data_SMR-c500693d89d1b6d2bda240a4e4fd5d28_7 _entry.id SMR-c500693d89d1b6d2bda240a4e4fd5d28_7 _struct.entry_id SMR-c500693d89d1b6d2bda240a4e4fd5d28_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P06935/ POLG_WNV, Genome polyprotein Estimated model accuracy of this model is 0.423, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P06935' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 442354.017 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP POLG_WNV P06935 1 ;MSKKPGGPGKNRAVNMLKRGMPRGLSLIGLKRAMLSLIDGKGPIRFVLALLAFFRFTAIAPTRAVLDRWR GVNKQTAMKHLLSFKKELGTLTSAINRRSTKQKKRGGTAGFTILLGLIACAGAVTLSNFQGKVMMTVNAT DVTDVITIPTAAGKNLCIVRAMDVGYLCEDTITYECPVLAAGNDPEDIDCWCTKSSVYVRYGRCTKTRHS RRSRRSLTVQTHGESTLANKKGAWLDSTKATRYLVKTESWILRNPGYALVAAVIGWMLGSNTMQRVVFAI LLLLVAPAYSFNCLGMSNRDFLEGVSGATWVDLVLEGDSCVTIMSKDKPTIDVKMMNMEAANLADVRSYC YLASVSDLSTRAACPTMGEAHNEKRADPAFVCKQGVVDRGWGNGCGLFGKGSIDTCAKFACTTKATGWII QKENIKYEVAIFVHGPTTVESHGKIGATQAGRFSITPSAPSYTLKLGEYGEVTVDCEPRSGIDTSAYYVM SVGEKSFLVHREWFMDLNLPWSSAGSTTWRNRETLMEFEEPHATKQSVVALGSQEGALHQALAGAIPVEF SSNTVKLTSGHLKCRVKMEKLQLKGTTYGVCSKAFKFARTPADTGHGTVVLELQYTGTDGPCKVPISSVA SLNDLTPVGRLVTVNPFVSVATANSKVLIELEPPFGDSYIVVGRGEQQINHHWHKSGSSIGKAFTTTLRG AQRLAALGDTAWDFGSVGGVFTSVGKAIHQVFGGAFRSLFGGMSWITQGLLGALLLWMGINARDRSIAMT FLAVGGVLLFLSVNVHADTGCAIDIGRQELRCGSGVFIHNDVEAWMDRYKFYPETPQGLAKIIQKAHAEG VCGLRSVSRLEHQMWEAIKDELNTLLKENGVDLSVVVEKQNGMYKAAPKRLAATTEKLEMGWKAWGKSII FAPELANNTFVIDGPETEECPTANRAWNSMEVEDFGFGLTSTRMFLRIRETNTTECDSKIIGTAVKNNMA VHSDLSYWIESGLNDTWKLERAVLGEVKSCTWPETHTLWGDGVLESDLIIPITLAGPRSNHNRRPGYKTQ NQGPWDEGRVEIDFDYCPGTTVTISDSCEHRGPAARTTTESGKLITDWCCRSCTLPPLRFQTENGCWYGM EIRPTRHDEKTLVQSRVNAYNADMIDPFQLGLMVVFLATQEVLRKRWTAKISIPAIMLALLVLVFGGITY TDVLRYVILVGAAFAEANSGGDVVHLALMATFKIQPVFLVASFLKARWTNQESILLMLAAAFFQMAYYDA KNVLSWEVPDVLNSLSVAWMILRAISFTNTSNVVVPLLALLTPGLKCLNLDVYRILLLMVGVGSLIKEKR SSAAKKKGACLICLALASTGVFNPMILAAGLMACDPNRKRGWPATEVMTAVGLMFAIVGGLAELDIDSMA IPMTIAGLMFAAFVISGKSTDMWIERTADITWESDAEITGSSERVDVRLDDDGNFQLMNDPGAPWKIWML RMACLAISAYTPWAILPSVIGFWITLQYTKRGGVLWDTPSPKEYKKGDTTTGVYRIMTRGLLGSYQAGAG VMVEGVFHTLWHTTKGAALMSGEGRLDPYWGSVKEDRLCYGGPWKLQHKWNGHDEVQMIVVEPGKNVKNV QTKPGVFKTPEGEIGAVTLDYPTGTSGSPIVDKNGDVIGLYGNGVIMPNGSYISAIVQGERMEEPAPAGF EPEMLRKKQITVLDLHPGAGKTRKILPQIIKEAINKRLRTAVLAPTRVVAAEMSEALRGLPIRYQTSAVH REHSGNEIVDVMCHATLTHRLMSPHRVPNYNLFIMDEAHFTDPASIAARGYIATKVELGEAAAIFMTATP PGTSDPFPESNAPISDMQTEIPDRAWNTGYEWITEYVGKTVWFVPSVKMGNEIALCLQRAGKKVIQLNRK SYETEYPKCKNDDWDFVITTDISEMGANFKASRVIDSRKSVKPTIIEEGDGRVILGEPSAITAASAAQRR GRIGRNPSQVGDEYCYGGHTNEDDSNFAHWTEARIMLDNINMPNGLVAQLYQPEREKVYTMDGEYRLRGE ERKNFLEFLRTADLPVWLAYKVAAAGISYHDRKWCFDGPRTNTILEDNNEVEVITKLGERKILRPRWADA RVYSDHQALKSFKDFASGKRSQIGLVEVLGRMPEHFMVKTWEALDTMYVVATAEKGGRAHRMALEELPDA LQTIVLIALLSVMSLGVFFLLMQRKGIGKIGLGGVILGAATFFCWMAEVPGTKIAGMLLLSLLLMIVLIP EPEKQRSQTDNQLAVFLICVLTLVGAVAANEMGWLDKTKNDIGSLLGHRPEARETTLGVESFLLDLRPAT AWSLYAVTTAVLTPLLKHLITSDYINTSLTSINVQASALFTLARGFPFVDVGVSALLLAVGCWGQVTLTV TVTAAALLFCHYAYMVPGWQAEAMRSAQRRTAAGIMKNVVVDGIVATDVPELERTTPVMQKKVGQIILIL VSMAAVVVNPSVRTVREAGILTTAAAVTLWENGASSVWNATTAIGLCHIMRGGWLSCLSIMWTLIKNMEK PGLKRGGAKGRTLGEVWKERLNHMTKEEFTRYRKEAITEVDRSAAKHARREGNITGGHPVSRGTAKLRWL VERRFLEPVGKVVDLGCGRGGWCYYMATQKRVQEVKGYTKGGPGHEEPQLVQSYGWNIVTMKSGVDVFYR PSEASDTLLCDIGESSSSAEVEEHRTVRVLEMVEDWLHRGPKEFCIKVLCPYMPKVIEKMETLQRRYGGG LIRNPLSRNSTHEMYWVSHASGNIVHSVNMTSQVLLGRMEKKTWKGPQFEEDVNLGSGTRAVGKPLLNSD TSKIKNRIERLKKEYSSTWHQDANHPYRTWNYHGSYEVKPTGSASSLVNGVVRLLSKPWDTITNVTTMAM TDTTPFGQQRVFKEKVDTKAPEPPEGVKYVLNETTNWLWAFLARDKKPRMCSREEFIGKVNSNAALGAMF EEQNQWKNAREAVEDPKFWEMVDEEREAHLRGECNTCIYNMMGKREKKPGEFGKAKGSRAIWFMWLGARF LEFEALGFLNEDHWLGRKNSGGGVEGLGLQKLGYILKEVGTKPGGKVYADDTAGWDTRITKADLENEAKV LELLDGEHRRLARSIIELTYRHKVVKVMRPAADGKTVMDVISREDQRGSGQVVTYALNTFTNLAVQLVRM MEGEGVIGPDDVEKLGKGKGPKVRTWLFENGEERLSRMAVSGDDCVVKPLDDRFATSLHFLNAMSKVRKD IQEWKPSTGWYDWQQVPFCSNHFTELIMKDGRTLVVPCRGQDELIGRARISPGAGWNVRDTACLAKSYAQ MWLLLYFHRRDLRLMANAICSAVPANWVPTGRTTWSIHAKGEWMTTEDMLAVWNRVWIEENEWMEDKTPV ERWSDVPYSGKREDIWCGSLIGTRTRATWAENIHVAINQVRSVIGEEKYVDYMSSLRRYEDTIVVEDTVL ; 'Genome polyprotein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3430 1 3430 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . 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_ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A H 4 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MKNPKKKSGGFRIVNMLKRGVARVSPFGGLKRLPAGLLLGHGPIRMVLAILAFLRFTAIKPSLGLINRWG SVGKKEAMEIIKKFKKDLAAMLRIINARKEKKRRGADTSVGIVGLLLTTAMAAEVTRRGSAYYMYLDRND AGEAISFPTTLGMNKCYIQIMDLGHMCDATMSYECPMLDEGVEPDDVDCWCNTTSTWVVYGTCHHKKGEA RRSRRAVTLPSHSTRKLQTRSQTWLESREYTKHLIRVENWIFRNPGFALAAAAIAWLLGSSTSQKVIYLV MILLIAPAYSIRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYC YEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSI QPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSD LYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALA GALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCK VPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKA FEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTK NGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSADVGCSVDFSKKETRCGTGVFVYNDVEAWRDRYKYHPDSPRRLAAAV KQAWEDGICGISSVSRMENIMWRSVEGELNAILEENGVQLTVVVGSVKNPMWRGPQRLPVPVNELPHGWK AWGKSYFVRAAKTNNSFVVDGDTLKECPLKHRAWNSFLVEDHGFGVFHTSVWLKVREDYSLECDPAVIGT AVKGKEAVHSDLGYWIESEKNDTWRLKRAHLIEMKTCEWPKSHTLWTDGIEESDLIIPKSLAGPLSHHNT REGYRTQMKGPWHSEELEIRFEECPGTKVHVEETCGTRGPSLRSTTASGRVIEEWCCRECTMPPLSFRAK DGCWYGMEIRPRKEPESNLVRSMVTAGSTDHMDHFSLGVLVILLMVQEGLKKRMTTKIIISTSMAVLVAM ILGGFSMSDLAKLAILMGATFAEMNTGGDVAHLALIAAFKVRPALLVSFIFRANWTPRESMLLALASCLL QTAISALEGDLMVLINGFALAWLAIRAMVVPRTDNITLAILAALTPLARGTLLVAWRAGLATCGGFMLLS LKGKGSVKKNLPFVMALGLTAVRLVDPINVVGLLLLTRSGKRSWPPSEVLTAVGLICALAGGFAKADIEM AGPMAAVGLLIVSYVVSGKSVDMYIERAGDITWEKDAEVTGNSPRLDVALDESGDFSLVEDDGPPMREII LKVVLMTICGMNPIAIPFAAGAWYVYVKTGKRSGALWDVPAPKEVKKGETTDGVYRVMTRRLLGSTQVGV GVMQEGVFHTMWHVTKGSALRSGEGRLDPYWGDVKQDLVSYCGPWKLDAAWDGHSEVQLLAVPPGERARN IQTLPGIFKTKDGDIGAVALDYPAGTSGSPILDKCGRVIGLYGNGVVIKNGSYVSAITQGRREEETPVEC FEPSMLKKKQLTVLDLHPGAGKTRRVLPEIVREAIKTRLRTVILAPTRVVAAEMEEALRGLPVRYMTTAV NVTHSGTEIVDLMCHATFTSRLLQPIRVPNYNLYIMDEAHFTDPSSIAARGYISTRVEMGEAAAIFMTAT PPGTRDAFPDSNSPIMDTEVEVPERAWSSGFDWVTDHSGKTVWFVPSVRNGNEIAACLTKAGKRVIQLSR KTFETEFQKTKHQEWDFVVTTDISEMGANFKADRVIDSRRCLKPVILDGERVILAGPMPVTHASAAQRRG RIGRNPNKPGDEYLYGGGCAETDEDHAHWLEARMLLDNIYLQDGLIASLYRPEADKVAAIEGEFKLRTEQ RKTFVELMKRGDLPVWLAYQVASAGITYTDRRWCFDGTTNNTIMEDSVPAEVWTRHGEKRVLKPRWMDAR VCSDHAALKSFKEFAAGKRGAAFGVMEALGTLPGHMTERFQEAIDNLAVLMRAETGSRPYKAAAAQLPET LETIMLLGLLGTVSLGIFFVLMRNKGIGKMGFGMVTLGASAWLMWLSEIEPARIACVLIVVFLLLVVLIP EPEKQRSPQDNQMAIIIMVAVGLLGLITANELGWLERTKSDLSHLMGRREEGATIGFSMDIDLRPASAWA IYAALTTFITPAVQHAVTTSYNNYSLMAMATQAGVLFGMGKGMPFYAWDFGVPLLMMGCYSQLTPLTLIV AIILLVAHYMYLIPGLQAAAARAAQKRTAAGIMKNPVVDGIVVTDIDTMTIDPQVEKKMGQVLLIAVAVS SAILSRTAWGWGEAGALITAATSTLWEGSPNKYWNSSTATSLCNIFRGSYLAGASLIYTVTRNAGLVKRR 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SVGKKEAMEIIKKFKKDLAAMLRIINARKEKKRRGADTSVGIVGLLLTTAMAAEVTRRGSAYYMYLDRND AGEAISFPTTLGMNKCYIQIMDLGHMCDATMSYECPMLDEGVEPDDVDCWCNTTSTWVVYGTCHHKKGEA RRSRRAVTLPSHSTRKLQTRSQTWLESREYTKHLIRVENWIFRNPGFALAAAAIAWLLGSSTSQKVIYLV MILLIAPAYSIRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYC YEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSI QPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSD LYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALA GALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCK VPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKA FEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTK NGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSADVGCSVDFSKKETRCGTGVFVYNDVEAWRDRYKYHPDSPRRLAAAV KQAWEDGICGISSVSRMENIMWRSVEGELNAILEENGVQLTVVVGSVKNPMWRGPQRLPVPVNELPHGWK AWGKSYFVRAAKTNNSFVVDGDTLKECPLKHRAWNSFLVEDHGFGVFHTSVWLKVREDYSLECDPAVIGT AVKGKEAVHSDLGYWIESEKNDTWRLKRAHLIEMKTCEWPKSHTLWTDGIEESDLIIPKSLAGPLSHHNT 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GFLNEDHWMGRENSGGGVEGLGLQRLGYVLEEMSRIPGGRMYADDTAGWDTRISRFDLENEALITNQMEK GHRALALAIIKYTYQNKVVKVLRPAEKGKTVMDIISRQDQRGSGQVVTYALNTFTNLVVQLIRNMEAEEV LEMQDLWLLRRSEKVTNWLQSNGWDRLKRMAVSGDDCVVKPIDDRFAHALRFLNDMGKVRKDTQEWKPST GWDNWEEVPFCSHHFNKLHLKDGRSIVVPCRHQDELIGRARVSPGAGWSIRETACLAKSYAQMWQLLYFH RRDLRLMANAICSSVPVDWVPTGRTTWSIHGKGEWMTTEDMLVVWNRVWIEENDHMEDKTLVTKWTDIPY LGKREDLWCGSLIGHRPRTTWAENIKNTVNMVRRIIGDEEKYMDYLSTQVRYLGEEGSTPGVL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 3423 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8cxg 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3430 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3444 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0 56.527 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSKKPGGPGKNRAVNMLKRGMPRGLSLIGLKRAMLSLIDGKGPIRFVLALLAFFRFTAIAPTRAVLDRWRGVNKQTAMKHLLSFKKELGTLTSAINRRSTKQKKRGGTAGFTILLGLIACAGAVTLSNFQGKVMMTVNATDVTDVITIPTAAGKNLCIVRAMDVGYLCEDTITYECPVLAAGNDPEDIDCWCTKSSVYVRYGRCTKT-RHSRRSRRSLTVQTHGESTLANKKGAWLDSTKATRYLVKTESWILRNPGYALVAAVIGWMLGSNTMQRVVFAILLLLVAPAYSFNCLGMSNRDFLEGVSGATWVDLVLEGDSCVTIMSKDKPTIDVKMMNMEAANLADVRSYCYLASVSDLSTRAACPTMGEAHNEKRADPAFVCKQGVVDRGWGNGCGLFGKGSIDTCAKFACTTKATGWIIQKENIKYEVAIFVHGPTTVESHG----KIGATQAGRFSITPSAPSYTLKLGEYGEVTVDCEPRSGIDTSAYYVMSVGEKSFLVHREWFMDLNLPWSSAG---STTWRNRETLMEFEEPHATKQSVVALGSQEGALHQALAGAIPVEFSSNTVKLTSGHLKCRVKMEKLQLKGTTYGVCSKAFKFARTPADTGHGTVVLELQYTGTDGPCKVPISSVASLNDLTPVGRLVTVNPFVSVATANSKVLIELEPPFGDSYIVVGRGEQQINHHWHKSGSSIGKAFTTTLRGAQRLAALGDTAWDFGSVGGVFTSVGKAIHQVFGGAFRSLFGGMSWITQGLLGALLLWMGINARDRSIAMTFLAVGGVLLFLSVNVHADTGCAIDIGRQELRCGSGVFIHNDVEAWMDRYKFYPETPQGLAKIIQKAHAEGVCGLRSVSRLEHQMWEAIKDELNTLLKENGVDLSVVVEKQNGMYKAAPKRLAATTEKLEMGWKAWGKSIIFAPELANNTFVIDGPETEECPTANRAWNSMEVEDFGFGLTSTRMFLRIRETNTTECDSKIIGTAVKNNMAVHSDLSYWIESGLNDTWKLERAVLGEVKSCTWPETHTLWGDGVLESDLIIPITLAGPRSNHNRRPGYKTQNQGPWDEGRVEIDFDYCPGTTVTISDSCEHRGPAARTTTESGKLITDWCCRSCTLPPLRFQTENGCWYGMEIRPTRHDEKTLVQSRVNAYNADMIDPFQLGLMVVFLATQEVLRKRWTAKISIPAIMLALLVLVFGGITYTDVLRYVILVGAAFAEANSGGDVVHLALMATFKIQPVFLVASFLKARWTNQESILLMLAAAFFQMAYYDAKNVLSWEVPDVLNSLSVAWMILRAISFTNTSNVVVPLLALLTPGLKCLNLDVYRILLLMVGVGSLIKEKRSSAAKKKGACLICLALASTGVFNPMILAAGLMACDPNRKRGWPATEVMTAVGLMFAIVGGLAELDIDSMAIPMTIAGLMFAAFVISGKSTDMWIERTADITWESDAEITGSSERVDVRLDDDGNFQLMNDPGAPWKIWMLRMACLAISAYTPWAILPSVIGFWITLQYTKRGGVLWDTPSPKEYKKGDTTTGVYRIMTRGLLGSYQAGAGVMVEGVFHTLWHTTKGAALMSGEGRLDPYWGSVKEDRLCYGGPWKLQHKWNGHDEVQMIVVEPGKNVKNVQTKPGVFKTPEGEIGAVTLDYPTGTSGSPIVDKNGDVIGLYGNGVIMPNGSYISAIVQGERME-EPAPAGFEPEMLRKKQITVLDLHPGAGKTRKILPQIIKEAINKRLRTAVLAPTRVVAAEMSEALRGLPIRYQTSAVHREHSGNEIVDVMCHATLTHRLMSPHRVPNYNLFIMDEAHFTDPASIAARGYIATKVELGEAAAIFMTATPPGTSDPFPESNAPISDMQTEIPDRAWNTGYEWITEYVGKTVWFVPSVKMGNEIALCLQRAGKKVIQLNRKSYETEYPKCKNDDWDFVITTDISEMGANFKASRVIDSRKSVKPTIIEEGDGRVILGEPSAITAASAAQRRGRIGRNPSQVGDEYCYGGHTNE---DDSNFAHWTEARIMLDNINMPNGLVAQLYQPEREKVYTMDGEYRLRGEERKNFLEFLRTADLPVWLAYKVAAAGISYHDRKWCFDGPRTNTILEDNNEVEVITKLGERKILRPRWADARVYSDHQALKSFKDFASGKRSQ-IGLVEVLGRMPEHFMVKTWEALDTMYVVATAEKGGRAHRMALEELPDALQTIVLIALLSVMSLGVFFLLMQRKGIGKIGLGGVILGAATFFCWMAEVPGTKIAGMLLLSLLLMIVLIPEPEKQRSQTDNQLAVFLICVLTLVGAVAANEMGWLDKTKNDIGSLLGHRPEARETTLGVESFLLDLRPATAWSLYAVTTAVLTPLLKHLITSDYINTSLTSINVQASALFTLARGFPFVDVGVSALLLAVGCWGQVTLTVTVTAAALLFCHYAYMVPGWQAEAMRSAQRRTAAGIMKNVVVDGIVATDVPELERTTPVMQKKVGQIILILVSMAAVVVNPSVRTVREAGILTTAAAVTLWENGASSVWNATTAIGLCHIMRGGWLSCLSIMWTLIKNMEKPGLKRGGAKGRTLGEVWKERLNHMTKEEFTRYRKEAITEVDRSAAKHARREGNITGGHPVSRGTAKLRWLVERRFLEPVGKVVDLGCGRGGWCYYMATQKRVQEVKGYTKGGPGHEEPQLVQSYGWNIVTMKSGVDVFYRPSEASDTLLCDIGESSSSAEVEEHRTVRVLEMVEDWLHRGPKEFCIKVLCPYMPKVIEKMETLQRRYGGGLIRNPLSRNSTHEMYWVSHASGNIVHSVNMTSQVLLGRMEKKTWKGPQFEEDVNLGSGTRAVGKPLLNSDTSKIKNRIERLKKEYSSTWHQDANHPYRTWNYHGSYEVKPTGSASSLVNGVVRLLSKPWDTITNVTTMAMTDTTPFGQQRVFKEKVDTKAPEPPEGVKYVLNETTNWLWAFLARDKKPRMCSREEFIGKVNSNAALGAMFEEQNQWKNAREAVEDPKFWEMVDEEREAHLRGECNTCIYNMMGKREKKPGEFGKAKGSRAIWFMWLGARFLEFEALGFLNEDHWLGRKNSGGGVEGLGLQKLGYILKEVGTKPGGKVYADDTAGWDTRITKADLENEAKVLELLDGEHRRLARSIIELTYRHKVVKVMRPAADGKTVMDVISREDQRGSGQVVTYALNTFTNLAVQLVRMMEGEGVIGPDDVEKLGKGKGPKVRTWLFENGEERLSRMAVSGDDCVVKPLDDRFATSLHFLNAMSKVRKDIQEWKPSTGWYDWQQVPFCSNHFTELIMKDGRTLVVPCRGQDELIGRARISPGAGWNVRDTACLAKSYAQMWLLLYFHRRDLRLMANAICSAVPANWVPTGRTTWSIHAKGEWMTTEDMLAVWNRVWIEENEWMEDKTPVERWSDVPYSGKREDIWCGSLIGTRTRATWAENIHVAINQVRSVIGE-EKYVDYMSSLRRYEDTIVVEDTVL 2 1 2 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_atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.586 2 1 3 0.423 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 216 SER 1 0.150 2 1 A 217 LEU 1 0.160 3 1 A 218 THR 1 0.170 4 1 A 219 VAL 1 0.210 5 1 A 220 GLN 1 0.370 6 1 A 221 THR 1 0.460 7 1 A 222 HIS 1 0.520 8 1 A 223 GLY 1 0.560 9 1 A 224 GLU 1 0.390 10 1 A 225 SER 1 0.440 11 1 A 226 THR 1 0.380 12 1 A 227 LEU 1 0.370 13 1 A 228 ALA 1 0.360 14 1 A 229 ASN 1 0.410 15 1 A 230 LYS 1 0.390 16 1 A 231 LYS 1 0.420 17 1 A 232 GLY 1 0.470 18 1 A 233 ALA 1 0.500 19 1 A 234 TRP 1 0.440 20 1 A 235 LEU 1 0.570 21 1 A 236 ASP 1 0.540 22 1 A 237 SER 1 0.590 23 1 A 238 THR 1 0.570 24 1 A 239 LYS 1 0.530 25 1 A 240 ALA 1 0.550 26 1 A 241 THR 1 0.600 27 1 A 242 ARG 1 0.530 28 1 A 243 TYR 1 0.580 29 1 A 244 LEU 1 0.620 30 1 A 245 VAL 1 0.670 31 1 A 246 LYS 1 0.630 32 1 A 247 THR 1 0.690 33 1 A 248 GLU 1 0.630 34 1 A 249 SER 1 0.750 35 1 A 250 TRP 1 0.640 36 1 A 251 ILE 1 0.730 37 1 A 252 LEU 1 0.680 38 1 A 253 ARG 1 0.660 39 1 A 254 ASN 1 0.710 40 1 A 255 PRO 1 0.700 41 1 A 256 GLY 1 0.720 42 1 A 257 TYR 1 0.700 43 1 A 258 ALA 1 0.680 44 1 A 259 LEU 1 0.670 45 1 A 260 VAL 1 0.730 46 1 A 261 ALA 1 0.690 47 1 A 262 ALA 1 0.690 48 1 A 263 VAL 1 0.720 49 1 A 264 ILE 1 0.700 50 1 A 265 GLY 1 0.720 51 1 A 266 TRP 1 0.650 52 1 A 267 MET 1 0.680 53 1 A 268 LEU 1 0.670 54 1 A 269 GLY 1 0.620 55 1 A 270 SER 1 0.630 56 1 A 271 ASN 1 0.670 57 1 A 272 THR 1 0.650 58 1 A 273 MET 1 0.660 59 1 A 274 GLN 1 0.700 60 1 A 275 ARG 1 0.650 61 1 A 276 VAL 1 0.700 62 1 A 277 VAL 1 0.730 63 1 A 278 PHE 1 0.680 64 1 A 279 ALA 1 0.710 65 1 A 280 ILE 1 0.690 66 1 A 281 LEU 1 0.680 67 1 A 282 LEU 1 0.690 68 1 A 283 LEU 1 0.700 69 1 A 284 LEU 1 0.680 70 1 A 285 VAL 1 0.710 71 1 A 286 ALA 1 0.710 72 1 A 287 PRO 1 0.710 73 1 A 288 ALA 1 0.670 74 1 A 289 TYR 1 0.550 75 1 A 290 SER 1 0.420 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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