA . 1 16 ALA . 1 17 ALA . 1 18 GLY . 1 19 GLU . 1 20 ALA . 1 21 LEU . 1 22 GLN . 1 23 ALA . 1 24 LEU . 1 25 CYS . 1 26 GLN . 1 27 GLU . 1 28 LEU . 1 29 ASN . 1 30 LEU . 1 31 ASP . 1 32 GLU . 1 33 GLY . 1 34 SER . 1 35 ALA . 1 36 ALA . 1 37 GLU . 1 38 ALA . 1 39 LEU . 1 40 ASP . 1 41 ASP . 1 42 PHE . 1 43 THR . 1 44 ALA . 1 45 ILE . 1 46 ARG . 1 47 GLY . 1 48 ASN . 1 49 TYR . 1 50 SER . 1 51 LEU . 1 52 GLU . 1 53 GLY . 1 54 GLU . 1 55 VAL . 1 56 THR . 1 57 HIS . 1 58 TRP . 1 59 LEU . 1 60 ALA . 1 61 CYS . 1 62 SER . 1 63 LEU . 1 64 TYR . 1 65 VAL . 1 66 ALA . 1 67 CYS . 1 68 ARG . 1 69 LYS . 1 70 SER . 1 71 ILE . 1 72 ILE . 1 73 PRO . 1 74 THR . 1 75 VAL . 1 76 GLY . 1 77 LYS . 1 78 GLY . 1 79 ILE . 1 80 MET . 1 81 GLU . 1 82 GLY . 1 83 ASN . 1 84 CYS . 1 85 VAL . 1 86 SER . 1 87 LEU . 1 88 THR . 1 89 ARG . 1 90 ILE . 1 91 LEU . 1 92 ARG . 1 93 SER . 1 94 ALA . 1 95 LYS . 1 96 LEU . 1 97 SER . 1 98 LEU . 1 99 ILE . 1 100 GLN . 1 101 PHE . 1 102 PHE . 1 103 SER . 1 104 LYS . 1 105 MET . 1 106 LYS . 1 107 LYS . 1 108 TRP . 1 109 MET . 1 110 ASP . 1 111 MET . 1 112 SER . 1 113 ASN . 1 114 LEU . 1 115 PRO . 1 116 GLN . 1 117 GLU . 1 118 PHE . 1 119 ARG . 1 120 GLU . 1 121 ARG . 1 122 ILE . 1 123 GLU . 1 124 ARG . 1 125 LEU . 1 126 GLU . 1 127 ARG . 1 128 ASN . 1 129 PHE . 1 130 GLU . 1 131 VAL . 1 132 SER . 1 133 THR . 1 134 VAL . 1 135 ILE . 1 136 PHE . 1 137 LYS . 1 138 LYS . 1 139 TYR . 1 140 GLU . 1 141 PRO . 1 142 ILE . 1 143 PHE . 1 144 LEU . 1 145 ASP . 1 146 ILE . 1 147 PHE . 1 148 GLN . 1 149 ASN . 1 150 PRO . 1 151 TYR . 1 152 GLU . 1 153 GLU . 1 154 PRO . 1 155 PRO . 1 156 LYS . 1 157 LEU . 1 158 PRO . 1 159 ARG . 1 160 SER . 1 161 ARG . 1 162 LYS . 1 163 GLN . 1 164 ARG . 1 165 ARG . 1 166 ILE . 1 167 PRO . 1 168 CYS . 1 169 SER . 1 170 VAL . 1 171 LYS . 1 172 ASP . 1 173 LEU . 1 174 PHE . 1 175 ASN . 1 176 PHE . 1 177 CYS . 1 178 TRP . 1 179 THR . 1 180 LEU . 1 181 PHE . 1 182 VAL . 1 183 TYR . 1 184 THR . 1 185 LYS . 1 186 GLY . 1 187 ASN . 1 188 PHE . 1 189 ARG . 1 190 MET . 1 191 ILE . 1 192 GLY . 1 193 ASP . 1 194 ASP . 1 195 LEU . 1 196 VAL . 1 197 ASN . 1 198 SER . 1 199 TYR . 1 200 HIS . 1 201 LEU 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A 1 1065 ARG 1065 ? ? ? D . A 1 1066 ALA 1066 ? ? ? D . A 1 1067 ASN 1067 ? ? ? D . A 1 1068 HIS 1068 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Retinoblastoma-like protein 1 {PDB ID=9c6b, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=9c6b.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 9c6b, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-18 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-13 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 4 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GHMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGT KLKIAPSS ; ;GHMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGT KLKIAPSS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 78 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 9c6b 2025-05-21 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1068 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 7.7e-40 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFTASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNINDDFEMIDCDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQENDDVLLKRLQDVVSERANH 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9c6b.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 3' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . HIS 619 619 ? A 157.861 159.882 127.635 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 2 C CA . HIS 619 619 ? A 156.461 159.783 127.067 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 3 C C . HIS 619 619 ? A 155.415 160.196 128.119 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 4 O O . HIS 619 619 ? A 155.681 159.861 129.276 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 5 C CB . HIS 619 619 ? A 156.227 158.309 126.626 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 6 C CG . HIS 619 619 ? A 154.933 158.086 125.931 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 7 N ND1 . HIS 619 619 ? A 154.672 158.877 124.843 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 8 C CD2 . HIS 619 619 ? A 153.911 157.221 126.154 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 9 C CE1 . HIS 619 619 ? A 153.489 158.483 124.410 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 10 N NE2 . HIS 619 619 ? A 152.981 157.484 125.174 1 1 D HIS 0.590 1 ATOM 11 N N . PRO 620 620 ? A 154.278 160.883 127.878 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 12 C CA . PRO 620 620 ? A 153.314 161.284 128.914 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 13 C C . PRO 620 620 ? A 152.727 160.151 129.730 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 14 O O . PRO 620 620 ? A 152.586 160.317 130.938 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 15 C CB . PRO 620 620 ? A 152.228 162.084 128.170 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 16 C CG . PRO 620 620 ? A 152.951 162.625 126.935 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 17 C CD . PRO 620 620 ? A 153.934 161.503 126.595 1 1 D PRO 0.630 1 ATOM 18 N N . ARG 621 621 ? A 152.411 158.982 129.139 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 19 C CA . ARG 621 621 ? A 151.860 157.857 129.881 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 20 C C . ARG 621 621 ? A 152.761 157.330 130.995 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 21 O O . ARG 621 621 ? A 152.286 156.941 132.053 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 22 C CB . ARG 621 621 ? A 151.423 156.687 128.962 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 23 C CG . ARG 621 621 ? A 150.144 156.966 128.134 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 24 C CD . ARG 621 621 ? A 148.891 157.318 128.956 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 25 N NE . ARG 621 621 ? A 148.722 156.225 129.964 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 26 C CZ . ARG 621 621 ? A 148.028 156.353 131.104 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 27 N NH1 . ARG 621 621 ? A 147.530 157.503 131.525 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 28 N NH2 . ARG 621 621 ? A 147.859 155.280 131.877 1 1 D ARG 0.660 1 ATOM 29 N N . VAL 622 622 ? A 154.093 157.314 130.789 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 30 C CA . VAL 622 622 ? A 155.061 156.851 131.777 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 31 C C . VAL 622 622 ? A 155.086 157.727 133.019 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 32 O O . VAL 622 622 ? A 155.121 157.247 134.148 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 33 C CB . VAL 622 622 ? A 156.471 156.843 131.202 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 34 C CG1 . VAL 622 622 ? A 157.463 156.244 132.223 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 35 C CG2 . VAL 622 622 ? A 156.498 156.017 129.905 1 1 D VAL 0.740 1 ATOM 36 N N . LYS 623 623 ? A 155.079 159.066 132.816 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 37 C CA . LYS 623 623 ? A 155.002 160.017 133.910 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 38 C C . LYS 623 623 ? A 153.655 159.974 134.624 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 39 O O . LYS 623 623 ? A 153.643 159.972 135.844 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 40 C CB . LYS 623 623 ? A 155.488 161.463 133.556 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 41 C CG . LYS 623 623 ? A 154.626 162.295 132.583 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 42 C CD . LYS 623 623 ? A 153.473 163.117 133.210 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 43 C CE . LYS 623 623 ? A 152.575 163.830 132.180 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 44 N NZ . LYS 623 623 ? A 151.436 164.500 132.856 1 1 D LYS 0.720 1 ATOM 45 N N . GLU 624 624 ? A 152.505 159.881 133.894 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 46 C CA . GLU 624 624 ? A 151.169 159.798 134.490 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 47 C C . GLU 624 624 ? A 151.020 158.566 135.360 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 48 O O . GLU 624 624 ? A 150.656 158.649 136.527 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 49 C CB . GLU 624 624 ? A 150.058 159.768 133.399 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 50 C CG . GLU 624 624 ? A 149.901 161.101 132.626 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 51 C CD . GLU 624 624 ? A 149.024 161.026 131.373 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 52 O OE1 . GLU 624 624 ? A 148.558 159.915 130.998 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 53 O OE2 . GLU 624 624 ? A 148.873 162.114 130.757 1 1 D GLU 0.730 1 ATOM 54 N N . VAL 625 625 ? A 151.417 157.382 134.847 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 55 C CA . VAL 625 625 ? A 151.372 156.143 135.614 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 56 C C . VAL 625 625 ? A 152.217 156.211 136.880 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 57 O O . VAL 625 625 ? A 151.795 155.788 137.951 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 58 C CB . VAL 625 625 ? A 151.809 154.947 134.766 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 59 C CG1 . VAL 625 625 ? A 152.005 153.669 135.611 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 60 C CG2 . VAL 625 625 ? A 150.730 154.687 133.700 1 1 D VAL 0.750 1 ATOM 61 N N . ARG 626 626 ? A 153.436 156.774 136.771 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 62 C CA . ARG 626 626 ? A 154.347 156.962 137.881 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 63 C C . ARG 626 626 ? A 153.863 157.927 138.965 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 64 O O . ARG 626 626 ? A 154.063 157.707 140.154 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 65 C CB . ARG 626 626 ? A 155.696 157.494 137.340 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 66 C CG . ARG 626 626 ? A 156.819 157.573 138.396 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 67 C CD . ARG 626 626 ? A 158.086 158.292 137.932 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 68 N NE . ARG 626 626 ? A 158.655 157.458 136.825 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 69 C CZ . ARG 626 626 ? A 159.657 157.840 136.024 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 70 N NH1 . ARG 626 626 ? A 160.243 159.023 136.177 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 71 N NH2 . ARG 626 626 ? A 160.090 157.028 135.061 1 1 D ARG 0.670 1 ATOM 72 N N . THR 627 627 ? A 153.261 159.068 138.564 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 73 C CA . THR 627 627 ? A 152.711 160.054 139.485 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 74 C C . THR 627 627 ? A 151.437 159.576 140.170 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 75 O O . THR 627 627 ? A 151.319 159.669 141.392 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 76 C CB . THR 627 627 ? A 152.485 161.436 138.859 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 77 O OG1 . THR 627 627 ? A 151.763 161.395 137.640 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 78 C CG2 . THR 627 627 ? A 153.843 162.066 138.515 1 1 D THR 0.730 1 ATOM 79 N N . ASP 628 628 ? A 150.487 158.993 139.401 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 80 C CA . ASP 628 628 ? A 149.249 158.402 139.895 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 81 C C . ASP 628 628 ? A 149.489 157.234 140.866 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 82 O O . ASP 628 628 ? A 148.831 157.118 141.899 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 83 C CB . ASP 628 628 ? A 148.341 157.922 138.720 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 84 C CG . ASP 628 628 ? A 147.786 159.061 137.863 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 85 O OD1 . ASP 628 628 ? A 147.609 160.190 138.390 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 86 O OD2 . ASP 628 628 ? A 147.468 158.776 136.676 1 1 D ASP 0.690 1 ATOM 87 N N . SER 629 629 ? A 150.469 156.341 140.571 1 1 D SER 0.690 1 ATOM 88 C CA . SER 629 629 ? A 150.828 155.215 141.440 1 1 D SER 0.690 1 ATOM 89 C C . SER 629 629 ? A 151.634 155.609 142.664 1 1 D SER 0.690 1 ATOM 90 O O . SER 629 629 ? A 151.607 154.925 143.689 1 1 D SER 0.690 1 ATOM 91 C CB . SER 629 629 ? A 151.562 154.044 140.715 1 1 D SER 0.690 1 ATOM 92 O OG . SER 629 629 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #