data_SMR-f32efb455ce9dbf45fb3d8a60bd2bbcf_4 _entry.id SMR-f32efb455ce9dbf45fb3d8a60bd2bbcf_4 _struct.entry_id SMR-f32efb455ce9dbf45fb3d8a60bd2bbcf_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q96PV7/ F193B_HUMAN, Protein FAM193B Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q96PV7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 112912.420 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP F193B_HUMAN Q96PV7 1 ;MTRRRSRPSGGAGRRERARAAGPQKPQAPEPPPPPSLEAGAGAGPPEAPAEPDHDGPREDDEPNLVPGPQ VPPASSQPVQTCCLLCHRERKGWEEGPSQNGLVLQGEKLPPDFMPKLVKNLLGEMPLWVCQSCRKSMEED ERQTGREHAVAISLSHTSCKSQSCGDDSHSSSSSSSSSSSSSSSSCPGNSGDWDPSSFLSAHKLSGLWNS PHSSGAMPGSSLGSPPTIPGEAFPVSEHHQHSDLTAPPNSPTGHHPQPASLIPSHPSSFGSPPHPHLLPT TPAAPFPAQASECPVAAATAPHTPGPCQSSHLPSTSMPLLKMPPPFSGCSHPCSGHCGGHCSGPLLPPPS SQPLPSTHRDPGCKGHKFAHSGLACQLPQPCEADEGLGEEEDSSSERSSCTSSSTHQRDGKFCDCCYCEF FGHNAPPAAPTSRNYTEIREKLRSRLTRRKEELPMKGGTLGGIPGEPAVDHRDVDELLEFINSTEPKVPN SARAAKRARHKLKKKEKEKAQLAAEALKQANRVSGSREPRPARERLLEWPDRELDRVNSFLSSRLQEIKN TVKDSIRASFSVCELSMDSNGFSKEGAAEPEPQSLPPSNLSGSSEQQPDINLDLSPLTLGSPQNHTLQAP GEPAPPWAEMRGPHPPWTEVRGPPPGIVPENGLVRRLNTVPNLSRVIWVKTPKPGYPSSEEPSSKEVPSC KQELPEPVSSGGKPQKGKRQGSQAKKSEASPAPRPPASLEVPSAKGQVAGPKQPGRVLELPKVGSCAEAG EGSRGSRPGPGWAGSPKTEKEKGSSWRNWPGEAKARPQEQESVQPSGPARPQSLPQGKGRSRRSRNKQEK PASSLDDVFLPKDMDGVEMDETDREVEYFKRFCLDSAKQTRQKVAVNWTNFSLKKTTPSTAQ ; 'Protein FAM193B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 902 1 902 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . F193B_HUMAN Q96PV7 . 1 902 9606 'Homo sapiens (Human)' 2013-06-26 584AF8E0C8F8DF74 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no 9 ;MTRRRSRPSGGAGRRERARAAGPQKPQAPEPPPPPSLEAGAGAGPPEAPAEPDHDGPREDDEPNLVPGPQ VPPASSQPVQTCCLLCHRERKGWEEGPSQNGLVLQGEKLPPDFMPKLVKNLLGEMPLWVCQSCRKSMEED ERQTGREHAVAISLSHTSCKSQSCGDDSHSSSSSSSSSSSSSSSSCPGNSGDWDPSSFLSAHKLSGLWNS PHSSGAMPGSSLGSPPTIPGEAFPVSEHHQHSDLTAPPNSPTGHHPQPASLIPSHPSSFGSPPHPHLLPT TPAAPFPAQASECPVAAATAPHTPGPCQSSHLPSTSMPLLKMPPPFSGCSHPCSGHCGGHCSGPLLPPPS SQPLPSTHRDPGCKGHKFAHSGLACQLPQPCEADEGLGEEEDSSSERSSCTSSSTHQRDGKFCDCCYCEF FGHNAPPAAPTSRNYTEIREKLRSRLTRRKEELPMKGGTLGGIPGEPAVDHRDVDELLEFINSTEPKVPN SARAAKRARHKLKKKEKEKAQLAAEALKQANRVSGSREPRPARERLLEWPDRELDRVNSFLSSRLQEIKN TVKDSIRASFSVCELSMDSNGFSKEGAAEPEPQSLPPSNLSGSSEQQPDINLDLSPLTLGSPQNHTLQAP GEPAPPWAEMRGPHPPWTEVRGPPPGIVPENGLVRRLNTVPNLSRVIWVKTPKPGYPSSEEPSSKEVPSC KQELPEPVSSGGKPQKGKRQGSQAKKSEASPAPRPPASLEVPSAKGQVAGPKQPGRVLELPKVGSCAEAG EGSRGSRPGPGWAGSPKTEKEKGSSWRNWPGEAKARPQEQESVQPSGPARPQSLPQGKGRSRRSRNKQEK PASSLDDVFLPKDMDGVEMDETDREVEYFKRFCLDSAKQTRQKVAVNWTNFSLKKTTPSTAQ ; ;MTRRRSRPSGGAGRRERARAAGPQKPQAPEPPPPPSLEAGAGAGPPEAPAEPDHDGPREDDEPNLVPGPQ VPPASSQPVQTCCLLCHRERKGWEEGPSQNGLVLQGEKLPPDFMPKLVKNLLGEMPLWVCQSCRKSMEED ERQTGREHAVAISLSHTSCKSQSCGDDSHSSSSSSSSSSSSSSSSCPGNSGDWDPSSFLSAHKLSGLWNS PHSSGAMPGSSLGSPPTIPGEAFPVSEHHQHSDLTAPPNSPTGHHPQPASLIPSHPSSFGSPPHPHLLPT TPAAPFPAQASECPVAAATAPHTPGPCQSSHLPSTSMPLLKMPPPFSGCSHPCSGHCGGHCSGPLLPPPS SQPLPSTHRDPGCKGHKFAHSGLACQLPQPCEADEGLGEEEDSSSERSSCTSSSTHQRDGKFCDCCYCEF FGHNAPPAAPTSRNYTEIREKLRSRLTRRKEELPMKGGTLGGIPGEPAVDHRDVDELLEFINSTEPKVPN SARAAKRARHKLKKKEKEKAQLAAEALKQANRVSGSREPRPARERLLEWPDRELDRVNSFLSSRLQEIKN TVKDSIRASFSVCELSMDSNGFSKEGAAEPEPQSLPPSNLSGSSEQQPDINLDLSPLTLGSPQNHTLQAP GEPAPPWAEMRGPHPPWTEVRGPPPGIVPENGLVRRLNTVPNLSRVIWVKTPKPGYPSSEEPSSKEVPSC KQELPEPVSSGGKPQKGKRQGSQAKKSEASPAPRPPASLEVPSAKGQVAGPKQPGRVLELPKVGSCAEAG EGSRGSRPGPGWAGSPKTEKEKGSSWRNWPGEAKARPQEQESVQPSGPARPQSLPQGKGRSRRSRNKQEK PASSLDDVFLPKDMDGVEMDETDREVEYFKRFCLDSAKQTRQKVAVNWTNFSLKKTTPSTAQ ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 THR . 1 3 ARG . 1 4 ARG . 1 5 ARG . 1 6 SER . 1 7 ARG . 1 8 PRO . 1 9 SER . 1 10 GLY . 1 11 GLY . 1 12 ALA . 1 13 GLY . 1 14 ARG . 1 15 ARG . 1 16 GLU . 1 17 ARG . 1 18 ALA . 1 19 ARG . 1 20 ALA . 1 21 ALA . 1 22 GLY . 1 23 PRO . 1 24 GLN . 1 25 LYS . 1 26 PRO . 1 27 GLN . 1 28 ALA . 1 29 PRO . 1 30 GLU . 1 31 PRO . 1 32 PRO . 1 33 PRO . 1 34 PRO . 1 35 PRO . 1 36 SER . 1 37 LEU . 1 38 GLU . 1 39 ALA . 1 40 GLY . 1 41 ALA . 1 42 GLY . 1 43 ALA . 1 44 GLY . 1 45 PRO . 1 46 PRO . 1 47 GLU . 1 48 ALA . 1 49 PRO . 1 50 ALA . 1 51 GLU . 1 52 PRO . 1 53 ASP . 1 54 HIS . 1 55 ASP . 1 56 GLY . 1 57 PRO . 1 58 ARG . 1 59 GLU . 1 60 ASP . 1 61 ASP . 1 62 GLU . 1 63 PRO . 1 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VAL . 1 151 ALA . 1 152 ILE . 1 153 SER . 1 154 LEU . 1 155 SER . 1 156 HIS . 1 157 THR . 1 158 SER . 1 159 CYS . 1 160 LYS . 1 161 SER . 1 162 GLN . 1 163 SER . 1 164 CYS . 1 165 GLY . 1 166 ASP . 1 167 ASP . 1 168 SER . 1 169 HIS . 1 170 SER . 1 171 SER . 1 172 SER . 1 173 SER . 1 174 SER . 1 175 SER . 1 176 SER . 1 177 SER . 1 178 SER . 1 179 SER . 1 180 SER . 1 181 SER . 1 182 SER . 1 183 SER . 1 184 SER . 1 185 SER . 1 186 CYS . 1 187 PRO . 1 188 GLY . 1 189 ASN . 1 190 SER . 1 191 GLY . 1 192 ASP . 1 193 TRP . 1 194 ASP . 1 195 PRO . 1 196 SER . 1 197 SER . 1 198 PHE . 1 199 LEU . 1 200 SER . 1 201 ALA . 1 202 HIS . 1 203 LYS . 1 204 LEU . 1 205 SER . 1 206 GLY . 1 207 LEU . 1 208 TRP . 1 209 ASN . 1 210 SER . 1 211 PRO . 1 212 HIS . 1 213 SER . 1 214 SER . 1 215 GLY . 1 216 ALA . 1 217 MET . 1 218 PRO . 1 219 GLY . 1 220 SER . 1 221 SER . 1 222 LEU . 1 223 GLY . 1 224 SER . 1 225 PRO . 1 226 PRO . 1 227 THR . 1 228 ILE . 1 229 PRO . 1 230 GLY . 1 231 GLU . 1 232 ALA . 1 233 PHE 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A 1 799 TRP 799 ? ? ? 9 . A 1 800 PRO 800 ? ? ? 9 . A 1 801 GLY 801 ? ? ? 9 . A 1 802 GLU 802 ? ? ? 9 . A 1 803 ALA 803 ? ? ? 9 . A 1 804 LYS 804 ? ? ? 9 . A 1 805 ALA 805 ? ? ? 9 . A 1 806 ARG 806 ? ? ? 9 . A 1 807 PRO 807 ? ? ? 9 . A 1 808 GLN 808 ? ? ? 9 . A 1 809 GLU 809 ? ? ? 9 . A 1 810 GLN 810 ? ? ? 9 . A 1 811 GLU 811 ? ? ? 9 . A 1 812 SER 812 ? ? ? 9 . A 1 813 VAL 813 ? ? ? 9 . A 1 814 GLN 814 ? ? ? 9 . A 1 815 PRO 815 ? ? ? 9 . A 1 816 SER 816 ? ? ? 9 . A 1 817 GLY 817 ? ? ? 9 . A 1 818 PRO 818 ? ? ? 9 . A 1 819 ALA 819 ? ? ? 9 . A 1 820 ARG 820 ? ? ? 9 . A 1 821 PRO 821 ? ? ? 9 . A 1 822 GLN 822 ? ? ? 9 . A 1 823 SER 823 ? ? ? 9 . A 1 824 LEU 824 ? ? ? 9 . A 1 825 PRO 825 ? ? ? 9 . A 1 826 GLN 826 ? ? ? 9 . A 1 827 GLY 827 ? ? ? 9 . A 1 828 LYS 828 ? ? ? 9 . A 1 829 GLY 829 ? ? ? 9 . A 1 830 ARG 830 ? ? ? 9 . A 1 831 SER 831 ? ? ? 9 . A 1 832 ARG 832 ? ? ? 9 . A 1 833 ARG 833 ? ? ? 9 . A 1 834 SER 834 ? ? ? 9 . A 1 835 ARG 835 ? ? ? 9 . A 1 836 ASN 836 ? ? ? 9 . A 1 837 LYS 837 ? ? ? 9 . A 1 838 GLN 838 ? ? ? 9 . A 1 839 GLU 839 ? ? ? 9 . A 1 840 LYS 840 ? ? ? 9 . A 1 841 PRO 841 ? ? ? 9 . A 1 842 ALA 842 ? ? ? 9 . A 1 843 SER 843 ? ? ? 9 . A 1 844 SER 844 ? ? ? 9 . A 1 845 LEU 845 ? ? ? 9 . A 1 846 ASP 846 ? ? ? 9 . A 1 847 ASP 847 ? ? ? 9 . A 1 848 VAL 848 ? ? ? 9 . A 1 849 PHE 849 ? ? ? 9 . A 1 850 LEU 850 ? ? ? 9 . A 1 851 PRO 851 ? ? ? 9 . A 1 852 LYS 852 ? ? ? 9 . A 1 853 ASP 853 ? ? ? 9 . A 1 854 MET 854 ? ? ? 9 . A 1 855 ASP 855 ? ? ? 9 . A 1 856 GLY 856 ? ? ? 9 . A 1 857 VAL 857 ? ? ? 9 . A 1 858 GLU 858 ? ? ? 9 . A 1 859 MET 859 ? ? ? 9 . A 1 860 ASP 860 ? ? ? 9 . A 1 861 GLU 861 ? ? ? 9 . A 1 862 THR 862 ? ? ? 9 . A 1 863 ASP 863 ? ? ? 9 . A 1 864 ARG 864 ? ? ? 9 . A 1 865 GLU 865 ? ? ? 9 . A 1 866 VAL 866 ? ? ? 9 . A 1 867 GLU 867 ? ? ? 9 . A 1 868 TYR 868 ? ? ? 9 . A 1 869 PHE 869 ? ? ? 9 . A 1 870 LYS 870 ? ? ? 9 . A 1 871 ARG 871 ? ? ? 9 . A 1 872 PHE 872 ? ? ? 9 . A 1 873 CYS 873 ? ? ? 9 . A 1 874 LEU 874 ? ? ? 9 . A 1 875 ASP 875 ? ? ? 9 . A 1 876 SER 876 ? ? ? 9 . A 1 877 ALA 877 ? ? ? 9 . A 1 878 LYS 878 ? ? ? 9 . A 1 879 GLN 879 ? ? ? 9 . A 1 880 THR 880 ? ? ? 9 . A 1 881 ARG 881 ? ? ? 9 . A 1 882 GLN 882 ? ? ? 9 . A 1 883 LYS 883 ? ? ? 9 . A 1 884 VAL 884 ? ? ? 9 . A 1 885 ALA 885 ? ? ? 9 . A 1 886 VAL 886 ? ? ? 9 . A 1 887 ASN 887 ? ? ? 9 . A 1 888 TRP 888 ? ? ? 9 . A 1 889 THR 889 ? ? ? 9 . A 1 890 ASN 890 ? ? ? 9 . A 1 891 PHE 891 ? ? ? 9 . A 1 892 SER 892 ? ? ? 9 . A 1 893 LEU 893 ? ? ? 9 . A 1 894 LYS 894 ? ? ? 9 . A 1 895 LYS 895 ? ? ? 9 . A 1 896 THR 896 ? ? ? 9 . A 1 897 THR 897 ? ? ? 9 . A 1 898 PRO 898 ? ? ? 9 . A 1 899 SER 899 ? ? ? 9 . A 1 900 THR 900 ? ? ? 9 . A 1 901 ALA 901 ? ? ? 9 . A 1 902 GLN 902 ? ? ? 9 . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Programmed cell death protein 7 {PDB ID=8y6o, label_asym_id=JA, auth_asym_id=Z, SMTL ID=8y6o.1.9}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8y6o, label_asym_id=JA' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A JA 29 1 Z # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MALPPFFGQGRPGPPPPQPPPPAPFGCPPPPLPSPAFPPPLPQRPGPFPGASAPFLQPPLALQPRASAEA SRGGGGAGAFYPVPPPPLPPPPPQCRPFPGTDAGERPRPPPPGPGPPWSPRWPEAPPPPADVLGDAALQR LRDRQWLEAVFGTPRRAGCPVPQRTHAGPSLGEVRARLLRALRLVRRLRGLSQALREAEADGAAWVLLYS QTAPLRAELAERLQPLTQAAYVGEARRRLERVRRRRLRLRERAREREAEREAEAARAVEREQEIDRWRVK CVQEVEEKKREQELKAAADGVLSEVRKKQADTKRMVDILRALEKLRKLRKEAAARKGVCPPASADETFTH HLQRLRKLIKKRSELYEAEERALRVMLEGEQEEERKRELEKKQRKEKEKILLQKREIESKLFGDPDEFPL AHLLEPFRQYYLQAEHSLPALIQIRHDWDQYLVPSDHPKGNFVPQGWVLPPLPSNDIWATAVKLH ; ;MALPPFFGQGRPGPPPPQPPPPAPFGCPPPPLPSPAFPPPLPQRPGPFPGASAPFLQPPLALQPRASAEA SRGGGGAGAFYPVPPPPLPPPPPQCRPFPGTDAGERPRPPPPGPGPPWSPRWPEAPPPPADVLGDAALQR LRDRQWLEAVFGTPRRAGCPVPQRTHAGPSLGEVRARLLRALRLVRRLRGLSQALREAEADGAAWVLLYS QTAPLRAELAERLQPLTQAAYVGEARRRLERVRRRRLRLRERAREREAEREAEAARAVEREQEIDRWRVK CVQEVEEKKREQELKAAADGVLSEVRKKQADTKRMVDILRALEKLRKLRKEAAARKGVCPPASADETFTH HLQRLRKLIKKRSELYEAEERALRVMLEGEQEEERKRELEKKQRKEKEKILLQKREIESKLFGDPDEFPL AHLLEPFRQYYLQAEHSLPALIQIRHDWDQYLVPSDHPKGNFVPQGWVLPPLPSNDIWATAVKLH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 216 260 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8y6o 2024-03-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 902 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 906 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.530 14.634 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTRRRSRPSGGAGRRERARAAGPQKPQAPEPPPPPSLEAGAGAGPPEAPAEPDHDGPREDDEPNLVPGPQVPPASSQPVQTCCLLCHRERKGWEEGPSQNGLVLQGEKLPPDFMPKLVKNLLGEMPLWVCQSCRKSMEEDERQTGREHAVAISLSHTSCKSQSCGDDSHSSSSSSSSSSSSSSSSCPGNSGDWDPSSFLSAHKLSGLWNSPHSSGAMPGSSLGSPPTIPGEAFPVSEHHQHSDLTAPPNSPTGHHPQPASLIPSHPSSFGSPPHPHLLPTTPAAPFPAQASECPVAAATAPHTPGPCQSSHLPSTSMPLLKMPPPFSGCSHPCSGHCGGHCSGPLLPPPSSQPLPSTHRDPGCKGHKFAHSGLACQLPQPCEADEGLGEEEDSSSERSSCTSSSTHQRDGKFCDCCYCEFFGHNAPPAAPTSRNYTEIREKLRSRLTRRKEELPMKGGTLGGIPGEPAVDHRDVDELLEFINSTEP----KVPNSARAAKRARHKLKKKEKEKAQLAAEALKQANRVSGSREPRPARERLLEWPDRELDRVNSFLSSRLQEIKNTVKDSIRASFSVCELSMDSNGFSKEGAAEPEPQSLPPSNLSGSSEQQPDINLDLSPLTLGSPQNHTLQAPGEPAPPWAEMRGPHPPWTEVRGPPPGIVPENGLVRRLNTVPNLSRVIWVKTPKPGYPSSEEPSSKEVPSCKQELPEPVSSGGKPQKGKRQGSQAKKSEASPAPRPPASLEVPSAKGQVAGPKQPGRVLELPKVGSCAEAGEGSRGSRPGPGWAGSPKTEKEKGSSWRNWPGEAKARPQEQESVQPSGPARPQSLPQGKGRSRRSRNKQEKPASSLDDVFLPKDMDGVEMDETDREVEYFKRFCLDSAKQTRQKVAVNWTNFSLKKTTPSTAQ 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RAELAERLQPLTQAAYVGEARRRLERVRRRRLRLRERAREREAER------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8y6o.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 4' 4 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 358.439 205.526 161.276 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 15 C CB . ARG 472 472 ? A 357.184 204.774 158.198 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 16 C CG . ARG 472 472 ? A 357.076 206.312 158.120 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 17 C CD . ARG 472 472 ? A 355.799 206.836 157.462 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 18 N NE . ARG 472 472 ? A 354.674 206.439 158.359 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 19 C CZ . ARG 472 472 ? A 353.389 206.388 157.997 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 20 N NH1 . ARG 472 472 ? A 353.036 206.700 156.750 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 21 N NH2 . ARG 472 472 ? A 352.473 206.059 158.900 1 1 9 ARG 0.500 1 ATOM 22 N N . ASP 473 473 ? A 356.677 204.121 161.215 1 1 9 ASP 0.650 1 ATOM 23 C CA . ASP 473 473 ? A 356.195 204.409 162.551 1 1 9 ASP 0.650 1 ATOM 24 C C . ASP 473 473 ? A 357.264 204.174 163.633 1 1 9 ASP 0.650 1 ATOM 25 O O . ASP 473 473 ? A 357.473 204.987 164.522 1 1 9 ASP 0.650 1 ATOM 26 C CB . ASP 473 473 ? A 354.933 203.552 162.841 1 1 9 ASP 0.650 1 ATOM 27 C CG . ASP 473 473 ? 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A 353.893 205.189 219.472 1 1 9 GLN 0.560 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.736 2 1 3 0.021 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 471 HIS 1 0.510 2 1 A 472 ARG 1 0.500 3 1 A 473 ASP 1 0.650 4 1 A 474 VAL 1 0.730 5 1 A 475 ASP 1 0.730 6 1 A 476 GLU 1 0.730 7 1 A 477 LEU 1 0.710 8 1 A 478 LEU 1 0.730 9 1 A 479 GLU 1 0.730 10 1 A 480 PHE 1 0.730 11 1 A 481 ILE 1 0.750 12 1 A 482 ASN 1 0.720 13 1 A 483 SER 1 0.740 14 1 A 484 THR 1 0.680 15 1 A 485 GLU 1 0.750 16 1 A 486 PRO 1 0.690 17 1 A 487 LYS 1 0.680 18 1 A 488 VAL 1 0.700 19 1 A 489 PRO 1 0.620 20 1 A 490 ASN 1 0.590 21 1 A 491 SER 1 0.620 22 1 A 492 ALA 1 0.690 23 1 A 493 ARG 1 0.640 24 1 A 494 ALA 1 0.800 25 1 A 495 ALA 1 0.840 26 1 A 496 LYS 1 0.790 27 1 A 497 ARG 1 0.770 28 1 A 498 ALA 1 0.900 29 1 A 499 ARG 1 0.800 30 1 A 500 HIS 1 0.820 31 1 A 501 LYS 1 0.860 32 1 A 502 LEU 1 0.860 33 1 A 503 LYS 1 0.870 34 1 A 504 LYS 1 0.880 35 1 A 505 LYS 1 0.870 36 1 A 506 GLU 1 0.860 37 1 A 507 LYS 1 0.830 38 1 A 508 GLU 1 0.830 39 1 A 509 LYS 1 0.810 40 1 A 510 ALA 1 0.610 41 1 A 511 GLN 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #