data_SMR-cf45b6662745a611c3940d70dacd8131_5
_entry.id SMR-cf45b6662745a611c3940d70dacd8131_5
_struct.entry_id SMR-cf45b6662745a611c3940d70dacd8131_5
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q9Y4C0/ NRX3A_HUMAN, Neurexin-3

Estimated model accuracy of this model is 0.012, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9Y4C0'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 210365.720 1 .
#
#
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_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP NRX3A_HUMAN Q9Y4C0 1
;MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDG
GVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPY
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;
Neurexin-3
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1643 1 1643
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
_ma_target_ref_db_details.is_primary
1 UNP . NRX3A_HUMAN Q9Y4C0 . 1 1643 9606 'Homo sapiens (Human)' 2009-03-03
E7360348E263C6EC .
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no G
;MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDG
GVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPY
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;

;MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDG
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 SER .
1 3 SER .
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1 17 LEU .
1 18 LEU .
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1 37 TRP .
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1 39 ARG .
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1 64 LEU .
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1 69 ASP .
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1 71 GLY .
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1 108 SER .
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A 1 10 PHE 10 ? ? ? G .
A 1 11 THR 11 ? ? ? G .
A 1 12 LEU 12 ? ? ? G .
A 1 13 LYS 13 ? ? ? G .
A 1 14 VAL 14 ? ? ? G .
A 1 15 SER 15 ? ? ? G .
A 1 16 ILE 16 ? ? ? G .
A 1 17 LEU 17 ? ? ? G .
A 1 18 LEU 18 ? ? ? G .
A 1 19 GLY 19 ? ? ? G .
A 1 20 SER 20 ? ? ? G .
A 1 21 LEU 21 ? ? ? G .
A 1 22 LEU 22 ? ? ? G .
A 1 23 GLY 23 ? ? ? G .
A 1 24 LEU 24 ? ? ? G .
A 1 25 CYS 25 ? ? ? G .
A 1 26 LEU 26 ? ? ? G .
A 1 27 GLY 27 ? ? ? G .
A 1 28 LEU 28 ? ? ? G .
A 1 29 GLU 29 ? ? ? G .
A 1 30 PHE 30 ? ? ? G .
A 1 31 MET 31 ? ? ? G .
A 1 32 GLY 32 ? ? ? G .
A 1 33 LEU 33 ? ? ? G .
A 1 34 PRO 34 ? ? ? G .
A 1 35 ASN 35 ? ? ? G .
A 1 36 GLN 36 ? ? ? G .
A 1 37 TRP 37 ? ? ? G .
A 1 38 ALA 38 ? ? ? G .
A 1 39 ARG 39 ? ? ? G .
A 1 40 TYR 40 ? ? ? G .
A 1 41 LEU 41 ? ? ? G .
A 1 42 ARG 42 ? ? ? G .
A 1 43 TRP 43 ? ? ? G .
A 1 44 ASP 44 ? ? ? G .
A 1 45 ALA 45 ? ? ? G .
A 1 46 SER 46 ? ? ? G .
A 1 47 THR 47 ? ? ? G .
A 1 48 ARG 48 ? ? ? G .
A 1 49 SER 49 ? ? ? G .
A 1 50 ASP 50 ? ? ? G .
A 1 51 LEU 51 ? ? ? G .
A 1 52 SER 52 ? ? ? G .
A 1 53 PHE 53 ? ? ? G .
A 1 54 GLN 54 ? ? ? G .
A 1 55 PHE 55 ? ? ? G .
A 1 56 LYS 56 ? ? ? G .
A 1 57 THR 57 ? ? ? G .
A 1 58 ASN 58 ? ? ? G .
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A 1 61 THR 61 ? ? ? G .
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A 1 64 LEU 64 ? ? ? G .
A 1 65 LEU 65 ? ? ? G .
A 1 66 TYR 66 ? ? ? G .
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A 1 69 ASP 69 ? ? ? G .
A 1 70 GLY 70 ? ? ? G .
A 1 71 GLY 71 ? ? ? G .
A 1 72 VAL 72 ? ? ? G .
A 1 73 CYS 73 ? ? ? G .
A 1 74 ASP 74 ? ? ? G .
A 1 75 PHE 75 ? ? ? G .
A 1 76 LEU 76 ? ? ? G .
A 1 77 CYS 77 ? ? ? G .
A 1 78 LEU 78 ? ? ? G .
A 1 79 SER 79 ? ? ? G .
A 1 80 LEU 80 ? ? ? G .
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A 1 82 ASP 82 ? ? ? G .
A 1 83 GLY 83 ? ? ? G .
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A 1 85 VAL 85 ? ? ? G .
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A 1 88 ARG 88 ? ? ? G .
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A 1 90 SER 90 ? ? ? G .
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A 1 100 SER 100 ? ? ? G .
A 1 101 ASN 101 ? ? ? G .
A 1 102 LYS 102 ? ? ? G .
A 1 103 GLN 103 ? ? ? G .
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A 1 139 PRO 139 ? ? ? G .
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A 1 191 SER 191 ? ? ? G .
A 1 192 ARG 192 ? ? ? G .
A 1 193 GLY 193 ? ? ? G .
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A 1 195 GLN 195 ? ? ? G .
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A 1 200 GLY 200 ? ? ? G .
A 1 201 PRO 201 ? ? ? G .
A 1 202 CYS 202 ? ? ? G .
A 1 203 GLY 203 ? ? ? G .
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A 1 206 PRO 206 ? ? ? G .
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A 1 277 GLN 277 ? ? ? G .
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A 1 279 SER 279 ? ? ? G .
A 1 280 SER 280 ? ? ? G .
A 1 281 ASP 281 ? ? ? G .
A 1 282 GLU 282 ? ? ? G .
A 1 283 ILE 283 ? ? ? G .
A 1 284 THR 284 ? ? ? G .
A 1 285 LEU 285 ? ? ? G .
A 1 286 SER 286 ? ? ? G .
A 1 287 PHE 287 ? ? ? G .
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A 1 290 TRP 290 ? ? ? G .
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A 1 293 ASN 293 ? ? ? G .
A 1 294 GLY 294 ? ? ? G .
A 1 295 LEU 295 ? ? ? G .
A 1 296 ILE 296 ? ? ? G .
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A 1 298 HIS 298 ? ? ? G .
A 1 299 THR 299 ? ? ? G .
A 1 300 GLY 300 ? ? ? G .
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A 1 858 GLU 858 ? ? ? G .
A 1 859 LEU 859 ? ? ? G .
A 1 860 LYS 860 ? ? ? G .
A 1 861 ALA 861 ? ? ? G .
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A 1 865 LEU 865 ? ? ? G .
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A 1 869 ILE 869 ? ? ? G .
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A 1 1253 ASN 1253 ? ? ? G .
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A 1 1550 GLY 1550 ? ? ? G .
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A 1 1553 ARG 1553 ? ? ? G .
A 1 1554 VAL 1554 ? ? ? G .
A 1 1555 PRO 1555 ? ? ? G .
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A 1 1560 VAL 1560 ? ? ? G .
A 1 1561 ILE 1561 ? ? ? G .
A 1 1562 ARG 1562 ? ? ? G .
A 1 1563 GLU 1563 ? ? ? G .
A 1 1564 SER 1564 ? ? ? G .
A 1 1565 SER 1565 ? ? ? G .
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A 1 1568 THR 1568 1568 THR THR G .
A 1 1569 GLY 1569 1569 GLY GLY G .
A 1 1570 MET 1570 1570 MET MET G .
A 1 1571 VAL 1571 1571 VAL VAL G .
A 1 1572 VAL 1572 1572 VAL VAL G .
A 1 1573 GLY 1573 1573 GLY GLY G .
A 1 1574 ILE 1574 1574 ILE ILE G .
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A 1 1576 ALA 1576 1576 ALA ALA G .
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A 1 1579 ALA 1579 1579 ALA ALA G .
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A 1 1581 CYS 1581 1581 CYS CYS G .
A 1 1582 ILE 1582 1582 ILE ILE G .
A 1 1583 LEU 1583 1583 LEU LEU G .
A 1 1584 ILE 1584 1584 ILE ILE G .
A 1 1585 LEU 1585 1585 LEU LEU G .
A 1 1586 LEU 1586 1586 LEU LEU G .
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A 1 1590 TYR 1590 1590 TYR TYR G .
A 1 1591 LYS 1591 1591 LYS LYS G .
A 1 1592 TYR 1592 1592 TYR TYR G .
A 1 1593 ARG 1593 1593 ARG ARG G .
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A 1 1595 ARG 1595 1595 ARG ARG G .
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A 1 1609 ILE 1609 ? ? ? G .
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A 1 1612 SER 1612 ? ? ? G .
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A 1 1623 LYS 1623 ? ? ? G .
A 1 1624 GLN 1624 ? ? ? G .
A 1 1625 GLN 1625 ? ? ? G .
A 1 1626 SER 1626 ? ? ? G .
A 1 1627 SER 1627 ? ? ? G .
A 1 1628 LYS 1628 ? ? ? G .
A 1 1629 SER 1629 ? ? ? G .
A 1 1630 GLY 1630 ? ? ? G .
A 1 1631 HIS 1631 ? ? ? G .
A 1 1632 LYS 1632 ? ? ? G .
A 1 1633 LYS 1633 ? ? ? G .
A 1 1634 GLN 1634 ? ? ? G .
A 1 1635 LYS 1635 ? ? ? G .
A 1 1636 ASN 1636 ? ? ? G .
A 1 1637 LYS 1637 ? ? ? G .
A 1 1638 ASP 1638 ? ? ? G .
A 1 1639 ARG 1639 ? ? ? G .
A 1 1640 GLU 1640 ? ? ? G .
A 1 1641 TYR 1641 ? ? ? G .
A 1 1642 TYR 1642 ? ? ? G .
A 1 1643 VAL 1643 ? ? ? G .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain {PDB ID=9cq4, label_asym_id=G, auth_asym_id=K, SMTL ID=9cq4.1.G}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 9cq4, label_asym_id=G'
'target-template alignment' .
4 'model 5' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-18
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-13
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 5 1 K
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGI
YRCNGTDIYKDKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRLSGAADTQ
ALLRNDQVYQPLRDRDDAQYSHLGGNWARNKGSG
;

;MEHSTFLSGLVLATLLSQVSPFKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGI
YRCNGTDIYKDKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRLSGAADTQ
ALLRNDQVYQPLRDRDDAQYSHLGGNWARNKGSG
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 99 133
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 9cq4 2025-01-15
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1643
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1643 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.500 17.143
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRTVLMLDGEGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGPCGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPGLSHLMMSEQAREENVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTTGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSITLPPTFRPLLTIIETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLPPTDDEDFYTTFSLVTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
2 1 2
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDPATVAGIIVTDVIATLLLALGVFCFAGHETGRL-------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 9cq4.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 'model 5' 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_ma_model_group.id
_ma_model_group.name
_ma_model_group.details
1 . .
#
#
loop_
_ma_model_group_link.group_id
_ma_model_group_link.model_id
1 1
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . SER 1566 1566 ? A 168.734 157.245 160.502 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 2 C CA . SER 1566 1566 ? A 169.782 156.637 161.407 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 3 C C . SER 1566 1566 ? A 171.060 157.416 161.201 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 4 O O . SER 1566 1566 ? A 171.331 157.799 160.067 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 5 C CB . SER 1566 1566 ? A 170.042 155.125 161.094 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 6 O OG . SER 1566 1566 ? A 170.981 154.565 162.012 1 1 G SER 0.430 1
ATOM 7 N N . THR 1567 1567 ? A 171.841 157.694 162.259 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 8 C CA . THR 1567 1567 ? A 173.061 158.494 162.193 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 9 C C . THR 1567 1567 ? A 174.202 157.574 162.456 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 10 O O . THR 1567 1567 ? A 174.133 156.753 163.366 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 11 C CB . THR 1567 1567 ? A 173.152 159.549 163.284 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 12 O OG1 . THR 1567 1567 ? A 172.084 160.460 163.131 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 13 C CG2 . THR 1567 1567 ? A 174.448 160.383 163.255 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 14 N N . THR 1568 1568 ? A 175.301 157.715 161.707 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 15 C CA . THR 1568 1568 ? A 176.463 156.842 161.656 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 16 C C . THR 1568 1568 ? A 177.286 156.805 162.941 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 17 O O . THR 1568 1568 ? A 178.101 155.922 163.139 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 18 C CB . THR 1568 1568 ? A 177.364 157.273 160.506 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 19 O OG1 . THR 1568 1568 ? A 177.654 158.663 160.583 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 20 C CG2 . THR 1568 1568 ? A 176.603 157.085 159.184 1 1 G THR 0.440 1
ATOM 21 N N . GLY 1569 1569 ? A 177.057 157.776 163.857 1 1 G GLY 0.500 1
ATOM 22 C CA . GLY 1569 1569 ? A 177.691 157.839 165.172 1 1 G GLY 0.500 1
ATOM 23 C C . GLY 1569 1569 ? A 176.749 157.682 166.346 1 1 G GLY 0.500 1
ATOM 24 O O . GLY 1569 1569 ? A 177.150 157.189 167.391 1 1 G GLY 0.500 1
ATOM 25 N N . MET 1570 1570 ? A 175.456 158.077 166.227 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 26 C CA . MET 1570 1570 ? A 174.541 158.057 167.370 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 27 C C . MET 1570 1570 ? A 174.147 156.660 167.804 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 28 O O . MET 1570 1570 ? A 174.291 156.297 168.963 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 29 C CB . MET 1570 1570 ? A 173.225 158.829 167.091 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 30 C CG . MET 1570 1570 ? A 173.427 160.344 166.909 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 31 S SD . MET 1570 1570 ? A 171.960 161.243 166.311 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 32 C CE . MET 1570 1570 ? A 170.902 161.009 167.767 1 1 G MET 0.510 1
ATOM 33 N N . VAL 1571 1571 ? A 173.687 155.813 166.854 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 34 C CA . VAL 1571 1571 ? A 173.327 154.426 167.128 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 35 C C . VAL 1571 1571 ? A 174.541 153.617 167.562 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 36 O O . VAL 1571 1571 ? A 174.476 152.844 168.504 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 37 C CB . VAL 1571 1571 ? A 172.562 153.759 165.974 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 38 C CG1 . VAL 1571 1571 ? A 173.366 153.774 164.661 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 39 C CG2 . VAL 1571 1571 ? A 172.135 152.319 166.335 1 1 G VAL 0.590 1
ATOM 40 N N . VAL 1572 1572 ? A 175.714 153.847 166.922 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 41 C CA . VAL 1572 1572 ? A 176.965 153.179 167.256 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 42 C C . VAL 1572 1572 ? A 177.398 153.463 168.687 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 43 O O . VAL 1572 1572 ? A 177.716 152.552 169.447 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 44 C CB . VAL 1572 1572 ? A 178.077 153.596 166.291 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 45 C CG1 . VAL 1572 1572 ? A 179.439 152.991 166.708 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 46 C CG2 . VAL 1572 1572 ? A 177.706 153.123 164.870 1 1 G VAL 0.620 1
ATOM 47 N N . GLY 1573 1573 ? A 177.356 154.749 169.112 1 1 G GLY 0.680 1
ATOM 48 C CA . GLY 1573 1573 ? A 177.690 155.134 170.478 1 1 G GLY 0.680 1
ATOM 49 C C . GLY 1573 1573 ? A 176.700 154.647 171.509 1 1 G GLY 0.680 1
ATOM 50 O O . GLY 1573 1573 ? A 177.091 154.279 172.615 1 1 G GLY 0.680 1
ATOM 51 N N . ILE 1574 1574 ? A 175.394 154.586 171.161 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 52 C CA . ILE 1574 1574 ? A 174.351 153.977 171.991 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 53 C C . ILE 1574 1574 ? A 174.577 152.492 172.212 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 54 O O . ILE 1574 1574 ? A 174.543 152.015 173.344 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 55 C CB . ILE 1574 1574 ? A 172.946 154.203 171.401 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 56 C CG1 . ILE 1574 1574 ? A 172.499 155.678 171.574 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 57 C CG2 . ILE 1574 1574 ? A 171.864 153.235 171.956 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 58 C CD1 . ILE 1574 1574 ? A 172.300 156.130 173.028 1 1 G ILE 0.620 1
ATOM 59 N N . VAL 1575 1575 ? A 174.863 151.719 171.140 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 60 C CA . VAL 1575 1575 ? A 175.142 150.292 171.238 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 61 C C . VAL 1575 1575 ? A 176.406 150.013 172.040 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 62 O O . VAL 1575 1575 ? A 176.424 149.148 172.914 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 63 C CB . VAL 1575 1575 ? A 175.227 149.640 169.858 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 64 C CG1 . VAL 1575 1575 ? A 175.658 148.158 169.954 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 65 C CG2 . VAL 1575 1575 ? A 173.835 149.715 169.196 1 1 G VAL 0.680 1
ATOM 66 N N . ALA 1576 1576 ? A 177.491 150.783 171.794 1 1 G ALA 0.720 1
ATOM 67 C CA . ALA 1576 1576 ? A 178.738 150.645 172.519 1 1 G ALA 0.720 1
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ATOM 197 O OH . TYR 1592 1592 ? A 173.252 142.231 198.701 1 1 G TYR 0.520 1
ATOM 198 N N . ARG 1593 1593 ? A 177.812 138.507 194.149 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 199 C CA . ARG 1593 1593 ? A 177.465 137.118 194.401 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 200 C C . ARG 1593 1593 ? A 178.635 136.243 194.831 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 201 O O . ARG 1593 1593 ? A 178.495 135.388 195.689 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 202 C CB . ARG 1593 1593 ? A 176.865 136.474 193.132 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 203 C CG . ARG 1593 1593 ? A 175.463 136.998 192.766 1 1 G ARG 0.440 1
ATOM 204 C CD . ARG 1593 1593 ? A 174.993 136.397 191.442 1 1 G ARG 0.440 1
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ATOM 206 C CZ . ARG 1593 1593 ? A 172.984 136.725 189.985 1 1 G ARG 0.440 1
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ATOM 209 N N . ASN 1594 1594 ? A 179.810 136.397 194.190 1 1 G ASN 0.390 1
ATOM 210 C CA . ASN 1594 1594 ? A 180.971 135.554 194.404 1 1 G ASN 0.390 1
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ATOM 215 O OD1 . ASN 1594 1594 ? A 180.996 133.096 192.274 1 1 G ASN 0.390 1
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ATOM 217 N N . ARG 1595 1595 ? A 181.655 137.411 195.894 1 1 G ARG 0.330 1
ATOM 218 C CA . ARG 1595 1595 ? A 182.525 138.085 196.821 1 1 G ARG 0.330 1
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ATOM 223 C CD . ARG 1595 1595 ? A 185.759 140.185 196.036 1 1 G ARG 0.330 1
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ATOM 228 O OXT . ARG 1595 1595 ? A 182.241 139.581 198.705 1 1 G ARG 0.330 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
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_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.589
2 1 3 0.012
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 1566 SER 1 0.430
2 1 A 1567 THR 1 0.440
3 1 A 1568 THR 1 0.440
4 1 A 1569 GLY 1 0.500
5 1 A 1570 MET 1 0.510
6 1 A 1571 VAL 1 0.590
7 1 A 1572 VAL 1 0.620
8 1 A 1573 GLY 1 0.680
9 1 A 1574 ILE 1 0.620
10 1 A 1575 VAL 1 0.680
11 1 A 1576 ALA 1 0.720
12 1 A 1577 ALA 1 0.740
13 1 A 1578 ALA 1 0.740
14 1 A 1579 ALA 1 0.750
15 1 A 1580 LEU 1 0.670
16 1 A 1581 CYS 1 0.690
17 1 A 1582 ILE 1 0.660
18 1 A 1583 LEU 1 0.660
19 1 A 1584 ILE 1 0.610
20 1 A 1585 LEU 1 0.610
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28 1 A 1593 ARG 1 0.440
29 1 A 1594 ASN 1 0.390
30 1 A 1595 ARG 1 0.330
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
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