data_SMR-95e4c85e8f9d9a3ae80c637d1e40a0b0_2 _entry.id SMR-95e4c85e8f9d9a3ae80c637d1e40a0b0_2 _struct.entry_id SMR-95e4c85e8f9d9a3ae80c637d1e40a0b0_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - P75211/ P200_MYCPN, Protein P200 Estimated model accuracy of this model is 0.027, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P75211' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/80e1e22/dist/mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.7 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2025-06.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.5.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.4.0 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.10.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.14.1 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 135634.389 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP P200_MYCPN P75211 1 ;MPKTIKKQNPSNTTLQYKKYLEQSKEKTAKAKNKDVSIDDLLKKPFLEEIKTNVLKKNKTTRASTATRGT SKVKKQIVESSIDFFDEKKRGVFIVPPAGTSVINDDRDDNKAVEETVSKTAISQNQLAHYANSELVETEQ FELKPVALEHNQVLTSTRHSQERESIFEKAQLFWQIFVGDVRFGFWKNHTWIWLGFFDQHQNWYYFEVVE TVELPQEHTAFIKRKQIDSCFWKPLVGNPNYGYIQNNIWVWKGFFDTKLNWIPDPVRFTLPMVEKATTTT PVVQIELPAPPTVTVVDQTSPPTAAVTVSTSQPVIEEQTTVFNQTTQLEQLSVSAPLLDQSEVETEMVEV PFVAPSTTTTQPQVVTVQAQPASSSIQFQEPIIKVEFVNESFDFKKPSQTAAAASQAPSQAINIALNEAD LIDELVAVGTTATTALPQSELIQEVVVIDNGQPQQAGFHYVVDFLTSTAPLTVAEIELQEQELVNEFVTT TSRETTTFASTPVFEPVVIPTVESEEQLLENEFVESTVVSATSNEPNVASTPVVETVELTETPVSLEPLE TVQLETAPVVTETVTVTEKAVEPEVLAVVEEAPLAVEPIVETSTTLAAETVEEAQVEQESTAVAVEPAIE TESKATSEAQAELDWEALIGNSEYGYFDAEQNWIWTGYFDEDNKWVSTATAQTEANAEEVVLTADAETSE LNTESDPSFEPEVEIQPEPEPNFDLETIPEPESIETTEPEPNFEPEVELEPEIEPNFESETEVQQELAQE SSFESEPEPNFETEVEVQPESEIESKFEAEVQSEPKVSLNSDFETKPEAQAEVTPETLEVEATSEAPELQ PETEATKVVDDVEEEQLDWELLIGNSNYGHYEPSGEWVWAGYFDDNQIWTPDASVEWARESDYTDLIGDE IYGRYNRKGEWIWYGYYDETGEWVLVDEHYQNHQPRISEAPRFWEQLIGNEDYGYYEDNEWKWYDGEFDS EGNWLVFHSSNAEDAKNIDIAKDIPVFESFDVDSIDADEWLDQFSDSDAKEVFGED ; 'Protein P200' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1036 1 1036 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum _ma_target_ref_db_details.is_primary 1 UNP . P200_MYCPN P75211 . 1 1036 272634 'Mycoplasma pneumoniae (strain ATCC 29342 / M129 / Subtype 1)(Mycoplasmoides pneumoniae)' 1997-02-01 DE5AEBAB6DD95B29 . # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MPKTIKKQNPSNTTLQYKKYLEQSKEKTAKAKNKDVSIDDLLKKPFLEEIKTNVLKKNKTTRASTATRGT SKVKKQIVESSIDFFDEKKRGVFIVPPAGTSVINDDRDDNKAVEETVSKTAISQNQLAHYANSELVETEQ FELKPVALEHNQVLTSTRHSQERESIFEKAQLFWQIFVGDVRFGFWKNHTWIWLGFFDQHQNWYYFEVVE TVELPQEHTAFIKRKQIDSCFWKPLVGNPNYGYIQNNIWVWKGFFDTKLNWIPDPVRFTLPMVEKATTTT PVVQIELPAPPTVTVVDQTSPPTAAVTVSTSQPVIEEQTTVFNQTTQLEQLSVSAPLLDQSEVETEMVEV PFVAPSTTTTQPQVVTVQAQPASSSIQFQEPIIKVEFVNESFDFKKPSQTAAAASQAPSQAINIALNEAD LIDELVAVGTTATTALPQSELIQEVVVIDNGQPQQAGFHYVVDFLTSTAPLTVAEIELQEQELVNEFVTT TSRETTTFASTPVFEPVVIPTVESEEQLLENEFVESTVVSATSNEPNVASTPVVETVELTETPVSLEPLE 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TSRETTTFASTPVFEPVVIPTVESEEQLLENEFVESTVVSATSNEPNVASTPVVETVELTETPVSLEPLE TVQLETAPVVTETVTVTEKAVEPEVLAVVEEAPLAVEPIVETSTTLAAETVEEAQVEQESTAVAVEPAIE TESKATSEAQAELDWEALIGNSEYGYFDAEQNWIWTGYFDEDNKWVSTATAQTEANAEEVVLTADAETSE LNTESDPSFEPEVEIQPEPEPNFDLETIPEPESIETTEPEPNFEPEVELEPEIEPNFESETEVQQELAQE SSFESEPEPNFETEVEVQPESEIESKFEAEVQSEPKVSLNSDFETKPEAQAEVTPETLEVEATSEAPELQ PETEATKVVDDVEEEQLDWELLIGNSNYGHYEPSGEWVWAGYFDDNQIWTPDASVEWARESDYTDLIGDE IYGRYNRKGEWIWYGYYDETGEWVLVDEHYQNHQPRISEAPRFWEQLIGNEDYGYYEDNEWKWYDGEFDS EGNWLVFHSSNAEDAKNIDIAKDIPVFESFDVDSIDADEWLDQFSDSDAKEVFGED ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 PRO . 1 3 LYS . 1 4 THR . 1 5 ILE . 1 6 LYS . 1 7 LYS . 1 8 GLN . 1 9 ASN . 1 10 PRO . 1 11 SER . 1 12 ASN . 1 13 THR . 1 14 THR . 1 15 LEU . 1 16 GLN . 1 17 TYR . 1 18 LYS . 1 19 LYS . 1 20 TYR . 1 21 LEU . 1 22 GLU . 1 23 GLN . 1 24 SER . 1 25 LYS . 1 26 GLU . 1 27 LYS . 1 28 THR . 1 29 ALA . 1 30 LYS . 1 31 ALA . 1 32 LYS . 1 33 ASN . 1 34 LYS . 1 35 ASP . 1 36 VAL . 1 37 SER . 1 38 ILE . 1 39 ASP . 1 40 ASP . 1 41 LEU . 1 42 LEU . 1 43 LYS . 1 44 LYS . 1 45 PRO . 1 46 PHE . 1 47 LEU . 1 48 GLU . 1 49 GLU . 1 50 ILE . 1 51 LYS . 1 52 THR . 1 53 ASN . 1 54 VAL . 1 55 LEU . 1 56 LYS . 1 57 LYS . 1 58 ASN . 1 59 LYS . 1 60 THR . 1 61 THR . 1 62 ARG . 1 63 ALA . 1 64 SER . 1 65 THR . 1 66 ALA . 1 67 THR . 1 68 ARG . 1 69 GLY . 1 70 THR . 1 71 SER . 1 72 LYS . 1 73 VAL . 1 74 LYS . 1 75 LYS . 1 76 GLN . 1 77 ILE . 1 78 VAL . 1 79 GLU . 1 80 SER . 1 81 SER . 1 82 ILE . 1 83 ASP . 1 84 PHE . 1 85 PHE . 1 86 ASP . 1 87 GLU . 1 88 LYS . 1 89 LYS . 1 90 ARG . 1 91 GLY . 1 92 VAL . 1 93 PHE . 1 94 ILE . 1 95 VAL . 1 96 PRO . 1 97 PRO . 1 98 ALA . 1 99 GLY . 1 100 THR . 1 101 SER . 1 102 VAL . 1 103 ILE . 1 104 ASN . 1 105 ASP . 1 106 ASP . 1 107 ARG . 1 108 ASP . 1 109 ASP . 1 110 ASN . 1 111 LYS . 1 112 ALA . 1 113 VAL . 1 114 GLU . 1 115 GLU . 1 116 THR . 1 117 VAL . 1 118 SER . 1 119 LYS . 1 120 THR . 1 121 ALA . 1 122 ILE . 1 123 SER . 1 124 GLN . 1 125 ASN . 1 126 GLN . 1 127 LEU . 1 128 ALA . 1 129 HIS . 1 130 TYR . 1 131 ALA . 1 132 ASN . 1 133 SER . 1 134 GLU . 1 135 LEU . 1 136 VAL . 1 137 GLU . 1 138 THR . 1 139 GLU . 1 140 GLN . 1 141 PHE . 1 142 GLU . 1 143 LEU . 1 144 LYS . 1 145 PRO . 1 146 VAL . 1 147 ALA . 1 148 LEU . 1 149 GLU . 1 150 HIS . 1 151 ASN . 1 152 GLN . 1 153 VAL . 1 154 LEU . 1 155 THR . 1 156 SER . 1 157 THR . 1 158 ARG . 1 159 HIS . 1 160 SER . 1 161 GLN . 1 162 GLU . 1 163 ARG . 1 164 GLU . 1 165 SER . 1 166 ILE . 1 167 PHE . 1 168 GLU . 1 169 LYS . 1 170 ALA . 1 171 GLN . 1 172 LEU . 1 173 PHE . 1 174 TRP . 1 175 GLN . 1 176 ILE . 1 177 PHE . 1 178 VAL . 1 179 GLY . 1 180 ASP . 1 181 VAL . 1 182 ARG . 1 183 PHE . 1 184 GLY . 1 185 PHE . 1 186 TRP . 1 187 LYS . 1 188 ASN . 1 189 HIS . 1 190 THR . 1 191 TRP . 1 192 ILE . 1 193 TRP . 1 194 LEU . 1 195 GLY . 1 196 PHE . 1 197 PHE . 1 198 ASP . 1 199 GLN . 1 200 HIS . 1 201 GLN . 1 202 ASN . 1 203 TRP . 1 204 TYR 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B 1 928 ASP 928 928 ASP ASP B . B 1 929 GLU 929 929 GLU GLU B . B 1 930 THR 930 930 THR THR B . B 1 931 GLY 931 931 GLY GLY B . B 1 932 GLU 932 932 GLU GLU B . B 1 933 TRP 933 933 TRP TRP B . B 1 934 VAL 934 934 VAL VAL B . B 1 935 LEU 935 ? ? ? B . B 1 936 VAL 936 ? ? ? B . B 1 937 ASP 937 ? ? ? B . B 1 938 GLU 938 ? ? ? B . B 1 939 HIS 939 ? ? ? B . B 1 940 TYR 940 ? ? ? B . B 1 941 GLN 941 ? ? ? B . B 1 942 ASN 942 ? ? ? B . B 1 943 HIS 943 ? ? ? B . B 1 944 GLN 944 ? ? ? B . B 1 945 PRO 945 ? ? ? B . B 1 946 ARG 946 ? ? ? B . B 1 947 ILE 947 ? ? ? B . B 1 948 SER 948 ? ? ? B . B 1 949 GLU 949 ? ? ? B . B 1 950 ALA 950 ? ? ? B . B 1 951 PRO 951 ? ? ? B . B 1 952 ARG 952 ? ? ? B . B 1 953 PHE 953 ? ? ? B . B 1 954 TRP 954 ? ? ? B . B 1 955 GLU 955 ? ? ? B . B 1 956 GLN 956 ? ? ? B . B 1 957 LEU 957 ? ? ? B . B 1 958 ILE 958 ? ? ? B . B 1 959 GLY 959 ? ? ? B . B 1 960 ASN 960 ? ? ? B . B 1 961 GLU 961 ? ? ? B . B 1 962 ASP 962 ? ? ? B . B 1 963 TYR 963 ? ? ? B . B 1 964 GLY 964 ? ? ? B . B 1 965 TYR 965 ? ? ? B . B 1 966 TYR 966 ? ? ? B . B 1 967 GLU 967 ? ? ? B . B 1 968 ASP 968 ? ? ? B . B 1 969 ASN 969 ? ? ? B . B 1 970 GLU 970 ? ? ? B . B 1 971 TRP 971 ? ? ? B . B 1 972 LYS 972 ? ? ? B . B 1 973 TRP 973 ? ? ? B . B 1 974 TYR 974 ? ? ? B . B 1 975 ASP 975 ? ? ? B . B 1 976 GLY 976 ? ? ? B . B 1 977 GLU 977 ? ? ? B . B 1 978 PHE 978 ? ? ? B . B 1 979 ASP 979 ? ? ? B . B 1 980 SER 980 ? ? ? B . B 1 981 GLU 981 ? ? ? B . B 1 982 GLY 982 ? ? ? B . B 1 983 ASN 983 ? ? ? B . B 1 984 TRP 984 ? ? ? B . B 1 985 LEU 985 ? ? ? B . B 1 986 VAL 986 ? ? ? B . B 1 987 PHE 987 ? ? ? B . B 1 988 HIS 988 ? ? ? B . B 1 989 SER 989 ? ? ? B . B 1 990 SER 990 ? ? ? B . B 1 991 ASN 991 ? ? ? B . B 1 992 ALA 992 ? ? ? B . B 1 993 GLU 993 ? ? ? B . B 1 994 ASP 994 ? ? ? B . B 1 995 ALA 995 ? ? ? B . B 1 996 LYS 996 ? ? ? B . B 1 997 ASN 997 ? ? ? B . B 1 998 ILE 998 ? ? ? B . B 1 999 ASP 999 ? ? ? B . B 1 1000 ILE 1000 ? ? ? B . B 1 1001 ALA 1001 ? ? ? B . B 1 1002 LYS 1002 ? ? ? B . B 1 1003 ASP 1003 ? ? ? B . B 1 1004 ILE 1004 ? ? ? B . B 1 1005 PRO 1005 ? ? ? B . B 1 1006 VAL 1006 ? ? ? B . B 1 1007 PHE 1007 ? ? ? B . B 1 1008 GLU 1008 ? ? ? B . B 1 1009 SER 1009 ? ? ? B . B 1 1010 PHE 1010 ? ? ? B . B 1 1011 ASP 1011 ? ? ? B . B 1 1012 VAL 1012 ? ? ? B . B 1 1013 ASP 1013 ? ? ? B . B 1 1014 SER 1014 ? ? ? B . B 1 1015 ILE 1015 ? ? ? B . B 1 1016 ASP 1016 ? ? ? B . B 1 1017 ALA 1017 ? ? ? B . B 1 1018 ASP 1018 ? ? ? B . B 1 1019 GLU 1019 ? ? ? B . B 1 1020 TRP 1020 ? ? ? B . B 1 1021 LEU 1021 ? ? ? B . B 1 1022 ASP 1022 ? ? ? B . B 1 1023 GLN 1023 ? ? ? B . B 1 1024 PHE 1024 ? ? ? B . B 1 1025 SER 1025 ? ? ? B . B 1 1026 ASP 1026 ? ? ? B . B 1 1027 SER 1027 ? ? ? B . B 1 1028 ASP 1028 ? ? ? B . B 1 1029 ALA 1029 ? ? ? B . B 1 1030 LYS 1030 ? ? ? B . B 1 1031 GLU 1031 ? ? ? B . B 1 1032 VAL 1032 ? ? ? B . B 1 1033 PHE 1033 ? ? ? B . B 1 1034 GLY 1034 ? ? ? B . B 1 1035 GLU 1035 ? ? ? B . B 1 1036 ASP 1036 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'DnaJ-like protein MG200 {PDB ID=4dcz, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4dcz.1.A}' 'template structure' . 2 'DnaJ-like protein MG200 {PDB ID=4dcz, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4dcz.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 4dcz, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 4dcz, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 2' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-06-25 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-06-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;KQEQPEINLDHVVEQTIKKVQQNQNQNKDPDELRSKVPGEVTASDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYF DEQGKWVWNEPVDSLEHHHHHH ; ;KQEQPEINLDHVVEQTIKKVQQNQNQNKDPDELRSKVPGEVTASDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYF DEQGKWVWNEPVDSLEHHHHHH ; 2 ;KQEQPEINLDHVVEQTIKKVQQNQNQNKDPDELRSKVPGEVTASDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYF DEQGKWVWNEPVDSLEHHHHHH ; ;KQEQPEINLDHVVEQTIKKVQQNQNQNKDPDELRSKVPGEVTASDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYF DEQGKWVWNEPVDSLEHHHHHH ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 44 77 2 2 44 77 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4dcz 2024-02-28 2 PDB . 4dcz 2024-02-28 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1036 2 2 B 1 1036 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1036 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1036 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 6.11e-05 50.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 6.11e-05 50.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MPKTIKKQNPSNTTLQYKKYLEQSKEKTAKAKNKDVSIDDLLKKPFLEEIKTNVLKKNKTTRASTATRGTSKVKKQIVESSIDFFDEKKRGVFIVPPAGTSVINDDRDDNKAVEETVSKTAISQNQLAHYANSELVETEQFELKPVALEHNQVLTSTRHSQERESIFEKAQLFWQIFVGDVRFGFWKNHTWIWLGFFDQHQNWYYFEVVETVELPQEHTAFIKRKQIDSCFWKPLVGNPNYGYIQNNIWVWKGFFDTKLNWIPDPVRFTLPMVEKATTTTPVVQIELPAPPTVTVVDQTSPPTAAVTVSTSQPVIEEQTTVFNQTTQLEQLSVSAPLLDQSEVETEMVEVPFVAPSTTTTQPQVVTVQAQPASSSIQFQEPIIKVEFVNESFDFKKPSQTAAAASQAPSQAINIALNEADLIDELVAVGTTATTALPQSELIQEVVVIDNGQPQQAGFHYVVDFLTSTAPLTVAEIELQEQELVNEFVTTTSRETTTFASTPVFEPVVIPTVESEEQLLENEFVESTVVSATSNEPNVASTPVVETVELTETPVSLEPLETVQLETAPVVTETVTVTEKAVEPEVLAVVEEAPLAVEPIVETSTTLAAETVEEAQVEQESTAVAVEPAIETESKATSEAQAELDWEALIGNSEYGYFDAEQNWIWTGYFDEDNKWVSTATAQTEANAEEVVLTADAETSELNTESDPSFEPEVEIQPEPEPNFDLETIPEPESIETTEPEPNFEPEVELEPEIEPNFESETEVQQELAQESSFESEPEPNFETEVEVQPESEIESKFEAEVQSEPKVSLNSDFETKPEAQAEVTPETLEVEATSEAPELQPETEATKVVDDVEEEQLDWELLIGNSNYGHYEPSGEWVWAGYFDDNQIWTPDASVEWARESDYTDLIGDEIYGRYNRKGEWIWYGYYDETGEWVLVDEHYQNHQPRISEAPRFWEQLIGNEDYGYYEDNEWKWYDGEFDSEGNWLVFHSSNAEDAKNIDIAKDIPVFESFDVDSIDADEWLDQFSDSDAKEVFGED 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYFDEQGKWV------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MPKTIKKQNPSNTTLQYKKYLEQSKEKTAKAKNKDVSIDDLLKKPFLEEIKTNVLKKNKTTRASTATRGTSKVKKQIVESSIDFFDEKKRGVFIVPPAGTSVINDDRDDNKAVEETVSKTAISQNQLAHYANSELVETEQFELKPVALEHNQVLTSTRHSQERESIFEKAQLFWQIFVGDVRFGFWKNHTWIWLGFFDQHQNWYYFEVVETVELPQEHTAFIKRKQIDSCFWKPLVGNPNYGYIQNNIWVWKGFFDTKLNWIPDPVRFTLPMVEKATTTTPVVQIELPAPPTVTVVDQTSPPTAAVTVSTSQPVIEEQTTVFNQTTQLEQLSVSAPLLDQSEVETEMVEVPFVAPSTTTTQPQVVTVQAQPASSSIQFQEPIIKVEFVNESFDFKKPSQTAAAASQAPSQAINIALNEADLIDELVAVGTTATTALPQSELIQEVVVIDNGQPQQAGFHYVVDFLTSTAPLTVAEIELQEQELVNEFVTTTSRETTTFASTPVFEPVVIPTVESEEQLLENEFVESTVVSATSNEPNVASTPVVETVELTETPVSLEPLETVQLETAPVVTETVTVTEKAVEPEVLAVVEEAPLAVEPIVETSTTLAAETVEEAQVEQESTAVAVEPAIETESKATSEAQAELDWEALIGNSEYGYFDAEQNWIWTGYFDEDNKWVSTATAQTEANAEEVVLTADAETSELNTESDPSFEPEVEIQPEPEPNFDLETIPEPESIETTEPEPNFEPEVELEPEIEPNFESETEVQQELAQESSFESEPEPNFETEVEVQPESEIESKFEAEVQSEPKVSLNSDFETKPEAQAEVTPETLEVEATSEAPELQPETEATKVVDDVEEEQLDWELLIGNSNYGHYEPSGEWVWAGYFDDNQIWTPDASVEWARESDYTDLIGDEIYGRYNRKGEWIWYGYYDETGEWVLVDEHYQNHQPRISEAPRFWEQLIGNEDYGYYEDNEWKWYDGEFDSEGNWLVFHSSNAEDAKNIDIAKDIPVFESFDVDSIDADEWLDQFSDSDAKEVFGED 4 2 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SDWEALVGDTRYGYFDETGDWSWKGYFDEQGKWV------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.555}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4dcz.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 'model 2' 6 'Homology model' . # # loop_ _ma_model_group.id _ma_model_group.name _ma_model_group.details 1 . . # # loop_ _ma_model_group_link.group_id _ma_model_group_link.model_id 1 1 # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.754 2 1 3 0.027 3 1 4 0.555 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 901 SER 1 0.490 2 1 A 902 ASP 1 0.510 3 1 A 903 TYR 1 0.760 4 1 A 904 THR 1 0.760 5 1 A 905 ASP 1 0.740 6 1 A 906 LEU 1 0.810 7 1 A 907 ILE 1 0.830 8 1 A 908 GLY 1 0.870 9 1 A 909 ASP 1 0.810 10 1 A 910 GLU 1 0.750 11 1 A 911 ILE 1 0.790 12 1 A 912 TYR 1 0.840 13 1 A 913 GLY 1 0.870 14 1 A 914 ARG 1 0.750 15 1 A 915 TYR 1 0.810 16 1 A 916 ASN 1 0.750 17 1 A 917 ARG 1 0.660 18 1 A 918 LYS 1 0.540 19 1 A 919 GLY 1 0.790 20 1 A 920 GLU 1 0.750 21 1 A 921 TRP 1 0.790 22 1 A 922 ILE 1 0.820 23 1 A 923 TRP 1 0.810 24 1 A 924 TYR 1 0.860 25 1 A 925 GLY 1 0.900 26 1 A 926 TYR 1 0.860 27 1 A 927 TYR 1 0.830 28 1 A 928 ASP 1 0.810 29 1 A 929 GLU 1 0.750 30 1 A 930 THR 1 0.790 31 1 A 931 GLY 1 0.840 32 1 A 932 GLU 1 0.790 33 1 A 933 TRP 1 0.550 34 1 A 934 VAL 1 0.530 35 1 B 901 SER 1 0.570 36 1 B 902 ASP 1 0.580 37 1 B 903 TYR 1 0.760 38 1 B 904 THR 1 0.730 39 1 B 905 ASP 1 0.720 40 1 B 906 LEU 1 0.800 41 1 B 907 ILE 1 0.820 42 1 B 908 GLY 1 0.860 43 1 B 909 ASP 1 0.800 44 1 B 910 GLU 1 0.730 45 1 B 911 ILE 1 0.770 46 1 B 912 TYR 1 0.830 47 1 B 913 GLY 1 0.860 48 1 B 914 ARG 1 0.730 49 1 B 915 TYR 1 0.800 50 1 B 916 ASN 1 0.710 51 1 B 917 ARG 1 0.570 52 1 B 918 LYS 1 0.500 53 1 B 919 GLY 1 0.800 54 1 B 920 GLU 1 0.740 55 1 B 921 TRP 1 0.790 56 1 B 922 ILE 1 0.810 57 1 B 923 TRP 1 0.790 58 1 B 924 TYR 1 0.850 59 1 B 925 GLY 1 0.890 60 1 B 926 TYR 1 0.850 61 1 B 927 TYR 1 0.830 62 1 B 928 ASP 1 0.810 63 1 B 929 GLU 1 0.750 64 1 B 930 THR 1 0.690 65 1 B 931 GLY 1 0.850 66 1 B 932 GLU 1 0.800 67 1 B 933 TRP 1 0.560 68 1 B 934 VAL 1 0.530 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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